3EKZA

Structural characterization of tetrameric mycobacterium tuberculosis fructose 1,6-bisphosphate aldolase - substrate binding and catalysis mechanism of a class iia bacterial aldolase
Total Genus 130
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
130
sequence length
345
structure length
334
Chain Sequence
PIATPEVYAEMLGQAKQNSYAFPAINCTSSETVNAAIKGFADAGSDGIIQFSTGGAEFGSGLGVKDMVTGAVALAEFTHVIAAKYPVNVALHTDHCPKDKLDSYVRPLLAISAQRVSKGGNPLFQSHMWDGSAVPIDENLAIAQELLKAAAAAKIILEIEIGVVGGKLYTSPEDFEKTIEALGAGEHGKYLLAATFGNVHGVYKPGNVKLRPDILAQGQQVAAAKLGLPADAKPFDFVFHGGSGSLKSEIEEALRYGVVKMNVDTDTQYAFTRPIAGHMFTNYDGVLKVDGEVGVKKVYDPRSYLKKAEASMSQRVVQACNDLHCAGKSLTHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Fructose-bisphosphate aldolase
publication title Structural basis for catalysis of a tetrameric class IIa fructose 1,6-bisphosphate aldolase from Mycobacterium tuberculosis
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 130
structure length 334
sequence length 345
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2008-09-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01116 F_bP_aldolase Fructose-bisphosphate aldolase class-II
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3ekzA00
3O07A 4FHAA 2B7QA 3JR2A 3WK1A 4GFSA 2NWSA 4AHQA 4KFNA 3S5OA 5CG7A 5AHMA 1MEHA 1O5XA 1ML1A 4FNSA 3BVJA 2WO5A 4HKPA 1FCUA 1TJPA 1KTNA 2QDGA 3LXBA 1YPIA 1VJIA 4KFOA 3QQ0A 3G18A 3UWQA 4QQ3A 1KTBA 4ZMGA 1IXNA 3FEMA 4K38A 5CSRA 5EBUA 2GVJA 4MJMA 4PC8A 2VFDA 1IIHA 4JX5A 1KV8A 4JX4A 4AF0B 2QJHA 3TQ0A 2BZNA 2PRLA 4O12A 4A22A 2GJNA 1F05A 3M47A 3OBKA 5LGZA 1I2NA 5AOUA 3TXZA 1TYGA 2A7NA 4ZQPA 3N3MA 4A2RA 2EF9A 2Y70A 2C13A 4P2VA 1UB3A 3MJYA 3W1LA 4RZ4A 3S1UA 4JR5A 4JDYA 4I7WA 1W31A 5DELA 1QMLA 3O05A 3LHYA 4OGZA 2IQTA 3CU2A 1IF2A 2YYUA 2DZPA 3PAJA 4AB4A 2LLEA 4O19A 1PVNA 2Z2UA 1O95A 4JTJA 3G0UA 5TBOA 5AN7A 1FWWA 1GEQA 3W87A 2BWGA 1BTMA 1JCNA 3W73A 4ALDA 4YCPA 2GVLA 4RZ6A 1YYAA 4PL2A 3C2RA 3P8JA 1JCXA 3A5FA 3ZS4A 2VFFA 2ZZ2A 1A50A 3FJLA 4DO5A 3E9AA 5G2IA 1Z42A 1H7NA 1HUVA 1Z41A 2TYSA 3MBDA 4JY9A 5LNVA 1G67A 3W7IA 2VFEA 4O28A 3DKJA 2YFNA 2Y89A 2CW6A 2RHGA 4ADTA 