3CJ1A

Structure of rattus norvegicus ntpdase2
Total Genus 141
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
141
sequence length
426
structure length
419
Chain Sequence
PALKYGIVLDAGSSHTSMFVYKWPADKENDTGIVGQHSSCDVQGGGISSYANDPSKAGQSLVRCLEQALRDVPRDRHASTPLYLGATAGMRLLNLTSPEATARVLEAVTQTLTQYPFDFRGARILSGQDEGVFGWVTANYLLENFIKYGWVGRWIRPRKGTLGAMDLGGASTQITFETTSPSEDPGNEVHLRLYGQHYRVYTHSFLCYGRDQILLRLLASALQIHRFHPCWPKGYSTQVLLQEVYQSPCTMGQSAIVSLSGTSNATLCRDLVSRLFNISSCPFSQCSFNGVFQPPVAGNFIAFSAFYYTVDFLTTVMGLPVGTLKQLEEATEITCNQTWTELQARVPGQKTRLADYCAVAMFIHQLLSRGYHFDERSFREVVFQKKAADTAVGWALGYMLNLTNLIPADLPGLRKGTHF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 2
publication title Structural insight into signal conversion and inactivation by NTPDase2 in purinergic signaling
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 141
structure length 419
sequence length 426
ec nomenclature ec 3.6.1.5: Apyrase.
pdb deposition date 2008-03-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01150 GDA1_CD39 GDA1/CD39 (nucleoside phosphatase) family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cj1A01
3.30.420.150 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Exopolyphosphatase. Domain 2 3cj1A02
1XQSC 4RCHA 5KQDA 2P9NA 3EL2A 3FGUA 2Q2RA 1DKGD 2IVOA 3ZEUB 4H5TA 5JLFA 4K43A 1RGIA 4CZIA 2GWKA 3D2FA 5EVZA 3VESA 2GEMA 3QBWA 4FSVA 4I6MB 3VF2A 2QWPA 4FOEA 3GE1A 4FO0A 1C0FA 2J4RA 5AZJB 3EO3A 5F2RA 1NM1A 4O8KA 1GLBG 4M63C 1ZXOA 4CZLA 1NLVA 1ATRA 4CZKA 3FZFA 4FWRA 2E1ZA 5AQFA 4YDUA 3KZBA 5BN9A 1YXQA 3HTVA 1LOTB 3VENA 1GLEG 1QZ6A 2AA4A 4H5WA 3WEEB 3CIPA 4FPAA 2CH6A 5F1XA 2V51B 4JHDB 4EFHA 2E20A 1E4GT 3SJHA 1HKGA 5AQYA 1QZ5A 4IZ9A 3QFPA 3QDKA 3TU5A 4FWLA 2FLOA 3WXKA 4NO7A 3BF1A 1BWFO 