3EPTA

Structure of the rebeccamycin biosynthetic enzyme rebc with reduced flavin
Total Genus 156
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
156
sequence length
527
structure length
516
Chain Sequence
APIETDVLILGGGPVGMALALDLAHRQVGHLVVEQTDGTITHPRVGTIGPRSMELFRRWGVAKQIRTAGWPGDHPLDAAWVTRVGGHEVYRIPLGTADTRATPEHTPEPDAICPQHWLAPLLAEAVGERLRTRSRLDSFEQRDDHVRATITDLRTGATRAVHARYLVACDGASSPTRKALGIDAPPRHRTQVFRNILFRAPELRSLLGERAALFFFLMLSSSLRFPLRALDGRGLYRLTVGVDDTMDSFELVRRAVAFDTEIEVLSDSEWHLTHRVADSFSAGRVFLTGDAAHTLSPSGGFGMNTGIGSAADLGWKLAATLRGWAGPGLLATYEEERRPVAITSLEEANVNLRRTMDRELPPGLHDDGPRGERIRAAVAEKLERSGARREFDAPGIHFGHTYRSSIVCGEGGWRPSARPGARAPHAWLTPTTSTLDLFGRGFVLLSFGTTDGVEAVTRAFADRHVPLETVTCHAPEIHALYERAHVLVRPDGHVAWRGDHLPAELGGLVDKVRGAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords RebC
publication title The FAD cofactor of RebC shifts to an IN conformation upon flavin reduction
pubmed doi rcsb
source organism Lechevalieria aerocolonigenes
total genus 156
structure length 516
sequence length 527
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-09-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 3eptA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3eptA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 3eptA01
1LQUA 5HYMA 3DJGX 1ZOVA 3IWAA 1CJ2A 3AEAA 1YQ3A 1GREA 1E1NA 3AYIA 3BHFA 3GRSA 4DSHA 5BUKA 4C5OA 3IHGA 3F8PA 3CIRA 2WETA 3DGZA 3LZXA 1FOHA 5GSNA 5BVAA 2B9XA 4APNA 1NHSA 2GR3A 4KX6A 1N4UA 4TM0A 2H89A 4ICYA 1ZY8A 1GT8A 3S5WA 1ZOYA 2WOIA 2AAQA 2Y6QA 5U63A 2FJDA 4AP3A 4MJWA 1PBEA 4U2LA 1PN0A 4YSYA 1IUSA 2Z5XA 4H4XA 2C67A 1HYUA 2WBAA 5L46A 1DOCA 3UKAA 2R0CA 4U8OA 3UTFA 1B5QA 5KOXA 1PJ7A 2I0ZA 3D1CA 3KLJA 3FPZA 3OZ2A 1QJDA 1GV4A 4CNJA 4A79A 5KRQA 2OAMA 3NN6X 2WU5A 4OPGA 1OJDA 2GQWA 4XWZA 5EB4A 3H4KA 2CFYA 2BS2A 1H7XA 2E4GA 1IUTA 2VZ2A 4WX1A 4AP1A 2BK3A 3H8IA 4H4QA 