The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
24
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sequence length |
65
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structure length |
65
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Chain Sequence |
TVLHVQEIRDMTPAEREAELDDLKTELLNARAVQAAGGAPENPGRIKELRKAIARIKTIQGEEGD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Ribosome
|
| molecule keywords |
50S ribosomal protein L2P
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| publication title |
Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb |
| total genus |
24
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| structure length |
65
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| sequence length |
65
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-02-26 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| V | PF00831 | Ribosomal_L29 | Ribosomal L29 protein |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | Helix Hairpins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1Q86 W; 3CCU V; 1S72 V; 1Q81 W; 4WFB V; 3I56 V; 1YJN V; 1M1K W; 2OTL V; 1VQ6 V; 3CMA V; 3CCR V; 3CME V; 1R73 A; 2D3O W; 4WFA V; 3CC7 V; 1YIT V; 4WCE V; 3CCJ V; 1QVG U; 1VQL V; 1W2B U; 3CC2 V; 1Q82 W; 3CCL V; 1KQS U; 2QA4 V; 1YJW V; 4WF9 V; 1YJ9 V; 1K8A W; 1VQN V; 1KC8 W; 3I55 V; 3CD6 V; 1VQ7 V; 1M90 W; 2OTJ V; 1K9M W; 1VQO V; 1KD1 W; 1VQ4 V; 1VQ8 V; 3G71 V; 1YI2 V; 1YIJ V; 3CCS V; 3CCV V; 1VQK V; 1QVF U; 3CXC U; 1VQP V; 1VQ9 V; 1YHQ V; 1NJI W; 1Q7Y W; 1VQM V; 2QEX V; 3G6E V; 1VQ5 V; 3CCE V; 3CCQ V; 3OW2 U; 3CPW U; 5DM6 V; 3CCM V; 3G4S V; 1K73 W; 3CC4 V; 1N8R W; 1JJ2 U; #chains in the Genus database with same CATH topology 3BAB A; 4UVC A; 5EK0 A; 4R50 A; 1BQZ A; 1R73 A; 1KYO F; 4NR1 A; 1AJN A; 3K06 A; 4L87 A; 4J7K A; 2IU0 A; 1GO3 F; 4GYC B; 1KB9 F; 3HKB A; 1VQN V; 4EKW A; 1N32 B; 4FK5 C; 1JPX A; 2DYR C; 4Q20 A; 1VQM V; 4LFC B; 3SJC C; 3ABK B; 5IDJ A; 4JI3 O; 3CCQ V; 1GN3 A; 2HFE C; 5L3D A; 4X89 A; 3ZHQ A; 4LCU C; 1THZ A; 3W7W A; 4BIO A; 2DQ3 A; 1XUQ A; 2WPD