3EBVA

Crystal structure of putative chitinase a from streptomyces coelicolor.
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
293
structure length
293
Chain Sequence
SLKHAVTGYWQNFNNGATVQKISDVPSAYDIIAVAFADATTTPGAVTFNLDSAGLGGYTVDQFKADVRAKQAAGKKVIISVGGEKGTVSVNSSASATNFANSVYSVMREYGFDGVDIDLENGLNPTYMTQALRALSAKAGPDMILTMAPQTIDMQSTQGGYFQTALNVKDILTVVNMQYYNSGTMLGCDGKVYAQGTVDFLTALACIQLEGGLAPSQVGLGLPASTRAAGGGYVSPSVVNAALDCLTKATNCGSFKPSKTYPDLRGAMTWSTNWDATAGNAWSNSVGAHVHAL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural genomics, unknown function
molecule keywords Chinitase A
publication title Crystal structure of putative Chitinase A from Streptomyces coelicolor
rcsb
source organism Streptomyces coelicolor
total genus 99
structure length 293
sequence length 293
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-08-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3ebvA00
4B16A 1E4NA 1BSIA 2WMIB 2YDQA 5IXEA 1ISYA 2J7FA 3AFBA 3WNPA 4AZCB 3PZNA 4MJ2A 2XM2A 1GHRA 4JCMA 1MFVA 4D6GA 2XSAA 1WCGA 2O9RA 2VCCA 2EPKX 4XB3A 2A3BA 4EANA 3VILA 4CVWA 3QOKA 4GZIA 3MMDA 3T0DA 3NDZA 3CUIA 1JL8A 3VD9A 1QI2A 3AIQA 1XSKA 1HL8A 2A3HA 1GVYA 1PEZA 1C7TA 2CBJA 3WQ5A 2FHBA 4B15A 3BAJA 4CN1A 4UZUA 2G3NA 1V6YA 3VVGA 2DSKA 4WF7A 2XIBA 2YDRA 3PZMA 4JKMA 1EHNA 5JBFA 3WSUA 1WZLA 3WFZA 3BXWA 4AZ5A 3RO8A 3BSHA 1B2YA 4H2CA 2IUZA 3K8LA 1LG2A 1UKPA 3S2CA 5A3HA 1KR0A 1GONA 4BQ5A 3BAIA 4OOUA 1XD0A 2OYMA 2GJRA 4MAZA 1K9EA 3VIPA 2G8ZA 3WH5A 2CITA 1OGSA 3WD1A 4D1JA 5CXPA 5GPRA 2W63A 4UQBA 1UZ1A 3VIFA 3L4WA 3MANA 3AIRA 3FHAA 3NCOA 4W8AA 3DECA 1TA3A 1FH9A 1TVPA 3GBDA 3VINA 2BHZA 3ARTA 5DT5A 5A6LA 5CG0A 3CZLA 3WD2A 3WF3A 1O7AA 1JXKA 1UD4A 1FP8A 5A2CA 3WNNA 4HPHA 1ZL1A 4MPKA 3VDHA 1GPFA 2QLYA 1H41A 3VX1A 1IZKA 1W1VA 4P7NA 1W9XA 2WVVB 8A3HA 2F8QA 5CGTA 3WN6A 3II1A 4UQCA 1C93A 1XCWA 3VD5A 1EO7A 1ISZA 1H1NA 4PMNA 1GOQA 