The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
59
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sequence length |
146
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structure length |
146
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Chain Sequence |
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGKALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKVKAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGKEFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen binding
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| molecule keywords |
Hemoglobin subunit alpha
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| publication title |
The high salt (phosphate) crystal structure of deoxy
hemoglobin E (GLU26LYS) at physiological pH (pH 7.35)
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
59
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| structure length |
146
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| sequence length |
146
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| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-07-17 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1V4X B; 2O58 X; 1ECN A; 3QZX A; 4U8U B; 1G08 B; 2AA1 B; 3IC2 A; 1CO8 A; 2VEE A; 3GQP A; 2AUP A; 1CG8 A; 2D2M B; 1SHR B; 4M4A A; 1NIH B; 2BMM A; 1YEO A; 1LUE A; 1GBU A; 2W6Y A; 1QXD B; 1YEU B; 3RJN B; 1LA6 B; 2EKT A; 3AQ5 A; 3D1K A; 3QM6 A; 1RVW B; 3IA3 B; 1MLM A; 4F6J A; 3WCT C; 1A3O B; 1CG5 B; 1ABY B; 1HGB A; 1LHS A; 1IOP A; 1NZ3 A; 2V1G A; 1RQ4 A; 3UHB A; 2ZLT A; 4ROM A; 3VRF A; 3GQR A; 1A6G A; 1XZ2 A; 1Y01 B; 1V9Q A; 1UMO A; 4KMW A; 1AJG A; 5CN9 A; 2ZFB B; 1GJN A; 1COH A; 3AQ9 A; 1YCB A; 4TYX A; 3PI9 A; 5MBN A; 2LH2 A; 2R50 A; 1YMA A; 2VEB A; 4MQH B; 2G11 A; 2BLH A; 1HV4 B; 5CN5 A; 2JHO A; 2D2N D; 2DHB A; 3S66 B; 3IC0 B; 3PT8 B; 3UHN A; 2VYW A; 1JF3 A; 2MBW A; 3RJ6 A; 1CH4 A; 1C7D A; 1MGN A; 1IT2 A; 3IC2 B; 1UVX A; 1HLB A; 3GQP B; 4HSW A; 2R4W A; 4MBN A; 1DXV A; 4FWY A; 1CG8 B; 1LTW A; 4M4A B; 4HSX A; 1MLQ A; 1VWT A; 2ZS0 D; 1CMY A; 3CIU A; 1YEO B; 1GBU B; 3UH7 A; 1BZ0 A; 3D1K B; 4N7P A; 2ZT2 A; 4MQK A; 1JY7 A; 3UHW A; 1IBE A; 2D5X A; 1HGB B; 2VLX A; 1FN3 A; 1RQ4 B; 2ZLT B; 4ROM B; 4SDH A; 3VRF B; 3SZK A; 1ECD A; 3GQR B; 4ZVA A; 4F6G A; 1XZ2 B; 2VRY A; 2NSR A; 2GL3 A; 3LQD A; 1F5O A; 1COH B; 1A9W A; 3OZU A; 