3C8FA

4fe-4s-pyruvate formate-lyase activating enzyme with partially disordered adomet
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
245
structure length
245
Chain Sequence
SVIGRIHSFESCGTVDGPGIRFITFFQGCLMRCLYCHNRDTWDTHGGKEVTVEDLMKEVVTYRHFMNASGGGVTASGGEAILQAEFVRDWFRACKKEGIHTCLDTNGFVRRYDPVIDELLEVTDLVMLDLKQMNDEIHQNLVGVSNHRTLEFAKYLANKNVKVWIRYVVVPGWSDDDDSAHRLGEFTRDMGNVEKIELLPYHELGKHKWVAMGEEYKLDGVKPPKKETMERVKGILEQYGHKVMF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Pyruvate formate-lyase 1-activating enzyme
publication title Structural basis for glycyl radical formation by pyruvate formate-lyase activating enzyme.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 85
structure length 245
sequence length 245
ec nomenclature ec 1.97.1.4: [Formate-C-acetyltransferase]-activating enzyme.
pdb deposition date 2008-02-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04055 Radical_SAM Radical SAM superfamily
A PF13353 Fer4_12 4Fe-4S single cluster domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3c8fA00
1LRTA 3E0IA 4H6KA 3C6CA 3TXVA 3QPYA 3EWUA 4DF1A 2RKXA 3TC6A 4GWEA 1P4CA 4XBKA 1SO4A 3FKRA 3HMJG 3ANYA 4OV4A 4O57A 2VEMA 4QAIA 1H7NA 3M6YA 5LNWA 1X6UA 4RJEA 3F4NA 5D33A 6ALDA 4EOUA 3L5LA 1YDNA 4ZL1A 3BW4A 3ZFHA 3L0GA 1JCLA 4PODA 2F84A 1W3IA 3FLUA 3DFOA 4UCGA 2A6NA 3VKJA 4IMCA 1LROA 4O8RA 4RKAA 4NQ1A 3UXDA 3T78A 3S0CA 5D2WA 4JEQA 1D3HA 3PULA 2TPSA 1H1ZA 1TSIA 3R8RA 3CB8A 5TIMA 1I2RA 1GT8A 2VFFA 2O7QA 1PS9A 4LVBA 1KV5A 4XZ9A 3TSMA 4HKPA 3LLFA 5C5YA 1KM5A 4WQ6A 3STFA 1GOXA 3OG3A 4UMBA 2Q8LA 3GB6A 2Y70A 4BR1A 2ATSA 3BW3A 3JRKA 2GPTA 1XKYA 3W7IA 3P8IA 2ZQ0A 3NM1A 4N6EA 4PL1A 4UNLA 3SI9A 5LSMA 1VR6A 3FA5A 3FKKA 4LNYA 5D03A 1BTMA 5H2ZA 3KVMA 4IX2A 1HO1A 2QJIA 3MI3A 5CKSA 1O4UA 4O0KA 1WAUA 5AFDA 4K36A 2DZVA 1P0NA 1X1OA 4LV9A 4GFSA 3GDRA 3MP5A 1TMHA 1YXYA 5D05A 1OX6A 3MBDA 2R14A 4ZQCA 4DXVA 3GNNA 4AXKA 1OK4A 3G1AA 4MY8A 4MYXA 4W9TA 3BLIA 2A2IA 3CWOX 4BI6A 5D30A 3LXCA 5DN1A 1OF8A 4EVZA 4DO4A 4U28A 3DFPA 3UWQA 2RHGA 5TQLA 4FXSA 1Q6OA 3LCLA 4IJBA 1IIGA 2C6QA 1QPOA 3BG3A 2B7NA 4UMCA 1ZY9A 3NEVA 