3CCLN

Structure of anisomycin resistant 50s ribosomal subunit: 23s rrna mutation u2535c. density for anisomycin is visible but not included in model.
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
186
structure length
186
Chain Sequence
ATGPRYKVPMRRRREARTDYHQRLRLLKSGKPRLVARKSNKHVRAQLVTLGPNGDDTLASAHSSDLAEYGWEAPTGNMPSAYLTGLLAGLRAQEAGVEEAVLDIGLNSPTPGSKVFAIQEGAIDAGLDIPHNDDVLADWQRTRGAHIAEYDEQLEEPLYSGDFDAADLPEHFDELRETLLDGDIEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Ribosome
molecule keywords 50S ribosomal protein L2P
publication title Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb
total genus 45
structure length 186
sequence length 186
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
N PF17144 Ribosomal_L5e Ribosomal large subunit proteins 60S L5, and 50S L18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cclN00
3CCQN 1K9MO 2OTJN 1VQ4N 3CC2N 3I55N 1VQ8N 4UY8O 5GADP 1VQNN 4WFNL 1S72N 4IOAL 1Q86O 1VQ7N 1KD1O 1K73O 1M90O 1YI2N 1ILYA 3CCLN 3OW2M 1VQON 1KC8O 1QVGM 3CCEN 5MLCQ 1VQ9N 4WCEL 1VQMN 1OVYA 2QEXN 5HL7L 1VQPN 4WF9L 2OTLN 3CCVN 5GAGP 1YIJN 5GAEP 4WFAL 3CCRN 3CXCM 3CF5L 1M1KO 3G4SN 5JVGL 1Q7YO 4U67L 3CD6N 3CC4N 3CMAN 1VQ6N 1Q81O 1YJWN 1W2BM 3J7ZO 2ZJQL 1VQ5N 1YJ9N 1JJ2M 4WFBL 1NJIO 3CCUN 5DM7L 1YITN 3CCJN 1VQKN 3DLLL 3CPWM 5H1SQ 3CCMN 3CCSN 3CC7N 3PIPL 2ZJPL 2QA4N 5JVHL 4IO9L 3PIOL 1K8AO 3G71N 3I56N 5DM6L 5GAHP 3CMEN 1QVFM 1KQSM 1Q82O 1YHQN 1N8RO 4IOCL 2ZJRL 1VQLN 3G6EN 1YJNN
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2QWQA 1S6PA 3CERA 3L6QA 3HPOA 4PL8A 2G8WA 4E7IA 1Q9XA 5KPTA 5AQHA 3CIPA 4JRQA 2G8IA 3FR0A 4O55A 4I2PA 4DQPA 1Z05A 2IVNA 1ZBUA 4KREA 3DLKA 2YHXA 1RTIA 2NRHA 3QB0A 3C6HA 3F2KA 2RPIA 1HPZA 1QQMA 4DR1K 4FLYA 4B3RK 4DTNA 1VQON 1D4XA 4BRHA 1NMNA 4O5BA 4DV3K 2CH6A 5HRRA 3HO1A 