4P8XA 3UG5A 4TVDA 1E71M 1B3VA 5BXRA 4BQ4A 1M04A 1DWIM 3AMLA 3THDA 3I3DA 2V3FA 1W3KA 2VRJA 1LL6A 1V6XA 4U2ZA 4V28A 1NM9A 3L4UA 5ABGA 3CH9A 2ZUVA 3WD0A 1UWSA 3LPFA 2UWFA 1E5NA 4P7QA 2VI0A 4IPLA 2V3DA 3I3BA 3ZIZA 1UWTA 1ESWA 1JZ5A 3UR8A 4TUFA 4UQDA 3PZGA 4UTFA 5I77A 1JGIA 4NI3A 4PMYA 4GI8A 1MXGA 4E2OA 4WKFA 1UKOA 4W7VA 3ZT6A 1BF2A 2CPUA 3T08A 1UWUA 4QAWA 2XM1A 3O6AA 4CN6A 3AZRA 1LWJA 4AC1X 5CPQA 2A3CA 4MADA 1NP0A 3N9KA 4KRUA 4M8UA 1VFMA 3AMCA 1MW2A 4AXNA 1CGUA 2XVLA 1NWRA 5JBEA 7CGTA 3WIJA 3ZJ7A 2GFTA 1PIFA 3OGVA 4RE3A 5A6AA 2J7DA 5AYBA 2XVPA 1JAEA 1BHGA 1AQ0A 4GIAA 3AHVA 3W0KA 2BFGA 5I79A 1GHSA 3QOMA 3SCPA 1B90A 1LLOA 2BVTA 1UUQA 3VMPA 1PIGA 3VDCA 3AIBA 2WSPA 1BYBA 4PBGA 1XSJA 2DT2A 2CCRA 1BPLB 2G41A 1N82A 2IXVA 1ITXA 1V6WA 3MMWA 2GDUA 1QI5A 5I5RA 2WHJA 2QHAA 3W37A 4PSPA 4WSJA 5DFAA 2CBIA 4CVUA 3W4RA 2VRQA 4HU0A 4LQ1A 3CUFA 2Y24A 1GCYA 1B3ZA 4JKKA 3GNPA 4WJXA 4CD8A 3WY1A 4D71A 1S46A 2EPMX 1GW1A 3AOFA 2XPKA 2JE8A 4JFTA 1QBAA 3WEZA 4AMCA 1XH2A 2WVTA 3CZ8A 1PAMA 2E9MA 4K68A 4S3KA 1JNDA 1R87A 3PZOA 4IPNB 2ZUNA 3RM4A 3CGTA 3WBEA 2WCAA 3EMQA 3IANA 1L8NA 3VGFA 1J10A 2D20A 5JIPA 4JFSA 4Z2IA 1XHGA 2WVSA 3VGEA 3PZTA 9CGTA 4H8VA 3GXMA 1H0IA 3VIHA 3L2LA 3TA9A 1EO5A 2D22A 4GZEA 1C8XA 3WQ6A 1UR9A 4GQRA 2XFFA 2XWDA 3UERA 1HN1A 5AYIA 3AHZA 1AQHA 1W91A 4AZBA 4LXFA 5DMYA 1ECEA 4BA0A 1GQLA 4P7LA 3RILA 2ESCA 4AW7A 1M01A 3DHPA 4FK9A 3N17A 1J12A 4TXEA 3ALGA 1X6NA 5HPOA 5GNYA 5E6YA 3SUUA 4PTVA 2J7CA 1WP6A 3RDKA 3RM8A 4AYSA 3QGVA 2PWGA 1FH8A 2CHNA 3BLPX 3N1AA 2OYLA 3ZQ9A 1V6VA 2DIJA 2A3AA 2ZUMA 4HP5A 4MJ4A 3B9AA 2WAGA 1ODZA 4W5ZA 3PZVA 4MNJA 1GOKA 2JIEA 3F5JA 3FHQA 3K4DA 2WC4A 1FFQA 2X0HA 1QHPA 3BMVA 1ZBCA 1RP9A 4QLJA 3WH7A 2WWDA 1R85A 5D9MA 4W89A 3CPUA 3HN3A 2WWCA 1W9VA 1HNYA 5A8MA 3VPLA 2XGBA 2DGAA 3TTSA 2W4XA 2D3NA 3WD4A 1GQIA 1WZKA 4UOJA 3N04A 5AC4A 3GNRA 1D3CA 5LA2A 3WEOA 4FMVA 3VM5A 1UQYA 