4Z24A 4Z2TA 1H83A 2GH5A 4CCQA 1N1PA 1S3BA 3BNMA 5CKUA 3AEGA 3K7MX 4U2TA 3AYJA 3D8XA 1F8SA 4K5RA 3ALMA 4TM3A 3ABVA 3KKJA 5HY5A 4ECHA 2BCPA 2YG5A 3AEBA 2YQUA 5JCKA 3FMWA 4X9MA 3UKKA 2BXSA 2V61A 4J57A 4UDRA 2DKIA 4K8DA 4OVIA 3QVRA 2GMJA 2IVEA 2R4JA 5HXIA 1YY5A 2XFPA 4UDQA 1F8WA 3NK2X 4REKA 2YLZA 3AXBA 3B6DA 3VR8A 3CGDA 3CPJG 4LA1A 4Z25A 5EOWA 1ONFA 1PBDA 1PBFA 3GYJA 2XVFA 3ICRA 4I58A 1FCDA 4YXDA 4OPDA 3CGEA 4YTNA 2E5VA 5EBKA 3VRBA 3AWIA 1GRBA 2X8GA 2O9ZA 2YWLA 2Q7VA 3UKFA 4DGKA 1KF6A 1SEZA 2R45A 4NTCA 4U2SA 3G5RA 4TLXA 4PAAA 2R9ZA 1FEAA 4YT0A 3HZLA 4Y4NA 4A9WA 2C72A 4HB9A 2VRLA 3NLCA 2X99A 3NTDA 4J36A 1M64A 2WDQA 4H4PA 1GRFA 2JAEA 1RYIA 1TRBA 1NG3A 3ALLA 3BNUA 3VRAA 1GPEA 2Y6RA 4U8LA 2YM2A 3ALJA 1N4VA 4M52A 3ZDNA 5KVHA 1KNRA 2VVLA 3F8RA 1LVLA 4EQSA 2A89A 4CBQA 1Q9IA 4A5LA 2R0GA 1CC4A 3VRDB 3JSKA 4J56A 3KPFA 1GEUA 1GSNA 3NRNA 3QSSA 5HHFA 4X9NA 1BWCA 3QSEA 3UP5A 3UKHA 3UCLA 5KXJA 2WU2A 2V3BA 3V76A 3UOVA 5IPYA 3C96A 3CNSA 3GSIA 2V5ZA 3K30A 3OC4A 4U8NA 5KOWA 2GV8A 3KVEA 4WCTA 3UOXA 4EMIA 3NKSA 2H88A 2BC0A 1CC2A 4LIIA 1CHUA 4Z2RA 1KNPA 2TMDA 1NEKA 2YG3A 4IA6A 2Q0LA 3NT6A 2B7RA 1E1LA 3RP7A 4CNKA 2GB0A 2VVLG 3C4NA 4YTPA 3DGHA 4JNAA 4KPRA 1COYA 1PHHA 2OALA 2DKHA 3EANA 3FIMB 4ZCDA 1Q1RA 1DXLA 2XLTA 3PVCA 4JNQA 2QA1A 3UTGA 4HA6A 3AE7A 3AYLA 2YVJA 2CVJA 5JCMA 3DK9A 1E39A 3Q9TA 1BGNA 1P2HA 1H86A 1D5TA 3NHOX 3BI2A 1E7PA 2EQ8A 3ITJA 2J3NA 1TDEA 1DODA 1W4XA 2BXRA 4NZHA 4ZCCA 2Q0KA 1JOAA 3G5SA 1PBCA 4YTMA 2VQ7A 2WPEA 2QA2A 4GF7A 2WOWA 3SGLA 1NDAA 2VRMA 4A99A 3NK0X 1ZMCA 1JRYA 2YVFA 2PHHA 2YLSA 3BHKA 2JK6A 3II4A 4AT0A 4EMWA 1ELIA 3NNEA 4EIQA 1Y0PA 3I6DA 2WHDA 1OJ9A 4H4SA 4H2NA 2WOVA 3IF9A 1ZK7A 2PYXA 5FS7A 1IUUA 3AECA 1H6VA 3NH3X 1XANA 4H7UA 4XXGA 2XVJA 1VG9A 1JU2A 2UZZA 1O5WA 2XVIA 1CBOA 2B76A 2X8CA 1KSUA 2GQFA 3FG2P 1DOEA 1RSGA 1IUWA 3AD8B 3ISHA 5J7XA 2YR6A 1BF3A 1IJHA 1DOBA 2OA1A 2XLUA 5DBJA 