3EKUA

Crystal structure of monomeric actin bound to cytochalasin d
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
372
structure length
362
Chain Sequence
EVAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTEEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELKDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMEACGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Contractile protein
molecule keywords Actin-5C
publication title Crystal structures of monomeric actin bound to cytochalasin D.
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
total genus 123
structure length 362
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-09-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ekuA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ekuA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3ekuA03
4CBXA 1IG8A 5ELZA 2Q31A 1ATNA 3EN9A 3O1BA 4DCHA 4IWVA 4JAXA 4A2BA 4H0TB 1CZAN 1WOQA 2A41A 1YAGA 3DXKA 3HI0A 3VEXA 4IO8A 3BF1A 2F9WA 3DAWA 4XEIA 5LY3A 4E1JA 4LC9B 3LDQA 3FE1A 4BRDA 5KQDA 2QWOA 4JHDA 4JD2A 1XUPO 3KVGA 4B1UB 5JLHA 5BPNA 3IFRA 2PBDA 2A5XA 3M6GA 4BRFA 3W0LA 4H5NA 3F9MA 3U9DA 4BC5A 1GLLO 1OKJA 5LJWA 4F9OA 4EHUA 4WQ5A 2FF6A 2P9UA 3HZ6A 2F9TA 2H3GX 5BPLA 2NLXA 3FZKA 3JXUA 5AQSA 4BQLA 4BVPA 1TUYA 4FWLA 4H0VB 4FWSA 3ULEB 4CI6A 5AZJA 1NGFA 3J8AA 3U9ZA 2Q0UA 1SZ2A 2YHYA 4Z94A 1BWFO 4EHTA 1ZXOA 2IIRA 1V4TA 5AQJA 4YDUA 2FF3B 4DQ8A 3AARA 4A62A 1RDWX 1S3XA 2GWKA 5BPMA 3SJHA 1BDGA 1JCGA 4BR5A 3A5MC 4M63C 1V4SA 4J8FA 4MLHA 4CJ7A 3KHYA 3ID8A 1GLDG 2YHXA 1K8KB 4H5VA 4IZ9A 1S22A 1MA9B 3MN9A 3ENHA 5AQMA 3R6MA 3EL2A 4WQ5C 5FPMA 3VEVA 3FLCO 4H0PA 1HKGA 4FWPA 3VF4A 3H46O 2ITMA 5AQXA 4H03B 2FSJA 3I33A 4BREA 3VPZA 2BTFA 2QWLA 3UKUA 5AQQA 3H45C 3ATUA 5KPZA 3H1VX 4BRGA 1J6ZA 3DXKB 4O8KA 4BR2A 5BN8A 3FZFA 1WUAA 1BU6O 4CZMA 1QQOA 5AQPA 3HSCA 3QFPA 5AQVA 3EZWA 3TPQA 5ADXA 3AAQA 2IVNA 4Y0WA 3DJCA 4JD2B 4MLEA 3QFUA 1C0FA 3L6QA 1X3MA 2D0OA 3TU5A 4MO4A 4WQ4A 3VEOA 4BR7A 1DGKN 3CQXA 4GY2B 3ZX3A 4FWNA 4MO5A 5CE3A 1H1VA 3LL3A 2P9UB 4DB3A 3O4WA 2I7NA 5AQRA 2QWMA 3CJAA 1X9JA 3GE1A 