5EET A; 1HBS A; 1JZM A; 3PI9 B; 111M A; 1DKE A; 5CN4 A; 4H2L A; 2GTL A; 1S5X A; 1FHJ A; 3UHV A; 1OJ6 A; 2G0R A; 2DHB B; 1XZV A; 3UBV A; 4MXK A; 1M9P A; 3D7O A; 3QQR A; 1YHU D; 1HLM A; 5EYS A; 2H8D A; 3WCU C; 2LH3 A; 104M A; 3NL7 A; 4JAC A; 1YMC A; 2D60 A; 4H07 A; 2Z6N A; 1C7D B; 1MOH A; 2MB5 A; 1DXV B; 1MZ0 A; 3ZJS A; 3QMA A; 3ZJL A; 2ZSS A; 3GK9 A; 1GDI A; 2O5M X; 3G52 A; 1VWT B; 2MGM A; 2ZLU A; 1CMY B; 3CIU B; 1XZ5 A; 1BZ0 B; 5KKK A; 1Y0W A; 5KDQ A; 2GNV A; 1A01 A; 1HSY A; 4N7P B; 4MQK B; 2MGD A; 1JY7 B; 1IBE B; 2D5X B; 5E6E A; 4XDI A; 1O1P A; 1FN3 B; 4DC7 A; 3O89 A; 112M A; 1MOD A; 1Y2Z A; 2NRL A; 3SZK B; 1YHR A; 3WCW C; 4NXC A; 2ZSO A; 1RPS A; 1G0B A; 2B7H A; 1A6M A; 3LQD B; 3HC9 A; 5CN8 A; 1EWA A; 3WCT D; 1HJT A; 1HBS B; 5SW7 A; 1DKE B; 1Y31 A; 2MGJ A; 2O5Q X; 2MGG A; 4H2L B; 2GTL B; 1S5X B; 1QPW A; 3UHY A; 1FHJ B; 5HY8 A; 1XZ4 A; 3S1I A; 1ITH A; 1F63 A; 5E83 A; 1XZV B; 1MLK A; 1M9P B; 3D7O B; 1DO1 A; 1MLG A; 1MOA A; 1CLS A; 2H8D B; 4C0N A; 2NSS A; 3NL7 B; 1Y8K A; 1O1K A; 4N7N A; 1NZ2 A; 2Z6N B; 2MGE A; 3PEL A; 1MBA A; 1WLA A; 4JYQ A; 1Y4F A; 102M A; 3OVU C; 2ZLU B; 3D17 A; 1W92 A; 4HRT A; 2MYD A; 1XZ5 B; 1Y0W B; 5KDQ B; 3M38 A; 3LB4 A; 4F6I A; 1A01 B; 3ORD A; 5IKS A; 2QFK A; 4WCH D; 1CPW A; 1LJW A; 1OUT A; 2HCO A; 2IG3 A; 3ASE A; 103M A; 1JPB A; 5E6E B; 1O1P B; 3H58 A; 1DUO A; 1Y8H A; 2FAM A; 3UGY A; 1Y2Z B; 1YHR B; 3QQQ A; 2O5B X; 3AT6 A; 1B86 A; 4TWU A; 1RPS B; 1G0B B; 1Q1F A; 3AQ8 A; 1HBI A; 2B7H B; 2LH5 A; 1X46 A; 1JL6 A; 1MWD A; 5SW7 B; 2HHE A; 3TLD A; 1Y31 B; 2GDM A; 3EU1 A; 1QPW B; 5HY8 B; 1XZ4 B; 3ZJQ A; 1ABW A; 2PGH A; 2V1J A; 1VXC A; 2ZSR A; 2ZFO C; 5E83 B; 1NPG A; 2HBE A; 3A0G A; 1CLS B; 1DXC A; 2ZS1 C; 2SPN A; 1MYZ A; 2OH8 A; 1BZR A; 1HBG A; 2HZ1 A; 1Y8K B; 1O1K B; 2QU0 A; 4N7N B; 1XZ7 A; 4FH7 A; 3PEL B; 2MYB A; 1Y4F B; 1PBX A; 2VYZ A; 2D2N C; 4XS0 A; 3D17 B; 4HRT B; 3WCU D; 1DO4 A; 2DN3 A; 4OF9 A; 2W72 C; 1UFJ A; 1RTX A; 1MYH A; 2AUO A; 3S65 A; 1MNK A; 2ZLV A; 1LJW B; 1OUT B; 2HCO B; 2MYC A; 3IXF A; 2HHD A; 3UHR A; 1Y8H B; 3OGB A; 1URY A; 3ODQ A; 3BOM A; 5CMV A; 4PQB A; 1X9F C; 5HAV A; 3AT6 B; 1B86 B; 1HRM A; 1MKO A; 3H57 A; 1Y4V A; 2E2Y A; 4AVE A; 1GZX A; 1JZL A; 1KD2 A; 1Y8W A; 4WJG A; 1MYM A; 5CN6 A; 2Z8A A; 3WCV D; 5JDO F; 1FDH G; 3W4U A; 2HHE B; 2G10 A; 1WVP A; 3EU1 B; 5F0B A; 1BBB A; 1HDS A; 1ABW B; 1HCO A; 2PGH B; 3A2G A; 2D6C A; 5CNB A; 1XQ5 