3D7EO

Enterococcus casseliflavus glycerol kinase mutant his232ala complexed with glycerol
Total Genus 174
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
174
sequence length
495
structure length
495
Chain Sequence
NYVMAIDQGTTSSRAIIFDRNGKKIGSSQKEFPQYFPKSGWVEHNANEIWNSVQSVIAGAFIESGIRPEAIAGIGITNQRETTVVWDKTTGQPIANAIVWQSRQSSPIADQLKVDGHTEMIHEKTGLVIDAYFSATKVRWLLDNIEGAQEKADNGELLFGTIDSWLVWKLTDGQVHVTDYSNASRTMLYNIHKLEWDQEILDLLNIPSSMLPEVKSNSEVYGHTRSYAFYGSEVPIAGMAGDQQAALFGQMAFEKGMIKNTYGTGAFIVMNTGEEPQLSDNDLLTTIGYGINGKVYYALEGSIFVAGSAIQWLRDGLRMIETSPQSEELAAKAKGDNEVYVVPAFTGLGAPYWDSEARGAVFGLTRGTTKEDFVRATLQAVAYQSKDVIDTMKKDSGIDIPLLKVDGGAAKNDLLMQFQADILDIDVQRAANLETTALGAAYLAGLAVGFWKDLDELKSMAEEGQMFTPEMPAEERDNLYEGWKQAVAATQTFKF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
molecule keywords Glycerol kinase
publication title Structural characterizations of glycerol kinase: unraveling phosphorylation-induced long-range activation
pubmed doi rcsb
source organism Enterococcus casseliflavus
total genus 174
structure length 495
sequence length 495
chains with identical sequence X
ec nomenclature ec 2.7.1.30: Glycerol kinase.
pdb deposition date 2008-05-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
O PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
O PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3d7eO02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3d7eO01
2ASMA 2P9KB 3U9ZA 4BRQA 5JLHA 5AQOA 1WUAA 4O8KA 4BR5A 3FLCO 5FPMA 2A5XA 1ATNA 2QWNA 2QXLA 1KAZA 2FF6A 1YAGA 3L4IA 3QDKA 1QZ6A 2AA4A 2V51B 2VWBA 4MLEA 3P4IA 4IXCA 3ZEUB 3QB0A 4B1YB 2YI1A 4LC9B 2P9SB 3UKUB 4BGAA 4EIAA 5ADXA 1X3NA 3EKUA 4FL9A 1LCUA 1S22A 2QWOA 2ASPA 4CD3A 4DB3A 5ELZA 1BA1A 3D2EB 5EOYA 4XH4A 5AQRA 4BVPA 3KHYA 3CJCA 4KBOA 