3EJ1A

Cdk2/cyclina complexed with a pyrazolopyridazine inhibitor
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
298
structure length
295
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLTEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase/cell cycle
molecule keywords Cell division protein kinase 2
publication title Synthesis and evaluation of pyrazolo[1,5-b]pyridazines as selective cyclin dependent kinase inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 80
structure length 295
sequence length 298
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2008-09-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3ej1A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3ej1A01
5L6WL 4NEUA 4BI1A 1Q24A 3WYYA 4FSQA 3E87A 1QPDA 2R3QA 1IG1A 3HV7A 3CD8A 2QODA 4C4EA 2R3LA 4IH8A 3JR1A 1WBSA 2VWZA 3ORPA 2B0QA 4JDIA 4P5QA 3ACKA 1JBPE 4A4OA 5L2QA 4AOJA 4XG6A 3BYOA 5AUVA 1XO2B 4AN3A 4LQMA 1JOWB 2C68A 5CT7A 2GS2A 2C30A 3R8UA 3RALA 1LEZA 1GIHA 1PXIA 4DF3A 4G31A 1G3NA 1PKDA 4PNIA 3RWQA 4OBQA 3DNDA 5HG5A 4DT8A 2C3IB 3IW6A 3L9PA 4IAAA 4A9YA 4MF1A 5LMKC 5ANOA 1SMHA 2WU6A 2CLQA 1Y91A 3GU8A 4FC0A 3P7BA 4WKQA 1ZAOA 2OG8A 3QTZA 2C69A 4BKZA 1Q8WA 4ZTQA 5HX8A 3WILA 5HBJA 2O3PA 3PIXA 3BYVA 4S2ZA 2PZYA 4HYUA 2DWBA 4GT4A 4CFMA 5IA2A 4WO5A 4O84A 2BTSA 3LCKA 5E8VA 4EHGA 1IAJA 3GB2A 4UZHA 4RWIA 3BBTB 4ITHA 4RIXA 2R3RA 3ELJA 3A8XA 4O0XA 1K3AA 3OFMA 4O0RA 4FL1A 4I0RA 3ZRLA 5AUWA 1FMKA 3NW5A 3LM0A 4FG8A 1WVXA 3FMDA 4I93A 4E7WA 4DFUA 4JNWA 5E8SA 4Q2AA 3VUIA 2QOIA 1CKPA 3NDMA 3NR9A 3RNIA 1QPCA 5AWMA 3ZDIA 1KOBA 2WQOA 5E4HA 3A60A 4GV1A 4L7SA 4BFMA 5HORA 4BF2A 1FMOE 1WBVA 3JVSA 1O9UA 2BZKB 2W4OA 3F3ZA 3E62A 4X3JA 2XJ2A 3NS9A 1H4LA 5IUIA 1Q8TA 4EQUA 4CTCA 5I9YA 4DG2E 3ZONA 2JLDA 3DNEA 5CT0A 5EW8A 4XS2A 3UVRA 5HVJA 3K54A 3DXQA 2XM9A 4O2PA 5C03A 3R9HA 3G33A 2GTMA 4TYJA 5CS6A 2UVYA 3AC4A 3IO7A 4JIKA 3PIYA 2J90A 3E8CA 3ACJA 3QRIA 4C2WA 4ID7A 3CP9A 2ACXA 3UYTA 3GC0A 3QCYA 1BL6A 3S3IA 4JXFA 3V6RA 2HENA 4PPBA 2OJFE 4RLKA 