4XZ9A 5I3JA 1GOXA 1I2RA 4UTWC 1PHQA 2FB2A 1S5WA 4CQ8A 4RX0A 8TIMA 1XUZA 3TQKA 3L2IA 2NWRA 1RVGA 4N6FA 5G5IA 4FX6M 1QFEA 4FO4A 3BV4A 4DXVA 3NM3A 4AHOA 3UZJA 3KVKA 2CLKA 4GBUA 4NX5A 3C2OA 1R2SA 3MMTA 2CZFA 2WSRA 2CU0A 4OQVA 3NQVA 1A53A 1J5TA 2Y85A 3PBUA 1M6JA 2OMAA 1H61A 2DORA 1YDOA 1UJPA 1LOQA 2JGYA 2ZZ3A 1F6PA 2VENA 1JUBA 5F2IA 1RV8A 4HSNA 3LHZA 4R53A 1OYBA 3FYOA 3LHVA 1TV8A 3QQ1A 3JRKA 5HWNA 5I3HA 3W1UA 4OV4A 4MY1A 3L5MA 2DU2A 4O50A 1GVOA 3CIXA 2V81A 3ABOA 2HTMA 1TPFA 3SI9A 1WYIA 4XQ6A 4Y8FA 5KMYA 2ATSA 3HBLA 1I2QA 1JR1A 3DH7A 4Z1DA 2E1DA 1Q6OA 3EWYA 3SSJA 4OU1A 3LCWA 1H60A 1VQTA 3MW7A 4JTKA 3EX4A 3EX3A 2VC6A 4M5PA 4JNMA 4LW7A 1B4EA 3MBFA 1XKYA 5HULA 1PE1A 5I3KA 1DVJA 3F1QA 2HS8A 1MXSA 4UR8A 4OHQA 2TMDA 5J5DA 1NAL1 3GVGA 3VE9A 5FF3A 4UIOA 1AW5A 1EA0A 1HTIA 4L4MA 2QUTA 4LVFA 2WNQA 1SO5A 4BF9A 5LNWA 3LGEA 3DHDA 1JULA 3G1VA 2O7SA 4YCOA 3TAOA 3I68A 1QPOA 5EA9A 5F1VA 1J2WA 4O8RA 4FNTA 1LCOA 2C16A 2OT0A 3GR8A 5CPLA 1RR2A 1TPB1 1GZGA 3B04A 1CI1A 1SO4A 5D2XA 2VFIA 3PB2A 1OX4A 1LOLA 4JN6A 5H2ZA 2AQWA 3LV6A 5K2ZA 4WY0A 3TDFA 2V30A 2FB3A 2JBMA 3SJ3A 3VCRA 1N8FA 3LRLA 3BLIA 5HJLA 2C6QA 3NNTA 2F7FA 1XI3A 2A7PA 1TPC1 4RCXA 3W1XA 1OVDA 6ALDA 4AWTA 1QR7A 1N55A 5HR6A 4Q4KA 4S2BA 3AJXA 3GDRA 3W1RA 1GJPA 3G8EA 4LU0A 3DGRA 4RXGA 3NZ1A 4FF7A 3W7CA 3ATYA 4CQ9A 2CLEA 2RH9A 4IOTA 4MOZA 3U2OA 2XN0A 2XN1A 1JQXA 3C6CA 3IRDA 3S5ZA 4UFKA 4EF8A 1OFAA 3G24A 1TIMA 3EWWA 3G8RA 4LVGA 4UTTA 4NVTA 2P1FA 1W8SA 3HGJA 3NDOA 1OF6A 5AHLA 3TC7A 1WQ5A 3NR0A 3I7SA 3LI1A 4UC5A 2QCHA 3SECA 1OFBA 2QCDB 3W7PA 3T78A 3DFNA 3BLEA 1CW2A 2GOUA 1YDNA 1NF7A 4GRSA 3L67A 3D0CA 3ABRA 1ZALA 2C15A 4XKYA 3UXDA 2Y7EA 3LB0A 5AHEA 1K02A 3EX6A 3L68A 2ISWA 4Y96A 5KZEA 3O6DA 4GWEA 1RQEA 5DY3A 5D02A 3ELFA 3LCXA 1THFD 3NQAA 4E38A 1U83A 1TV5A 4DQWA 1D3HA 4H6KA 1QO2A 3TSBA 3LTSA 4O1AA 2ZRWA 3C4UA 2QUVA 3W7EA 1G69A 2DZTA 1FDYA 3FS2A 5EMUA 3FKRA 2TPSA 4TIMA 2QUUA 2QJGA 1L6SA 2VOMA 1TCDA 3BG5A 3BW2A 2NX1A 4NJHA 2V8ZA 2KZHA 3W74A 5D2YA 1AL8A 1XBYA 4NZJA 3FA5A 2EGZA 2QAFA 3G22A 5EKYA 1TQJA 4LUJA 1R47A 2FPTA 1FQ0A 5U4NA 1XCFA 3C2FA 1QO5A 1H7XA 1W54A 2H8ZA 1I4NA 3QM3A 4FNRA 4UTIA 1W5NA 4DF1A 3Q58A 1QOQA 3HPXA 4M7TA 