2QWQA 3LDQA 1T44A 3MN7A 2NLXA 4H5WA 4CZFA 5CE3A 4QS7A 4CBWA 3VEYA 5AQXA 3WXIA 2ZWHA 2E2QA 2E2OA 1BOTO 1NGHA 1NM1A 2A41A 5AQUA 4ISFA 2Q1NA 4M63C 2D0OA 4HTLA 2P9PA 3M1FA 4BRMA 2IVPA 4K41A 3ATVA 2ZGZA 1U2VA 3CETA 5AQHA 3QFUA 3EO3A 2PAVA 1JCGA 5KQDA 4FWMA 4CZHA 2ZGYA 4B1WB 1QZ5A 1HUXA 5FPDA 1JCFA 2E8AA 1NGAA 3HI0A 2FSJA 3FE1A 3L0QA 1V4SA 5AZJB 3SLCA 4B1XB 4BC5A 1HKCA 4K25A 1HPMA 3CJ9A 5E26A 3VGMA 3MCPA 3L6QA 5BPMA 2E1ZA 3W3DA 5KPRA 3FZFA 3ULEA 3CQXA 3VEVA 3A0IX 3I8BA 3UB5A 4CBUA 3O4WA 4CZKA 2E88A 1K8KB 1ZBSA 4BRLA 3VF4A 2Q0RA 1HKBA 4WQ4A 1GLJO 2IVOA 3O6WA 3SMPA 4JHDB 4A2AA 4FWQA 3HZ6A 4K42A 3VOVA 3WT0A 4IJNA 2P9LA 5AQSA 5BREA 3MN9A 3H3NO 3CHWA 4NB4A 3ENHA 3CI5A 4FSVA 4CZJA 3R6MA 4BRCA 3H45C 3VPZA 4PL8A 1Y64A 5AQVA 2P9NB 4CBXA 4CJ7A 1GLLO 1SZ2A 3DXMB 1RFQA 1S3XA 4MO5A 5AQQA 2GTDA 2A40A 5E84A 3FFKB 2OANA 3WEEB 2D1KA 2ASOA 4B9QA 4JD2A 2P9IB 3QICA 3A5OC 4JNEA 2V52B 2Q97A 3GL1A 5AQWA 1ZXOA 2P9KA 4RCHA 4FWSA 3CJAA 2GELA 1G99A 1OKJA 1E4FT 2VCPA 3O5BA 1MWMA 5BPNA 3D2FB 2GUPA 2YJFA 3ATUA 3FZHA 3ZX3A 1HX1A 1J6ZA 1NGDA 3CJ1A 1MA9B 3D7EO 4IO8A 5AFUH 1X3MA 1BUPA 1XUPO 2NZTA 4PKHA 3A5LC 3C0BA 3G25A 4JN4A 4XEIA 3ZEUA 4BR7A 1JCEA 1TUUA 1RDWX 5JMVA 4FWKA 1E4GT 1NWKA 3VETA 4BROA 3IFRA 5AQGA 2YHWA 5AR0A 4BRHA 1BG3A 3UKRA 4FWOA 4GY2B 3QMLA 3ENOA 4BQLA 3VENA 3I33A 3D2EA 2F9TA 2VYPA 1Z6RA 2YJEA 4BR4A 3DXKB 5I9EB 4ISEA 2FLOA 3LL3A 4FO0A 4FOEA 4CZMA 2BUPA 3BEXA 1NGEA 4BRPA 4YDUC 4CZEA 3QBWA 4C23A 1H1VA 5LY3A 2ZF5O 3VGLA 3IUCA 3LDLA 1NGBA 2CH5A 4BRGA 4MO4A 4H5TA 5EX5A 2GWJA 1MWKA 1KXPA 3AAQA 3FZMA 3CERA 4K43A 2D4WA 3AAPA 1NMDA 4AM7A 2A3ZA 1V4TA 1MDUB 3LM2A 5BPLA 4E1JA 3ZETB 4CI6A 1T6CA 3WQTA 1QHAA 2D0PA 1SQKA 3S41A 2FSNA 3UE5A 3RSEA 3MN5A 2QWMA 4ISGA 5JICA 5KPTA 3GBTA 3KVGA 4WQ5C 4IWVA 3ZX0A 1BDGA 1SAZA 4F9OA 5KPZA 3GE1A 