3DFOA

Dihydroxyacetone phosphate schiff base and enamine intermediates in d33n mutant fructose-1,6-bisphosphate aldolase from rabbit muscle
Total Genus 140
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
140
sequence length
363
structure length
350
Chain Sequence
PHSHPALTPEQKKELSDIAHRIVAPGKGILAANESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKRCQYVTEKVLAAVYKALSDHHIYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKYSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGVTFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSSNHAY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Fructose-bisphosphate aldolase A
publication title Charge stabilization and entropy reduction of central lysine residues in fructose-bisphosphate aldolase
pubmed doi rcsb
source organism Oryctolagus cuniculus
total genus 140
structure length 350
sequence length 363
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2008-06-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00274 Glycolytic Fructose-bisphosphate aldolase class-I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3dfoA00
3AO0A 2VKZG 4UC5A 1KV8A 4M6VA 3S8HA 1P4CA 2GQ9A 1N8FA 1KM0A 1GG1A 4LNYA 2E09A 3KXQA 4OGZA 3O63A 3B4UA 1MO0A 2BTMA 1ALDA 4UTLA 2NV1A 2Q3RA 1FWTA 1RD5A 2FPVA 5CGQA 4L4LA 2ZYFA 3NPUA 3B03A 3QPYA 1T99A 3W84A 1WOBA 2CFFA 7TIMA 3CT7A 1W54A 3ANYA 1YPFA 3PBWA 1K03A 4N9CA 4QISA 3W23A 3HBLA 1RQHA 4CCDA 4DPPA 4O17A 3NQVA 2WOQA 4MY9A 1VPXA 1LORA 3IVTA 2J9ZA 4WD0A 1VR6A 4YWIA 3LCLA 4LWWA 2YYTA 2TPSA 1OX5A 3ZWTA 1OF8A 3HG2A 2H3BA 1LRTA 3AJXA 4U4MA 2NWRA 3SR7A 4AAJA 4G1KA 2JKAA 4RXFA 2G96A 3QMTA 4AHPA 2WQPA 3A21A 5ABTA 1Q6OA 1TJPA 3CM4A 3L2IA 5AYZA 1PS9A 3DZ1A 1XXXA 4IX0A 4PEKA 3M9YA 1VZWA 3R8RA 3FJLA 4JTSA 3L5MA 4JIQA 1TV8A 1JCJA 2HS6A 1YXDA 3R2GA 5HNRA 2Y61A 4UNKA 4MZ1A 1TREA 1FXPA 3E0IA 3PG9A 4E2DA 5I3HA 1GEQA 3L0GA 5HWNA 4ONVA 1S3HA 3N2MA 1S5WA 1W5PA 4UTWC 1I2NA 4IPIA 4OBTA 1D3GA 2DJLA 4MYAA 2Z6JA 4O28A 3BARA 4LY8A 3HF3A 2VEMA 2ALDA 1SSGA 3A22A 3W2LA 5KSWA 2YCEA 3MBFA 3FEMA 2V2CA 2WV8A 5IM51 5LNRA 2ISVA 3LOTA 2PRMA 1FDYA 4DBDA 1ICQA 1IIGA 