3CCJN

Structure of anisomycin resistant 50s ribosomal subunit: 23s rrna mutation c2534u
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
186
structure length
186
Chain Sequence
ATGPRYKVPMRRRREARTDYHQRLRLLKSGKPRLVARKSNKHVRAQLVTLGPNGDDTLASAHSSDLAEYGWEAPTGNMPSAYLTGLLAGLRAQEAGVEEAVLDIGLNSPTPGSKVFAIQEGAIDAGLDIPHNDDVLADWQRTRGAHIAEYDEQLEEPLYSGDFDAADLPEHFDELRETLLDGDIEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Ribosome
molecule keywords 50S ribosomal protein L2P
publication title Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb
total genus 41
structure length 186
sequence length 186
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
N PF17144 Ribosomal_L5e Ribosomal large subunit proteins 60S L5, and 50S L18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ccjN00
5H1SQ 3DLLL 1N8RO 2ZJQL 1ILYA 3CC2N 1VQ4N 1JJ2M 3CMEN 5GAGP 1K73O 1VQLN 1VQ7N 3OW2M 1VQ5N 2ZJRL 3G6EN 1VQ9N 1K9MO 4WFBL 3CCJN 1VQMN 1KQSM 2ZJPL 1VQ6N 1VQ8N 4WFAL 3CCEN 4IOCL 1KC8O 4WF9L 5JVHL 1YJ9N 3CMAN 1VQKN 3G4SN 1QVGM 3CC4N 3CC7N 3PIPL 3CCMN 5JVGL 3CCVN 1YITN 5HL7L 5DM7L 4WCEL 1K8AO 1Q81O 1S72N 1Q82O 1YJWN 3CXCM 1KD1O 2QEXN 5MLCQ 1YI2N 1M90O 3CCQN 2OTJN 5GAEP 3CCLN 4WFNL 1YJNN 3J7ZO 1Q86O 2OTLN 3G71N 5GAHP 1VQNN 1NJIO 1OVYA 3CCUN 3CPWM 3CF5L 1M1KO 3I56N 5DM6L 4IOAL 1Q7YO 4U67L 1YIJN 5GADP 1W2BM 1VQPN 3CCSN 1QVFM 3CD6N 3CCRN 1YHQN 3I55N 2QA4N 3PIOL 4IO9L 1VQON 4UY8O
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4JS5A 4M3UA 2D5RA 5AQWA 2Q36A 4DQRA 2QK9A 3VA3A 4EIAA 4OO1J 5F2RA 4ISFA 1BL3A 3VF2A 2HVIA 4DR5K 1MWMA 4B9SA 5HBMA 4B08A 2F9WA 1NJZA 5LJWA 4GMJB 3IG1A 2ZJPL 4CJ5A 3H46O 1N5YA 3OYFA 1RTDA 2G8UA 1YTUA 3CCEN 1NOZA 4DF8A 3FFKB 3WXIA 1U4BA 3FZFA 4I7FA 1KC8O 4LFCK 1QSYA 3V1RA 5AQYA 