3C0JA

Structure of e. coli dihydrodipicolinate synthase complexed with hydroxypyruvate
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
292
structure length
291
Chain Sequence
MFTGSIVAIVTPMDEKGNVCRASLKKLIDYHVASGTSAIVSVGTTGESATLNHDEHADVVMMTLDLADGRIPVIAGTGANATAEAISLTQRFNDSGIVGCLTVTPYYNRPSQEGLYQHFKAIAEHTDLPQILYNVPSRTGCDLLPETVGRLAKVKNIIGIEATGNLTRVNQIKELVSDDFVLLSGDDASALDFMQLGGHGVISVTANVAARDMAQMCKLAAEGHFAEARVINQRLMPLHNKLFVEPNPIPVKWACKELGLVATDTLRLPMTPITDSGRETVRAALKHAGLL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Dihydrodipicolinate synthase
publication title Conserved main-chain peptide distortions: A proposed role for Ile203 in catalysis by dihydrodipicolinate synthase
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 106
structure length 291
sequence length 292
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.3.3.7: 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase.
pdb deposition date 2008-01-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00701 DHDPS Dihydrodipicolinate synthetase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3c0jA00
1FCBA 5HUOA 4LV4A 2E77A 3RK8A 2NUYA 4IQLA 2VOMA 4JX6A 2FDSA 1WBHA 3OBKA 4JYDA 4UTWA 1LOQA 1L9WA 2WKJA 4IX0A 1JULA 4IPIA 2QCGA 4BI7A 1K7EA 5C6MA 1TO3A 4UTUA 1B57A 1NF7A 2FPVA 4O17A 2QCNA 1FXQA 3IIPA 2FPYA 4P2VA 5E0KA 1TIMA 3PB0A 1TMHA 1MEWA 3IVSA 3BG5A 2V8ZA 4XTIA 4QISA 3LHTA 3LTPA 4PTNA 2H8ZA 3DZ1A 4HSOA 3UWWA 4HHPA 5AC7A 2A4AA 3W1TA 5CSRA 2ATSA 3FLUA 3QW3A 3W1NA 4MY1A 4MJZA 4OV4A 1HG3A 4QNWA 4R34A 1G4EA 1WOBA 3N2MA 1FUYA 5K9XA 5CPNA 1U83A 3E9AA 3C6CA 4H4IA 3LV6A 2WOQA 2O7SA 5DLCA 4E0CA 2YGYA 3E96A 1YLVA 1W5MA 1TPEA 1SW3A 2ATMA 2HS6A 3MP5A 2CFFA 3RU6A 1M6JA 4O57A 3W84A 1H62A 1YPIA 4ML9A 3NQEA 3USBA 4IXHA 1RZMA 2WNZA 1JUBA 3VI2A 3PVFA 3M5XA 3HO8A 2DZXA 3AO0A 2XN1A 2CWNA 3C2EA 3O6YX 4GNJA 1PHWA 3LCFA 2XN0A 3C2RA 3W88A 3SY5A 1RQHA 1EX5A 3NDOA 5D38A 3R5EA 3T40A 3QFEA 2X2GA 1L6WA 3WK3A 1W1ZA 3OHIA 3N9SA 2Q3OA 3TNOA 2EPHA 3LBMA 2ZQ0A 1QWGA 3DI1A 3FYPA 1ZY9A 3W22A 2QJIA 3GK0A 3R2GA 4FNRA 4TMCA 1XBZA 3PWAA 1W5NA 2EGZA 3RMJA 1LYXA 2R14A 3KVMA 5HMSA 