3C3NA

Crystal structure of dihydroorotate dehydrogenase from trypanosoma cruzi strain y
Total Genus 109
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
109
sequence length
311
structure length
311
Chain Sequence
CLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCSTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAVPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase
publication title Crystal structure of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase from Y strain
pubmed doi rcsb
source organism Trypanosoma cruzi
total genus 109
structure length 311
sequence length 311
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date 2008-01-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.26.10 Mainly Beta Roll Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2 Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2 3c3nA02
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3c3nA01
5LGXA 3C2FA 3I6RA 4MJMA 3IGXA 2Y7EA 4LV9A 4JTSA 1OYBA 1FDYA 3QRHA 1W56A 4MLRA 2A7PA 5DY2A 2FJKA 2ZRYA 1BWLA 1SQ7A 2DZXA 2OCZA 3W85A 1F6PA 1MO0A 3W1QA 3TXVA 3W1PA 1HL2A 4KFNA 3HJZA 4JTGA 3SZ8A 4Z1AA 3WK0A 3FS2A 3PR2A 3G3MA 4HT3A 3HMJG 1O4UA 1NSJA 3JRKA 3DH7A 1H7XA 2HS6A 4YMZA 4O57A 4QIUA 2CWNA 4EOUA 1ME9A 1ZJIA 5EKYA 1CX9A 2PCQA 3W7QA 1C29A 3IGSA 1FQ0A 4OU1A 3F03K 5FESA 1W54A 3LRLA 5I3IA 2YR1A 1OVDA 4R7JA 4WUIA 4ZQOA 1K7EA 4TMBA 4AWUA 1G4PA 4O13A 4UFMA 3W7IA 1TMHA 1EPXA 4S2CA 3LI1A 1N8FA 4Y96A 2FDSA 5F4XA 2CU0A 3CQ0A 1GVQA 3STFA 1DVJA 1H1YA 3HG2A 3IIVA 4DF1A 3TSBA 5KSWA 4IUOA 3P81A 1M7PA 1VGAA 5KMYA 1JUEA 4QM1A 5MHBA 3W7MA 1QFEA 3WJYA 3W6YA 4WOZA 4JYEA 4HNVA 2UV8G 4LC8A 4YWIA 1OABA 3HG3A 2P10A 5CPLA 1IXPA 4LS1A 1ICSA 3L68A 3GXTA 4NZJA 2GVJA 3S6DA 2HS8A 2EF9A 3HO8A 2E5CA 1W3NA 2FB2A 4IJBA 3BW3A 3NL3A 1Z44A 3N9SA 4DEFA 1ALDA 3UZJA 1QPOA 1GG1A 2R14A 3W1RA 3SGZA 1W31A 3LCFA 3LTYA 2O7SA 5CZSA 2J24A 1XBVA 3BGGA 3LGEA 1F7BA 2DP3A 1VCFA 2QDGA 4RV8A 1W3TA 2I9EA 2DZPA 2CLKA 4IQLA 3TDFA 3P82A 4H6KA 4O19A 5FI8A 2CW6A 3EKLA 3UXAA 4WY0B 1RVGA 5BNKA 1XFBA 3OHIA 3CM4A 3PB0A 