3EQIA

X-ray structure of the human mitogen-activated protein kinase kinase 1 (mek1) in a binary complex with adp and mg2p
Total Genus 101
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
101
sequence length
344
structure length
315
Chain Sequence
ELELDEQQRKRLEAFLTQKQKVGELKDDDFEKISELGAGNGGVVFKVSHKPSGLVMARKLIHLEIKPAIRNQIIRELQVLHECNSPYIVGFYGAFYSDGEISICMEHMDGGSLDQVLKKAGRIPEQILGKVSIAVIKGLTYLREKHKIMHRDVKPSNILVNSRGEIKLCDFGVSGQLIDSMANSFVGTRSYMSPERLQGTHYSVQSDIWSMGLSLVEMAVGRYPIPPPDAKELELMFGCPMAIFELLDYIVNEPPPKLPSGVFSLEFQDFVNKCLIKNPAERADLKQLMVHAFIKRSDAEEVDFAGWLCSTIGLN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 1
publication title Crystal Structures of MEK1 Binary and Ternary Complexes with Nucleotides and Inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 101
structure length 315
sequence length 344
ec nomenclature ec 2.7.12.2: Mitogen-activated protein kinase kinase.
pdb deposition date 2008-09-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3eqiA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3eqiA01
3C4ZA 4FGRA 4O0XA 3VAPA 4BI1A 5C8NA 1XH9A 3HMOA 4D5HA 1YXVA 3BYMA 2ZMCA 3SD0A 2WTDA 4H36A 4FC0A 1VYZA 4E6DA 3FKOA 4P4CA 3FKLA 5IA4A 4KRCA 3AD5A 2XIZA 5HG5A 3KMUA 1P5EA 2W1FA 3PIXA 3QTZA 2YACA 3EMGA 3NYNA 4LG4A 1H0WA 2XBAA 3QUPA 4W4XA 4YPSA 2W1EA 5ANJA 3WZUA 4DH8A 4D0XA 5IG1A 5D10A 2F4JA 4CTCA 4U9AA 5J9ZA 1HOWA 4EOPA 4C61A 4OBPA 5IEVA 1J7UA 1W7HA 4ZAUA 3FZTA 4IAAA 5HTCA 3AC1A 3DGKA 4IWPA 2GNHA 4KNBA 2HXLA 1UU8A 2B4SB 5HICA 3VBXA 1LPUA 4D4VA 5LXMA 3NW6A 3QQHA 1MQ4A 2QOLA 3Q53A 4BGGA 2VO7A 2F7XE 4IIRA 4YHFA 3I0QA 3UZPA 2CGUA 5L3AA 3A7IA 4UBAA 1AD5A 1JKLA 3FYKX 2WQMA 1VZOA 3OY1A 3JXWA 4XLVA 4EQMA 3V51A 5AAFA 3OROA 4IACA 3ZFXA 3WZEA 3S0OA 4MQ2A 4EH3A 5HU9A 1IAHA 1KE9A 5BVEA 3HRCA 4IZAA 2I0EA 4DEHA 3FLYA 4BDKA 1PMNA 2W4KA 3VWAA 2PVRA 3MA6A 4M84A 4CTBA 1JLUE 4EZ3A 4J1RA 4S2ZA 4WNMA 4JDIA 4ANSA 1QCFA 4ENXA 4DCAA 4Q2AA 3OY3A 1R78A 4F7JA 2QNJA 4ASXA 3MH1A 3CCNA 3CQWA 4PX6A 4I94A 1FVTA 1XH5A 2XK7A 4ZY5A 5BVFA 2YJRA 3QCXA 4RX7A 4V0GB 3BZ3A 4DT9A 1Y57A 4PMPA 4ACMA 2ONLA 3HAMA 1YXUA 3LJ2A 3FI2A 4IMYA 4NEUA 3RAKA 2HZIA 3GCVA 2FVDA 2R7BA 1JSUA 2NO3A 2C5YA 3GBZA 4U8ZA 4FTCA 3ZM4A 3GI3A 5IUHA 2WMUA 2QQ7A 4Y46A 1NY3A 2BUJA 3QD0A 4IB0A 4XBRA 2R3NA 5AUXA 3DPKA 4X2FA 1NW1A 1XBBA 2I0HA 4LUEA 2X7OA 4HYSA 3GNIB 4FT0A 2WEVA 1VEBA 2W5AA 4H39A 4LV5A 4K9YA 2ZB0A 1V0OA 4GT4A 3ROCA 