3D93A

Apo human carbonic anhydrase ii bound with substrate carbon dioxide
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords carbonic anhydrase II
publication title Entrapment of carbon dioxide in the active site of carbonic anhydrase II
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 76
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2008-05-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3d93A00
2NWYA 5FLPA 5FDCA 4QJ0A 3KOKA 4QEFA 4YXOA 4E9OX 5FNJA 3U47A 1CAOA 1JCZA 5IPZA 1TB0X 3V5GA 4DZ9A 1CVFA 5EH8A 4YGJA 1CNHA 1CA3A 3KOIA 3ZP9A 3R16A 3MYQA 4MDMA 1BV3A 1IF7A 1RAZA 3S72B 4QJXA 1THKA 3L14A 5JESB 3TVOX 1G54A 2QP6A 1OKLA 3OYSA 4WR7A 1CIMA 2FOVA 3RYZA 1KOPA 4JSZA 1TEUX 1BNNA 1HEBA 3DAZA 4YYTA 3DV7A 5AMGA 5FL4A 4QSBA 3NB5A 1LG5A 1CVDA 2AX2A 2EU3A 4HU1A 5DSKA 1H9NA 4LU3A 5FL6A 1G52A 5FLRA 4IWZA 2H4NA 5E2SA 4HBAA 1G48A 3N3JA 4Q07A 4Q8YA 4LP6A 3DCSA 1CRAA 3DC9A 5BRVA 3MHLA 4Q49A 1FSNA 3N2PA 5DSQA 2WD2A 5FLTA 4RH2A 2NXSA 1H4NA 4QJWA 1ZNCA 5LMDA 4QY3A 5JG3B 4ITPA 2GEHA 3M5SA 1FQNA 2HOCA 4MO8A 4Z0QA 5BRWA 1CALA 2FOUA 5EH5A 5SZ2A 5EHWA 3T85A 4E3GA 1OKMA 3EFIA 1CILA 3KONA 1AVNA 1DCAA 4HT0A 5AMLA 3P4VA 3U45X 3M14A 4YWPA 1TG3A 1ZSBA 1CAKA 1ZSAA 1G0FA 1FR7A 4M2VA 1FQRA 3IBLA 4KNNA 1ZSCA 1RJ6A 3OIKA 5DOGA 3MWOA 4E49A 4ZWXA 3D92A 4KNJA 5SZ5A 4Z1KA 1MOOA 1HCAA 3T5ZA 3V3GB 3M96A 3M2NA 3P3HA 3HS4A 3MNAA 3MNKA 4LHIA 3ML5A 4Q8ZA 5E5RA 3MZCA 1TE3X 2ILIA 5C8IA 5JEHB 1KWRA 3S8XA 1CNKA 5L3OA 2O4ZA 5SZ7A 4FU5A 1JV0A 3NI5A 2EZ7A 2W2JA 1I9QA 1G4OA 4QK1A 5BNLA 4DZ7A 4KUWA 3F4XA 2FMZA 3M98A 5JEGB 4ILXA 5BYIA 1CCSA 3MNIA 2NN1A 5EH7A 4FPTA 4HEWA 5SZ3A 4G7AA 4KAPA 4E3HA 3P55A 4MLTA 1CCTA 5EHVA 2GD8A 1CNYA 2POWA 4R5BA 4ZWIA 5A25A 1XQ0A 1I9NA 1G0EA 2NNOA 1UGGA 5JQ0A 5G03A 3JXGA 4COQA 3HKTA 2FOSA 3RZ7A 3GZ0A 4GL1X 2VVBX 4CACA 4QIZA 1CNXA 5EOIA 1URTA 3PYKA 5BRUA 3F7UA 4QSAA 2NMXA 3OKVA 4JSWA 1CRMA 1RJ5A 1IF5A 3D8WA 4XFWA 3M40A 3F7BA 3RZ5A 2FOYA 1CNBA 5AMDA 5G0CA 4C3TA 2WD3A 4WW6A 1KWQA 4ZWZA 5DSNA 4MLXA 2F14A 3M5EA 4KV0A 4KUVA 1I8ZA 1BNVA 1KOQA 4Q6DA 1YDAA 5DSIA 1FSRA 4Q7SA 