The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
52
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sequence length |
141
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structure length |
141
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Chain Sequence |
VLSAADKSNVKAAWGKVGGNAGAYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGEKVAAALTKAVGHLDDLPGTLSDLSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHSLLVTLACHLPNDFTPAVHASLDKFLANVSTVLTSKYR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen storage, oxygen transport
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| molecule keywords |
Hemoglobin subunit alpha-1/2
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| publication title |
Crystal Structure determination of Goat hemoglobin at 2.61 Angstrom
rcsb |
| total genus |
52
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| structure length |
141
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| sequence length |
141
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| chains with identical sequence |
C
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-05-05 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3DHR A; 2ZLV A; 3QJB B; 2D2M C; 4NZI A; 1S61 A; 1Y4P B; 5KDQ B; 3EOK A; 3HF4 B; 1A4F A; 5HLQ A; 1JEB A; 1MYM A; 1O1O A; 3CIU A; 2W6Y A; 1HCO A; 1DXU A; 2AA1 B; 2O5B X; 2V1G A; 3A9M A; 1VXD A; 1IT3 A; 3LR9 A; 2HBS B; 1Y0D A; 1FSX A; 3KMF C; 4UZV A; 1DO7 A; 4WJG 1; 2NX0 A; 1CG5 B; 1F63 A; 1EBT A; 2R4W A; 4MQG A; 5ILP A; 3UHW A; 1HSY A; 1YHU B; 2GKN A; 2VLZ A; 1QSH B; 2EF2 A; 1R1Y A; 1ABS A; 1J3Z B; 1YGD A; 2GL3 A; 5EUI A; 1YGF B; 1CBM A; 2HBC A; 2R80 A; 4GZG A; 3OO4 A; 2DN2 B; 1IDR A; 1O1M B; 1GZX B; 1MOA A; 1AJ9 B; 1A01 B; 2RI4 A; 2BW9 M; 2B7H B; 4ESA B; 3QMA A; 1MLM A; 3WCV B; 1MYI A; 3TM3 A; 1Y0C B; 1XXT B; 1MLF A; 3ARK A; 3UI0 A; 1C7D A; 5KKK A; 4O4T A; 1ABW A; 3WCP B; 1AJG A; 3PT7 B; 1NPG A; 2G12 A; 1Y46 B; 107M A; 1G0B A; 1Y8I B; 1A0U A; 1Y2Z A; 1A6G A; 1YHU D; 5JDO D; 2NSS A; 1Y01 B; 4NK2 A; 4H0B A; 3NG6 B; 1T1N A; 1LH1 A; 1CH9 A; 4FWX A; 3MVC A; 1MYF A; 3WCV D; 1Y4Q A; 1XZ2 A; 4G51 B; 3WTG B; 2MGD A; 4F4O B; 1HLM A; 2G0X A; 1CQX A; 4O35 A; 2ZFB A; 4U8U B; 3TM9 A; 2ZLX B; 2HBG A; 1EWA A; 2HBF B; 1Y5K B; 2ZSX A; 3D1K B; 1OR4 A; 1LFQ B; 1CH2 A; 1YEV B; 1HBA B; 1Y0A A; 3WFU A; 1Y4G B; 1PBX B; 1HV4 A; 