2GQ9A 1R30A 3PC0A 4FX8A 3W2KA 2OMAA 1W5QA 1ICSA 3L65A 3PAJA 2VEIA 1OHLA 5AHLA 4BFAA 4O1CA 3W1MA 5J5DA 3PB0A 2BX7A 2FTPA 1A5SA 3PY2A 2A1YA 1UASA 4ZQPA 1TPWA 2A21A 2QEZA 2B7PA 4CLMA 1RVGA 3GXTA 4M6QA 3LRLA 3S1UA 1R2TA 5F2LA 3ELFA 5IBXA 2TMDA 4WJEA 3NQ8A 1F6KA 3LBMA 5AHIA 4H3DA 4O11A 4D2JA 1E51A 4JS3A 1TTJA 5HULA 5D37A 3LB0A 4GXMA 4ORIA 1PHQA 1TV7A 1G6CA 1M5WA 3EX3A 4PFMA 3P60A 3L9CA 2DZUA 5DY3A 5G5IA 1U5JA 4O1AA 1OX4A 1BWLA 4O0ZA 1EUAA 5AYZA 1VQTA 5HUPA 3STCA 3G1XA 3UWWA 2NUXA 1SZGA 1LOSA 1H51A 4TMBA 3TE9A 1P1XA 3W1NA 2DZSA 2E77A 4CCEA 5CPMA 1K7EA 3R12A 4UTTC 4UIOA 3L5MA 5F2IA 4IGHA 5CG7A 4NJJA 2HMCA 4YL2A 3S6DA 4QIUA 2A0NA 4JN6A 1EX5A 3UNDA 1I2QA 1Q6QA 1SUXA 1LCOA 1VCFA 3P5ZA 4O18A 1DVJA 3ZWSA 4MJZA 4NZJA 1VYRA 4O19A 4JYEA 4FO4A 1YDVA 3W85A 2NLIA 4P61A 3HQ1A 4C1LA 3PSVA 4O52A 1H63A 2C19A 4KFNA 3TXZA 3W7MA 3MHGA 4M19A 4MZ1A 5CZ0A 4Z1BA 4UTKA 1KM3A 2FPTA 3CQ0A 3NR0A 4AEOA 4WD0A 3TFXA 2X1SA 3EX4A 3B03A 1G67A 1MZHA 3W70A 1FWWA 1FWNA 3L21A 1TPVA 2ZA2A 3C2EA 4PL2A 3NQGA 3LERA 4RX0A 4UR7A 4BWLC 2H8XA 4FEZA 2R94A 3UPBA 1H7WA 2PRMA 5EKYA 2CU0A 3JS3A 4AB4A 5AC8A 4IPJA 4Y90A 1IXOA 4XKYA 2FLIA 1K7FA 5AN7A 5AHFA 5G1TA 1PCWA 1LZOA 3A9IA 3PWAA 3MWAA 3LI0A 2OX1A 1JCMP 4HSOA 5AC6A 2YZRA 3WFAA 1D3GA 4MLRA 3NG3A 5HWNA 1R2SA 1W5NA 1C9DA 1FDZA 3UY8A 1Q6LA 3Q58A 5F4WA 3U2OA 2X1UA 3TCEA 2NZLA 1TYGA 2KZHA 3TKFA 2E6YA 1YTEA 3A24A 2GVLA 3W7QA 1FCQA 3E12A 2B7QA 1FCUA 4BWLA 4A2RA 1SU5A 2GVGA 3GNDA 2JKEA 1GTEA 5F2GA 4XQ6A 3S5NA 3B04A 1SW3A 3VCRA 3BLEA 3NVTA 2A5HA 4LS2A 1SO6A 3LHYA 1ZENA 3LHUA 4ZQRA 5DXXA 4FNTA 4ADSA 2QCDA 3HGSA 2XN2A 3NQCA 1KLYA 1TV5A 1TQXA 1W5OA 4LY8A 1XBZA 3W7HA 4ADTA 3LCXA 2FDSA 1SZNA 3U8GA 4Z08A 4M6PA 1H5YA 1BEUA 2YR1A 2Z6JA 2CLIA 3S9YA 3GYEA 2GQAA 1DJNA 2Z6IA 4Y6GA 1AMKA 1EIXA 5BOOA 1B3OA 1TPDA 3IIPA 1N7KA 1RPXA 2BWGA 3W7EA 2G96A 2ABBA 2QCMA 5A8GA 3IVSA 1QPRA 1THFD 1JULA 3DH7A 4GUFA 3RMJA 2VEPA 1NVMA 3TAOA 4DQWA 2GJNA 2V2HA 1SW0A 2H90A 3PVFA 2JK2A 1SSDA 3W1RA 3EKLA 3TW7A 2XFWA 2ZTJA 2V2DA 3W1LA 4E2DA 3KXQA 1IXPA 1JVNA 1LRNA 5K2ZA 2A7NA 4UFIA 4OHQA 3MW7A 3USBA 3BVJA 2P1FA 2ZA3A 4I7WA 4WX2A 5K9XA 4UFLA 