4Z1NA 4WW8A 3BETA 2POVA 1LZVA 1UGFA 5J8ZA 1F2WA 3OY0A 1IF4A 4E4AA 3RJ7A 3CZVA 3M1WA 3RGEA 1ZE8A 3IEOA 3C7PA 3MHCA 4CA2A 4PZHA 4QK2A 4CQ0A 3P3JA 3S78B 4YVYA 3S74B 1RZCA 3KWAA 5FLSA 3M04A 4Q7PA 5FNMA 2NXTA 3HKUA 5E2MA 2FOQA 2WEGA 4K0ZA 1CAJA 3MHOA 3TMJA 4RIUA 1DMYA 3MNUA 1HECA 1LG6A 4CNRA 3OILA 3PO6A 3TVNX 3KKXA 4RN4A 1CAIA 2CBEA 2FNKA 1FLJA 4RIVA 4M2UA 5DSLA 3OKUA 2HKKA 4M2RA 4HEYA 3B1BA 5SZ6A 4K13A 6CA2A 3DBUA 2X7SA 4JSAA 3V3HB 5CA2A 3S9TA 5JQTA 1CVCA 3N4BA 1RAYA 4MDGA 4K0TA 3IBIA 1TG9A 4YGFA 3M5TA 3B4FA 3K7KA 3IAIA 1BNUA 5DSPA 3S75B 3P44A 5DRSA 1CNCA 3CYUA 4FVNA 5FNIA 1I9OA 4WL4A 1HUHA 3R17B 5FNGA 5DSMA 2CBBA 1YO1A 2NNGA 2X7UA 1FQLA 1TBTX 2NWZA 5JG5B 2WEJA 1OQ5A 1TEQX 2FW4A 4KNIA 4Q87A 2FNNA 5L6KA 1A42A 1UGAA 1G45A 1AZMA 1CNJA 1IF8A 2OSFA 3MMFA 4Q7VA 4QTLA 4QK3A 1BN3A 4R59A 1KEQA 1CNWA 1BN4A 3M1QA 2NNVA 1Z97A 5JGSB 4HF3A 1FSQA 4Q90A 3U3AX 3KIGA 5E2NA 3D0NA 3ZNCA 4YGLA 4Q81A 5SZ4A 1CVEA 4TWMA 5E2RA 1XPZA 1YDBA 1YO0A 3RLDA 4Q78A 4MDLA 1XEGA 5EKJA 5E28A 2NN7A 1YDDA 2ABEA 3RG3A 3CAJA 3Q31A 1CAZA 4N0XB 3HLJA 2CBAA 4RFCA 3RYVB 3M2ZA 3S77B 4RFDA 3RG4A 4XIWA 1G6VA 1RZAA 3S71B 5FNHA 3V3IB 5A6HA 1BN1A 4WUQA 5JGTB 4X5SA 4N16A 1G4JA 4PQ7A 4QSIA 3S73B 1HCBA 3RZ8A 4RUZA 1YDCA 2NXRA 4FL7A 3T82A 1MUAA 5FL5A 1CANA 3FFPX 4E3FA 3M1KA 3VBDA 4Z1EA 1FQMA 3V7XA 1UGBA 2CA2A 3NJ9A 5FNKA 3T84A 1I90A 3S97A 4QJMA 3KS3A 3RZ0B 2VVAX 1CVHA 1G3ZA 1CAMA 2NWOA 1ZFKA 4JSSA 3HFPA 4M2WA 3U7CA 5HPJA 5E2KA 3M1JA 1TTMA 1CNGA 1V9IC 4HEZA 4KUYA 2NWPA 4BF6A 4Q08A 3BL0A 2NNSA 5JEPB 5SZ0A 3EFTA 1G1DA 2ZNCA 1ZH9A 3P5AA 3SAXA 1Z9YA 3IBUA 1DMXA 5E5UA 5G01A 1FR4A 3N0NA 4YHAA 5JDVB 3S76A 3V3JA 1T9NA 3OIMA 4ITOA 3BL1A 1CVBA 2WEOA 3M3XA 3HKQA 5DVXA 1J9WA 2CABA 2QOAA 4KNMA 1CA2A 3V3FA 2FNMA 5EKHA 1OKNA 5EZTX 4TWLA 3IGPA 3D9ZA 1I91A 1UGDA 3T83A 3K34A 3QYKA 4QJOA 2Q1BA 3M67A 3IBNA 1BZMA 5CLUA 1BICA 1CCUA 5DSRA 1LGDA 1AM6A 3OYQA 3DCCA 4BF1A 3RZ1B 2HD6A 1BNTA 5EKMA 4XE1A 4E5QA 1Y7WA 3RYYA 4G0CA 4KP5A 4YGKA 4WUPA 4Q09A 4FVOA 5SZ1A 3SBHA 5CACA 8CA2A 4QJPA 1CAHA 2CBDA 5DOHA 4QSJA 5EIJA 1RZDA 1CZMA 1IF6A 3LXEA 3P5LA 2WEHA 