3BXWA

Crystal structure of stabilin-1 interacting chitinase-like protein, si-clp
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
361
structure length
360
Chain Sequence
TLLEKSQFSDKPVQDRGLVVTDLKAESVVLEHRSYCSAKARDRHFAGDVLGYVTPWNSHGYDVTKVFGSKFTQISPVWLQLKRRGREMFEVTGLHDVDQGWMRAVRKHAKGLHIVPRLLFEDWTYDDFRNVLDSEDEIEELSKTVVQVAKNQHFDGFVVEVWNQLLSQRVGLIHMLTHLAEALHQARLLALLVIPPAITPGTDQLGMFTHKEFEQLAPVLDGFSLMTYDYSTAHQPGPNAPLSWVRACVQVLDPKSKWRSKILLGLNFYGMDYATSKDAREPVVGARYIQTLKDHRPRMVWDSQASEHFFEYKKSRSGRHVVFYPTLKSLQVRLELARELGVGVSIWELGQGLDYFYDLL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Chitinase domain-containing protein 1
publication title Structure of human stabilin-1 interacting chitinase-like protein (SI-CLP) reveals a saccharide-binding cleft with lower sugar-binding selectivity.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 115
structure length 360
sequence length 361
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-01-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.8.360 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Helicase, Ruva Protein; domain 3 3,6-anhydro-alpha-l-galactosidase 3bxwA01
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 3bxwA03
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3bxwA02
2TAAA 1V3JA 2NT0A 3PZQA 5HPOA 2WMIA 3LPPA 5D9OA 2JIWA 1KBKA 1VENA 1HJVA 2OYKA 1B3YA 3W25A 1B90A 4UTFA 2GK1A 3VINA 1UD5A 4OUEA 3RO8A 3QOMA 2VL4A 2VCAA 1TR1A 3F4VA 5IHRA 3VKKA 2WKLA 1JD7A 1X6LA 2WZHA 3A6OA 1VBRA 1E6ZA 1GONA 3ECQA 3NSNA 1HXJA 1WZLA 3O6AA 2GJXB 3SCTA 3OGRA 1JDDA 4D1IA 4P7OA 1ZBVA 4LXFA 3WQ8A 1M04A 3W37A 4J7RA 3AZTA 4U3AA 2V3FA 1ISXA 2BHYA 4GXPA 3PTQA 4AZBA 4D6JA 4ML4A 3QHNA 4B16A 1OGGA 1JDCA 1QNRA 1ISWA 2Z1KA 3W29A 1LJYA 5FIPA 4PTXA 4MNLA 1HVQA 2VX6A 4UQ9A 1E43A 2GJPA 1MW1A 3RPMA 1I1XA 2VURA 1E5NA 3OGSA 2VT0A 1UR2A 3APGA 4QLLA 5CXPA 2X0YA 1G1YA 3VGGA 1HNYA 5A6BD 3GNPA 4UFHA 3OIHA 4Z2LA 2ZUTA 4HOXA 3UR8A 3AHVA 3FY1A 1MQPA 4CCCA 1HT6A 3AS0A 2YBUA 2VQTA 3POCA 2OSYA 1HKIA 3W0KA 5FOOA 3VGHA 2ESCA 3E1F1 3AMDA 3KL5A 3NCOA 1MFUA 1ZJAA 4PMZA 1GORA 3ZO9A 1UD8A 1PPIA 3VIPA 1WDRA 1HJQA 1GHSA 4M24A 