3MN6A 3P4IA 5FPNA 5EY4A 5AZJB 3MK6A 1NGJA 5E26A 1BA0A 4XH1A 3SMSA 2GEMA 1K8KA 3QICA 2V51B 4BQZA 3ZX2A 1D4XA 3WT0A 1TUUA 2A3ZA 2KHOA 3ZEUA 3QB0A 3H6EA 4WQ4C 4FWOA 3GDQA 3CI5A 3CETA 4BR0A 3BUZB 2E1ZA 5AQIA 5EX5A 1QZ6A 1C0GA 1SAZA 4CD3A 2A42A 4BC4A 2E1YA 2OANA 2QWNA 1NGEA 1QQMA 5AQHA 4B1WB 1IJJA 4A2AA 3CHWA 3UKUB 1LOTB 2P9PA 3SMPA 4FWKA 5BR9A 4QS7A 2ASMA 2UYTA 1NMDA 1NLVA 5F1XA 3CJ1A 4ISEA 3CJCA 2HF4A 3MN7A 4BC2A 2CGJA 2QWPA 2ASOA 2IVPA 3VEWA 5JMVA 3GBTA 3GG4A 2GWJA 5AR0A 1NGCA 4NB4A 2E2OA 2V52B 4RTFD 5KQ8A 3EKUA 1T44A 4BRCA 4NO7A 4A61A 3LDLA 2D1KA 2A6AA 4BC3A 1T6DA 2P9SB 3VF6A 1GLJO 3R9PA 3W3DA 5AFUH 4FL9A 3S41A 4BR9A 2P9KB 5AQGA 2WUSA 5AQTA 1E4GT 3VENA 4CZLA 4XH5A 4PL8A 3O8MA 3A5NC 2E2QA 4ISFA 5AZIA 3A5LC 1GLEG 4CZKA 1JCEA 2E8AA 2HF3A 1QZ5A 2CGLA 4QS8A 4HTLA 2NZTA 1NBWA 2HOEA 3B8AX 3M3ZA 2P9LA 3ZEUB 4JNEA 3QMLA 1LCUA 4EAHD 1ATSA 1BUPA 2QWQA 1KAYA 1KAXA 3WXIA 4I6MA 3SK3A 5BREA 2Q97A 4YDUC 1TYQA 3VEYA 4BRIA 4RWTA 3O08A 3BF3A 5JICA 4K42A 5BRHA 3LDOA 4L3QA 5AQLA 3MMVA 1GLBG 2D4WA 5E84A 2GTDA 3FZLA 1RGIA 2QXLA 4JN4A 4AM6A 2P9PB 2ZGZA 3AAPA 3QBXA 4PKHA 1KAZA 1NGIA 3CERA 3O1WA 1MDUB 4FOIA 3WXKA 4BRLA 3VGLA 5AFUA 3LDPA 1HKCA 5AQWA 3ZETA 4B9QA 4CZIA 3D2FA 5KPTA 2P9SA 3OHRA 2IVOA 4B1YB 2P9IA 1G99A 2E88A 2P9KA 4PKIA 3LM9A 1MWMA 2AP1A 3FGUA 4BRAA 3H3NO 1JCFA 4FPAA 3VGMA 2QM1A 2CH6A 2Q36A 3WEEB 5AQUA 3ZX0A 4CD1A 4K25A 2W40A 2V7ZA 2ZF5O 1HX1A 3C0BA 1GLAG 2Q1NA 1BO5O 4FWMA 5AQOA 4FO0A 2W41A 4ISGA 3HM8A 4M7YA 4CZGA 3WXLA 5I9EB 3O5BA 2V7YA 3IDHA 3UKRB 3UB5A 2A40A 3M1FA 5AZIB 1P8ZA 3QBWA 1HJOA 1NGBA 3CJ9A 2E2NA 4CZHA 4KBOA 2ASPA 4BG9A 1QHAA 1XQSC 2P9LB 3DXMA 2YHWA 1QQNA 3BP8A 1R59O 2I7PA 3KZBA 2VWBA 3WUHA 4I6MB 2ZGYA 4RCHA 3VETA 2YJEA 1TYQB 3RSEB 2PAVA 2D0PA 1HLUA 2P9NB 5BN9A 4AM7A 3FZHA 2E20A 4H0OA 2Q2RA 3VEZA 5AQNA 1HKBA 5EOYA 1NGHA 4K43A 4CZJA 4BR4A 1X3NA 3CJ7A 4CZFA 3GL1A 3VGKA 3MCPA 3JS6A 4PL7A 5B8HA 2J4RA 4CBWA 1NWKA 5BRFA 3C7NB 3CIPA 3U8XA 3R8EA 4BRQA 2AA4A 4FPBA 4BG8A 3H1QA 2DPNA 3SLCA 3WEEA 1SQKA 1ESVA 3DWLA 4IJNA 3ZETB 1GLCG 2YJFA 3D2FB 4WYBA 1YUWA 2FSNA 4M7XA 1HUXA 3LM2A 1YXQA 2P9IB 4B1VA 4CZEA 