3UPWA 4IMFA 1YTDA 2BXVA 3GR8A 4RZ4A 5FF2A 1EUNA 4RXFA 1OVDA 4BI7A 2W6RA 4KFOA 2NWRA 1ICQA 3LHVA 1XCFA 5I3FA 3QMRA 3QEZA 4POCA 1TPEA 1R46A 2OT0A 5AHNA 1AL8A 1TJRA 2WKJA 4R34A 3QPZA 3S5YA 5BW6A 2JKPA 2V82A 3W88A 4PTNA 3BG9A 3PM6A 1J4EA 3NQ2A 5J5RA 5DLCA 4MFEA 2QAFA 3W76A 5ABTA 1PIIA 2IQTA 1L6WA 1WV2A 3M1ZA 3N34A 3ATYA 3B0VC 3MI6A 2J9ZA 1OYAA 3L0KA 3S5ZA 1SZFA 1X8FA 4HIBA 1MEHA 4RK8A 4AVFA 3FFSA 3O15A 2YFNA 1JQVA 2QCDB 1T99A 3G8RA 2Z0IA 1SSGA 5G4EA 4NXSA 3PS7A 3M5YA 5BMWA 4RLIA 3N3MA 1A5CA 1B4EA 3LHWA 3N2XA 4OQVA 1JJKA 2CLFA 1PV8A 5KTLA 3VE7A 2EF9A 3P84A 4DBDA 1B9BA 1SO3A 3CWNA 2E5BA 4ORMA 3CC1A 4KWWA 1HUVA 4N4QA 4G1KA 1ME7A 4O4VA 2OJPA 2C13A 4UXDA 1ZAHA 4JTKA 5MHBA 1RZMA 4JY9A 3NO5A 4TX9A 4O28A 1QO5A 1LLZA 2JKAA 2ZTKA 3I7RA 4ADUA 4DF2A 1BKSA 2YW4A 4ZVJA 3LI1A 2G5WA 1WBJA 3BPWA 3LXBA 3O06A 3Q37A 3P74A 5HR6A 2CWNA 1XBYA 3O05A 1JRCA 5CSSA 1XBXA 5BMXA 4N9DA 3LCWA 1R47A 3DHDA 3MP3A 5HNRA 5K4XA 2Y7EA 3G22A 3ZS4A 3HGRA 2ZDRA 3W7LA 1L6YA 3PUDA 2PC4A 2QCGA 1OFPA 4S1FA 4WXZA 3MMTA 2C0AA 1QOPA 5K9DA 1SFLA 4UMAA 2V2CA 3O6YX 3W73A 5EA9A 3I6RA 1K3UA 3LTYA 1IF2A 1F6PA 1QO2A 4Y8FA 1WBHA 4MPQA 3OIXA 1HL2A 4JXCA 3G1DA 1OABA 1H61A 2I9EA 4HT3A 3FYPA 3W7DA 1Z42A 2O7SA 1KM0A 3DFSA 1ZHAA 1V7YA 4N9EA 3KRUA 2NWSA 3EXSA 1OFDA 4O12A 2VFIA 1G7VA 4DF0A 4N9CA 3GK0A 3I68A 4TO8A 3NQVA 3ABRA 3QSTA 2VFHA 3M5VA 4LU0A 1DBTA 4LWWA 2R8WA 3PBUA 1KA9F 4J9JA 5C2XA 2ZZ4A 1WDWA 3SGUA 5I3IA 1XC4A 4N9BA 3UZJA 1JCYA 1G4EA 3NDOA 2QUTA 4TMCA 2XN0A 4Y9AA 4TIMA 3WK3A 3RK8A 3LCIA 3W7JA 3G1HA 1KM4A 2X30A 4HPXA 4ZZ9A 4ZQOA 3NQAA 3IIVA 4YMZA 1K02A 3A23A 1GG0A 1NFBA 3SJ3A 4JTHA 5G2WA 1ONRA 1QPQA 1DQXA 1QR7A 4AHPA 3KFTA 1OG0A 3R13A 1EP2A 3KAOA 5F1VA 3W07A 2VFDA 1FWRA 1HTIA 2J9XA 1PHWA 2EAWA 4N6FA 3UYCA 1CW2A 2YYUA 3OVRA 3ZWTA 2QUVA 1NSJA 1KBIA 1QOQA 4O17A 5DXYA 2ATMA 1EWDA 4I7VA 1SR9A 3W7KA 3F1QA 1Q3NA 3VE9A 3EX6A 4MYAA 3GAKA 3NQDA 4JDBA 3TSBA 5LGZA 1EEPA 3NL2A 4WZHA 3TNOA 2ZZ2A 1U83A 4MLJA 4Z0JA 5DELA 3IVUA 5T26A 1FXQA 3QQ0A 3C61A 1VS1A 3CHVA 1ZCOA 4K7VA 2H3BA 3W6YA 1EA0A 3GKFA 2NX1A 4A22A 2BSLA 3P82A 1FX6A 1EB3A 1QDSA 2ISSA 5D2XA 1XL9A 4EIVA 1FXPA 