3D2EB

Crystal structure of a complex of sse1p and hsp70, selenomethionine-labeled crystals
Total Genus 109
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
109
sequence length
379
structure length
379
Chain Sequence
AAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords Heat shock protein homolog SSE1
publication title Structural basis for the cooperation of Hsp70 and Hsp110 chaperones in protein folding.
pubmed doi rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 109
structure length 379
sequence length 379
chains with identical sequence D
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-05-08
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3d2eB02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3d2eB01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3d2eB03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3d2eB04
2CH6A 4K41A 2E1YA 3A5NC 3G25A 3WQUA 4H0VB 3UB5A 3KHYA 1GLBG 2IIRA 2QWLA 2GTDA 5AQOA 3ZETA 1CZAN 4QS9A 1NGCA 4BGAA 4ISFA 1EQYA 1Z05A 4JNEA 3SLCA 2GWJA 4A2AA 5AQGA 4B1WB 3C0BA 4MLEA 3C7NA 4BVOA 3O4WA 2QWNA 4CZFA 2H3GX 2QWQA 2P9LB 4BRPA 2P9NA 4K25A 1JCGA 4PL7A 2V52B 4XH4A 3M3ZA 1QQNA 1Z6RA 2FSKA 3ATVA 1GLDG 1R59O 3VF6A 5BN8A 4PL8A 4QS8A 5KQ8A 5AQQA 1E4GT 4IJAA 4RWTA 1NGIA 1X9JA 3LM9A 1IJJA 1RGIA 1ATNA 2YHWA 3L6QA 4BRKA 2Q0UA 4B9QA 4FWLA 3CJ9A 3EN9A 5AQLA 3VESA 4GNIA 5BPLA 2I7PA 3DXKB 2ZWHA 3U8XA 3CI5A 4JAXA 2GWKA 3VGLA 3QFPA 3LDOA 5AQMA 5FPEA 1IG8A 3FZFA 2ITMA 1HX1A 3VPZA 5AFUA 3O8MA 2ASOA 1KXPA 3HM8A 4BR9A 4L3QA 4H0PA 4H0YB 3DXMA 2ZGZA 2VYPA 4FSVA 1DEJA 3FZLA 1TUUA 5KPRA 2UYTA 4CZMA 2FF6A 4H5VA 3EKUA 2D4WA 1BDGA 1NMDA 3KZBA 3SK3A 1V4SA 4FWMA 4DQ8A 5ADXA 3FZKA 1MWMA 4BRDA 1GLJO 4MO4A 2DPNA 4BRGA 2CGLA 4BG8A 5I9EB 3MN9A 4XH1A 1D4XA 4WQ4C 4CZKA 3FR0A 3D2FB 4H0TB 1RDWX 1MDUB 4I6MA 5TKYA 2QM1A 4J8FA 2BTFA 2HOEA 3U9ZA 3GOIA 3HSCA 3WUHA 4QS7A 3MK6A 1YUWA 4CD3A 