3C13A

Low ph-value crystal structure of emodin in complex with the catalytic subunit of protein kinase ck2
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
328
structure length
328
Chain Sequence
GPVPSRARVYTDVNTHRPREYWDYESHVVEWGNQDDYQLVRKLGRGKYSEVFEAINITNNEKVVVKILKPVKKKKIKREIKILENLRGGPNIITLADIVKDPVSRTPALVFEHVNNTDFKQLYQTLTDYDIRFYMYEILKALDYCHSMGIMHRDVKPHNVMIDHEHRKLRLIDWGLAEFYHPGQEYNVRVASRYFKGPELLVDYQMYDYSLDMWSLGCMLASMIFRKEPFFHGHDNYDQLVRIAKVLGTEDLYDYIDKYNIELDPRFNDILGRHSRKRWERFVHSENQHLVSPEALDFLDKLLRYDHQSRLTAREAMEHPYFYTVVKD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
molecule keywords Casein kinase II subunit alpha
publication title The Catalytic Subunit of Human Protein Kinase CK2 Structurally Deviates from Its Maize Homologue in Complex with the Nucleotide Competitive Inhibitor Emodin
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 112
structure length 328
sequence length 328
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2008-01-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3c13A01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3c13A02
3SG8A 4MWHA 5A4EA 3R7EA 3RM7A 4A9SA 3CIKA 4FNYA 3QTRA 1H08A 4D4RA 3LLTA 4KIOA 1DM2A 3H10A 4MYGA 5AIKA 4PX6A 3CKXA 2QOLA 4QMTA 4R5SA 5ANGA 5AR3A 1NY3A 3ANRA 3Q32A 4FSTA 5AP5A 1ZYSA 1IR3A 3G51A 2PE1A 3VS6A 4K2RA 4FVPA 4FMQA 1F5QA 3GU7A 2YAAA 4ACHA 3CQUA 3R9OA 1URWA 4F1OA 5BVNA 2VWIA 4A9TA 4M67A 4E8AA 3UO6A 4FEXA 3CQEA 3R01A 3RK5A 3R28A 3AQVA 1Q4LA 3OF0A 4NU1A 4JS8A 3ACJA 3V5TA 3EFLA 4QMQA 5HORA 4MBJA 5CAOA 3FZRA 2HW6A 1PXPA 2A2AA 2OFVA 3P1AA 1PY5A 5IQIA 4DE4A 1PXLA 3VBXA 2PVKA 4FEUA 2VWXA 3JVSA 4DGGA 3EQGA 4MCVA 4XOZA 3LFSA 3UDBA 3W8QA 1IA9A 4UX9A 4R3RA 3V51A 2J0JA 5KX8A 5HVYA 1W8CA 1VR2A 4QP2A 3FMHA 4I20A 5HI2A 4FV8A 3JUHA 5EDQA 4FG8A 2C68A 3O8UA 4BKJA 4CFWA 3ZS5A 3PG1A 4QNAA 5DVRA 5AR8A 3LCSA 2W17A 2O8YA 4CKIA 4FODA 1H8FA 4G17A 2QO7A 4FV7A 5HEZA 