1YADA 4X3ZA 4MY1A 2WNZA 1LBFA 2QDHA 2VFGA 3L67A 1Q45A 1VZWA 4MJMA 1KFCA 5HMSA 1H60A 3T55A 4GNJA 3NGJA 4E2BA 1GVSA 5F4SA 5D09A 2LLEA 4LV4A 1ADOA 1LRQA 3N2MA 3O16A 4JTLA 1JUEA 2ALDA 4CQAA 1S3HA 2DU2A 4NX5A 2TSYA 1O5XA 3NNTA 3M7WA 2B7OA 4NX0A 4A21A 1LORA 3QH2A 3CT7A 1VPXA 2ZRZA 4N2YA 3UWZA 3PB2A 3NPWA 4XUGA 3QF0A 5K9CA 3O6DA 4M6VA 3LV5A 2E5DA 2X2GA 2ZRXA 3T7VA 4I7UA 1T8XA 4JGDA 2OZ0A 3SIZA 2NXGA 5I3KA 1SZEA 3T40A 1MEWA 5G2HA 4LS0A 3QJAA 3W1PA 5G1YA 4OGZA 3Q2DA 2QDGA 2ZZ1A 3E49A 2XN1A 3WJWA 3TUUA 3F03K 2RDTA 4GUIA 3GIYA 3H53A 4XBSA 3TMLA 4AHOA 1GEQA 3QMTA 3BV4A 4BK9A 2ZZ6A 5CZJA 2Y7GA 3IIZA 3IIOA 3DENA 4WY0A 5TBOA 3P61A 4IUOA 3O6CA 3LTSA 3MP4A 1EPXA 4PCFA 4OWGA 3THAA 4JTTA 3EWWA 4QNWA 4MVAA 5HINA 1H62A 1YLVA 2B0MA 2Q8ZA 1ZAIA 4O53A 2VFEA 3O63A 3HG2A 4JD4A 1CX9A 5C54A 4O4WA 4X22A 2V5LA 4NZFA 1W31A 5F1UA 4AWUA 3GVGA 3G3DA 3S1VA 2VEKA 2J6XA 3CM4A 3G8EA 3DU0A 3LTPA 1XDMA 3M44A 2YGYA 4LUJA 4UNKA 3W7NA 3SW6A 4RZ6A 3MUXA 3TU9A 3ABOA 4UFHA 2E6AA 1TTIA 4YXGA 3LGEA 1LYXA 2J27A 1XBVA 5G4WA 1VYPX 1JUBA 3EXRA 1GJPA 3TA6A 2EPHA 5C6MA 1TRDA 4JX6A 4LW7A 3RLUA 4JX4A 5EL1A 2CLOA 2GUUA 3FEMA 2YW3A 2E68A 1KW1A 4EF9A 3SECA 5AYXA 4O54A 3QC3A 3BGGA 5U7SA 2DJLA 3UZ5A 2ISWA 4UTUA 4UTTA 4FNUA 1GTHA 2WV8A 3U6WA 5BNKA 1KFEA 4QNEA 2PE4A 2CFFA 1WYIA 4N02A 2A7PA 3HIJA 1LTDA 4MUZA 1S5TA 1O94A 1OFEA 4JIPA 1WA3A 3P67A 4JYDA 3PUEA 1W8SA 1OX4B 3WK0A 3P7YA 3W71A 4CQ9A 3G3MA 3PG8A 3W2MA 2QCCA 3THQA 1AW2A 4ML9A 3BG5A 4FF7A 1XXXA 2W0UA 1ALDA 4MFDA 1LOLA 4Q4KA 5FEPA 1C8VA 3OVQA 1ZAJA 3E02A 1X7FA 4E38A 3HG3A 1EP1A 5EMUA 1A5BA 3B05A 4FNQA 3N9RA 1JQXA 1DJQA 3TJLA 4NJHA 2FFCA 1TIMA 4BI5A 3MI2A 3NM3A 4WXYA 2Y88A 1VHCA 1KV8A 4QITA 1O5KA 1GVFA 1LM1A 3MYOA 5A5WA 3BARA 3GXNA 3GXPA 3NPXA 1HFBA 4A3UA 5SWUA 2CLHA 4FX6M 1AW1A 1W5PA 2B4GA 4NJIA 3G24A 3FS2A 1NEYA 4HNUA 1K03A 2ZRYA 2FIQA 2OT1A 1D9EA 1L2UA 3C2RA 4JTIA 3W86A 4K8EA 1ME9A 3P5YA 3L5AA 2RDWA 5IM51 4S2CA 1G4PA 1TB3A 8TIMA 2VOMA 5AHEA 1JUKA 4FX7A 3W7CA 4LT9A 3GZ3A 4EF8A 3N14A 2YCEA 4OV9A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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