3E02A

Crystal structure of a duf849 family protein (bxe_c0271) from burkholderia xenovorans lb400 at 1.90 a resolution
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
310
structure length
310
Chain Sequence
MKQSKKIIITCAVTGSIHTPTMSPYLPITPEEIVKEGVAAAEAGAAMLHLHARDPLNGRPSQDPDLFMRFLPQLKERTDAILNITTGGGLGMSLDERLAPARAARPEVASMNMGSLNFNISQAAAKFDTFKFDWERPYLAGTRDFILSNTFSQIERGMTELGASGTRFEFECYDVGHLYNLAHFVDRKLVEPPFFLQCVFGILGGIGADPENLLHMRTIADRLFGQDYYLSVLAAGRHQMPFVTMSAILGGNVRVGLEDSLYSGKGQLATSNAEQVRKIRRIIEELSLDIATPDEARAMLKTKGANETSF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Metal binding protein
molecule keywords uncharacterized protein DUF849
publication title Crystal structure of protein of unknown function (DUF849) (YP_555544.1) from BURKHOLDERIA XENOVORANS LB400 at 1.90 A resolution
rcsb
source organism Burkholderia xenovorans lb400
total genus 105
structure length 310
sequence length 310
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-07-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF05853 BKACE beta-keto acid cleavage enzyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3e02A00
4UNKA 1KLZA 2Z0IA 5LNUA 3ZWTA 1VJIA 2OMAA 1TTJA 4JYFA 4K39A 3CPRA 3TXVA 4PL2A 1PCKA 1RQHA 3GDKA 3IGUA 2C18A 2NXHA 8TIMA 3V1PA 3PB0A 4UIOA 2W0UA 4LW7A 3PBVA 1P1XA 3CIXA 5G4WA 3STCA 4QNWA 4FIRA 3LTYA 4NZJA 3THAA 4X2RA 2E6DA 3TXZA 4LVBA 1DQWA 3TC7A 4M7TA 4GBUA 1OFBA 1TV5A 2F84A 2H8XA 2XN0A 2RH9A 1X6UA 4N02A 1BKSA 3EXRA 3QQ1A 4M7SA 1GJPA 3P67A 4JY9A 1ICQA 1JCNA 4K6AA 1H51A 2RDTA 1EWDA 2R14A 4CNPA 3E49A 2V30A 5HR7A 1P5BA 3L9CA 4JX4A 1VYRA 4UFMA 2RDUA 4X22A 4BI5A 3DI0A 3PULA 4CCCA 5BOOA 1JQVA 1EP3A 3CEUA 4O1AA 5LKYA 3BPWA 3LV6A 4BFAA 3OEXA 4OWGA 3TNOA 2WKJA 2ZZ2A 2YSWA 3TFXA 1F2JA 3W72A 3LCGA 4AF0A 5I3FA 3I7QA 1OFOA 1YXCA 2CLIA 4UNLA 3LV5A 2ISSA 3H53A 3FJ6A 5CG7A 2ABAA 4HPXA 2DZWA 3W1AA 1JRCA 1SFJA 3PBUA 3M7WA 4LRTA 2GQAA 4LS1A 3QYQA 1EWEA 2NX9A 4GNJA 1GYLA 3KXQA 4DPQA 4AVFA 3GX9A 1ZNNA 3ABSA 3W73A 2LLEA 3EX3A 3G18A 4MJZA 1K8YA 2CLKA 3KRSA 4OV4A 4JTTA 4GXMA 3T44A 4WZHA 2YGYA 2HSAA 3NL6A 3W07A 2QCDB 2VFHA 2OZ0A 4UTWA 2J6XA 1H7PA 