1GOLA 5IKWA 3ENHA 4G3GA 3A60A 3OWPA 3KK9A 4JQ8A 1ZOHA 4RVLA 3R8ZA 2E9NA 3FYJX 1YDSE 2WMXA 4FK6A 3ZEWA 4BCNA 4OTRA 4BL1A 3ORZA 4WKQA 2IG7A 4RWIA 1OIYA 2RSVA 3KF4A 4O0TA 5HG5A 5IH5A 5KHWA 4TN6A 3E3PA 3VBTA 3CTHA 2E2BA 4TY1A 5E8UA 3FKLA 2XIYA 4ASDA 2C5NA 2QONA 2J9MA 4JLCA 4BIBA 2C30A 2B52A 4PP9A 4ASZA 5HKMA 5IA4A 2B4SB 4L9IA 1VEBA 5EI2A 5C1QB 3VRYA 2O5KA 2FH9A 4IJ9A 3PLSA 2XRWA 5CEKA 2C5YA 5FWKK 4L3LA 5CEQA 3U9NA 4E6CA 1H26A 3BGQA 4L8MA 3SA0A 3FMNA 3UQFA 3MYGA 3FI4A 3ACKA 3Q9XA 4E6DA 4C2VA 4JOAA 4ZSEA 4MNEA 2PYWA 5A4CA 3G15A 4FIIA 3RHXA 2R3HA 4WG3A 1M7NA 4FICA 3D2KA 4XV9A 5EKNA 2WMBA 3E87A 3ZO1A 4AW1A 5DE2A 4HVHA 2OG8A 5BYLA 4YURA 2XK7A 5CU4A 3DJ7A 3FUPA 4TYHA 4BKYA 2GNLA 4X2NA 4G6NA 4FEVA 1DAYA 4HJOA 1WZYA 3TUDA 3PVWA 3HAMA 3K5VA 4B0GA 4DEEA 3OOGA 5CI6A 3QC9A 1EH4A 4XG4A 4CEGA 4O7RA 5IQEA 4UWCA 2X7GA 2RGPA 4CMTA 2C6MA 3OZ6A 4G16A 3BHVA 3TV7A 2WOTA 3SHEA 3ZC5A 4BB4A 3O96A 4FBXA 3LXNA 3ZMMA 5IQHA 4LGGA 3O8PA 3PLAE 1GIIA 4M68A 1PF8A 4GSBA 3PA4A 5J9YA 3AGLA 4YHTA 3FLYA 1JSUA 3O71A 4JRVA 4NTSA 3VQUA 1JAMA 2ZMDA 3T3UA 5BVFA 3EJ1A 4HYHA 3UIBA 1XH4A 4N0SA 3LMHA 4MBIA 3S95A 1H07A 4V0GA 4GW8A 5TOZA 3R9HA 3FMJA 3PYYA 4F0IA 1I44A 3PXYA 2X81A 3MTLA 3KREA 3A61A 1CKJA 2B0QA 2WMVA 3VW8A 4ARKA 1B38A 4PPCA 3FPQA 1MRVA 3GVUA 3PA3A 1XBBA 2R3PA 4H3PA 2XK3A 4L46A 4S30A 3HDNA 1MRYA 2HOGA 2ZV7A 3A7GA 1UU9A 4RLKA 4Z9LA 2GQSA 2QVSE 5JK3A 3I6UA 3RK9A 3NVKI 4LMUA 3HECA 1PJKA 5AUWA 5I9VA 1OL6A 4Y5HA 4HVIA 3BRBA 3LIJA 5LMBA 4L45A 3F3VA 5J87A 4NKSA 5E92A 4JG7A 4TKSA 4AT3A 4YJNA 4USDA 2J50A 5CAQA 3NMUF 3DKCA 4FNWA 4U9AA 5BUEA 2ZM4A 2PE0A 4B9DA 4MHAA 4LGDA 4A9YA 4EEVA 1LPUA 2XIRA 4XG7A 3HV4A 3Q4UA 1Q3WA 3A7IA 4I41A 5HOAA 2R3QA 3A2CA 4JDKA 2QOFA 4FK3A 3F2NA 4ERKA 1GIHA 4UWBA 3R7VA 5EK7A 1H1PA 1G8SA 3ULIA 5AIRA 1MP8A 4X3FA 3UMXA 1OB3A 1ZYLA 3QQHA 1OUYA 4AGCA 5AEPA 3C9WA 2YDJA 4DEDA 4XJ0A 2GQRA 3QRJA 2CGXA 2OF4A 2ITQA 2R0UA 5L2WA 1JQHA 4IANA 1OL1A 