3EQDA

X-ray structure of the human mitogen-activated protein kinase kinase 1 (mek1) in a binary complex with atp-gs and mg2p
Total Genus 101
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
101
sequence length
344
structure length
315
Chain Sequence
ELELDEQQRKRLEAFLTQKQKVGELKDDDFEKISELGAGNGGVVFKVSHKPSGLVMARKLIHLEIKPAIRNQIIRELQVLHECNSPYIVGFYGAFYSDGEISICMEHMDGGSLDQVLKKAGRIPEQILGKVSIAVIKGLTYLREKHKIMHRDVKPSNILVNSRGEIKLCDFGVSGQLIDSMANSFVGTRSYMSPERLQGTHYSVQSDIWSMGLSLVEMAVGRYPIPPPDAKELELMFGCPMAIFELLDYIVNEPPPKLPSGVFSLEFQDFVNKCLIKNPAERADLKQLMVHAFIKRSDAEEVDFAGWLCSTIGLN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 1
publication title Crystal Structures of MEK1 Binary and Ternary Complexes with Nucleotides and Inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 101
structure length 315
sequence length 344
ec nomenclature ec 2.7.12.2: Mitogen-activated protein kinase kinase.
pdb deposition date 2008-09-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3eqdA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3eqdA01
3I6WA 5HNGA 5CAQA 1OKZA 3KXNA 5FXQA 3TNQB 4NKSA 2X39A 4I5HA 4WNKA 1M7NA 4FSZA 2BCJA 4BZNA 2SRCA 5DR2A 5TO8A 4HVSA 2R3JA 3PVGA 4DEGA 4LUEA 1H1QA 4O1OA 4N70A 2CGUA 1MRYA 1B39A 4N57A 5CEMA 3VRZA 2QOQA 3Q04A 4KWPA 3F2RA 4AQCA 1IAHA 1WVWA 3RK7A 4LOOA 1H25A 4I93A 5DN3A 5GJFA 3U6HA 1GIJA 1JSTA 4FT9A 2E9VA 5L6WL 4H1MA 3RHXA 2JDSA 3MB7A 2C3JA 3VW8A 5HVYA 5IEXA 5AR3A 4D4YA 4E8AA 3FLWA 4MD7E 5FDPA 3EHAA 2XRUA 2WO6A 2BRGA 4J96A 3Q32A 1H24A 3QQFA 5EG3A 4XBRA 4H05A 2VX3A 4DFXE 5IUHA 2C3IB 2ZB1A 2YM5A 2XA4A 4IDVA 4DG3E 1Q4LA 4E6AA 3AMBA 2RG5A 5L2IA 4DTAA 3MH1A 1TKIA 2XB7A 3ORKA 3O7LD 3V6RA 3MA3A 3UP7A 3LLAA 1VJYA 2Y4IB 3E62A 2WMXA 3JPVA 3R21A 4MTAA 4IQ6A 2QG7A 5AFVA 3QRKA 4GT5A 2CCHA 3RHKA 3OWLA 4XMOA 5JK3A 4IE9A 1Z5MA 2JDVA 5JRQA 2Q0NA 5FEEA 3NAYA 5AUUA 5KNJA 5JRSA 2YERA 3COHA 4P2KA 3I81A 