The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
24
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sequence length |
65
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structure length |
65
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Chain Sequence |
TVLHVQEIRDMTPAEREAELDDLKTELLNARAVQAAGGAPENPGRIKELRKAIARIKTIQGEEGD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Ribosome
|
| molecule keywords |
50S ribosomal protein L2P
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| publication title |
Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb |
| total genus |
24
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| structure length |
65
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| sequence length |
65
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-02-26 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| V | PF00831 | Ribosomal_L29 | Ribosomal L29 protein |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | Helix Hairpins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1KC8 W; 3CD6 V; 1VQ6 V; 3G71 V; 4WCE V; 3CC2 V; 3CME V; 1VQP V; 1Q82 W; 1Q81 W; 3CCJ V; 3OW2 U; 1K8A W; 3CCL V; 3CCS V; 1S72 V; 1QVG U; 3CPW U; 1W2B U; 1K9M W; 1N8R W; 1VQL V; 1YJ9 V; 1VQO V; 1VQN V; 1YIJ V; 5DM6 V; 2QEX V; 1M90 W; 2QA4 V; 3CCQ V; 1R73 A; 1YHQ V; 1VQM V; 1M1K W; 4WF9 V; 1YJN V; 1YIT V; 1VQ7 V; 1K73 W; 1JJ2 U; 1VQ8 V; 3CC4 V; 1KQS U; 1QVF U; 1NJI W; 3I56 V; 4WFB V; 4WFA V; 3CMA V; 3CCV V; 2D3O W; 3CC7 V; 1KD1 W; 1VQ5 V; 1VQ9 V; 3CCE V; 1VQ4 V; 3CCM V; 3G6E V; 3CCU V; 1VQK V; 2OTL V; 3CCR V; 1YJW V; 3CXC U; 1Q7Y W; 3G4S V; 1Q86 W; 2OTJ V; 1YI2 V; 3I55 V; #chains in the Genus database with same CATH topology 4JYY A; 5J2U B; 3J80 N; 1U96 A; 2Y69 C; 3EHB B; 3CCL V; 5IYB O; 3TET A; 2WLK A; 5KHJ A; 4WFF A; 5JVD A; 5B1N A; 1GN4 A; 1XRE A; 1JOY A; 2JS3 A; 3RYF B; 4I55 B; 1XMO O; 2UUC O; 4DYL A; 1RPR A; 3H1I H; 1A32 A; 5EZY B; 3NXS A; 4AQY B; 1IDS A; 3JD3 A; 4J42 A; 4B3S B; 1IZ3 A; 3OR7 C; 1AP5 A; 1B3Q A; 4WFA V; 1W0K G; 3AG1 B; 4EB6 B; 3CCU V; 4UB8 