3VF6A 3U9ZA 2BE2A 3D0PA 5AZJA 3E9OA 1BG3A 3D6RA 4X64K 3ID6A 2AA4A 1TGOA 3SAFA 4KTQA 1VSHA 3NGIA 1S22A 2O8DB 4IO8A 4CD1A 3Q7BA 1REVA 3HTVA 4A2AA 1QQOA 4DB3A 1SKRA 1LAWA 3BUZB 4ELTA 3QETA 3ULEA 3LDSA 3RSEB 4H4OA 3KK3A 1RT1A 4H5WA 2A1SA 5GAEP 4L3QA 4CEFA 2OCEA 3SAHA 3HJFA 4C1NI 3THYB 4JKDA 1K6YA 1BO5O 4JKCA 1K8KA 4IXCA 4X66K 3G71N 3SV3A 4IKFA 4BRFA 4DTMA 3MECA 4Z4CA 2A41A 1S1UA 3TTFA 1W7AA 3OYGA 3A5NC 4DSEA 5ADXA 2E2NA 4PKHA 4ISEA 2VWBA 2W40A 3HYFA 4PL8A 1NGFA 2CGJA 2HHUA 1C0TA 4FJ5A 3ZX2A 4JI1K 3CERA 3D2EB 4DUZK 2IVNA 1KXPA 3I55N 3SZ2A 2QKBA 2Q0UA 4JKGB 1C0MA 4CJQA 2EX3A 1QZ5A 3CYMA 4CERA 3V9XA 5AQTA 4C23A 2F9TA 1Z6RA 4M3XA 4W5NA 1O1WA 5HRNA 4JKFA 5IWAK 2G8IA 3AVMA 4Q5VA 4G9ZA 1RBRA 3THWB 3T3FA 1RDAA 3VQ6A 3MXMA 3NH0A 2D0OA 4BRQA 2QKKA 4WFAL 3OYMA 4AF1A 4M63C 1DTTA 4LD0A 3S3NA 3A5OC 4QAGA 5EVZA 4JK7A 2XO7A 1HYVA 2P9NB 3M5RA 3J7YP 1QQNA 1RT7A 4H0OA 5BR9A 4BDZA 1X9MA 1VSMA 1KVBA 4WE1A 4DLGA 3G4SN 2NRVA 3CC4N 2P9PA 1NJXA 3TABA 2RN2A 4BRKA 1YITN 3HPGA 3NDKA 3CPEA 3LP2A 1Q82O 4BRLA 3NBPA 2XRIA 5FPNA 2OZMA 1SZ2A 1GLLO 3QEIA 4DV7K 1ATNA 5LL6Z 5AQOA 3KLGA 3LWMA 4NXNK 1WSHA 2W42A 2OA8A 3DLRA 4DHYA 3WXJA 2IAJA 3SK3A 4M7YA 1NMNA 2E2OA 4JYAK 3DLBA 1IV0A 2KW4A 4OX9K 4Z4GA 3HSCA 4CEDA 3K59A 4JKAA 4DU4A 5BN9A 3AAPA 4BDPA 4CF2A 3CM6A 4AM6A 3O3GA 3QMLA 3MN9A 1SQKA 4H5NA 4E7KA 2PYLA 2HF3A 4XH5A 1KAXA 3EE9A 2VYPA 2A42A 3HP6A 3VQPA 4FLWA 2HHTA 5AQGA 1QVFM 1JL2A 3NAEA 5GIOA 1UAXA 2A3ZA 5AQNA 4H4MA 4ID1A 4CJFA 4IO9L 1HNIA 1HNVA 3DLLL 4CF1A 2O8DA 4LSNA 4FLXA 1JJ2M 5I9EB 1WAJA 2UYTA 4B9UA 2QWOA 3BF1A 3G0ZA 1K9MO 2P5GA 1KLMA 4CEEA 4A62A 3RSEA 3ZT4A 3SQ1A 1RT6A 4O0IA 5E41A 3QDKA 4BRAA 1YVNA 4HTUA 3TTCA 1JLGA 3T1HK 1E4FT 3ZSXA 4B3TK 4EHTA 4NO7A 3NFAA 3KKRA 3CQ8A 3THYA 2FBVA 1YJ9N 3CMAN 3O5BA 4DTJA 3L3UA 