3DKLA

Crystal structure of phosphorylated mimic form of human nampt complexed with benzamide and phosphoribosyl pyrophosphate
Total Genus 169
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
169
sequence length
476
structure length
464
Chain Sequence
FNILLATDSYKVTHYKQYPPNTSKVYSYFECREYEETVFYGLQYILNKYLKGKVVTKEKIQEAKDVYKEHFQDDVFNEKGWNYILEKYDGHLPIEIKAVPEGFVIPRGNVLFTVENTDPECYWLTNWIETILVQSWYPITVATNSREQKKILAKYLLETSGNLDGLEYKLHDFGYRGVSSQETAGIGASAHLVNFKGTDTVAGLALIKKYYGTKDPVPGYSVPAAEHSTITAWGKDHEKDAFEHIVTQFSSVPVSVVSDSYDIYNACEKIWGEDLRHLIVSRSTQAPLIIRPDSGNPLDTVLKVLEILGKKFPVTENSKGYKLLPPYLRVIQGDGVDINTLQEIVEGMKQKMWSIENIAFGSGGGLLQKLTRDLLNCSFKCSYVVTNGLGINVFKDPVADPNKRSKKGRLSLHRTPAGNFVTLEEGKGDLEEYGQDLLHTVFKNGKVTKSYSFDEIRKNAQLNI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
molecule keywords Nicotinamide phosphoribosyltransferase
publication title A phosphoenzyme mimic, overlapping catalytic sites and reaction coordinate motion for human NAMPT.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 169
structure length 464
sequence length 476
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.2.12: Nicotinamide phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2008-06-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04095 NAPRTase Nicotinate phosphoribosyltransferase (NAPRTase) family
A PF18127 DUF5598 Domain of unknown function (DUF5598)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3dklA02
5DXYA 3LCWA 4NZJA 2Y63A 4NU7A 3WJSA 3W1AA 4LS1A 4IXHA 2A7RA 4WD0A 3QSRA 1XBXA 4DPQA 2W0UA 1TTIA 1VLWA 3M9YA 2WSYA 3TC6A 7TIMA 3O05A 1NSJA 1OFOA 3CT7A 3EX1A 2QCGA 2Z0IA 3FYOA 1SFLA 3VI2A 4JTFA 3I7SA 2TRSA 2YW3A 3NZ1A 4NVTA 3EX6A 1B3OA 3STFA 4DO6A 5AFDA 1WA3A 4AVFA 3I7RA 4BI6A 1E51A 2B4GA 3BO9A 3LRLA 4PL2A 3CPRA 2ATSA 3BLIA 2ZFAA 1F7BA 1YPIA 1W5PA 3M44A 5K9XA 3TJXA 1LRQA 3RK8A 4ZVJA 2ZA3A 3C8FA 1QPRA 2ZA1A 1VCGA 3O6DA 4O0ZA 2I14A 5HINA 2DP3A 3S5YA 3L2IA 5K4XA 5LNRA 1ICQA 4MYAA 4PEKA 4X3ZA 3PR2A 1OX5A 3DZ1A 1IXNA 3PUEA 4AWSA 3DBPA 3HQ1A 3MI3A 4R53A 4RV8A 5EY5A 2C3ZA 4AHQA 4O57A 1QWGA 5D38A 5L6UA 1EX5A 3PM6A 1W1ZA 3C2RA 3W72A 1GPWA 2NX3A 2Q8ZA 1LBMA 2ABBA 3W86A 3LX9A 3NL5A 3W2NA 5SWUA 4O28A 1RQBA 