5M51A 5IDPA 4G34A 5HLWA 3BQCA 4O38A 4TWPA 5DIAA 5HNIX 3I0QA 5IF1A 2C0IA 5JFSA 2JKQA 4UN0C 3OUNB 5BYZA 4FTNA 4RFZA 3ETAA 2GNJA 4YJOA 4CEGA 5DG5A 4S33A 4GSBA 4GYIA 5AR2A 3VUGA 3DJ6A 3O8UA 4P4CA 5TT7A 3P78A 4AFJA 4X0MA 4IWQA 4NFNA 4RJ3A 5ANIA 1M52A 5D9HA 4PDOA 5A4CA 5A4QA 3VAPA 3FXXA 2Y7JA 5BVFA 5GIPE 4FTTA 4R3PA 3QX4A 3PXZA 5AP1A 3R7IA 2A4LA 2VUWA 3R2BA 4YZNA 4E5AX 3G0EA 1DI9A 2X4FA 3JYAA 3POZA 5J5SA 2A2AA 3BHVA 3S95A 4BTMA 3KF7A 4RX5A 2XYUA 3TNWA 2C5NA 1OM1A 1MUOA 4U7ZA 4CZTA 3HECA 2IJMA 1P4FA 2XUUA 4RC3A 3RAHA 4G17A 3F5PA 2GMXA 1PXNA 3BHHA 4BDKA 4OTRA 2I0EA 2X8DA 3OCBA 4KS7A 3GI3A 1R3CA 5CWZA 1ZYCA 1TQMA 5DHJA 3UP2A 5HLPA 4IZAA 1OBDA 4LUEA 4ZTLA 4O0TA 2ESMA 4WNKA 2PVLA 3R71A 3EOCA 2BAKA 2PE1A 4M67A 1YXVA 3VS0A 1MRUA 1KV1A 4JAJA 3EQCA 1R78A 3EN9A 4KBAA 3PUPA 4NM3A 4UB7A 3RK7A 2OIDA 3GU6A 4D2PA 4F7LA 1PMVA 2JDVA 3Q60A 4AZSA 4WG3A 3NWWA 2C3LA 3PRIA 2PY3A 4HNFA 3IG7A 4IVBA 5F4NA 4XH6A 4L67A 3SX9A 5C4LA 3E64A 3MPMA 4GU9A 1OIQA 2XNEA 4I0TA 5M56A 4K8AA 1OL6A 1S9IA 2OJJA 5KNJA 4BZDA 3B2TA 1PXKA 3BLQA 3GC8A 3ORNA 3LPBA 3QGYA 4IDTA 3ITZA 1KE8A 1FQ1B 1PXOA 1TVOA 2RFSA 3NIZA 4U9AA 3DAJA 5EHYA 3NAYA 3G6GA 4M13A 2XIYA 3DZOA 3GFWA 3BWJA 3WF9A 3VBVA 3RBWA 5HBEA 5JFVA 4IX3A 5DT3A 3ZLYA 4HZSA 1OPKA 3VQHA 4AU8A 4D2TA 1YXXA 4XCUA 5KO1A 4AT5A 3L9NA 4RG0A 3WARA 2ZV9A 5M55A 4U44A 3KRLA 2GFCA 4TTHB 4O81A 4QMTA 2YIRA 3R7EA 4DBXA 5E8ZA 2O0UA 4CTBA 1H28A 4RJ8A 4UBAA 3QHWA 4TZRA 2G1TA 4FG7A 3UO5A 4JX7A 2DQ7X 4R1YA 4RWJA 2UVXA 2YABA 3QKLA 1T45A 5JEBA 1OUYA 3GCQA 5J9ZA 4QNAA 4D55A 2Z02A 3AT3A 3MY1A 4FVQA 3UOHA 4OAUC 2GDOA 2OGVA 3PPJA 2ZJWA 2PWLA 4Z16A 4PL3A 5CI7A 5FDXA 3LCTA 4GVJA 5FTQA 3TL8A 1GZNA 5BVEA 3H10A 3R7UA 3WZDA 2XCKA 3ZMMA 2RF9A 5B2LA 3AMYA 4FTUA 5L8LA 3UPZA 4IACA 3DZQA 3VNTA 3LJ0A 3UDBA 1YOMA 4I6BA 4QP6A 4FKSA 4IM3A 4FZFB 1W0XC 2BR1A 3SLSA 2PMOX 4CV9A 4EOOA 3RMFA 4B99A 2E9VA 1P4OA 2VO6A 4L00A 1FVRA 3BLRA 4BCNA 3FLNC 3UQGA 1PY5A 4G6NA 3UODA 1Y57A 5JZNA 4Z3VA 4JG8A 3G15A 4FF8A 1WBPA 3R22A 5TO8A 4EOSA 3HNGA 3OCGA 4ZSJA 