3CJCA

Actin dimer cross-linked by v. cholerae martx toxin and complexed with dnase i and gelsolin-segment 1
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
372
structure length
372
Chain Sequence
DEDETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Structural protein/hydrolase
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Connecting actin monomers by iso-peptide bond is a toxicity mechanism of the Vibrio cholerae MARTX toxin.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 99
structure length 372
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-03-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 3cjcA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cjcA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3cjcA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3cjcA04
2GUPA 3AAQA 4HWIA 1E4GT 4BRNA 1T6CA 4H0YB 3B8AX 4BREA 3D2EA 2FF6A 4MLHA 4BRMA 5FPMA 3C7NA 1Z6RA 3QBXA 1BA0A 3VEWA 4MO5A 4O5FA 4XH1A 3W3DA 4B1VA 4H5RA 4XEIA 3OHRA 1NGIA 2P9NA 3GBTA 4H5TA 5KQ8A 2E2NA 3BUZB 3BF1A 5AQVA 4IO8A 2HF4A 4ISGA 5AQFA 3UKRA 5AZIB 4KBOA 1QQOA 3FZMA 5LJWA 3QICA 1C0FA 4BRFA 1Z05A 4DB3A 4A62A 2P9IB 3BF3A 4B1ZA 2VWBA 4FWPA 5ADXH 3IUCA 4EHUA 2EWSA 1NGEA 3MCPA 3O4WA 4I6MA 1DKGD 4WQ4C 3BEXA 4FOEA 4RCHA 3ZX2A 2WUSA 5BPMA 2V52B 3CHWA 4EFHA 1NGAA 4CJ7A 4BC4A 3LM2A 2NRHA 2PAVA 3FGUA 4CZLA 3SLCA 3UB5A 4BVOA 5EX5A 2A5XA 3ZETB 3ATUA 4JN4A 3ZX0A 4BRLA 4H5WA 3GG4A 3P4IA 4YDUC 2E2PA 2ASPA 5JMVA 4IWVA 1G99A 3O80A 3F9MA 2QWOA 2E8AA 3DXMA 4EIAA 1KAZA 2BUPA 2V51B 1R59O 1BWFO 3A0IX 5JLHA 4NO7A 1BO5O 2P9LA 1YXQA 1NGFA 4WQ4A 3QDKA 2E20A 3S41A 4BC5A 1WUAA 1X9JA 3LDQA 3MMVA 4CD1A 2W41A 5I9EB 4BR4A 4O8KA 3UKUA 4BVPA 1X3NA 3VPZA 5AQIA 1E4FT 4QS7A 1TYQB 1YVNA 1ZXOA 1BUPA 4DQ8A 4AM6A 1MWKA 5AQSA 4M7XA 1TUYA 1JCEA 4YDUA 3I8BA 2D0PA 2DPNA 2P9SA 2AA4A 4B1UB 4CZEA 3DXKB 1S3XA 3SK3A 2P9IA 2HOEA 4H5NA 1C0GA 1S22A 3RSEA 4CZMA 2P9KA 5BREA 4BR2A 3CJBA 3H1VX 2HF3A 4BRGA 1YAGA 2IIRA 1X3MA 1NGGA 1NMDA 3CERA 5AQOA 4FO0A 2I7NA 4E1JA 3KVGA 4JNEA 3GDQA 2FLOA 3KZBA 5FPNA 2VYPA 1GLCG 1RGIA 1IJJA 4FWRA 