1XCFA 2QAFA 2H90A 1SW7A 1GVOA 3BK0A 1PHQA 4BWLA 2A7NA 3P84A 1H1YA 2V8ZA 3M43A 3W7QA 3MP3A 1W5OA 3QQ1A 1LOLA 3CIWA 1P0NA 4NJJA 5DCBA 3AO0A 3FEMA 3B03A 4RX0A 3LXAA 3MP4A 1TV7A 1ZAIA 2ZRUA 1GVQA 3W2KA 5G2HA 1AG1O 3UPBA 4Y9AA 1GTHA 5G1YA 3BV4A 5D04C 3C4UA 3GZ3A 4WOZA 3P62A 3MMTA 4JTIA 5F2IA 1ICPA 1PCKA 3IGXA 3G1SA 1F05A 1FDYA 4WZHA 3UXDA 1A5SA 2XN0A 3LBCA 3WK2A 4JR5A 1G4PA 4M6QA 4O18A 4ORIA 4OV4A 3NYZA 1ME8A 4B5NA 1VYSX 3FYPA 3U2OA 3I68A 4CLMA 3BARA 4P2VA 3H55A 4IX2A 4NT0A 4FHAA 4MVAA 3M0ZA 4G1KA 4FX8A 3JS3A 2DZPA 3P8IA 1XM3A 1KV8A 3F03K 4O19A 3GYEA 3LCFA 4GUHA 2C19A 1JQVA 3M16A 3NQ7A 1RQHA 3HPSA 1H7OA 4JICA 1K8ZA 2FB3A 3C3NA 1TCDA 2Y7FA 4LOCA 3TDFA 4UCGA 3O6YX 3G1VA 3FFSA 3ZWTA 1JCXA 3ZS4A 3MW7A 5HR6A 1FDZA 1CX9A 3A5VA 3N73A 4JS3A 1Z41A 3IIXA 3HPXA 4UTMA 4LY8A 2GQ8A 1UBSA 2FB2A 4HNUA 4XZ9A 2NWRA 5D02A 2QCDB 3S6DA 3CB8A 2E77A 2YR1A 4CNPA 4IMFA 2V2HA 4JYEA 1A5BA 5K2ZA 3WJWA 3NAVA 1SSGA 2ZYFA 3SJ3A 2I1OA 3CWNA 4X22A 1W5MA 1QPQA 2WNQA 1WXJA 2PURA 3TXVA 4HNNA 2G95A 5K9CA 1A53A 5KSWA 3C6CA 5CZTA 1WYIA 3A23A 4FIRA 3G1HA 1VCFA 3B4UA 3DI0A 3W7NA 4ONVA 4ADTA 4Z1BA 1R2RA 1JUKA 1M6JA 5G4EA 4UTLA 2C18A 4BWLC 3E12A 1R2SA 1IF2A 3CWOX 4O10A 2A6LA 4IX0A 1DQXA 2CLIA 1LBLA 1QAPA 5IBXA 3I7QA 4FX6M 1L6WA 4O1BA 5FI8A 3GKFA 3W1UA 4UFJA 1XXXA 4MZYA 3T78A 3QF0A 3VKJA 1K7XA 3S5OA 3P61A 3PS7A 1VJIA 3KRUA 3L9CA 4NJKA 1TPWA 3NQFA 3DKJA 3G8RA 5IM51 1QDSA 2GQ9A 2ZRXA 3LCXA 3LXCA 4QNEA 2DZUA 2NWSA 1K02A 3NPWA 2PE4A 3NQAA 4ADUA 1OJXA 1X8FA 4LV9A 2VFGA 3RLVA 3N19B 4DF2A 4EF8A 1XI3A 2YSWA 3FS2A 3Q2DA 5BRBA 1Y0EA 3TUUA 1O60A 1R46A 3D0CA 1D3HA 5G1TA 2V0TA 1SZEA 1XL9A 4LRTA 4PFMA 2CLOA 2X1SA 1TJPA 1OX6A 3E9AA 1PV8A 2QCMA 1YYAA 4UR7A 3K30A 1SW3A 1N8FA 1TREA 5D2TA 4R7JA 3S9YA 2WJZA 2Z6IA 4Y96A 2DJXA 3FLUA 2YGYA 4JYFA 1GJPA 1MEIA 3ANYA 3WK1A 3FKRA 4IXXA 4ZZ9A 1TQJA 3CIXA 1JCNA 2OJPA 4FB7A 3LBMA 2YXGA 3GLCA 5C55A 3THQA 4RXGA 5G5IA 4E2BA 5AHMA 5FEZA 3QW4B 4LC6A 3R8RA 4Z1AA 4DXVA 8TIMA 2YPIA 1Q6QA 3P82A 2LLEA 2C6QA 4ZQPA 2RHGA 4LUIA 4CQ8A 2Y62A 4BK9A 5F4WA 2Y85A 4QISA 1ZJIA 3O1NA 3GNDA 4K38A 2FIQA 2CFFA 2XN2A 3R2GA 2RDTA 4IPJA 3M5XA 4O15A 5AC8A 3SSJA 3PULA 3EWZA 3QC3A 4Z1DA 3UPWA 1OK6A 1M5WA 3A5FA 1HL2A 5F2GA 4MZ8A 1GVRA 4XKYB 4O8RA 