The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
64
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structure length |
64
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Chain Sequence |
PLDQPSCKALYDFEPENDGELGFREGDLITLTNQIDENWYEGMLHGQSGFFPLSYVQVLVPLPQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Endocytosis
|
| molecule keywords |
Endophilin-A2
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| publication title |
Crystal structure of the SH3 domain of rat endophilin A2
rcsb |
| source organism |
Rattus norvegicus
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| total genus |
11
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| structure length |
64
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| sequence length |
64
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-01-19 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2BZX A; 4D8D A; 1ZUK A; 2D0N A; 4HCK A; 3M0U A; 1EFN A; 3U23 A; 3SHW A; 2KBT A; 4JZ3 A; 4JJD A; 1BU1 A; 3QWX X; 1GL5 A; 2KT1 A; 3REA B; 1WLP B; 1T3S A; 2KRS A; 4J9F A; 3VS1 A; 2LZ6 B; 2CT3 A; 3UF4 A; 1GFC A; 2GBQ A; 2CRE A; 4R0K A; 2ABL A; 3JV3 A; 3EHR A; 1K4U S; 2J6O A; 2JM8 A; 1QCF A; 2EGE A; 2HDA A; 1H3H A; 3O5Z A; 3H0I A; 1SHG A; 3TSW A; 1ABQ A; 1RI9 A; 3RBB B; 2NWM A; 1NEB A; 1K1Z A; 2RQT A; 1WA7 A; 3THK A; 2OI3 A; 1K9A A; 4OML A; 4GBQ A; 5IHI A; 1PRM C; 1LCK A; 1NEG A; 1PRL C; 1HJD A; 3M0P A; 1OPK A; 2EGC A; 1T0H A; 1OPL A; 2PNI A; 1V1C A; 4OMM A; 2CSQ A; 2YDL A; 1GRI A; 1M3C A; 2J6K A; 2H8H A; 4CC3 A; 4OMO A; 2BZY A; 2O9V A; 2A28 A; 2JS2 A; 1E6H A; 2HSP A; 1KFZ A; 1X69 A; 2JS0 A; 1WIE A; 1QWE A; 1PWT A; 2VVK A; 1UJ0 A; 1VA7 A; 2KYB A; 2EKH A; 1PHT A; 4D8K A; 3GBQ A; 1VYU A; 1M3B A; 1B07 A; 3H0H A; 2J06 A; 2RMO A; 1QKX A; 4ESR A; 2LJ1 A; 2GTJ A; 4HVV A; 2RF0 A; 1W70 A; 2KXD A; 3EHQ A; 2K6D A; 2V1R A; 4IIM A; 2KRO A; 1H8K A; 2A08 A; 2GTO A; 4RTZ A; 2FPE A; 4Z8A A; 2M0Y A; 2L3P A; 1OV3 A; 1BK2 A; 2PZ1 A; 2RQV A; 4F17 A; 3R6N A; 4AFZ C; 1G83 A; 3I5R A; 4RTX A; 2O31 A; 4RTV A; 5IH2 