G; 4LF9 B; 4GKK O; 4LFA B; 5B3S C; 2A06 H; 5CB4 A; 4I55 B; 2VWJ A; 3OR7 C; 2KSD A; 2DYS B; 3W7U A; 2XND G; 3ZN0 A; 4WFH A; 5J9P C; 4IYI A; 3SYO A; 1QHT A; 4JF3 A; 1ZL8 B; 1L8D A; 4JI8 B; 1KMI Z; 2FKX A; 3T4D A; 2R9I A; 3AG2 B; 2CAZ C; 1AP6 A; 4DR5 B; 3DSQ A; 2WLN A; 1Q43 A; 3MHS C; 4CH6 A; 1K4C C; 2DWE C; 4PHZ A; 2DN9 A; 3UCS C; 3OW2 U; 1H2M A; 2H8P C; 2EBO A; 1XNR B; 3CYO A; 1K5Q A; 4I0X A; 1DLB A; 3D36 C; 4RUE A; 1IBK B; 5B1N A; 2ARH A; 2QWQ B; 4EB6 B; 2KKW A; 4FFK A; 1OCC C; 1F23 A; 1RM1 B; 3STZ C; 1O9H A; 5EZY A; 3HKD B; 1RP3 B; 1N36 O; 2UUC O; 4LFA O; 1R3J C; 5C93 A; 1BQ0 A; 4ZKI A; 4PA7 A; 2ZE8 A; 5LGT A; 3JAL B; 2VQE B; 2E74 B; 3P3N A; 1AB3 A; 3TET A; 4MVR A; 1G4Y B; 4BW5 A; 3HR0 A; 3ETD A; 1Y6X A; 3JD2 A; 4NXM O; 3IJ4 A; 5KHK A; 2X6C A; 3F7Y C; 1YZB A; 1YHQ V; 4FFB B; 1SZT A; 4PEL A; 1XBL A; 2Z0A A; 1PM9 A; 2DWD C; 1EBO A; 3CCM V; 2DOS A; 2P22 C; 3BHP A; 3QVN A; 1S72 V; 4J10 A; 3ETQ A; 2Y69 C; 1W0J G; 3UT5 A; 3K58 A; 1XNR O; 2W6I G; 1AI5 A; 2QTS A; 1IBK O; 2P7T C; 3HKE A; 2YIC A; 2ZNJ A; 4J9Y B; 4CS3 A; 2ZIO A; 4XDK A; 4NB5 A; 5IY5 C; 1XNQ O; 3AG3 C; 4DV3 B; 3UO2 A; 1K7D A; 1HDJ A; 4YXW G; 4N23 A; 3WG7 C; 4LR3 A; 5IWA B; 3ASO C; 1YTF B; 3K9S A; 4LNU B; 1F51 A; 3GWK C; 1YIT V; 5EYP B; 4YHH B; 2UXC B; 4JAU A; 2JJ1 G; 4G2K A; 4NTY A; 3I55 V; 2XHB A; 1VQ7 V; 3N2G B; 1I5X A; 4YJ2 B; 4PA4 A; 5CN0 A; 4X1I B; 2RDC A; 3OMI B; 4RUF A; 2WLL B; 1LNQ A; 4O4H B; 4DW1 A; 4AI8 A; 3RYC B; 3IC7 A; 3M99 B; 5B1A C; 1BMF G; 4JGS A; 3ZHS A; 5GTI Z; 4I9Q A; 1GRJ A; 4JYY A; 1GMG A; 3SJQ C; 3I56 V; 1JQ0 A; 3APQ A; 5J2U A; 3ZRX A; 4H37 A; 2JK5 C; 2LO1 A; 3E8B A; 3O65 A; 3QO8 A; 2QE7 G; 2Q5Z A; 4N21 A; 1M5I A; 3H1K H; 4PV1 B; 4UB8 Z; 2P90 A; 4J41 A; 4JI2 B; 2YI8 A; 5K1X A; 1D5A A; 4DV3 O; 4HNA A; 2QM7 A; 4AQY B; 2JEX A; 2ZCE A; 1JOY A; 4JI0 B; 2N04 A; 3MD0 A; 1HR0 O; 4JV5 B; 3FYE B; 1MZF A; 4YHH O; 1JMK C; 2UXC O; 5LA6 B; 1X4T A; 5BY1 A; 4UV8 A; 1NI8 A; 2ZIM A; 2ZD9 A; 3A0R A; 1FS0 G; 2YIA A; 3STL C; 3ETG A; 3ICX A; 2GBO A; 5H9C A; 3QG5 A; 5LOV B; 3JD1 A; 2CGN A; 1ZX3 A; 4JI6 B; 4QJF B; 5B66 Z; 4AIL C; 