3C0BA

Crystal structure of the conserved archaeal protein q6m145. northeast structural genomics consortium target mrr63
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
331
structure length
316
Chain Sequence
MILGIDIGGANTKITELHENGEFKVHHLYFPMDKLAEVLKTYSNDVSHVALVTTAEEGVDNILNAAESAFGSNISVFDSNGNFISLESAKTNKVSASNWCGTAKWVSKNIEENCILVDMGSTTTDIIPIVEGKVVAEKTDLERLMNHELLYVGTLRTPISHLGNTISFKGVDTNVSSEYFAITADISVVLEKVTTEEYTCDTPDGKGTDKRSSLVRISKVLCSDLDQISEIDAENIAKNYYELWKELILENVENVAEKYGSKKVVITGLGENILKDALADFEVISVAERYGKDVSLATPSFAVAELLKNELLEHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural genomics, unknown function
molecule keywords Conserved archaeal protein Q6M145
publication title X-ray structure of the conserved archaeal protein Q6M145.
rcsb
source organism Methanococcus maripaludis s2
total genus 87
structure length 316
sequence length 331
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-01-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01968 Hydantoinase_A Hydantoinase/oxoprolinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3c0bA01
3.30.420.190 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 conserved archaeal protein q6m145 3c0bA02
4BRFA 2E2OA 1YVNA 2A40A 4ISFA 4K41A 5BN8A 4Y0WA 2E1ZA 5AQIA 1DEJA 5EY4A 4B1WB 4CI6A 4XH4A 1C0FA 3CQYA 2E2QA 2CH6A 4BRMA 3R9PA 1ZXOA 3L4IA 2YHXA 4RWTA 2NLXA 4EHUA 1CZAN 4CD3A 3VENA 3ZX3A 3I33A 5ELZA 2D4WA 3VGKA 2FF6A 2A6AA 4FWKA 3AY9A 2WUSA 5EX5A 3FZFA 3O1BA 3H6EA 4BRGA 1SQKA 3H46O 2P9IA 3O5BA 5AQQA 2IIRA 3WT0A 5KQ8A 3ID8A 5AFUA 3UKUA 4IZ9A 1ZBSA 3IMXA 1YUWA 3UE5A 3ZX2A 1NGBA 1P8ZA 2E1YA 3FZHA 4CZHA 4DQ8A 3VEOA 3VF2A 2YHYA 4PL7A 1HKBA 3OHRA 4WYBA 2PBDA 3D2EA 3MN7A 5AQKA 3ZEUA 3CQXA 2QWQA 4BRCA 4DCHA 4BRIA 4BRHA 2V51B 3WXKA 2P9SA 3SMSA 3GOIA 3FE1A 3CHWA 3FLCO 4C23A 2I7NA 1U2VA 3BF3A 3MK6A 4BRLA 5FPDA 4I6MA 5AQTA 4KBOA 1RFQA 1X3MA 3IFRA 4BR4A 5AQLA 3G25A 2VWBA 4FPBA 3FR0A 1ESVA 1BOTO 2UYTA 5AZIB 2GUPA 4CZMA 3WQUA 5AQNA 4EHTA 3EKSA 2E2PA 4FPAA 3JS6A 3HZ6A 3R6MA 5AQGA 2P9UA 4EFHA 5LJVA 3A5NC 1E4FT 1SZ2A 3DXKA 4MO5A 3QICA 4JD2B 3GG4A 1HKCA 5JLHA 4FOEA 3A5MC 1C0GA 4BQLA 3DXMB 3HSCA 3SLCA 4FL9A 1HX1A 3CJCA 1D4XA 1BA0A 2QWPA 