1VJZA 5AC5A 4CU8A 3AXXA 3OBAA 3ZJ8A 1H11A 2BVYA 1VFOA 3CMGA 3WUGA 2QMJA 2Y5EA 4HMCA 4GO9A 2X09A 1J10A 3CZLA 4HU0A 5CSUA 3WDQA 6A3HA 2VCBA 2W91A 2ZOXA 1UWQA 1W32A 2OLHA 1LWJA 1PIFA 4EE9A 5A6KA 4D72A 1V3IA 4OBSA 3CIVA 1OSEA 1E5JA 4CN6A 1NOFA 1JNDA 4ZEPA 3AIUA 2RGLA 4BQ3A 4Q22A 3PHAA 3MUIA 1VFFA 3PTKA 2QLYA 4DWSB 2ZX8A 3WMCA 4AEFA 2DT3A 3AI0A 3N11A 3TOPA 3PZNA 3WNPA 3BH4A 1DWGM 2QMKA 2WC4A 4DWSC 2IUZA 4AZHA 2VR4A 3A47A 3MSGA 3W6LA 2WPGA 3GBEA 3VDHA 3W38A 4D6DA 5D9NA 4A4AA 1MXDA 1UKQA 2XSBA 2XPKA 1HP5A 1Q6CA 3SUVA 1JGIA 1AQHA 4JKKA 3T08A 3OLEA 3BMWA 1C3FA 3VIJA 3NJ3A 3RM8A 3PZUA 4W8LA 3SCVA 3BC9A 5AC4A 3N13A 1C7SA 4HMDA 1XSJA 1LQ0A 4M29A 1UD6A 2EEXA 2J7FA 1XC6A 3UEQA 4ACZB 4H04A 4V28A 3T0BA 1E4MM 2W92A 4UCFA 2O9OA 3WELA 1HIZA 1QNQA 1I1WA 2WC7A 3VIHA 1CTNA 2PBGA 2WHJA 1QBBA 3U57A 2BV9A 4MAZA 1G94A 3LPOA 2XSAA 3AOFA 1EDQA 5EB8A 5A8PA 1CECA 2GVYA 3SUWA 1M01A 1OBAA 3DECA 4BA0A 2BNJA 1PIGA 2FH8A 2WYSA 3SCWA 4KRUA 3MS8A 5JUVA 5JH8A 3BAYA 2QPSA 5GQBA 4PMNA 1V6YA 2BXZA 3MMUA 3VIGA 1PAMA 4WIWA 3S2CA 4AIOA 1C8YA 4GI6A 3PBGA 4L4PA 4U3CA 5M5DA 2G3NA 1KBBA 5E0CA 2E4TA 3MUZ1 1BLIA 4HA4A 4L4OA 3THDA 1D3CA 3ZSSA 2F8QA 1H5VA 2DH2A 5CQ1A 1KR1A 1KFWA 2XHYA 3T09A 3B9AA 3CZ8A 2D2OA 3I3DA 1W9XA 5CG0A 5DMYA 1UA7A 4N42A 2DEPA 3AIRA 1QVBA 2XG9A 1I75A 3ZSTA 3FHAA 1MQRA 2EXOA 2O9RA 5LA0A 4HOWA 1BVNP 5CPTA 3VD7A 4AD0A 5LA1A 2WWDA 1OINA 2WMIB 3WY1A 1V0MA 1JZ5A 1JXKA 1BYBA 2CPUA 4WKAA 4KMQA 1G0CA 4JKMA 2GK1B 2GJXA 3VTRA 2BHZA 2V3GA 1E4LA 3EDDA 1GNXA 2XGIA 1UYQA 1JYXA 2J7BA 3AHTA 5CGTA 3CZJA 4PTWA 1MWOA 2DSWA 1J0JA 4AD4A 2O9TA 3K8KA 1Y7VA 1NH6A 4ZXLA 1BFNA 4M82A 1GOWA 5AY7A 1TA3A 1XCXA 5HPCA 1HF6A 2XVNA 2A3HA 2VVSA 4UFKA 3HU7A 5FL1A 2D0HA 3WNLA 4C7FA 1JF5A 2FGLA 3O9NA 1NQ6A 2D1ZA 3ARYA 1WAWA 3AICA 4D6IA 1QNPA 3QHOA 1BGGA 3ZMRA 4UNIA 3BAJA 2FGZA 1BPLB 1JNEA 5I77A 1DHKA 5D9MA 2BY2A 1DEDA 4HMEA 4MDPA 5CSYA 1KXQA 3ARQA 3SEPA 1J18A 4JZ5A 4AD5A 3TTSA 4MTVA 3N04A 3SUSA 1J01A 5HXMA 3AIVA 2WNWA 5KZ6A 3IANA 4ZXOA 4PEEA 4N0RA 1GOOA 3LMYA 1JD9A 3CTTA 3WNNA 1E0XA 2PWFA 3WQ5A 3PZVA 1H09A 3VILA 4HPGA 3T2PA 4BS0A 4PMQA 2BY3A 3UERA 1CLVA 1E70M 2EPOA 4QCEA 3WD2A 2ZX5A 1KB3A 4PTVA 1UZ1A 2ZWYA 