4XKYB 3W7IA 4MY8A 1WOBA 3NQMA 1D9EA 3LBMA 2QJIA 2GJNA 4U4MA 3L5LA 3FYPA 3G8RA 4JD4A 1K8XA 2XFWA 3LXAA 3PUEA 3O63A 1DJQA 1MZHA 2G5WA 4LY8A 4O52A 2E77A 3MI6A 2FB3A 5BMWA 5K4ZA 4QNEA 4KFNA 3G0UA 4JXCA 4K38A 4LRSA 4C1KA 3L67A 3FJLA 1QWGA 3W1NA 5D04C 2QCFA 4CNOA 3DI1A 2RHGA 3BGGA 3M5VA 3N73A 2WSYA 1W5NA 3T7VA 1K7EA 1WXJA 2C13A 3QPZA 3W88A 3ELFA 3W7MA 1H62A 3LI0A 2W79A 1FXQA 3F03K 4ZQOA 1CW2A 5D2WA 4FNUA 4ONVA 4R33A 3ABOA 1P4CA 3TFCA 4UTLA 2P1FA 4OT7A 1GZGA 1KM3A 4MYAA 4RKAA 4RXFA 4LNYA 2PRLA 1PVNA 4JTSA 1O5XA 1FWSA 4N2YA 4QAIA 3EX6A 1NVMA 3R5EA 4DBDA 3RMJA 1YPIA 4JTFA 1M5WA 3FFSA 3IV3A 3CC1A 2CLLA 4TR9A 2FIQA 4Z1CA 1AMKA 3M43A 5D30A 1DQXA 3WJZA 3L21A 3C52A 3TUUA 4K7VA 3SI9A 3S5NA 4WUIA 3GDLA 5FEPA 3EKZA 3GXTA 2DZUA 3M5ZA 5AYXA 3P74A 4WD0A 3FKKA 4O57A 4HN4A 2QF7A 3THQA 1H60A 1F6KA 1DV7A 4IJBA 5LGXA 4HSOA 1G7UA 3W2LA 3LHTA 5EYWA 3E12A 4AHPA 1KBIA 1R2RA 4UR8A 4JTKA 3IRDA 3T78A 2BTMA 1LRNA 1LLZA 3EWBX 4MY1A 3B06A 2E6FA 1WQ5A 4QJ1A 5C54A 3G22A 5CPNA 2E6AA 3QW3A 3PUDA 2C3ZA 3BW4A 5D33A 2NV1A 1EUNA 1XBYA 5FI8A 4ZQNA 1Z42A 3NQ7A 2P10A 3EWUA 1FQ0A 1H7WA 1VCGA 3B04A 1SZGA 4QSHA 1SO4A 3TMQA 1SW7A 3FOKA 3LCIA 3WJSA 4DO5A 3N2MA 1EUAA 1OFEA 3GDMA 5F4WA 4DF1A 5I3HA 3EWWA 3EX4A 1G4EA 4HHPA 2B7PA 3QH2A 4AH7A 3MWAA 5FEXA 2J88A 1ALDA 3W22A 3GNDA 3G1SA 2VEIA 3W74A 1ML1A 2JK2A 2V2DA 1NSJA 3G1YA 1PV8A 4UTUA 2B7OA 1FY6A 1UASA 2TRSA 2A6NA 1T8XA 1XBXA 3BLFA 4ZQRA 2YYUA 3NPWA 4UTKA 1R47A 5U7SA 4QITA 1JJKA 5HQEA 4OBTA 3HGJA 2Z2UA 3KVKA 2QCGA 3LCXA 4HNNA 4LS2A 1RQEA 3WJXA 1GT8A 4MIMA 2CLHA 4IWWA 5D03A 1G67A 5DELA 3S1XA 3P62A 5L6UA 1I2QA 2RFGA 2O7QA 4BI6A 4UTIA 2GPTA 2EHHA 4JX5A 4ZQCA 4M6VA 4M6PA 4XTDA 5CZJA 1YXDA 3UXAA 1T0OA 2ZZ4A 3B03A 3KVJA 3KVLA 3TH6A 5DY3A 3LLFA 5C55A 4O1DA 4FF7A 5DBTA 1PE1A 3B4UA 1H1ZA 1HFBA 2ZA3A 5LNRA 1DOSA 5CZSA 3B8DA 1KBJA 1PCWA 4BI7A 3JR2A 4CNNA 4N6FA 4QIUA 2YR1A 3O06A 5EKYA 4PH6A 3LTSA 4IXXA 3STGA 4DELA 1Z48A 4A2SA 2I9EA 1XUZA 3K30A 4M5PA 5IBXA 4EOUA 3Q58A 1CI1A 2RDWA 3C0JA 3MHFA 5LNWA 2QR6A 5HUPA 1TRIA 4L4LA 2NLIA 2YXGA 4U28A 2V9DA 4OHQA 3PBYA 1MEIA 4O13A 3ANYA 1AG1O 5F1UA 3NZRA 1KFEA 1GEQA 3NPUA 4DF2A 4JTJA 1FWTA 