The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
19
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sequence length |
76
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structure length |
76
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Chain Sequence |
TKWLTLEVCREFQRGTCSRPDTECKFAHPSKSCQVENGRVIACFDSLKGRCSRENCKYLHPPPHLKTQLEINGRNN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Metal binding, rna binding protein
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| molecule keywords |
Muscleblind-like protein 1
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| publication title |
Structural insights into RNA recognition by the alternative-splicing regulator muscleblind-like MBNL1.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
19
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| structure length |
76
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| sequence length |
76
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-05-08 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | DNA polymerase; domain 1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3D2Q A; 2E5S A; 3D2S A; 3D2N A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4YCX A; 4CNQ A; 5KL1 B; 2E8P A; 4OCZ A; 4R63 A; 3IN5 A; 2IA6 A; 4ED8 A; 1RPL A; 2R8H A; 3OSN A; 5DDM A; 1PK1 A; 1N60 A; 3ZD8 A; 4ED6 A; 1DGJ A; 3WKE A; 2D8C A; 2EZY A; 2E1F A; 3SYZ A; 4DOA A; 3NTU A; 1L5U A; 5A0L A; 2PMZ C; 5J0P A; 9ICC A; 3WKB A; 4TQS A; 2MU2 A; 2B0C A; 4FBT A; 4C7Z A; 2BCU A; 2LI6 A; 4F5P A; 3TAD A; 4B9S A; 3IHQ B; 2FLN A; 2KJ9 A; 2W3S A; 3G6V A; 4M9H A; 1QQ6 A; 2OM6 A; 5HML A; 5B5E U; 2JZB B; 4EEN A; 2ASJ A; 4Q8E A; 1ZD3 A; 5ALX A; 1C7Y A; 1ZJM A; 1XO0 A; 2VAN A; 2R8K A; 1ZQV A; 4DWI A; 4DLG A; 1ZQZ A; 5CR0 A; 5DB8 A; 5ALJ A; 1WUD A; 5KG1 A; 3CNH A; 3NAS A; 2OEH A; 1WCN A; 3H8W A; 8ICO A; 5F9N A; 4AYB F; 3PX0 A; 4DSK A; 1SV0 A; 4I2F A; 3SV4 A; 3GZF A; 1PVP A; 2ZG6 A; 3SD7 A; 4DFK A; 5J0X A; 3C21 A; 3L3F X; 3JPN A; 4GFJ A; 3ZDE A; 3GDX A; 5H2F U; 4J9Q A; 1DGS A; 5KFR A; 3RB3 A; 3ZDA A; 5ALG A; 1SZP