3UKLA 4J31A 4B1BA 1H84A 1PJ5A 1ZKQA 2X8HA 1D4CA 1KDGA 2C76A 2W0HA 3NIXA 4B65A 3AD7B 2C70A 5KVIA 3AE8A 4FDCB 4I59A 3UKPA 3NTAA 4GCMA 4U8JA 2HQMA 1TYPA 3CPIG 3QFAA 2BACA 4K2XA 4AOSA 2ZZBA 2GR0A 2ZBWA 1EL7A 1P2EA 3GD4A 4EQWA 1KSSA 3AD9B 1F3PA 3GWFA 1OJCA 1RP0A 2RGOA 3F8DA 4YWOA 4H2RA 2EQ9A 1L9CA 3EF6A 4GUVA 2C75A 4USRA 3URHA 1JNRA 3AE5A 3Q6JA 5JCLA 1IUXA 1H82A 4YSXA 3UOZA 4OPUA 2QCUA 4H4VA 1XHCA 2Q6UA 2B7SA 3AE3A 1LTXR 4GRTA 4H4UA 4Y4MA 3GRTA 4ADWA 2R0PA 2YAUA 1VRQB 3ICTA 3LJPA 4O5UA 1GRAA 3AE6A 4CY6A 3DH9A 1GNDA 4B64A 4EQXA 2NVKX 1CF3A 3AE9A 1XPQA 1JNZA 3K7QX 1TDFA 2E1MA 2YLXA 4UDPA 4BK3A 4NTDA 4BV6A 4PABA 2WESA 3NYEA 3NG7X 2YLTA 3VR9A 3V3NA 4D03A 2YR4A 4C74A 5LV9A 5BRTA 1E1MA 4JY2A 3NYFA 5EB5A 4Z26A 1Y56B 2C66A 5IQ1A 4GDEA 1D4EA 4OPTA 4OPLA 1VG0A 3WE0A 1GOSA 2WS3A 1PBBA 1FEBA 2XVHA 4NEVA 1D7LA 3DJJA 3DA1A 3CNTA 1OJTA 3CNJA 5IQ4A 4U8IA 4H4WA 4NEWA 4C3XA 3CTYA 4U8KA 1EL9A 4BJYA 4J33A 1O94A 1BZLA 2ARDA 5M10A 4RSLA 5ER0A 4B63A 2EQ7A 1PXAA 4H50A 4B68A 1TDKA 3SFEA 3REDA 1PS9A 2NPXA 4YKFA 5M0ZA 3NN0X 1D7YA 3P4PA 4EMJA 2XFQA 4GR1A 4JY3A 1LPFA 1NHRA 3AE1A 4BURA 4IV9A 2QAEA 4DNAA 4C77A 4Z43A 1VQWA 3CGBA 3DMEA 3AEFA 4H2PA 3SQPA 2GAHB 2WDVA 4FK1A 1S2QA 4XWRA 4GDPA 3K7TA 4JQ9A 1Q1WA 1B8SA 4A6NB 2XVEA 1O95A 4FX9A 1JEHA 2ACZA 3L1RA 3VQRA 3B3RA 4H4YA 2A87A 3FBSA 3CNDA 1D4DA 1TYTA 4J34A 2BK4A 3IHMA 1F6MA 1NAAA 1L9EA 1VDCA 2GR2A 2IVDA 3LOVA 3LXDA 5U1OA 2RGHA 2RABA 2XFNA 4OPIA 1NHPA 2XCGA 1REOA 2GAGB 2GMHA 3RP6A 2V3AA 2BS3A 4IVMB 2FBWA 1ZX9A 2WDRA 4YSHA 4H4ZA 4BK1A 2WPFA 2C65A 4O5QA 4ZN0A 1ZP0A 1LQTA 4UP3A 1L0VA 2JB1A 1GRGA 1XDIA 3KU9A 1LJ1A 1MXTA 2EQ6A 3QJ4A 3RP8A 4LU6A 1CJCA 2VVMA 1PJ6A 5FS9A 1QO8A 1GXFA 2BC1A 2JB3A 4U8PA 1GALA 1GTEA 2CDUA 2V6OA 2X50A 3G5QA 4USQA 5FS8A 3GD3A 1H7WA 3M12A 2FJEA 2BK5A 1K0IA 2A8XA 3R9UA 1CJ3A 4JN9A 2YG6A 3RNMA 4RG3A 2ZZ0A 4YSZA 3GMCA 5C3JA 1ZDLA 4B66A 1QLBA 4B67A 