Z; 4J7Z A; 1D5N A; 5HFM A; 2XHB A; 2HR3 A; 3ASO B; 1O9H A; 2NN4 A; 2YSU B; 2V4D A; 3ETG A; 3OE7 G; 2LO1 A; 3AG3 B; 1AP6 A; 1JVM A; 1F7Y A; 5B3S C; 4TWK A; 1FXK A; 3ABK B; 1XMQ B; 3UO3 A; 3OMN B; 3K0D A; 4E2L A; 1I5Y A; 3F5W C; 3CRC A; 4X88 A; 4UVC A; 2NR5 A; 2EIJ B; 2EIN C; 2YXH A; 4PDL A; 3KCX A; 3OFN G; 4R8C A; 5KA5 A; 5L3D A; 1XNQ B; 1MG1 A; 4D7T A; 3VOU A; 2UU9 B; 4DR6 B; 3ZMZ A; 2XAG A; 1L8D A; 4OX9 B; 4JZ2 A; 4LCU C; 3M99 B; 3SJA C; 4BIO A; 4GX1 A; 1IX9 A; 2QWR B; 3SGI A; 3H9V A; 1MZE A; 2DE0 X; 4TV9 A; 4X1I A; 1EN6 A; 4K3A A; 1SQG A; 3VQW A; 1YF2 A; 4IL6 Z; 5FLX N; 4LFC O; 3ABL C; 5LP6 A; 1BHB A; 2HJF C; 1Q7Y W; 3IJ4 A; 1H2N A; 2WAM A; 4IIJ A; 3CME V; 3CSX A; 2O57 A; 3QO8 A; 4DV5 O; 1S72 V; 2FL4 A; 1VIB A; 4JYA B; 1SET A; 2HG5 C; 4F6R A; 4FFB B; 2X6A A; 2IM9 A; 1IBL B; 3WU2 Z; 2XAF A; 4DV7 O; 1SQF A; 1RFY A; 4LF5 B; 4X8A A; 1WPB A; 4I50 A; 2OCC C; 5LOV B; 5F2V O; 1JPX A; 4TV9 B; 4JF3 A; 2Q5Z A; 1QU7 A; 4X1I B; 3K3W A; 4DR2 B; 1HNW B; 4BW5 A; 2ZT9 B; 2QGN A; 5JJN B; 1TAE A; 3UO2 A; 1EM1 A; 3Q4H A; 1V9P A; 4MTG A; 4J80 A; 4IGG A; 4IIJ B; 2QKA A; 4JI6 O; 5KUM A; 3K57 A; 1SKV A; 3RYC A; 2LW1 A; 3SJC C; 4X65 O; 2K9P A; 4F6R B; 3K03 A; 2AZ0 A; 4IHJ A; 4KHP B; 5EBL C; 3ZHU A; 1HNZ O; 2VQE O; 4JAU A; 4H0L B; 3B2E E; 3SPG A; 1K34 A; 1XL6 A; 4LF8 B; 4R50 A; 4QE9 A; 3RT3 C; 3UCS C; 4FJC C; 4I50 B; 3AG7 A; 3KCY A; 5DN6 G; 3K5M A; 4J10 A; 1PV0 A; 1HNX O; 2ZDI C; 4UCS A; 2HHH O; 2Q6A A; 1M56 C; 5BY1 A; 1QBZ A; 4DUY B; 1HR0 B; 5IJ9 A; 3E22 B; 3X2Q B; 1NU1 H; 4UCV A; 4X64 O; 2M6Y A; 4LF6 O; 2Z0A A; 4IT5 A; 1IXM A; 1Y4M A; 3Q4H B; 4XBF A; 4QPK A; 5LYJ A; 1AJN A; 3ASN C; 1ZL8 B; 3I5D A; 2IJJ A; 1VQ9 V; 1TVK A; 2H94 A; 5LMN O; 3ZRX A; 4NXM B; 4DV0 O; 5IYZ A; 1NTM H; 3RYC B; 2W0X A; 4Z1V A; 1S77 D; 5J2T A; 5L3G A; 4W4K A; 2DWD C; 4IHJ B; 2PGG A; 5EK0 A; 1PD3 A; 4R7C A; 2YXY A; 1T5E A; 5JQG A; 2YUA A; 1YDX A; 2GHY A; 4U7N A; 2YDE A; 5H2F Z; 1YI2 V; 1IBM B; 1OCC B; 5KX5 A; 4JI4 O; 2F1M A; 4ZKI A; 1PNK A; 3OEH G; 2DMX A; 5BR8 B; 2BSK A; 2X7R B; 5IJ9 B; 3HKE A; 3E8H A; 4HBN A; 4WBN B; 4FVM A; 1R73 A; 