3Q4CA 3CD8A 4K11A 2WMTA 3RVGA 4AZEA 4Y5QA 3WIKA 4BDKA 3VHEA 4RVKA 3FI8A 1IRKA 4O7NA 2CN8A 2F49A 4G34A 2WU6A 5TKDA 4ANOA 5EOLA 5B0XA 2GNIA 5ANKA 4Z3VA 3QGYA 4YBKA 1SNUA 3QLFA 3LJ0A 4DFNA 1J91A 3CGFA 5EHOA 5LVOA 3UYTA 4HYUA 3Q52A 2YCRA 2XIXA 4K6ZA 1YOLA 4LFIA 4M13A 4RJ6A 2QKWB 4PWNA 4DTBA 2VX3A 1A9UA 4FKPA 5JFXA 4IWOA 5KBRA 4HOKA 2OLCA 3NPCA 4KSQA 1QPEA 4R1YA 2GPHA 3LE6A 2ZVAA 4KKHA 3RPOA 3WBLA 3VUDA 4CCBA 5CF5A 5CAPA 3FXXA 1B39A 2YA9A 3HVCA 3PIZA 4RQKA 5JGDA 2Z60A 4CFUA 4RJ3A 1WVXA 3AGMA 3N51A 3A62A 1CTPE 4XRJA 4C7TA 4U3YA 5EQYA 3OWJA 3AD4A 4PDYA 4AWIA 4RFYA 2QQ7A 4YHJA 1Q8ZA 2W1ZA 4TRLA 3EFJA 4BCGA 2YM8A 3GQLA 2F2CB 1BUHA 4M97A 4CZUA 5BUJA 5DT3A 3C5IA 3P78A 3QCQA 4J99A 3QRKA 3HRBA 2UZBA 5M4UA 3EHAA 3VUHA 2J2IB 3OW4A 3E63A 3H30A 4YLKA 2PVRA 1BX6A 4CFFA 3KRLA 1B6CB 3FQSA 4OTQA 1YI3A 3IONA 5ETAA 5AP3A 4MXAA 4WBOA 2O64A 1KE5A 3C0HA 4FTIA 4O6LA 1GNGA 4ZSJA 5CLPA 5E8VA 5AJQA 2B9JA 4Z55A 2Q0BA 2YACA 4YZ9A 3UODA 3Q9ZA 3OW3A 3BHUA 4QPSA 5DRDA 2V5QA 3FI2A 5AV3A 5CQWA 3NAXA 2R64A 1U4DA 3GCPA 1OKWA 4FTTA 4ZJIA 5J7BA 1KUTA 3EQDA 3IW6A 1LEWA 4G2FA 1GAGA 2VWWA 3VS0A 5M57A 2XK8A 2WKMA 1Z5MA 1GJOA 4BZNA 3ORNA 4NFMA 4LUDA 2OFUA 5JFWA 3JS2A 4QQTA 4K77A 3PSDA 1OMWA 2IZTA 4C3RA 4F6UA 3DT1A 4E5BA 3QQGA 4KRCA 2C5VA 4IBMA 4EOKA 2CKPA 4EZ5A 1M7QA 1CDKA 2P4IA 4R1VA 4APCA 4RJ5A 2XA4A 3QTIA 4AT4A 2ZDTA 2BZIB 4HVGA 4FTRA 3DDQA 5EG3A 4BTKA 4YZBA 1F0QA 4QYFA 3HMOA 5DNRA 5HBEA 4CMOA 4EH7A 3LFEA 4GK4A 4UY9A 4C4HA 3SV0A 4RVTA 3R7YA 4EH9A 3DTWA 3BELA 4XG9A 5HCXA 4O1OA 4I0SA 4MVFA 4IVDA 4ZZMA 5TT7A 5LOHA 3FXWA 4D58A 2XEZA 2PTKA 4FF8A 2ZMCA 3HUBA 5HX8A 4JBQA 4AZSA 3I60A 3LVPA 5FP6A 4OW8A 5EH0A 3GCQA 3F3TA 4JNWA 3PJ3A 3LXLA 2IVUA 4FA2A 2VWVA 3DA6A 2CHLA 4BRXA 1VZOA 5AUXA 5JGBA 4MBLA 5FTGA 3MY1A 4KABA 3UO5A 3LKMA 5IQFA 4AW2A 5D7AA 4C61A 4Z7GA 4ONAA 5LVPA 3HAVA 4I22A 3ZU7A 3PXQA 5J9LA 2ZYBA 4MF0A 2J0IA 3VBVA 5I4NA 3NUAA 2XIZA 3G0FA 4FG7A 3NCGA 3W8LA 4ZY4A 