3C2FA

Crystal structure of the quinolinate phosphoribosyl transferase (bna6) from saccharomyces cerevisiae complexed with prpp
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
294
structure length
267
Chain Sequence
PVYEHLLPVNGAWRQDVTNWLSEDVPSFDFGGYVVGSDLKEANLYCKQDGMLCGVPFAQEVFNQCELQVEWLFKEGSFLEPSKNDSGKIVVAKITGPAKNILLAERTALNILSRSSGIATASHKIISLARSTGYKGTIAGTRKTTPGLRRLEKYSMLVGGCDTHRYDLSSMVMLKDNHIWATGSITNAVKNARAVCGFAVKIEVECLSEDEATEAIEAGADVIMLDNHFLLECSGGLNLLCDDIDIYSTSSIHQGTPVIDFSLKLAH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase
publication title Comprehensive X-ray Structural Studies of the Quinolinate Phosphoribosyl Transferase (BNA6) from Saccharomyces cerevisiae.
pubmed doi rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 91
structure length 267
sequence length 294
ec nomenclature ec 2.4.2.19: Nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating).
pdb deposition date 2008-01-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01729 QRPTase_C Quinolinate phosphoribosyl transferase, C-terminal domain
A PF02749 QRPTase_N Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3c2fA02
3.90.1170.20 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aldehyde Oxidoreductase; domain 3 Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain 3c2fA01
4UTWA 4PTNA 3GLCA 3CEUA 5CKSA 2QJGA 4ZVJA 4CQ9A 4FX8A 4ORMA 3DXIA 3LB0A 4WOZA 3AO0A 4YL2A 1Z42A 3F03K 4UMBA 2Y7DA 4XUGA 1IGSA 2NWRA 5I3HA 4YMZA 1FCQA 3EWUA 4M7TA 1B3OA 1VH7A 3DZ1A 4JTFA 2QUVA 4PL2A 3C2FA 4UMCA 3L66A 3N14A 3CT7A 4GWEA 4A2SA 4PEKA 4LU0A 1J2WA 3NQGA 4N9BA 1SZGA 2FB2A 4K37A 4ZQPA 5K4ZA 2WSRA 1T8XA 3W07A 3KXQA 2Y88A 1FXPA 1GT8A 3PM6A 1JCJA 1VHCA 4GBUA 4WY0F 2G96A 3JRKA 5DLCA 4Z0JA 3G8EA 5CSRA 4ZQMA 4A2RA 2HS8A 3W7QA 1W37A 4O52A 1PHWA 4O17A 3A23A 3A5VA 2R91A 3OA3A 3QQ1A 1MZHA 2CZEA 2E6DA 3DFQA 3LCFA 2VFEA 1OX5A 1WDWA 2A21A 3EWZA 5BMWA 1U83A 2V2HA 4ZQNA 4D2JA 