3I7RA 3G1DA 2HTMA 4H3DA 5EPDA 4A29A 5I3JA 3NPXA 1H7XA 4AF0B 1PIIA 1YDNA 2WQPA 4M19A 4JTHA 2OT1A 1ZHAA 1UCWA 1KTCA 2QCNA 1FDYA 2Q3OA 4GJ1A 2C6QA 3CTLA 1Q6RA 5AHMA 3TR2A 1KTBA 4UMAA 5IM51 3W1MA 2Y70A 3G1HA 5E0KA 5AYZA 3DU0A 1VYSX 2E6YA 1M7OA 4FNRA 2Q3RA 1HG3A 2ATMA 2CZ5A 4TU1A 3RLUA 1GWJA 3NL3A 2VOMA 1V5XA 1IXPA 2JKAA 3NQ8A 1RR2A 4CQ8A 4MZYA 3RU6A 4JDBA 5LHEA 4O53A 3W2KA 2ZFAA 1EX5A 2ZA1A 5G2HA 3M16A 3DHDA 3HIJA 1TPWA 3NQVA 4K8HA 2V2CA 1FWWA 1ZCOA 3R13A 4UTHA 3NXFA 1QPQA 3VKJA 3FS2A 5FF7A 3MI3A 1GQNA 2NUYA 5TBOA 3ATZA 3BG9A 4O1CA 4BK9A 1VLIA 3G0SA 1MEHA 3B05A 4OV9A 4AAJA 5HWMA 1JVNA 3LXBA 3HB9A 3O8AA 3P5ZA 1G4PA 5KITA 1ZENA 4PA8A 5HUOA 3ZS4A 1BWKA 2PURA 1GTHA 4ADSA 4I7VA 2ZZ3A 4O14A 4FHAA 3R2GA 3SECA 2HS6A 2CU0A 3DZ1A 3O07A 3QMRA 5EY5A 3W2NA 3BG3A 4BR1A 4WY0A 3E96A 2Y62A 1EA0A 2WNQA 2AGKA 1QDSA 2BXVA 4A2RA 4YWIA 1GVOA 1H7NA 1W31A 3UWZA 5KINA 4LC6A 1KM0A 3TJXA 5FESA 1XL9A 3DFNA 2VFDA 2P0OA 4N9CA 2X16A 4IQLA 4LV4A 3KOFA 2EKCA 1SQ7A 4Q33A 3PM6A 2EAWA 2E09A 3LRMA 1JCMP 1ICSA 1XFBA 1LLWA 5AOUA 4JICA 2A4AA 1RV8A 1G4TA 3EEGA 5C2XA 3HPZA 1LBMA 1KM6A 3UQNA 1TIMA 2IQTA 3NR0A 3W7KA 5KTLA 1O95A 1GPWA 1L9WA 2B0MA 5AC6A 4IOTA 3PF3A 1GG1A 2J27A 1UUOA 4TMBA 1P0NA 1FWNA 1IIHA 1ICPA 1LORA 1KV8A 3C2EA 4FB7A 3AO0A 4NX5A 4JIQA 3W7DA 1PL9A 2Y6ZA 1LCOA 1QPOA 4HKPA 3HJZA 4Q4KA 2OX1A 3LTPA 4JS3A 4O50A 1B57A 2X2GA 3QM3A 1JCYA 1X1OA 2NUXA 4IPIA 4UUIA 2DZTA 2YPIA 2QDGA 4OGZA 1KFCA 5G1YA 2FJKA 2YW3A 4YL2A 5CKSA 3C2RA 3P81A 1OF8A 4PFMA 3EB2A 3VFLA 4DF0A 3GLCA 2PRMA 4A3UA 3NPVA 3QSTA 1OFRA 4NJHA 2DORA 3IEBA 3L0NA 3BARA 2NWRA 3LHUA 2AAMA 3W7GA 4IGHA 3PSWA 4R7JA 4UFJA 1XC4A 3PB2A 4KKXA 3HG2A 2QJGA 4J9JA 3UZJA 3GNNA 3SZ8A 4M6QA 3EKLA 4LV9A 3UWUA 4YMZA 1FCUA 3LCLA 2ZZ1A 3P8JA 4O12A 5F4SA 2Y89A 3CLMA 3S5YA 1TPFA 4PC8A 4DXVA 3S9YA 2NX3A 1B9BA 2H3DA 3O16A 1AW5A 3EWYA 1XXXA 4W9TA 4Z1AA 5HNRA 4O4VA 1F6PA 2VELA 3GKAA 3I7SA 4QISA 2WOQA 5G5IA 2I1OA 3LERA 2QAPA 2ZTJA 3N14A 3TAKA 1KFKA 4LVFA 1KFLA 2C19A 3G3MA 1BWLA 3L2IA 2H3BA 1A5CA 5F1VA 3O15A 2YCEA 5HINA 1T99A 1D3GA 3NO5A 3W1QA 1SO5A 1WV2A 3C6CA 2QUUA 2Y63A 4MOZA 2B7NA 5D2TA 4EWND 1SR9A 5D37A 4PCFA 4TIMA 