4I6FA 4QQ5A 5IA2A 3R8LA 3IW6A 1G8SA 2ZV8A 3EQFA 2VZ6A 3NYOA 4RX5A 4PDSA 3R8ZA 3EQPA 2F7XE 2XNGA 3ORPA 2XIXA 4IW0A 3DKGA 3KCFA 2XBJA 4O7RA 5EW8A 4ZTNA 1OL2A 3EFJA 1OI9A 5I9WA 3P86A 4GYIA 1Z9XA 3OVVA 4JOAA 3W8LA 4F1OA 3NEWA 4XRLA 2R3NA 4XLIA 4I21A 3FC1X 4OTWA 4D2TA 5DRDA 4ZSJA 4PMPA 3MJ1A 4QMQA 1Q3WA 3DCVA 5JFVA 3I60A 4O0XA 4LFIA 3TT0A 3OBGA 3NUXA 3S2PA 4TWCA 4JR7A 4OAVB 3QX4A 2R9SA 5CY3A 3MN3A 4E5BA 2E2BA 2BZIB 4YHJA 2CN5A 4BI1A 2ZB0A 4EH2A 5LXMA 4UMUA 1CMKE 3VNTA 2CHLA 4F9AA 1QMZA 1H8FA 4TYIA 4L44A 2J7TA 3OG7A 2J0KA 3ENMA 3ZMMA 4J99A 4QYHA 5AV1A 2YM6A 5AUXA 5DLSA 3D5UA 2DS1A 5EYCA 3D7TA 3Q3BA 4I6BA 5TR6A 1REKA 1TQMA 2OWBA 4D1SA 1UU7A 5DGZA 1QPDA 3U51A 2YLEA 2OZAB 1RW8A 4M68A 3BRBA 3HV5A 3D83A 3S0OA 3PXKA 5FTGA 3I1AA 1S9IA 2JD5A 4A9TA 3KVXA 2XK3A 2F49A 5EM7A 3UZRA 4C02A 2C30A 3UMWA 3UQFA 2PZ5A 1YKRA 3DXNA 2O2UA 4ITJA 4RA5A 4FV5A 1YXXA 2W7XA 3HZTA 4U79A 3U4UA 5BVFA 1Y6BA 3NYVA 5CF6A 4HYSA 4ZY5A 2XK6A 4RC3A 5T3QA 1PXLA 1ND4A 2WMVA 1G5SA 4RX9A 2YM7A 3A8XA 4ZZOA 2RL5A 2PMOX 4F0IA 4F4PA 3R9HA 3TTIA 5LVPA 5CENA 3KRLA 4QTEA 4DTBA 1R0EA 2VTRA 1X8BA 4IIRA 4TYHB 5DIAA 1M14A 4J7BA 4FKSA 3U9CA 5LWNA 3TG1A 4FT0A 3IDCA 5K3YA 3OXZA 3RWQA 2XK4A 5JSMA 4RVMA 3R22A 3ZXTA 4CFUA 3GQLA 3F2NA 3V04A 5IDNA 3UNZA 5I0BA 5J1VA 2R3FA 2OH0E 4YO6A 4QMUA 4XLVA 2X2LA 1ERKA 4CMUA 5A6OA 4FVQA 4MF0A 4AOIA 2X7GA 4AT3A 2PVYA 2Z7LA 2P33A 2R3OA 5IF1A 1H01A 3TWJA 2OW3A 4CNHA 4DG0E 3R2YA 3ALNA 3B2WA 2PWLA 4ZXTA 4EUUA 3LFCA 4TYHA 5C1QB 1FINA 3LXKA 3PG1A 4FG7A 4F65A 3NVMB 5CF5A 3OBJA 4YC8A 3C13A 1QCFA 4O2ZA 3VBTA 3UVPA 5L3AA 5L8KA 3R04A 4OTFA 1UNLA 3JVRA 4ID7A 4S34A 4L46A 5AR5A 3CE3A 5E92A 2WTDA 4ZTLA 3G6GA 2JKQA 2A4LA 3TCPA 2HW7A 4IADA 2UZNA 3EB0A 1ZOEA 4KBCA 3V6SA 2J5FA 4F7SA 3I0QA 2BTSA 4WO5A 5C26A 5CWZA 4PUZA 4WG3A 4X21A 4S33A 4XG8A 3C4WA 5A4LA 3Q2JA 1SNXA 1J91A 3NAXA 3PJ3A 4QOXA 3CQUA 1U46A 3KVWA 2J9MA 3DQXA 3F2AA 3MIAA 1YDTE 2XZSA 