1TYQA 3DXKA 3D7EO 3R8EA 4BC2A 1YVNA 1KAXA 1V4SA 4BRQA 1SQKA 3SLCA 4ISGA 3M3ZA 3VOVA 4B1WB 4BRKA 2QWRA 4CI6A 2Q36A 3U8XA 1X9JA 4NB4A 5KPRA 3LDOA 2E2PA 2YHYA 5AQZA 5KPTA 2PBDA 4PKGA 1IJJA 1V4TA 1YUWA 4AM6A 4RTFD 4IXCA 4BGAA 4Z94A 3A5NC 1JCFA 3UE5A 4BR7A 5B8HA 3BF3A 5ADXH 2QW9A 4H03B 3TPQA 4BR5A 1NGJA 1NGBA 5E26A 1NGAA 1K8KA 4BRNA 4BRGA 2P9KB 2QWOA 2W41A 5AQRA 3IFRA 4BRLA 3CERA 3VEZA 2Q31A 3DAWA 1WUAA 3C0BA 3W3DA 1NGHA 3CI5A 3H1VX 2E2OA 2I7PA 1LCUA 3QMLA 1NGEA 1HX1A 5AFUA 5AQJA 2P9UA 2W40A 3LDQA 4ISEA 1TUUA 2A42A 3A8YA 4A2AA 3UKUA 1ATNA 1IG8A 1GLJO 4CD3A 1C0GA 4K42A 3CJAA 3WXIA 3A5MC 4BRDA 3O08A 3GL1A 4BVPA 2A3ZA 3ATVA 1QQMA 2D4WA 3HM8A 1XUPO 1MWKA 4GY2B 3KHYA 4BC5A 2ZGYA 1CZAN 2CGJA 2D1KA 3GG4A 3SK3A 4CZHA 3VERA 4M7XA 4HTLA 3SMSA 4H0XB 2P9IB 4JAXA 1JCEA 2FSJA 1X3NA 1S22A 2YHXA 3IMXA 2YJEA 3WQTA 4Y0WA 1G99A 4L3QA 5AZIA 5BN8A 1WOQA 3O4WA 2GWJA 4H0OA 3A5OC 4PL7A 3DWLA 1T6DA 3S41A 2CH5A 1BOTO 4CZGA 4FWPA 4H5VA 2ASOA 5ADXA 4BRHA 3VF4A 1GLAG 2YI1A 5LJVA 3D2EB 1QQNA 4BQLA 4CZMA 3LM9A 1P8ZA 1RDWX 4FWSA 1QHAA 1Z05A 3FE1A 3O8MA 2FSKA 3L0QA 3ZX3A 1J6ZA 2HF3A 3BEXA 5AQXA 5BRDA 4DCHA 3U9ZA 2Q1NA 2FF3B 4FPBA 2IVPA 2P9NB 3FZLA 3ZX2A 4K25A 1T44A 2FXUA 3WQUA 5TKYA 4FWKA 3D2FB 2P9PA 3LDLA 4H5NA 3F9MA 3VEOA 2QM1A 2A40A 5AFUH 4H0TB 5F0XA 4H0YB 4JD2A 3OHRA 3ZX0A 3P4IA 1GLDG 5AQPA 4BRCA 3MN5A 4B1UB 3WXLA 2ZWHA 3LM2A 4RWTA 3GDQA 3QB0A 3O1BA 2V52B 3KVGA 3RSEA 3FLCO 2ZGZA 4WQ5C 3O6WA 4WYBA 4BRFA 4BVOA 3JS6A 4FWQA 5ELZA 2GTDA 1Y64A 3FZHA 1T6CA 3JXUA 4AM7A 3DJCA 1TYQB 3DXKB 4FOIA 4IJAA 1SZ2A 2FSNA 1BA0A 5AQKA 3H3OB 2QXLA 3W0LA 1U2VB 3MCPA 2YJFA 3CJBA 2QWQA 2P9SA 3C7NA 2BTFA 3HBTA 4IO8A 4BC3A 3CETA 3WXJA 4JN4A 5BR9A 4C23A 3CQYA 1OKJA 3QFUA 3H3NO 1HKCA 5AQVA 5CE3A 4E1JA 1MA9B 4BR2A 2DPNA 