4PKGA 5F2RA 4A2AA 1V4SA 2QWRA 3HM8A 4RCHA 1KAXA 4H0PA 5JICA 2YI1A 3SK3A 4BC4A 5AQZA 3HBTA 3LM9A 1NGGA 4RTFD 3GBTA 3FZLA 1TYQB 3VETA 3WXJA 4QS8A 5ADXA 2Q2RA 3MN5A 1MWMA 4FWOA 3O6WA 3UKRB 3VF4A 1X3NA 5AQYA 2Q31A 1GLLO 1U6ZA 4K42A 4JN4A 1QQNA 3R8EA 3ULEA 4M63C 3LDPA 3CJ1A 4FWLA 3LDQA 1Z6RA 3QFPA 3QBWA 3L6QA 3O4WA 4B1UB 4CZFA 4IJAA 3C7NB 4JHDB 2KHOA 4H5WA 2QM1A 2IVNA 3VGLA 4BR2A 1TUUA 3JXUA 3A8YA 1QZ5A 1IJJA 1BG3A 1YXQA 2V7YA 2OANA 3FGUA 4GNIA 3HTVA 1RDWX 2QWMA 4MO4A 3VEYA 2P9LB 3WEEB 1V4TA 2FLOA 2A41A 5BPNA 4B1YB 3GDQA 3O80A 4FWNA 2GELA 2A5XA 4H5VA 1Z05A 2ASOA 3A5LC 2EWSA 2FSNA 3RSEB 1NGJA 3LDNA 2NZTA 5I9EB 2VYPA 2GWKA 4A62A 4B1VA 4H0TB 3DJCA 1GLDG 5AQRA 3MN6A 4J8FA 5AQJA 4BVOA 5AQXA 3U4LA 2AA4A 5FPMA 4EIAA 3VGMA 3QDKA 4PL8A 2GTDA 3B8AX 2YJFA 2D1KA 1NGIA 1T6CA 2DPNA 1NGHA 5FPEA 1GLCG 1NGEA 2P9PA 4BRAA 1ATRA 2HOEA 4BVPA 1JCGA 5F0XA 5LY3A 3WUHA 4IXCA 2NRHA 3QMLA 3O1WA 1E4GT 4XH5A 1MA9B 5AZJA 1GLEG 5TKYA 3DXMA 5EVZA 5FPNA 4CD1A 4PKIA 5E26A 3WXIA 2QWOA 1R59O 3W3DA 4AM7A 5BREA 3BP8A 4Z94A 4F9OA 2A3ZA 4IWVA 4M7YA 1T44A 1BU6O 3AARA 1TUYA 3I8BA 4BQZA 2ZF5O 3EN9A 2P9KB 5LJWA 5JLFA 1NGFA 1NGCA 1RGIA 4H03B 3BF1A 3LM2A 3ZEUB 2Q97A 1TYQA 4BC3A 2Q36A 2ASMA 5CE3A 2P9SB 1GLAG 1SAZA 1LCUA 1Y64A 2V52B 2HF4A 2VCPA 3MMVA 4IO8A 3ZETB 1K8KB 3D2FA 1QQOA 4H0XB 4NB4A 1U2VB 3S41A 3FZMA 4QS9A 1ZC6A 4JAXA 4CJ7A 2W41A 3TPQA 4WQ5A 1Q18A 2CGJA 3H3OB 4BRDA 1S3XA 1NBWA 4CZEA 3U8XA 4BR7A 2J4RA 1X9JA 4BRKA 1OKJA 2P9UB 2QWLA 5AQPA 3C7NA 4HWIA 2P9NB 4JHDA 4NO7A 2A42A 5KQDA 4A2BA 4QS7A 3QB0A 5AQSA 3ENOA 4YDUA 1G99A 4WQ5C 2ITMA 3L0QA 2PAVA 1DKGD 2CGKA 3TU5A 3GE1A 3KVGA 2QXLA 3WEEA 2E20A 4BRQA 1MDUB 1BDGA 4FWPA 3CETA 4L3QA 4CZGA 1WUAA 2ZGZA 2HF3A 4AM6A 5E84A 2W40A 2ASPA 4K25A 5JMVA 3M3ZA 4YDUC 3P4IA 1NGAA 4BC2A 1NWKA 3EO3A 1HPMA 4GY2B 4PKHA 2FXUA 3QBXA 3M1FA 5BR9A 4BREA 1YAGA 3UB5A 2V7ZA 1BWFO 2F9TA 3ATUA 4H5TA 2Q1NA 3BUZB 3U9ZA 2I7PA 3VESA 1MWKA 3ULEB 5BN9A 5BRFA 3MCPA 1J6ZA 4K43A 1BA1A 4BR0A 4FWRA 5AFUH 5AQFA 4BR5A 3FFKB 3FZKA 1QQMA 2YJEA 4BRPA 3J8AA 4CZJA 3F9MA 3VEXA 4DB3A 3LDLA 1NM1A 3KHYA 1BO5O 2HMPA 3M6GA 2YCHA 3EL2A 2E88A 3A0IX 4EAHD 4FOIA 4H5RA 4BGBA 5AQVA 5BPLA 4B1XB 4JNEA 5KPRA 3U9DA 3CERA 3MDQA 