3BV2A 1OL6A 3E7OA 3F5UA 4A7CA 4J97A 5FP6A 5L2QA 4C4HA 4YTFA 1ZOGA 2W1ZA 4DLIA 1PXOA 3LKMA 3DY7A 5D7AA 4DAWA 4QMSA 5IA3A 1W82A 3IGOA 3RPRA 4CKRA 3HGKA 3KMUA 2PE1A 3TV6A 5KMJA 3DOGA 5E8SA 3GFWA 5LCKA 4AZTA 4JBPA 1QPEA 5TOZA 2VUWA 3G0FA 3U87A 2QOHA 4II5A 4USDA 4R8QA 4ZEGA 5K5XA 2YLFA 5FLFA 3GU4A 1F5QA 1PY5A 4O22A 1GZNA 4QP8A 4OTPA 5D10A 4F09A 3RINA 3KRWA 4YHTA 4D5HA 5ETFA 4O1PA 5FG8A 4DEDA 2J90A 4JX3A 4ALUA 2XBAA 2ONLA 5EM5A 5LCJA 3NMUF 5EDRA 2YAAA 3OT8A 4FX3A 4XYFA 4BDKA 4XBUA 5AP2A 5J1WA 2JFLA 3R7UA 1NT2A 3SOAA 5A4CA 2RF9A 4TWNA 4AZSA 4FL3A 4HCVA 4TY1A 4JRNA 2CDZA 4XP0A 2NNWB 4IH8A 3CD8A 2E9NA 2YISA 4M7IA 2Y6MA 4W9WA 5AJQA 4BCJA 4EKLA 4UMQA 5KKRC 4TWPA 5ACKA 2XNMA 3FI2A 2JIIA 3IONA 3LJ0A 3O51A 4H3QA 3NWWA 3AGLA 3PIYA 2WMWA 3LJ1A 4NUSA 4PTCA 2B9HA 4HGEA 2LGCA 2WPAA 1PXJA 4OTRA 1BKXA 5E7RA 3IDPA 2V62A 1IAJA 1PMEA 3BX5A 3ZEPA 1R39A 3DXPA 3FPMA 3QQGA 4FTCA 4ACMA 4H3PA 1DS5A 3R1YA 4NCTC 4GSBA 3EN4A 5JZJA 3PXYA 2P2HA 4QP9A 2WOUA 2O3PA 4WRSA 2WD1A 3NRMA 4J71A 4TXCA 2BDFA 3C4EA 4QYYA 3QD2B 4EI4A 4O7TA 4BI2A 4FODA 1Y57A 4X3FC 5CF4A 1PMNA 4NJDA 4Q9SA 3MTLA 3QKLA 4BCIA 4ANMA 5CASA 3LQ8A 1PXKA 4L00A 3R7IA 5AX3A 4PPAA 4Z7HA 3VO3A 3CY2A 4MD8E 4IX5A 2F2UA 1Q97A 4K1BA 5E8XA 3W2PA 2IPXA 2HAKA 3NNVA 4I41A 3TM0A 4QP4A 5HLPA 5CNNA 3UO5A 1V0OA 1FVRA 3BV3A 2HCKA 4NIFB 5A14A 3VUDA 4WBBB 1YXTA 3UOHA 3MGYA 3MFTA 3QTQA 3FKOA 4H36A 3UIUA 4CQEA 4EOSA 3NDMA 5IH5A 5K4JA 3ATSA 3L1SA 4FV8A 4XS2A 4L9IA 3FMNA 4RZWA 3RTPA 3MH3A 3MVJA 3MJ2A 4MAOA 4RZVA 5E8UA 5LQFA 3MFSA 4PDOA 1Q3DA 3FMJA 2QQ7A 4ZY4A 4CEGA 2PVLA 3F5XA 4TL0A 2V22A 2R3LA 3C0GA 4TZRA 4EQMA 1P4FA 3RP9A 4BCOA 3KU2A 2QO9A 5LMKA 1OITA 3GCQA 2IZUA 4DE4A 5EHLA 3W32A 2BPMA 4Z3VA 1MP8A 2W1DA 2R3GA 3C1XA 5M07A 4NIFA 4KNBA 3FEGA 3DDQA 3IOPA 2C69A 5M55A 3CQWA 4CXAA 4ZSAA 4NYEA 5DH3A 3H30A 2OXDA 2YCRA 3COMA 2WELA 5GJGA 4G17A 4D2PA 1YXUA 3P5KA 1OUKA 1WCCA 5AR8A 4F9YA 3N4VA 1GY3A 