2JRI A; 1VQM V; 2WLI A; 5ITZ B; 1DK1 A; 2UUB O; 3A0R A; 1RP3 B; 3A8T A; 4MVU A; 1KMI Z; 4GKJ B; 1FJG B; 5CB4 B; 5EBW C; 4P9O A; 4B3R O; 1CP9 A; 4GUN A; 5LYJ B; 3LUT B; 1PPJ H; 4EEQ A; 2ZKO A; 1KYO F; 2CTR A; 2WLN A; 1SQV H; 2YIC A; 1I7F A; 5IYZ B; 2DQ3 A; 2ZR2 A; 3EVK A; 1XI1 A; 5J2T B; 1YJN V; 4MVR A; 2P06 A; 4J7K A; 2UUA O; 2CE4 A; 4UFZ A; 1BQ0 A; 4LFA O; 3APQ A; 5JQG B; 3DXR B; 1QR9 A; 5E1A C; 3B8N A; 5CBH A; 4ZI7 A; 4PA9 A; 4YHH O; 5KA6 A; 5KMG A; 2JEU A; 1L0L H; 3T4D A; 3QNE A; 1YTF D; 5H5N A; 2CTW A; 3CS5 A; 4PEL A; 4QNH B; 3CP1 A; 2BSK B; 1ZX3 A; 4GKK O; 2L6L A; 1N36 O; 1WB8 A; 2WLI B; 4BWA A; 1Q6U A; 1Q86 W; 3FAV A; 3AK1 A; 1NZ6 A; 2DWE C; 2KQX A; 3D3I A; 2GTS A; 5FPR A; 1K33 A; 1KEC A; 1JFF A; 1JX9 A; 3O9O A; 2IJK A; 3CPW U; 3JD4 A; 1J95 A; 2V7Q G; 3LNM B; 2IJI A; 1N0J A; 2FTK A; 5H6R A; 1SES A; 3JAR A; 2WA4 A; 2PUS A; 2PZS A; 2MW2 B; 2AXT Z; 2Z3Y A; 4PV1 B; 3T1C A; 3QO5 A; 5HFL A; 3CRM A; 4F6E A; 5B1A B; 4ZOL A; 1N34 O; 3B40 A; 1ZUQ A; 5KMG B; 4R6Z A; 4I9Q A; 3LDE A; 2QWP B; 4CC5 A; 4GX0 A; 1NTK H; 4GLX A; 4DUZ O; 1JA8 A; 3E89 A; 3VQX A; 4YJ3 B; 2QKC A; 2ADP A; 3WB0 A; 2F4V B; 1MAB G; 3S3W A; 2CGN A; 4HAM A; 1Y76 A; 4NTX A; 1SA0 A; 1BS3 A; 3K08 A; 2WLL A; 1AJQ A; 3AG1 C; 2F95 B; 4I4T B; 5JCO C; 1SQP H; 1VQO V; 3B4S A; 2NNU A; 3ASO C; 3K5N A; 1CEZ A; 4ICG A; 4X1K A; 1JR9 A; 1K4D C; 4Z2W A; 3TGU H; 5LXT A; 1R6N A; 1WA8 A; 3AG3 C; 3SPI A; 2OWO A; 2QKS A; 3D3Q A; 3BPZ A; 4LH7 A; 4D7S A; 4DV6 O; 3JAR B; 5C8Y A; 4N23 A; 2QWO B; 3E8B A; 4FMT A; 3ABK C; 3SDL A; 2X0L A; 1UPG A; 5IWA O; 3A0H Z; 3G6B A; 2P7T C; 2UXD O; 3K5O A; 3W7S A; 1FFT B; 1IBK B; 1NBM G; 3L72 H; 4WFG A; 2RMK B; 4ZOL B; 2ILM A; 3F7Y C; 1P7G A; 4Q20 A; 4MVM A; 2Q0A A; 4K0K B; 5JJE B; 2WSS G; 3K9A A; 3ZIA G; 2XAH A; 4WCE V; 5EYP A; 4UV9 A; 2P22 C; 5CBF A; 1Y76 B; 1SA0 B; 3T1H B; 1VF6 A; 2WLL B; 3BEH A; 2PTM A; 4UCU A; 2F66 C; 2X6B A; 2Q73 A; 2QE7 G; 4DV1 B; 5EIB D; 2VWK A; 4RWU A; 3BFR A; 3U10 A; 4LF4 O; 1VQ6 V; 2E75 B; 1WA8 B; 4FPP A; 3HR0 A; 3RYI A; 2E3C A; 1FXH A; 2LW7 A; 4O4I B; 1EZJ A; 4GX2 A; 1HDJ A; 4NVP A; 1Q3E A; 