3CJBA

Actin dimer cross-linked by v. cholerae martx toxin and complexed with gelsolin-segment 1
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
370
structure length
360
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Connecting actin monomers by iso-peptide bond is a toxicity mechanism of the Vibrio cholerae MARTX toxin.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 104
structure length 360
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-03-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 3cjbA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cjbA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cjbA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3cjbA04
1IG8A 3TPQA 3VGKA 4BRAA 3DWLA 2CH6A 3L4IA 2FF6A 2FLOA 5EVZA 4CJ7A 2YCHA 4YDUC 4CZLA 4EIAA 3A5MC 3VF2A 4IO8A 4WYBA 4XEIA 5F0XA 3QICA 3QFPA 4BRQA 3VERA 1U6ZA 3FR0A 4BQZA 3LM9A 1Y64A 1DGKN 2E2OA 3H45C 2E1YA 4BVPA 1BWFO 1SZ2A 5BPMA 4DCHA 3FZFA 1NGCA 2W41A 2E88A 5KPZA 1BU6O 1QHAA 1HPMA 1NGJA 4NO7A 3CI5A 3KHYA 3O8MA 4EAHD 3M3ZA 1G99A 3HM8A 2A42A 2V51B 2E1ZA 3SMSA 4BRLA 5BREA 3HSCA 1DKGD 5AQUA 1ATRA 2ZWHA 3C7NA 5AQHA 1SQKA 1GLJO 2Q97A 3P4IA 4I6MA 1ZXOA 3TU5A 1NGDA 3BP8A 3WXLA 4BC5A 3WXKA 4FPAA 4H5TA 1HKGA 2V52B 2YI1A 5KQ8A 2PAVA 5LJWA 5ELZA 1TUYA 3VEVA 2ITMA 2QM1A 4YDUA 2P9NB 1YVNA 1BA1A 1QZ6A 1J6ZA 3O1BA 3DAWA 5AZIA 4PKGA 1NGGA 2P9KA 4CBWA 4H0XB 4A62A 4CBXA 3KZBA 5AQZA 5BPLA 5TKYA 5LY3A 4B9QA 1HUXA 1Z05A 5I9EB 4FOEA 5E84A 4Y0WA 1ESVA 1BUPA 1Q18A 4H03B 2W40A 3FZLA 4L3QA 3GOIA 2FF3B 3W0LA 4C23A 3D2EA 5AQQA 4BG9A 4PKIA 1T44A 4K42A 3LL3A 1TYQB 5BR9A 4JHDB 3O6WA 1HJOA 1ZC6A 4H5VA 3D7EO 2ZF5O 5KQDA 4RCHA 5BN8A 2HMPA 3QFUA 3FGUA 1MWMA 3W3DA 5ADXA 1RGIA 3UKRA 2E8AA 4J8FA 3CQYA 5F1XA 2FXUA 4H0TB 1JCFA 3H46O 4MO5A 3VF6A 5AQOA 4B1UB 3EKSA 1XC3A 3U9ZA 4KBOA 1QQOA 5EOYA 5AQRA 5B8HA 4Z94A 4BC2A 3CETA 1LOTB 1NGFA 3DJCA 5AZJB 4BRMA 4H0VB 3SK3A 4RWTA 4F9OA 3GDQA 3IDHA 2VYPA 3MK6A 1WUAA 3LM2A 3LDNA 1T6DA 3QBXA 4CZEA 1V4SA 2E2QA 1NMDA 3JS6A 1LCUA 3M6GA 4H5NA 3SJHA 3WEEA 2QWNA 4FWKA 