A; 4RQN A; 3TKA A; 4QZC A; 4Q45 A; 2ZIV A; 1ZQN A; 1ZQY A; 2JR5 A; 9ICI A; 3TFS A; 2KZZ A; 3PW5 A; 5AKY A; 2ZJ8 A; 2BZF A; 1KN5 A; 5KFQ A; 2G0A A; 4C4R A; 3JPQ A; 2PXI A; 4J9O A; 5GTI U; 5KFZ A; 4ECY A; 4EZ9 A; 4CDG A; 4XA5 A; 4XUS A; 2YY6 A; 8ICS A; 4EX7 A; 1DRG A; 5EWG A; 4Y2Q A; 2YMM A; 4DQS A; 2BQU A; 4UAR A; 1RM6 C; 8ICX A; 2QAR A; 1V38 A; 1PK1 B; 1SB3 C; 4UQG A; 2PFQ A; 4F5R A; 5ALM A; 5J0O A; 3KFU F; 2F3N A; 4DS4 A; 4OJO A; 9ICA A; 2K4H A; 1VJ5 A; 4MFA A; 2GOL A; 2KIV A; 1FO4 A; 4O3O A; 4DOB A; 4JV2 A; 1MQ2 A; 3AU2 A; 4KLQ A; 3WK8 A; 2XIC A; 3I1Y A; 1ZRM A; 2OYY A; 3M6Z A; 4F5Q A; 4QZG A; 3PW0 A; 3NGD A; 1DOQ A; 1ZQQ A; 7ICR A; 3BZK A; 2ASD A; 2QKQ A; 5EWE A; 4ECZ A; 4C8O A; 2M9N A; 1BPE A; 5J0T A; 1UA0 A; 5KFG A; 2YMP A; 1Q46 A; 2LYH A; 3CYM A; 5DB7 A; 3NS1 A; 4JV0 A; 1JN3 A; 2YQE A; 4O9M A; 1QQ7 A; 5KG0 A; 4U7C A; 4US9 A; 1X6J A; 3Q8S B; 2NRT A; 1ZD4 A; 1WYG A; 3SEI A; 3UXN A; 9ICQ A; 4CF3 A; 2NRW A; 4R8U A; 4KLD A; 4F72 A; 8ICR A; 3BS7 A; 3QX7 A; 3ISB A; 3K4G A; 4QWB A; 5J2F A; 3T79 A; 3RBD A; 1U9L A; 3V72 A; 1MA7 A; 2G07 A; 2W8L A; 2PKE A; 2RP5 A; 4P0P A; 4ECS A; 4FFD A; 2LBO A; 1KRP A; 2ZIV B; 4O5E A; 2QB0 A; 4F4K A; 2KV2 A; 1TKD A; 5KT7 A; 1ZQS A; 5J2E A; 3G6X A; 4I2D A; 1RXV A; 3T5J A; 3WK6 A; 4O3M A; 3WKA A; 1SKS A; 4YMO A; 1V85 A; 1HUO A; 2YB4 A; 4O3P A; 1KBU A; 2BCQ A; 4FZM A; 5K4L A; 1SKR A; 4F2S A; 2A1J B; 1ZQP A; 2OWO A; 4DQR A; 2QAR B; 4I2I A; 5J2C A; 4DLE A; 2BGW A; 4ACO A; 2ZIW B; 4QWA A; 4RT2 A; 4TUQ A; 1ZQD A; 1SZH A; 2KD1 A; 1YT3 A; 1RG6 A; 3PW7 A; 3UMB A; 2MSN A; 4O0I A; 2V4R A; 1KLN A; 2WF6 A; 1NJW A; 4M9N A; 4O3S A; 3MR3 A; 5KFE A; 5KL8 B; 2ZTE A; 4NJ8 A; 1NKC A; 2IMW P; 2HHU A; 4FZL A; 4BWJ A; 4Y2U A; 5DDY A; 2BQ3 A; 5J0R A; 1T3Q A; 3N7R C; 4O3R A; 3Q8M A; 4ELU A; 8ICL A; 4DL3 A; 5DG9 A; 4F91 B; 4YXM A; 3RRH A; 2OXO A; 7ICP A; 4M47 A; 1CRX A; 3PSI A; 1JI7 A; 3RJK A; 3PNC A; 4I2E A; 5G5G A; 4CGZ A; 4UAS A; 4KLI A; 4X5V A; 3IDW A; 3OHA A; 4ECU A; 5KG2 A; 1XU4 A; 3H0L B; 5AKK A; 4F4W A; 1S97 A; 2NRV A; 4J9M A; 4Y2S A; 4R8U B; 4RU9 A; 4J9L A; 3NRZ A; 4KLU A; 3CW2 C; 1S76 D; 