2ZUUA 5A2AA 1KGXA 1TCMA 2EPKX 2CKRA 2XIBA 2ZE0A 4XZWA 4ATDA 1Q4NX 1XHGA 2VX4A 3CHCA 1NP2A 2BY0A 1MXGA 1FP9A 4J3SA 2Y8VA 3BAWA 1VF8A 3AQUA 1JZ3A 4AWEA 1OT2A 4PMOA 3VX0A 1H3GA 2ZXBA 1LWHA 1E56A 1LG2A 4S3JA 4D71A 1VEOA 2WBKA 2UY5A 3GXFA 2Q8XA 5EBAA 1W1TA 3ZT7A 2BS9A 4EANA 4Z2GA 4W93A 4UQAA 5A1AA 1FH8A 4CD4A 2G4FA 1K9DA 3SURA 3VVGA 2WMGA 2DGAA 4Y7EA 5JBEA 2D3NA 3F5JA 1YHTA 3PTMA 3ARSA 1W1VA 4NZCA 1KQYA 3VGBA 1JDAA 5ABEA 3K4DA 4MDOA 3AIEA 4ACZA 5M17A 1RP9A 1C7TA 3AMGA 1W9VA 1FA2A 3BCFA 1J12A 2XFRA 4U5KA 2OYLA 2W66A 5E09A 4ZE5A 2J62A 2J7GA 1F4AA 4A3HA 3MMWA 3VIOA 1OT1A 3ZOAA 3OGVA 2XGBA 3MKKA 1E1FA 2WAGA 3GH7A 1TE1A 2FH6A 3VDCA 4U2ZA 5BXPA 4PMYA 2FDMA 3KEHA 1HJWA 2DT2A 1KR0A 5I78A 5I0DA 3DYPA 4J3XA 1WDSA 3VMOA 2E3ZA 2NW0A 5I24A 1VEMA 1XGZA 3IJ9A 5BXTA 3BLKA 1WDQA 1KXVA 4UFJA 4QDMA 1QI3A 1LL6A 2BY1A 2PF0A 1W9UA 4TVDA 4F66A 2GFTA 1UR9A 3OG2A 3A3HA 4BQ2A 4NRRA 1OGBA 3ARVA 2A3AA 2J7HA 2CCRA 3GH4A 4W5ZA 5DFAA 2CERA 4W5UA 4QP0A 3EDKA 5EFDA 1B2YA 1UWRA 3KE0A 5A8OA 3WIJA 3WH5A 4JKLA 3L4ZA 1DWFM 1DP0A 2C8NA 4FLSA 1BGAA 3VMNA 3N15A 3RJYA 2CKSA 4MPKA 2VRJA 1WNOA 2E9BA 2ZX9A 3ALFA 1FFQA 4HPHA 4AZIA 1ESWA 4QAWA 1JF6A 1KGWA 4HOZA 5M03A 3VGFA 2ZUSA 2X0HA 2HVMA 4BQ4A 1CGTA 3WH7A 3CH9A 1UKSA 4DM1A 1VFUA 4CCEA 2EPLX 4M81A 1M7XA 2CNCA 3WDRA 1RH9A 5A6MA 1HJSA 2YIHA 4LX4A 3MMDA 3QHMA 1VFMA 4FF5A 1UUQA 3G6MA 1QPKA 2GUYA 5A6SA 4HP5A 4AY1A 4QLJA 4UQBA 5DT5A 3WEZA 3THCA 2ZXAA 4KRTA 3AIWA 2CYGA 1E6RA 3CUIA 1HJXA 4RE3A 2YA2A 1R7OA 3GNRA 4GZEA 3WH9A 3CUGA 1E15A 4W7UA 3GZAA 2VZOA 3VMPA 1E6SM 4CD8A 1R87A 2D24A 2ZXQA 1TA3B 4IM4A 4ZFMA 1AMYA 5A8QA 1G5AA 1EHAA 2AAAA 2E0PA 7A3HA 3AXHA 3W27A 1NWUA 1CGXA 4H8UA 5D9PA 2VCCA 3ALGA 4HA3A 1QI0A 3CZGA 5I5RA 2XM2A 1MFVA 2JEQA 4DWSD 1C90A 1BYAA 3W53A 3WSUA 1HP4A 5JBFA 2OWXA 3NIYA 2GSJA 1CXFA 2V3DA 3W4RA 4NSBA 1GVIA 4F79A 3TONA 1BHGA 3ARUA 1ODUA 3NYDA 5TD4A 3WDHA 5D4YA 1TUXA 3ZJ7A 1DWIM 1N82A 4R5EA 2J25A 5GNXA 4ZENA 7TAAA 1D2KA 4H7VA 4KGLA 4OOZA 3UG4A 5BRQA 1NWTA 4EAMA 3GTNA 1EO5A 4D6FA 2VQUA 2WM0A 2OYMA 2W62A 2XVKA 5FL0A 3EMCA 2DH3A 1WDPA 1UR4A 3NSXA 3UG5A 3W82A 3CBWA 3D5HA 3L2LA 5EFFA 5I2UA 3WEOA 4H2CA 3CZEA 1FHDA 4MB4A 2OSWA 3WDIA 