A; 4HVU A; 2VKN A; 5I22 A; 1GBR A; 3NHN A; 1U06 A; 1H92 A; 2LJ0 A; 1WFW A; 1ARK A; 1U5S A; 1AZE A; 1X6G A; 1PNJ A; 4J9D A; 1ZLM A; 1AOJ A; 4JJB A; 2KEA A; 1JO8 A; 1JEG A; 3I5S A; 1B3Q A; 4LN2 A; 3M0R A; 3VS2 A; 1AWJ A; 1UE9 A; 3VS7 A; 2A36 A; 4LUD A; 5GJV B; 1AD5 A; 2K9G A; 1WYX A; 4J9C A; 3NMZ C; 4ORZ A; 2SEM A; 3UAT A; 2RQU A; 1HSQ A; 2FG0 A; 4CC7 A; 2V1Q A; 2EQI A; 1PKT A; 1SPK A; 3EGU A; 2VWF A; 2A37 A; 1UHC A; 5IXB A; 4IIO A; 4J9B A; 3PVQ A; 3A98 A; 2ROL A; 1RLP C; 3QWY A; 1I0C A; 1ZUU A; 1X27 A; 1FMK A; 2FRY A; 2W10 A; 1Y0M A; 2E5K A; 1NYG A; 2MOX A; 3NPF A; 2MCN A; 2EBP A; 4J9I A; 1QLY A; 2QDL A; 2SRC A; 2HEQ A; 3VS5 A; 1MUZ A; 2MIO A; 4Z88 A; 1UEC A; 1HD3 A; 1Z9Z A; 5ECA A; 2JMA A; 3C0C A; 2CDT A; 1YCS B; 4CC2 A; 1JU5 C; 1G2B A; 2OJ2 A; 4M4Z A; 3VRY A; 3REB B; 2CH4 W; 4Z89 A; 2DMO A; 4LUE A; 1N5Z A; 2DNU A; 2DL3 A; 2B86 A; 2RQR A; 1S1N A; 2LMJ A; 2FO0 A; 1WXB A; 3UA7 A; 1YN8 A; 1NYF A; 2DJQ A; 2ED0 A; 4RTY A; 1GFD A; 2EYW A; 3ULR B; 3UA6 A; 1BBZ A; 3KFV A; 2LP5 A; 2GGR A; 1U3O A; 5IHN A; 1RUW A; 1ZBJ A; 2W0Z A; 1T3L A; 1JXM A; 4J9H A; 3PE0 A; 4KRT A; 2DIL A; 3M0S A; 2DBK A; 1SSH A; 1UUE A; 4AFQ C; 4AG1 C; 2AKL A; 4LE9 A; 1CSK A; 1T0J A; 2LNH B; 3NGP A; 1I1J A; 1X6B A; 4GLM A; 1CKB A; 1YP5 A; 1WXT A; 3TVT A; 2CUB A; 3IQL A; 2FPD A; 4JZ4 A; 1M30 A; 2X3X D; 4A63 B; 3I35 A; 1Z9Q A; 2C0O A; 1I07 A; 1YWO A; 2ECZ A; 1WDX A; 1M3A A; 2BTT A; 2I0N A; 1AWW A; 2DE0 X; 1YNZ A; 4WCI A; 2EW3 A; 2JT4 A; 3TSZ A; 2EPD A; 2CT4 A; 4Y92 A; 2KE9 A; 2DLP A; 3CQT A; 4F14 A; 1X43 A; 2D8J A; 2JM9 A; 1K0S A; 2J6F A; 2K7A A; 1NM7 A; 1K76 A; 2LCS A; 1K0X A; 2KYM A; 3M0Q A; 2PTK A; 1UTI A; 3RNJ A; 3VS3 A; 1ZX6 A; 1AZG B; 4AFU C; 2CUD A; 1SHF A; 2EYZ A; 2EYY A; 5GJW B; 1GBQ A; 2IIM A; 4HVW A; 4E6R A; 1M8M A; 2EYX A; 1UG1 A; 2NUZ A; 1JQQ A; 4JPB W; 1QWF A; 1AEY A; 1GCP A; 2DRM A; 5HCK A; 1KJW A; 2L2P A; 3SEM A; 1ABO A; 2P4R A; 2DVJ A; 2XMF A; 1UFF A; 2L3S A; 2O2O A; 2YUQ A; 2K79 A; 1VYV A; 1TUD A; 4J9E A; 2ED1 A; 4K11 A; 3M0T A; 2DBM A; 4ZNX A; 2BZ8 A; 2KR3 A; 1KIK A; 2EGA A; 