3BG9A 5A8GA 3MUXA 4JN6A 4X2RA 3IIOA 2VFFA 3SFKA 1TPFA 4QNWA 2TSYA 3VFLA 1FWSA 2FJKA 4JXCA 4O0ZA 5LSMA 3N34A 2VELA 3B4UA 1EA0A 4O1DA 1C29A 1FDJA 2QCGA 3GDMA 3S9YA 1SW7A 4LS2A 2I9EA 4GJ1A 4ZL1A 1A5CA 3NQMA 4FO4A 2C1HA 3Q94A 5D30A 3M41A 3G1VA 2GVGA 4HNUA 5J5DA 4WUIA 1YDVA 1MXSA 4UTTC 3ZWSA 3WFAA 2B7OA 3DKJA 1LOSA 4I7VA 4LUJA 4YLWA 3A22A 3OHIA 1MO0A 2VFDA 2HMCA 4IMEA 4DQWA 3QSRA 3UWQA 5K9DA 1ICQA 2J6XA 1K8XA 4LC8A 4O1CA 2ATSA 5U4NA 3TAKA 4WJEA 2EKCA 1UASA 2QCHA 3N19B 2A2IA 5FF3A 3GX9A 3W7IA 3BG5A 3R8RA 4JTJA 2DJLA 4GUIA 4IX0A 4DPPA 2ATMA 2QAPA 2QCEA 1KM4A 5HWNA 2C18A 3HGJA 2CLIA 3PAJA 3F4NA 4DELA 2OZ0A 3NL5A 2Z0IA 5E1QA 1JRBA 2ZQ0A 3W1AA 3G1SA 3GDRA 5HMSA 2DJXA 2H8ZA 3GXNA 2NUYA 5LNRA 2O7QA 1LOQA 3G1AA 2PURA 5FEZA 3DH7A 3O07A 4MZYA 4IWWA 2OJPA 1XBYA 5I3IA 4FF7A 1LROA 2VEIA 1DVJA 4PA8A 4RK8A 3KRZA 4DPQA 2P10A 1SW0A 1WXJA 4Y90A 4WY0A 3E12A 4RJEA 5AHIA 2ZRZA 4O16A 2VKZG 3UY7A 2C0AA 3LX9A 3NPUA 1KV5A 1GEQA 1GTHA 3QMRA 5E93A 2DZWA 5IBXA 3BO9A 3LDVA 2YYUA 3M5YA 5D2XA 3LTYA 5G1YA 5H91A 1F73A 2J9XA 1W1ZA 3HGRA 4NUWA 3S5ZA 2XN2A 4CLMA 3O6DA 4EWND 3FIGA 3R12A 4WXYA 1TTPA 1JRCA 4MUZA 3VCRA 3W1RA 2I1OA 5CZSA 2NUWA 3W7MA 2AQWA 1WQ5A 5F2GA 3W2KA 4JYEA 4OWGA 3LLFA 1R2TA 1HO1A 3E49A 3CPRA 2C3ZA 1UB3A 1J4EA 3CIWA 3A24A 3LBMA 1P4CA 2GPTA 3G0XA 4Z1AA 4RCXA 3PS7A 1UUMA 4UIOA 1YDOA 1KM0A 1OX4A 1MSSA 2VEMA 3FJLA 1W5MA 5CSSA 2DORA 1RQBA 2BZNA 3DFOA 5DCEA 3EXTA 3DHDA 2GJNA 2JK2A 4DO4A 3NNTA 3U6WA 1GVRA 3PR2A 4MOZA 1B4KA 1KM6A 3HG3A 1QPRA 1V7YA 1M7PA 1JVNA 4LNYA 3W1XA 5AYXA 3LHWA 5FF2A 5G2IA 1NAL1 4MKNA 6TIMA 1XKYA 4YCPA 1W8SA 2A1YA 1G69A 4UTKA 1C9DA 3ATYA 3QQ0A 3S1UA 1Q45A 4NJHA 3LCWA 3EWWA 3MP4A 3BGGA 2Y89A 2UV8G 2PCQA 1QWGA 1TV7A 1L6WA 3OBKA 3EX1A 4LVGA 5F1VA 5AYZA 3QC3A 1KFEA 1GOXA 2G5WA 3PULA 3O15A 4GC4A 4AF0A 2QCDB 5F2MA 5D38A 1AW1A 3QH2A 1EEPA 1AL8A 3UWUA 4FNTA 4N2YA 2YPIA 3ELFA 3W88A 3DFNA 2CFFA 1DV7A 3L2IA 1R2RA 3FJ6A 1F7BA 4UFMA 1T0OA 4JTKA 4R33A 