1ESVA 5BN8A 4IJNA 2FSKA 2GTDA 1K8KA 1DGKN 3FR0A 3FE1A 3WXKA 3ZETA 4K43A 1XC3A 3LDLA 1ZBSA 3CI5A 1GLEG 2NZTA 3VGKA 3IDHA 3VEOA 4F9OA 3VF6A 3ATVA 2D0OA 5AQPA 5BPNA 4C23A 1KAXA 3QBWA 3H46O 4A2BA 4WQ5A 3ULEB 1H1VA 1HUXA 2A6AA 2YI1A 1EQYA 1U6ZA 2CH5A 3M6GA 4WYBA 1ATRA 2P9UA 3FZKA 5BRFA 1P8ZA 2A42A 1GLAG 3EKSA 4BRDA 2Q1NA 3ID8A 4XH4A 3D2FA 4DCHA 3UE5A 3VF4A 1OKJA 3FZLA 3WEEB 3WXJA 5B8HA 4CBXA 3MN6A 1MDUB 2P9PB 4QS8A 2Q0RA 4JHDA 1HPMA 2E1ZA 5BRHA 1LCUA 1DEJA 2F9TA 3AAPA 3CQXA 3ENHA 1GLFO 3VENA 1KAYA 4J8FA 4BGBA 4ISEA 3O1BA 5AQQA 4B9QA 4PL7A 2AP1A 4CBWA 2YHWA 3FFKB 3R9PA 3EN9A 4FWKA 3LL3A 5AQKA 1NGHA 3G25A 3H6EA 3KHYA 4B1XB 3MN7A 3WQUA 2ASMA 1J6ZA 2H3GX 3L6QA 3LM9A 3CJ9A 1QZ5A 3ZEUA 4H03B 2GWKA 1QHAA 1GLLO 1RDWX 3U9DA 1ATSA 5BR9A 4EHTA 1Y64A 3TU5A 4FWLA 5F1XA 5ADXA 3R8EA 1NM1A 4BQLA 1BDGA 2E1YA 2HMPA 3FZHA 2YHXA 2I7PA 4FWNA 3M3ZA 4FWSA 3VETA 2GEMA 4K25A 1HLUA 3H3OB 3DJCA 2IVPA 4IZ9A 2A41A 2E2QA 2YHYA 3VEVA 3MK6A 1SZ2A 1BOTO 3LDPA 3MN9A 5F2RA 3O8MA 4LC9B 1Q18A 4RWTA 4QS9A 1JCFA 3C7NB 4BRHA 4BC3A 3JXUA 5EY4A 5AFUH 4BRQA 5AQXA 1ZC6A 2CGKA 2D4WA 2FSJA 4FWQA 5AQWA 4H0VB 4B1YB 2ITMA 3DWLA 2GELA 3QFPA 2ZGYA 3GL1A 5EOYA 5EVZA 3CJCA 4PKHA 2QWQA 4BRAA 3MDQA 2KHOA 4JAXA 4WQ5C 5AZIA 4BRCA 1HKBA 2FSNA 3D7EO 3L0QA 2BTFA 1BA1A 5AZJB 3WQTA 1NWKA 3QMLA 4CZGA 3U4LA 4I6MB 3WUHA 2W40A 4IJAA 5AQYA 1IG8A 3FLCO 2ZGZA 5AQMA 1LOTB 2E88A 3SMSA 2QW9A 4B1WB 4BC2A 5AFUA 2QWPA 3MN5A 4PKGA 4GY2B 3HM8A 3VERA 4XH5A 2QWNA 2V7YA 3I33A 4FPBA 4BROA 1TUUA 3J8AA 3U8XA 3CJ7A 4BRPA 2ZF5O 4H0TB 2QXLA 4PKIA 1NBWA 1YUWA 1BU6O 3QFUA 4MLEA 5LY3A 2A3ZA 3O1WA 1T44A 4JD2B 3DXMB 3A5LC 3O6WA 3JS6A 5FPDA 3EO3A 4CZIA 5AQTA 5EXWA 3SMPA 3WXLA 4H0OA 1ATNA 2IVNA 2P9LB 1V4SA 1NGDA 4M63C 3U9ZA 3M1FA 3HZ6A 5AQRA 3VEYA 2GWJA 4CZJA 3ZX3A 4FWOA 1NGCA 1GLJO 3HTVA 4BR0A 4FOIA 4BR9A 2QM1A 3HI0A 3UKUB 4CZKA 5TKYA 1GLDG 1D4XA 1TYQA 2PBDA 4MO4A 4A61A 2OANA 1QQMA 2CH6A 1KXPA 1NGJA 1T6DA 3H45C 4K42A 5AQGA 1WOQA 1RFQA 2NLXA 4FWMA 2P9SB 4BRKA 2ASOA 3DXKA 5AZJA 2Q31A 2Q97A 3ENOA 2QWRA 2F9WA 3RSEB 3BP8A 5BPLA 2P9KB 1U2VB 5F0XA 3EZWA 3VF2A 3CJ1A 4BQZA 4DHYA 