5M1PA 5AQFA 5T7BA 1VQ9N 3UKUA 2VQEK 1QS4A 5AQQA 3DLGA 3C6AA 4DR6K 3SAHA 4JKGA 4B8AB 4AHVA 3OS1A 2P9NA 4J2BA 3CD6N 4BG8A 3OYBA 1XC9A 4FXDA 2KTQA 5ADXH 4CJEA 5AQPA 3SBTA 4FPAA 4IXCA 3E9LA 3J7ZO 1TKDA 4JI4K 1CZAN 3JXUA 3V9ZA 3DRRA 3H3OB 1NGFA 4DF4A 2LSNA 4CJVA 3GL1A 3HM8A 2E8AA 3CCMN 4KH4A 4GV9A 4KHWA 4DV0K 4RW4A 1EWQA 1QQNA 3AVLA 5AQOA 5AFUA 4CHNA 1BG3A 4MQ3A 3O9RA 1R0AA 1C1CA 1W97L 5BRDA 4DSIA 3ALYA 3OYIA 3I8DA 1BO5O 3LP0A 4M3XA 1GLBG 4JKBA 3O9UA 3CCQN 3QERA 2Q31A 4OKEA 2DFEA 1KFSA 4PA1A 4GVEA 3EKSA 4LF7K 2HHWA 1U04A 3THYB 2HVIA 4LF6K 2O4IA 3WNEA 3VGKA 1CLQA 3F5TA 2ZGYA 3C95A 4M3WA 2Z1HA 3HJFA 1GLLO 3E01A 3D2FB 1ZYQA 2FSJA 3H1VX 1Y64A 3A2FA 3VERA 4CGIA 4LFAK 3THWA 2Q36A 3S3MA 3UB5A 1TAQA 4I7FA 4B9VA 3P39A 4KI6A 4CERA 3CG7A 3M5RA 3U6FA 2UUBK 3QEIA 3TAFA 5KGWA 3AVFA 5AJ3K 4Z4GA 4G9ZA 1EWRA 2HMPA 3ZSWA 4CE9A 1N34K 5MLCQ 3P1GA 4CBUA 1EXQA 3WT0A 4YOXA 4BGAA 3R1XA 4DUYK 1S3XA 4GV6A 4CF1A 4CW7B 4CBXA 1S1VA 4FO0A 2A3ZA 1J5EK 4EZ6A 2D5RA 3DRSA 4CEEA 1TK8A 5AZIA 3TTCA 4B9MA 2IGIA 4KKOA 4CZGA 4FJLA 4CZKA 1KAZA 4DV7K 2KZZA 4KB1A 3KKSA 5JICA 3JAMO 4DTOA 1WBDA 2A1RA 5I3UA 1D8YA 3V81A 1SKSA 3KK1A 4E0DA 1SV5A 4ILHA 2Q97A 2VGMA 5BREA 3CFPA 3L4QA 3VQQA 1E4GT 3LDNA 3K9KA 3MK6A 4CFAA 4MO4A 5AQUA 1YTUA 4KBOA 4M7XA 1IBMK 1RTDA 2W6KA 1EP4A 1HLUA 3G71N 3C94A 3EYZA 3C6UA 2Y1JA 1SKRA 5FROA 2H3GX 4DB3A 4PKHA 3T1AA 4HUFA 1NGIA 3ATVA 4DUZK 4WQ4C 1JLEA 3NGZA 1YHQN 1K6YA 3ZX3A 3ZYYX 1CXQA 2ZF5O 1WSFA 3SYZA 4MDAA 5KRTA 5AQTA 4JI5K 3VA3A 4NYFA 4HTUA 4HTLA 3VPZA 3O1WA 4IEEA 4IO8A 4CJQA 2DPNA 2YNFA 4AHRA 4E7HA 4DHYA 4JK9A 1L3SA 1LWEA 1FK9A 3WNFA 4C1NI 2E6LA 2WONA 3TAQA 3ZSZA 1T05A 3O8MA 4DV1K 3JYTA 1MWKA 3EE9A 5BPLA 4DKWA 3ZETB 3QESA 5CZ1A 4B1WB 4B1ZA 1IJJA 2P9SB 2P9PA 1IKVA 1FKOA 2E2OA 4BG9A 3SAFA 2IIRA 3QICA 4DV2K 3RSEA 1NK7A 3NF7A 4GVMA 4NYNA 1TUYA 2FBYA 2UXBK 