1FWSA 1LP6A 2B7NA 3UY7A 3TQKA 5K7JA 2FPYA 3MUXA 4FNSA 3QQ0A 3DU0A 5D30A 1HTIA 2ZBTA 1TIMA 3N2MA 3W1XA 3LCGA 3G18A 2NV2A 5LSMA 4UTKA 4PODA 3KVKA 4NX0A 3S5NA 2JGQA 4X2RA 3VFLA 2QCCA 2Y70A 2YDAA 2H8XA 5KINA 3ELFA 3A21A 2VFEA 3ABSA 3GVGA 2ABAA 1S5TA 5AHEA 2W79A 5LNUA 1OG0A 4N6FA 3TAOA 3MP5A 4MFDA 5EYWA 5F4XA 5H2ZA 1LZOA 3NZRA 3O07A 4PA8A 2VC6A 3W7EA 2QDGA 5EMUA 1EIXA 1Q3NA 1X7FA 3UWVA 4ZL1A 2Q3OA 3H53A 4KFPA 5IBXC 3PB0A 1W5NA 5LNSA 1WOBA 1G67A 1VRDA 1YXYA 4QITA 5AC7A 3W1QA 4DBDA 2WO5A 4E0CA 4OHQA 1PCWA 5TQLA 2P0OA 5AC6A 3IGSA 3P80A 4JDYA 1VGAA 4M19A 3FIGA 3QMSA 3RNDA 1F2JA 3MHGA 1W56A 1QO2A 1YLVA 1CW2A 1ME9A 3GX9A 3BGJA 4AMAA 1WOAA 4NUWA 3G24A 4JTSA 1X6UA 1FCUA 1H1ZA 4FIQA 3W7RA 1FCQA 4HSOA 5D2XA 2P10A 4S2CA 3RF9A 3DHDA 1XDLA 3STCA 2QKFA 2XFWA 1THFD 4LW7A 1OFQA 4M6PA 2B7QA 4WQ6A 3QJAA 4BI7A 4O16A 4C1KA 1HO4A 5AN7A 1KM2A 3P5ZA 5EBUA 2XN1A 2J24A 4LNYA 3LTSA 3C52A 3EB2A 2G97A 4NXSA 3W07A 3T44A 3HG5A 4AF0B 3PVFA 3PSVA 5CGQA 3GDRA 1H50A 5DBTA 1WBJA 1H7XA 3OBKA 3E02A 1KBIA 4W9TA 4ML9A 1YDVA 2J9XA 5CKSA 3IIPA 2E6DA 3W87A 4JY8A 4OT7A 2A6NA 4EIVA 1BWLA 1K3UA 2QCLA 3E96A 4RK8A 2VEMA 2JKPA 4YMZA 2TMDA 3UY8A 2QCDA 2QCEA 3N9RA 1O5KA 2C16A 2RH9A 4JIQA 2GVLA 1GG0A 3SR7A 1FXQA 1N55A 5HMSA 4AB4A 4RCXA 1VYPX 3C0JA 1W37A 3NQDA 3W7OA 1R30A 1FY6A 3G0XA 4O50A 4WY0F 1XUUA 4NQ1A 1DBTA 2V9DA 5LNVA 2Q3RA 3OVRA 3W1MA 4IPIA 2WSQA 1GTEA 4LVGA 4N9CA 5E93A 3NNTA 3KAOA 3IVSA 4K6AA 4EVZA 1ZHAA 5A5WA 2P1FA 1OABA 5DXXA 3W9ZA 3SGZA 1TTQA 2E68A 1LDCA 1DVJA 3NM3A 3HGSA 4H4IA 1GWJA 2BTMA 5C54A 1QMLA 1GYLA 2EGZA 2YYTA 1O4UA 2YZRA 4FNPA 3M41A 1JCYA 5D09A 3W88A 1W3NA 4M6VA 2QUUA 2GUUA 2YW4A 1KA9F 1SPQA 1SZNA 5BMWA 5A8GA 2A2IA 4HN4A 5AHFA 1MSSA 3L21A 5K4ZA 1TV5A 5FF2A 5GVJA 1P4CA 1VC4A 3W7HA 4D2JA 4JX5A 1GT8A 3USBA 3QZEA 1W31A 1H61A 1ZNNA 4U4MA 3U8GA 2DZWA 3W1PA 2BWGA 4QQ3A 3TR2A 4JXCA 4UFLA 2PRLA 1OX4B 2NUXA 4U28A 1MZHA 1EUNA 3DFQA 1I2NA 4JGDA 3DHFA 4ALDA 1EEPA 3PG9A 4QAIA 4UFMA 2FPVA 2Y6ZA 3PC0A 1VHNA 3GR8A 1MXSA 3HMJG 3UD6A 2I9EA 5L9FA 3EEGA 3P67A 1XC4A 3OHIA 3B0VC 5CPNA 1PS9A 2NUYA 4GNJA 5D05A 1W5QA 5ABTA 3TFCA 1XFBA 5BMXA 3QPZA 2Q8LA 2JBMA 4OQVA 3B05A 3QMTA 4DO4A 3G1FA 1C29A 4KFOA 3NA8A 4MKNA 2DORA 3PAJA 2GOUA 3GXTA 2NX9A 3S1UA 