4ML9A 3G1FA 1GWJA 3C3NA 1AG1O 5MHBA 3LRMA 2FDSA 4WX2A 3P60A 2Y63A 3TMLA 1TV8A 1X1ZA 3DAQA 4XZ9A 4J9JA 5D32A 3SJ3A 1KLYA 3VI2A 2QF7A 3CC1A 4WY0B 1O5XA 2JKAA 5G4EA 4RR4A 2A6NA 1TO3A 1YTKA 3LV6A 3HF3A 2Z6IA 2ZA2A 1S3HA 3TROA 3LTSA 3BGJA 1ZJIA 2CU0A 2PRMA 2ZZ2A 3MYPA 4MFEA 4MYAA 2X1TA 2V0TA 2O7SA 4JGDA 1DHPA 3A9IA 3Q58A 3CHVA 2Y62A 1NF0A 4X22A 1X1OA 2Y6ZA 3UXAA 4CQ8A 1SO5A 2DZPA 4N6FA 3LCLA 3DFPA 4JNMA 1OFAA 5D03A 8TIMA 3KVKA 3B0VC 2J9YA 4GE8A 2VFGA 1I2NA 5BRBA 1HUVA 1LTDA 4H4IA 1XUUA 1N55A 3NM3A 4KFNA 3KVMA 3L5AA 1TQJA 1KFCA 4O13A 3NQDA 3TSDA 1GVSA 2TYSA 1VR6A 2V2CA 4Y8FA 2QUUA 1T99A 1LM1A 3ATZA 4Z1CA 1TREA 3S1XA 2LLEA 1VCFA 4UTLA 4XBSA 1XDMA 3PSVA 1XL9A 1VCVA 1FCBA 3GB6A 4GUGA 1OX4B 4X9SA 3I7RA 3EXRA 1XI3A 4LRSA 4A22A 3NAVA 4M19A 4UXDA 2CZ5A 4OBTA 5AB3A 3MI3A 5IBXC 1KM2A 2BWGA 3NL6A 1KTCA 1U5JA 3B04A 2ISSA 5G5IA 1EWEA 2A7NA 4AH7A 4CCCA 3HMJG 2EGZA 4JDBA 3C2OA 3TC7A 5FF4A 3KVLA 3TAOA 3C2VA 1TRIA 1LRTA 3S1VA 1JJKA 3W22A 3ABOA 2C13A 1FY6A 1SO3A 1YXDA 1PIIA 1TCDA 3MP5A 4NZJA 4POCA 4AWSA 5DN1A 4JTSA 3CU2A 4Z0SA 4KWWA 1KTBA 3THAA 4MYXA 1FCVA 3FKKA 2ZZ5A 3GDKA 4LVDA 1YADA 1DQXA 1OYAA 4AF0B 3IIXA 2V9DA 3MI2A 1KW1A 3LGEA 2GQ8A 1OABA 1W3TA 3KRUA 3YPIA 5FEWA 1LORA 1OFQA 4UTTA 1KM5A 2V82A 1ZAJA 2WNZA 4ADUA 4HSNA 1OFPA 4RKAA 1CX9A 1WBJA 2EPHA 3I7SA 3T78A 5BOOA 3ANYA 1M5WA 2NX9A 1YTEA 3TQ0A 2WO5A 1T96A 2WPBA 1I2OA 2E09A 2EAWA 5DELA 4BR1A 1NF7A 5D2TA 4WQ6A 3SZ8A 1GZGA 1LLZA 2A5HA 1OG0A 3NDOA 4MFDA 4ZQOA 3QMTA 4EVZA 4ZMGA 3NGJA 1PV8A 2E77A 4LTSA 4IXXA 3OVQA 5K9XA 4N9DA 2ABAA 3NQ8A 4HPXA 3PB2A 4AAJA 1ALDA 5EA9A 2OT1A 3W73A 2V81A 3MJYA 1OFEA 4LWWA 5G4WA 3TSBA 2BXVA 5I3KA 2JBMA 2ZRUA 3TQKA 5CZ0A 3QJAA 1HFBA 2HTMA 2Q3OA 3BW3A 3W7GA 2JKEA 3M9YA 3P82A 2XN0A 1DKWA 1OK6A 3BV4A 2VOMA 1GTEA 3M43A 3TJXA 4TMCA 4FIRA 4GXMA 1G4SA 1ZNNA 1JCLA 1SR9A 5AOUA 5K9CA 4AVFA 3LM7A 1YTDA 4Y6GA 5K7JA 4O53A 4FB7A 1W5QA 2C14A 2DP3A 4UFJA 1LYXA 3W7KA 4PC8A 3N3MA 4FX7A 3KRSA 