2E2NA 1GLFO 2NRHA 2P9UB 5AQYA 2P9PA 4BRKA 2HOEA 4CZGA 3H3NO 2FSNA 2ASMA 4CZMA 3C7NB 2D0PA 4DQ8A 4I6MB 3CJBA 4MO4A 5AQIA 1P8ZA 3B8AX 3L6QA 3LDOA 2GELA 4PL8A 5LJVA 1GLDG 3SLCA 3EKUA 2D1KA 4BR9A 3CJ9A 3ZEUA 3VEZA 3BF1A 4CZIA 5AQJA 3UKUA 3VOVA 4BRIA 3ZX3A 1MWKA 2UYTA 3S41A 4BROA 4JNEA 4JD2B 3QMLA 2GWJA 4IZ9A 3R6MA 2I7PA 5FPEA 3CJCA 4FOIA 2P9LA 1NGBA 5JLHA 4IWVA 3DXKA 3IMXA 2H3GX 5AZIB 3R9PA 1C0FA 2P9KB 1C0GA 4GY2B 3KVGA 1MDUB 4BRHA 4LC9B 3GE1A 5AQVA 4BC4A 1EQYA 3WQUA 4BQLA 5JMVA 4QS8A 4FWPA 2E20A 1NGIA 3H3OB 3EZWA 3H6EA 3RSEA 5JICA 4E1JA 3CJ7A 5BRDA 2FSJA 4BRCA 3WT0A 1ATNA 4WQ4C 4BRDA 1JCGA 2E2PA 3F9MA 2OANA 1RDWX 2YJFA 1KAYA 3QB0A 1DEJA 2QWOA 3D2EB 3BF3A 1BOTO 3G25A 3ULEA 5EX5A 3EN9A 3CJAA 4CZKA 1ZBSA 5EXWA 4BR4A 5AQWA 2F9TA 2A5XA 2PBDA 1JCEA 3J8AA 3D2FA 1GLAG 4BR7A 5AQPA 3WXJA 1HLUA 4BR2A 1QZ5A 2GWKA 5AQTA 4BGBA 4EHTA 3VESA 2QWPA 4PKHA 2GUPA 1CZAN 4MLEA 5BPNA 1BO5O 2CGJA 2ZGYA 3BEXA 5EY4A 4AM6A 2QWLA 1GLBG 2V7YA 2KHOA 3FZHA 3I8BA 1E4GT 3U4LA 4K41A 3M1FA 1MA9B 3QDKA 5KPRA 3VGLA 1YUWA 1NGAA 4FWMA 2GEMA 5AQSA 2HF4A 1K8KA 2P9IB 2A40A 3VPZA 2VCPA 2Q1NA 5AQKA 3O1WA 1QQMA 4ISFA 1BG3A 1XQSC 2F9WA 3DXMA 2P9PB 5AQXA 3UB5A 4B1XB 3AAPA 4WQ4A 4CZFA 1X3MA 3FLCO 4FSVA 4H0PA 1HX1A 3O80A 2QW9A 3WQTA 1OKJA 3ZETA 3AY9A 2BTFA 3FE1A 4A2BA 3U9DA 2NLXA 3O08A 1U2VA 4FWNA 3ZEUB 2ASOA 4BVOA 2GTDA 2CGLA 4B1WB 3H1VX 4CZJA 3ZX2A 3CHWA 4K25A 4BRPA 1NGEA 3ENOA 2V7ZA 3ID8A 2BUPA 3R8EA 2AP1A 1IJJA 1RFQA 3C0BA 1GLCG 2P9LB 4A61A 4DB3A 4XH1A 3VETA 3AAQA 5F2RA 2Q0UA 2WUSA 3ZX0A 1HKCA 2D4WA 2Q31A 1NWKA 2FSKA 2Q36A 1QQNA 4HTLA 4K43A 3HTVA 1BA0A 3ATUA 4H5RA 2CGKA 4ISGA 3I33A 2QWQA 4IXCA 2YHYA 3RSEB 5FPDA 4FWSA 4EHUA 4FL9A 4RTFD 5AZJA 5AQLA 2NZTA 1KXPA 4PL7A 4IJNA 3CERA 3L0QA 3MDQA 4NB4A 3VENA 1V4TA 3MN7A 2A3ZA 1NM1A 3MN5A 4BR5A 3FZKA 2IVPA 2ZGZA 3ULEB 2D0OA 5BRHA 4CI6A 4M7YA 4BRGA 2P9SA 4BRNA 1KAXA 4B1VA 1H1VA 2YHWA 5AFUH 1BDGA 1S22A 2IVNA 4M63C 2YHXA 2P9UA 1HKBA 1NBWA 3D2FB 4B1YB 4FWQA 2A6AA 4CZHA 3ATVA 3FZMA 3LDLA 3CIPA 3A5LC 3A0IX 1S3XA 5FPMA 3QBWA 3LDQA 5AQGA 3O4WA 4H0YB 4IJAA 4BRFA 3IFRA 