3FYH A; 4Q8F A; 5L1L A; 2WB1 F; 1YZ7 A; 1ZET A; 5KFL A; 2W04 A; 4P2H A; 1ZQF A; 8ICJ A; 5CHG A; 3BQ2 A; 2YB1 A; 3Q8Q B; 5KG5 A; 2QB0 B; 1ZQM A; 3H8S A; 1TK0 A; 3Q8R B; 1SGG A; 1EXN A; 4ECT A; 3A0B U; 4RPY A; 4ZOH C; 5DG8 A; 1ZQT A; 1M6Y A; 4Z6C A; 1URJ A; 1VDV A; 3IRU A; 1SKW A; 1N62 A; 1RQL A; 5DB9 A; 4QZB A; 2FMQ A; 2ZXH A; 2IHM A; 5AM5 A; 4M9G A; 1ECW A; 2HBK A; 4PPX A; 4DSE A; 4U6P A; 4OJL A; 4F50 A; 5ALU A; 5D49 A; 1P7D A; 4F4X A; 2NO4 A; 4ED0 A; 1F5S A; 1NK8 A; 1MN8 A; 9ICM A; 9ICR A; 2KOB A; 3K75 D; 1H38 A; 4RQ2 A; 2W7O A; 3AM9 A; 4K4H A; 4F71 A; 3UXO A; 3OHB A; 3LVW A; 5IIL A; 5ALZ A; 3UM9 A; 4EYI B; 2RLT A; 2HBJ A; 3T5L A; 4UAZ A; 3C5G A; 4RPX A; 3BQT A; 2KVC A; 2WF7 A; 3HIL A; 2LMR A; 3H8J A; 1T7P A; 9ICO A; 5J2G A; 3MR6 A; 4F3O A; 2FPL A; 1A0P A; 3LVV A; 1JUD A; 1QQ5 A; 4QW8 A; 2CXY A; 1WCL A; 4ECQ A; 2IOF K; 5AK3 A; 3Q8L A; 1KW4 A; 3C28 A; 4PJ0 U; 1AQ6 A; 5JTI A; 2H3F A; 2FPM A; 1NK0 A; 1SL0 A; 1ZQJ A; 3QZ7 A; 4O3N A; 3JPS A; 8ICM A; 4NWI A; 2RDI A; 8ICA A; 1L7M A; 3PSF A; 1S0V A; 2HDO A; 3KBB A; 4KLM A; 3FC4 A; 2YTU A; 1LVH A; 3OJS A; 2ZIU A; 3JPP A; 1ZQC A; 3E58 A; 1NKE A; 1BPZ A; 5KFP A; 5CP2 A; 4KLE A; 4C4S A; 1SV4 A; 3PVX A; 4DL4 A; 5AKJ A; 1S9F A; 4TQR A; 2PFP A; 3H8M A; 5CWR A; 4NLK A; 8ICY A; 4KMO B; 5AI5 A; 2O6K A; 3B9J A; 2BCS A; 5ALP A; 4Y2T A; 2EQY A; 2E8M A; 2OH2 A; 5ALW A; 4MFF A; 1KEJ A; 2XVT A; 3UQ2 A; 4IS7 A; 2P66 A; 2AH5 A; 4GXJ A; 1A6S A; 2AU0 A; 2JH7 A; 2V4Q A; 3PSP A; 5L1K A; 8ICU A; 2KFN A; 5KFJ A; 1L3U A; 1A76 A; 3KHH A; 4B9V A; 2KKV A; 3MFH A; 1L3S A; 4HAI A; 7ICE A; 3KKA A; 1L6N A; 4F4Y A; 1DK2 A; 1KTQ A; 2Y1I A; 4B9N A; 2VA3 A; 2JEG A; 2C28 A; 1XSL A; 2MA1 A; 2PFN A; 1KFS A; 5J0U A; 3OTQ A; 9ICU A; 1XS9 D; 2ZJ5 A; 1UQV A; 2C2D A; 4Y2Y A; 4I28 A; 3KD3 A; 1BPB A; 4DSJ A; 4IR1 A; 3KHL A; 2Z7J A; 2JGA A; 1XWL A; 4KX3 A; 1NJY A; 5KAF U; 4J9R A; 4BWM A; 3H7I A; 4GC7 A; 5HR6 A; 1SL1 A; 5III A; 3WU2 U; 3ZDC A; 4LVS A; 4RQ8 A; 9ICE A; 3BQ1 A; 1ZQW A; 3PV8 A; 3ORY A; 5EE9 A; 4IQU A; 2YMQ A; 5KFY A; 4O5K A; 1DK3 A; 5EWF A; 3RRG A; 4DQP A; 5KTQ A; 7ICU A; 3K1Z A; 4UAU A; 1X66 