3HBTA 1E4FT 4H5TA 4BRKA 1DEJA 2YCHA 1BA1A 2GUPA 3WXJA 3EO3A 3UKRA 1YVNA 1Z6RA 2GELA 4B1XB 3D2EA 4GNIA 1XC3A 5ADXH 1NM1A 3CJBA 2YI1A 4DHYA 1U2VA 3MDQA 4H0YB 1U6ZA 3G25A 1Y64A 2QWRA 2EWSA 2VYPA 2VCPA 1NGDA 2NRHA 2CH5A 5FPEA 2Q0RA 4IXCA 3GOIA 4C23A 2BUPA 1BOTO 5FPDA 3AY9A 3RSEA 3I8BA 3VF2A 2P9NA 3WQTA 4QS9A 4FWRA 5F0XA 1HPMA 1EQYA 4FWQA 1RFQA 2FXUA 3DXMB 3ENOA 3FZMA 3D7EO 3A0IX 3L4IA 5AQFA 4H5WA 3UE5A 4BRNA 4FOEA 3C7NA 3U4LA 4H5RA 4BGAA 4H0XB 3MN5A 4XH4A 4HWIA 3L0QA 4FSVA 5EVZA 5LJVA 2QW9A 4O5FA 1NGAA 4EFHA 4BVOA 3VERA 5AQYA 2HMPA 3FFKB 3IUCA 5BRDA 3BEXA 2ZWHA 3HTVA 1NGGA 3EKSA 4BRPA 3IMXA 1DKGD 1ZC6A 5AQKA 3A8YA 3O80A 5EXWA 5JLFA 1ATRA 3O6WA 4B1ZA 1GLFO 2FSKA 4JHDB 3ULEA 3VOVA 5F2RA 1Z05A 5TKYA 1MWKA 3CQYA 2CGKA 4EIAA 4PKGA 4BGBA 4K41A 1Q18A 3A5OC 1KXPA 3FR0A 4BRHA 1T6CA 5KPRA 3VESA 1ZBSA 3H3OB 5AQZA 4IJAA 3QDKA 4BROA 1BG3A 3D2EB 3ATVA 4BRMA 2E2PA 3LDNA 3WQUA 4CBUA 2FLOA 1U2VB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2LSNA 3QESA 4KH4A 4F3OA 1ATNA 2QK9A 3O1BA 4DCHA 2IC3A 4AHVA 4IWVA 3NAEA 4FJLA 2UU9K 4I9QA 3N4QA 1CZAN 4JKEA 4M3WA 1HPZA 2A41A 3CFPA 3DXKA 1LAVA 5FLXO 3D0PA 1W7AA 3DAWA 1RDUA 4C1NI 4LC9B 3QIOA 4BRDA 5KQDA 4DSFA 3NF6A 4J2AA 5I3UA 4KHNA 1LWCA 3HP9A 4BDZA 1RBVA 3MEEA 2A5XA 3PIOL 3SUNA 5DK5A 4BE7B 1JL1A 3AO2A 2YNHA 4BC5A 4BE1A 2EX3A 4WQ5A 3RMDA 3AA2A 3PO5A 2F9TA 2NLXA 3DMJA 4CK2A 5AZJA 3AV9A 3Q7BA 4CGHA 1NU0A 1U4BA 2Q0UA 4Z94A 5AQJA 4YDUA 3RTVA 4DQ8A 4ID5A 4DSKA 1RDWX 4Y1CA 1S3XA 3K9JA 1ILYA 5BPMA 3JAMO 2JWKA 4BR5A 4M63C 1TK8A 4DR6K 3KKRA 3DLGA 3KHYA 1K8KB 3TAFA 1RDDA 3THXB 3BZCA 3EL2A 3VEVA 2VG5A 3K58A 1HKGA 4FWPA 3CPEA 4KTZA 5AJ3K 5AQXA 3OYGA 3I33A 3UKUA 4DWIA 4AHUA 4YY3K 4KHUA 3ZT3A 4J2DA 4KH6A 3H1VX 4BRGA 1J6ZA 5H1SQ 1M90O 1EO1A 5BN8A 4HCCA 3FZFA 1WUAA 1S6QA 4CJLA 1QQOA 3O9QA 2DFEA 4UQGA 4I2PA 3OYFA 1VSKA 3QFPA 3TPQA 3CCMN 1L5UA 1FKPA 4CF8A 5ADXA 3AAQA 3F73A 2ATQA 2Y1JA 4CJTA 4JD2B 3QFUA 2D0OA 3HSTB 3LZJA 1VQ8N 3OYLA 1ZBHA 4YFUA 4X62K 4FWNA 5CE3A 1H1VA 2W6KA 1CLQA 4DR1K 4PHTX 2OZSA 2F7TA 3GE1A 2IDOA 1BQMA 5FPNA 4C8MA 3MK6A 3NGIA 1HNWK 1D4XA 1TUUA 1NJZA 2UXCK 