A; 2HBE B; 1LFQ A; 3A0G B; 3LR9 A; 1MLN A; 5CNE A; 4O4T A; 2QU0 B; 2ZWJ A; 1XZ7 B; 3G4Q A; 3UHC A; 1JDO A; 5AZR A; 1B0B A; 2FAL A; 4LPI A; 1SWM A; 1PBX B; 4XS0 B; 2OHA A; 3LB1 A; 1LFV A; 1MTI A; 2DN3 B; 1S0H A; 1K1K A; 1MYT A; 3DR9 A; 3KMF C; 3AQ7 A; 3S65 B; 3ZH0 A; 1NAZ A; 2ZLV B; 4ESA A; 1F65 A; 3ZJN A; 3UHZ A; 2HHD B; 1H1X A; 1HBH A; 3ODQ B; 3QJE A; 3BOM B; 1GDJ A; 1MKO B; 3VRE A; 1Y4V B; 3GOU A; 4IRO A; 1GZX B; 4YU4 A; 1KD2 B; 1Y8W B; 3PI1 A; 5EUI A; 2XKI A; 1NS6 A; 1G0A A; 2BKM A; 4MAX A; 3W4U B; 1MYI A; 1FDH A; 3UH5 A; 1MLS A; 1BBB B; 1HDS B; 3QJB A; 1HCO B; 4B4Y A; 2OLP A; 1BAB A; 1XQ5 B; 3MJU A; 4NK2 A; 1LFQ B; 1YIE A; 1TU9 A; 4QAU A; 1JP8 A; 1S6A A; 4OOD A; 3WFT A; 1UC3 A; 1J3Y A; 1YVQ A; 2SPL A; 4BJA A; 1S69 A; 1MBS A; 1YGD A; 1HDA A; 1BJE A; 3VRG A; 2EB8 A; 2ZFO D; 1OUU A; 6HBW A; 4F69 A; 1URV A; 2ZS1 D; 1LFV B; 4C44 A; 1S61 A; 1ECA A; 2LH1 A; 1S0H B; 1K1K B; 2FRJ X; 2EB9 A; 4G1B A; 3K9Z A; 5EYJ A; 4ESA B; 3WR1 A; 2SPO A; 2Z6S A; 1SDK A; 2GKN A; 1Y7G A; 1S56 A; 4HHB A; 3UHT A; 1MCY A; 1HBH B; 3QJE B; 1KR7 A; 5AZQ A; 3VRE B; 1NS9 A; 3GOU B; 1I3E A; 1RQ3 A; 4IRO B; 4YU4 B; 1Y7Z A; 3HF4 A; 3G4Y A; 5EUI B; 1NS6 B; 1G0A B; 2QFN A; 2H35 A; 1MWC A; 4FH6 A; 1HGC A; 3ARJ A; 3QJB B; 1G9V A; 1X9F D; 3UH3 A; 1BAB B; 3MJU B; 1GBV A; 1FLP A; 3GDJ A; 3AT5 A; 4M4B A; 3E5O A; 3E5I A; 5HLX A; 1IRC A; 1YIE B; 2HBS A; 1J3Y B; 1YVQ B; 2ZT0 A; 1Y4R A; 4NXA A; 2O5O X; 1Y09 A; 1YGD B; 4TWV A; 1HDA B; 3VRG B; 1MTK A; 1OUU B; 6HBW B; 3E4N A; 4NI0 A; 4U8U D; 2PEG A; 1YH9 A; 2D2M D; 1QSH A; 2Z6T A; 1HHO A; 4G51 A; 108M A; 3WR1 B; 1SDK B; 1Y4B A; 1Y7G B; 5CHR A; 1CBL A; 3BJ2 A; 1O1I A; 1O1O A; 2WTG A; 4HHB B; 1MYF A; 3MOU A; 2GNW A; 3BJ3 A; 3WFU A; 1IRD A; 1CH7 A; 1NS9 B; 5MBA A; 1RQ3 B; 2GTL C; 4F6B A; 1CBM A; 1Y7Z B; 3HF4 B; 2ZSY A; 3B75 A; 1NXF A; 2H35 B; 1Y7D A; 1HGC B; 1AZI A; 1LH6 A; 7HBI A; 1BUW A; 1Y4P A; 2MGA A; 1G9V B; 4L7Y A; 3HYU A; 2H8F A; 4PQ6 A; 1VXF A; 4IT8 A; 2O5L X; 3S1J A; 1GBV B; 3GDJ B; 4MQG A; 3AT5 B; 3A9M A; 4M4B B; 4MXL A; 4N7O A; 2W6V A; 3GQG A; 1RQA A; 2HBS B; 1IT3 A; 3AQ6 A; 1MYJ A; 3BJ1 A; 1Y4R B; 2M6Z A; 1Y22 A; 1Y09 B; 2BW9 M; 1THB A; 3WCV C; 5JOM A; 3UHH A; 3EDA A; 1MWB A; 2WTH A; 1V4U A; 5EQM A; 4NI0 B; 2EF2 A; 1MBO A; 1J40 A; 5JDO C; 2PEG B; 1YH9 B; 3NG6 A; 1O1L A; 2R4Z A; 4NK1 A; 3WCW A; 1QSH B; 1YEV A; 1Y5K A; 1HHO B; 4G51 B; 1NQP A; 1DO3 A; 4KN3 A; 