3DM0A

Maltose binding protein fusion with rack1 from a. thaliana
Total Genus 213
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
213
sequence length
691
structure length
675
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPAAAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSAVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDAALAAAQTNAAAGLVLKGTMRAHTDMVTAIATPIDNADIIVSASRDKSIILWKLTKDDKAYGVAQRRLTGHSHFVEDVVLSSDGQFALSGSWDGELRLWDLAAGVSTRRFVGHTKDVLSVAFSLDNRQIVSASRDRTIKLWNTLGECKYTISEGGEGHRDWVSCVRFSPNTLQPTIVSASWDKTVKVWNLSNCKLRSTLAGHTGYVSTVAVSPDGSLCASGGKDGVVLLWDLAEGKKLYSLEANSVIHALCFSPNRYWLCAATEHGIKIWDLESKSIVEDLKVDLKKVIYCTSLNWSADGSTLFSGYTDGVIRVWGI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Sugar binding protein,signaling protein
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein fused with RACK1
publication title Structure of a signal transduction regulator, RACK1, from Arabidopsis thaliana.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 213
structure length 675
sequence length 691
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-06-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00400 WD40 WD domain, G-beta repeat
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.130.10.10 Mainly Beta 7 Propeller Methylamine Dehydrogenase; Chain H YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase 3dm0A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3dm0A01
2HYEA 4YAHX 1LAHE 2AQ5A 5HE2B 3MXXA 5FKRA 2XXUA 1MH4A 4F3SA 2OBGA 4E54A 3WAFA 2V84A 3RTFB 3UVKA 1UTBB 3PV0E 1UQWA 5H8NB 5DVIA 3I7PA 1K32A 1M5BA 4IO5A 3OKWA 1NNFA 2I0SA 1NL5A 4ZDMA 4O3BA 4ELRA 5ELVA 4CI8A 4R7AB 5K2XA 4WEPA 4FB1D 3Q26A 3D4CA 4G77A 4QF9A 3HHGA 2QMWA 3PPRA 4OFOA 4OHNA 2Q89A 4M4GA 1VR5A 1I6BA 2CN3A 1POTA 2XL2A 3RMZD 4QHQA 3T96B 1XHMA 1B3GA 3CIJA 3I7HA 2Z8DA 3PGFA 3KRWB 4ZN4A 3QXMA 2AH1A 3EHSA 3TTMA 4U23A 2OLBA 4KFQA 4Y5RD 3PD9A 1B0HA 3H06B 3EI1A 1NH7A 4EQ7A 4OESA 4A2LA 2HKMA 3TODA 2B3BA 3U93A 1LAGE 1B32A 1JW5A 1MY2A 3CG3A 3OO9A 2P9IC 4UA8A 2CN2A 2PMSA 4MFIA 3AL8A 3FGBA 3L6HA 1YCJA 3F3PA 2H98A 3UR4A 3UKRC 3A09A 3SEWA 3IOWA 4NF5B 3K2DA 3V5AA 1MY4A 4OFJA 1MDQA 3SEUA 2P9UC 4A09A 4J78A 3LBSA 3RGYA 2O6AA 3SBPA 2I0RA 