5FI8A 1AK5A 2ZRYA 3M16A 4JTLA 1EX5A 1N8FA 2VEPA 4BF9A 3GNDA 1UUOA 1VZWA 2W79A 1G4EA 3W86A 4CNNA 3C2RA 3SIZA 2Q8ZA 3W1QA 4I7UA 2NV1A 2QR6A 3TU9A 2WOQA 4RXFA 3LHZA 3OG3A 3IIVA 3IGXA 3NQVA 4RZ4A 2YR1A 3EX3A 3VE7A 1F05A 3PBWA 3IIZA 1Q6RA 1BWKA 3FA5A 3TC6A 1ICPA 1ZHAA 4O28A 4OE7A 2DZSA 3D0CA 5ABTA 1L2UA 4GRSA 5HR6A 1RR2A 2EHHA 2FFCA 3TV8A 3EXSA 4O57A 5DY3A 2F84A 1TPUA 2P1FA 4O1BA 1ADOA 3W1PA 2CLKA 2V8ZA 3P67A 4JTTA 2H3BA 1XM3A 3T44A 2RDWA 1IF2A 2I14A 1YDNA 3EWXA 4JS3A 4O8RA 1IXOA 3BW4A 1NEYA 3T4CA 2X1UA 1BWLA 1W3IA 4Z1DA 5G2HA 3NA8A 3M5ZA 3LOTA 3QRHA 2CLLA 4DF2A 1VQTA 3W85A 2NX3A 4DF1A 4UCGA 4Y96A 3TX9A 3L0GA 3W7RA 4JX4A 3PSWA 2QAFA 4QSHA 1QO2A 3TW6A 3HPXA 3OEXA 4XBKA 4H6KA 1H62A 1X8FA 3DU0A 4LVAA 3O6YX 1TPWA 3S5OA 3P61A 1VYPX 1VC4A 4CNOA 3NYZA 3T55A 1S5TA 3HBLA 3TNOA 2HS6A 1NSJA 4UTJA 2E68A 3EX6A 2A7RA 4AHOA 1O94A 5CPMA 1WA3A 1K03A 5HJLA 4K8EA 4L4LA 2C6QA 1IXPA 2HSAA 5I3JA 1G67A 5F4WA 1N7KA 3EKZA 1GVQA 5E0KA 1A53A 4MY9A 2OCZA 1QPNA 5KINA 1KM1A 3N73A 4UMAA 3NXFA 1PHQA 4RXGA 4CNPA 1SO6A 5D2WA 3W7DA 4UUIA 4JTUA 1LRQA 4NNCA 4OQVA 3OVRA 4BI7A 4WXZA 5J5RA 2C19A 3W83A 4O10A 5I3GA 4LV9A 2V5LA 2QJHA 2NZLA 1KBIA 5EMUA 4O4VA 4IUOA 4O1AA 1XDLA 1BTMA 3B0PA 3TA6A 4EOUA 3SGZA 3E9AA 3GDTA 2QCDA 4DBEA 1SO4A 4JTEA 3GAKA 5BNKA 3P84A 4UNKA 1I2QA 3NPVA 2Z6JA 3C8FA 4QITA 3W7HA 4FNQA 4LVFA 4B5NA 3NQ7A 3A5FA 1EP3A 2X1RA 1JULA 2E6YA 1A5AA 1SW3A 3G8RA 4DO6A 1VLWA 1G4TA 1GJPA 2B4GA 4GUFA 3C6CA 1SSDA 3PWAA 3W74A 3SY5A 3P5ZA 1XBVA 4O14A 3LCGA 4KKXA 5AC7A 4LOCA 1OJXA 1TRDA 3H54A 5TBOA 3ZFHA 4FNSA 5BW6A 4S2CA 1WAUA 3IVUA 3KOFA 5KSWA 1OX6A 3N2XA 3KAOA 4MY8A 1PE1A 4NX5A 3IRDA 4P61A 1ML1A 2Q8LA 1DQWA 5C2XA 2BSLA 3CWNA 2RHGA 3HG5A 3S0CA 4RV8A 3NQEA 3CEPA 2YX0A 3WJZA 3I68A 1DL3A 3PBUA 3UWVA 4NT0A 2A0NA 4HSOA 5TIMA 3T40A 3WK1A 1Y0EA 3EEGA 4I7WA 3UXDA 3QM3A 4Z1BA 3AJXA 3C2EA 1HG3A 4M6QA 1QOPA 1W5OA 4MVAA 5DCDA 3LTPA 4IMDA 3KX6A 1QFEA 3FS2A 4M6PA 3S5YA 4HKPA 4WD0A 1P0KA 