1NJI W; 4JI0 B; 2Q69 A; 4FLZ A; 2WLH A; 4JAA A; 3FB8 C; 4UCR A; 3RBZ A; 2VQF O; 3H01 A; 3OT7 A; 4DR3 B; 2KG7 A; 1BE3 H; 1MOF A; 2DYS B; 1H2M A; 5CA3 A; 5IYD O; 2Q7E A; 2DYR B; 3HKB A; 3ZN0 A; 2ODM A; 4CC6 A; 5EYP B; 3D8C A; 4DR7 O; 4YIO A; 1TUB B; 2Y48 A; 3HKD B; 4TOI A; 1IUR A; 3G4S V; 4UUJ C; 1YTF B; 2UXC B; 4GT1 A; 3AEI A; 2XOK G; 4B7E A; 4DO2 A; 2Q4P A; 4LFB B; 1TUE B; 1N4C A; 4N21 A; 4YY3 O; 4LF9 B; 3MAQ A; 3G6E V; 4DR4 O; 4BW9 A; 4JYB A; 5EBM C; 2AHY A; 1VQ7 V; 2EZP A; 1M57 B; 5KAI Z; 2GBO A; 1XDC A; 5CA0 A; 3L9D A; 4PDV A; 3VQV A; 5IYC O; 2RJZ A; 2KG7 B; 4NXN O; 1KQS U; 2JGU A; 3JAW A; 4EFE A; 3S3X A; 1VQK V; 4Z1M G; 3CCR V; 2JDI G; 3CJH A; 1R3I C; 1GKF A; 3W7T A; 1KC8 W; 5A9G A; 3SPH A; 3RVY A; 2R9A A; 4O2B A; 4GX5 A; 2BCC H; 1RM1 B; 2RCV A; 4FLU A; 4NKG B; 3HB3 B; 1ZSP A; 3IFX A; 3X2Q C; 1BT8 A; 4B08 A; 1E79 G; 3QF7 A; 1YJW V; 5JVD B; 1FKA O; 1YIJ V; 5JH7 A; 3P32 A; 4NB5 A; 4U3J A; 2OYQ A; 3H1K H; 2QTS A; 1QLE B; 1BCC H; 5CBG A; 1YIT V; 2VRZ A; 1AJP A; 2FML A; 5CA0 B; 2EZO A; 2Y4T A; 5KLV H; 4PI2 A; 1XMQ O; 1GH6 A; 3JSN A; 1BHA A; 3DGE A; 3D36 C; 2OIG A; 2F23 A; 4I0X A; 1W0J G; 1AR1 B; 3B8M A; 4EKW A; 2HFE C; 1UJW B; 1K9M W; 1I5X A; 1S76 D; 2PI5 A; 4H37 A; 1OCC C; 4G28 B; 1G6U A; 1XNQ O; 1P7B A; 1RSO A; 1WPX A; 1HW7 A; 5J9P C; 1VQ4 V; 4DR6 O; 2CUG A; 2EIM C; 2LP7 A; 4O4L A; 5AG2 A; 3TK1 A; 1FXK B; 3K06 A; 1N32 B; 2CK3 G; 4LWS A; 4TSF G; 4ABM A; 4KFM A; 3FD9 A; 4ZIB A; 3LSS A; 3O65 A; 3GB7 C; 5JH7 B; 4GZR B; 2RDC A; 4LF7 O; 4NTY A; 1XOU A; 2HEP A; 4U3J B; 4QIW F; 1E1R G; 1AI7 A; 1SS3 A; 2R9R B; 2GTA A; 3SYA A; 4XDK A; 4DV7 B; 3OTO B; 1P4R A; 3ZBH A; 5LHH A; 3W7X A; 3HKC A; 3OM3 B; 4JAS A; 1OHH G; 4DV2 B; 2QM4 A; 4FLT A; 2UXB B; 2A06 H; 1FD9 A; 2Q68 A; 3RN4 A; 2X6C A; 4UVB A; 3ZMS A; 3FKS G; 3M7M X; 3CCV V; 3FX7 A; 4JYA O; 1CPY A; 1CXZ B; 2N74 A; 2ZXW B; 4X1Y A; 2G38 A; 1Y67 A; 2ZNI A; 3F7V C; 5H9C A; 3CC2 V; 3K59 A; 4LC1 A; 5LP6 B; 3K04 A; 4O4L B; 1Q43 A; 5JWP A; 3SJB C; 1ENV A; 4LWS B; 2CGO A; 2PY5 A; 2YEV A; 1M9N A; 4B3T B; 4I9W A; 3ETQ A; 3CC7 V; 3QTC A; 4MVZ A; 1HNZ B; 1BL8 