1O6IA 3WF4A 4W88A 3T09A 3ARQA 2WC7A 5A69A 2XFYA 2YJQA 1B0IA 1C8QA 3T0AA 4PMXA 3OLDA 2AOSA 2CKSA 1UG6A 1PZ3A 4KRTA 2YA0A 5BROA 4QFUA 4HTYA 3ZR5A 2WHKA 2G3MA 1E0WA 1CGWA 1GUVA 3CUGA 4PMOA 4PEEA 4HOWA 3POCA 1V3MA 3ZJ8A 3I3EA 2G3IA 5A1AA 2XIIA 1HIZA 4W93A 4HU8A 3W27A 1WB0A 1H3GA 5FL0A 2JALA 1QI0A 2ZIDA 3CHCA 4TX6A 3N18A 1NQ6A 4QCFA 4BZYA 2EQDA 2BVDA 4AD3A 3SUTA 3K4AA 3AS0A 3VIOA 3AI0A 4H04A 1AVAA 3EDDA 3G6LA 3EMZA 2NT0A 2RGLA 1JDAA 4AD5A 1JNEA 2G3JA 1VFOA 3EDJA 3M6DA 2DSWA 5D9PA 3WMSA 2PWHA 2OSYA 3D3AA 2XG9A 3A4WA 2OYKA 1AMYA 1UA7A 7TAAA 4W85A 4JL1A 4FLRA 4BF7A 4D6EA 1WZMA 2VZVA 2ZXQA 3UEQA 1NP2A 3L4TA 3GDBA 1OB0A 2DT3A 5D4YA 3WEMA 2ZX5A 1Z32X 2V3GA 4JFUA 4J28A 1ISWA 2BVYA 3BMWA 1E70M 4PMZA 3KZSA 4AWEA 2ZE0A 2WNWA 2YLAA 5A6KA 4MB3A 4RE2A 4JFWA 2C8NA 3AYRA 1HP5A 4NF7A 4GXPA 3VU2A 2YL8A 4JL2A 1LJYA 3MUAA 3VIMA 4AD0A 3W82A 3WH9A 3A47A 4UQEA 3VMOA 1V08A 2EPOA 2J25A 2WSKA 3NIYA 2VR4A 5FCZA 3WDRA 2JFEX 2EPNA 1VF8A 2JEPA 1SMAA 3TP4A 2CNCA 2CXGA 3O9NA 4HZ8A 2J4GA 2D0GA 5CSUA 3N11A 4ZEPA 3GTNA 2EXOA 1HX0A 5M5DA 1V3LA 1E5JA 2GK1B 4CGTA 5D9NA 1E3XA 2X2YA 2FGLA 1HL9A 3OLIA 5HXMA 4HPGA 4CD4A 1U30A 3SCRA 1VJSA 3AICA 1ZJBA 2CYGA 1TR1A 3CZKA 3HU7A 4H8HA 1QHZA 2ZXBA 4MNKA 4AEEA 1EOKA 2ZUUA 1HF6A 3KL5A 5EB8A 4AD2A 1EDGA 2BY0A 5AY7A 2WVUA 2X8RA 3W29A 1V3IA 3IJ9A 2WC3A 4W86A 3L4ZA 1UQZA 4GI9A 3WUEA 1QNRA 2ZX6A 3ECQA 5EFFA 3SURA 1CWYA 1XH1A 5A6BD 4PMRA 2WMGA 2YA1A 3MO4A 4GINA 3D5HA 5F7UA 1W3HA 3IAQA 5A2AA 3AHYA 1I1XA 4GKLA 3AMDA 1KCLA 2XSBA 4PUDA 2CERA 5A8OA 2CBVA 4QLLA 2YL5A 1HP4A 4GI6A 1TMQA 2Y2WA 3UG4A 2IXUA 1XD1A 2D24A 1Q6EA 3WUBA 1U33A 2XHYA 4MDOA 3ZSSA 4DWSB 1EDTA 2BY1A 1OT1A 1Q6GA 4D6IA 1CXEA 1E0XA 2FH6A 3GH5A 1QNQA 2NSXA 1OGBA 4Z2LA 4EE9A 1OT2A 4D6HA 4WIWA 5A95A 1CXLA 1UD8A 4C7GA 4J27A 4M24A 1JYXA 1BVZA 3UG3A 3CZJA 1OIMA 2J78A 2BY2A 3ARVA 5E0FA 4RL3A 4OIFA 4WKAA 3VD4A 1BYDA 1MFUA 2VCAA 4V2XA 