1ICQA 1UASA 3HIJA 4UTUA 3ZFHA 4LVBA 5A8GA 3G1AA 5EA9A 3O15A 3N34A 4CNPA 1W8SA 1H61A 4J9JA 3R2GA 5G1YA 3HPZA 3R13A 1YXCA 4Z0JA 3SJ3A 4HPXA 4MVAA 3B0UX 2DJXA 3HF3A 1F74A 4CCEA 1LROA 3TKFA 2F84A 1I8JA 2Y62A 1YDVA 1K8XA 3ZWTA 4JTIA 2WNZA 1I2RA 5HJLA 4FO4A 2ZZ1A 4N4PA 1KFKA 2HMCA 2YXGA 1TPH1 3IVSA 1KM0A 2VC6A 3S0CA 3DHDA 2ZRUA 2QF7A 2OZ0A 4XZ9A 2ZRWA 2NUXA 1YDNA 3SIZA 3MI3A 4QISA 2OJPA 2I14A 3PSWA 2J6XA 2YFNA 2NX3A 4NJKA 1V7YA 4ONVA 1FUYA 4R53A 1WA3A 3QSRA 4IPJA 4MY9A 1X7FA 2BZNA 3TX9A 1TPC1 4TX9A 3LHZA 1VJIA 1OK4A 3P80A 4QJ1A 3CEPA 2Y89A 2PRHA 4K8EA 3NQEA 5F4SA 3O05A 1SO3A 4N9BA 4UFHA 3AO0A 3NQFA 4ML9A 3W87A 3P7YA 3LBMA 4PCFA 5AHMA 3C4UA 1SSDA 5C54A 3W1UA 2A6NA 1JQVA 1ZHAA 3MHGA 2NLIA 4FF7A 2GQAA 4E38A 3SI9A 2Y88A 4IX0A 1RQBA 4FX8A 2YDAA 5TIMA 1XBZA 4OV9A 4YCOA 2Z6JA 2H90A 2BSLA 3GNNA 1SR9A 3KFTA 3UWVA 3VI2A 3NEVA 5G4WA 5C55A 5E0KA 4D2JA 2ZFAA 3MHFA 3R5EA 4CNOA 1K02A 2C16A 2WSRA 2A21A 3G1HA 4UTJA 4HN4A 4X2RA 4LRSA 4O4WA 4FNRA 3YPIA 4LNYA 3B06A 3TUUA 5FEZA 4MY1A 2ZTJA 1OX6A 4PL1A 4JN6A 1GVSA 1SO4A 3QMRA 3LXAA 2E77A 3GDLA 1FWWA 1J2WA 5AHFA 4O1DA 3W7JA 4JEQA 4IMCA 2C15A 1K3UA 1JULA 1NF7A 3FJ6A 4Q32A 3VCRA 3DFOA 1O94A 1AL8A 3WK1A 4RJEA 3FKKA 3S5OA 1G4TA 4E2DA 3W2LA 3M1ZA 2WSYA 5F2GA 1DOSA 1C8VA 4NVTA 5D2WA 1H51A 5AB3A 1X1ZA 1TRDA 5CPOA 1GYNA 3KRZA 4PA8A 3F1QA 2BX7A 3MYOA 3V75A 3G1SA 3QEZA 5DN1A 1AL7A 2WQPA 3O07A 3W73A 3W7OA 1H63A 5K9CA 1LRTA 2EHHA 4XKYA 5AC7A 3LV5A 1FWNA 1VLIA 3EX3A 1X1OA 1U83A 2V8ZA 4FXSA 4Z1DA 4H3DA 4UMCA 1UUMA 3W84A 1DL3A 3HGRA 5FF7A 5D33A 1JCYA 1H1ZA 3SSJA 4M6VA 3WFAA 1GJPA 5EMUA 3NDOA 2NXGA 2B0MA 4BI6A 1AW2A 2NX1A 3KRUA 3PUDA 2RDTA 1BWKA 1VYPX 2C14A 4GXMA 4JX4A 3LTSA 5DELA 1XI3A 5K4XA 3SGUA 1D3HA 1SSGA 4UMBA 3W76A 4GUGA 3ANYA 1BTMA 3ABQA 1F2JA 2WNNA 3EX1A 3QC3A 3LI0A 3GDTA 4UFKA 3LHYA 1C9DA 1IXQA 1TRIA 3NM1A 3GXPA 4O10A 1GVRA 1JUKA 1W1ZA 1PHWA 4NQ1A 1GTHA 2Q3RA 4O4VA 3B0PA 3GDRA 3IV3A 2B7PA 3PUEA 1ZAIA 3JR2A 2CLLA 3CTLA 2GJLA 1HG3A 4IOTA 4CLMA 4O54A 1TIMA 5EBUA 1AK5A 1AW1A 2TPSA 4KFPA 3PF3A 3G1VA 3V1PA 3S5ZA 2C19A 5K9DA 3P84A 4WY0F 1TO3A 4JD4A 4WXZA 