3CQYA 2CGKA 5AZJA 3VF2A 3BF1A 4QS8A 4H03B 3WQUA 4BQZA 3C7NA 3B8AX 3R9PA 5JLFA 1LOTB 5AZIB 1QQOA 4BG9A 1KAYA 3VEWA 3MMVA 2CGLA 2FSKA 4BR2A 2GWKA 3W0LA 1ZC6A 3CJBA 2W41A 5EVZA 4BGBA 1ATRA 1TYQB 2W40A 4JHDA 4IZ9A 4FWLA 2CH6A 4M7YA 5AQZA 5BRDA 3AY9A 2BTFA 4EFHA 5AFUA 4EHTA 4I6MA 2HOEA 4GNIA 3A5NC 5AQJA 3GOIA 3LDOA 5AQIA 4WQ4C 4PKIA 3TPQA 4RTFD 4BR9A 2QW9A 5EXWA 4O5FA 2NRHA 4BRKA 3DAWA 3SJHA 2DPNA 3VEZA 1D4XA 3HTVA 2P9NA 4A62A 3BP8A 2H3GX 3DXMA 4CZGA 5BN8A 2FF3B 2QWLA 3O1BA 2HF4A 1NGIA 2A6AA 5FPNA 4WYBA 5AQYA 3H6EA 1NGFA 1Q18A 4CZIA 5FPEA 1DKGD 5BN9A 3VGKA 3MDQA 5BRFA 3A5MC 3J8AA 4BC4A 4BVOA 1ATSA 4BREA 1GLAG 2I7PA 2Q0UA 3MN6A 2J4RA 2WUSA 2P9IA 2YHXA 3EZWA 4AM6A 1BU6O 2P9UB 3SMSA 1U6ZA 2E1YA 1HJOA 4H0OA 2HF3A 3O8MA 3ID8A 3WUHA 5EY4A 1R59O 3A8YA 3D2FA 2IIRA 2I7NA 3DWLA 1GLFO 2P9SA 2Q31A 2E2NA 3UKUA 5BR9A 5LJVA 1P8ZA 2Q2RA 1HKGA 1NGJA 4QS9A 5AQLA 4BRIA 3WXKA 1T6DA 3FGUA 5KQ8A 3FZKA 3BUZB 1ESVA 1KAXA 3LDNA 4FPAA 5TKYA 2GEMA 3VF6A 3HSCA 1DGKN 3EN9A 4H0VB 4PL7A 1QQMA 4RWTA 4BG8A 5AQFA 3O1WA 3WXJA 4M7XA 2V7YA 3M6GA 3UKRB 4YDUA 3DXKA 2YCHA 4BRDA 3JXUA 3QBXA 4XH1A 4B1ZA 4BRNA 4H5VA 4FWRA 4PKGA 4FOIA 2HMPA 1X9JA 4MLHA 3GDQA 4IJAA 1GLEG 3JS6A 4JAXA 4DQ8A 3AARA 2P9PB 3GG4A 2EWSA 3IDHA 3ZETA 5B8HA 1U2VB 2ITMA 1RGIA 3KZBA 3O80A 1YXQA 3EKSA 4H5RA 5BRHA 3U9DA 2E2PA 3H3OB 4BRFA 4XH5A 4H0PA 4WQ5A 3RSEB 1YVNA 4Y0WA 4HWIA 3F9MA 2V7ZA 2FXUA 3HM8A 3O08A 4FWNA 3VERA 3OHRA 2QWPA 4CZLA 3R8EA 2QWRA 4H0XB 1IG8A 1XC3A 2UYTA 3FR0A 4H0YB 5AQMA 1GLCG 1NGCA 3WXLA 4FWPA 1BA0A 1C0FA 2QM1A 4BR0A 3DJCA 4B1UB 4EAHD 5ADXH 3ULEB 1NLVA 4L3QA 1GLDG 3H46O 3LDPA 5AZIA 1K8KA 5AQPA 3C7NB 3VESA 4DCHA 2A42A 3EL2A 5AQKA 2F9WA 4EHUA 3CJ7A 3M3ZA 3VEOA 1XQSC 3H1VX 3FZLA 1CZAN 1TYQA 3TU5A 1C0GA 4H5NA 2E20A 2P9LB 4H0TB 3QFPA 2CGJA 5F1XA 5AQTA 1NBWA 3SK3A 