4C4GA 3FLNC 3EH9A 1JKSA 1GIIA 3NX8A 3O8PA 4R3CA 5EDQA 4A06A 2WQBA 4C58A 5DT4A 3GU6A 1UU8A 2VRXA 4JX7A 1JSVA 2OFVA 2B7AA 2PMNX 5DEYA 5IQGA 1NVQA 3UODA 5CEOA 3LZBA 4H58A 3AD4A 4EHVA 2WTKC 4LL0A 5KX8A 3Q96A 4IAAA 2X1NA 2JAVA 3U6IA 4DYMA 3F7WA 3MFUA 4NU1A 1R1WA 4I4EA 3PYYA 2YIQA 4FIFA 4UZDA 3U6JA 5LOHA 4GYGA 3QWKA 5ANJA 3QKMA 4QMTA 3ZU7A 1OIRA 4S31A 2W0JA 2YWPA 2QURA 2XYUA 3L9NA 1CKPA 2PMIA 3D7ZA 5DYJA 4ZTSA 1OIUA 4YURA 1OECA 4M84A 3EN5A 5HNBA 3SKCA 2VNWA 3TXOA 2JITA 4FEUA 3WZUA 1JWHA 3FYKX 3G0EA 3PA4A 3EJ1A 3GC0A 4N4SA 3DZQA 2XKDA 4U44A 3SD0A 4FIHA 2GS2A 4QMOA 2AUHA 4ZP5A 4F08A 5HX6A 3FMKA 4BCMA 4C59A 3JUHA 5AIRA 4CV9A 5H2UA 3LFDA 5HORA 4IM0A 2WIPA 2ITNA 3EQGA 2PTKA 4O6EA 4IXPA 4C3PA 5M53A 3HV6A 4EZ3A 3FC2A 4ACHA 4M0ZA 2NP8A 4MWIA 3IW8A 3V8WA 4DGMA 4EOJA 4O82A 3LCTA 3LFSA 4CFMA 3CQEA 4YMJA 4EUTA 2CCIA 4YTCA 4QMWA 3FI3A 4J8NA 4FL1A 3QGYA 1ZZLA 4C62A 4FK3A 4XX9A 5ANDA 4E26A 3LFNA 2UW9A 1PXPA 5BVWA 2X7FA 5M06A 3EL8A 3ZBFA 4WG4A 2XS0A 4F7LA 3VUIA 2FA2A 3D0EA 4FTJA 4LOQA 3DXQA 4PF4A 3M2WA 5CVFA 3BQCA 5EI2A 2NRYA 4WOVA 2XYNA 3WZEA 4C7TA 2IO6A 3C5UA 3HYHA 3W16A 4YZCA 1M52A 2J6MA 1Q8YA 3D94A 4UWCA 1Q24A 4LMUA 5IZFA 4FNWA 4WKQA 5IDPA 5AIKA 4ENYA 3HDMA 1GZOA 2R5TA 3HECA 4BBMA 2UVXA 2AC3A 3W8QA 5HZNA 2R2PA 2BFYA 4HW7A 2C4GA 1YWNA 1H28A 5JZNA 3KN5A 3NPCA 3JR1A 4USEA 3G15A 1YHVA 1H26A 2WTIA 4U81A 4EL9A 5EI6A 4ZTHA 5HNIX 1ZLTA 3F5PA 3FXXA 3ORXA 3CTQA 4FZDB 4XV3A 5J7BA 2PU8A 2OJFE 3OC1A 4EONA 1MQBA 3C51A 4NM0A 3THBA 3CKXA 4CRLA 1W7HA 2DQ7X 4DFYA 2LAVA 3OY1A 2WIHA 4FTOA 1YOLA 2VTOA 4BYJA 2I6LA 3HV4A 3RAIA 3RGFA 4AFEA 4CD0A 3ITZA 5BVNA 4K6ZA 3LVPA 4EK3A 4AW2A 4D0WA 3WOWA 4AXAA 3GBZA 4O81A 1K9AA 5KZIA 1CTPE 4RIOA 4X2FA 4O0VA 4D9TA 5IQAA 5AUYA 4U3ZA 4AS0A 2RG6A 1WBOA 2Z7RA 1XH5A 4LGGA 2IW9A 4BGGA 4QTAA 1CM8A 4JS8A 2VWUA 3VBQA 3LIJA 2QLUA 3O50A 3PSBA 1YDRE 1SNUA 2ZM4A 3L9PA 3DKOA 1OGUA 4ZK5A 4BWKA 5J79A 2FB8A 2VAGA 