2EWSA 4IJNA 3AAQA 1MWMA 2KHOA 3BUZB 4BRAA 4KBOA 5EY4A 3VGLA 3CQXA 5AQGA 4BG9A 4BREA 2AP1A 1JCGA 1K8KB 1NWKA 3J8AA 4BR0A 5BPMA 3GBTA 2A41A 1GLLO 4BRPA 4BQZA 2Q0RA 4BRMA 3ZETB 3WT0A 3DXMA 4WQ4C 3L4IA 4B1XB 2ZF5O 3MN7A 2HMPA 2P9UB 4MO4A 1KXPA 3LDNA 3U4LA 3O1WA 2HOEA 3UKUB 1H1VA 3ULEA 1DGKN 5LY3A 1R59O 4BR4A 4CJ7A 4FWMA 3AY9A 5AQLA 2P9LA 3QBXA 4BGBA 3B8AX 1NGGA 2IVNA 3VETA 4DB3A 1TUYA 4BG8A 2E88A 2QWMA 3HZ6A 4XEIA 3ENOA 3EZWA 2GELA 2UYTA 3CJCA 4HWIA 3MN9A 2A6AA 4H5RA 3EN9A 1Q18A 1BUPA 5AQMA 3FFKB 5AQQA 4XH5A 3AARA 3VF6A 4BRIA 4CZFA 5AZIB 5BRHA 1HJOA 3SMPA 5AQOA 2E2NA 3HI0A 5AQTA 4B1YB 2D0PA 2WUSA 4BC4A 2VYPA 5BREA 5BRFA 4A62A 5BPNA 4B1VA 3MN6A 3UKRA 3UB5A 5AQHA 4FWNA 2E8AA 1HKBA 1GLCG 1NBWA 5JICA 3BP8A 3I8BA 5AR0A 2CGKA 2BUPA 3GOIA 1ATSA 5BPLA 1NMDA 5EX5A 3IDHA 4CBUA 3LDPA 3ZEUA 3LL3A 1U6ZA 1GLFO 3H46O 4CBWA 2P9PB 1BU6O 4JNEA 1BDGA 4I6MA 4JD2B 3VGMA 5AZJA 4DHYA 4FWOA 4H0VB 2QWLA 5FPDA 3VGKA 3L6QA 5FPNA 3FR0A 1QQOA 4H0PA 4XH4A 4ISFA 3RSEB 5EXWA 3MMVA 4LC9B 3WEEA 3M6GA 3O5BA 4JHDA 4CD1A 1HLUA 1KAYA 3H45C 2CGLA 3H6EA 4BROA 4CBXA 2GUPA 2V7YA 1ZC6A 5AQSA 1HUXA 4EHTA 4O5FA 2NZTA 5KQ8A 3I33A 3IUCA 3MK6A 5EOYA 3CJ1A 4GNIA 5JMVA 4WQ4A 2P9SB 3C7NB 4PKHA 4DQ8A 2VWBA 4YDUC 3EKSA 4CZEA 4CZJA 1U2VA 2NLXA 3MDQA 3VEWA 1YAGA 3WUHA 3O80A 5LJWA 1ESVA 1BG3A 1Z6RA 3AAPA 1D4XA 2P9KA 2F9TA 1KAZA 3A0IX 2A5XA 5FPEA 3QICA 5JLHA 2OANA 2IIRA 4BR9A 3EKUA 3DXMB 2QWNA 2D0OA 3A5LC 4IWVA 2ITMA 2Q0UA 1NGIA 2YCHA 4PKIA 2H3GX 2FF6A 4MO5A 1S3XA 4EIAA 1BO5O 5AQUA 3ZETA 4EHUA 4EAHD 4XH1A 1RFQA 3ULEB 4B9QA 4B1ZA 1NGDA 3U9DA 3VEYA 5KPZA 1E4FT 3FZKA 4QS8A 3G25A 2P9LB 3FZMA 3H1QA 4K41A 5AQNA 3CJ7A 3VEVA 5AQIA 2VCPA 2NRHA 4FL9A 2V7ZA 4J8FA 2E2QA 1SAZA 2P9IA 2E1YA 4QS9A 4A2BA 1NGCA 3VPZA 2PAVA 5E84A 2Q97A 