2P6J A; 1R6T A; 3BY6 A; 1S76 D; 2ZQM A; 4IHJ A; 3HB3 B; 3LDE A; 1UPG A; 2JEU A; 2QKC A; 2PF4 E; 5CMU A; 1QCE A; 3K0G A; 4JI2 O; 5E1A C; 3CCR V; 4LF7 B; 2FL4 A; 4AQY O; 2R72 A; 4EFB A; 3WB2 A; 5JQG A; 4JI0 O; 3FD9 A; 1K8A W; 1EZJ A; 3UQ8 A; 3TXQ A; 5FNV B; 1KBH A; 1LUV A; 1SRY A; 1PL4 A; 2OYQ A; 1Y67 A; 1SQV H; 4PI0 A; 2IW5 A; 1U96 A; 1K34 A; 5FPO A; 4JI1 O; 1JFF A; 4JI6 O; 4WFG A; 3ZRW B; 4JZ2 A; 3X2Q C; 4JAV A; 3F5T A; 3SDL A; 4TUY B; 2QWN B; 1GKF A; 3KG2 A; 1R3L C; 4GLX A; 2Y4U A; 1XMQ B; 1K3E A; 4U7N A; 3JAR A; 1IBM B; 2WLH A; 5CA0 B; 1N0J A; 1BHA A; 5HFM A; 1YJ9 V; 1N34 B; 4OX9 O; 1PL0 A; 1SZX A; 1KD1 W; 1FFX B; 4X8A A; 2OCC C; 1BGY H; 5KMG B; 2BSK A; 1YEW A; 2WLI B; 4TT3 G; 5CBG A; 3CP1 A; 2OIG A; 3FFQ A; 3RWR D; 2ZM6 B; 2JS3 A; 1QU7 A; 1VQ6 V; 2Q8V A; 5TIS Z; 3JYC A; 4JYB A; 3OMN B; 3LSQ A; 1Q6U A; 2DJV A; 3SYC A; 3FKS G; 1G8M A; 3AG1 C; 3BA8 A; 3C3T A; 5HFL A; 3DXR B; 3QNE A; 2ZIN A; 5LL6 Y; 1M90 W; 5L3F A; 2ZXW C; 2EIM C; 2PUS A; 3RW0 A; 1FKA O; 4LP8 A; 2EIJ C; 1JJ2 U; 3T1Y B; 1IZ3 A; 4MSW C; 5LXT B; 3THO A; 2ODM A; 1N33 O; 1XMQ O; 3FB5 C; 2JJ2 G; 4ASU G; 3ZX6 A; 1H2S B; 4UXN A; 3JAS A; 2IJK A; 1SQX H; 4MTX A; 4XBF A; 3CRR A; 1N34 O; 1R6K A; 4TQF A; 4DV7 B; 5KHJ A; 2BTO A; 3CS5 A; 4MVQ A; 2OT5 A; 4Z1V A; 3J7A U; 4TV8 A; 2IH1 C; 2Y0I A; 2Z5U A; 5ITZ A; 5JWP A; 2Z3Y A; 3RN4 A; 1Y76 B; 1Y74 A; 1VF6 A; 2HJD A; 3ABL C; 4MVM A; 2XT9 A; 1W59 A; 1NJI W; 1Q3E A; 1QLE B; 3P32 A; 3G6E V; 1KKC A; 4QPK A; 3E22 B; 1AR5 A; 1H8E G; 1NU1 H; 1Q5O A; 2KQX A; 3GVM A; 3T1Y O; 3SYP A; 1VEW A; 2NR5 A; 4G27 B; 1TA8 A; 2B1I A; 3W7S A; 1GN6 A; 1U97 A; 3RYH A; 1K9M W; 4QE9 A; 5B1B B; 1BE3 H; 2QGN A; 4QGP A; 3CXC U; 1DGS A; 1NH2 B; 2GUZ A; 4LF5 B; 3ASN B; 2R9A A; 1VP7 A; 4BIZ A; 4DV7 O; 1B3Q A; 5A2Q N; 4DV4 B; 4LH7 A; 1GM8 A; 1M1K W; 4UFZ A; 3Q4H A; 3CMA V; 1N0N A; 3BA9 A; 2C2A A; 3EFF K; 4R7C A; 3L71 H; 4I4T B; 2WWW A; 2Q73 A; 2QSA A; 3JD0 A; 3U11 A; 1RPO A; 4YIP A; 2F66 C; 2OCH A; 3ZS8 C; 4GZR B; 4MTF A; 4X20 A; 1MMM A; 4CH3 A; 4FM1 A; 4UCS A; 1AVM A; 1HNW B; 2A9H A; 5J2T A; 1H38 A; 4R6Z A; 1M9N A; 2KB1 A; 