3PULA 3BW4A 3HG4A 2GJLA 1LOLA 1TQXA 2R8WA 3S5NA 2EF9A 3BLEA 2NZLA 3W7IA 4O16A 3L5LA 3NG3A 3SECA 1SR9A 3LV5A 5G1TA 3STFA 3S1UA 1TPC1 3LERA 3FS2A 4MZYA 3W7RA 3DFPA 3UYCA 1FCQA 2RKXA 4BWLA 4OE7A 3SY5A 4UTIA 3Q2DA 1TPB1 4CQ9A 4U28A 2FFCA 3BW2A 4P61A 4FX7A 1DQXA 1QDSA 2J24A 4DF0A 1RVGA 5HR6A 2NWSA 4TX9A 5F4XA 5LZLA 4K7VA 1AG1O 3W7MA 4O15A 4AVFA 4DELA 1T8XA 1H7OA 2BSLA 1GJPA 1YTDA 1KM5A 3S1XA 4GJ1A 3TSDA 2CLLA 1TMHA 4AHQA 4Q4KA 2A85A 1LRNA 1YDNA 1P1XA 2FTPA 3CQ0A 3NM3A 2QF7A 5D2XA 4IJBA 3H53A 1WV2A 4EVZA 4Q33A 2WSRA 3TMQA 1XBYA 3E96A 4TO8A 1DJNA 1KFJA 3NL6A 4AWUA 3GX9A 2A6NA 3IEBA 2J88A 4ZZ9A 1F5ZA 2X1TA 3DH7A 4QIUA 3FFSA 5LGXA 1FWWA 2G5WA 3W7GA 1JUEA 1JQVA 1SFLA 4IXXA 5FEXA 5LGZA 4POCA 3LRLA 1LM1A 1V5XA 3M5VA 4LVBA 2OJPA 3H54A 3LCFA 4O19A 3M5ZA 4LVFA 5U4NA 3N73A 2EKCA 3EWZA 2QCMA 5F2LA 4TMCA 1I4NA 1E51A 4A22A 1QOPA 1KFBA 1QPQA 1K8ZA 4XKYA 3R89A 4AWTA 3HQ1A 5D09A 1Q6QA 2E1DA 4LVAA 1XCFA 4O12A 3SSJA 1X7FA 1YTKA 4JTLA 3NQ8A 1QMLA 3NPXA 4UMAA 2AGKA 3W2UA 4TIMA 3KOFA 4C1LA 4JY8A 4ZQRA 3RF9A 4BI5A 4C1KA 4RZ5A 2ZZ7A 2DZVA 5F4WA 2QCGA 1SUXA 3JRKA 3LCHA 2I1OA 5D2WA 4M7TA 4JR5A 3PVFA 1IXQA 4DEFA 1KLZA 1KA9F 4HNTA 4PFMA 3W70A 2Q3OA 2E77A 1YLVA 3QJAA 3DBPA 4ML9A 2DZTA 2I14A 2Y7DA 1YADA 3M16A 3MYOA 1VCGA 5I3GA 3W7HA 2B7PA 5FF2A 2GVGA 3QSTA 3NQ2A 3N19B 5D05A 1WOAA 2DZPA 2X30A 1HFBA 1XKYA 4ORMA 5BOOA 3EEGA 4M5PA 1R2TA 4A2SA 5DBTA 4D2JA 3EXRA 4LTSA 4TU1A 5EMUA 3MP4A 3P8IA 4Z0JA 3WK1A 4I7UA 5CSRA 3NQDA 3WK3A 2FDSA 1DJQA 4NNAA 3W74A 2ISWA 1NF7A 4OV9A 3NZRA 3TW6A 3WFAA 2QUVA 3TW7A 3NVTA 1Z42A 4W9TA 4JYFA 1L9WA 2C19A 5D38A 1KLYA 2C6QA 2QJGA 1HG3A 1W5OA 3F4WA 4FNSA 3BVJA 3FYPA 1I8JA 4NJIA 4LC8A 1XUUA 4ADSA 1U5JA 2AAMA 2H8XA 2V82A 1TPEA 2EGZA 1C29A 3CTLA 1G4SA 2Y7GA 3C52A 3JR2A 3NL5A 1YDVA 1VJIA 2B4GA 5C5YA 5IBXA 4A29A 3RNDA 1A5AA 2WSQA 4DF1A 1P5BA 3F4NA 3A24A 3KX6A 3BGGA 3N9RA 4P2VA 5AB3A 3KVMA 3BW3A 1Z44A 4AWSA 2VEIA 3LX9A 4M6PA 1JCYA 3C3NA 3L67A 4JN6A 4ORIA 5HJLA 3M41A 3LBCA 4WY0A 1MXSA 3U2OA 5TIMA 4UTTC 1Q6LA 1UCWA 1I2QA 1A5SA 1B4EA 3LHTA 4O1DA 4DO5A 3S1WA 1K02A 5CZTA 2A6LA 5MHBA 4LW7A 1W3NA 3YPIA 4JTIA 4ICNA 1I2RA 4HNVA 2DJXA 1LTDA 