4MLHA 5I9EB 4MLEA 1EQYA 3ATUA 3ENHA 3M1FA 4QS7A 3R9PA 1ZBSA 1X3MA 4F9OA 2I7NA 3ID8A 5AQWA 4A61A 1DEJA 4M7YA 2YHWA 3VEXA 2F9WA 3HSCA 3CJ9A 2HF4A 3D2EA 1HPMA 1NGFA 3CHWA 1XC3A 2ASMA 4PL8A 3UKRB 1MDUB 1BA1A 3R6MA 4WQ5A 5FPMA 2ASPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1XQSC 5CZ2A 3OYAA 3EL2A 1IH7A 5AJ3K 3CYMA 1GOBA 3ZEUB 3UIQA 2O8FA 4HCCA 4K43A 4CZIA 3D2FA 2GEMA 3VF2A 5M1PA 1HYSA 4FO0A 3NGZA 4CK3A 5F2RA 3DRRA 2G8HA 2R7YA 4M63C 4CZLA 1NLVA 3G6EN 4FVMA 4Z0UA 5IWAK 4YDUA 3PIPL 5BN9A 3THYA 4ELVA 3HTVA 2AA4A 2ZD1A 4H5WA 3WEEB 5F1XA 1HQUA 4JHDB 3ZT3A 4FXDA 1HKGA 5AQYA 3M8RA 1Q81O 2ITGA 3TU5A 3WXKA 3R8EA 3QETA 4X66K 1QVFM 4BWMA 3M3ZA 4B1WB 3P5JA 1C1AA 3CCRN 5KPRA 3U8XA 4NB4A 3LDOA 2YHYA 5AQZA 5KPTA 3SZ2A 2PBDA 1V4TA 3ZLJA 2QI2A 4ILHA 3KD5E 4BGAA 1JLEA 3L2UA 3UE5A 4BR7A 2VQEK 5ADXH 4BE1A 4GKKK 4AHRA 4W5NA 4H03B 1NGJA 5CZ1A 1NGAA 5JVHL 1C0MA 1EO1A 2QWOA 4FJMA 2KQ2A 3VEZA 4CESA 2G8WA 3P39A 3C94A 1Y97A 4CEDA 3H1VX 2E2OA 1RT4A 4HUFA 4RW9A 1KRPA 5T7BA 5AQJA 5CR4A 2W40A 1ZBLA 3CD6N 2A42A 3A8YA 3PUFA 2JLEA 3UKUA 1LW0A 1ATNA 3VQCA 4K42A 1BISA 3L2QA 1T05A 3O08A 3GL1A 3AV9A 1WBBA 1MWKA 4BC5A 3NE6A 4FLVA 3QO9A 3SK3A 4KREA 4CZHA 1WSHA 3K5OA 3SMSA 2P9IB 3C6TA 5HBMA 2XHBA 3DOLA 1T8EA 3TAMA 4FM2A 4DR1K 1X3NA 4DV5K 1U49A 4AH9A 1TKTA 4UQGA 1A5VA 3JYTA 4BE2A 5HRRA 5ADXA 4BRHA 4U67L 1GLAG 3NH0A 4M3ZA 4C8NA 2F96A 1C0UA 4CZMA 1C0TA 5DMRA 1Z05A 1VRTA 2FSKA 1QHTA 1NK5A 3ZX3A 5BRDA 5AQXA 2HW3A 4DCHA 1KTQA 3U9ZA 3OYDA 2Q1NA 2VGMA 4FPBA 5HL7L 3FZLA 5J2PA 3OYBA 2OTJN 4A5BA 2DFHA 3OYMA 1L3UA 1NU0A 4Z4CA 4NYNA 2QM1A 3QEVA 4H0TB 4JD2A 2Q3SA 1XHZA 3P4IA 5AQPA 2YNHA 4BRCA 4B1UB 2ZWHA 3LM2A 4CHQA 5LMUK 1N6QA 4A59A 4B9VA 3QB0A 1RDUA 3C6HA 1S9GA 2ZJRL 1ILYA 1ZYQA 2O8CB 4OGEA 2RE2A 3AGKA 