4CY3A 5AFU3 4ISUA 5C2WB 1OVTA 4MF3A 3O29A 3DP6A 2QJEA 1RYXA 3KBRA 4F2QA 2O69A 1N6DA 1NH8A 2GH9A 4GZ8A 4FECA 4NMYA 4J87A 4PQJA 3FJGA 3DWLC 1AMFA 1GVCA 1LB9A 2H13A 4NSXA 1FTJA 3KSJA 2H9BA 2ALUA 3V5WB 1Y4TA 4FAJA 4GM9A 2Q9TA 5H8SA 1AL3A 3KJTA 4DCXA 5H8FA 2R6GE 5DEXA 3IKOA 3FV2A 1XVXA 2QRYA 1O64A 4GXAA 5I57A 1P1UA 3MAMA 4LUBA 4F1VA 2UVJA 4P0GA 4QSCA 1GXRA 4PC0A 1DTZA 4U7AA 3THIA 1B4HA 1R9LA 1URGA 4K3FA 2I4CA 3A3UA 3G3GA 5EHMA 2H14A 4GD5A 4I79A 4NF8A 2ZNUA 3O66A 3SEVA 4DIGA 4LQ5A 3KSXA 4NF8B 2HJ4A 4F3PA 3T22A 3T9UA 3OMBA 3TCHA 1IQ7A 3RN0D 4GQOA 3C99A 4HTGA 3OTTA 1PDAA 3SBRA 3G7WA 3G3JA 4F39A 1A8FA 3I89A 5B4WA 3KRXB 2OJTA 3T9HB 1B4ZA 3OKTA 1XKSA 1AH5A 3IX1A 3PPPA 5EAPA 5AA2A 3CIKB 3MPKA 1NMUA 4QFKA 3EWEA 4WEDA 3JV9A 3CFVA 4CZVA 2DE3A 4OWRA 5FKQA 5CBSA 2OWTA 2XXWA 4FA5D 4OETA 1DSNA 3H7MA 1JJUB 4GGCA 2PBWA 2F5XA 1I6AA 3SVWD 1VFDA 1II5A 4O3CA 4E5ZA 4O9DA 2I48A 4E5ZB 4JDFA 2OZZA 1U2VC 3PUYE 2Q88A 3B7FA 5H17A 2AGWA 1UIUA 3I5OA 3M3FA 1PGUA 2RCAA 5HQGA 2GRVA 2ZYNA 3JZNA 3GFCA 3FZVA 4LZ7A 2CE9A 4R9GA 2DS9A 1A99A 3IO6A 3PU5A 4CY1A 3OO8A 4GQ1A 1Y3PA 3EHTA 4FA1D 1POY1 3ZKLA 2G29A 1QKBA 1L5TA 1ERJA 3K6XA 4YKKA 5GSAA 5EMMB 3TTNA 1BP5A 1Y3NA 3USDA 5I2KB 3UKUC 2UYFA 3FVGA 1Z7ME 1IEJA 4X61B 3RY3A 2G93A 4QL1A 2GC7A 3MBPA 3DXKC 4RPNA 1MY1A 3GXAA 1QUJA 4G56B 4NWCA 2IUPA 1MXXA 2RKMA 4JD2C 2OIZA 3TELA 2DP8A 4U22A 2HKRA 4AQ4A 2B5MA 5GMKn 1SHYB 3PUZE 3FIRA 4OEVA 3ILTB 3G3KA 1QKAA 4KFMB 1MXVA 4FIMA 1B3FA 5A2Qg 1XOCA 2XXQA 2R9JA 3IOUA 2CMOA 4LGNA 3QUJA 3FXUA 2ABHA 4O3UB 1U4CA 3HHFA 2HZLA 1DMBA 2HCAA 3KOTA 3VFJA 4JSVC 3O97A 4AOWA 4DXUA 3EI4A 3PUVE 2ESNA 2PT2A 3EQ1A 2UVIA 1SQ9A 4X48A 4A08A 4ZOVA 3JB9L 4OERA 2Z2PA 1TFAA 5EMKB 3PSLA 3UVOA 4A08B 4ELOA 1B6HA 5FTIA 1FTOA 4OZUA 4POWA 1LFGA 2XXXA 5EMLB 2YMUA 3AL9A 2XXRA 3FVOA 4A11B 2KLFA 2YPNA 4O3AA 4TZ4A 4F3GA 3W15C 1VE4A 5DVJA 2O51A 5KDTA 2H4IA 3UP9A 4YB7A 3BFTA 1JW4A 3BG0A 4F3BA 3CRBA 1N84A 3PUXE 4BDOA 2F78A 2YNOA 4EWRA 1ZBMA 3RPWA 4KCDA 1XC1A 2NOOA 2XXYA 3OSQA 3PXTD 4G4PA 2PM9A 1IUDA 4ZZEA 1NNPA 5AE4A 1B51A 4PFWA 4HDJA 2F6PA 3IL1B 3N6UA 4TLLB 4EF2A 1OLAA 3B6TA 2OCUA 1FQCA 3I7NA 2QS2A 2ZMBA 3EHUA 2PX1A 2CO0C 3D4GA 1D3KA 1RYOA 2UVGA 4ERZA 3JYRA 3AXFA 3MKQA 1ANFA 2GHBA 4P11A 4GLIA 1N3XA 2DXRA 5CBRA 3PXWD 3C36A 