3M5VA 3DBPA 5AFDA 2C6QA 3BW4A 4JY9A 3RLUA 1QDSA 2V81A 1L2UA 4G1KA 1Z42A 3BV4A 3EWBX 5I3KA 1IXOA 2ZZ3A 5E93A 1OFAA 1TPB1 3L65A 1K7XA 2V2HA 3C0JA 1TCDA 2VXNA 3HGJA 4P61A 3OG3A 2WNQA 3N9RA 1XBYA 4JXCA 1LCOA 4DBDA 3C2OA 1SPQA 3BW2A 4XKYB 3TR2A 3PVFA 4Q33A 3G0UA 3ELFA 3TXZA 2J88A 3NZ1A 2YSWA 1U5JA 2V2DA 3IIPA 3O6YX 4ORIA 3TAOA 4M7TA 3MO7A 4ZQNA 4MYAA 1FDZA 5F2MA 5LNSA 3C56A 1ADOA 1VS1A 5HMSA 5CZ0A 1DJNA 3M5ZA 3G0XA 1UUOA 3W71A 2VEKA 3BPWA 3LRMA 3N73A 4YXGA 2Y7DA 2E68A 4I7VA 3STCA 3MI2A 1L6YA 4RR4A 2W0UA 3EEGA 2YX0A 3WJZA 4MFEA 3OIXA 5KZEA 3LOTA 1KTCA 2CZ5A 3U2OA 1I2QA 1SW3A 3CPRA 3MJYA 4DQWA 2FLIA 3NPVA 1A5CA 2PRLA 1H7WA 4O28A 4EVZA 4RXFA 4JX5A 4MUZA 1I4NA 2GJNA 4NNAA 3A21A 1K7FA 1ZENA 3B8DA 4A2RA 1LBLA 2H8ZA 3Q2DA 3E96A 1KTNA 4HPJA 4NX5A 2YZRA 1MZHA 4HNTA 3QPYA 1EIXA 1G67A 3NOEA 1AMKA 1FY6A 5D32A 2X1SA 1G6CA 4MKNA 4ICNA 1JCNA 3FEMA 1A5AA 1B4EA 2TYSA 2B7QA 1RZMA 1OFQA 1JCMP 2Y63A 5U7SA 1YYAA 1KFEA 1GG0A 3LB0A 4QNWA 1QWGA 3NQGA 1SFJA 3NPWA 2ZA3A 4CQ8A 1TTPA 3A22A 3BARA 3U6WA 4L4LA 2DZSA 1QR7A 1TJPA 3T40A 3PG8A 1OHLA 3DXIA 3M41A 1DV7A 3KVLA 3NQ2A 2A1YA 1ZY9A 3LERA 4I7WA 2YPIA 2RDUA 2ZDRA 1GYLA 1Z41A 4GFSA 1THFD 3QYQA 1GVOA 3MW7A 3NG3A 2R91A 3H54A 4WY0A 1FDJA 2ISSA 1WYIA 1LLZA 3NPUA 2NWSA 2FQIA 2VENA 1ME8A 1H60A 3A24A 4JDYA 2FFCA 5CKSA 4NJJA 1LRNA 4CNNA 3TJLA 4A2SA 4FIRA 4JDBA 3W7HA 5DXXA 2ZZ6A 3BLEA 3KAOA 2X2GA 4ZMGA 3KRSA 4MZ8A 5CPMA 3EXRA 3C2VA 1XCFA 2Z1BA 2ALDA 4LT9A 2FPVA 3TU9A 3NQ7A 3FJLA 4NNBA 5D37A 3E02A 4LV4A 5HNRA 1FCQA 4IMGA 2ISVA 4OGZA 3OVRA 3LV6A 3HOJA 1W5NA 1D3GA 3O63A 5C5YA 3EWYA 2A7RA 4U4MA 4MY8A 5I3FA 1LM1A 1X8FA 1K8ZA 1FCUA 2HTMA 3L9CA 3P67A 4XTIA 3W7RA 1YPFA 2XFWA 4AF0A 1OX4A 2QCCA 4UTKA 1WBHA 3LHWA 5I3GA 1PIIA 2ZCGA 1NFBA 5D2TA 2KZHA 2ATMA 4TR9A 4XWUA 4M19A 3BG5A 2QKFA 2RDWA 1TQXA 3QH2A 3S1VA 2Y7GA 4YL2A 2ABAA 3LHTA 3NL6A 3WJSA 3LHVA 2P0OA 4JTHA 4LY8A 3T55A 3DFSA 1P0NA 3OA3A 4NXKA 2QJIA 2I1OA 3ABSA 3P61A 2YYUA 3HQ1A 3FOKA 5HWMA 3G1YA 3B05A 5FF2A 2CLMA 3P8IA 3A5FA 1R2TA 2D73A 3LLFA 2NXHA 3FFSA 3GVGA 2Y7FA 2NX9A 4HNUA 2QCEA 4OT7A 2Q3OA 1Q6QA 4LW7A 3QW3A 1FCBA 