2DIEA 4TVCA 1V3KA 1UKTA 1WKYA 1NOWA 4UFIA 3AS1A 3U5UA 4JIEA 4AIOA 2ZX7A 1JZ6A 4F9JA 1LL7A 4CU6A 3OZPA 2WHLA 4FLOA 1J0IA 5TD4A 1GQJA 4PYSA 2YOCA 1MW0A 3OZOA 1M7XA 3VGBA 1QOXA 2WMFA 3CLWA 4TVUA 5A6SA 1HVQA 5ABFA 4QLKA 2BHYA 4AY1A 2X05A 1KR1A 3EYPA 4X0NA 2J77A 2WZEA 4B3LA 2XFRA 1VB9A 3WMCA 3AS2A 1CGVA 1CLVA 3AIUA 4ZENA 1JG9A 4UZSA 1CECA 1BQCA 3NUKA 4PTXA 4X9YA 3ZO9A 1XYFA 5I6SA 3A3HA 3OLEA 3MUZ1 2XUCA 4S3JA 3WDHA 2PWDA 1QNSA 4ATWA 4PSRA 3DYOA 3NYDA 3ZOAA 3PBGA 3GBEA 4AIUA 1DWGM 4UFLA 3CUHA 1PX3A 3ARWA 1FFRA 2QPSA 3CUJA 3MV01 2E9LA 2CBUA 1EGZA 2J62A 1E9LA 4H41A 4HA1A 4TOQA 2VMFA 1XYZA 4ZXLA 1MW1A 2WCSA 5GQBA 4URIA 1CGTA 2Z1SA 2BV9A 1JI2A 1BGGA 4AEFA 4M56A 5A94A 5ABHA 1VAHA 4KGJA 1OSEA 1DWJM 2ZICA 2CEQA 5HDRA 1QBBA 1KQZA 1G9HA 2D0HA 1JD9A 4HOXA 5C8BB 1K9TA 1V3JA 2WPGA 3WFLA 5HOSA 2Y8VA 3KWXA 3RJXA 3F4VA 3WD3A 4R5EA 2O9PA 4UQAA 5E0CA 1Q6FA 1C8YA 3WNKA 3WF1A 1RP8A 4RE4A 1UR0A 4J3UA 3WQVA 4J3TA 2E8ZA 4GO8A 3THCA 1ZS2A 3VD3A 1PX4A 4WSKA 2VZOA 4Z2JA 1Q6DA 1H11A 1C3FA 1JDDA 2OWCA 2WZHA 1KB3A 1UKQA 5KEZA 2DSUA 1IT0A 3M46A 2YL6A 2EPLX 5FL1A 3SUWA 3MUIA 1MYRA 2ZUWA 1MW3A 4P8VA 3PHAA 3U7BA 3VTRA 1DHKA 4HA3A 2ZWYA 1SMDA 1PBGA 2MANA 3BAYA 5LA0A 3OLGA 1HKJA 4OOZA 2DT1A 1GOIA 5E6ZA 1CBGA 3OA5A 1V0MA 2J8FA 2WCGA 1EH9A 2J75A 2E4TA 3PN8A 4AD1A 1JF5A 1E40A 2V3EA 4W8BA 2B31A 1KBKA 3POHA 2D2OA 1OD0A 4CU7A 3OIHA 3OGRA 1CTNA 2W92A 1QVBA 2OSXA 4GO9A 3MUY1 4YPJA 5IHRA 4W87A 4UQ9A 1HJVA 3AIEA 2JF7A 3WF2A 1NWTA 1W9UA 2WANA 1VFFA 3SCWA 4ZE5A 4E8DA 2X09A 4PTWA 3AZSA 1WDPA 1E6XM 1OBAA 1MWOA 1R7AA 4LX4A 4AZ6A 2VZUA 3T0BA 3ARZA 1RD6A 1TA3B 3TONA 1OWQA 3ARSA 2WBGA 5IFPA 1F4HA 4BCEA 2VR5A 3U7VA 1GORA 2VQTA 4L4OA 1TE1A 1HJSA 2ZWZA 5KZ6A 4U31A 4M1RA 2J7EA 1H2JA 1WDRA 3ZT5A 2EBNA 2QPUA 2VC9A 1TCMA 5D8WA 2FHCA 3KL0A 4UFHA 7A3HA 3OBAA 3LMYA 4TTUA 3SCUA 2GK1A 3IK2A 1R8LA 1VEOA 2PF0A 4FLQA 1W2VA 1CGYA 4PCTA 5I0DA 4N42A 