4FSS A; 2JTE A; 1X2Q A; 2LQN A; 1TUC A; 3H0F A; 2CSI A; 2AZV A; 4EIK A; 1ZSG A; 1E7O A; 1X2K A; 1J3T A; 3VS4 A; 1QKW A; 5IXF A; 3ZL7 C; 2D1X A; 1WXU A; 3EG3 A; 2M51 A; 1AWO A; 2YUO A; 1RLQ C; 2DL5 A; 4AG2 C; 1UJY A; 1VYT A; 5EC7 A; 2YUN A; 2CH4 A; 2O9S A; 1OOT A; 2AKK A; 1KSW A; 5FW9 A; 2LX7 A; 2J7I A; 1OEB A; 3I9Q A; 2ENM A; 2L3Q A; 2ESW A; 2ROT A; 3EG1 A; 2F2V A; 4DEX A; 4JJC A; 1W1F A; 1FYN A; 5IHK A; 1WX6 A; 2RPN A; 4OMQ A; 1NLP C; 2KXC A; 3PVL A; 4HXJ A; 2O88 A; 1ZUY A; 3EG2 A; 1SEM A; 1UGV A; 1BB9 A; 2FPF A; 1JXO A; 3VS6 A; 2DA9 A; 3H41 A; 1A0N B; 5I11 A; 2HBW A; 1UHF A; 2RQW A; 1XOV A; 1YWP A; 4CC4 B; 3VS0 A; 2AK5 A; 3VRZ A; 5FWB A; 1WI7 A; 2DYB A; 4AFS C; 3FJ5 A; 3LH5 A; 1SRL A; 5L23 A; 2LQW A; 2DX1 A; 2RN8 A; 1E6G A; 2DM1 A; 2D8H A; 1PKS A; 4RUG A; 2FRW A; 2KRM A; 1MV3 A; 2L0A A; 2YUP A; 1AVZ C; 4J9G A; 4F16 A; 4LNP A; 2DRK A; 2KGT A; 2C0T A; 2F2W A; 2RNA A; 1GCQ A; 1TG0 A; 2JMC A; 2KNB B; 2J05 A; 1CKA A; 4OMP A; 2DF6 A; 2LJ3 A; 4QT7 A; 2JW4 A; 1GCQ C; 2YSQ A; 1SRM A; 2C0I A; 2OAW A; 2FEI A; 2AZS A; 2DL8 A; 4RTU A; 2DL7 A; 3EG0 A; 4DEY A; 1UDL A; 2GQI A; 5FWC A; 2K2M A; 2HCK A; 4OMN A; 1Y57 A; 2F2X A; 2KT8 A; 2DL4 A; 4RTT A; 1W6X A; 2G6F X; 2JXB A; 2K3B A; 2EVR A; 1MV0 B; 1NLO C; 2KRN A; 1AWX A; 2YT6 A; 4RTW A; 2X3W D; 4X1V A; 2GNC A; 1M27 C; 1NG2 A; 1IO6 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2VAS A; 2BE9 B; 2BZX A; 1ZA1 B; 2PVO B; 5M9O A; 4BY6 B; 3U23 A; 5AYF A; 3SHW A; 2KBT A; 4JZ3 A; 4QQG A; 3OYJ A; 3V7C A; 2KT1 A; 2DER A; 2P4T A; 3INZ A; 4EMK B; 1R8O B; 1AHJ B; 1GFC A; 2E41 A; 3QPH A; 2ABL A; 3QYG B; 2ZAE A; 1MNE A; 3QII A; 1TSF A; 2J6O A; 2QAZ A; 3FIF A; 1OZ2 A; 2DD5 A; 1VQO T; 2VXF A; 4MMK A; 3QJY A; 1Q82 R; 4BD3 A; 4PJM A; 2NWM A; 1NEB A; 1M2O A; 4JRP A; 5LJ3 e; 1Y71 A; 2RQT A; 8ATC B; 5KYU B; 4OML A; 3FB9 A; 2YWW A; 1NEG A; 3CC4 A; 2OAU A; 3QYH B; 4C0F A; 1YHQ Q; 4M7A B; 1VQL Q; 4LD9 K; 2DEQ A; 4IUR A; 1IXD A; 4A54 A; 1Q86 R; 4L5G A; 2YDL A; 3MEW A; 1QVG A; 1M3C A; 1Q82 U; 2E3I A; 1BCM A; 4CC3 A; 1H3Z A; 3CC4 T; 1Y96 A; 