4JIQA 4ADSA 4IXHA 4NZFA 4O11A 4UXDA 4GUIA 4NX0A 3PULA 5LHFA 4AH7A 2QJGA 3PSVA 1XKYA 2GPTA 4QAIA 2ZQ0A 3TC6A 4N9CA 1PCWA 1QO2A 3M44A 3W7NA 3F4NA 1ZCOA 4XQ6A 2EGZA 1A50A 3UWZA 5DCEA 3L66A 4M7SA 2VFEA 1TPDA 5HINA 1GVFA 3SFKA 3BO9A 4LTSA 2QCDA 3PM6A 3UYCA 1R46A 3DI1A 4PFMA 3GAYA 4OWGA 2C3ZA 5F1VA 3LCWA 3PBYA 3QF0A 5HR6A 3B0VC 1EP3A 3B04A 4KFOA 3TIMA 5KITA 1TQJA 3GYEA 4MZ1A 4AHPA 1KM5A 1DORA 3NNTA 1HO1A 2YW3A 1W0MA 2NV1A 4NUWA 1LTDA 4IX2A 2Y61A 2Q8LA 4LVDA 4PL2A 5G2IA 3TFXA 2QCFA 4LS2A 1EA0A 4C1LA 3T7VA 2DZWA 4WXYA 4AVFA 1T0OA 1H5YA 4NNCA 4AF0B 2X16A 1OX4B 3N19B 4FNTA 4X22A 2A6LA 2JKEA 3W2KA 3W70A 3LCXA 1TYGA 4XUGA 4FB7A 5FF0A 1B9BA 1BKSA 2ZRZA 1I2PA 4QSHA 2CZFA 2YW4A 3LCGA 3VE9A 4O0ZA 2HSAA 3IIOA 4RKAA 1LRQA 3GDKA 3UZ5A 4UNLA 3CWOX 1H7RA 2B7NA 1H7OA 1S5WA 3QPZA 1GTEA 3E9AA 3N3MA 5TBOA 4O8RA 3QZEA 3Q58A 5G2WA 1OJXA 1EX5A 4ADTA 4NU7A 4BWLA 4HIBA 1QNVA 1H7PA 3DFQA 3RMJA 4LC6A 6ALDA 4LU0A 1I2NA 1DJQA 4UC5A 1TPEA 1RD5A 3M5YA 4MPQA 3TQVA 4Y90A 4Y6GA 1BEUA 4UR8A 1OFDA 2OMAA 4YCPA 3HG5A 1QOQA 4N4QA 4BWLC 4N9DA 5G2HA 3DI0A 1OG0A 3SECA 4AEOA 4YLWA 3QW4B 1TREA 1ONRA 2NUYA 4O18A 3MUXA 4GC4A 4C1KA 3DKLA 5H91A 1QCWA 3W07A 2AGKA 5EY5A 5E1QA 3EWZA 4UUIA 2CLHA 3UWWA 5D30A 1LZOA 3G8EA 1A5BA 2WKJA 2QCDB 2VELA 4DO6A 5C6MA 2DU2A 3TCEA 1YXYA 1W5MA 3GR8A 4UCGA 5F4WA 5DLCA 5G5IA 1WBJA 1Y0EA 2LLEA 4RXGA 3DKJA 1ZALA 3CLMA 3L0GA 3BG9A 4ZQPA 4I9AA 3I7QA 1QMLA 3RFAA 3GKAA 1WOAA 4RZ4A 2C18A 4XBKA 4ADUA 1E51A 1VZWA 3SR7A 4DF0A 5LNUA 3H55A 3W74A 2TSYA 3C8FA 2NWRA 1VHNA 1UBSA 1YDOA 3QJAA 1G7VA 1LOLA 3EB2A 5DBTA 3TW6A 1SO6A 1MEWA 4IXXA 2DZTA 3B03A 1VPXA 4OE7A 2V30A 3QSTA 5BRBA 1JRBA 3CIWA 2NZLA 4QNEA 3W9ZA 1I2OA 1TPVA 4ALDA 1O5KA 4Y8FA 1LDCA 2J27A 3NAVA 2VFDA 3NQVA 1F6KA 2Q8ZA 4AXKA 1DQXA 1TTJA 3W2UA 2V2CA 5LHEA 1VCGA 4RK8A 1D9EA 3UWUA 3G22A 1S5TA 3NQ6A 3STGA 3W7PA 3W1XA 1XDMA 2E5DA 2ZYFA 3LBCA 3UNDA 3KHJA 1P1XA 2ZA2A 3Q94A 1JCLA 1GPWA 1DHPA 4LOCA 2G96A 8TIMA 5CGQA 4ZQRA 4R33A 1KM3A 1LYXA 2ZA1A 2ZZ4A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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