1JRCA 4AHOA 3NQ6A 2O7QA 1P0NA 3IIPA 2CLHA 3N34A 3TXZA 4N4PA 1DVJA 2PRLA 2EAWA 3M6YA 2BLEA 2ZRYA 3NQMA 5HUOA 3P67A 4O53A 3QQ1A 3UXAA 5FEWA 1LP6A 1HO1A 3NQ7A 4JX5A 3MHFA 3W7PA 2ZZ4A 4NNBA 3C6CA 5CPMA 1JULA 3HB9A 3EWBX 2R14A 3RLVA 4JTFA 3F1QA 5FI8A 3WK0A 1W31A 4DXVA 1QFEA 1G7VA 5D33A 4OV4A 3NEVA 2OT1A 3TX9A 3STCA 5HUPA 3CLMA 3W75A 4HN4A 1V7YA 3MP5A 3M5YA 1H60A 3IIXA 4O1BA 4AB4A 1KFLA 1GVFA 1H7NA 3HGOA 3LI0A 2B7NA 3W1QA 4MY1A 3UWZA 3QFEA 2QUTA 2ZTKA 1XBXA 3KVKA 4LC6A 3PBVA 4K6AA 5J5RA 4WXYA 1H51A 1TPFA 1EP3A 3LTSA 5K9DA 1EUNA 3NL3A 3VE7A 2O7SA 4I7VA 4LV9A 5AOUA 5KZDA 1W3IA 1EA0A 1VLIA 5FF7A 3B05A 4HIBA 4KFNA 1XUZA 5F2IA 3EX1A 2YX0A 1GPWA 2Z1BA 3UWYA 3CIXA 1W8SA 1TV7A 1FCVA 4YLWA 2NUWA 4IXHA 1PHQA 3W2JA 3CHVA 1CI1A 1YXYA 3HGRA 3TQVA 1G7UA 4KWWA 3IIZA 4DF2A 2CWNA 3QF0A 2RFGA 1YDOA 5GVJA 1PHWA 2WPBA 1SSDA 1F73A 3G24A 1LBMA 4JX4A 1ZFJA 3OA3A 5AC6A 3G1YA 2VFDA 5HR7A 2CLOA 2X1RA 3W1NA 2ISSA 1Z48A 4O14A 1JUBA 4UNLA 1K3UA 3QM3A 1MEIA 2B7OA 2PURA 3G1AA 4FHAA 4QITA 4K7YA 3GZ3A 3TK7A 1SW7A 2V30A 1LZOA 3TAKA 3IVUA 2C1HA 3UQNA 4JTEA 4NZFA 3N9SA 2ZBTA 3LTYA 3C8FA 4Y9AA 4UR7A 4H6KA 3PUDA 4WOQA 5CSSA 1TPUA 2ZZ5A 3H55A 1OX6A 1G69A 2ZZ6A 1VYPX 3L0KA 3GDMA 5AC7A 2P0OA 1AW2A 3S1VA 1ONRA 1LROA 1YPIA 4CNOA 3ABSA 3GDTA 2ZRVA 3LXBA 2VFHA 1VCFA 3NPWA 2GQ8A 3PS7A 5AHLA 3KRUA 1GT8A 3B0PA 3QW4B 3VI2A 5KZEA 3ELFA 3LTPA 2WNNA 3PSVA 1G4TA 1VQTA 1LLWA 4MPQA 5A8GA 2Z0IA 1FCUA 3B8DA 3O8AA 4IOTA 2FPYA 1O4UA 2V81A 4YCOA 2Q8ZA 3UY8A 3P7YA 1R30A 1GVOA 2F84A 3SW6A 2VELA 4MJMA 2ZA3A 3GDKA 1KBIA 3E12A 3LCGA 3ZFHA 4M19A 1G6CA 1H61A 4LVGA 4RZ6A 1OYAA 3CEPA 3DFNA 3W1XA 2C18A 4ZQPA 5F2MA 3HG5A 1N7KA 3DU0A 3Q58A 2CLFA 1X6UA 1A50A 5U7SA 2QCLA 3A9IA 3SFKA 2H8ZA 4DPQA 3LRMA 1GQNA 3Q94A 2W0UA 1W5NA 1T96A 4O18A 5C2XA 5I3KA 4MZ8A 3LCIA 3W86A 3LB0A 4O0ZA 3CB8A 3I7QA 1QPRA 1EUAA 3W1LA 3W7JA 3RFAA 3P5YA 1DBTA 1F6PA 1H5YA 4HKPA 4NT0A 1KTNA 5DLCA 1AL8A 3L0NA 3EWWA 3FIGA 1MSSA 3EWYA 4EF9A 2NXIA 2VFEA 2CZFA 1M5WA 3G0XA 5AFDA 5LNWA 3TSMA 1F7BA 2A7NA 1KM1A 2GVJA 4HSOA 3HIJA 3OG3A 3DKLA 3KHJA 1OYBA 5DBUA 1TIMA 1FUYA 1RPXA 3IRDA 4UFLA 3ABQA 3W83A 1DL3A 1KTBA 3MHGA 2H90A 4FX8A 