1WOQA 4A2BA 2AP1A 1HLUA 5F2RA 2YHYA 4I6MB 2Q36A 1YUWA 5F0XA 3BF3A 1BO5O 1BWFO 4BC2A 3H1QA 1EQYA 4NO7A 1Z05A 2PBDA 3CIPA 4DHYA 5LJWA 1IJJA 4CD1A 2KHOA 4Z94A 4BC3A 3WEEA 1DEJA 3U8XA 3LM9A 4BRAA 3MK6A 3ZX2A 5AQNA 3HBTA 3IMXA 4J8FA 4JD2B 1NGGA 3U4LA 1QQNA 4FPBA 3VEXA 2IVNA 4A61A 1GLBG 1TUYA 4B1VA 2P9UA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1RT3A 4BRQA 4FLZA 1YHQN 4O8KA 4CJQA 4BR5A 1TKZA 4B8CA 3UIQA 4JKAA 1MU2A 1HRHA 3QDKA 3TANA 3Q7CA 1QZ6A 2AA4A 2VWBA 2WOMA 3ZEUB 3QB0A 4CFDA 4B1YB 4JKCA 4AF1A 1YTAA 3PO4A 1X3NA 4FL9A 3T1YK 3DRRA 4IDKA 4M3UA 3I8DA 2JLEA 1JLAA 4J2AA 3D2EB 5C0YA 4KHQA 3KHYA 4A57A 2QWQA 2WFBA 4FJGA 5AJ3K 3SUNA 2E2QA 2OA8A 2P5OA 3LP0A 4PA1A 2P9PA 3M1FA 2IVPA 5M1OA 2PZSA 4FJIA 2ZGZA 4WFAL 1U2VA 4EZ6A 3NHGA 3MXIA 1WSFA 2KQ2A 3CETA 1KQSM 3IRXA 4X66K 3ULDA 1NK5A 3HOTA 4B1WB 2HW3A 4M41A 4HUEA 1JCFA 4ID1A 4X65K 1BCMA 3FE1A 5SZTA 3QNOA 1VHXA 1VQ6N 2HVHA 1W0HA 2GBZA 2VWKA 1Q82O 4BC5A 3IG1A 3CC2N 2YX6A 4KHYA 3CJ9A 3V1QA 2VG7A 4JK8A 3L6QA 5HRSA 4JKGB 4L8RB 4FJHA 2OTLN 4JI4K 2NRVA 3I8BA 1TK0A 3U3GA 3UB5A 3OS2A 4CZKA 1ZBSA 4DSEA 2KZZA 4I9LA 3VF4A 2VGMA 3M8PA 4CEOA 4WQ4A 4DV5K 2D5RA 3O6WA 3HM9A 4YFUA 1Z26A 4FYDA 3VOVA 5IWAK 1N5YA 4AHSA 1WAFA 3MN9A 3NF9A 3CHWA 1K8AO 1S5JA 4JKFA 4MDBA 3HPHA 1VQLN 4JI3K 3CI5A 1VSJA 3R6MA 4AHVA 1Y64A 5AQVA 3LWMA 1SZ2A 4E1NA 1RBUA 2W6LA 3TARA 3S3NA 3MX5A 3AO4A 2DY4A 3VTHA 3SV4A 2X6SA 3EYZA 1EX4A 2OANA 3WEEB 1VAZA 4M3WA 3MEGA 2KLAA 4KAZA 3V81A 4DR2K 3PSFA 4JNEA 4RCHA 3CJAA 1G99A 3DLRA 5BPNA 4KB0A 4OPJA 3FZHA 3LPUA 2HNDA 4LSNA 1J6ZA 1NGDA 4GMJB 3D7EO 3CYMA 1C0TA 3TAPA 1XUPO 3CQ8A 1QVFM 4PKHA 3HP9A 1JCEA 3AVLA 4BROA 1L3TA 5C24A 2IDOA 3VQ7A 4BRHA 2HNYA 4GY2B 3QMLA 4LF5K 5HP1A 1VQON 5EU7A 3VENA 3I33A 4RW7A 4BR4A 4LF9K 4FOEA 3THWB 3K57A 4YDUC 4R79A 2ZD1A 4C23A 