3DXKB

Structure of bos taurus arp2/3 complex with bound inhibitor ck0944636
Total Genus 56
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
56
sequence length
212
structure length
211
Chain Sequence
QAVLTLYAQGLLGVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLTRRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVLVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIRIEDPPRRKH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin-related protein 3
publication title Characterization of two classes of small molecule inhibitors of Arp2/3 complex
pubmed doi rcsb
total genus 56
structure length 211
sequence length 212
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-07-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3dxkB01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3dxkB02
2FLOA 5B8HA 1G99A 4JHDB 1ATNA 1Z6RA 4BR5A 3FE1A 1HKCA 5F0XA 4H5RA 4DCHA 4KBOA 3H1QA 1GLJO 1ZC6A 3A5OC 4B1WB 1BG3A 3VEYA 1BDGA 3CJ7A 4ISFA 5CE3A 4CZGA 1RFQA 2W40A 3I8BA 2OANA 5TKYA 1GLCG 1Y64A 5AQJA 2KHOA 3VEOA 4FWMA 5AZIB 1RDWX 4FPAA 3W3DA 1TYQA 1JCGA 2CGJA 3A0IX 4IXCA 3U9DA 3O6WA 3VEVA 3FZFA 1HLUA 5AZJB 2QXLA 3QFPA 3ZETA 3VF2A 3CJ1A 4M63C 3MK6A 5AQPA 3ULEB 4FWQA 3H1VX 1C0GA 2ZF5O 4CD1A 1XC3A 1KXPA 4JHDA 5BRDA 3DXMA 4K43A 4FWRA 4EAHD 4FO0A 3VETA 5BRHA 2P9SB 1R59O 5LJVA 3LDLA 4BRIA 5KQDA 4PKGA 1KAYA 5LY3A 2YJEA 3MN7A 3AARA 4BQZA 3BEXA 1K8KB 3L4IA 4H0VB 4CZIA 4QS7A 2GTDA 4CZFA 5EX5A 3VF6A 5FPMA 3R9PA 4A2BA 4EHTA 2YHXA 5BPLA 5BN9A 1MDUB 5AZIA 4F9OA 5EOYA 5AQXA 2E2QA 2W41A 2P9UB 3DAWA 2FSNA 3MN6A 3O1WA 3F9MA 2IIRA 1IJJA 2QWQA 3LM9A 5AZJA 1V4SA 2HOEA 2P9NB 4DB3A 2NRHA 1NGGA 4BVPA 3EL2A 4H5TA 2F9TA 3LDQA 3ULEA 3VGLA 4Y0WA 3U8XA 3DJCA 4FL9A 1ZXOA 4CD3A 5EXWA 2HF4A 1GLFO 4A2AA 1KAXA 3O1BA 3QFUA 5BRFA 4FWKA 2P9SA 5EY4A 3GOIA 2ASPA 3EZWA 1P8ZA 1K8KA 3GDQA 3O8MA 2VCPA 1Z05A 3G25A 3WEEB 1NGCA 2E2NA 4YDUA 2P9PA 2E2PA 1MWMA 1NGEA 5I9EB 3UKRB 5F2RA 1E4FT 1CZAN 2VYPA 5BR9A 2V7ZA 4FWSA 2E1YA 3HI0A 3OHRA 1XUPO 1HJOA 2P9UA 1TUUA 3GL1A 2P9IB 4BROA 1MWKA 4IO8A 1X3NA 1OKJA 4JD2B 1HKBA 1LOTB 1NGBA 