3HV7A 1FMOE 5K5XA 2UW3A 3D4QA 2XM8A 3DQWA 4NKAA 4FV1A 1CKPA 2G9XA 3KXHA 2C6IA 4IAAA 3H9OA 4OTWA 2YISA 3BQCA 2BFYA 3H4JA 2X8IA 4UWYA 3R6XA 3QZFA 5H8EA 4FTNA 1Q8WA 4WRSA 3R04A 2VTOA 3MV5A 1T46A 1M17A 2OK1A 4FKQA 4RIOA 4RVMA 2BRHA 5D12A 2CMWA 4L7SA 2J51A 4ZLZA 3ZO2A 5E8TA 2C6LA 2P33A 2XF0A 4FVQA 4WHZA 4B99A 4EZ7A 4IFCA 1UNHA 3MVMA 1FOTA 4F6WA 4HGSA 2CKOA 1P5EA 4EKLA 3LQ5A 4IB3A 1KV2A 5CNNA 5EM7A 1FGKA 1JLUE 5J5TA 4V01A 4BC6A 5GNKA 5J8IA 5H2UA 4ACMA 3QD3A 4L01A 3SW4A 5AR2A 1CSNA 4D2WA 3SW7A 2ZAZA 2NP8A 3AC4A 4IH8A 2OXYA 5AAEA 4H3BA 2JGZA 5T68A 4U40A 3ALNA 4PNKA 2BTRA 2GNFA 2UZOA 4EWQA 3IG7A 4PPAA 4YSJA 5AUTA 4R78A 3LQ8A 3UIXA 3PRIA 3BBTB 4C2WA 2YIWA 1JKTA 3IDBA 4FT5A 3BEGA 4ITJA 3ITZA 5IPJA 4GG5A 2Y6MA 4XS2A 3TCPA 3V01A 4YMJA 5KMLA 2YIQA 4CKJA 4O2ZA 3GUBA 2AYPA 2HZ4A 4WT6A 1TQMA 3QC4A 5CALA 3O23A 4RIWA 3DY7A 4R8QA 5CEIA 2CNVA 3QTSA 5AX9A 4Y8DA 4FIFA 4P90A 4A4OA 3KVWA 3AC3A 4G3FA 2YAKA 4IMYA 4BZDA 2IVTA 5DBXA 4BDFA 5J9ZA 5EQEA 3HGKA 2PHKA 3C4EA 3CLYA 4IB0A 2XYNA 4K8AA 2A0CX 5EYKA 1BL7A 2C3JA 5EI6A 3TEIA 1YVJA 4FTQA 3IKAA 2QODA 1W0XC 2VTIA 3P7AA 1XO2B 3R00A 4ZMFA 2XK4A 3UNJA 4O7TA 5ETIA 2JBPA 4M69A 3TJDA 3W10A 4F6SA 1IG1A 4H39A 3QD2B 2ITOA 5A54A 1Q8YA 3ZRLA 4RJ7A 3UBDA 3MFTA 4I5PA 5IA3A 3TT0A 5KE0A 3RBWA 4D1ZA 2X2MA 1OL2A 4OT6A 4XHKB 2CCHA 3Q04A 4D1XA 2VWUA 4QYEA 4UMTA 1JPAA 4XYFA 4FE2A 4PDSA 2YZAA 4GU6A 1YDTE 2HYYA 3QUPA 4AOJA 5BUIA 3DK7A 3TG1A 2YDIA 1YOJA 5KMMA 5L6PA 2JITA 4DCAA 5FQDC 5HG7A 4OTIA 2PY3A 1MQ4A 3FMMA 4GV1A 5F9EA 4FSQA 4FYNA 3F5GA 4EOQA 2VUWA 4AA4A 4C35A 3TDVA 4QTEA 4IZYA 2EVAA 1ZMUA 3WF6A 5I3RA 4UB7A 4Z7HA 5AP6A 4UXQA 4KS8A 3FL4A 2C47A 3NIEA 4K1BA 4BGHA 2OJJA 4J97A 5A4QA 1PMVA 5DT4A 1RE8A 3EFWA 1WAKA 2QO2A 4G1WA 4QP8A 4R7HA 3QA0A 4XNEA 3Q4ZA 3VWAA 3VJNA 4O21A 1VYWA 3O0GA 4CCUA 2ETRA 1FGIA 1KSWA 1XQZA 4H58A 3HRCA 2AC3A 4DH8A 4DEIA 5DYJA 3T9IA 1K9AA 4FSNA 3UVPA 3ZZWA 3HEGA 3DBEA 4LOPA 3UVRA 2WHBA 4AA0A 