1US3A 2HVMA 5BXPA 3OB8A 1B3WA 2PB1A 4ATLA 3FW6A 5CLWA 3ZMRA 1D2KA 1M53A 5GNZA 2WM0A 2PWFA 1UWRA 3GXFA 2WMIA 1UH3A 1ZBVA 4B9ZA 4XV0A 3CZGA 4U3CA 2WHMA 1MQPA 2W67A 1K9FA 4AZCA 2OSWA 3WDJA 2J7HA 2VOTA 1E4MM 5BYWA 4H8UA 3SCSA 3SCQA 3BC9A 5CLTA 2ZX9A 1UR4A 1M03A 1C7SA 3BCFA 1R86A 1JZ8A 2DH2A 4Y7EA 2V38A 2YBTA 4DWSC 2E3ZA 5EBAA 2DQXA 3AISA 5CPTA 5E70A 4WK9A 1MQRA 3VOCA 3NSNA 3CIVA 1IZJA 1UYQA 1V6UA 4DWSA 1OCQA 2BS9A 2WLZA 3TTYA 4CCDA 4P7RA 5JUVA 1EDQA 3QHNA 3EMCA 1E15A 4WKHA 4P8WA 1J0KA 5CQ1A 4A3HA 2J7GA 1KWGA 2W91A 2XVKA 3BSGA 2ZUTA 3CHEA 4V27A 3APGA 1W1TA 3WH8A 3AS3A 1QI4A 3WELA 1QW8A 3LPGA 4R27A 3HMCA 1A47A 3N15A 4JZ5A 4EK7A 5ABEA 1KXTA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4B16 A;  1E4N A;  1BSI A;  2WMI B;  2YDQ A;  5IXE A;  1ISY A;  2J7F A;  3AFB A;  3WNP A;  4AZC B;  3PZN A;  4MJ2 A;  2XM2 A;  1GHR A;  4JCM A;  1MFV A;  4D6G A;  2XSA A;  1WCG A;  2O9R A;  2VCC A;  2EPK X;  4XB3 A;  2A3B A;  4EAN A;  3VIL A;  4CVW A;  3QOK A;  4GZI A;  3MMD A;  3T0D A;  3NDZ A;  3CUI A;  1JL8 A;  3VD9 A;  1QI2 A;  3AIQ A;  1XSK A;  1HL8 A;  2A3H A;  1GVY A;  1PEZ A;  1C7T A;  2CBJ A;  3WQ5 A;  2FHB A;  4B15 A;  3BAJ A;  4CN1 A;  4UZU A;  2G3N A;  1V6Y A;  3VVG A;  2DSK A;  4WF7 A;  2XIB A;  2YDR A;  3PZM A;  4JKM A;  1EHN A;  5JBF A;  3WSU A;  1WZL A;  3WFZ A;  3BXW A;  4AZ5 A;  3RO8 A;  3BSH A;  1B2Y A;  4H2C A;  2IUZ A;  3K8L A;  1LG2 A;  1UKP A;  3S2C A;  5A3H A;  1KR0 A;  1GON A;  4BQ5 A;  3BAI A;  4OOU A;  1XD0 A;  2OYM A;  2GJR A;  4MAZ A;  1K9E A;  3VIP A;  2G8Z A;  3WH5 A;  2CIT A;  1OGS A;  3WD1 A;  4D1J A;  5CXP A;  5GPR A;  2W63 A;  4UQB A;  1UZ1 A;  3VIF A;  3L4W A;  3MAN A;  3AIR A;  3FHA A;  3NCO A;  4W8A A;  3DEC A;  1TA3 A;  1FH9 A;  1TVP A;  3GBD A;  3VIN A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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