2O9V A; 2RHI A; 4J7F A; 1B34 A; 1JJ2 A; 3X26 B; 1WIE A; 3G7Z A; 4ELY C; 4HCC A; 1G3W A; 4MDW A; 3A8M B; 1PCX A; 1XQH A; 1BI1 A; 1QP3 A; 2RMO A; 4ESR A; 4HVV A; 2GTJ A; 5CCA A; 2KI7 A; 1Q86 U; 3OYG A; 2K6D A; 2V1R A; 3JCM W; 1K9M R; 2A08 A; 1OUL A; 1MGQ A; 4PJO A; 3CBO A; 1HXD A; 5GAN h; 1VQ4 T; 1OV3 A; 1BYM A; 5FU6 C; 4M75 B; 3EGX B; 2WAC A; 2JVV A; 1VQO Q; 2VKN A; 2XI9 A; 1U06 A; 1H92 A; 1PD1 A; 2Y4Y A; 2NUP B; 1ARK A; 3CCE A; 1LJO A; 2EJG A; 2KEA A; 4C0G A; 5GAO n; 4OB1 B; 5EG2 A; 1K9M U; 4M7A D; 3QKJ A; 3OYB A; 4HT9 A; 4HA8 A; 3M0R A; 2DTH A; 4J7I A; 1OYX A; 3OYA A; 5I21 A; 3VS7 A; 3MEA A; 4LUD A; 4J9C A; 5GAM g; 1BIB A; 2ZPG B; 1TWB A; 2SEM A; 1TTH B; 4A4K A; 3CCE T; 4X34 A; 1VQN A; 3M5A A; 3CXC A; 1VQ9 A; 1Q95 G; 1RAB B; 3PVQ A; 3CC4 Q; 3PNW C; 2XU8 A; 4M77 E; 2M02 A; 2RK1 A; 4O5V A; 1KK7 A; 1FMK A; 1VQN T; 3CPF A; 3EG9 A; 2W10 A; 1Y0M A; 3MHX A; 1P92 A; 2E1H A; 4P5N A; 1QLY A; 2QQB A; 3QSU A; 2EQM A; 3VS5 A; 1Q81 R; 4XTW A; 3L2W A; 5KYY A; 4XAX B; 5KCO A; 2CDT A; 4CC2 A; 3D7S B; 1JU5 C; 4M75 D; 2OJ2 A; 4C8Q A; 3REB B; 3Q1J A; 5FRO A; 2OTJ A; 5GAN d; 3EFR A; 2RA2 A; 1VQ4 Q; 2DNU A; 1SKU B; 3A5Z B; 4M78 G; 4M78 A; 3JB9 F; 2FO0 A; 3UA7 A; 1NYF A; 2DJQ A; 5L8R E; 2ED0 A; 5FU7 C; 1FMW A; 1NJI R; 1VQ5 T; 1BBZ A; 1Q81 U; 2GGR A; 2OTJ T; 2CZ6 B; 5FLX E; 1LOJ A; 2R58 A; 5HK3 A; 3O8V A; 1QMC A; 2YRC A; 3SWN A; 1T3L A; 2QXF A; 1JXM A; 3PE0 A; 4KRT A; 2WSF E; 2MPX C; 4AFQ C; 4LE9 A; 1TH7 A; 1ZQ1 A; 1X6B A; 1IGQ A; 5CQY A; 1N9R A; 5D6X A; 2RO0 A; 2VUB A; 5LJ3 f; 1MMD A; 3HFN A; 1FXX A; 3CCE Q; 4LDU A; 3JCM P; 5D7U A; 3DB3 A; 4FW1 A; 2ZPI B; 4OP0 A; 2X3X D; 1M2V A; 3BE3 A; 1NJI U; 4FSX A; 1ZSZ B; 2C0O A; 1DJ7 B; 5KYW B; 5LJ5 j; 2BTT A; 1M90 R; 3L2Z A; 1BI0 A; 2HAX A; 4BDY A; 4Y92 A; 1WQ7 A; 1VQN Q; 3JB9 J; 2PVD B; 3GIB A; 3CC2 A; 2J6F A; 4XU3 A; 1K76 A; 4PJL A; 2JTM A; 2LCS A; 3UDC A; 1IRX A; 4E7H A; 4FL6 A; 2PTK A; 2F69 A; 3VS3 A; 1OQK A; 3QG1 A; 1SHF A; 4N4H A; 2BE7 D; 4DBR A; 2IIM A; 4HVW A; 3F70 A; 4E6R A; 1M8M A; 1D09 B; 1JQQ A; 2M16 A; 4JPB W; 1BCO A; 4QQD