A; 3ISC A; 4QZF A; 2WF9 A; 2F1J A; 1PUZ A; 5KFM A; 2C2E A; 3GIL A; 4MEX A; 5JU5 A; 2K8A A; 5AI6 A; 4RQ7 A; 3PO5 A; 5DLF A; 4JUZ A; 3JPO A; 1KQQ A; 9ICH A; 5ALF A; 2ZIU B; 2Q0Z X; 4UW9 A; 4KLT A; 1B4F A; 2E1E A; 1NK7 A; 3Q8P B; 1HIW A; 2HI0 A; 2W54 A; 4YR0 A; 1ZQG A; 7ICF A; 3QUC A; 5HNK A; 5KFN A; 4RZR A; 3SQI A; 4IR9 A; 3RH6 A; 2AGP A; 5L1J A; 1X9S A; 7ICN A; 5KNI A; 5D46 A; 2DGZ A; 4M2Y A; 1L7O A; 5KFF A; 2ISO A; 4OO1 J; 5ALD A; 3TFR A; 5HP4 A; 7ICJ A; 4CF4 A; 4JWM A; 1BPD A; 1TE2 A; 3FDS A; 5J2J A; 1COK A; 2XID A; 4QZH A; 4AYB C; 3M9M B; 2P35 A; 5DQH A; 2WTF A; 2E8O A; 3RJG A; 4PZN A; 5AKZ A; 2LM1 A; 4I27 A; 4P4M A; 2AGO A; 9ICJ A; 8ICW A; 3AUO A; 5ALN A; 5E79 U; 1TK8 A; 3OGU A; 1PK3 A; 3ISD A; 1Z00 A; 3ZI4 A; 3ALR A; 2ZUD A; 4EEL A; 4YR2 A; 4ELT A; 3M9N B; 3TAR A; 4ED3 A; 3QE9 Y; 2G5I B; 4EBD A; 1SWV A; 4DSF A; 3QUQ A; 3F5E A; 4YP3 A; 2KSO A; 1FFV A; 5KG7 A; 4IRK A; 4CCH A; 4C8M A; 4KLO A; 2B21 A; 4GLX A; 4BXO A; 3MGI A; 2R8I A; 2A1J A; 4Z6F A; 4RQ5 A; 1DXS A; 4LJX A; 1J97 A; 3KOO A; 4JV1 A; 2ZIW A; 5J2H A; 3QUB A; 1ED1 A; 4NXZ A; 1L8L A; 5KFI A; 4G9B A; 3J81 j; 9ICX A; 2AXT U; 4YXJ A; 2HHT A; 3HWT A; 1N63 A; 3N97 B; 2XGP A; 3SAG A; 5BPC A; 1QSL A; 1ARO P; 1L7N A; 2Y1J A; 2AQ4 A; 2MUT B; 3SV3 A; 1BVS A; 5KFO A; 3N28 A; 5AHX A; 4RQM A; 4EBC A; 1Z4N A; 3FAH A; 2EZX A; 4YR3 A; 4PH5 A; 4B9U A; 1V9P A; 3HKZ F; 1KFD A; 3M6K A; 2I6X A; 3T5H A; 1X6I A; 4NV0 A; 4FE3 A; 1ZQ1 C; 2RHF A; 4UBC A; 4KLG A; 4C8K A; 4JB3 A; 2VJ4 A; 2F76 X; 4BJQ A; 4ZH4 A; 3S6J A; 3ONN A; 3TAN A; 8ICV A; 1ZQO A; 5KFW A; 4MHV A; 3NVV A; 1B22 A; 4J03 A; 4PHD A; 5AKX A; 4RNO A; 3N7P D; 4YMN A; 2GH1 A; 3L5K A; 3BS5 A; 2WF8 A; 3KHR A; 2ASL A; 4B9L A; 4ECR A; 1Z00 B; 4EX6 A; 1FFU A; 3JPT A; 5ALT A; 2I9G A; 1COO A; 4GXK A; 3H0R B; 4Q44 A; 2N1R A; 9ICP A; 3WK5 A; 3RH5 A; 4DOC A; 3EPG A; 5ALH A; 1JAL A; 3PX4 A; 2KSO B; 4YVZ A; 2J6T A; 3PY8 A; 2ZXI A; 2VA2 A; 3T3F A; 9ICK A; 1RZT A; 3RAQ A; 4BXO B; 2Y9T A; 1S77 D; 3AQF A; 2DPJ A; 3RB0 A; 4UBB A; 4MEY A; 2XY7 A; 4F93 B; 4CRX A; 1S0O A; 1ZD5 A; 2HOI A; 4BX9 C; 2HW3 A; 3ED5 A; 7ICH A; 3RJI A; 