4CRTA 3H8LA 2YVGA 2YR5A 1KFYA 5JCIA 1NENA 2BS4A 3UP4A 3ZYXA 3DK8A 1MOKA 5U25A 2B9YA 1NG4A 1GRTA 3QSMA 1GTHA 2GEWA 2GVCA 2OLNA 2CULA 4IA5A 1TDOA 1YQZA 2XFOA 3ICSA 1EL5A 4CY8A 3NYCA 2JBVA 3GYIA 1JRXA 3SFDA 1CL0A 3DJEA 1DJQA 1Y56A 1BGJA 4J2WA 4YKGA 1K4QA 3P4SA 5CQFA 3O0HA 4E0VA 4P9SA 4TLZA 3M0OA 1CC6A 3AEDA 3LZWA 2GF3A 2BABA 2AR8A 3AB1A 1N4WA 4B69A 2WP5A 2YM1A 3ATQA 1M6IA 4U8MA 4DSGA 1F8RA 3SM8A 3UTHA 3P9UA 3S61A 2IIDA 3PS9A 2YG4A 3AEEA 2BYBA 4EM4A 3V3OA 1JRZA 2R4EA 2XLPA 3ATRA 1GESA 3CGCA 4OPCA 1H81A 1CJ4A 4X4JA 2B9WA 3ADAB 4A65A 5JCNA 1IUVA 2WP6A 2AQJA 2BA9A 2C3CA 4A6NA 3I3LA 1UKVG 3NGCX 1BKWA 3P4QA 4TM4A 2XDOA 1E6EA 1B37A 3DK4A 3LADA 4H4RA 1PXBA 3M13A 3GDNA 4Z44A 3EAOA 2WQYA 3GMBA 4AT2A 2GR1A 3C4AA 3COXA 3RHAA 4OCGA 1DNCA 3QVPA 3UOYA 4FK1C 2VOUA 3GWDA 2XFUA 3UKQA 1YKJA 1DJNA 2XYOA 1YQ4A 1B4VA 1NHQA 4Z2UA 2Z5YA 1EBDA 4A7AA 5FMHA 4AOXA 4N9XA 4NTEA 1PDHA 4EIPA 3BI4A 1GETA 2C7GA 3EPTA 1X31B 1GRHA 1S3EA 1FL2A 2VQBA 3P1WA 3DJDA 3KA7A 3QFBA 4RG4A 2JKCA 4D04A 2JB2A 1K0LA 1PXCA 1Z6LA 3LB8A 3AE2A 4CCRA 4C3YA 3PO7A 5C2TA 1EL8A 4BK2A 2WP9A 2ZZCA 3T37A 2V60A 2F5ZA 2XLSA 1ZMDA 4IVOB 4K7ZA 2YG7A 1S2YA 1V59A 3BI5A 1MO9A 3CNPA 3E1TA 5FS6A 4Y4LA 2TPRA 3GDPA 4BJZA 3KD9A 3L8KA 2FJBA 4K22A 4EQRA 1E1KA 3AE4A 5J60A 2YLWA 2C73A 4K5SA 2C64A 3NK1X 3IC9A 2WEUA 5GRTA 1LV0A 2RGJA 4TM1A 2BCGG 4JDRA 1AOGA 2APGA 2WPCA 3P4RA 1TDNA 3CN8A 5KWFA 5TR3A 2YLRA 2FJAA 4H4TA 2X3NA 2OLOA 5BULA 4H2QA 1K0JA 3UTEA 2R46A 2XLRA 4EM3A 2C3DA 1NPXA 1FECA 2GRTA 1L9DA 3CPHG 1GERA 1OJAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2PU9C 5HYMA 2VCVA 5JWRB 3DJGX 3IWAA 5CAXA 3ZNOA 1ML6A 5BUKA 2E82A 1XG8A 5JCUA 5D93A 1QGVA 1MTCA 3MDKA 3C73A 3QDNA 5JWQB 5BVAA 1N4UA 1F37A 2VIMA 3TJGA 2DMMA 2Y6QA 1GSYA 2FJDA 4U2LA 1O8XA 1IUSA 4H4XA 2C67A 3DRNA 3TKSC 5L46A 1GTUA 1B4PA 2R0CA 4BVYB 1B5QA 3H93A 4KA0A 2I0ZA 1C0LA 3D1CA 2FWEA 3ZL5A 