4KI6A 2CH5A 3RR8A 5EX5A 3LZJA 3AO2A 3D45A 1S6PA 4DV1K 4AM7A 4K43A 4E7IA 1NMNA 4RW4A 1V4TA 1MDUB 3LM2A 3VQCA 4E1JA 3ZETB 3WQTA 3L4QA 1NKBA 4OVLA 2FSNA 3PX0A 4CEQA 3MN5A 4OPAA 2F8TA 4DF4A 1CLQA 1YIJN 1ASWA 4CEBA 4NLCA 4YOWA 2ETJA 1U48A 4IWVA 3SI6A 1SAZA 1X9MA 1KVAA 2X74A 2HHQA 3L3VA 3VF2A 4RW9A 3L2RA 3DLBA 3HP6A 3OW2M 4BQZA 3C7NA 3B8AX 2VG6A 4FM1A 3R9PA 5JLFA 3NDKA 1QQOA 3OYBA 3MMVA 2FBTA 3O9RA 4BR2A 3KD1E 3AVCA 1ZC6A 3CJBA 1JLEA 1N8RO 5EVZA 3KLEA 3SBGA 1ATRA 4AHCA 4FWLA 3WNHA 2CH6A 4M7YA 4OKEA 2BTFA 4EFHA 1UWBA 1XNQK 4I6MA 2HOEA 3A5NC 3T1AA 4DR6K 3TSPA 3P38A 1RDBA 3HL8A 4O5FA 4DUYK 3DAWA 3F5TA 1IBLK 1D4XA 3HTVA 2P9NA 2P1JA 3OYEA 5M1PA 4B3TK 4YHHK 2BGGA 3AO1A 3OYAA 1VSLA 3RTVA 1NGFA 2DFHA 1S72N 4F2SA 5J2PA 3O9UA 4BREA 3CM5A 3SV3A 3AVMA 2Q0UA 3MN6A 4LSLA 5CY4A 3KTQA 2P9IA 4AM6A 3VQ4A 2O8CA 2Z1HA 2HHWA 3SMSA 1IG9A 4JEPA 3O8MA 1YJ9N 4W5NA 3A8YA 1RT2A 2IIRA 2I7NA 3KK3A 4CFAA 3S3OA 3K59A 2P9SA 3DWLA 2Q31A 5BR9A 3LWLA 1Q81O 2E5LK 3NGZA 2Q2RA 3NFAA 1X9SA 4FJNA 5M1NA 1HKGA 1WSIA 3CM6A 4QS9A 5AQLA 3WXKA 1T6DA 4CHZA 1VSIA 5KQ8A 5BR8K 3BUZB 4LF7K 5K14A 3JAMO 3EN9A 3VQ6A 2VGNA 4OX9K 2BH1A 2V7YA 4ZTFA 4YDUA 1TAUA 1S1WA 1O13A 5CYMA 3ITHA 4FWRA 1X9JA 4MLHA 2X6NA 1GLEG 4IJAA 4FVMA 1RT4A 4JAXA 2OYQA 3GG4A 5I3UA 2EWSA 5GAGP 2HVIA 4F3OA 5B8HA 1NK4A 4H5RA 4Y1CA 2E2PA 4H0PA 3OTOK 4O44A 3RSEB 4CECA 3NMUA 3VQ5A 4CVNE 4HWIA 4JK7A 1XWLA 3SPYA 3R8EA 2YNIA 5AQMA 2OPSA 3WXLA 4YOYA 4FXDA 4FWPA 4CJ3A 1EKEA 4B1UB 1JLFA 3ULEB 4TSXA 4L3QA 1NK9A 3PLAA 3VESA 2A42A 3R1XA 5HL7L 2RE2A 3EL2A 5AQKA 4AH9A 5DMRA 2F9WA 4LFAK 2O8EA 1BL3A 3CJ7A 3M3ZA 3VEOA 4FLUA 3MECA 1CZAN 3NF8A 1C0GA 2HHVA 2AJQA 3OYMA 5HRPA 3AA4A 4IG3A 4RW6A 3CG7A 4E7HA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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