2X7FA 3KQ7A 4FEQA 4Y73A 2OI4X 4ORKA 4R5YA 1BMKA 4JT3A 4DH3A 4FX3A 4QTCA 4XEYA 3VWAA 5J5TA 4H1MA 4ITJA 1YXTA 2Y9QA 3GQLA 3P86A 3BGZA 4EJNA 1XH7A 4XRJA 5A4TA 5AP6A 2PVRA 2BRNA 5T3QA 3THBA 4BTJA 1CSNA 3LZBA 4LRJA 2OXXA 3OZ6A 4B6LA 4UV0A 4F9AA 3U6HA 4FTRA 4Y46A 5LARA 2BKZA 2J2IB 3BX5A 3CPBA 2P4IA 5CSWA 3L1SA 1YKRA 5JFXA 4RC4A 5AUXA 5HQ0A 3FKOA 1PXLA 1YWNA 5BYYA 2Z7QA 4CNHA 2RGPA 4GK2A 4EK8A 2W0JA 3DDQA 3FQEA 3QC4A 3T3VA 3MVHA 4CLJA 5HU9A 4AZVA 1BUHA 4NSTA 5D7VA 1K9AA 5TKDA 2ZV8A 3DAKA 3MH3A 4GT3A 3C4FA 5AM7A 5IKWA 5L2TA 1O6KA 4FZ7A 4IMYA 2HZNA 2YZLA 2JC6A 2UW6A 4C35A 3A7GA 5HX6A 2OXDA 3OWPA 4BCMA 3NUUA 3NMUF 3QCQA 4YC3A 2WFYA 2OJGA 2W05A 1UVRA 2FGIA 4FT3A 4M69A 4RIWA 5DA3A 3GOKA 3R7GA 2QHNA 3UJGA 4AGWA 1FPUA 3W8QA 3CY2A 4HPTE 2PZPA 3U51A 1URCA 4NM0A 5KX8A 4K33A 2J0KA 2YDIA 3HMNA 3I6UA 4QP1A 4C4HA 3Q9WA 1A06A 3HDMA 4YJQA 2RFEA 5IH6A 4BDIA 4PTCA 4EEVA 1H26A 4P5ZA 3VUMA 3U54A 1UWHA 3QRKA 4OTQA 1J7LA 2XKEA 3EKKA 3M2WA 5EDQA 2WTKB 3UQFA 3NSZA 4LGDA 5AP3A 5J7BA 4U45A 4FTIA 4AZTA 5FTOA 1XH6A 1ZOEA 2JD5A 4UMUA 5B7VA 4QPSA 4QP4A 5IUGA 4EYMA 5DGZA 3DK7A 1RJBA 5AP0A 5DOSA 4E93A 1U5QA 4C4IA 3SDJA 4O7ZA 3O71A 3SQQA 4D9UA 4EK4A 2VWWA 3KULB 4ZJVA 1QCFA 4FKTA 5LWNA 3RPOA 3KXXA 4D1SA 4FG9A 1VZOA 4FBXA 1P14A 4QYFA 3KXGA 4MXXA 3NLBA 4RVKA 3AC5A 1X8BA 3D5XA 4L44A 3UO6A 2LAVA 3BPRA 3D2IA 4A9RA 3MIYA 2ZM1A 2I6LA 3AG9A 4O27B 2VWUA 4I6QA 3E88A 2WELA 4U79A 3T8OA 4TXCA 5M08A 3PXQA 3QCSA 4I94A 1TKIA 1V0BA 4HZRA 4I5PA 1PYXA 3VQUA 5KMMA 4FODA 4II5A 3LFQA 3R7YA 2PVKA 4XG3A 3OWKA 4QP3A 3S1HA 3DJ5A 3V51A 3FJQE 5IQCA 1YOLA 1GIIA 1W98A 4NW5A 5TF9A 1JSVA 3FI4A 4FNYA 3UPXA 5DR2A 2YM3A 4ANSA 1XH5A 5E8XA 3PZHA 4YC8A 2CKQA 3OOMA 4RWKA 5JH6A 2UW5A 2HW6A 4ZLZA 4AUAA 3CPCA 4R3CA 2ZM4A 3LE6A 4QO9A 3ZLWA 5CASA 1NXKA 4I24A 3OP5A 4BKYA 5LOHA 4YJTA 4BGHA 2XK4A 3ALOA 4MD9E 5K5XA 4XOYA 5EKOA 2ITZA 4AGCA 3CLYA 4FIEA 4B0GA 1HCLA 1RQQA 3SOCA 5C8MA 3BE2A 4WSQA 4PV0A 4FT5A 3A7HA 4QP8A 3I7BA 5CAOA 4ANMA 4QMLA 4DTAA 2KULA 3Q4TA 4F1OA 2ZAZA 3OHTA 4EORA 2WMAA 5AV2A 