2OJPA 3GIYA 5E93A 2V5LA 1Q6RA 3UWWA 3OIXA 3P5YA 1FXQA 5I3GA 4MY8A 1T8XA 1T96A 1UCWA 1OFQA 3L5LA 4LC8A 3PB0A 2PE4A 1ONRA 4MZYA 4Z08A 3W70A 2ZA3A 5FF7A 1EWDA 3PG8A 2PRHA 4ONVA 1SQ7A 2C1HA 4AF0A 3LBMA 5FF0A 1SW0A 2VXNA 2CLOA 1PCKA 5K4XA 3HPZA 1IXPA 2I1OA 3NPVA 3NQFA 3MP4A 3NL3A 2ZZ5A 5E0KA 3E02A 4FNUA 1SR9A 3NQ6A 1OK4A 3TXVA 5K3VA 2E6YA 4CNOA 2CZDA 4ICNA 1XM3A 2Y6ZA 3I6RA 3HGOA 3MWAA 4O52A 4QAIA 5C55A 1EP2A 3LHTA 2QCEA 4Y9AA 4EIVA 1TTJA 1W0MA 4K8EA 4NQ1A 4P61A 1R30A 3C2EA 1I2PA 3VI2A 2WJZA 3MI2A 3QW4B 1TTIA 3M9YA 4N9CA 3KRUA 1W5MA 4N9BA 4UTKA 3W86A 2ZZ7A 2VELA 1Q45A 4WZHA 3PR2A 3TV8A 3PUOA 2V82A 1KBIA 2H6RA 3ANYA 3G1XA 2V9DA 3MHUA 3OVRA 4JYDA 3W7QA 1LROA 4JICA 1KA9F 4HPJA 4LS1A 1H7OA 1H7PA 2HSAA 1FUYA 2W0UA 4AVFA 2EHHA 4NU7A 4WD0A 2ALDA 3U6WA 1PCWA 3TMQA 3A5VA 3C52A 3TE9A 3W1QA 3EEGA 1GVQA 3G1SA 2E77A 2X16A 3GYEA 3M5VA 3TKFA 3NQEA 3DBPA 2I14A 4UFIA 1SSGA 1XDMA 3I7RA 1KM1A 4PH6A 4MYXA 3TK7A 1GTEA 1MO0A 3THAA 1QNVA 3W1AA 1JRBA 5ABTA 5EPDA 4ZQNA 3P60A 4TU1A 2B0MA 4GUHA 4LOCA 4BI6A 1A5CA 1FBAA 3GXNA 3OHIA 2ZRUA 4POCA 3UY7A 1R46A 2FIQA 4PL1A 2JKAA 2WNNA 3QW3A 2AAMA 4N2YA 5FEXA 3PWAA 1E51A 1OYAA 5AYXA 3LOTA 4JYEA 5IBXC 1TJRA 3C3NA 3MHGA 1C29A 2I9EA 2Q3RA 1LP6A 4WOZA 4NXKA 4YMZA 2UV8G 1SO3A 4LRSA 3HGSA 4WXZA 1OABA 1QAPA 1W5QA 5FESA 4LV9A 3DI1A 4LS2A 1FY6A 5K4ZA 3IIPA 2YPIA 4O1CA 1B4KA 4YWIA 3GXPA 2NXIA 3WJWA 4FX7A 2NUXA 1KFEA 3QZEA 2GJLA 1RD5A 4M19A 3LLFA 3NQDA 3I65A 1R2RA 3BG9A 3BW3A 4JGDA 3E0IA 2O7QA 4HHPA 3LHWA 1S5VA 1NFBA 4ORIA 3IV3A 3WJSA 3P8IA 3PUEA 1FWSA 4K36A 3W2NA 4UFLA 4TO8A 1YTEA 1YXCA 1B9BA 1SW3A 5IBXA 5I3FA 3L0GA 3HG2A 3UWYA 1AK5A 5T26A 1LZOA 1ADOA 3MHFA 2XN2A 1VCVA 3KVLA 3KOFA 4OE7A 3DXIA 3NPXA 3AO0A 4WJEA 3GDKA 4Z1CA 4KWWA 4NXSA 3O15A 3VNDA 4R7JA 3TUUA 1TO3A 2A5HA 2YX0A 1VPXA 3W2MA 3P82A 5D04C 5F2GA 3NOEA 2RDUA 3G3DA 3LRMA 2OT1A 2R8WA 5AFDA 5K9XA 4E2BA 4OBTA 2QCNA 4N4PA 3P81A 4O17A 2V2HA 4LTSA 1DJQA 1EIXA 3S5NA 4DPPA 1G7VA 4HNVA 3FOKA 2R91A 5LHFA 3BG3A 4AMAA 1JCYA 3SW6A 3DFPA 1W1ZA 4HSOA 2ZQ0A 1OFEA 3E96A 1K8ZA 4RLIA 3TW6A 2E6AA 3DHFA 3HJZA 2C0AA 3PUDA 4IMCA 5HR7A 1K8XA 5FF2A 4JDBA 3NQ2A 4I7VA 4IUOA 1EUNA 1R2TA 5LHEA 5D38A 4LWWA 