3RRMC 2WKYA 1MRPA 4GL0A 1KWHA 2DE4A 3KGCA 3OD7A 2REGA 2HXCA 1NNKA 2QS3A 2H9MA 4PE5B 5I5MA 3UVNA 2UVHA 3R7XA 5JEIA 1WODA 5I58B 1B46A 3PVWB 1B9XA 3RLFE 3UA8A 5J1DA 3B6QA 4J86A 2CZLA 1SBPA 4ELQA 2XD3A 3CFSB 4XYIA 1B05A 1IXCA 1A0RB 3IO4A 1D9YA 2E0SA 3FVNA 5A5XA 3SHFA 4ESXA 5ICTA 4AEZA 4L17A 5IJ8E 4JWXA 3HO7A 2OK4A 1LCFA 2GHAA 2IWKA 3J81g 3VA6A 5H8QB 4DZ1A 3T93B 3GLBA 3RLMD 3SETA 4A0BB 3RTWB 4A7JA 4F22A 3LSFB 4R73A 3OKYB 1B1XA 1JETA 4H5IA 1B5IA 2V93A 3I8CA 4YKIA 4GF8A 2GNQA 3B6WA 1FQEA 2DSFA 1SDXA 1B9YA 4R6KA 4Z0IA 4IO6A 2V3TA 1MY3A 2P0SA 4U4SA 1UTBA 2ZXTA 5H8NA 3N94A 2FYIA 3VXCA 4PFTA 3DSMA 4O45A 3FASA 2F7AA 3FXQA 4NTLA 4O3TB 3VLVA 4GGDA 5CXBB 1R1NA 3MP6A 3W9VA 4GGAA 1ZLQA 4XKQA 3EI2B 4LVQA 1OQHA 4LG8A 1XHYA 2Q7QA 3ZKKA 4TOZA 3SEXA 5F7VA 3DP8A 1LGBC 4R2FA 2HXWA 5BWJA 1PI6A 1QUIA 1XVYA 3E0CA 3DM0A 4RXLA 3CSBA 1MXYA 2V3UA 3K6WA 2V3QA 5DT6A 3V7DB 2RC9A 1URSA 3LSWA 1HSEA 1LAXA 3TKDA 2PYYA 2NVUB 3CFXA 2ZYOA 2OVPB 4YU0A 4IO4A 2O7UA 3O6IA 2HZKA 5CMBA 3OXNA 2A5SA 3DELB 4KPTA 3E4RA 3LUYA 3H6WA 4KI0E 1T0KA 3EI3B 5F1QA 4RYAA 2PVUA 5I84A 2QS1A 2Y7RA 4FA4D 4E0WA 1VYHC 3TCGA 1GR2A 3I7KA 3VVDA 4C0RA 4NF6B 1P1QA 3Q29A 2O7IA 4KCCA 2XU7A 3KZGA 1FWXA 3QK6A 1O7TA 5KCJB 3HPIA 3C33A 1QUKA 4GM8A 5DTBA 5JTYB 4X3EA 2XX7A 2I3VA 1JOFA 4FWWA 4NF5A 4MH5A 5K19A 1Y1MA 1OLCA 1ZIUA 1M5CA 3L4OD 2VOZA 4FAVD 2YLNA 3JPXA 3S9EA 3M8UA 3N26A 4OXVA 3IJCA 4R6YA 4Q0CA 1ELJA 4RPOA 3ONMA 4LATA 1TWYA 3IB0A 4FE8A 1A40A 2RCBA 4EXKA 3C31A 4X1BA 5I5IA 1YPNA 2ONKE 3ECRA 3CFLA 4NF4B 4DLDA 3TEPA 4U2RA 4GWOA 4J84A 1FQFA 4ZOZA 4U21A 4H67A 3S9LC 2RC8A 5K2YA 4PBYA 1FQBA 2OJYA 5IAIA 3PE7A 3H6TA 3TCFA 1JQFA 2F7CA 5LOMA 2F34A 1F9BA 3O2AA 1JNFA 1DTGA 1H3DA 1JMZB 4FHLA 5M2VA 1IXHA 4DDDA 4J73A 4DE8A 4YZZA 3K6VA 3VGZA 2VD3A 4IY6A 4POXA 1B0LA 3MVZA 5AA2D 2CNXA 4IO2A 3A3CA 1ZMGA 3SFZA 4N6PA 1N76A 4JT5C 4LG9A 4HW8A 3RNNA 4YKPA 1TXFA 4GRKA 2HJBA 3FATA 3IAZA 3N0DA 3OENA 2J56H 3TDJA 5CMKA 2AGLA 3C34A 4G68C 2B5LA 3MZKA 1B7ZA 3GBBA 5DVFA 3CSGA 3FJMA 3NVNA 3I3VA 4TLMB 3K00A 2H6QA 4CI2A 5TU0A 4X9TA 3EG6A 3FUZA 3AH8B 3H3GA 1OQGA 3SWSD 3K1NA 2O1MA 1XS5A 4FEBA 3KN3A 4EF1A 4FA9D 3RFGA 2YNNA 4FORA 3RUMA 1B52A 2Z2NA 4IO3A 4F19A 4OEUA 4I9DA 2EBSA 3TMGA 2H9LA 3TUSA 1TYQC 5HE0B 4H65A 2P1SA 3G3HA 1B3EA 