3B0UX 3MHFA 1V7YA 1UBSA 3PAJA 1VR6A 2X1SA 3S0CA 4KFPA 4O13A 4IJBA 2GQ8A 4NX0A 4R33A 5F4WA 1P1XA 1W0MA 2LLEA 4DF1A 2QCCA 4NT0A 4M5PA 4EVZA 4JTEA 3W07A 1TV8A 1TJRA 3W1LA 5I3JA 4NJHA 2VENA 3OEXA 5HJLA 1G4TA 5FESA 4J9JA 3QMSA 4RX0A 2E6AA 1THFD 1TTIA 3TR2A 2FTPA 3F4NA 3O15A 3BV4A 1SQ7A 1YTDA 1W5PA 4Q33A 1FCUA 4XQ6A 4N02A 3MYOA 5LHFA 1Q6LA 2NV2A 4PCFA 5G1TA 3M1ZA 5HR6A 3P81A 4O1CA 4ORMA 3G18A 2CLMA 3O6CA 3HBLA 3BW4A 3U6WA 1DBTA 3DHFA 4TIMA 1KM0A 4GUIA 1EEPA 4W9TA 4S2BA 3TSMA 4TU1A 5CZTA 5D05A 3SI9A 4DELA 1SZEA 4JTUA 4OWGA 3NL2A 2Z6IA 4JY9A 1A5BA 3EX6A 4JTTA 5HNRA 1SPQA 4O50A 1YDNA 1KV5A 2OZ0A 3LCHA 2HTMA 1GZGA 1H7XA 1KBJA 2V82A 1IXNA 2RH9A 3O8AA 1EP2A 2G95A 1KM4A 1QFEA 1LRNA 3BLIA 1SW0A 3FKKA 2V81A 3NQAA 1XM3A 4DF0A 3QMTA 3LBCA 1SZGA 4LVAA 5A5WA 3W85A 2CLKA 1BKSA 1WV2A 2AAMA 4KFNA 4RV8A 3HB9A 1EA0A 4O16A 1TPDA 6TIMA 1IXQA 2B7OA 2DU2A 2NV1A 1ICPA 1FWTA 1IXOA 1WA3A 2BTMA 1VYRA 1PCKA 3T55A 3W7GA 4CNPA 4NXSA 2XFWA 4FIQA 5LSMA 5LGXA 2A6LA 2X30A 3M41A 5F2LA 3BK0A 4DBDA 4BWLA 2BSLA 3SFKA 2QCHA 5D09A 1XBVA 1TJPA 1QPOA 3K30A 1RR2A 4LWWA 1VQTA 2DZWA 2QUUA 3O07A 3QQ1A 4C1LA 3ATYA 4HPXA 1SO3A 3UPWA 2JKAA 3NEVA 4K6AA 4OE7A 4O1BA 1PIIA 4OV9A 4OBTA 1YTKA 2R94A 2O7QA 4UC5A 5FEPA 3G1YA 1S3HA 3TKFA 1FWNA 3WJWA 1W3NA 1PV8A 4I7UA 4M19A 3LCWA 4KKXA 3W7KA 2EAWA 1G69A 2A2IA 2NX3A 3G0XA 4K37A 1JRCA 4K36A 3TMQA 4UMCA 3U2OA 4O1AA 4NJJA 2JBMA 4S2CA 5HINA 4O8RA 5L9FA 4JNMA 3W7MA 1Z41A 1JQXA 3IGUA 4AF0A 3BGJA 5LNRA 3EWUA 3W2JA 1X7FA 3B8DA 3TH6A 1I8JA 1S5VA 3LRKA 3W71A 1ONRA 3MW7A 1I2NA 2NX1A 1OFDA 3MJYA 4A2SA 1Q3NA 1SSDA 4FNSA 3L66A 3L5LA 1H63A 2X1RA 4U28A 4O0KA 3PG8A 3HJZA 2C0AA 1JUKA 5C2XA 1NEYA 1FQ0A 1A5AA 4OT7A 2CLFA 2QEZA 3LM7A 1EP1A 4N9BA 4UTMA 3EWXA 3JR2A 3M9YA 3NQFA 3W7NA 4UNLA 5T26A 1NAL1 3PSWA 5C5YA 5HWJA 3HPXA 1XFBA 5EL1A 1FXPA 3KRUA 5G2IA 2CW6A 2I1OA 5DY3A 3PB2A 1XL9A 3INPA 4LS1A 5LKYA 4JY8A 2VEKA 5F4XA 3TW7A 3DFQA 5FEXA 4WOZA 3N19B 1KLZA 4JDBA 4RZ6A 3NZ1A 4A22A 5D37A 2A7PA 1UJPA 3ABOA 4DPQA 1SO4A 1TPVA 4JS3A 2ZZ5A 2FJKA 1KTNA 4AWUA 1UCWA 3TDFA 2ZFAA 4MZ1A 2G97A 4CLMA 1VCVA 5U7SA 4UMAA 3W2MA 1TYGA 4NJKA 3THAA 4NNCA 3LGEA 5LHEA 