3VBQA 2B9FA 4E6QA 4UMPA 2GTMA 4FV6A 5BYYA 5HTBA 2VTTA 4MX9A 1E1XA 4ALWA 4PDOA 5M53A 3BGZA 4DTAA 3NUUA 3CGOA 2XNEA 3BLRA 4I94A 2UVZA 2P3GX 4G3EA 5E8XA 5BVOA 4R6VA 3NZ0A 3F9NA 2E9PA 3QHWA 4J8NA 5CF6A 1MUOA 4S2ZA 3II5A 5IQAA 5AP7A 4GCJA 4LM5A 4AFEA 5JEBA 1SM2A 2R0IA 4L52A 4AS0A 1SVGA 3LM0A 2QOKA 4G5PA 5DR6A 2W9ZB 3PJ2A 4EHEA 4YZDA 3ID6C 2PVMA 2CKEA 4FEQA 1OPKA 4QNYA 3U51A 4CVAA 5D1JA 2CCIA 3QF9A 3ODZX 4RA5A 5CVHA 3BPRA 4DBNA 3TI1A 2FVDA 2PK9A 4G3CA 4MXXA 4P5QA 5ANDA 3OXIA 3GC7A 3VF8A 2WTVA 3LXKA 5J79A 1PXNA 3F3WA 1Y6BA 4AW0A 2DYLA 4BGGA 3EZRA 4JL9A 3LJ2A 5AM7A 3R9NA 1U46A 2OO8X 4BI2A 4IC7A 3CE3A 3EQCA 2J6MA 3HL7A 4RMZA 3PXRA 4R77A 2WO6A 4FC0A 4YPDA 2HY81 4ZEGA 4QT1A 4DA5A 4IWDA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3SG8 A;  4MWH A;  5A4E A;  3R7E A;  3RM7 A;  4A9S A;  3CIK A;  4FNY A;  3QTR A;  1H08 A;  4D4R A;  3NFF B;  3LLT A;  4KIO A;  1ST0 A;  1DM2 A;  3H10 A;  4MYG A;  5AIK A;  4PX6 A;  3CKX A;  2QOL A;  4QMT A;  4R5S A;  5ANG A;  5AR3 A;  1NY3 A;  3ANR A;  3Q32 A;  4FST A;  5AP5 A;  1ZYS A;  1IR3 A;  3G51 A;  2PE1 A;  3VS6 A;  4K2R A;  4FVP A;  3AKL A;  4FMQ A;  1F5Q A;  3GU7 A;  2YAA A;  4ACH A;  3CQU A;  3R9O A;  1URW A;  4F1O A;  5BVN A;  2VWI A;  4A9T A;  4M67 A;  4E8A A;  3UO6 A;  4FEX A;  3CQE A;  3R01 A;  3RK5 A;  3R28 A;  3AQV A;  1Q4L A;  3OF0 A;  4NU1 A;  4JS8 A;  3ACJ A;  3V5T A;  3EFL A;  4QMQ A;  5HOR A;  4MBJ A;  5CAO A;  2ZFY A;  3FZR A;  2HW6 A;  1PXP A;  2A2A A;  2OFV A;  3P1A A;  1PY5 A;  5IQI A;  4DE4 A;  1PXL A;  3VBX A;  2PVK A;  4FEU A;  2VWX A;  3JVS A;  4DGG A;  3EQG A;  4MCV A;  4XOZ A;  3LFS A;  3UDB A;  3W8Q A;  1IA9 A;  4UX9 A;  4R3R A;  3V51 A;  2J0J A;  5KX8 A;  5HVY A;  1W8C A;  1VR2 A;  4QP2 A;  3FMH A;  4I20 A;  5HI2 A;  4FV8 A;  3JUH A;  5EDQ A;  4FG8 A;  2C68 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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