4WZHA 1JVNA 2A4AA 4XTIA 4NU7A 3W2MA 3G22A 3I65A 4XQ6A 3TH6A 4CQ8A 1ME8A 3MMTA 3L65A 1TRDA 4BF9A 4HSNA 3VFLA 1H7RA 3W2NA 2QCHA 3W1UA 2QAFA 1N55A 4FXSA 3OHIA 3G1HA 1F74A 1UUMA 1W0MA 3FJ6A 3C2VA 1L6WA 2G97A 4NQ1A 2VOMA 1X1ZA 4EIVA 4WQ6A 3BGJA 5J5DA 1WQ5A 2Y88A 4BK9A 4GBUA 3TCEA 3S5OA 2WJZA 3EX6A 2NXHA 2ZZ3A 3STGA 4O50A 2W79A 4JTGA 4XZ9A 3MWAA 4AF0A 4XKYB 1MEHA 4S2BA 3IVSA 4ZQCA 3PWAA 3TSBA 3GR8A 3CIWA 2PRHA 3PC0A 3BPWA 3BG9A 3T78A 3V1PA 2FLIA 4UTWA 4Z0SA 3HGJA 1EB3A 3KVJA 1UUOA 3W71A 1PIIA 5K2ZA 2J9XA 3C0JA 2EHHA 4TR9A 3C56A 3M44A 2JK2A 4O0KA 2GPTA 4Y90A 4YCPA 3W7KA 1F05A 4Q32A 4MOZA 5L6UA 1L6SA 4BR1A 4BI6A 4UTUA 4L4MA 3ATYA 1J5TA 3DFTA 4HPXA 4X22A 5K9CA 5FF3A 4ZQMA 1ZY9A 2A2IA 3T4CA 1LLZA 2BWGA 1TPWA 4JYDA 3MHUA 1YXCA 1PE1A 1C8VA 4MKNA 1RZMA 3G3DA 5E93A 3NZ1A 3QMSA 2YPIA 2CZEA 4H4IA 4RJEA 3EKLA 4M7SA 1ME7A 1TPVA 4O54A 2Z2UA 2OX1A 3UWVA 2ABAA 5HWJA 4LUIA 4CCCA 2NX3A 4PL1A 1QWGA 2R91A 3U8GA 4O57A 2E6FA 1VYRA 3MBDA 2XN1A 3S5YA 2Y7EA 4Z1AA 1OFEA 1ZALA 2OCZA 5G2WA 2TMDA 3UNDA 3WJSA 5CZJA 3LLFA 3OVPA 4AMAA 3C61A 1Y0EA 1DORA 4IQLA 3HMJG 5CZ0A 4LS1A 3I6RA 3QEZA 5AHFA 1XI3A 1NFBA 5K4ZA 4FX6M 2Y63A 3OBKA 4DQWA 3B04A 4IMGA 1DHPA 4K39A 3N2XA 1SPQA 1GYNA 2E5DA 3GKFA 1FQ0A 2QDHA 3UD6A 1OX4A 3UXDA 4UCGA 2W6RA 1FXQA 2FB3A 1QR7A 3TE9A 1ML1A 3TKFA 5KZMA 1DQWA 5H91A 1W56A 1YTEA 3JS3A 4NXSA 3Q37A 3U6WA 3W73A 3VKJA 3NQAA 5EA9A 3EB2A 3IV3A 1VH7A 1NVMA 2C13A 1PV8A 3UZJA 2C0AA 1H7XA 4WY0B 1GVSA 3LHWA 3P74A 1TQJA 2RDUA 5AHNA 3PBUA 2Y89A 1K7FA 3MP3A 4GFSA 3OIXA 3EX4A 2QCCA 3A5VA 3NQGA 5T26A 2A7RA 2ZRZA 1AMKA 5AHEA 1H50A 2IQTA 3GB6A 1LDCA 3P8JA 5AYYA 3G1DA 4IUOA 5G4EA 4UTJA 2I9EA 1GZGA 1SW3A 4GUIA 1J2WA 1SFJA 2QJIA 3CPRA 3EWXA 3GYEA 3IGSA 3MYPA 2XFWA 1EWEA 5BRBA 4UMCA 3VCRA 4CLMA 4RV8A 3GAYA 1OABA 4JTJA 4GNJA 3TXVA 2LLEA 3EKZA 3IGXA 3QSRA 4CNNA 4EOUA 4CQAA 1C9DA 4FIQA 1JCNA 1SZNA 4IMFA 4JDBA 5TBOA 4NUWA 4FO4A 4UTHA 3NPVA 3A5FA 4GE8A 3ZR4A 3NQCA 4RK8A 5FEZA 5I3FA 1AW5A 4IMEA 4PODA 1CX9A 4PCFA 1P0KA 4UTKA 3GXTA 3MI6A 4JICA 3C2OA 3CEUA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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