2D1KA 2IVNA 5AQWA 1NGDA 4F9OA 1SQKA 1NGHA 2Q36A 5ELZA 3WXLA 1GLCG 4DHYA 3FZMA 1HLUA 1SZ2A 4JN4A 5KPZA 1P8ZA 5AQVA 1QZ5A 2FF3B 3FE1A 3IUCA 4B1UB 5AQPA 5AQJA 2CH5A 1BA1A 4ISEA 3H1QA 3O6WA 3QBXA 4CD1A 1XUPO 1BWFO 1JCFA 2Q31A 3P4IA 4FOIA 3WEEA 3ZEUA 2P9PB 2Q0RA 3BUZB 1ATRA 3AY9A 4O5FA 3WXKA 4BR5A 3BP8A 1BO5O 4FWKA 3UKRB 4BR7A 5AZJB 4A2BA 1TYQB 1GLLO 4FOEA 3WXIA 2J4RA 3RSEB 3L4IA 2P9SA 1U2VA 4JHDB 5AQKA 1QQMA 2E8AA 3GL1A 3QMLA 3A5MC 1J6ZA 3S41A 1HJOA 1BUPA 1ZC6A 4BR0A 3TPQA 4EAHD 2A3ZA 2E20A 2P9KB 2A41A 4CBXA 2YJFA 3LDPA 2P9LA 5EY4A 2E2PA 4IXCA 4BVPA 5AR0A 2D0PA 1BU6O 3MMVA 3R9PA 4IO8A 2A40A 4BQZA 4H5WA 4WQ4A 4BROA 3B8AX 2P9IB 3FLCO 4FWRA 4Z94A 4BRNA 4BRAA 2QWMA 3GDQA 5AQYA 5AQXA 3D7EO 5AQZA 4CBUA 3C7NB 2V51B 4FPBA 3EZWA 4BC5A 3JS6A 4AM6A 2VCPA 4B1XB 3CETA 1DKGD 5FPMA 4NB4A 4H0XB 1KAZA 3H3NO 4BRMA 3M6GA 1NGFA 4CZLA 3CERA 3FGUA 3DWLA 3MDQA 4WQ5A 4XH5A 3H46O 5JMVA 5B8HA 2HF3A 3O5BA 4E1JA 2E88A 2NLXA 2YI1A 3MN7A 4H5NA 3IMXA 2P9UB 2YHXA 3GE1A 2FSNA 2AP1A 4EHTA 2ZF5O 5F2RA 2E2NA 2W41A 2FLOA 4ISGA 3H6EA 3D2EB 3A5OC 3CQYA 4BRFA 4C23A 5BRDA 5EXWA 4JD2A 3VF4A 4CZGA 5F1XA 2YJEA 4MO5A 4BC4A 3DXMB 3M1FA 1BG3A 1C0GA 4B1ZA 3CQXA 5FPDA 3MN6A 5E26A 5AZIA 2Q97A 2QW9A 2ASMA 2F9TA 3R6MA 3IDHA 4H03B 3AAPA 5KQDA 1TUYA 3CIPA 4AM7A 3GBTA 2QXLA 5F0XA 2WUSA 4FWPA 2OANA 1WUAA 3QFUA 4EFHA 4BR2A 2GELA 4PKIA 1RFQA 4BG9A 4YDUC 3ENOA 5EOYA 3VEWA 1E4FT 1C0FA 3GG4A 4FPAA 3QB0A 1T6DA 3H45C 1NM1A 4CJ7A 3I8BA 3VGKA 2AA4A 4DCHA 4WQ5C 3ID8A 2YHYA 4FO0A 4EHUA 5E84A 4I6MB 3VF2A 4H5TA 4FWNA 4O8KA 2A5XA 2PBDA 3WT0A 4CZHA 3LM2A 4BREA 5BPMA 5EVZA 2P9PA 1QZ6A 3W0LA 3I33A 1K8KA 2Q2RA 5ADXH 2BUPA 2IVOA 5AQHA 1NBWA 3HBTA 3W3DA 3DJCA 4XEIA 1NGAA 4M7YA 1YXQA 3LL3A 2GUPA 1ESVA 1QQOA 5BPNA 1S22A 1TYQA 3WXJA 2QWRA 1ZXOA 1NGEA 4JHDA 4CZJA 3CJ1A 3ZX2A 3ULEB 3WEEB 1SAZA 1NGBA 2IVPA 3UKUB 3ZEUB 3CJCA 4BC3A 1Q18A 1YAGA 1ZBSA 1NGJA 3H3OB 3EL2A 3IFRA 4A62A 3O1WA 