3LHVA 4AWUA 2B7NA 3RNDA 1B57A 4WZHA 3W2UA 3PUEA 1ME8A 3HG4A 2CLEA 4IQLA 5HWJA 3P74A 1O95A 4N6EA 4XTIA 1TV5A 4KFPA 3DFSA 2NXGA 1K7FA 4FXRA 3IIPA 3FOKA 1G7VA 3MP3A 4G1KA 4OGZA 4QQ3A 4OT7A 4PH6A 5HR7A 2FIQA 5G1TA 1YXCA 3GZ3A 4LW7A 4JDYA 1J5TA 3VKJA 1AW5A 3W7PA 2E5BA 3DI0A 3GNNA 1RPXA 3G0UA 1DORA 3UWZA 1FWTA 3ZR4A 1ME7A 3NOEA 1D3HA 5F2LA 1ZALA 3BARA 3GR8A 1GPWA 3WK3A 3IV3A 2NXIA 1KFJA 3W75A 1F5ZA 1TTJA 2V5BA 1R30A 2X16A 1QPQA 5D2VA 4E2DA 3JR2A 2ZFAA 2QUTA 3G24A 1JCXA 1HTIA 3HPSA 3P62A 1XCFA 3MWAA 4E0CA 2AGKA 3I7QA 3ABSA 4UTIA 2CLHA 5LNWA 3G3MA 5AHNA 4MZ8A 2GQAA 1TQXA 3W76A 1KLZA 5G2WA 2J27A 3LERA 3E02A 3H53A 2EF9A 3LHTA 1QOQA 3DI1A 1FBAA 5FESA 2YDAA 1B4EA 3STGA 3GAYA 5KZEA 2B0MA 2QKFA 4ZZ9A 2GJLA 2ZRVA 1VHNA 3W84A 1O60A 1M7OA 2G95A 3G1XA 2RKXA 4IPIA 3TFCA 3W23A 1X7FA 4UC5A 2Y70A 3TUUA 3HO8A 1EIXA 1TSIA 4A29A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3FFS A;  4UFI A;  5LGZ A;  3B8D A;  3Q2D A;  1TPC 1;  1OHL A;  2E5C A;  2RDT A;  4UFK A;  4HHP A;  3BVJ A;  3SI9 A;  1K7E A;  2NLI A;  2FB3 A;  1VGA A;  3EX4 A;  3QMS A;  4NJI A;  4PCF A;  4BWL A;  4R7J A;  1BEU A;  3QST A;  1L6Y A;  1ICS A;  1KFL A;  3DFT A;  2TMD A;  4PFM A;  1PCK A;  2H6R A;  3NG3 A;  2H3D A;  4JY9 A;  2V2D A;  3TIM A;  2QCF A;  1TPB 1;  3GIY A;  3WK0 A;  1RD5 A;  4YWI A;  7TIM A;  3M6Y A;  5EBU A;  1LP6 A;  4JEQ A;  3P7Y A;  4O15 A;  5CPN A;  4UTM A;  4FNR A;  1L9W A;  4AMA A;  3GXT A;  4LY8 A;  1H7O A;  5CG7 A;  3HJZ A;  4UFL A;  5DBT A;  3S5N A;  3STE A;  3INP A;  1GG1 A;  2E6A A;  3W7C A;  1EUN A;  2QDH A;  3GKF A;  4LT9 A;  3DBP A;  2NXH A;  3GKA A;  2A4A A;  4O12 A;  3O1N A;  1F74 A;  3W9Z A;  1O4U A;  5CZT A;  3TFX A;  2VXN A;  4OHQ A;  1JQV A;  2A6L A;  2Y7G A;  2NWS A;  1EP1 A;  2B7P A;  3N2M A;  4JIP A;  3NQ2 A;  4EF8 A;  1BKS A;  3NPX A;  2R8W A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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