3A9IA 2WKJA 1SFJA 4D2JA 4IPJA 3TX9A 2QCDA 4AAJA 2A6NA 2W79A 3P84A 5BMXA 1X6UA 4FXSA 1VC4A 5HNRA 3GNDA 3PSWA 1KW1A 5BW6A 5EY5A 5D09A 4M6VA 5DBTA 3VKJA 3CPRA 1O4UA 1OFDA 4MIMA 4CCCA 5A5WA 1JCJA 2E6DA 3LM7A 1TV7A 3QF0A 1DOSA 1VGAA 2X30A 2RDWA 5FEPA 4BR1A 3EXSA 3MI6A 2VFGA 3W6YA 4UTUA 4FNPA 2C14A 2J9ZA 3MI3A 4JTFA 4YLWA 4LRTA 3C8FA 4JIQA 3LI0A 1EB3A 2ZRXA 1LBMA 4B5NA 4EWND 3R89A 1O60A 3W7OA 4N9DA 2FPVA 4AXKA 5KTLA 3M0ZA 3NQGA 4ADSA 4NJGA 2Z6JA 3UWUA 4QITA 1NEYA 1IIGA 4OWGA 4O14A 1SO6A 3TFXA 1QWGA 4JTIA 4PCFA 2WOQA 2Y61A 3EX2A 4JS3A 3UY8A 3EWXA 2ZBTA 3YPIA 1XBVA 4FIRA 1Q6QA 3UXAA 2NX9A 2YW4A 1OFRA 2GVGA 5D37A 2FFCA 4U4MA 3GB6A 4NNAA 3IIOA 3NEVA 4X9SA 5G4WA 4UTWA 3CM4A 2A85A 4N02A 4RV8A 1XUUA 2ATMA 2Z1BA 4CQAA 1Y0EA 3P80A 2GQAA 1DBTA 3S5YA 3T7VA 3MYOA 4MJZA 4JTHA 3EWUA 1J4EA 3SIZA 2QCMA 4JTSA 1GT8A 1H63A 2FJKA 2V5BA 1KM6A 3OG3A 3UNDA 3S0CA 1OJXA 1LLZA 3NZRA 4CCDA 2CLMA 2GUUA 5HWMA 3H55A 3IIXA 4K39A 1T99A 3EB2A 4O0KA 2A6LA 3EWZA 3R13A 4IMDA 4CNNA 3SGUA 3LX9A 3MO7A 4KWVA 5DCEA 3PULA 4JYFA 2ABBA 1LORA 4GXMA 4LVBA 1H51A 1KLZA 3O16A 3W1MA 4NJIA 3GDLA 2OX1A 3H53A 3M5XA 3WJXA 5BMWA 3NL6A 3CIWA 1OFOA 5KZMA 2QR6A 2VEKA 3NGJA 3GDMA 3QFEA 4BI5A 3C0JA 2Y7FA 4LNYA 2X1UA 5KINA 2ZRVA 2C18A 3DU0A 3PC0A 3QRHA 3RLUA 3WK3A 2JGQA 1ICPA 4AEOA 2A1YA 2B7PA 3LRKA 1OK6A 4U28A 2DZSA 3Q94A 3O63A 4UMAA 1FWNA 2ISVA 4IQLA 4UR7A 3THQA 1LOSA 1XDLA 5KSWA 1A5AA 3H54A 4Z0SA 3HG3A 3TJXA 3TU9A 5AYZA 1M7PA 1F74A 3IVTA 4IMGA 3B4UA 5DXYA 5DY2A 4Y90A 5C54A 3GR7A 4I9AA 3N2MA 2ZFAA 3OVPA 4JX6A 1YTDA 1IGSA 1PV8A 1QPQA 1SFLA 3L66A 1K7EA 3BPWA 3NQ8A 3MUXA 4Z1AA 1W56A 1MZHA 4X22A 3LCFA 1HL2A 3JS3A 2FTPA 1WV2A 3C56A 1ME7A 3WK2A 3CHVA 3NQCA 1A5SA 3HO8A 1P5BA 7TIMA 2Y63A 3BARA 1KFKA 3S1WA 1MEIA 3W83A 4UMBA 1DL3A 3BW4A 4IX2A 2ZTKA 5D03A 2WNZA 3O1NA 1I8JA 3GAKA 3QMSA 2CWNA 3DFQA 3HGRA 2J27A 3NQMA 3W7DA 5DN1A 4JD4A 1X1ZA 2NLIA 3KHJA 1PIIA 4TMBA 5KITA 4WX2A 3KFTA 4FXRA 4QJ1A 2HS6A 1H7RA 5D2VA 1ZCOA 3LTPA 3QH2A 1G7UA 1EEPA 2X2GA 3EXRA 1XBZA 3LHUA 4NNCA 3P61A 1YDVA 4RKAA 4GUFA 2NXHA 4MVAA 5MHBA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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