4K8ZA 3DM2A 1KVCA 3DXKB 3NFAA 3TWHA 5KGXA 5HL7L 3IDHA 1HMVA 4WF9L 4DSFA 2XY5A 4KV8A 4DG1A 4CVNE 1NK8A 1WN7A 1JLBA 1V4SA 2FBVA 1EETA 1SAZA 3CF5L 3LWLA 5JVGL 2A41A 3QO9A 3VESA 3ZEUA 3P4IA 4M63C 1BU6O 3AO2A 1VQ6N 3CJ9A 2CGLA 1RBSA 2JLEA 2P9IB 4FWMA 3F73A 1ITGA 4FJ9A 4YY3K 3SCXA 1OVQA 4W5NA 3T69A 4NXNK 4CJKA 3HZ6A 4F3TA 2VG6A 2HNYA 4ELUA 3WEEA 1VQKN 4CGFA 1W0HA 1XUPO 5JS1A 4O5FA 4JI7K 1JL1A 1DGKN 4DS5A 3RMCA 4CJ3A 3KK3A 1YT3A 5F0XA 4BRLA 1TYQA 4DQSA 4A5BA 2QK9A 1I3AA 3HYFA 3FFKB 2FC0A 3DXMB 1REVA 2IDOA 1WAJA 5DM6L 2HW3A 1WB9A 4PL7A 3HPHA 4B3SK 3K57A 2E2NA 4ZTFA 5FPDA 4FCYA 3OA9A 4FWNA 3EEQA 4DR3K 4IOXA 3A5MC 3O9SA 5AQKA 4V19S 2OANA 3KIOA 1N32K 1OKJA 2X78A 1NGCA 3F9MA 4DR5K 3NH1A 5AQNA 3CQXA 1HRHA 2NRWA 3OTOK 3HOSA 3A5OC 4OO1J 3LL3A 1YUWA 3C0BA 3MWPA 1UOCA 3DMJA 3OYNA 4F3OA 3CM5A 3PSIA 4ELTA 3BP8A 2KZMA 2F96A 3TAGA 3C6TA 3ULDA 3ULEA 4NCAA 3OW2M 2RKIA 2HF3A 2F9WA 3HRGA 3J81O 2HHUA 4FW2A 5AZJA 4BWMA 1N36K 1Y97A 2IVOA 2E2PA 3S9HA 4K25A 2OTLN 2F8SA 1GOAA 3LANA 1NU0A 2Q0UA 2F9TA 3K0SA 4WFAL 2E1ZA 4FYDA 1EQYA 3IG1A 4OPHA 5SWMA 1HNVA 2VGNA 3MDQA 1ASUA 3L2WA 3C7NB 5B8HA 1U4BA 4AQYK 4JKFA 1C1BA 2HHSA 4JS5A 1HNIA 4PY5A 1ATSA 5EXWA 4XH4A 4JNEA 5BPMA 4CF2A 4LF9K 4DCHA 2B6AA 2F8TA 3AA3A 3V4IA 1NG9A 2YJEA 2HBKA 1LCUA 1XMQK 1DTTA 1B9FA 1X3NA 5KRSA 3NF9A 4FJ8A 3DRPA 2YX6A 1X9WA 4BDZA 4CEQA 3PIOL 3G0ZA 4OJRA 3UE5A 4B1YB 4A2AA 3K5OA 3NCIA 5EY4A 5GAHP 1WSGA 4PWDA 3O4WA 1Z6RA 1X9JA 4OKJA 1VQLN 3VQCA 1K8KB 1GOCA 4CEZA 3LAMA 3CPEA 3CC2N 1RBTA 2D4WA 1DTQA 4HUEA 2OPRA 3EE8A 4C8NA 3ISNC 3CM6A 3VOVA 3B6OA 4CJ7A 1TKTA 2NRRA 4BR5A 4CIEA 1ZBHA 4LC9B 3NE6A 2YCHA 3LP3A 4Z4CA 4Z0UA 4BR2A 1XNRK 4EHUA 5EOYA 4BQLA 1RT4A 4N47A 4KHUA 3TPQA 1QTMA 1YI2N 4BRDA 3EZWA 3VGMA 2XY6A 4X62K 4M42A 4PUOA 2A42A 4C8LA 4B1UB 3GDQA 1BDGA 2GWKA 4X64K 5AQWA 3NF6A 3V1QA 3RVCA 4MFBA 4JI0K 