8ICF A; 1N61 A; 1D8Y A; 5AM0 A; 3RJE A; 3H4D A; 5DLG A; 5DBB A; 2DF4 B; 4TUR A; 3QU5 A; 1U45 A; 5DGB A; 2BPC A; 3PW2 A; 3ZDD A; 4PGX A; 4C8N A; 2OCE A; 1ZQI A; 2M0N A; 3HJE A; 4IQT A; 5KFV A; 1O08 A; 3SAF A; 2Y0S F; 1JRP A; 2BHN A; 2GLE A; 1BPY A; 2BDU A; 4DEZ A; 1SXD A; 3RB6 A; 1TVA A; 2NRZ A; 1Z1B A; 1JX4 A; 1QCK A; 5CB1 A; 4IQV A; 1RQN A; 4QWD A; 5IIO A; 3PZP A; 4QZA A; 2XY6 A; 7ICQ A; 4I2A A; 1Q3U A; 2LHT A; 1UA1 A; 5AI8 A; 3MDC A; 3EZ5 A; 4UB5 A; 5IIJ A; 2C22 A; 5HMM A; 5J0W A; 2WF5 A; 3I28 A; 3F2D A; 3PR5 B; 3C2K A; 4DFP A; 3NVZ A; 1ZQA A; 1K1Q A; 1OW5 A; 3UXP A; 5KG6 A; 3RBE A; 5DQI A; 3PR4 A; 3BS5 B; 3GQC A; 2HBM A; 2F1H A; 4DS5 A; 1Z19 A; 1MQ3 A; 1D8B A; 2WB1 C; 5JUM A; 3OPX A; 2C2R A; 3ZD9 A; 3QU2 A; 4YD2 A; 4RPZ A; 1MC8 A; 1X9X A; 5DKW A; 2CRX A; 2BQR A; 3T5K A; 1SIJ A; 4PL1 A; 2G08 A; 2GWS A; 3E2E A; 4QIW F; 4UB8 U; 3GII A; 3H4B A; 5IIK A; 1L7P A; 1X2I A; 3KTQ A; 2BPG A; 3GIK A; 3QEB Z; 2VKQ A; 4DFJ A; 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4UAV A; 4OJ6 A; 2NO5 A; 1NOM A; 3RJF A; 5KFT A; 4Y2X A; 1NJX A; 4KMU A; 3MBY A; 1LKY A; 3HT3 A; 5AKL A; 4IRC A; 2H3Z A; 1GO3 F; 2KVS A; 3ETL A; 5KFH A; 4RUC A; 2AJQ A; 8ICB A; 3FM9 A; 1CUK A; 5KFB A; 1BGX T; 5KT2 A; 1KKX A; 4RNN A; 5AKG A; 5AM3 A; 2BDP A; 3AEV A; 7ICG A; 3OSP A; 5GTH U; 1T4G A; 4QZ9 A; 4TUP A; 2DKX A; 2DQN B; 3PO4 A; 1FEZ A; 2H3I A; 2AGQ A; 4NLZ A; 3ICX A; 2QLT A; 3PML A; 2D6F C; 2KZM A; 1ZQL A; 3RB4 A; 9ICB A; 2IOF A; 2PI5 A; 9ICG A; 3MFI A; 4ED7 A; 4DO9 A; 3CP8 A; 3RAX A; 4K4I A; 1Q3V A; 2HSZ A; 2ALZ A; 1D8L A; 5KFK A; 5J2K A; 1QH9 A; 1T8E A; 2ZUC A; 3DV9 A; 4P0Q A; 8ICP A; 4NL9 C; 5AI4 A; 5ALE A; 2D3D A; 2HMX A; 2ZIX B; 1RYU A; 4DFM A; 3RR8 A; 1S5L U; 3EW9 A; 4DF8 A; 3HPO A; 2JEJ A; 5D4B A; 2WFA A; 4Y2V A; 1UT8 A; 1WWU A; 2PMZ F; 4NLB A; 1ZJN A; 8ICI A; 1V97 A; 2MUT A; 1UHU A; 1Y88 A; 5ALI A; 2A3V A; 2W7P A; 5F9L A; 4EYH B; 1Z4O A; 9ICF A; 1RXW A; 3IV6 A; 4M6W A; 4PHP A; 4Q43 A; 3D2Q A; 2JEF A; 4Y2R A; 1XC9 A; 3M8R A; 1TK5 A; 2HHS A; 1F0M A; 2H3V A; 4RQ0 A; 2W3R A; 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