1M6M A; 1MOC A; 3S48 C; 3PI2 A; 1Y4B B; 1VXG A; 3WI8 A; 1NZ5 A; 105M A; 2MHB A; 1XCH A; 3BJ2 B; 1LFL A; 1O1I B; 1O1O B; 1UT0 A; 1NEJ A; 1GVH A; 3BJ3 B; 3ZJO A; 1IRD B; 6HBI A; 3UHS A; 2EVK A; 1CQX A; 2ZLX A; 3ZJH A; 3G46 A; 1U7S A; 1CO9 A; 2LH6 A; 3B75 B; 1R1X A; 1MBC A; 1Y7D B; 4UUR A; 1BVC A; 1OR4 A; 1BUW B; 3FH9 A; 1Y4P B; 4L7Y B; 1EBT A; 3HYU B; 2H8F B; 1YIH A; 3ZOL A; 2QRW A; 2OIF A; 4MQG B; 2QSP A; 3PIA A; 4N7O B; 1R1Y A; 2W6V B; 3GQG B; 1RQA B; 2HBC A; 2MGL A; 3BJ1 B; 1VHB A; 1YVT A; 5EV5 A; 1S5Y A; 4UZV A; 3MJP A; 2M6Z B; 1Y22 B; 1THB B; 1J3F A; 1DO7 A; 4DWU A; 1O1J A; 4O2G A; 2GRH A; 4X0L A; 2VLY A; 3P5Q A; 1Y4G A; 4B3W A; 1V4U B; 2V1I A; 1HAB A; 2OH9 A; 1BIN A; 1J40 B; 3NG6 B; 1O1L B; 3WCW B; 1MLH A; 1J7Y A; 1YEV B; 1Y5K B; 3ED9 A; 3A5B A; 1N9I A; 1NQP B; 4F6F A; 3BCQ A; 1N9F A; 1EMY A; 2QLS A; 3LB2 A; 2MHB B; 1LFL B; 1NEJ B; 3MVC A; 4PNJ A; 1OBM A; 2EVP A; 4O1T A; 3OO4 A; 1OFK A; 4L2M A; 1Y85 A; 2GRF A; 1D8U A; 1YCA A; 2ZLX B; 3E55 A; 1J7S A; 1DLY A; 1K0Y A; 1NWN A; 4F68 A; 2ZT3 A; 1R1X B; 1O16 A; 1CH3 A; 3QM5 A; 1X3K A; 1LFY A; 3G53 A; 3FH9 B; 5C6E A; 109M A; 1YIH B; 3ECL A; 2GTL D; 2QSP B; 3QJD A; 3PIA B; 2D2N A; 4MQJ A; 1R1Y B; 2HBC B; 1YVT B; 2BLI A; 1S5Y B; 3ZJP A; 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2WY4 A; 4MBA A; 1MLL A; 1HGA A; 3DUT A; 1Z8U B; 2GLN A; 1A0Z A; 1XYE B; 2HBD A; 3GLN A; 2HHB A; 2ZSZ A; 1V4W B; 1MLR A; 1YEN A; 2RI4 A; 1CH1 A; 1ECO A; 1YHE B; 3A5G A; 1YG5 B; 1Y0A A; 1I3D A; 1BZ1 A; 1XZU A; 4WJG 1; 5JDO E; 3WCT A; 1MNO A; 1HBB B; 3ZJM A; 4FC3 A; 2G0Z A; 2RAO A; 1JZK A; 1L2K A; 1YE0 B; 2YRS A; 1JEB A; 3CY5 B; 1J41 A; 1YGF A; 3WHM B; 3HXN A; 3R0G A; 1MLJ A; 3K8B B; 1T1N B; 1YHU B; 2R1H B; 5ILE A; 3ECX A; 3D1A A; 1V75 B; 2ZLW A; 2HBF B; 1LFT A; 5JGG B; 1F5P A; 1LH3 A; 1HDB A; 1Y5F A; 1O1M B; 2DN2 A; 1DXT B; 1HBA A; 2G14 A; 2ZT4 A; 2ZSN A; 1MDN A; 2D5Z B; 4DWT A; 1UIW B; 3PT7 B; 1BZZ A; 3GKV B; 1MLO A; 1AJ9 B; 1GDL A; 3K3U A; 3UHX A; 5HLQ A; 3HEN A; 5EOH A; 1HGA B; 2QSS A; 1OFJ A; 3DUT B; 3ARK A; 1A0Z B; 3A59 A; 1CP5 A; 2HBD B; 4O4Z A; 1DXD A; 2HHB B; 2G0X A; 4KMV A; 3G4V A; 1YEN B; 2RI4 B; 3GYS A; 3MYM A; 3ZJI A; 5CN7 A; 1Y0A B; 3SDH A; 1Y45 A; 1BZ1 B; 5B84 A; 4FWX A; 1LH2 A; 3QM9 A; 1VXB A; 1FAW A; 1XZU B; 2CMM A; 3WCT B; 4HRR A; 1XXT A; 4FC3 B; 2RAO B; 2VM0 A; 2YRS B; 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