3A8YA 2E2OA 1MA9B 2Q36A 1SQKA 5E26A 4EAHD 3WXIA 1HKGA 5AQUA 1XUPO 4BG8A 1GLBG 3O08A 2Q0UA 1HJOA 2QWMA 4CI6A 4CD3A 5FPEA 4H0XB 4BG9A 1K8KB 4FPAA 3C0BA 2IVOA 3DAWA 2J4RA 2YJEA 5E84A 2UYTA 3HSCA 3VEXA 3CJAA 1CZAN 3TPQA 3A5NC 4L3QA 3GOIA 3AARA 3GE1A 5BRDA 1QZ6A 3D2EB 5AR0A 3VOVA 4CZFA 4CZHA 5AQHA 2A40A 3ULEA 3SJHA 1SAZA 4K41A 5CE3A 4JD2A 3WT0A 4FL9A 5KPZA 5LJVA 3VGLA 2P9NB 3VEZA 3EKUA 2VCPA 2P9UB 4H0PA 2QWLA 5AQJA 2FXUA 3EL2A 1HKCA 5KPTA 2FF3B 3CQYA 4ISFA 4A2AA 1NGBA 3H1QA 3UKRB 3D2FB 3WEEA 4PL8A 1JCGA 2P9PA 5JLFA 3CETA 3R6MA 4JHDB 3QB0A 4HTLA 2CGJA 3LDOA 3AY9A 5KPRA 2CGLA 5AQNA 4H5VA 4BR7A 4GNIA 3FZFA 3O5BA 5JICA 4IXCA 1BG3A 1XQSC 1QQNA 4BR5A 2D1KA 4RTFD 4Y0WA 3VGMA 3W0LA 4NB4A 3LDNA 1U2VA 1MWMA 3A5MC 4CBUA 1HX1A 4BGAA 3A5OC 4Z94A 5AQZA 5AQLA 2YJFA 3ZEUB 5ELZA 4FSVA 4M7YA 2V7ZA 2Q2RA 3CIPA 3IFRA 2ZWHA 5BN9A 3HBTA 3H3NO 4AM7A 4BRIA 3IMXA 1NLVA 3L4IA 1V4TA 5KQDA 2YCHA 3VESA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5J2MA 2JWKA 1SKSA 1K6YA 4BREA 3D2EA 4YOVA 4DQQA 1Z6RA 3VEWA 4X62K 4ELUA 3E1YA 4AILC 3W3DA 3OHRA 1NGIA 2P9NA 3SI6A 1S1XA 2E2NA 3BF1A 4JKAA 5AQVA 4DV2K 3SAGA 4W5TA 3UKRA 4KBOA 3QICA 2UXCK 4CIEA 3CCSN 4FWPA 4FK4A 3IUCA 4EHUA 3D45A 4DF8A 1NGEA 4KH5A 3NE6A 4I6MA 4DSLA 1RT5A 4Y1CA 3AO2A 3RRHA 4A57A 4FJJA 4GKJK 3QNNA 5BPMA 1ZBUA 4EFHA 4BC4A 4CEQA 2NRHA 1B9DA 1I3AA 3IKMA 3ZETB 2UUAK 1HPZA 3ATUA 4JN4A 4DR5K 3LP0A 4H5WA 3P4IA 1KVBA 5J1EA 3V4IA 4O0JA 1RT3A 2QWOA 4BACA 2E8AA 1TKTA 4LF5K 4K8ZA 3HSTB 4DTSA 1VQ7N 3NGIA 1BWFO 2RE2A 4I7FA 4CCHA 3L3VA 4OGEA 1L3SA 2P1JA 4WQ4A 5GAGP 1BQMA 3QDKA 4H8KA 4BC5A 1S1VA 3P5JA 4OPHA 1CXQA 4BR4A 5HROA 4DFKA 5CZ2A 4U7BA 4BVPA 4MFBA 4JRPA 1BISA 5I3UA 3MECA 1S1WA 1BCOA 4NCGA 1MWKA 4M7XA 1WSEA 2HMIA 3QNOA 3OYLA 4AHUA 3LANA 3HVRA 2AA4A 3LPUA 1NOZA 3ZT3A 4CZEA 4CJSA 3SK3A 3TAEA 1C0GA 1S22A 3RSEA 5M1NA 3CJBA 2NRWA 3H1VX 4BRGA 4FLYA 1C1AA 3K9JA 4CJFA 1NMDA 3CERA 4FO0A 4DSKA 3CC7N 3DOKA 4YY3K 3KWGA 4GW6A 4CGDA 4CF2A 4JKFA 3R1XA 4E1MA 3V9ZA 1IJJA 3TR8A 4NYNA 5BN8A 3KKRA 4IJNA 3OVNA 1HNXK 3CCVN 2GTDA 1K8KA 4KKOA 3FR0A 3TWHA 3FE1A 4M3XA 1P90A 3WXKA 4BE7B 