1GLBG 5AZIA 5KPZA 3EZWA 3VERA 2GEMA 1XQSC 2YHWA 2BUPA 3O08A 2D0PA 2CGLA 4B9QA 4BGAA 4O5FA 2BTFA 3BEXA 4FWQA 5AQWA 1IG8A 3VEWA 3WQTA 2FF3B 4JD2A 4XEIA 1EQYA 4CBXA 2P9IB 2P9KA 3H45C 2IVPA 1WOQA 3MN9A 4IJNA 1KXPA 2H3GX 3UKUB 4CBWA 1LOTB 3C0BA 1QZ6A 4WQ4A 1S22A 2Q0RA 2ZWHA 3HI0A 3IDHA 4E1JA 3ZETA 1ATSA 4A61A 1K8KA 2E2NA 3CI5A 3KZBA 3CJ9A 1NLVA 5BPMA 4BG9A 4XH1A 2E8AA 1XUPO 3D2EB 2CH5A 4FSVA 3VEZA 3WXLA 3DAWA 5AQUA 5EXWA 4O8KA 4DHYA 4WQ4C 5AQHA 4FWMA 4BC5A 4CZKA 1GLFO 2P9PB 5EOYA 1ATNA 4MLEA 4I6MB 3ZX0A 4H0VB 2Q0UA 3UKRA 3VEVA 1KAYA 2GWJA 3ATVA 2P9NA 1KAZA 4H5NA 4CZIA 3H1QA 4FWSA 4ISEA 1T6DA 2AP1A 4LC9B 5F1XA 3LL3A 3SJHA 1JCEA 4M7XA 3H1VX 3A5OC 5ADXH 5AZJB 5BRDA 1BUPA 1HJOA 3H3NO 4B1ZA 3ENHA 2FSJA 3EKUA 4ISGA 5AQMA 3QFUA 3LDOA 3DXKB 5BRHA 2FSKA 2QWNA 2F9WA 3DWLA 4CBUA 1QHAA 3AAPA 4H0YB 4CZLA 5AQOA 1GLJO 5B8HA 2ZGYA 1H1VA 1HUXA 1XC3A 1JCFA 3CJ7A 4HTLA 2IVOA 1HKGA 2P9LA 3AAQA 3SMPA 4BR9A 2D0OA 3CIPA 3D2FB 3O8MA 4BRNA 1HLUA 5KPTA 2QW9A 3VPZA 4BROA 4BG8A 3VF6A 3D7EO 3IUCA 1NMDA 1NGDA 4MLHA 4FO0A 4H0OA 3VOVA 3W0LA 3RSEA 3CJAA 3GL1A 5AR0A 1DGKN 3CJBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3VQPA 4BRFA 2E2OA 1YVNA 3CMEN 1RTHA 1C1BA 4Y0WA 5AQIA 1DEJA 5I42A 3IAYA 2VG5A 3LP2A 3OYJA 1SUQA 1KLMA 1WBBA 4XH4A 1KQSM 3CCRN 3NAEA 3CQYA 1Q81O 3TTFA 2CH6A 2BDPA 4BRMA 4DQQA 4Z4CA 4RWTA 1YHQN 4DFMA 4EHUA 5LMUK 3MAQA 5KI6A 1C0UA 1JLAA 3SAFA 5HBMA 3VENA 2HHXA 2A6AA 2OTLN 4TSXA 3L2RA 1K6YA 3H6EA 2OZSA 4CVNE 5KQ8A 3BZKA 3TAGA 5IT9O 4DTUA 3UE5A 5A2QO 1JLEA 4ZTFA 2O8CA 2KZMA 4YFUA 4AILC 4AHRA 2XY6A 2IOCA 1HKBA 3HPOA 3D2EA 5AQKA 1KCFA 4BRCA 4KHPK 4DQSA 3SMSA 3GOIA 4DS5A 4CJPA 3CHWA 1RTDA 4CJ5A 4CGGA 3BF3A 3MK6A 3KLHA 4JS5A 1TVRA 2A1RA 5AQTA 3VMFB 4Q0BA 3SUPA 3IFRA 3C6HA 3KK1A 3G25A 5C25A 2QXFA 2UYTA 4CJ3A 3J7YP 4G1QA 5AZIB 4CZMA 4WFAL 1YIJN 5AQNA 4GMJB 4CJSA 3PX0A 1QSLA 3M8QA 2WBNA 4R5PA 4IDHA 1RT4A 2NRRA 3DXKA 3HOSA 4DSIA 1O13A 1N33K 4A5AA 3AGKA 1RCHA 4LFAK 4JI0K 1NOZA 3OYEA 4ZHRA 1KVBA 1U48A 4B3SK 4JLHA 5C12A 1BA0A 5C10A 2HNYA 4ID1A 1HYVA 2QWRA 4DQRA 3TAPA 3L2VA 4BC4A 3Q7BA 4C8LA 3L4QA 3THWB 1NGGA 4RTFD 3FZLA 3VETA 5ADXA 3CCVN 3WXMB 4M3RA 1N34K 1RBTA 1HNVA 4LH4A 1FK9A 4FWOA 4DWIA 