1OG0A 3W7LA 1VHCA 1FWRA 3I6RA 3OBKA 1LROA 4UFLA 1MO0A 2CFFA 6ALDA 2E5DA 4MUZA 2DZSA 4UR7A 1GVRA 1K03A 3W3OA 3SR7A 4LVAA 2H6RA 3N2XA 2V5LA 3WK1A 4GWEA 2A6LA 3W7QA 4BWLC 1XI3A 2QJHA 5K3VA 2QCHA 3UXDA 3QPYA 4UTJA 3TDFA 4NT0A 5SWUA 1H63A 3SY5A 4NX0A 2VEPA 3CQ0A 1OABA 2BWGA 1QNVA 4FEZA 2WSQA 4ZQPA 2OT0A 5H91A 3G24A 1DL3A 5KSWA 4DEFA 5DCDA 3W23A 5D09A 4RX0A 1Z44A 1VCFA 3IVUA 3NQAA 3UD6A 4O10A 3A21A 3LRKA 4IX0A 4FXRA 5FEWA 4GUIA 5AHLA 4N4QA 3C2OA 3H54A 1TPH1 3D0CA 4EVZA 1NF0A 1VHNA 1QCWA 4KWWA 1TPC1 5AYYA 4FXSA 4MLRA 3HPXA 2VKZG 4TX9A 4ORMA 1SO6A 5U4NA 2GVJA 3NQCA 1G7VA 3QSRA 4I9AA 3NQ2A 3WK2A 1AL7A 4AXKA 4IX2A 3W7HA 4NNAA 2ALDA 3RFAA 1VPXA 2ZTKA 3MHUA 3HGSA 3TQ0A 1N7KA 2QUVA 1PHWA 2QDHA 3DGRA 1SW0A 1B3OA 1X1ZA 3W7EA 4AMAA 3MP4A 5BRBA 5I3IA 3LHVA 1NF7A 1OFDA 2HS8A 3MYPA 1FCVA 3MUXA 3LCWA 1DJNA 1SZFA 3QZEA 2OJPA 1G69A 1FCBA 2W6RA 4FNQA 4IPJA 3NZ1A 1XBZA 5D2YA 1NFBA 2YZRA 4TMCA 4JTIA 1ZAIA 3OHIA 1OYCA 4NXKA 1A5BA 1H7OA 3N3MA 3P5YA 1DORA 2YYTA 4JTLA 3R8RA 2FLIA 3DXIA 3VI2A 3BK0A 5C6MA 1ME8A 4O0ZA 3IGSA 4R53A 5FF0A 4XZ9A 4JNMA 1IF2A 1VGAA 4XWUA 1SU5A 1UBSA 1UJPA 2KZHA 1RPXA 1H7RA 3NAVA 1N55A 3C2FA 4HNVA 3RF9A 1OYBA 1OFAA 1JCJA 3Q37A 1UUMA 1JULA 2A7PA 3DH7A 4E0CA 1Y0EA 5FF4A 3FA5A 4ML9A 2ZRWA 4UTWC 2Y61A 1F76A 1G6CA 3KAOA 5K4XA 3NM3A 3M6YA 4Y6GA 3NL5A 2OCZA 4H6KA 1KM2A 2NWSA 2ZA2A 4JGDA 1P0KA 3KRUA 1HUVA 4H4IA 3W1RA 5C5YA 1X8FA 3TW7A 3QRHA 1F73A 2TYSA 4RZ5A 4O15A 3M5YA 1QAPA 3Q94A 3GZ3A 2GUUA 3PAJA 1IXNA 4Z0JA 1RQBA 4UMBA 5LZLA 4UFHA 3BGJA 3P8IA 1SZNA 3QF0A 2YFNA 2CLEA 2TSYA 3S8HA 1QOQA 2CLOA 2O7SA 4QM1A 4Y96A 3GVGA 4R34A 2VFEA 3IIXA 1JRBA 2A7NA 4MYXA 4NJGA 3T55A 2A7RA 4CCEA 2D73A 4DO4A 2PRHA 5K9DA 3L0GA 3B0UX 1I2PA 2X1RA 1XUUA 1YPFA 5TQLA 2CLFA 3F4NA 1TV7A 5AC8A 3A22A 3VNDA 1LBLA 1PHQA 1W8SA 1THFD 3LOTA 4JDYA 2ZDRA 1F05A 1OX5A 4JR5A 3W1UA 1EPXA 1Z41A 3T40A 2GJLA 3LHZA 4ADTA 4O4WA 3PVFA 1EEPA 1RZMA 3W2UA 2J24A 3STFA 4C1LA 1WYIA 3QMTA 2WSRA 1LRTA 2RKXA 3FLUA 1SUXA 4YCOA 1O5KA 2V8ZA 4FNPA 4KFOA 4S1FA 2E68A 4ALDA 4FO4A 2PE4A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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