5AQRA 1KAYA 4RTFD 3BF3A 3VOVA 3ATUA 2ZGYA 3U4LA 3VETA 3CJAA 3VEZA 5AQFA 5AQUA 3BEXA 2P9SB 1U2VB 2I7NA 3ZETB 4K43A 5BRFA 2P9IA 3KVGA 4HTLA 4NO7A 1GLEG 3FFKB 2E2QA 4B1VA 1X3MA 3ENHA 4BRIA 4YDUA 1OKJA 3SMSA 4FWSA 5JLHA 4DB3A 1MA9B 2KHOA 1LOTB 2P9NB 4IZ9A 3DXKA 2Q1NA 3MCPA 2EWSA 3SJHA 5BREA 3VERA 4WYBA 3SMPA 3EKSA 3WQTA 2YCHA 3HTVA 3O1BA 3VENA 2NRHA 2W40A 4CZIA 5BR9A 5LY3A 3LDQA 4EIAA 4H0OA 2V7ZA 1BOTO 2P9UA 2FXUA 3VEOA 1HUXA 5BRHA 3QBWA 5AQTA 2HF4A 5LJVA 3VEYA 4M63C 5JICA 1HPMA 3R8EA 2E1ZA 3H1VX 3D2EA 3CHWA 1BA0A 1Y64A 2CGKA 2HMPA 1NLVA 3L0QA 1MWKA 3MN5A 5BN9A 1G99A 2VWBA 2CGJA 3O80A 4BRHA 5KPTA 4A61A 2GEMA 3J8AA 4BGBA 4B1YB 3A0IX 1HKCA 3D2FA 3AARA 3QICA 5CE3A 3DAWA 4HWIA 4JD2B 1KAXA 4IJNA 2ASPA 5AFUH 3ZX3A 4K42A 3A8YA 4CBWA 2QWPA 1JCEA 1T6CA 3HI0A 4LC9B 2A6AA 3U9DA 5AQIA 4H5RA 2V7YA 5AQSA 3AAQA 3UE5A 1GLFO 1DGKN 5AZIB 1LCUA 1NWKA 1T44A 5LJWA 3HZ6A 1QHAA 4RCHA 4BR4A 3JXUA 4FWQA 3VGMA 2E2OA 3BF1A 1GLAG 3VEXA 1HKBA 4BRQA 3TU5A 2FSJA 4CZEA 3CJBA 3ZX0A 3FZHA 3A5LC 2QWOA 5EX5A 3F9MA 4BRCA 4Y0WA 4KBOA 4M7XA 4PKHA 3LDLA 5JLFA 3UKRA 1XC3A 4CI6A 5AZJA 1WOQA 2A42A 5AQNA 1NGGA 3CJ7A 3VEVA 4GY2B 3RSEA 1U6ZA 1YVNA 4BQLA 4FL9A 4PKGA 1ATSA 3OHRA 3ULEA 2NZTA 1H1VA 3LDNA 3EO3A 5FPNA 4IWVA 3UKUA 4BRLA 1S3XA 2F9WA 3QDKA 3O08A 1K8KB 2D0OA 2P9KA 1X3NA 4MLHA 4FWOA 4BC2A 2PAVA 1HKGA 1XQSC 1V4TA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1QVGM 5C0YA 3KLFA 3ZSVA 1PE4A 3A5NC 3OY9A 3WQUA 4H0VB 2IIRA 1LQQA 2QWLA 4B8CA 3PLAA 3P1GA 4OX9K 4GV6A 4JKCA 2O8BA 4ISFA 1XWLA 1CN2A 4DLEA 4JNEA 1KLNA 3C7NA 1L4VA 1RILA 1RTIA 1J5EK 2P9LB 2YILA 1BL3A 3J81O 1LV5A 3I55N 1OH6A 4PL7A 2V52B 4XH4A 4AH9A 3ITHA 3VQQA 3CCQN 1Z6RA 2FSKA 4CJEA 2XY6A 4KHNA 1HNWK 3J7YP 2KZMA 5BN8A 5AQQA 2EX3A 1NKCA 3AGKA 4FJGA 2A7TA 4BRKA 2OTJN 4B9MA 4X66K 4Z4IA 4UQGA 4IKFA 3T1HK 3U8XA 3HOSA 3VGLA 4LF6K 1ZFUA 1RNHA 4CGGA 1IG8A 1VK0A 3TTDA 3TABA 4JI5K 3NAEA 1BMRA 