1ENV A; 1TVK A; 3K5N A; 1FXK B; 2VWK A; 4X1K A; 3K57 A; 3CCS V; 1NBM G; 4PD4 F; 1Z5V A; 4TWK A; 4CC5 A; 1BL8 A; 3OUS A; 4O4J A; 4LF5 O; 4ZHQ B; 2R70 A; 2A79 B; 4F6R B; 2PY5 A; 1UFI A; 4X64 B; 2RQ6 A; 2YDE A; 3JAK A; 2XUM A; 4LWS A; 3EVK A; 2VS0 A; 2AXT Z; 1E79 G; 4TV9 A; 4J80 A; 3ZIA G; 4WBN B; 2UXB B; 3ZN1 A; 4DR2 O; 4YJ3 B; 4MT8 A; 4DV1 B; 5CA1 A; 2OTL V; 3T1C A; 4U7O A; 3L70 H; 2F1M A; 1SQP H; 3M7M X; 1TUB B; 4DUZ B; 4MS2 A; 1B04 A; 1HNW O; 1K92 A; 3MHH C; 3QF7 A; 2Q7E A; 1D2D A; 2Q67 A; 4J42 A; 2K9P A; 2EIN C; 2GHY A; 2UXX A; 4X62 B; 1K73 W; 4DR6 O; 2LGQ A; 2EX3 A; 4OGQ B; 5C8Y A; 2EIL B; 3HKB B; 4WFB V; 5LP6 C; 1I5Y A; 1XMO B; 1S0V A; 2ZNI A; 2AHY A; 1JA8 A; 4FLT A; 3BCC H; 1V54 C; 4O4I A; 4X64 O; 3VQY A; 4JI7 B; 3H01 A; 5LP6 A; 1YF2 A; 4UUJ C; 4ABM A; 2D2C B; 5LGU A; 2W6J G; 2WA4 A; 4MTO A; 3U10 A; 4DV6 B; 2DYR B; 2UXB O; 1JCH A; 5KHG A; 3NXS A; 2BOB C; 1JX9 A; 2DMX A; 4CBC A; 2A3Q A; 3F5W C; 2YXH A; 5B5E Z; 1MSD A; 3CRA A; 5CB4 B; 4DV1 O; 2HP8 A; 1L0N H; 3OUF A; 1SET A; 5L3G A; 1OCO C; 2XOK G; 3CE2 A; 5IT9 N; 1SER A; 5B3S B; 5LBQ A; 4LF4 B; 3MDS A; 1GTO A; 1PNM A; 3K04 A; 3CRM A; 3OAA G; 4DV2 O; 4X62 O; 2YIB A; 2L35 A; 3IFX A; 5EIB C; 4X65 B; 1XMO O; 2X6A A; 4LF6 B; 3R65 A; 5IYC O; 1NTK H; 1M4U A; 1V9P A; 1QVF U; 3JAW B; 1N32 O; 1URF A; 3TK1 A; 1FPO A; 4JI7 O; 4I55 A; 1KP3 A; 1WAZ A; 3E2E A; 1Q86 W; 3AG2 C; 4LFC O; 5K1P A; 5LMN B; 2HVJ C; 1HNX B; 2F95 B; 5LYJ B; 1WLE A; 4KHP B; 4KP4 A; 2ZT9 B; 4O2A B; 1SF9 A; 2YID A; 4H44 B; 4D7T A; 1FJG B; 4E4E A; 5H6Q A; 1K4D C; 1YDX A; 2LJ2 A; 1US6 A; 1F4M A; 4LF9 O; 4BAY A; 1SC5 B; 3OT7 A; 1L0L H; 3SPI A; 4LF4 O; 3UO3 A; 3CHX A; 3OTO B; 2A7W A; 2YEV B; 2YI9 A; 5KA5 A; 2ZE6 A; 1COW G; 4JI8 O; 1PV0 A; 1NT2 B; 2LQT A; 5EBM C; 5A9G A; 4LH6 A; 1WPB A; 5EIB D; 3E89 A; 4DR5 O; 1Z2G A; 1Q6H A; 2F93 B; 4LF6 O; 3W7T A; 5IJ0 B; 2QEX V; 2HHH B; 3UT5 B; 4FLW A; 3HKD A; 3LNM B; 4JTD B; 3QO5 A; 4UCU A; 4ZI7 B; 3HKE B; 2GTS A; 3LDC A; 4L8J A; 5LMN O; 2YXY A; 3WU2 Z; 4MW3 A; 1HNX O; 4KHP O; 2Y69 B; 3KZI Z; 2OIE A; 4JTC B; 4X88 A; 4DRX B; 1DF4 A; 1FJG O; 1ZUQ A; 2IH3 C; 4PJ0 Z; 3U0Z A; 1VQ5 V; 3OFN G; 1XHX A; 5IY5 B; 1MSW D; 4Q6G A; 1WN7 A; 4FFB A; 2O57 A; 3BEH A; 4JAS A; 5D5Q A; 4FMT A; 2VQE O; 3ASO B; 3OTO O; 4YY3 B; 1YSC A; 3G71 V; 4JI4 B; 3OMA B; 1XI1 A; 1NR1 A; 3CEI A; 1Q7Y W; 1JR9 A; 3CCE V; 3JAT B; 4CZZ A; 2HHH O; 4JPR A; 2AW9 A; 2CH7 B; 2YUA A; 4DV5 B; 4CS2 A; 4MTG A; 2QKA A; 1EM1 A; 3D3Q A; 4K3A A; 1P7B A; 3K9A A; 1OCZ B; 2RJZ A; 1YIJ V; 5EYP A; 4CS4 A; 4HNA B; 1GAX A; 4FVM A; 4FLZ A; 2PI4 A; 3VOU A; 3N2G A; 4YJ2 A; 5L3E A; 4X1I A; 3A8T A; 5BMV B; 2WLL A; 3L74 H; 5IYZ B; 1NTM H; 4B7K A; 5IWA O; 2QJ1 A; 1IXM A; 3H1H H; 1KC8 W; 1GH6 A; 1VQ8 V; 4KUM A; 1IBL B; 4YY3 O; 1YVW A; 3CRC A; 3B8M A; 4PA3 A; 3S3W A; 2IJI A; 4RAI A; 4UCV A; 4IHJ B; 1NQT A; 5IYD O; 4NTX A; 4MW8 A; 4ZOL A; 2QA4 V; 3BVO A; 1J5E B; 4LFB B; 2ADQ B; 3UKM A; 3JD4 A; 2HKO A; 1SES A; 5LA6 A; 1MNG A; 3ABM C; 2IM9 A; 4NYK A; 1OV9 A; 4P9O A; 3C3S A; 2Q9L A; 1WP7 A; 1NKD A; 4W4K A; 2CTW A; 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1VF5 B; 4RO2 A; 1YCI A; 1AI4 A; 3RYI A; 2H3O A; 4TOI A; 4F4L A; 3B2E E; 2NLJ C; 2W0F C; 1VF6 C; 2XAG A; 3JCZ A; 5ITZ B; 4KXR A; 2ZR2 A; 2ZM6 O; 1MZE A; 4UB6 Z; 1IXB A; 4P2Z A; 1QBZ A; 4UCT A; 3SR2 C; 3CD6 V; 4J7J A; 1G1X B; 1KP2 A; 1TUE B; 2Y48 A; 1OCR B; 2EIK C; 4RQE A; 3DC5 A; 1NVP D; 4B3S B; 3ABL B; 4B3M B; 2W0X A; 1XIL A; 2P67 A; 1XL6 A; 3K79 A; 3RYF A; 4NTW A; 3CB2 A; 4DK0 A; 2GUZ B; 2FYU H; 5KX5 B; 4DR3 B; 1Y66 A; 2JS5 A; 2Y4T A; 4FM2 A; 5JH7 B; 4X66 O; 4BIU A; 2P5O A; 2V1D A; 4LF8 B; 2F4V B; 1MA1 A; 3ZJZ A; 2ILM A; 4YIO A; 1PNK A; 2M6Y A; 2HEP A; 2G38 A; 1P84 F; 2H94 A; 1AIL A; 1S3J A; 3SPJ A; 1M56 C; 3KCX A; 3L72 H; 5LHG A; 3E22 A; 3PJS K; 4R8C A; 4MVO A; 3AG4 C; 3W7X A; 1LUW A; 4H33 A; 3E8G A; 2JIZ G; 2WAM A; 1PKX A; 2B9Z A; 5JVD A; 3AK1 A; 1ORQ C; 2RCV A; 2IBZ H; 5EBW C; 3IGA C; 3WB0 A; 3ZRS A; 5J2T B; 4B3S O; 3OGC C; 1RSO A; 4B3M O; 1AR1 B; 4P30 A; 2AZ2 A; 4QPJ A; 4UCO A; 2EJ7 A; 5GON B; 5IJ9 B; 3K0D A; 3I5D A; 3CCV V; 4DR3 O; 2ZE5 A; 4GUN A; 2CE4 A; 4PDM A; 2WLJ A; 2XAF A; 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