2FQIA 4WOQA 1LCOA 3S8HA 4WXZA 1Q45A 4UTIA 3EWXA 3T7VA 1CI1A 3S5ZA 2CLFA 3NQ2A 5T26A 4RKAA 4XKYA 1OFDA 3L0GA 1H7PA 3T40A 2Y7DA 2TYSA 4KFNA 3W71A 1H63A 4AAJA 4MY9A 3GXNA 1XBYA 1Z42A 2YCEA 5LGXA 2VEKA 2UV8G 4ADSA 1LRNA 3DFPA 3LHWA 4K37A 2E09A 1WQ5A 4UC5A 4NNBA 1FDJA 2E6FA 2C14A 1FCBA 4PL1A 1TPEA 1XDMA 1OFPA 3W7KA 2ISWA 1OVDA 4XBKA 2GJNA 3LRKA 4R34A 1P5BA 1SW0A 3P74A 1VLIA 1OFAA 1VYRA 3M5YA 3MBFA 2CZFA 4RZ4A 3LHUA 3PY2A 2DZTA 5CPLA 1H62A 5FF3A 4UTTA 2ZTKA 1L6SA 3STGA 4O12A 4N6EA 3H54A 1GZGA 3W2MA 1OK4A 5J5RA 1RVGA 3OVQA 3L65A 1H60A 1Z44A 1JCMP 1TRIA 2EKCA 3DAQA 3GDLA 4FXSA 3LERA 4O4VA 1K7FA 1KTCA 2R8WA 3W2UA 2GVJA 3F4WA 4FXRA 1JUBA 1B4EA 4EOUA 1DV7A 4NJGA 5G4WA 2CLHA 4ZQMA 2VFHA 4A22A 2H6RA 4DBEA 4OV9A 3NL3A 4A21A 1KV5A 4LU0A 1G7VA 1W3IA 2ATMA 3NPVA 3ZFHA 4LRSA 2B7OA 1I8JA 3SIZA 3S0CA 1NVMA 4K39A 3LV6A 2C15A 2CLEA 4MY8A 2V82A 4AF0A 2AGKA 4RJEA 1AK5A 3LHYA 5I3JA 1KFCA 5F2MA 3A9IA 5CPMA 5AHNA 5HNRA 5LGZA 3T55A 2QJGA 3BLEA 3WK0A 1TV8A 1H51A 2J27A 4IGHA 3I6RA 2ZA2A 1G7UA 3F1QA 2IQTA 5HR7A 1A50A 1B4KA 4E2DA 5TIMA 1KFJA 1JULA 2WNNA 3W7LA 2CLKA 3G0SA 1KFEA 4K7YA 2VEIA 2V2CA 3FKKA 5HUPA 3SZ8A 4K36A 1ZY9A 4YCPA 2E1DA 3GK0A 2X16A 3LCIA 3NQEA 5C6MA 5D2VA 2FTPA 1U5JA 3R5EA 1ICSA 1C8VA 1JR1A 2C0AA 4IJBA 3S1VA 3RLUA 1J4EA 2A5HA 3TV8A 4L4LA 1BWKA 3O15A 3SGUA 4YWIA 4PTNA 1JCLA 5LZLA 3B0UX 1EWEA 1I45A 3A24A 2V30A 2RKXA 1JRBA 4HPXA 1R2TA 6ALDA 3GDMA 4GJ1A 5CSSA 3DXIA 4JTJA 1JUEA 3W70A 3HBLA 3W3OA 3TMLA 2H8ZA 3R13A 1TTJA 3NG3A 1SZGA 5F1VA 3W7IA 5D03A 1HG3A 1ML1A 3C2VA 4HSNA 2EAWA 4UTTC 1I4NA 4MUZA 3ZR4A 3NM1A 5DY2A 3CTLA 5D32A 3GIYA 1EP2A 2RDWA 1S5WA 1LORA 1L9WA 1QO5A 1BKSA 5CSRA 4IWWA 2VFDA 3QPYA 4Z0SA 4OGZA 1RZMA 3LTYA 1VH7A 1AMKA 2NZLA 5AYXA 4O14A 1W0MA 2E5BA 1L2UA 1WBHA 1OX4A 4RZ5A 3C2EA 3V75A 1K8XA 1JJKA 5F4SA 3BG9A 3B06A 4S1FA 1FWRA 2WKJA 3AJXA 3KFTA 4XTDA 2F7FA 3LOTA 3W7JA 3LGEA 2H3BA 1UCWA 5FEPA 3FJ6A 2FLIA 3LCLA 2E6AA 1PIIA 1DJQA 4AHOA 3BPWA 4QIUA 1ZAHA 3IRDA 1T0OA 4IMCA 1EA0A 2DZVA 1DQWA 3WJYA 3L5LA 2E6YA 4HHPA 1T8XA 2ZRZA 2FJKA 1H7WA 3TXZA 1ADOA 1LYXA 4GE8A 3NO5A 4O11A 1ZAJA 1PHWA 3MHFA 4MFEA 4JX6A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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