5AFUA 4DSEA 2ASOA 1KXPA 1HMVA 3HM8A 3MEGA 1W0HA 4DFJA 2JWLA 4WCEL 2YIOA 3L2RA 4CGFA 4I9QA 2O4GA 4GVMA 2YX6A 3FZLA 5HRNA 1C56A 1K73O 2UYTA 1TKTA 1HJRA 3EKUA 2G8WA 4M3RA 3KZBA 3QNNA 4DQ8A 1V4SA 4OLAA 4FM2A 2GL1A 1L3UA 2Y1JA 3FZKA 1MWMA 2G2KA 4Y1CA 3DM2A 5JVGL 1BCGA 2QI2A 2DPNA 4JV5K 2CGLA 4BG8A 4MQ3A 3KWIA 4N41A 3RR8A 4DR3K 3AA5X 3MN9A 4XH1A 4CZKA 3SQ1A 4H0TB 3PY8A 1MDUB 3QEVA 2BTFA 1BCMA 3DLKA 1PTXA 1U04A 5FDLA 4QS7A 5H1SQ 2RE2A 1KTQA 3DLLL 1RBTA 1NGDA 2IAJA 2Q36A 3WXLA 1GLCG 2X78A 3D45A 3FZMA 3ZSQA 1IV0A 1NG9A 1SZ2A 3QI7A 2G8HA 1QZ5A 2N66A 3FE1A 5AQPA 1VQPN 2CH5A 1D9FA 4DQRA 4ISEA 4CGDA 3SBGA 4I2QA 4YORA 1XUPO 3VA0A 1NK0A 1BQMA 4ZTFA 2YV0X 3AY9A 4ID5A 4BR5A 1NOYA 1KD1O 3KLIA 3N4QA 4CHZA 3G4SN 5M1FA 1SN4A 2GUIA 1QTMA 3B6OA 4B9VA 3GL1A 2E8AA 2Z1GA 4M3WA 4KRFA 1ZC6A 1P00A 3L3UA 4CK1A 2A3ZA 2E20A 2P9KB 1J5OA 3OYGA 3PIOL 1EWQA 5CY0A 1VSFA 3KD1E 3ALYA 4DUZK 4OGEA 1YI2N 2FBVA 1VQMN 3LDSA 2E2PA 3DMJA 4BVPA 4FK2A 2RHKA 1S6QA 2WFBA 1BU6O 3MMVA 3VMFB 3R9PA 1VNBA 3K5OA 4LF4K 4BQZA 3P31A 4H5WA 4WQ4A 2OPRA 2P9IB 1JZAA 2O8BB 4Z4CA 1RTJA 2QWMA 3GDQA 3D7EO 3KHWA 1CHZA 1HNVA 3C7NB 4BC5A 3ID6A 3CETA 1DKGD 1JXCA 5FPMA 4FW1A 3CMEN 3H3NO 1T1TA 1NGFA 4CZLA 3CERA 4NXMK 4QAGA 2HHQA 4DFPA 3EE9A 3AV9A 4DU3A 4E7LA 2B6AA 2E88A 2YBRC 3LP1A 3PSMA 4E7KA 3CFPA 4B3RK 1W7AA 2G8IA 1I6FA 1IKVA 1RT2A 2DFHA 2E2NA 2R7YA 3SPZA 4YOXA 4HE7A 1SKSA 4ISGA 3M8RA 5GADP 3H6EA 3A5OC 3CQYA 5JS2A 4BRFA 4YOUA 4C23A 3THWA 3VQEA 4JD2A 3VF4A 4OKKA 1GPSA 2ITGA 2GV9A 4J2BA 3SJJA 4O0IA 2RKIA 1TI5A 3B6PA 2HBMA 1NK6A 5CYQA 5E26A 5AZIA 1OVYA 1RT6A 3CC4N 4A59A 1RBRA 4E7IA 1U49A 3CIPA 4HUEA 4FWPA 4CIFA 1JKZA 4CJTA 1SL1A 4MDAA 4EFHA 3TAFA 4PKIA 4BG9A 1VQNN 3ENOA 1TKXA 1TL3A 4JS5A 1E4FT 2O8FA 2LI7A 3QB0A 2D56A 1T7EA 2FBYA 4DCHA 3K9KA 3KJVA 4GW6A 2XO7A 1JL1A 3CCLN 4CJLA 4FO0A 3ULDA 4DV5K 4JK8A 2A5XA 4PHTX 3KK3A 3LM2A 3SYZA 1YJWN 3I33A 1K8KA 3HBTA 3W3DA 3DJCA 1IKYA 4JI7K 