3NN6X 4G0KA 2GQWA 3ZRDA 5IMDA 2VZ2A 4H4QA 2OBIA 4CCQA 1H83A 3Q19A 1BYEA 1N1PA 1S3BA 5CKUA 2KLXA 1PD21 4MLYA 5G1LA 4GWRA 2BRYA 4U2TA 4K5RA 1V9WA 2YZHA 2EIRA 1GTIA 2VL9A 4Q5NA 2V61A 2DKIA 2IJYA 2GMJA 1KBNA 2IVEA 2R4JA 4NAXA 2JZSA 2OACA 3WT2A 5IPGA 2DJ3A 1PBDA 3GYJA 1DUGA 1ERWA 1EEJA 2L57A 3UMAA 1NHYA 4DEJA 3GA4A 2YWLA 2Q7VA 4K7IA 5CRGA 1KF6A 3AY8A 4HQZA 2L6DA 2H8LA 4YT0A 5CRDA 2M46A 2HZFA 1TRBA 3ALLA 3BNUA 1HD2A 1SKWB 1OYJA 1T3BA 1XW9A 5IMVA 4I97A 2VCWA 3F8RA 4CBQA 3FKFA 1Q9IA 2R0GA 1OKTA 3ZNQA 1JFUA 1G7OA 4GRFA 1WRYA 3SZFA 1GEUA 1GSNA 5HHFA 3LORA 1BWCA 3UKHA 2A4VA 5KXJA 1O73A 2H72A 5HR2A 1TI3A 4OD7A 4IN0A 4WCTA 3BCKA 3RBTA 5A4VA 2GV8A 3KVEA 4U8NA 5DBQA 2KP1A 1CC2A 3VFIA 5DCHA 1CHUA 4BA7A 3SZWA 1NEKA 3FR9A 3WD6A 4IA6A 1YZXA 5ID2B 2MYGA 2Q0LA 5KN2A 1WMJA 3IOSA 3RP7A 2GB0A 2VM1A 3C4NA 3GSTA 4EO3A 3APQA 4ZBDA 2DKHA 3VWVA 3GUSA 1Q1RA 3UTGA 2GSRA 4EUYA 4HA6A 3IRAA 2DJ2A 1QK8A 3Q74A 5JCMA 4KDYA 3OR5A 3TOUA 3UARA 1E7PA 2GSSA 2E49A 4ZXGA 5ECSA 1TDEA 1W4XA 4NZHA 1SD8A 2R6KA 1FAAA 3CXGA 22GSA 4XS1A 1X9MB 1JOAA 1GWCA 4IGJA 2FWFA 3VLNA 4A99A 4IW9A 5KN0A 4PUAA 2GZPA 2YLSA 3BHKA 2JK6A 2VM2A 2F9SA 1OJ9A 4EVMA 5JWOB 1AQXA 1EV4A 3GHAA 3IF9A 3RAZA 4DSRA 2PYXA 5FS7A 3KTLA 3AECA 1H6VA 3NH3X 2HZEA 1JU2A 3ZIJA 2GLRA 2X8CA 2GQFA 3ISHA 3AD8B 5J7XA 2H1BA 3DIEA 1TW9A 4TXOA 4YJFA 1DOBA 1IJHA 2XLUA 5DBJA 1W4VA 4B1BA 2K18A 2P0GA 1ZKQA 1D4CA 1KDGA 2WS2A 2GDRA 4I59A 4I6XA 2OE1A 2HQMA 1XW6A 3IXRA 2JSZA 4EQWA 1KSSA 3AD9B 3QMXA 2HT9A 1Z7RA 2EQ9A 1EP7A 2L4QA 3EVIA 5J9CA 4KSOA 1H82A 1TRVA 1ABAA 2IPAA 3GKNA 4OFTA 2GS3A 1G7EA 2Q6UA 1LTXR 2E4AA 3E3EA 4BJYA 4POKA 1VRQB 4EQXA 5DQSA 3AE6A 3DH9A 1XFLA 2WZ9A 1CF3A 3GL5A 3GIXA 2YLXA 3KJYA 4NTDA 4PABA 3NG7X 3V3NA 1F3AA 1OE8A 1E1MA 3D22A 2C66A 3ZTLA 5DAKB 1FVKA 3LXZA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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