3QJB A; 5CN5 A; 1JZL A; 3GKV B; 1CH3 A; 1YHR B; 3OZV A; 1M6C A; 4HRT B; 2Z6N A; 1VXE A; 5KDQ A; 3CY5 B; 1LJW A; 2MGC A; 5HY8 A; 3HEP A; 1Y22 B; 2W72 C; 1Y4B A; 2R4X A; 1HHO A; 2AA1 A; 3D4X B; 1YE0 A; 2HBS A; 3D1A B; 3A59 A; 1JP8 A; 1G09 B; 4L2M A; 1MLK A; 3UH5 A; 3H57 A; 1ECA A; 3GQR B; 5CNC A; 1NWI A; 4U8U D; 1V5H A; 1Y35 B; 2MYA A; 4UIQ A; 1OUU A; 1CG5 A; 1O1I B; 1QPW A; 1M9P B; 3U3E A; 2ZLU B; 1YHU A; 2XYK A; 2SPL A; 3AQ6 A; 3S1I A; 1A3O A; 1DXT B; 1HAC B; 2O5T X; 1YIE B; 1O1M A; 1GZX A; 1AJ9 A; 1A01 A; 2B7H A; 4WCH D; 2ZLW B; 1JZK A; 1XXT A; 1JL6 A; 2Z6T A; 4PQ6 A; 3UBV A; 111M A; 1YEO A; 2XKI A; 2PGH B; 1RTX A; 1NS9 A; 2ZSS A; 2ZWJ A; 3UGZ A; 1TES A; 3G52 A; 1DXC A; 2HCO B; 1Y8I A; 2MGM A; 2EKU A; 3ORD A; 1WLA A; 3GDJ B; 3UHN A; 2QSP B; 3BJ3 B; 2ZS1 B; 3BJ2 A; 1FN3 B; 109M A; 2Z8A A; 1SI4 B; 3PI9 B; 1MLS A; 3OJ1 A; 2D6C A; 2D60 B; 3QJD B; 1BZP A; 1F5P A; 4ROM A; 3OZW A; 1COH B; 3NG6 A; 4KMV A; 1XQ5 A; 1FAW A; 1MLG A; 2ZT3 A; 2QFN A; 1Y8H B; 104M A; 3WTG A; 1JF4 A; 2WY4 A; 5CN8 A; 5F2A A; 4M4B B; 4F4O A; 2RAO B; 3QZX A; 1Y7D B; 2GRZ A; 4MQI B; 1THB B; 1FDH G; 1YVT B; 3ZJS A; 1GCV A; 1CLS B; 1Y5K A; 5SW7 B; 1RPS B; 1IT2 A; 3PEL B; 1MNO A; 1CH7 A; 1YEV A; 1HBA A; 1Y31 B; 3ZJR A; 1Y4G A; 2ZS1 D; 1MNK A; 3M39 A; 5B85 A; 5EOH A; 1V07 A; 1QI8 B; 2HBE B; 4HRT A; 3CY5 A; 4OF9 A; 2VHB A; 1Y22 A; 4L7Y B; 3K8B B; 4IRO B; 5E83 A; 2HHD A; 2KSC A; 1HGC B; 3LHB A; 3AQ9 A; 4YU3 B; 1MBD A; 2D5Z B; 1A9W E; 1DM1 A; 3A0G B; 3A5A A; 1UC3 A; 3GQR A; 1Y4R B; 1Y35 A; 4X0L B; 1BAB B; 1YEQ A; 1XCH A; 3FH9 B; 1DLY A; 1MLJ A; 1M9P A; 5CNE A; 1NQP B; 3MJU A; 1XY0 B; 1WVP A; 3NML A; 3QJC A; 2ZFO A; 3G4R A; 3IC0 B; 4DWT A; 1JY7 A; 1DXT A; 1YEN B; 1YMC A; 1K1K B; 3WCT A; 2QU0 B; 2V1J A; 3UHB A; 3OK5 A; 4F6J A; 1LHS A; 2YRS B; 4MAX A; 3DHR B; 3PI3 A; 2O5Q X; 3LB1 A; 2HHE B; 3GK9 A; 1A4F B; 5MBN A; 1GDK A; 1HBR A; 1G9V B; 3ED9 A; 1JEB B; 3PT8 B; 1OFJ A; 3CIU B; 4XS0 B; 1J7Y A; 1HCO B; 3ECL A; 1DXU B; 3DR9 A; 2MGJ A; 5M3S A; 1U7R A; 1OBM A; 4OOD A; 2ZLT A; 3ZJI A; 3GDJ A; 2QSP A; 3BJ3 A; 3QM9 A; 2ZS1 A; 1FN3 A; 2HZ3 A; 1DWT A; 2DC3 A; 1GBU A; 1MLN A; 1SI4 A; 1MTK A; 1Y8K A; 3WHM B; 2O5O X; 3MJP B; 2ZSZ A; 3VRE B; 3GLN A; 1Z8U B; 2D60 A; 3MYM A; 4HSX A; 1R1Y B; 1C7C A; 1GLI B; 3ZJM A; 4HRR A; 1QXE B; 4B3W A; 2R80 B; 3OO4 B; 4DC8 A; 2GRH A; 1J3F A; 2RAO A; 1YCB A; 2G3H A; 5EYS A; 1CG8 A; 1THB A; 2OH9 