2ITGA 3T1HK 1HYVA 3O4QA 3VN5A 4U67L 3TANA 1FJGK 1RDAA 1EX4A 2UYTA 2V7ZA 4ZTJA 4OX9K 3IUCA 4I6MA 3OYJA 3O9QA 4IFVA 2AP1A 1HYSA 2UXCK 2FBTA 3VTIA 4KPYA 3SJJA 4FSVA 1TL3A 3AAPA 3ZSVA 4CJ5A 1L3UA 4DS4A 3QBXA 3RRGA 2OZMA 3EKUA 1RDCA 2O8BB 1BI4B 4TSXA 3QETA 1EKEA 3SQ2A 2KFZA 5CYMA 3DLHA 3ID6A 3UKRA 1ZBLA 3H6EA 3I0RA 2P9KA 3SUOA 1W9HA 1NGBA 2GEMA 4FK2A 3SJHA 3VEVA 4CHQA 4H0YB 5JLHA 3ID8A 3AA4A 3TSQA 3WXLA 1SZ2A 4MDBA 3OS2A 1ASVA 1SKWA 1RDWX 2HVHA 4DR4K 4N41A 3DOLA 3EO3A 2HBJA 1VSFA 3QIOA 2ZQBA 4DQQA 2O8CA 1L3TA 1VSMA 4BREA 4CFBA 3AARA 1ASWA 3RMBA 2RN2A 4Q5VA 3C65A 4CCHA 5TKWA 4ISGA 4BRGA 1VAZA 3AVHA 3K2PA 5AFUH 3HBTA 4YORA 2BUPA 3TU5A 2A1SA 2B4JA 4AM7A 1JLQA 3WEEB 2Z1JA 3MAQA 2O8FA 1NGHA 4H5RA 4CESA 2O8DA 3DYAA 1WSIA 1TYQB 3IAYA 1EO1A 3SPZA 1KLMA 5C24A 3QIPA 5TKYA 5E84A 2QWRA 3PUFA 3O9TA 1KAXA 4CZEA 3SNNA 3G4SN 2VQFK 4ISEA 3U8XA 3D45A 2P9UB 2YNIA 1B92A 2EHGA 4LSLA 2HHHK 5J2MA 5KPZA 3K59A 3ENBA 4BRAA 4EP4A 3VQ8A 1VHXA 1QHTA 1KRPA 5DK5A 3VQ6A 1NJYA 3AVAA 2BGGA 4CHZA 1QSLA 4OGEA 3V9SA 3OBYA 4KFBA 2HHVA 5C2DA 4CF8A 1BISA 3V9UA 4F9OA 4CZLA 2HB5A 1TAUA 3ITHA 2WUSA 3NDKA 1TUUA 1SUQA 2I7PA 3VMFB 3RWUA 3GG4A 4BRCA 4PKIA 4BR0A 3SQ1A 1TKZA 3QINA 3DOKA 3HL8A 1J54A 1RT6A 4IKFA 3TAEA 3RR8A 3LAKA 1A5WA 4CJ4A 4BQZA 3J80O 4FM1A 1Z26A 3V1RA 4C8KA 1NJXA 4JHDB 1XWLA 4JD2B 3DJCA 3VF4A 5D3GA 4GY2B 2FXUA 3AVCA 3Q7CA 4NCBA 4YOUA 1RDUA 2NZTA 1JL2A 5ELZA 2PAVA 3D2EA 4WYBA 5C25A 3SMPA 1C0GA 5EVZA 1KC8O 1LAVA 4G1QA 2VG7A 4FWOA 1NKEA 3JSMA 1VSIA 4EHTA 1XQSC 3S3OA 2QEXN 2KKZA 1JKHA 3K5MA 2BE2A 4IBNA 3NVMA 3MXMA 3WNHA 1LAWA 4B9TA 5EX5A 4FK0A 1NGJA 2I7NA 4FOIA 4FVMA 4BR9A 3LDSA 5BR9A 3QFPA 1Q7YO 3PY8A 3ZT1A 4H5WA 3QEPA 1RBVA 1NGEA 4JI1K 5GIOA 3OYMA 2A6AA 3FZMA 5JMVA 3R6MA 4DTMA 1SL2A 4DTXA 1MDUB 3IKMA 1SQKA 4N5SA 4QS9A 1JCGA 1T7PA 4UQGA 4WFBL 5J2PA 4C1NK 5CHIA 