2XN2A 1XUZA 3W7CA 3M0ZA 3FKRA 4GUGA 2E5BA 2W79A 4NJGA 5G5IA 2Y7DA 3EX3A 4WD0A 3W9ZA 3G1VA 3PBYA 4K7YA 2DZUA 1WDWA 2ZA1A 4JR5A 3W7PA 1OYBA 1TB3A 4JTKA 1LM1A 4M7SA 4ZQNA 1KFCA 3FOKA 3IEBA 3P60A 4UTTA 4X3ZA 3UZ5A 3UWYA 4FB7A 1Q6QA 4N9CA 1EUAA 4AXKA 3E12A 3EWZA 4FHAA 3UWUA 3CEPA 4ZZ9A 3O06A 4FNUA 1OFQA 3TX9A 2J9ZA 3W76A 1TRDA 1QPQA 3ZFHA 4HNTA 2GJNA 1KM1A 1O5XA 5AHEA 2TMDA 1OFRA 5I3KA 5BW6A 4OGZA 2F84A 3LV5A 1BTMA 5CZSA 4GFSA 4UR8A 4PODA 1HO4A 4K8HA 3VCRA 5DXXA 3B05A 4FNTA 1HFBA 5AC6A 3TU9A 1XXXA 2CZDA 3D0CA 4TO8A 3H53A 1IXPA 4RK8A 5EYWA 2GOUA 3A22A 2ZTJA 1VGAA 3NPWA 1AW2A 4UMBA 2GVGA 4LUJA 4O28A 3GZ3A 1YXCA 1K03A 2YXGA 1QAPA 3MI2A 1N7KA 3B0VC 4UTIA 1F7BA 4O53A 4N9DA 1W3TA 5K4XA 3W73A 1KM6A 4GUJA 4Q32A 5BMWA 1WBJA 1KLYA 3IIXA 1ME7A 3C3NA 4FO4A 2DORA 4DXVA 4UFKA 4QQ3A 3TV8A 1H60A 5AB3A 4XWUA 1R2TA 2A6NA 2C13A 2ZA3A 4Z08A 5LNSA 1I2QA 4YL2A 5K2ZA 1LRQA 1T8XA 2A0NA 3G3DA 4LVDA 1ZJIA 2OJPA 1J4EA 1F05A 5ABTA 3STGA 4AAJA 3ELFA 3RNDA 2VFFA 3V75A 1LOSA 2ZZ1A 4JTLA 4QAIA 3P82A 4YCPA 3S8HA 3ABRA 3WJSA 4UXDA 4JTHA 2HSAA 1W5OA 4L4MA 3MO7A 2W0UA 2I14A 2B4GA 3HG4A 4EF9A 3JS3A 5CSSA 1GVFA 2DJLA 4H6KA 1R2RA 1MSSA 3HQ1A 2J88A 3PUDA 3S9YA 5AYXA 3QJAA 1WYIA 3ZS4A 4Z1BA 2JKEA 3JRKA 1ADOA 2VFIA 4Q4KA 3KRSA 1PE1A 1H7WA 1TSIA 2H6RA 3N2XA 3EWYA 4BI6A 3I7SA 5K4ZA 4POCA 3LHYA 4FEZA 4JTSA 1CX9A 2FIQA 3L0KA 1VJIA 3UXDA 3L9CA 2V2CA 1QR7A 3L2IA 2ISSA 4LVFA 2ISWA 3HMJG 2GPTA 1GVSA 1A53A 3IIZA 4NUWA 4BI5A 4D2JA 2ZZ6A 3GDMA 2GJLA 1UB3A 2QUTA 1DV7A 2P0OA 1GVOA 4Z0JA 3KXQA 3W83A 1XDMA 3L0GA 2VXNA 4EWND 3CB8A 3HIJA 2E6FA 1W5QA 1HO1A 2GVJA 3QQ0A 3GKFA 3TQVA 1X1ZA 3KOFA 5KZMA 4Y9AA 2A1YA 1K7FA 3T7VA 4IX2A 1E51A 3QF0A 4PH6A 4LU0A 1W37A 3OVPA 1H5YA 1G67A 3NOEA 2Y6ZA 2CLLA 5KMYA 5DBTA 3W23A 4K39A 4PL1A 5EA9A 2ZRUA 2VKZG 5L6UA 1OK4A 3NQ6A 4PFMA 4N2YA 3G1DA 3Q58A 1JQVA 5LNVA 2ABBA 3TJXA 3EXSA 5D30A 3LRMA 2YZRA 3C4UA 4MVAA 4TR9A 4NJIA 2Z6JA 1LBFA 3GDKA 2V30A 3O63A 3S6DA 4Z0SA 4M6QA 3TXZA 3T4CA 3N14A 4FX8A 3PULA 4ORIA 3BG9A 1TQXA 4X22A 1XUUA 3W87A 1GG0A 4CNOA 4JN6A 4DO5A 5CPMA 1SZFA 3M47A 3GAYA 3BGGA 2H8XA 3W7EA 1VHNA 1TPC1 4UIOA 1XBXA 2CLHA 4NVTA 3I68A 