A; 1YVT A; 3PI2 A; 1YOG A; 5EV5 A; 3S1J A; 1CLS A; 2OH8 A; 2HZ2 A; 4MQH A; 1C7D B; 2OHB A; 2MGH A; 4YU4 B; 1N9X A; 3BA2 A; 1YOH A; 1SHR A; 1G0B B; 1QI8 A; 2HBE A; 1S56 A; 1BZ6 A; 1Y2Z B; 1LH7 A; 1K0Y B; 1X46 A; 3K8B A; 2BK9 A; 1LA6 A; 1U7S A; 2D5X B; 2VLY A; 5CNG A; 2D2M A; 2ZSN A; 4YU3 A; 1GDJ A; 3A0G A; 1MTJ A; 1M6M A; 4QAU A; 2BLI A; 2LH7 A; 1MOB A; 1V75 A; 1DTI A; 1BAB A; 4ODC A; 2MGI A; 1LH6 A; 2NRM A; 1Y4Q B; 1NQP A; 4XDI A; 1XY0 A; 2HHB B; 3AQ8 A; 2ZFB B; 3G4Y A; 3ONZ A; 1FLP A; 3WCU C; 2E2Y A; 3IC0 A; 1KD2 B; 2G14 A; 3KMF A; 2ZT4 A; 2GNW A; 1K1K A; 1UVY A; 1O1K A; 1Y0A B; 4AVE A; 1X9F B; 4KJT A; 2YRS A; 3BOM A; 1HV4 B; 4B4Y A; 3A2G A; 3GOU B; 5CNF A; 2ZSQ A; 2HHE A; 2Z6N B; 1LJW B; 5HY8 B; 1G9V A; 1NIH A; 3PT8 A; 5HAV A; 1N9H A; 4XS0 A; 3OVU C; 1Y4B B; 2EVP A; 1YE2 A; 1HHO B; 1J41 B; 4NXA A; 1RQ4 B; 1XZ7 A; 1YE0 B; 2FAL A; 3ECX A; 3A59 B; 1Y0W B; 4FWZ A; 1OUU B; 4NI0 A; 1MOH A; 1QPW B; 2MBW A; 3NFE A; 2MGK A; 3WHM A; 2GTL C; 3FS4 A; 2BMM A; 3MJP A; 3VRE A; 3PI1 A; 3DHT A; 1GLI A; 1A3O B; 1X9F D; 5D5R A; 1YMB A; 1QXE A; 2VM0 A; 7HBI A; 3HHB A; 2H35 B; 5HLX A; 1IWH B; 1JW8 A; 1Y09 A; 1MBS A; 3HRW A; 3UHX A; 1LH5 A; 1YEO B; 3DUT B; 1J40 A; 1O1P A; 4YU4 A; 2ZSR A; 1J7S A; 2WTG A; 1NS9 B; 1HDA A; 1BVD A; 1H1X A; 6HBW B; 2D2N C; 1HGA A; 2GRF A; 1LFT B; 1CBL A; 4G1V A; 4PNJ A; 1HDB A; 3AQ5 A; 1K0Y A; 3BJ2 B; 1LH2 A; 5KER B; 3PIA A; 1MWB A; 2D5X A; 3BCQ B; 3UHH A; 3LB4 A; 3HC9 A; 4MBN A; 1MBA A; 3OZU A; 1NGK A; 1Y7C A; 1YVQ A; 2VYY A; 3UHG A; 1RQA B; 1GCW A; 4ROM B; 1I3D A; 2ZS0 A; 2HBD B; 4TYX A; 1Y7Z A; 1WMU A; 1UX8 A; 2W6V B; 1J7W B; 1XQ5 B; 1FAW B; 4PQC A; 2HHB A; 1G08 A; 3VRG B; 3LB3 A; 1YG5 A; 1NPF A; 3ZJP A; 1KD2 A; 105M A; 1GCV B; 1AJH A; 5E6E A; 1GVH A; 1X3K A; 1OUT A; 3E5I A; 5HBI A; 1DO3 A; 2SPN A; 1X9F A; 2G10 A; 2OLP A; 2OHA A; 3QJE A; 3WCW B; 3GOU A; 1HGB B; 1HBS A; 1Y8W B; 5E83 B; 1XYE A; 4F6I A; 4VHB A; 4FWY A; 4M4A B; 1YEU A; 2HHD B; 1Y85 B; 1J41 A; 1RQ4 A; 4SDH A; 1YFF A; 4N7N A; 2G11 A; 2MYB A; 2V1E A; 1Y0W A; 5EE4 D; 1NS6 B; 2EB8 A; 3VRF B; 2LHB A; 1YIH B; 3SDH A; 1YEQ B; 2FRF A; 3MJU B; 3PI8 A; 4ILZ A; 3QJC B; 2ZFO B; 1XZV B; 2GDM A; 1O16 A; 3ECZ A; 3QQR A; 1JY7 B; 1MYZ A; 3WCW D; 3WCT B; 1JP6 A; 2R50 A; 1Y4V A; 2ZSP A; 1MOC A; 1VXH A; 3UHE A; 2H35 A; 2NSR A; 2V1K A; 4ZVA A; 1G0A B; 2MYE A; 3ZJO A; 1BZ1 B; 1IWH A; 3WFW A; 3GQP A; 3QM5 A; 1HBR B; 1HBG