4DR6K 1XMOK 1FJGK 2IS3A 3HVRA 5C42A 3NE6A 1VSEA 4C1NK 3A2FA 3TSUA 4CGIA 1NGEA 4JHDA 4CZJA 4CJFA 4GMJB 1NGBA 3UKUB 1WBBA 3CJCA 3NH2A 3ZSOA 1Q18A 2OPSA 4PUOA 1NGJA 2W42A 2SN3A 2I5JA 2LSNA 3C6UA 4A62A 1KAYA 4RTFD 3BF3A 3VOVA 3L2QA 3BEXA 1WSFA 5C24A 3THXA 1X3MA 1OKJA 1JLBA 4CFCA 2QA4N 4FWSA 1YHQN 3H08A 4DB3A 1MA9B 1NRBA 2RN2A 2P9NB 2O8DB 4B08A 3MCPA 3IAYA 4AHUA 3SJHA 4B9UA 3LAMA 2B3CA 1HR0K 3EKSA 4FLZA 3WQTA 2YCHA 1EKEA 4CZIA 4EP5A 2K35A 1ASUA 1UOCA 3AO4A 5GIOA 4ILGB 3ZT1A 4CHPA 3VEOA 3WNEA 4YOVA 4JLHA 3G0ZA 1OZZA 4NCBA 1NMNA 1IBLK 1FKOA 1HPMA 2KTQA 2E1ZA 1DTQA 3OS1A 4DTUA 1JLQA 1GOAA 1Y64A 2HMPA 2E6MA 3S3OA 1ZBIA 1MWKA 4FJJA 2F4VK 4FJ9A 3PX4A 1AHOA 2CGJA 1CXQA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1QVG M;  5C0Y A;  3KLF A;  3ZSV A;  1PE4 A;  3A5N C;  3OY9 A;  3WQU A;  4H0V B;  2IIR A;  1LQQ A;  2QWL A;  4B8C A;  3PLA A;  3P1G A;  4OX9 K;  4GV6 A;  4JKC A;  2O8B A;  4ISF A;  1XWL A;  1CN2 A;  4DLE A;  4JNE A;  1KLN A;  3C7N A;  1L4V A;  1RIL A;  1RTI A;  1J5E K;  2P9L B;  2YIL A;  1BL3 A;  3J81 O;  1LV5 A;  3I55 N;  1OH6 A;  4PL7 A;  2V52 B;  4XH4 A;  4AH9 A;  3ITH A;  3VQQ A;  3CCQ N;  1Z6R A;  2FSK A;  4CJE A;  2XY6 A;  4KHN A;  1HNW K;  3J7Y P;  2KZM A;  5BN8 A;  5AQQ A;  2EX3 A;  1NKC A;  3AGK A;  4FJG A;  2A7T A;  4BRK A;  2OTJ N;  4B9M A;  4X66 K;  4Z4I A;  4UQG A;  4IKF A;  3T1H K;  3U8X A;  3HOS A;  3VGL A;  4LF6 K;  1ZFU A;  1RNH A;  4CGG A;  1IG8 A;  1VK0 A;  3TTD A;  3TAB A;  4JI5 K;  3NAE A;  1BMR A;  5AFU A;  4DSE A;  2ASO A;  1KXP A;  1HMV A;  3HM8 A;  3MEG A;  1W0H A;  4DFJ A;  2JWL A;  4WCE L;  2YIO A;  3L2R A;  4CGF A;  4I9Q A;  2O4G A;  4GVM A;  2YX6 A;  3FZL A;  5HRN A;  1C56 A;  1K73 O;  2UYT A;  1TKT A;  1HJR A;  3EKU A;  2G8W A;  4M3R A;  3KZB A;  3QNN A;  4DQ8 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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