5JLFA 1RNHA 5J2NA 3GOIA 1NK6A 1HJRA 1RT5A 5AQXA 1TAQA 4ICLA 3ASMA 1W97L 4UQGA 5EX5A 3C6HA 3KK2A 2RPIA 4YOVA 3P31A 5FPDA 1DEJA 3SJJA 1D5AA 2OPSA 3H45C 3OYBA 2D0BA 5ELZA 4OGCA 3LDOA 4JKGA 3EKUA 4DFPA 2XY5A 5C24A 3FLCO 3LANA 3LM2A 2YJFA 3RMCA 1J53A 1BDGA 4OGEA 3L4QA 4BRIA 4BC2A 3U3YA 1T6DA 3AO3A 4PL7A 1DTQA 4IJNA 4JI2K 2BANA 1KCFA 4W5OA 1ZBLA 4ILHA 1J5OA 5BPMA 2P9SB 2YKNA 2E1YA 4FO0A 1LCUA 3THWA 3P1GA 1S5JA 4CI6A 4CEOA 1FW6A 3D2FB 1CXQA 3TPQA 3SUOA 1J54A 1VSDA 3QERA 3ZSZA 4IFYA 2GEMA 2FLOA 3BZCA 4FWPA 2P9NA 3CCRN 1L3TA 1B9DA 3AO1A 3T1YK 3AVJA 4OKKA 1OKJA 3VESA 4DV6K 4QS8A 2QTDA 2OTJN 1N32K 2D0AA 3O3FA 2ZJQL 1GLBG 1WSIA 4CZEA 5HLFA 1NKCA 4FJ8A 1JLCA 3AARA 4H5TA 1RFQA 4I9QA 4B3MK 2KZZA 1UA1A 4DQ8A 2VG5A 4FJLA 2F8SA 3BEXA 4EAHD 1R0AA 3NHGA 4Y0WA 3SNNA 4DS4A 2ETJA 4DR3K 3DOKA 3V1QA 3NE6A 1L3UA 5M1FA 2RE2A 4DSKA 2Q1NA 4WF9L 1SAZA 2YNFA 3V4IA 4C8NA 4FJMA 2NRZA 1EWQA 2XHBA 3HT3A 4BE2A 4KHWA 3PIPL 3CFRA 4GW6A 3U3GA 3A0IX 2KHOA 5DM7L 1K8AO 1Q81O 2BH1A 1VRTA 1VSEA 2PYJA 4GNIA 1YI2N 1MDUB 3SBGA 4ILJA 4CZIA 3PX6A 1F21A 2E1ZA 1BIUA 1HKCA 4I2QA 4FVMA 4QCLA 2Y1JA 2O4GA 4FCYA 2O8CA 3OYCA 3LL3A 4DSJA 2FXUA 4CCHA 3KLHA 4Z4HA 3O9TA 3WXLA 2PY5A 3ZSWA 3HOSA 1P8ZA 1E3MA 1VSKA 3GL1A 4LF6K 4BC3A 4H5RA 5SZTA 2KZMA 2E2QA 1J9AA 5AQSA 3KLFA 4FJJA 2O8EA 4CJKA 2E6LA 1U45A 4K8ZA 2NLXA 4I6MB 4F2RA 5HROA 2F7TA 1FK9A 4JAXA 1JL1A 4BRMA 1MU2A 3LP0A 3GG4A 4H5VA 3ZYYX 1I94K 4KBOA 2ZD1A 5CZ2A 3S3MA 2YX6A 4CHPA 3I8DA 3O3HA 2Q0RA 3ZSOA 3O4QA 1N8RO 4XH4A 4BC4A 3QBXA 1K73O 4OPHA 4KKOA 2D0PA 3M8RA 4FLUA 2O8BB 4XEIA 5CE3A 4C8KA 1KTQA 4GVMA 5JS2A 4A5AA 4AILC 3V9ZA 4IG0A 3K57A 4RW8A 4KAZA 4KHNA 3ZSYA 1TKDA 1TYQB 1BGXT 2BDPA 4E7JA 5AQRA 1K8KB 4DV0K 2HVHA 4KB0A 3PX4A 1S1TA 4XH1A 4CZMA 2QWQA 1C0UA 1OH7A 4ILGB 4BC5A 4C8LA 