2P9NA 4GY2B 4B1VA 5ADXA 3ATVA 4RTFD 5AQWA 5E84A 2D4WA 3M6GA 3VOVA 2Q36A 1QQMA 3IUCA 3M3ZA 3KVGA 5AQRA 1SAZA 1GLDG 1HX1A 2QWPA 4BRDA 3KZBA 1ESVA 2F9WA 1NLVA 3CETA 4M7XA 4CZMA 4MLEA 3A5LC 3AY9A 3C7NB 5AQGA 5EVZA 3MN9A 3CJ9A 3H3OB 3HBTA 2ITMA 4XH4A 3RSEB 1HPMA 2CGKA 2ZGYA 4BRMA 2E8AA 3WXIA 4MLHA 3LL3A 4QS9A 2A5XA 1J6ZA 3I33A 4BC5A 1S22A 2V52B 3VGMA 3UKRA 1NBWA 5KQ8A 3ID8A 4H0OA 4FWOA 3AAQA 5F1XA 4WQ5A 2P9IA 4H0YB 3B8AX 2YHWA 4GNIA 4JD2A 3LM2A 1GLBG 3ZX2A 2YHYA 3WXLA 2QWLA 1TUYA 4I6MB 4XH5A 1C0FA 4BRCA 4LC9B 4IJNA 1NGFA 3HZ6A 2Q97A 4PL8A 3U4LA 3C0BA 5KPZA 2BTFA 3FZLA 4H5VA 4WQ5C 5AQNA 4BG8A 3A5NC 3QBXA 1S3XA 2V51B 4PKHA 4BRGA 5AFUA 3O5BA 3FGUA 4O5FA 3UKUB 3C7NA 3L6QA 2BUPA 5JLHA 2FSJA 3RSEA 4XEIA 3D2EB 2YJFA 2A40A 2FXUA 2Q31A 3VENA 1RGIA 3JS6A 3WT0A 2QWOA 4CBUA 3H3NO 5BREA 3VEXA 3CJCA 5AQYA 1QQNA 2GWJA 2Q0UA 1NGHA 3TU5A 4B1XB 3BF1A 4C23A 3VEWA 1QHAA 3FR0A 2P9LB 1DEJA 3UE5A 3WXJA 3SJHA 3ZEUB 4I6MA 1JCEA 3EO3A 4CZHA 2GWKA 1BOTO 4EIAA 2GELA 4H0PA 5ELZA 1DKGD 3D7EO 3VERA 1NGIA 2IVPA 4HTLA 3FZMA 4BR4A 2QWMA 1GLEG 1H1VA 2GEMA 3ENHA 5AQFA 1QZ5A 3MN5A 2AA4A 4BR9A 4WYBA 1NMDA 4XH1A 3CIPA 3R8EA 3HM8A 1QQOA 3UKUA 3P4IA 3H45C 4CI6A 5BPNA 3D2EA 2Q2RA 1T44A 2FSKA 2QW9A 1DGKN 2VWBA 3WUHA 4BRLA 3BP8A 5AQLA 1YXQA 1ZBSA 4BGBA 4J8FA 4ISGA 4NO7A 3VEZA 2ASMA 4RWTA 1BU6O 3FZKA 1Q18A 5AQZA 1U2VB 2P9LA 3L0QA 4FOEA 3ZEUA 2PBDA 2D1KA 5AQHA 4BRPA 5KPTA 3LDNA 3QMLA 3QDKA 2CH6A 4HWIA 1SZ2A 3MCPA 1BO5O 2A6AA 3MMVA 1NM1A 1NGDA 4IZ9A 1NGAA 3BUZB 3J8AA 3FFKB 3IDHA 1BUPA 4CBXA 1YUWA 3KHYA 2NZTA 2QWRA 3GE1A 4RCHA 4MO5A 5AQSA 3EKSA 3UB5A 3CJBA 3ZX0A 3WEEA 5JMVA 4BRFA 4E1JA 3DXMB 4NB4A 2NLXA 2Q1NA 4JN4A 4BRKA 5JICA 1U6ZA 2IVNA 4JNEA 5AQTA 4FWPA 4WQ4C 3VPZA 1HUXA 2HF3A 2HMPA 1HKGA 4A62A 3O4WA 2YCHA 3R6MA 5AQOA 4PL7A 3QB0A 5ADXH 2FF6A 2E1ZA 2E2OA 3DXKB 1U2VA 3JXUA 3IFRA 4BG9A 4BR0A 5AQMA 2YI1A 4CBWA 1BA1A 4CZLA 4PKIA 1GLLO 2CH5A 1IG8A 4L3QA 3VESA 4BREA 2A42A 2ZWHA 4H5NA 2WUSA 3SMPA 4QS8A 5KPRA 4MO4A 5AQUA 1BA0A 4BR2A 3WQTA 2P9KB 3FZHA 4O8KA 3WXKA 2QWNA 4K42A 5FPDA 3GG4A 1E4GT 3SK3A 3U9ZA 4BC2A 4BC3A 4BRNA 1V4TA 4CJ7A 