5FLQA 7CA2A 3FE4A 4Q6EA 3UYNA 4Q0LA 3SAPA 4YGNA 1UGEA 1BNWA 1IF9A 3MHIA 12CAA 3ML2A 2Q38A 1YO2A 5FDIA 1JD0A 1I9MA 1TH9A 4FIKA 5G0BA 3UYQA 2HL4A 3RYXB 3DVBA 3K2FA 4L5VA 3P58A 4K0SA 2X7TA 4QIYA 4ETQC 3RYJB 2OSMA 5EHEA 4Q9YA 4PYXA 4R5AA 2QO8A 3DD8A 1HEAA 4K1QA 1RZEA 2AW1A 4CNVA 3D93A 3DVCA 4ZX0A 3V2MA 3DD0A 1BNMA 3JXHC 1RZBA 4KP8A 4YXIA 4PYYA 4XIXA 3DCWA 1XEVA 1CNIA 3KLDB 1V9EA 1HUGA 5FLOA 4YX4A 4FRCA 1CINA 2EU2A 3M2XA 4E3DA 1G46A 4HT2A 3F8EA 2FMGA 3DA2A 1ZFQA 3DC3A 4Q06A 4CNXA 2POUA 4IDRX 4L5WA 3SBIA 2HFWA 1CAYA 3T5UA 4RUXA 3W6IA 5CJFA 4Q99A 3MHMA 4Y0JA 4YXUA 3PJJA 3CA2A 4L5UA 4BCWA 1BCDA 4RUYA 3KNEA 4CNWA 3W6HA 3HKNA 4ZWYA 1EOUA 1G53A 1ZGFA 2IT4A 3V2JA 3M2YA 1I9PA 9CA2A 4Q7WA 2HNCA 4JS6A 3MNHA 1HVAA 3FW3A 4Q83A 4MTYA 3MDZA 4PXXA 1UGCA 2H15A 4ZX1A 1DCBA 1LUGA 4XZ5A 1Z93A 4ZAOA 5DSOA 1BNQA 1I9LA 5FNLA 1H9QA 1CVAA 3MNJA 4UOVA 4Z1JA 2Q1QA 4Q8XA 5DSJA 3DVDA 3JXFA 2CBCA 1ZGEA 1HEDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2NWY A;  5FLP A;  5FDC A;  4QJ0 A;  3KOK A;  4QEF A;  4YXO A;  4E9O X;  5FNJ A;  3U47 A;  1CAO A;  1JCZ A;  5IPZ A;  1TB0 X;  3V5G A;  4DZ9 A;  1CVF A;  5EH8 A;  4YGJ A;  1CNH A;  1CA3 A;  3KOI A;  3ZP9 A;  3R16 A;  3MYQ A;  4MDM A;  1BV3 A;  1IF7 A;  1RAZ A;  3S72 B;  4QJX A;  1THK A;  3L14 A;  5JES B;  3TVO X;  1G54 A;  2QP6 A;  1OKL A;  3OYS A;  4WR7 A;  1CIM A;  2FOV A;  3RYZ A;  1KOP A;  4JSZ A;  1TEU X;  1BNN A;  1HEB A;  3DAZ A;  4YYT A;  3DV7 A;  5AMG A;  5FL4 A;  4QSB A;  3NB5 A;  1LG5 A;  1CVD A;  2AX2 A;  2EU3 A;  4HU1 A;  5DSK A;  1H9N A;  4LU3 A;  5FL6 A;  1G52 A;  5FLR A;  4IWZ A;  2H4N A;  5E2S A;  4HBA A;  1G48 A;  3N3J A;  4Q07 A;  4Q8Y A;  4LP6 A;  3DCS A;  1CRA A;  3DC9 A;  5BRV A;  3MHL A;  4Q49 A;  1FSN A;  3N2P A;  5DSQ A;  2WD2 A;  5FLT A;  4RH2 A;  2NXS A;  1H4N A;  4QJW A;  1ZNC A;  5LMD A;  4QY3 A;  5JG3 B;  4ITP A;  2GEH A;  3M5S A;  1FQN A;  2HOC A;  4MO8 A;  4Z0Q A;  5BRW A;  1CAL A;  2FOU A;  5EH5 A;  5SZ2 A;  5EHW A;  3T85 A;  4E3G A;  1OKM A;  3EFI A;  1CIL A; 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