3DI6A 2I5JA 2P9SA 3DXMB 1KLNA 3C0BA 4FWMA 3R6MA 1GLEG 1IKYA 4E3SA 3OYIA 1ESVA 3HRGA 3D2FA 1BUPA 3QESA 4FWSA 4RW7A 1SKWA 5HOOA 1WUAA 4CGIA 4F9OA 3F9MA 4HTLA 1C0FA 4PUOA 4YOWA 2V7YA 1VSFA 4YNQA 1HMVA 2E5LK 4JKBA 3O1BA 3AO2A 1IKVA 4DLEA 1ITGA 5EU7A 3IS9A 3P83D 2UUCK 4PWDA 4H0TB 1JCEA 3KTQA 3MAQA 4Z4FA 5DM6L 4HUEA 3VENA 4G1QA 2ASPA 4I9LA 3Q7CA 3HO1A 4CK1A 2QWNA 1W2BM 2KTQA 4F4KA 1NGEA 1ASVA 1NJWA 4N5SA 4O4GA 4DQQA 2I7NA 3CI5A 3J8AA 1RGIA 4B1UB 3WQUA 3KK7A 1V4SA 2P9LA 1IJJA 5KPTA 1LAVA 2VQFK 4CJEA 3K5NA 3AGRA 4RW6A 3QEPA 1U47A 2YHYA 3OW2M 2EWSA 4HVJA 4YY3K 3RRGA 4WFBL 5KRSA 4LF5K 3THXB 4O5FA 1TL3A 1YUWA 1X1PA 3QB0A 3SI6A 3L2RA 3KZBA 2O4IA 3MMVA 3WNGA 4FK0A 1C6VA 4BVPA 1EX4A 3K5OA 1HX1A 2AP1A 4HCCA 5C25A 5AQZA 1UOCA 3DLHA 4CVNE 1A5WA 3F2KA 2Z1HA 3AGKA 3LPTA 3NH1A 3GBTA 4JEPA 2NUBA 3AVNA 4E7LA 3ATUA 2G8WA 4H0XB 4DSIA 3UKRB 4I6MA 2HNZA 2X6NA 3ITHA 4CHQA 4HHTA 3GDQA 4DQIA 1TK0A 4PQUA 5C12A 1UA0A 1C1AA 3OBYA 2ITMA 3VQAA 4B9NA 4JV5K 4V19S 1TUYA 3MEDA 1QHAA 3MCAB 3V9SA 3VPZA 4NLCA 4DSFA 2NRHA 2HBKA 1KFSA 1WSEA 2RHKA 1S1WA 5LY3A 3VERA 4DTNA 2UXCK 2YNIA 4FLVA 4NB4A 2CGLA 3VQCA 2O8BA 4FYDA 3EEQA 1XQSC 4DV1K 3NVMA 3O08A 1M1KO 4TSXA 1NLVA 1WAFA 4B3SK 3OYHA 4DCHA 4Z0UA 2A40A 5AQPA 3O9QA 4BROA 4JNEA 1J6ZA 4C8OA 3L2WA 3NF7A 5J2QA 1TYQA 4IEIA 3LZIA 3VQ9A 3MX5A 4H0YB 1DKGD 1IKXA 3PIOL 5LMUK 1JKHA 2WOMA 2YI1A 4CFDA 3LP3A 3DLGA 4MO5A 4DSLA 3DXMA 3SLCA 4E19A 4J2EA 4A61A 4KH6A 3O4WA 5M1OA 3C7NB 4Z4EA 5I42A 2UXDK 5AJ3K 3CIPA 3S3OA 4RW9A 3CCJN 2X74A 2NRXA 3L3VA 4AQYK 1S6PA 5C2FA 3RMBA 3M8PA 1LWCA 3FGUA 3ZSRA 1A5XA 3MN7A 3AA2A 4PKIA 5AQLA 3VEVA 3BZKA 2PZSA 1GLJO 3U9DA 5J2PA 1BHLA 5FROA 3VMFB 2IVOA 4NCAA 3UIQA 2GUIA 2HB5A 3TSQA 2Y1IA 2HHVA 2B5JA 2GWKA 1T7PA 3I0RA 1VK0A 4H03B 4B1YB 1W9HA 5BRDA 3SMSA 