3BI6A 2W1EA 3KN5A 2O65A 4FV8A 4TNBA 4JDJA 1JVPP 3DV3A 3Q4ZA 4U5JA 3AXWA 5KCVA 1ZZLA 4DH1A 5FQDC 1OVEA 2X2KA 3QRUA 2W1GA 3CKWA 4HJOA 3UIUA 3V6SA 1OIYA 2IVTA 4MXZA 3CSVA 1WBNA 2W5AA 4Y5QA 2YHVA 3B8RA 2ZDTA 4CKJA 3H9FA 2C1AA 1QPEA 3MA3A 3GC7A 4ANLA 3KGAA 4IAIA 2QNJA 2YITA 4OBOA 2FB8A 3GENA 2WO6A 3A7JA 3QKKA 1WVWA 2F7ZE 1MRVA 3O23A 1Z57A 2C3KA 4BICA 5JFWA 2I7QA 2GU8A 3EZVA 4F63A 5K3YA 3UZTA 5BUEA 1OKVA 3GNIB 1OKWA 4LOOA 1IAHA 3E5AA 4PPCA 2CHLA 2XK7A 3KB7A 4FTCA 4M0ZA 1OI9A 4AAAA 2PYWA 2BHEA 2C6LA 2B9JA 1MQ4A 4FT0A 5E8YA 1FOTA 1KE9A 2WTIA 3FHIA 2HK5A 4WIHA 2W1CA 5EK7A 1ND4A 3CR0A 5KMKA 3UGCA 3HA6A 1NY3A 3QD3A 3TDWA 3H30A 4Y8DA 4FIHA 3DY7A 5C01A 4YHTA 3R73A 2V7AA 4BRXA 4BCGA 4DFYA 3HV3A 4A9SA 4E26A 1ZYSA 2PE0A 2XBAA 3EL7A 3K3IA 1W83A 4U42A 4XHKB 3R1YA 3ZLSA 3R8PA 3SAYA 4IAFA 4L6QA 4G16A 4IM0A 5J95A 2ITTA 4IXPA 2OIQA 4R3RA 4CLIA 3DU8A 2UZVA 1Y8YA 3A2CA 3DTWA 2B1PA 1ZMWA 3O17A 1HOWA 4WA9A 4A4XA 2QR7A 2PMIA 3BKBA 2PVYA 2Y4PA 5DEWA 4B8LA 2R3GA 3CXWA 4EZ5A 2F7EE 3G0FA 3OCSA 4M12A 1PMUA 2ZM3A 3AC2A 4D4VA 4F70A 1LR4A 4L53A 4BC6A 2XP2A 3UQCA 1PXJA 2RFDA 2WB8A 3BYUA 4YBKA 2WXVA 5EQYA 3NYOA 4J98A 1AGWA 3EQBA 4GK3A 1L3RE 2J0MB 5HTCA 5JKGA 2FYSA 3EYGA 4ZTNA 3UBDA 4L43A 3BCEA 3UVPA 1H1RA 5CQWA 4D4RA 4FKLA 4DN5A 4NUSA 5JQ5A 3PA3A 3V04A 1OKYA 4ANBA 1B39A 5L3AA 1M2RA 5LCKA 3LLAA 3TDVA 4XG7A 3ANQA 5HO8A 4M68A 3ZZWA 5H3QA 3ATTA 2EUFB 2W96B 2WIPA 1YXSA 1T46A 3MTFA 5HBHA 3BV2A 3ZBXA 1Q4LA 4NWMA 4DT9A 3ZSHA 3U4WA 2Y6OA 3DKCA 4GIIA 3FWQA 3EFJA 5FM2A 4ZJJA 4G3DA 3UTOA 2XB7A 5LCJA 3UOJA 3U55A 4JX3A 2P2HA 4CT2A 5HTIA 4EWQA 4I92A 5KMJA 3KVWA 3VS7A 3F9NA 3OTVA 3DXPA 5GIOE 1BL7A 3D83A 5DH3A 4DGGA 2OZAB 4ALUA 5E9EA 5FEDA 4KSPA 5F1ZA 2R3KA 4FGBA 2X9FA 4YC6A 4DYMA 3DKFA 4FV6A 5H8EA 3OS3A 2NPQA 5IA3A 2QOQA 1PHKA 2GNLA 3R1SA 3TUDA 2G2HA 2WTVA 3CQUA 4OT5A 5AUUA 1IEPA 4OLIA 3H3CA 3WF8A 2XEYA 3FQHA 3LFEA 4MBIA 4ZY5A 3FQSA 4JR7A 3RM6A 4FNWA 5I9UA 4RZWA 1JSTA 3FKNA 3LFFA 3F2AA 3FMJA 4V0GB 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