2NRVA 3CCUN 4CZIA 1MWMA 1QQCA 1IG8A 3VF6A 1NBWA 4A5AA 3CPWM 4IG0A 2IOCA 5K14A 3VEOA 3CC7N 4CEOA 2QWPA 1E3MA 2QA4N 5JVHL 4YHHK 4BRFA 2VWBA 2KQ2A 3H08A 4FLZA 1JLFA 5ADXA 2VYPA 1JXBA 4FM0A 2WOMA 4OPKA 2E4LA 2QM1A 2O8EB 4H0XB 3BF3A 1SL0A 2E20A 4FOEA 4J2DA 4BACA 5KQ8A 1VQ8N 2HSTA 2JGUA 1HR0K 4HHTA 1RDDA 3FE1A 4DQIA 3CJ1A 4BC3A 2VCPA 3S41A 4KTZA 3PO5A 1HNXK 5E26A 1QSSA 1T6CA 5AR0A 1IH7A 4E7JA 1U49A 3QEWA 4I2QA 3TR8A 4I6MB 1KD1O 4EAHD 1VK0A 3VQPA 1RT7A 4CZFA 4K8XA 4BRIA 1M90O 3P5JA 1N33K 3BZCA 4IJAA 4FWSA 5CY4A 3Q7BA 4JLHA 3FFIA 3EN9A 1JCFA 2ZGZA 5I9EB 2G8VA 1TK0A 1RTHA 3BGRA 3KHYA 2P9KB 4X65K 3KLEA 3HPGA 5I42A 4OPJA 3AA2A 3ZSYA 4DSEA 4JKAA 3KLHA 1T44A 4XEIA 3U9ZA 2HBMA 3QNOA 3LDLA 3LM2A 5C15A 3MN7A 4E19A 1NLVA 3LDPA 3B6PA 2X6SA 4BRQA 2YKMA 4H4MA 1VQ5N 1HUXA 4KTWA 3DLBA 4FZXC 3FLCO 1HPMA 1RTJA 3M6GA 3WUHA 1J6ZA 3KK7A 1LW2A 3OHRA 5FPNA 4E89A 4H8KA 3DWLA 3HM9A 2OA8A 1HKGA 1O1WA 3OYLA 2P9LA 5BRHA 1QSYA 2IAJA 3FZLA 3QEVA 2XY7A 3VEWA 3O5BA 1IKYA 3LWMA 3NVKA 3LP1A 2FSKA 3L3UA 4CJWA 5LMNK 2P5GA 3LPUA 4CEFA 3HT3A 4RWTA 2ASPA 4BE0A 3L2RA 3THXA 3L0QA 4B3TK 5CE3A 3GOIA 4KHPK 4GW6A 3CQ8A 3U3GA 4AH9A 5HLFA 5A2QO 4CJFA 2W40A 3O3HA 2XY8A 3T19A 5SZTA 1WBBA 3KZBA 1QE1A 1S1XA 4BRPA 3NF8A 4FWQA 4L8RB 3H45C 3ZSXA 5GIPA 4C23A 4DF8A 4U7BA 3UKUB 1QZ5A 1HX1A 4Z4IA 3AGKA 4WE1A 4PHTX 3RMAA 2D0CA 4QOZB 4CZMA 4A2BA 3VQ7A 4N76A 4B9QA 3M8RA 4JKGB 1QVGM 1YTAA 2P9NB 3KLIA 4QS7A 1HKBA 2G8UA 2HHQA 4FVUA 4XH1A 3FZHA 2WBNA 3CCVN 1BQMA 3SV4A 4RTFD 4DTUA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3CCQ N;  1K9M O;  2OTJ N;  1VQ4 N;  3CC2 N;  3I55 N;  1VQ8 N;  4UY8 O;  5GAD P;  1VQN N;  4WFN L;  1S72 N;  4IOA L;  1Q86 O;  1VQ7 N;  1KD1 O;  1K73 O;  1M90 O;  1YI2 N;  1ILY A;  3CCL N;  3OW2 M;  1VQO N;  1KC8 O;  1QVG M;  3CCE N;  5MLC Q;  1VQ9 N;  4WCE L;  1VQM N;  