A; 1VRF A; 3DUT A; 1J7Y B; 2QRW A; 1RTE A; 1S5Y B; 2CMM A; 6HBW A; 1MZ0 A; 3P5Q B; 2G0R A; 2ZLT B; 1LFT A; 1MYG A; 2SPO A; 1IBE B; 5KER A; 2ZFO D; 1MBC A; 1GBU B; 3BCQ A; 1YZI A; 2AUO A; 3RJN B; 1Y8K B; 5B84 A; 1LTW A; 3UHC A; 3WCT D; 1YHU C; 1UX9 A; 1RQA A; 5JDO C; 1CIK A; 1S0H B; 2HBD A; 3BJ1 B; 1C7C B; 4HRR B; 3GQG A; 2W6V A; 1J7W A; 1XZ5 B; 2MGB A; 2FRI X; 1CH5 A; 4N7P B; 1A00 A; 4F6B A; 4H07 A; 2G0Z A; 1Q1F A; 4MQJ A; 3WI8 A; 3VRG A; 1CG8 B; 1S5X B; 3HXN B; 3EU1 A; 1RVW A; 3WCV C; 2LH5 A; 1J52 A; 3K9Z A; 4MQH B; 1B86 A; 4WJG A; 4C44 A; 4FH7 A; 2G0S A; 3WCW A; 1SHR B; 3G4Q A; 1EMY A; 3SZK A; 2IN4 A; 3M38 A; 1HGB A; 1XZ4 A; 1VXG A; 1A9W A; 3ZJJ A; 1Y8W A; 3E55 A; 1LA6 B; 4O2G A; 5CMV A; 3UH7 A; 4M4A A; 1Y85 A; 2D2M B; 5CN6 A; 2LH6 A; 1MBI A; 2VLX A; 1MYJ A; 1SPG A; 1V75 B; 2BLJ M; 2GNV A; 1NS6 A; 3VRF A; 1J3Y A; 1YIH A; 4ODC B; 1MWD A; 1YH9 A; 2QLS B; 1BZZ B; 1H97 A; 1NZ2 A; 3ARL A; 1LFL A; 1MKO B; 3ONZ B; 1XZV A; 4U8U C; 1XZU B; 1R1X B; 1YHE B; 1D8U A; 2MGG A; 3R5I A; 3QM7 A; 2FRK X; 1O1K B; 3G4W A; 1G0A A; 3BOM B; 1BZ1 A; 1BUW B; 1S69 A; 2QSS B; 2D2M D; 2EKT A; 106M A; 3ODQ B; 1NIH B; 3H58 A; 1AZI A; 4JAC A; 1IRC A; 1OFK A; 1QSI B; 3G4U A; 1YE2 B; 2IG3 A; 1CO8 A; 1XZ7 B; 1S5Y A; 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5E29 B; 1GDI A; 1CIO A; 1BUW A; 1V9Q A; 2QSS A; 1HBS B; 2BNL A; 1V4X B; 3ODQ A; 1XYE B; 4UUR A; 1JF3 A; 1C7B B; 2VYZ A; 2ZS0 D; 4ZVB A; 1QSI A; 1YEU B; 2QMB A; 1HBH A; 1O1N A; 1YFF B; 4N7N B; 1LFV B; 1ASH A; 2ZSO A; 1YDZ A; 1A3N B; 1LHT A; 1MTI A; 1GDL A; 3S65 A; 2SPM A; 1UVX A; 3PI8 B; 2D2N A; 4F6G A; 4BJA A; 1NEJ A; 1CH1 A; 4HBI A; 1A0Z B; 101M A; 1TU9 A; 2BWH A; 1Y4V B; 2PEG A; 4MXK A; 2MYD A; 1VXB A; 2W6W A; 3UH6 A; 1LFZ A; 1N9F A; 3HEO A; 5C6E A; 1JPB A; 3AT6 A; 5CN7 A; 3GQP B; 3UHI A; 1GBV A; 1MNJ A; 1Y5F A; 1BBB B; 3HYU B; 4H2L B; 2MB5 A; 2NRL A; 3ZH0 A; 1HBB A; 3LQD A; 3D7O B; 1LUE A; 5HLU A; 2HZ1 A; 1SDK B; 3QM6 A; 2Z85 A; 2EB9 A; 2O58 X; 4NI1 A; 3UBC A; 1MYH A; 1N9I A; 5JGG A; 3NMM B; 1F65 A; 4FC3 A; 1C40 B; 1YZI B; 1NZ4 A; 1URY A; 1BIJ A; 5AZR A; 3WR1 A; 1BJE A; 3GQG B; 2W72 A; 1RQ3 A; 1URV A; 2R1H A; 2ZT1 A; 2MGA A; 1S6A A; 1Y7G B; 1VRE A; 1A00 B; 4N8T A; 4MQJ B; 2GLN A; 5CHQ A; 4MPM A; 3E4N A; 3O7N A; 1Y4F A; 1LFY B; 3EU1 B; 1RVW B; 1DUK A; 2JHO A; 3IC2 A; 1UIW A; 2H8F A; 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