3DWLA 3HSCA 1T6CA 2PAVA 3ATUA 4FWLA 2DPNA 1KAZA 4FOIA 1BWFO 3LDPA 2I7NA 4IWVA 3O80A 5AQIA 3A8YA 4CZJA 1NWKA 3D2FB 5BPMA 3CI5A 5LJWA 3W0LA 1D4XA 2QM1A 5BN8A 3DXKA 3QICA 5AR0A 4IJAA 4CZEA 2P9PB 5AQKA 3S41A 2IVOA 2J4RA 4FSVA 1WOQA 1ATRA 2D0PA 4H0TB 2UYTA 3CQXA 2A3ZA 3A5MC 4JAXA 3SMSA 3ZX3A 4BVOA 4BGAA 4B9QA 1NGJA 5E26A 2ASOA 3BF3A 3O08A 1YVNA 5AFUH 2P9KA 5FPNA 4Z94A 1XQSC 4DHYA 3QBWA 3LDOA 3H6EA 3WQUA 2FF3B 2V7YA 3IMXA 3TPQA 3MDQA 3CJAA 1SQKA 4B1UB 1YAGA 4AM7A 2E88A 1X3MA 3H46O 1LCUA 4B1YB 4BC4A 4B1ZA 3SLCA 5FPEA 4BR7A 3CERA 1WUAA 4AM6A 4BRHA 3EKUA 3EN9A 3D2FA 4CZKA 4H0XB 1T6DA 3CHWA 3VF4A 3FLCO 1EQYA 1JCFA 4EHUA 1X9JA 1QZ6A 2D0OA 1GLAG 2H3GX 4H5WA 3HTVA 2AP1A 4ISEA 1TYQB 2E20A 5JLFA 4K41A 3VGKA 5AQVA 2EWSA 2Q0RA 3AAPA 1ATSA 4M7YA 4EFHA 3M1FA 4BQLA 2ZGZA 2I7PA 3ZETB 3ENOA 4BRAA 4WQ4A 4FWNA 4A61A 2A41A 3GBTA 3CQYA 5AQQA 4BRQA 2CGLA 1MA9B 4K25A 4YDUC 4H03B 4FPBA 4DQ8A 2GUPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4X65K 5B8HA 4DSKA 1G99A 1C0UA 1CZBA 3HYFA 3HP9A 1FK9A 3THXB 4BWJA 1BG3A 4B9MA 3L3UA 4FJJA 3K5NA 5JVGL 1XHXA 4ISFA 5CE3A 4CZGA 1RFQA 4HUEA 2OANA 3A2FA 2YNGA 1Y64A 3VEOA 4K0KK 3ZSXA 4FJMA 1TYQA 4X66K 2CGJA 4IXCA 4DR3K 3U9DA 3DLHA 1KFDA 5J2QA 3MXIA 1HLUA 1RDUA 2QXLA 4YOWA 1ZYQA 1BQNA 5AQPA 3K58A 3ULEB 4FWQA 3MEEA 4FZZA 4LF5K 4C1NI 2RE2A 4CD1A 5KGXA 1JLQA 4JHDA 1JL1A 4LF6K 3DXMA 1FJGK 2XY5A 5LJVA 3L2WA 5KQDA 4OLBA 3C6UA 4CGGA 3MN7A 4CHOA 3AO2A 4JEPA 3TR8A 4OPKA 1K8KB 4W5OA 4A5BA 3SNNA 3O9RA 4DR6K 4CZIA 4WF9L 4Q5VA 4I9LA 2GTDA 3AVJA 3KK3A 4DS4A 3DRRA 3VF6A 3CXCM 5FPMA 3R9PA 2YHXA 5BPLA 1HPZA 5BN9A 3CC7N 4DTXA 2BE2A 3KWGA 2QXFA 2E2QA 4DMNA 3DAWA 4OJRA 3RMAA 2QWQA 5C2FA 1ZBIA 5AZJA 4RW7A 2P9NB 4JK7A 2F96A 1LV5A 3G4SN 3EL2A 3KK2A 3L3VA 3QNNA 3KLIA 4LD0A 3U8XA 1ZXOA 4CD3A 5EXWA 4A2AA 4IDKA 2XY7A 3QEVA 1E3MA 1Q8IA 4DFJA 4IOAL 4DR2K 1KVBA 3G25A 3G71N 3K59A 1YHQN 3IS9A 4YDUA 1X9WA 3V81A 1L3VA 1EWQA 3MX2A 1NGEA 4MDAA 2F4VK 3UKRB 3ZT3A 4DLEA 2V7ZA 4PY5A 1VSIA 3AO4A 3OHRA 4FYDA 2B5JA 4DSFA 5LL6Z 3CC2N 2P9UA 3KLEA 4K8ZA 3SV4A 1RT1A 3KLHA 1LOTB 5ADXA 4E1NA 2LSNA 4DTMA 1SL1A 2AJQA 