2AGYA 4GM3A 2P2AA 3EF7A 3IJ1A 3KJ7A 2PT1A 1P99A 4AB5A 3M3LA 3K26A 4ZZAA 1MXUA 1SD3A 3U92A 2QS4A 1A7LA 2G9AA 1LBCA 4ZEBA 2X7PA 5K1CC 4UACA 3MVWA 5AJAA 4G8NA 5FKTA 3SXTD 1Z7NE 2P9NC 2P9LC 5I59B 4A2MA 1M5FA 2UYEA 4Z8LA 2V25A 2W7YA 1IXGA 3MKSB 4RNSA 4KQPA 5I2KA 4QQEA 3VH0A 2QL3A 4LONB 4RK9A 4G8HA 1GOTB 3CFZA 3T9XB 2O1LA 2DWAA 2R71A 4PFUA 4FATA 3F3FA 3BG1A 1HSJA 1OIBA 3EMHA 3RN8A 4PBZA 2O9KA 3LC8A 1CE2A 1MY0A 2PM6B 1DOTA 4H8JA 4Y7RA 3SMRA 2DWHA 1FTLA 1BTJA 4E0XA 1B40A 3MW0A 4J8GA 4F2OA 3C75H 5CM6A 2H68A 3K0VA 3FGSA 2AGZA 5DYHA 3GBAA 1LB8A 4G68B 5C9ZB 4U1ZA 5EYFA 4CZXA 5I56B 3O28A 5EAMA 3JZHA 4PXWA 1JEVA 1ZU0A 3KOSA 3UGWA 2P9PC 2ANJA 4ESGA 5L9OA 4ERQA 1S50A 1B7UA 2P9KC 2H47A 4JXMA 4Q8RA 4MBPA 4P0IA 1IZ1A 3DLNA 3S9NC 4X63B 3MZBA 3G3IA 2DQVA 2DVCA 1MQJA 1DPEA 2REJA 2DVZA 2IUQA 4R74A 1VFEA 4ZOYA 3K4UA 4ZEDA 2BJJX 3FRXA 2W18A 5EARA 1BKAA 3PUWE 3V89B 4F1UA 3IOVA 3CG1A 4L9OA 5CMMA 4A11A 4FEDA 3AFCA 5FKSA 3K27A 4WKMA 1VSOA 2E1SA 3WAEA 2G99A 4J0WA 5TP9B 4ECFA 1UIVA 4BUJC 1WVJA 1OLZA 1H43A 2THIA 3JAMg 4XIGQ 4ERYA 3EPEA 1NFTA 3U94A 1US5A 4H5FA 2F36A 3RFHA 5B7DA 1GTKA 1MDAH 3QIMA 1MQGA 5IGOA 1MPCA 5FLXg 2J55H 4OYVA 3V8XB 3A0FA 3OEKA 2BCJB 1P1NA 2OK2A 4H5JA 4YVDA 1EZ9A 5ISUA 3TAJA 1B3LA 4XXUA 2I3TA 1SW2A 5EHSA 1MH3A 3SESA 3UN6A 2XXTA 3BWSA 3VVFA 4ZS9A 4QFOA 5CYKA 3F3GA 4GFRA 4OQOA 4Q30B 1WDNA 2CE8A 3PSCB 1QULA 5CYKB 2QPQA 3PMVA 4OZ9A 4R72A 2AGXA 1USYH 3TTKA 5FQDA 2Y7PA 4ZEKA 1PB7A 4ND9A 1A55A 1PBPA 1PBQA 5CI5A 4HS7A 3IJ0A 3TQLA 4O1QD 3VE1B 1QJMA 2BBKH 1OMPA 3MJNA 1Y4CA 1TFDA 3QUFA 2ZNTA 4UI9R 5I58A 1AOVA 2YNPA 5H8HB 2HESX 5HBCA 1S4UX 4OFLA 2RINA 4HCWA 4U1OA 2Z8EA 2H9NA 1EU8A 1QVSA 1RI6A 4ZEFA 2FA7A 3TTRA 4HCYA 4IY5A 3T9VA 4L3GD 5FHNA 2X26A 2Z23A 5TEEA 1JW1A 2XX9A 5EMJB 2IUVA 1N7WA 3ODBA 5H14A 3RT8A 4MLVA 3MZ1A 2H6KA 1EZPA 2QXVA 5H8QA 3U4YA 4THIA 1MQDA 3IJXB 3FXRA 4A0BA 5CXCB 2IURA 2B3FA 1EH3A 2ZYMA 3OKYA 5ICQA 1XT8A 3OW8A 4J8BA 3I7LA 3W15A 2H3XA 1Q35A 3MWBA 1USYE 3N0EA 3CI8A 1S9TA 1ZJLA 4EDPA 3SEYA 1LCTA 4X60B 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4JSN C;  5FXY A;  2F7B A;  1O6G A;  2AYS A;  3PPN A;  1FTK A;  3V83 A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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