1XC3A 4YOXA 3CPWM 3VEOA 3ATVA 2E5LK 1KAXA 3QEPA 3H46O 1U49A 4B9UA 4K8XA 4CEBA 3TSQA 1B92A 1TGOA 1EQYA 1LWCA 5BRFA 4CHPA 2A42A 2JLEA 3TABA 1EX4A 3G71N 4DTXA 2Y1IA 3ID8A 4XH4A 2VG5A 2P5GA 5C2DA 3THXA 3UE5A 1IBLK 2G8FA 1OKJA 1TKZA 4CFCA 4YFUA 3MCAB 2D0BA 2P9PB 1RDUA 3ZT0A 4I9LA 2WBNA 4K0KK 3AAPA 5M1KA 3ENHA 3P31A 4FJHA 2PZSA 4ISEA 4Z4EA 4B9QA 1TKXA 1N32K 2YKNA 4PL7A 4CBWA 1T3VA 3QIPA 1D8YA 5H1SQ 1KC8O 3EN9A 4PA1A 4EZ9A 3LL3A 4DKWA 3VQPA 1NK9A 4I9QA 2HB5A 1FKOA 3TANA 3VQ8A 4Z4FA 1HNZK 3SQ0A 2ASMA 4CERA 2HBKA 1QSLA 1UOCA 1QZ5A 3K58A 1QHAA 4RG8A 4CVNE 1RBTA 4AHCA 5KGXA 1LV5A 3AO3A 3TU5A 3LPTA 4G1QA 4LY7A 4FM0A 4BQLA 2NNWA 2HMPA 5CY4A 4CEEA 2YHXA 5JVHL 4FWNA 3M3ZA 4BDPA 3VETA 2HHIA 4R79A 4AF1A 4IZ9A 3TTDA 3VEVA 1JKHA 3MN9A 4XIUA 4RWTA 3I0RA 5EY4A 3SPZA 4BRQA 2DFHA 2XY8A 4B1YB 1VQ4N 5T7BA 3ENBA 3SAFA 4CEFA 2HHTA 2IDOA 3HVTA 3VQQA 5EOYA 3SQ1A 3RMCA 2Z1HA 3J80O 2VQFK 4DSFA 3V9UA 3E9OA 1HKBA 3L4QA 1ZYQA 3KD5E 4JI3K 3TAGA 3L2RA 3DI6A 1T8EA 4IBNA 3WUHA 4CHOA 4FZXC 2W40A 4HVJA 4KTZA 4LSNA 1IG8A 4N5SA 4E19A 3H08A 4R5PA 1IKVA 5AFUA 1YT3A 5C10A 3HOSA 4FJXA 5JS2A 1VSFA 3AVLA 4N41A 2V7YA 4BROA 4YHHK 1VSMA 4JS5A 2G8WA 1TUUA 3HL8A 4DS4A 4F8RA 4F4KA 1RDDA 4FJ5A 4J2EA 3EE8A 3T7ZA 5M1FA 3CCUN 4JI5K 1T44A 2QXFA 4X64K 1RBUA 1X9SA 2OZMA 3O9SA 5M1QA 1IKWA 3ZSVA 1O1WA 4JKDA 4CZJA 2GWJA 1NGCA 1GLJO 3HTVA 3ZLJA 4I2PA 4FOIA 4ZTJA 1CXUA 4B3RK 2G8UA 1D4XA 3MWPA 4DR6K 4MO4A 4B8AB 2NRTA 4OPAA 3AVHA 2KLAA 4B8CA 4K42A 1WOQA 1NK0A 2NLXA 4FWMA 1VRTA 3UIQA 3ENOA 2QWRA 4FVUA 1SUQA 4JI0K 4CHNA 2Q36A 4EAHD 4DR1K 1HKGA 4IDKA 1VSJA 4DQSA 1HJOA 2BGGA 1TK0A 3DLGA 4CI6A 3SBGA 3KWIA 2O8DB 2IVOA 3M8QA 3T1HK 4DV1K 3DAWA 2J4RA 3L2QA 1CZAN 3TPQA 5JVGL 3HRGA 2EHGA 3GE1A 3GOIA 4DU3A 3D2EB 1JLQA 3KIOA 3VOVA 4OO1J 4CZFA 3AVIA 3NH2A 3CC4N 4GV9A 4GV6A 2A40A 4CGJA 4K41A 4JD2A 3WT0A 5KPZA 4CGFA 3NVKA 3VGLA 3VQAA 1C1CA 1ASWA 2P9NB 4O0IA 1QVGM 3VEZA 1NG9A 5DM6L 2QWLA 4A59A 1BL3A 4LF4K 3UKRB 3D2FB 2HNYA 3BZCA 5DMRA 1LW0A 2P9PA 5JLFA 1FW6A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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