3SMPA 4JAXA 5JLFA 3VF4A 4O5FA 4AM7A 3U8XA 3H1QA 1GLLO 5ADXH 1KAZA 3CQXA 3VEYA 1TUUA 3VEOA 5KPTA 4JD2A 3UKRB 1K8KB 3JXUA 4H0OA 5FPNA 3WUHA 1ATSA 4GNIA 1WOQA 3DXMB 3FFKB 4FPBA 4FWOA 1GLEG 3MMVA 3HI0A 2Q0RA 5AQMA 4CBUA 1X3NA 3ZETB 4DHYA 3A8YA 4FO0A 5E26A 2QXLA 3MCPA 1U2VB 4O8KA 4WQ5C 2AA4A 4BREA 2QWMA 3GG4A 1SAZA 4EFHA 4QS9A 4MLHA 1NGHA 2EWSA 1T6CA 1E4FT 4FWLA 4JN4A 3WEEB 4B1ZA 3GL1A 1XUPO 4FWRA 5AFUA 3AARA 4ISEA 2IVOA 2HF3A 3A5OC 2P9NA 3A5NC 3IUCA 4HWIA 1NLVA 3EL2A 4CD3A 3WXIA 3VEXA 3ENHA 2Q2RA 4BC3A 5AQFA 5BN9A 3VEWA 3GBTA 2A41A 5AQNA 3O5BA 4BG8A 5CE3A 2VWBA 3VGMA 5BRFA 3UKUB 2I7NA 4QS7A 2ASPA 3MN9A 3OHRA 4M7XA 2YJEA 1YAGA 3HZ6A 3LDPA 1Z6RA 2IIRA 4BGAA 3HBTA 4CD1A 3EO3A 2J4RA 4H5WA 1YXQA 3UE5A 1TYQA 3BUZB 3DXKB 4JHDA 4XH5A 1R59O 5AR0A 3CJ1A 1D4XA 4BR0A 2DPNA 2QWRA 2P9SB 3MN6A 1X9JA 2CH5A 4XH4A 4A2AA 2P9IA 4WQ5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3E1YA 1VSHA 4JI2K 4J2DA 5JVHL 4NYNA 2JGUA 3MX5A 3H08A 4FW2A 4YDUC 3AVAA 4CZLA 3OS0A 3A5MC 4FJHA 3T1YK 3C6UA 2GV9A 3CMEN 5HP1A 4NXNK 4BQZA 3LM9A 1Y64A 2E2OA 3HK2A 3H45C 4BVPA 1KD1O 5CYMA 2IOCA 3FZFA 1NGCA 3CC4N 3RRGA 2QK9A 2E88A 3OJUA 3KHYA 4CCHA 1Z26A 1NJYA 1YITN 5KRSA 3HM8A 4BRLA 2VQFK 3HSCA 5AQHA 3C7NA 2NRZA 3ISNC 2Q97A 4I6MA 2B6AA 2A1RA 1NGDA 3U6FA 4BC5A 3SQ1A 4CFDA 4KV8A 5KQ8A 3L2UA 2HHHK 1NMNA 3OTOK 4FZXC 3DRPA 2DTUA 3NHGA 4BWJA 3NGZA 2XY5A 2UUAK 2QM1A 3KK7A 4KREA 2FBTA 2OPSA 1J6ZA 3O1BA 5AZIA 2P9KA 1EXQA 4CBWA 4H0XB 1YJ9N 5FDLA 4FYDA 5BPLA 5LY3A 3LP0A 4E7IA 4B9QA 4G1QA 3D6RA 1VRUA 1BI4B 4FOEA 1HQEA 1FKOA 1BUPA 1VQ4N 4L3QA 1NKBA 4DSIA 1Q81O 4JKBA 1K9MO 3W0LA 2YNIA 1UOCA 4CF9A 2NRTA 4BG9A 1RDAA 4KHUA 4FM1A 4CW7B 1X9WA 3QLHA 3KKSA 4CIGA 4CHOA 3MXMA 1WN7A 3D7EO 4TSXA 1S6QA 3AVJA 5K14A 4HUGA 2HHXA 4W5TA 1N36K 4M3ZA 3CXCM 3FGUA 1RT1A 2ZJPL 2FXUA 3CC7N 4MO5A 3M8SA 1VK0A 3EKSA 3U9ZA 4KBOA 1QQOA 2G8KA 4FM0A 4YOXA 4BC2A 3CCSN 4OJRA 3IS9A 3QO9A 4BDPA 3SK3A 1M1KO 3SPZA 4JS5A 3GDQA 3IDHA 1JL1A 1WUAA 3LM2A 5C2FA 3TAEA 4WF9L 1BQNA 1Q86O 3P83D 3SJHA 3M6GA 3WEEA 1KLNA 2E2NA 3AO1A 3SV3A 4Z4GA 5AQYA 4DTJA 