A; 4C92 G; 1M90 U; 3NFC A; 1QWF A; 3CC2 T; 5GMK l; 4F7U E; 3DB4 A; 2QTX A; 1HYO A; 2CP2 A; 1UFF A; 4XTU A; 3H9N A; 2LQ8 A; 3CCM A; 3UPU A; 3JSC A; 4J9E A; 2NLU A; 1X75 C; 2ED1 A; 4C0D C; 2P84 A; 1VQ5 Q; 1KIK A; 3I56 A; 2DIQ A; 1X2Q A; 2O01 E; 2OTJ Q; 2CSI A; 5KE2 A; 1X2K A; 1J3T A; 5IXF A; 1QKW A; 2I2L A; 3ME9 A; 1RLQ C; 2L89 A; 3AT1 B; 3FEO A; 1N9S A; 3CCM T; 3M54 A; 4KGV B; 2QQA A; 3L2U A; 1D0Z A; 5KYN A; 2CH4 A; 5A0L A; 3I56 T; 1I4K 1; 2LX7 A; 1PD0 A; 3I9Q A; 3OYN A; 1UB4 A; 3OYM A; 2VB6 A; 3EG1 A; 2FHD A; 4X9C A; 4KBM B; 3KUF A; 4DEX A; 5GAM h; 2QQR A; 4OMQ A; 1NLP C; 1K8A C; 4HXJ A; 1C6V X; 4M78 C; 2JZ2 A; 2O4X A; 4OB2 B; 2K3X A; 2DA9 A; 2VYT A; 1H64 1; 3RES A; 3H41 A; 1A0N B; 2G3R A; 2QDY B; 5I11 A; 4LDW A; 1YWP A; 2GQV A; 2FZG B; 3VS0 A; 2M9U A; 4C92 F; 1WI7 A; 3C12 A; 2CZ1 B; 3FJ5 A; 2EQJ A; 3SWN C; 4J83 A; 4N4G A; 2LQW A; 3TRE A; 2HQX A; 2JTF A; 5IAY A; 1RAG B; 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1D1A A; 4LD6 A; 1X6O A; 2GFU A; 3MET A; 3OW2 S; 3MJX A; 1YJ9 A; 1Q7Y C; 3MEV A; 4M77 D; 4PJO E; 4A4E A; 3SFM A; 4OMO A; 1QVG P; 2HSP A; 1YHQ A; 2HL3 A; 2JS0 A; 1PWT A; 1U1T A; 1I5O B; 1UJ0 A; 1VA7 A; 2WSC E; 3OMC A; 3E1S A; 2EKH A; 1PHT A; 4D8K A; 1YJ9 T; 1N8R R; 3JCM b; 1JJ2 P; 1JBM A; 1M3B A; 3JCM J; 2XKO C; 2J06 A; 4OMF B; 3PIO A; 5CKF A; 2DZC A; 2LJ1 A; 3J7A F; 1Y07 A; 2RF0 A; 1W70 A; 4JRQ A; 2RJD A; 3EHQ A; 2QGG A; 1YHQ T; 3OBW A; 2PU9 B; 1VQ8 A; 3X25 B; 4LXC A; 2M1H A; 2FPE A; 4Z8A A; 2M0Y A; 2L3P A; 2PZ1 A; 4F7U B; 4AFZ C; 2RK2 A; 1WHJ A; 4MZP A; 2D0Q B; 2EIF A; 3OYH A; 4OF1 A; 5A0D A; 2DD4 A; 5I22 A; 1N8R U; 4EPC A; 4BI8 B; 2XHC A; 2V8K A; 1WFW A; 1U5S A; 4PL6 A; 1VQ8 T; 1PNJ A; 2KMT A; 3VV0 A; 1ZLM A; 4JJB A; 1QVF A; 4M7A G; 5DLQ E; 4EMG A; 2OTL Q; 5CVI A; 5CO7 A; 2IPO B; 1PSF A; 3X28 B; 1B3Q A; 3V8J A; 3DKM A; 3ASK A; 3VS2 A; 1VOM A; 1AWJ A; 1UE9 A; 1VQO A; 1VUB A; 2A36 A; 5GJV B; 2K9G A; 1WYX A; 2HQE A; 4RG2 A; 3UAT A; 2FG0 A; 2HBP A; 4CC7 A; 3CCU Q; 4JJN K; 4E47 A; 2EQI A; 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