4CFXA 4YPSA 3N4UA 4NEUA 1GZKA 4I0TA 2B55A 4RLKA 5CF8A 3RCDA 4O0SA 4FT7A 1NVRA 5AP0A 5TF9A 4C4JA 1MQ4A 1OIQA 3MA6A 2VN9A 1H1WA 2VX0A 3BBTB 4OTDA 3R7OA 4PNKA 4FNYA 3AT4A 5JGAA 1Y8YA 3PLSA 5J95A 3QXOA 4ZMEA 2GTNA 3WZKA 3TZ9A 2OO8X 2OIQA 3CP9A 2YIXA 1ZRZA 3CS9A 4G34A 3VN9A 2R3RA 4ALVA 5AAGA 3Q52A 2UW0A 4FUYA 3FY2A 3AC8A 4FVPA 4I5MA 3VAPA 3F61A 3GXLA 2Y4IC 3FZTA 4DTKA 3FJQE 3MTFA 1XJDA 3F88A 4RBLA 4G5PA 4MK0A 4QYGA 3QUPA 5C8NA 2HYYA 4OBOA 3IS5A 4AU8A 4U43A 4G3FA 1JLUE 3QQJA 3OXTA 5A54A 2PVMA 4MF1A 1JKKA 4EQCA 1BI8A 2OF2A 3GU7A 4D4SA 4JDIA 3FKLA 5I9XA 3EQRA 1YWVA 4ITIA 2OKRA 4BTKA 1BMKA 1FOTA 5C8MA 2C5XA 4FOBA 3ZDUA 3BIZA 5C4KA 2HZIA 3FQHA 5CT7A 4MKCA 3KCKA 1SZMA 3MB6A 3VUGA 3ZM4A 2OH4A 2ZV2A 2XUUA 4IC7A 4MHAA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3I6W A;  5HNG A;  5CAQ A;  1OKZ A;  3KXN A;  5FXQ A;  3TNQ B;  4NKS A;  2X39 A;  4I5H A;  4WNK A;  1M7N A;  4FSZ A;  2BCJ A;  4BZN A;  2SRC A;  5DR2 A;  5TO8 A;  4HVS A;  2R3J A;  3PVG A;  4DEG A;  4LUE A;  1H1Q A;  4O1O A;  4N70 A;  2CGU A;  1MRY A;  1B39 A;  4N57 A;  5CEM A;  3VRZ A;  2QOQ A;  3Q04 A;  4KWP A;  1OGY A;  4AQC A;  3F2R A;  1IAH A;  1WVW A;  3RK7 A;  4LOO A;  1H25 A;  4I93 A;  5DN3 A;  5GJF A;  3U6H A;  1GIJ A;  1XML A;  1JST A;  4FT9 A;  2E9V A;  5L6W L;  4H1M A;  3RHX A;  2JDS A;  3MB7 A;  2C3J A;  3VW8 A;  5HVY A;  5IEX A;  5AR3 A;  4D4Y A;  4E8A A;  3FLW A;  4MD7 E;  5FDP A;  3EHA A;  2XRU A;  2WO6 A;  2BRG A;  4J96 A;  3Q32 A;  1H24 A;  3QQF A;  5EG3 A;  4XBR A;  4BJJ B;  4H05 A;  2VX3 A;  4DFX E;  5IUH A;  2C3I B;  2ZB1 A;  2YM5 A;  2XA4 A;  4IDV A;  4DG3 E;  1Q4L A;  4E6A A;  3AMB A;  2RG5 A;  5L2I A;  4DTA A;  3MH1 A;  1TKI A;  2XB7 A;  3ORK A;  3O7L D;  3V6R A;  3MA3 A;  3UP7 A;  3LLA A;  1VJY A;  2Y4I B;  3E62 A;  2WMX A;  3JPV A;  3R21 A;  4MTA A;  4IQ6 A;  2QG7 A; 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