4KB0A 3F9KA 2P9PA 2HOEA 3LWMA 1SKSA 4O4GA 1VSKA 4CJVA 4FJGA 3OYNA 3O3FA 4CZMA 3C7NB 5J1EA 4Z0UA 4I6MB 3CJBA 1KLMA 3P39A 1CXQA 4JK9A 4MO4A 3B8AX 3LDOA 4PL8A 4DV5K 3HT3A 3EKUA 5IWAK 2GBZA 1VQ6N 3BF1A 4CZIA 1WSIA 5AQJA 4W5NA 3UKUA 4DF8A 3VOVA 1RCHA 3ZX3A 3OYLA 2UYTA 3AVKA 3MWPA 4FVUA 3QMLA 2F4VK 5FPEA 3CJCA 3RTVA 2OYQA 1NU0A 3TSQA 4DTOA 4IWVA 3DXKA 1NKEA 3VMFB 5DMRA 5AZIB 4WE1A 2P9KB 4GY2B 5AJ3K 4N5SA 4FK0A 1MDUB 3C94A 3GE1A 4BQLA 1T7PA 2I5JA 4LF4K 1RT6A 4FWPA 1OH7A 1NGIA 3RSEA 2Z1JA 3I0SA 2YNHA 3CJ7A 2FSJA 4BRCA 1NK5A 4CJ3A 3LDSA 1JCGA 1RDWX 3DOLA 2E6LA 5GAEP 5M1KA 2QWOA 2RKIA 4JKDA 3G25A 4B8CA 1P90A 4CJQA 1S1WA 1QVFM 3RR8A 1QSLA 3J8AA 4DR1K 3T3FA 4RW4A 1JL2A 2F8SA 3OBYA 1A5VA 4JEPA 4I2PA 4M3YA 3VESA 5HRNA 2PFUA 5BPNA 1VSJA 2QWLA 3SNNA 2KHOA 3FZHA 4K41A 4W5OA 3VGLA 1NGAA 4JK7A 4FWMA 2VCPA 4I9LA 1IBLK 1QQMA 3V1OA 1XQSC 2P9PB 4JKFA 3AAPA 3R3LA 3OYEA 4DQQA 4YOTA 1EWQA 4FSVA 3VQ7A 1D9FA 5J2MA 3O80A 4CJWA 4DLGA 3WQTA 4DFJA 3AY9A 3G0ZA 3FE1A 3L3UA 4LF8K 4GVEA 1ILYA 3WNGA 3CCLN 4DR6K 1RT4A 3SUPA 4DQPA 3AO4A 4IKFA 1A5WA 2ASOA 4JKCA 1ZYQA 2WFBA 4ID1A 3ZLJA 2WTUA 3ZX2A 3VA0A 3CHWA 4MFBA 1NGEA 3E01A 4AHRA 1RT3A 2VGNA 3JYTA 3ID8A 2AP1A 4CJUA 2O8EA 4JI5K 4XH1A 5F2RA 4FLVA 2HHTA 3QEVA 5GADP 4N76A 3TAGA 1HKCA 1VQ5N 1JLGA 2ZJQL 1QSYA 1WAFA 1WNSA 3HTVA 4H5RA 5M1NA 2CGKA 1IV0A 3TSPA 2O8BA 3V9SA 2RN2A 2YHYA 5HBMA 3K57A 1N33K 4O5BA 3RSEB 1TGOA 1XNQK 5FPDA 4CJTA 4EHUA 2NRVA 2O4IA 3VTIA 2VGMA 4LSNA 4C8MA 4PHTX 3CERA 4BEBA 4KHWA 1V4TA 3MN7A 2A3ZA 4EP4A 4Z4CA 3FZKA 2ZGZA 3KWGA 4CJEA 4CGHA 4BRGA 2P9SA 4BRNA 3NF7A 1VQMN 1BDGA 1WSFA 3V6DA 3KTQA 1IG9A 4FWQA 4C8KA 2A6AA 4CZHA 3ATVA 3LDLA 4DV1K 5FPMA 1S3XA 1JLFA 4DSJA 2JWLA 3QBWA 3OYAA 3LDQA 4BACA 3O4WA 4IJAA 4CGJA 5HL7L 1N32K 3C6HA 1J5OA 3VF4A 1R0AA 2YKNA 5T7BA 3CYMA 1GLLO 3T7ZA 5ADXH 4L8RB 3T1AA 4OLAA 4LFBK 3TSUA 3VEYA 4DG1A 3RMDA 3VEOA 4N47A 4KI6A 5KPTA 1HQUA 3ZT3A 3QERA 2ZE2A 1ZBFA 4JD2A 4H0OA 5KRTA 1L3VA 5FPNA 2KZMA 3V1QA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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