3I3EA 4JFWA 1UD2A 2OWWA 3CMJA 1PZ2A 2CHNA 1UG6A 1R86A 2CETA 1W2PA 3TTQA 2V5DA 1JZ8A 5HBFA 1E9LA 3MANA 1CGWA 2E9LA 3AYRA 1UR1A 2CITA 3AFBA 5D8ZA 5HDRA 4PUEA 4W85A 3ARXA 3L4WA 4TVUA 4FLQA 5I6SA 2XVGA 4YN5A 4F8XA 3UR7A 4MNMA 1E3XA 4LYRA 2DPEA 3JUGA 2CHOA 1TVNA 3ARZA 3VGDA 3T2OA 1J11A 4LPCA 5C8BB 1WCGA 1UWIA 2VX5A 3L4VA 4MNJA 3CO4A 3GBDA 3W26A 6TAAA 1FHLA 3M46A 4PMUA 2FHCA 4M80A 1DWJM 5ECUA 1JXJA 2VTFA 2ZX7A 3VNYA 8CGTA 1JFHA 5CLWA 1B9ZA 1J0YA 3D3AA 1M53A 4F9JA 4U5IA 3WQ6A 1B3XA 5ABFB 4UOZA 1JI2A 2D0FA 3EBVA 2ZICA 3VPLA 2J75A 1UZ4A 4J3TA 1UA3A 2MANA 2AMGA 1W2VA 2YLLA 2ZXDA 3N9KA 2WMFA 1NOUA 2PWHA 1UKTA 3QGVA 4J27A 2JIEA 1YQ2A 6CGTA 2B31A 2Y4SA 5I3DA 4MNKA 2DQXA 1QHOA 4AC1X 3WMSA 1LLOA 2XVPA 4PMRA 4GQRA 1EHNA 4PUDA 1OIFA 1V0LA 4EK7A 2D22A 5A2CA 1C91A 3CHEA 1UH4A 3VO0A 3SCQA 3AHYA 3A4AA 1E71M 4W86A 3POHA 4E4PA 4CD6A 1QI4A 1XD1A 4NRSA 1WP6A 2VVNA 1W3KA 2WKGA 1UQZA 3BGAA 2BHUA 2J8FA 2WVTA 1XH0A 4JHOA 4ZE4A 4MB3A 1UR8A 1V0KA 3ZT6A 1ECEA 3AIQA 2YBTA 2WLZA 3OLDA 3ARRA 4B15A 1GOKA 1S46A 1U30A 1FOBA 1V08A 1EOKA 1E6XM 4TUFA 2WSKA 4Z2HA 4PTMA 1H4PA 2WZIA 1EDTA 1VIWA 2ZX6A 1B3VA 1SR0A 5E6ZA 2VR5A 1GCYA 5A2BA 3TTOA 4D6EA 3VD5A 3FHQA 4UQDA 1CYGA 2YLAA 2J7CA 4XX6A 4CU6A 1AQMA 3DHPA 1ZBKA 1OGSA 2CXGA 3WUEA 2WZEA 3SUTA 3WBEA 3F5LA 1DWAM 2G3JA 4QLKA 1IV8A 1GHRA 1SFSA 3WBAA 4U2YA 4MADA 5CPQA 4ATLA 1A47A 1ZBWA 4PCSA 1BYCA 1K9FA 4FMVA 3VGEA 2G3MA 1V3HA 4YPJA 4XV0A 3L4XA 4OJYA 1EQPA 1J0ZA 3AZSA 1QBAA 1G9HA 1XH1A 1CIUA 1F4HA 3OZPA 3UG3A 4JHZA 3W6MA 3AROA 4CN1A 2EJ1A 3OZOA 3TTYA 1E55A 2YDQA 2WB5A 3NSMA 1HVXA 2A3EA 4W87A 1E3ZA 1BAGA 4HZ6A 1JAEA 3VD3A 2XVLA 1ZBCA 4UZSA 5JIPA 3WQVA 5BYWA 1XSKA 3SCPA 1QI5A 1C93A 3AMCA 1ODZA 3WL0A 1W3LA 2WWCA 3AHXA 3CUFA 5A94A 3FW6A 4CVUA 4JIEA 4IUGA 4CGTA 1V0NA 1K9TA 3ZR6A 2CEQA 1JYNA 1V3LA 1K6AA 4Z2IA 1KCLA 1ZB5A 1EGZA 1MYRA 1B31A 3SCSA 4AYSA 1VB9A 3ARWA 4GI9A 1HN1A 2VX7A 4AZ5A 1EO7A 1UWTA 1U33A 3RM9A 2ZUVA 4WSJA 5A6AA 3VD4A 5DO8A 4Z2JA 2YJQA 3BAXA 1UHVA 3U5UA 2D0GA 4OKDA 4D6CA 2Z1SA 1UKOA 1EQCA 2O9PA 4AMCA 1UH3A 1GOMA 3WF4A 3BLPX 3NDZA 4IPNB 1R8LA 1UQYA 1GVYA 1IZJA 2JE8A 5BXSA 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