A; 4XDL A; 5LL6 Y; 4DR2 O; 4UVA A; 4AIL C; 1VEW A; 1HNW O; 4JI8 O; 2KB1 A; 5LGU A; 1I94 B; 3ZHQ A; 3U0Z A; 4B3M B; 4JTC B; 3ZRW A; 3FFQ A; 2BTO A; 4X62 O; 5B1A C; 4JI2 B; 3CCM V; 4U7O A; 2GSM B; 1XL4 A; 5DED A; 4O4J A; 4JI1 B; 4LF6 B; 4X20 A; 1KP2 A; 2Q7H A; 1H2L A; 1F51 A; 2R9I A; 5LHG A; 3CX5 F; 2ITC C; 1K8A W; 2CH7 A; 4KHP O; 3CCS V; 4JI3 B; 1OCR B; 1SF9 A; 1XNR B; 1H2G A; 3OUS A; 4LNU A; 2YEV B; 4LF8 O; 3E2E A; 1DF5 A; 2QTO A; 5B3S B; 1LR1 A; 3OD4 A; 2Y0I A; 1S5H C; 4PJ0 Z; 5B5E Z; 2V1D A; 4DUY O; 2ZM6 B; 3T1Y B; 4CH6 A; 1DLB A; 5B1B B; 4FIP C; 2E5L B; 4CH4 A; 2WA3 A; 5LMU B; 2QJ1 A; 4JI4 B; 1WLE A; 2D2C B; 1PL4 A; 4A5U B; 4OPH A; 1WNS A; 5EC2 C; 1R6K A; 4O4J B; 4X20 B; 5IJ0 A; 2QWQ B; 2BOB C; 4NXM O; 4IYI A; 4TT3 G; 3OMA B; 4YJ2 A; 3IGA C; 4B3R B; 1PKX A; 3JAM N; 1FAF A; 1OCZ B; 3OGI B; 4HNA A; 3ABU A; 4ZBM A; 3HPL C; 1TVK B; 4GCZ A; 1D2D A; 2ZR3 A; 3AG4 B; 3CCJ V; 1IBM O; 2Y4U A; 4DV4 B; 1OJH A; 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1GTO A; 4RQE A; 4FM2 A; 3CMA V; 1TA8 A; 1YVW A; 4CS4 A; 4ZHQ A; 3OUF A; 2K1E A; 4Q6G A; 1QLE C; 3JAT B; 4J7J A; 5L3F A; 1K5Q A; 1FYJ A; 1K3E A; 4DXW A; 3MD0 A; 3RYH B; 5IY5 B; 4UXN A; 1LUV A; 2ZE6 A; 4JI5 O; 4DW1 A; 3B77 A; 2QA4 V; 1KKC A; 1GMG A; 3IC7 A; 2FYU H; 2OTL V; 3CWB H; 1JCH A; 1J5E B; 1Q6H A; 4X1K B; 5LXT B; 4K0K O; 4DR1 O; 2E74 B; 1MNG A; 2QM7 A; 1VQN V; 1G4Y B; 5C8Y B; 5LHI A; 1FXK C; 4H33 A; 2WPD G; 1BSM A; 1M93 A; 4JTA B; 2VQF B; 2QSA A; 3WG7 B; 3PJS K; 1EZV H; 1GM8 A; 5LA6 A; 3AK2 A; 3M8A A; 2AW9 A; 4JPR A; 1SZX A; 1EFR G; 3K5L A; 2BOC C; 4DV1 O; 1ZAU A; 5FNV A; 4ZHQ B; 4E4E A; 5EC1 C; 4F4L A; 1P49 A; 2Q67 A; 1VMG A; 2OCH A; 3RYF A; 2Y0P A; 1U97 A; 1OZ0 A; 1XEQ A; 4NYK A; 1QHT A; 3ZRS A; 1LUW A; 5C93 A; 2IBZ H; 4WFE A; 2H8P C; 3NR7 A; 4JI0 O; 3LSU A; 2LGW A; 2YI9 A; 1AVM A; 2ZQM A; 2PI4 A; 3UT5 A; 4BR6 A; 2CTQ A; 1WAZ A; 3LDC A; 3K79 A; 4EB6 A; 4QPJ A; 5FL7 G; 4DR3 O; 5JCO A; 1XMO B; 1K73 W; 4GYC B; 3RYI B; 2UUC B; 5LP6 C; 1WP7 A; 2LQT A; 5LGN A; 1EN4 A; 1GN6 A; 1BGY H; 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