3HPOA 4ZHRA 3OYKA 1N33K 3VTIA 3ISNC 3MCPA 2YNGA 3FR0A 1IO2A 4B9TA 1XNRK 2HSTA 2FSKA 2YCHA 3OJSA 4AHSA 3C6AA 4KTZA 5GAHP 2Z1IA 3RMAA 4J2DA 5AQQA 4DF4A 4KH5A 3JXUA 4CHOA 3V81A 3QO9A 3CCUN 4CGJA 3IMXA 3THXA 2FBTA 3NH2A 5BREA 2G8FA 1NNEA 4U67L 2Q2RA 4EZ6A 2FSNA 5J1EA 3KJVA 5DK5A 3FZLA 4CBWA 1VQPN 3WT0A 5A2QO 5FDLA 1X9JA 2CGKA 1XUPO 4FZZA 1NGBA 3KKSA 2P51A 1ZBIA 1NOYA 3ZX0A 1NGHA 4UY8O 3FE1A 4FJ9A 2I7PA 3VEYA 1NK7A 4IZ9A 1VQ7N 1H1VA 1ZBUA 2HBLA 4ID5A 4BRGA 3EO3A 2E4LA 5AQIA 3UKRA 2WONA 4ZTJA 1RBSA 4Z4IA 3R1XA 3R8EA 4CJ7A 4JI4K 2WC9A 5AZIB 2WUSA 2UUBK 3VQEA 3PY8A 4RG8A 3OYLA 4JI5K 4KHUA 3ZEUB 3CM5A 4FXDA 1X9SA 1TK5A 2O8CB 2B4JA 3S9HA 1T8EA 1TAUA 3AVBA 2PBDA 5EXWA 3QEWA 4JLHA 1HLUA 2P9UB 5C15A 5JVHL 3QINA 3MDQA 4H0VB 4OPKA 5FRMA 4CJTA 3SV4A 3CC7N 1NWKA 3WNFA 3CCVN 2O8EB 1HQEA 4YDUA 4FVUA 4FSVA 1BA1A 4WCEL 3QNNA 3K58A 3MWPA 4CF0A 4LC9B 3NVKA 4K41A 3C65A 1RDUA 3NF8A 5MLCQ 1OH5A 4JI3K 1BA0A 1Y64A 5AQFA 5KQ8A 3ZT0A 4CE9A 3QEXA 1EXQA 4CGDA 4FOIA 1U6ZA 1WLJA 4LH4A 1SL2A 5HRPA 1RDCA 3DWLA 3KWGA 1ZYQA 5BPNA 1CZAN 4FWLA 1Q86O 2VGMA 3K5LA 4FW2A 3C7NA 1HNWK 2PFUA 3WQTA 3TI0A 1IKWA 1NGJA 3VTHA 4QOZB 4BQLA 3V1OA 4BR4A 4OKJA 4B3OA 2RF2A 4BR7A 4IOAL 2HF4A 4JI8K 4AH9A 1ASUA 4CEQA 3KHYA 4O8KA 5AQMA 5GADP 1MWKA 1I3AA 3DXKA 5TKYA 4DKWA 3OY9A 4JRQA 4B8AB 1RT2A 1X9WA 4O5BA 1Z26A 1EWRA 2QA4N 3SUQA 2UU9K 4BACA 3UE5A 5JLHA 2ZM6K 1TUUA 3TR8A 1KRPA 3A2FA 4KRFA 1NGAA 1SL0A 1NGCA 1KVAA 1Z25A 4B1VA 1VQ5N 4CZJA 3DJCA 4DR7K 1Y97A 4OLBA 3O8MA 1LWFA 2VWKA 1JLEA 4W5TA 3ALYA 4LSLA 2ZWHA 3P4IA 5KGWA 3CETA 4FJGA 5JMVA 1WBDA 2J4RA 3O9UA 4FWOA 1L5UA 4YOXA 3WNHA 3ZLJA 3IUCA 4BQZA 4M7XA 4O44A 4DG1A 2DY4A 3ATVA 4KO0A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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