1OVY A;  2QEX N;  5HL7 L;  1VQP N;  4WF9 L;  2OTL N;  3CCV N;  5GAG P;  1YIJ N;  5GAE P;  4WFA L;  3CCR N;  3CXC M;  3CF5 L;  1M1K O;  3G4S N;  5JVG L;  1Q7Y O;  4U67 L;  3CD6 N;  3CC4 N;  3CMA N;  1VQ6 N;  1Q81 O;  1YJW N;  1W2B M;  3J7Z O;  2ZJQ L;  1VQ5 N;  1YJ9 N;  1JJ2 M;  4WFB L;  1NJI O;  3CCU N;  5DM7 L;  1YIT N;  3CCJ N;  1VQK N;  3DLL L;  3CPW M;  5H1S Q;  3CCM N;  3CCS N;  3CC7 N;  3PIP L;  2ZJP L;  2QA4 N;  5JVH L;  4IO9 L;  3PIO L;  1K8A O;  3G71 N;  3I56 N;  5DM6 L;  5GAH P;  3CME N;  1QVF M;  1KQS M;  1Q82 O;  1YHQ N;  1N8R O;  4IOC L;  2ZJR L;  1VQL N;  3G6E N;  1YJN N; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 2QWQ A;  1S6P A;  3CER A;  3L6Q A;  3HPO A;  4PL8 A;  2G8W A;  4E7I A;  1Q9X A;  5KPT A;  5AQH A;  3CIP A;  4JRQ A;  2G8I A;  3FR0 A;  4O55 A;  4I2P A;  4DQP A;  1Z05 A;  2IVN A;  1ZBU A;  4KRE A;  3DLK A;  2YHX A;  1RTI A;  2NRH A;  3QB0 A;  3C6H A;  3F2K A;  2RPI A;  1HPZ A;  1QQM A;  4DR1 K;  4FLY A;  4B3R K;  4DTN A;  1VQO N;  1D4X A;  4BRH A;  1NMN A;  4O5B A;  4DV3 K;  2CH6 A;  5HRR A;  3HO1 A;  5M1P A;  5AQF A;  5T7B A;  1VQ9 N;  3UKU A;  2VQE K;  1QS4 A;  5AQQ A;  3DLG A;  3C6A A;  4DR6 K;  3SAH A;  4JKG A;  4B8A B;  4AHV A;  3OS1 A;  2P9N A;  4J2B A;  3CD6 N;  4BG8 A;  3OYB A;  1XC9 A;  4FXD A;  2KTQ A;  5ADX H;  4CJE A;  5AQP A;  3SBT A;  4FPA A;  4IXC A;  3E9L A;  3J7Z O;  1TKD A;  4JI4 K;  1CZA N;  3JXU A;  3V9Z A;  3DRR A;  3H3O B;  1NGF A;  4DF4 A;  2LSN A;  4CJV A;  3GL1 A;  3HM8 A;  2E8A A;  3CCM N;  4KH4 A;  4GV9 A;  4KHW A;  4DV0 K;  4RW4 A;  1EWQ A;  1QQN A;  3AVL A;  5AQO A;  5AFU A;  4CHN A;  1BG3 A;  4MQ3 A;  3O9R A;  1R0A A;  1C1C A;  1W97 L;  5BRD A;  4DSI A;  3ALY A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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