4KHYA 2YV0X 2G8IA 2O8BA 4WQ4C 1C0TA 5HBMA 4FWOA 2X74A 3BUZB 1YIJN 3LP3A 3HXMA 2BE2A 1C0GA 4KB1A 3THWB 1OH7A 3NH0A 4AHTA 3K0SA 3CPWM 1ASWA 2OANA 2F8SA 4DQPA 3PUFA 1LAWA 4FCYA 4B1WB 4NXMK 3CHWA 1LWEA 1VSFA 1LOTB 4W5QA 2P9PA 3SMPA 5BR9A 3PV8A 4QS7A 2UYTA 1DT9A 4HUGA 2VG6A 1X1PA 3B6PA 3V9UA 2HF4A 4X66K 2QWPA 3VEWA 5HRNA 3GG4A 3SAHA 4F8RA 1NK5A 1NGCA 3VQQA 4XIUA 1N36K 2E2OA 1XHZA 3CG7A 4RTFD 4WE1A 2O4GA 1Q82O 4X64K 4NO7A 4R79A 4JS4A 3I0RA 3I55N 3V4IA 4AH9A 1T6DA 4JEPA 1GLJO 3W3DA 5AFUH 5GADP 5M1FA 1BGXT 3QEWA 3S41A 4BR9A 3KLGA 3AVIA 4EP5A 1S1VA 4KH5A 3VENA 1BI4A 3J7ZO 4PL8A 3A5NC 4JKDA 4IDHA 2E2QA 3A5LC 4CZKA 2AJQA 3WNEA 1EX4A 1QZ5A 4HVJA 3B8AX 2FBXA 1LCUA 4DV4K 1KAYA 1KAXA 3AGKA 3WXIA 5M1KA 4YDUC 2QA4N 4DLEA 3NF8A 5BRHA 3C6AA 3LDOA 4DG1A 4GW6A 1W9HA 5LMUK 3VQCA 3CYGA 2GTDA 1C6VA 3M5RA 3THYB 4O55A 3K5LA 2ZGZA 3AAPA 1UA0A 3ZLJA 1XNRK 2WTUA 4BRLA 3VGLA 4NLBA 3WNHA 3L4QA 4B3SK 4IEEA 4DTMA 3AVCA 4BWMA 3K2PA 3ZSYA 1FK9A 4U7BA 2P9KA 4PKIA 2IOCA 3PSFA 2O8EA 3V9XA 3FGUA 4FPAA 3VQPA 3WEEB 3G10A 4FLZA 3SAFA 1VQNN 2E6LA 1WSIA 2V7ZA 3AO5A 3C0BA 4FJGA 1JLFA 4ISGA 3OJSA 4JKGB 3JSMA 2UUCK 5BR8K 3SUOA 3O5BA 4B9NA 2I5JA 3PX4A 4Z4FA 3M1FA 3S3NA 1S5JA 2VWJA 1U49A 4N76A 4LF6K 3AGRA 2OPQA 1QHAA 1XQSC 2P9LB 3DRPA 1QQNA 2P5OA 1VQ6N 4OKKA 3KZBA 3VETA 2JWLA 1TYQB 2KZZA 3K59A 4AM7A 4F4KA 4E1MA 3NVMA 4K8XA 1NK9A 3TTFA 1HKBA 4LF8K 5EOYA 4M3XA 1RT2A 4FK4A 3ZT0A 4Q5VA 1X3NA 1VQPN 4B3OA 3EZ5A 2ZJPL 3JS6A 3SJJA 5GAEP 3OW2M 3SPYA 5BRFA 3C7NB 3BDPA 3R8EA 3EY1A 4BRQA 2AA4A 4FPBA 4WCEL 2DPNA 1JLGA 4N41A 1GLCG 2NRVA 1HUXA 2P9IB 3L2UA 1RDCA 4CFCA 4B1VA 3HBTA 1VSEA 4BRKA 1BA1A 1W0HA 3EO3A 3UKRA 3AO4A 1N8RO 1N33K 1QSSA 5ADXH 1NM1A 2B5JA 3SBTA 2YI1A 2KW4A 4BDYA 3S3MA 1U6ZA 5CZ2A 3HT3A 3U3YA 1W97L 2QWRA 3RRHA 4E7KA 3WNGA 2C1IA 3S5TA 1NGDA 4CGJA 2CH5A 2Q0RA 4IXCA 3AA4A 2BUPA 4DTRA 1NK0A 1BOTO 5FPDA 3AVFA 3AY9A 4JI4K 3RSEA 1UA1A 2P9NA 5IT9O 2WFBA 4QS9A 5JVGL 4KHQA 4DU3A 2RN2A 5C42A 3KLIA 4JKAA 3D7EO 1XMQK 3TTCA 3L4IA 5AQFA 4H5WA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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