2G8UA 4YFUA 3DRSA 1VSFA 2IOCA 1OVYA 2D4WA 3M6GA 1RT4A 1DLOA 1FW6A 2C1GA 3IUCA 2XY6A 1SAZA 2ETJA 1ASVA 4UQGA 3C6HA 4KHUA 3TSQA 3V1OA 3CETA 3T7ZA 3HVRA 2RKIA 3C7NB 3CJ9A 4KH4A 4DSIA 4B9LA 4Z4HA 2ZGYA 3WXIA 1A5XA 4CF1A 3HK2A 3I33A 3CG7A 3VQQA 2V52B 2X78A 1NK5A 4IO9L 3HPOA 4JI0K 1JJ2M 2FBVA 2P9IA 3B8AX 1I39A 5GADP 4OX9K 2YHWA 3HSTB 4GNIA 2UXBK 2YHYA 4CJRA 3SQ0A 4IJNA 1G15A 1NGFA 4PL8A 3U4LA 5CHIA 3C0BA 2WBNA 1HNXK 4H4OA 4CK3A 4H5VA 2HHIA 2HMIA 4BG8A 3QBXA 2Y1JA 2ZJQL 4BRGA 3NH1A 3FGUA 4O5FA 1FKOA 1XMQK 2BUPA 3SBTA 4B9SA 1REVA 2O8EA 5GINA 2UUAK 2A40A 3VENA 1RGIA 1NMNA 2D0AA 1TL3A 2GWJA 5JVHL 4KPYA 4IFYA 3VQ5A 4LSNA 5DMRA 3FR0A 1KLNA 2P9LB 3OS2A 3UE5A 3WXJA 2O8FB 3S3MA 4I6MA 3S5TA 2GUIA 1WBDA 5MLCQ 2GELA 2YHAA 4ID1A 4E7KA 3RRGA 5ELZA 1DKGD 4BDZA 4CEQA 5FRMA 2IVPA 5JS1A 3KK1A 2AA4A 5J2PA 1MU2A 2QEXN 3NFAA 4XH1A 3OYMA 1UA0A 3OYLA 5C0YA 2RPIA 3HM8A 3KD1E 1QQOA 3ZSWA 3H45C 3CFOA 4DUZK 4UY8O 4CEFA 3I0RA 4FK0A 3CM6A 2FSKA 2QW9A 2Z1IA 2VWBA 3BP8A 3RR7A 3D0PA 1YXQA 4V19S 2HHQA 3THYA 1C1BA 3SAFA 4CF2A 5C24A 3JSMA 3QETA 3FZKA 4FM1A 3TANA 5C10A 1EP4A 2PBDA 4C8NA 3TAEA 4BRPA 3CCMN 1YJNN 3LDNA 2CH6A 3N4PA 4B9TA 2JLEA 1Q9XA 2HHHK 5T7BA 1JLGA 4BDPA 2W42A 1NGAA 4BDYA 2B6AA 4CJ4A 4CBXA 1BUPA 3FFIA 2RN2A 4RCHA 4CHNA 3G6EN 3V9XA 5AQSA 2D0CA 4JKGA 3G0ZA 4CF0A 3NH0A 5JICA 5AQTA 4WQ4C 3VPZA 2HMPA 1D9DA 4BY9C 2YCHA 1LW0A 3TAGA 5C12A 3DXKB 1U2VA 2FBXA 3JXUA 2X6NA 5JENA 1VQ4N 3IFRA 4PA1A 5AQMA 4FXDA 3AO5A 3OBWA 4CZLA 4PKIA 1RBVA 3Q7BA 3U3GA 3QEWA 1QQCA 3J81O 5KPRA 5AQUA 1BA0A 3FZHA 4O8KA 1SKWA 4K42A 1HRHA 4JKEA 3VQDA 1VSDA 3GG4A 4JKAA 4JI1K 3U9ZA 4BRNA 3DWLA 4WCEL 3L2QA 4RW4A 4IFEA 1T6CA 4FJXA 2PAVA 1QSLA 2DPNA 4NCAA 1BWFO 4FJLA 3EYZA 2W00A 1XMOK 4IWVA 4FVUA 3LANA 5AQIA 3A8YA 1TGOA 3D2FB 5BPMA 1KQSM 2HNZA 5LJWA 4CJLA 2QM1A 3SQ1A 3QICA 5AR0A 4DV1K 4FK2A 3NVKA 2HSTA 2P9PB 3S41A 4FSVA 1Q81O 2A1SA 1ATRA 2D0PA 4H0TB 3CQXA 5GAEP 2RF2A 4CJKA 5M1FA 4BGAA 1VSMA 1X9SA 1SL0A 1OH5A 1NGJA 5E26A 3NGZA 5HBMA 2ASOA 2VGMA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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