3TSQA 1C1CA 3JS6A 2B4JA 1Y64A 2O4GA 2IGIA 1EETA 1S1UA 4AM7A 1TYQB 3BDPA 3V1QA 5DM7L 1BA0A 1VAZA 1VSMA 3HOSA 4DSJA 2QXLA 1U2VB 2P9SA 3TR8A 3WXJA 4DTJA 5GIPA 4YORA 1NMNA 1S6PA 1HKCA 5AQVA 4E1JA 2UUBK 2DPNA 1IKVA 1MWMA 4YY3K 4NCGA 4I9LA 1JCGA 2JWKA 2D0CA 3OJSA 5BPMA 4FLTA 4BRPA 5HRNA 4JK7A 3AO2A 2HHTA 3AGRA 1QVGM 4CF8A 4YOWA 4DQRA 3BZKA 4JKGB 4WQ4C 4CEOA 1YIJN 2DTUA 3ULDA 1NNEA 5M1FA 3ULEA 4LFBK 1O13A 1WSJA 1S1VA 2P9LA 3ZCMA 4FK0A 4BGBA 2OPPA 1BCMA 4DLEA 3I8DA 4Z4GA 1NGGA 1RBUA 4J2BA 3V6DA 1SL1A 1TV6A 3OYCA 4BG8A 2EHGA 4M3YA 3HZ6A 4XEIA 1RT3A 1JJ2M 3VQ9A 2GELA 4KKOA 3CJCA 4FW2A 4DSFA 4DTPA 5H1SQ 1UAXA 1YTUA 1IBLK 4DQQA 4XH5A 3TAGA 4CZFA 1U45A 4CGGA 1IKYA 5BRHA 1HJRA 4B9LA 1HJOA 4ZTJA 1TKZA 1W9HA 5BREA 5BRFA 3PLAA 4FJIA 3DLGA 1RTJA 4A62A 5BPNA 2NRRA 2VG5A 4OGCA 3UKRA 4U7BA 4DTSA 4J2AA 4LF8K 3IAYA 4M3TA 3OYGA 5AR0A 2CGKA 4AHVA 1ATSA 4CK2A 1NMDA 1XC9A 3DLLL 4CBUA 3LDPA 3ZEUA 3T1AA 2Z1GA 2KW4A 1GLFO 3H46O 4OJRA 4CBWA 1SUQA 1ZBIA 3KK1A 3PX6A 2DFEA 4JI2K 5HOOA 3Q7CA 5KI6A 2KFZA 4FWOA 4H0VB 1XNRK 3K59A 4IOXA 3L6QA 5EU7A 3NGYA 2E6MA 4BDYA 4XH4A 4UY8O 3MMVA 3WEEA 1WAJA 4JHDA 5FRNA 1HLUA 3H6EA 1EKEA 3S3OA 2WFBA 1WLJA 4AQYK 4C8MA 1KSPA 4KHWA 1ZC6A 4PHTX 3RRHA 4FZXC 3ZSOA 1OVQA 1W0HA 2WOMA 1VRUA 3MK6A 3ZSWA 1OH8A 4CCHA 1OH7A 3OJUA 3E9LA 3VA3A 4B9NA 3C7NB 2HSTA 1K9MO 2QEXN 4PKHA 4DQ8A 4BY9C 4CZEA 5C12A 1QTMA 4AHSA 5M1OA 4JKAA 3MDQA 3VEWA 4G1QA 1KVCA 3EYZA 1YAGA 3CMEN 2RF2A 4J2DA 3WUHA 4DR3K 3O80A 5JS2A 5LJWA 3I56N 4PQUA 4WCEL 2F7TA 1BG3A 1Z6RA 3AAPA 5GIOA 3HVRA 4FJLA 4KTQA 4OLAA 4DV6K 4CERA 3VQAA 3PX0A 1O1WA 4CHZA 4RG8A 2IIRA 3EKUA 3DXMB 4IWVA 3ZETA 1A5WA 4EAHD 2QKKA 3WNEA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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