3K9JA 3O6WA 4YORA 4KRFA 2Q31A 5M1OA 1SKRA 1GLLO 1U6ZA 3PX6A 3R8EA 2JLEA 3CCJN 3LPTA 2Z1JA 2DFFA 3PV8A 4CHPA 3QNOA 3P1GA 3SQ0A 4J2DA 3QINA 3O4WA 5M1QA 2VWJA 4B1UB 3SZ2A 3AA2A 4X64K 1VQ8N 4AH9A 2IVNA 4IEEA 2LSNA 1S72N 1NNEA 4IOAL 3THXB 3DM2A 1IJJA 4MO4A 2OANA 2V7YA 4MDBA 1WAFA 2QWMA 2B6AA 2P9LB 4GKKK 4KREA 4EP4A 1BL3A 3SQ1A 4O8UA 5BPNA 4B9LA 4DTOA 1S1WA 3O3FA 1Z05A 2EHGA 3ENBA 4LD0A 2EWSA 3TTCA 3KLEA 1VQ9N 5SWMA 2NZTA 2VYPA 1NK6A 4CHZA 4B1VA 3DOLA 1YTAA 1I39A 1TK5A 3MN6A 4E1MA 3U3GA 3EY1A 2IC3A 3DYAA 2AA4A 5FPMA 2HHTA 1UWBA 3VQ9A 1NGIA 1T6CA 2DPNA 3K57A 3KLIA 4RG8A 4CFAA 2P9PA 3SNNA 1MU2A 2HOEA 3CC2N 5J2NA 1JCGA 4OKJA 1SL1A 4M3UA 4HUFA 1KVCA 3NCIA 1KVAA 5TKYA 5EVZA 4CJFA 1NJZA 2FBTA 4PKIA 4ICLA 1FW6A 3V6DA 1R59O 4KHNA 2W6LA 2G8VA 1RDDA 1M90O 2HBJA 3HP6A 1HRHA 2AJQA 3IKMA 4I2PA 3OYKA 3U3YA 4PY5A 3P38A 1REVA 5LJWA 1HNZK 4NLCA 5JLFA 1RGIA 2Z1IA 4IOXA 1N5YA 3S3OA 4KAZA 5CE3A 2P9SB 5C2DA 2W42A 1GLAG 3CFRA 3MMVA 2FBYA 1K8KB 4H0XB 3C94A 3LP0A 4NB4A 1U2VB 4CK1A 1P90A 1ZC6A 4JAXA 2OPSA 1BISA 4WQ5A 4E7IA 3H3OB 4OLAA 1S3XA 1JL1A 2UXBK 4DR4K 4PQUA 4BR7A 3I0RA 3P5JA 1X9JA 1D9FA 1OKJA 1LWFA 3PIOL 5FLXO 3C7NA 1TAUA 5AQSA 4Q5VA 2O4GA 3P39A 2PAVA 1DKGD 1TKTA 2CGKA 4CCHA 2G8IA 3TU5A 3DI6A 1IKVA 4FJMA 1BDGA 1NOYA 3F73A 4L3QA 3RTVA 4OKKA 4YOWA 3OBWA 4AM6A 1XNQK 5E84A 3NMUA 5M1FA 3OTOK 3TABA 1J53A 4OPJA 4DFPA 4FW2A 1GOCA 3EE9A 1HPMA 1NKEA 4PKHA 1RDUA 2FXUA 1JLBA 2XRIA 5BR9A 2P1JA 3D45A 4K8XA 4RW8A 4KPYA 4HUEA 3Q7CA 3RVCA 2D0BA 3U9ZA 2I7PA 1EX4A 1B9DA 1MWKA 3ULEB 5BN9A 1SV5A 4CGJA 3MCPA 1I94K 1J6ZA 3AVLA 5AQFA 4JRQA 3FFKB 3V1RA 1QQMA 3VEXA 4CE9A 4DB3A 1J5EK 3KHYA 1HR0K 4DV2K 2P51A 2HMPA 5M1NA 4QOZB 1RTJA 2YCHA 3LWLA 4O0IA 3VQEA 4M3XA 3K9KA 2NUBA 1YJWN 1VSJA 4B1XB 4AHSA 5HP1A 4CIFA 2NNWA 3CERA 3KD5E 4KKOA 4OLBA 5AZIA 5KPZA 3EZWA 5HOOA 1XQSC 3KLGA 4ILGB 2HHWA 1EETA 4GV3A 2BTFA 1VSLA 3BEXA 3O9SA 3VEWA 1IG8A 3WQTA 4AHUA 5GAEP 5M1KA 4DV4K 1EQYA 1KD1O 1KRPA 2ZE2A 3FFIA 2IVPA 3OVNA 1LOTB 5HRPA 1S22A 2X6SA 3HI0A 3G0ZA 3KK2A 2O8CB 1S5JA 1LWCA 3CJ9A 4BG9A 1KC8O 3THYA 4LF5K 3D2EB 3WNHA 3THWA 3V1QA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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