1Z42A 1O60A 5BOOA 3LI0A 3NQ2A 3SW6A 3EEGA 4MZYA 1EB3A 1XI3A 5CPOA 3W6YA 4WUIA 1JCJA 1S5WA 5EPDA 3W74A 4LUIA 2DZSA 2WQPA 3DU0A 4JXCA 3L5AA 4RCXA 5EBUA 4B5NA 3TSDA 4UR7A 3OVRA 2J24A 2NXGA 5G2WA 3TE9A 2PE4A 3NL6A 1DQXA 1KA9F 3G1XA 2QCMA 2ZZ3A 2NXIA 4NZJA 2Y70A 3PBUA 3R8RA 1XDLA 4GUHA 3B04A 3M5VA 2RFGA 3P84A 2ZRYA 4GBUA 3GKAA 2QDGA 1MEIA 4UFHA 3I7RA 4LC8A 3PS7A 1YXDA 1ZCOA 2C19A 4QM1A 4GXMA 3IIVA 1SUXA 3P8JA 3W2KA 4IWWA 1SO6A 1DQWA 2VEIA 2B7PA 3N73A 1R46A 4Z1DA 3Q2DA 3QPYA 2FLIA 5IBXA 3B4UA 1LCOA 1RVGA 2Y7EA 3MMTA 2C16A 4FX7A 3NVTA 2NXHA 5KZEA 3SIZA 1GEQA 4LTSA 4UTWC 1X1OA 2V2HA 3PUOA 4FF7A 4PC8A 4A29A 2NUWA 1MXSA 2Z0IA 1GTEA 1G7UA 2HS8A 5CG7A 3FS2A 1J2WA 1N8FA 4JTGA 2QJHA 1OFBA 2QF7A 1K02A 4O15A 2YPIA 3TK7A 4ZL1A 3W70A 3LI1A 3WK0A 4WJEA 2RKXA 2P10A 3GIYA 5J5DA 5D03A 2E09A 5LNWA 2NLIA 3PBWA 1H7RA 3L0NA 4WOQA 2J9XA 3HPZA 3MI6A 3PR2A 2TSYA 4AF0B 4ALDA 3S1XA 2H3DA 4LNYA 1YYAA 2WSRA 3G1HA 3UQNA 3YPIA 3NQCA 1LTDA 1DVJA 1ME9A 2ZZ2A 4RJEA 8TIMA 1YPFA 3I7QA 3KFTA 5EMUA 3DH7A 1NFBA 4ZMGA 3P67A 4KFOA 1I4NA 4IXXA 5KITA 5J5RA 2ZRVA 1KTBA 1KM2A 3QW4B 5DCEA 1JJKA 1O94A 1B4KA 3N9RA 1VH7A 3QPZA 3SSJA 1W54A 4JIQA 1W3IA 2QCDB 2B7NA 1ZHAA 2CZ5A 4YWIA 5A8GA 3QH2A 2DZPA 3EWWA 1WQ5A 4QSHA 3FJ6A 4LW7A 1B3OA 2EKCA 4RZ4A 1YDOA 2C15A 2CZFA 5DBUA 4O19A 4MFDA 1GTHA 1K3UA 1QDSA 2W6RA 3QYQA 3TJLA 5EKYA 2CLEA 5HQEA 3P5ZA 2Y7GA 3ABSA 4CCEA 4DPPA 3GAKA 1SO5A 5KZDA 1GQNA 4A2RA 5C55A 1OFAA 1W56A 3MBFA 1H7OA 2ZCGA 3GB6A 1OF6A 1TTQA 3G0SA 1UUOA 3IGSA 4IMFA 3CIWA 4DF2A 3NQ7A 3M5ZA 2X1TA 1OFEA 2C6QA 3L5MA 4ZQCA 3HGRA 3UWQA 2KZHA 1LORA 1M7PA 5C54A 1SFLA 3W86A 3NO5A 2D73A 3PBVA 5TQLA 1A5SA 5KTLA 5K9DA 1VRDA 1KFEA 3GDTA 4IGHA 4N4QA 3VE9A 1FDZA 4O4WA 4IUOA 1ME8A 5G4EA 3RFAA 4FNPA 4K7VA 2QR6A 5FF4A 4DBEA 2A21A 3B0PA 3I65A 2DJXA 2OX1A 1WXJA 3CM4A 3LHUA 5G4WA 2YFNA 4JYFA 3BW2A 4MKNA 3CIXA 3DFSA 2GUUA 2V2DA 3CWNA 4CQ9A 3KVKA 5AHFA 3KHJA 1PCWA 4ADSA 4ZVJA 3IV3A 2QCDA 1AMKA 3G8RA 5D2VA 2E6DA 5K7JA 2QCFA 5FEZA 2Y7FA 2HMCA 1K8ZA 3H54A 3TMLA 2GVLA 5AOUA 3IRDA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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