3WZDA 1JPAA 2VTIA 5BQ0A 4DT8A 4DINA 3I81A 4CNHA 2VTQA 3GOPA 3O8TA 4XS2A 4ZY6A 3SDJA 3UQGA 3ENMA 2JAMA 4MTAA 2Z02A 3L8PA 3LIJA 3SOCA 3V8WA 4LI5A 4U44A 4AE6A 5HX8A 2IJMA 4FTOA 3F3WA 2ZB1A 4FNXA 4L3LA 4M15A 2CNUA 2I0YA 3LCTA 3BEGA 4OT5A 3VS4A 1L3RE 3RINA 3HMPA 3WZJA 4E1ZA 3IW8A 3F5PA 3NGAA 4H05A 3HYHA 2BRNA 4MXCA 1OL2A 2J90A 4UZDA 4YU2A 3BQCA 4KKHA 3BHHA 4M69B 5AM7A 4IADA 3DDPA 4ZSLA 4EK4A 2X9FA 4CEGA 3R7YA 3LCSA 3TL8A 2QD9A 2ITWA 1J1CA 1WBTA 4X3FB 4C37A 4E73A 1ZYSA 4NSTA 1GIHA 2UZNA 4BR3A 3CGFA 4MXYA 4CFWA 3TUBA 4YZBA 1KWPA 5CU0A 5ITAA 3AGLA 4WKQA 3TZMA 2CGVA 4ACDA 5JKGA 2C5XA 4FIJA 5B2LA 5HVKA 3DJ5A 4RFZA 2G01A 5HIEA 4DBNA 3G5DA 4PV0A 5D12A 5J5SA 5AP3A 3FWQA 3VHKA 3EQPA 1JOWB 1Q3DA 2GTMA 2XNBA 4ZK5A 2UW5A 2HWOA 2NRYA 4S30A 4PMSA 4UXLA 3CKWA 2X7GA 4BDEA 3N9XA 2NP8A 3NUPA 2B9HA 1YXTA 1LR4A 1UVRA 4RFMA 2RFNA 3E92A 4IEBA 4UYNA 5AAEA 3KFAA 4JBQA 5D7VA 3KCFA 3AT3A 2BAJA 4O82A 2E2BA 3EQDA 2UW6A 3KVXA 3ZCLA 5JMSA 2JBPA 4TYJA 4BKYA 5CXZA 3KCKA 4E6CA 5C01A 4U6RA 4FG7A 1MRYA 2C1AA 3NCZA 2XNEA 5CS6A 2OXXA 3TACA 4TL0A 2XA4A 3GOKA 3KK8A 4PF4A 4I6QA 2FA2A 3AQVA 1K3AA 2QOIA 2PVMA 4ID7A 3KU2A 3ODYX 5LCKA 2VTHA 4QTCA 4GUEA 3FHRA 4DG0E 3EJ1A 1Y8YA 3ETAA 4K77A 3CS9A 4D2SA 3FPQA 5BX0A 2IN6A 2UZOA 4OAUC 5D7AA 5LQFA 3RM6A 3CR0A 5DR6A 5ANIA 4YSJA 3NDMA 5M56A 3LMIA 4I24A 3F3UA 4O7LA 3ORIA 3HDNA 4QMUA 1QPDA 3RPYA 2XNNA 4MKCA 5TR6A 3SV0A 2J2IB 3FZRA 3L9MA 1KE7A 2XKCA 3K3IA 2W17A 2F2UA 5D11A 3RTPA 3HV5A 3FQEA 5DR9A 4RX5A 2X4ZA 4MYGA 3OT8A 5KMKA 2WOUA 3BYOA 5ETIA 5E8UA 4UMPA 1IAJA 4I5CA 4DEAA 3EWHA 4FNYA 4PL4A 3LFBA 3MJ2A 3R9NA 2ZDTA 1JVPP 2QG5A 2WTIA 3I1AA 4IAIA 3A8WA 5GINE 3FXZA 5I4NA 2YITA 5M57A 5FDXA 4B99A 4LMUA 3GCQA 3VVHA 3QL8A 4CCUA 4IJ9A 4GT3A 3CQUA 3L1SA 2PVYA 1H01A 2EB2A 4F7SA 3E64A 4DFUA 3MWUA 3BBWA 4BIDA 3O71A 2G2FA 1JWHA 3D2IA 3QRTA 3OS3A 4I0SA 3ZYAA 5HZNA 1YQJA 1O6KA 3QZGA 4NU1A 4P7EA 1GY3A 2XM9A 5A4CA 4UALA 1YOMA 2CHLA 2WHBA 1LUFA 4XLIA 4GJ2A 4AZTA 1BYGA 1JKTA 2QO2A 2XCKA 2XKDA 3MSSA 3SHEA 4AT3A 2RL5A 3W8LA 3G0EA 1PMUA 3QKMA 1YWVA 4D4SA 3R28A 5KMNA 4YTHA 4C33A 5F4NA 4AW1A 4TYIA 3VF8A 1SVEA 1MRVA 2HY0A 4LOPA 2CKEA 5KZIA 2CLXA 3IDCA 4G3FA 1JSVA 2JEDA 2I40A 1PXJA 3B8QA 4CYJA 4PDSA 5H9BA 1UNGA 2OH0E 3FMHA 4II5A 5EG3A 2X8EA 3DCVA 4DFYA 3GU5A 2ONLC 2R3HA 4EORA 3R0TA 4KSPA 3H0ZA 3ZSGA 5BVDA 4L3JA 1ZMVA 1V0BA 2WO6A 4MNEB 2ITNA 3DBCA 4TTHB 3CBLA 5CSPA 5JFVA 1OBDA 5BUEA 1H1PA 3DKCA 4PWNA 3IO7A 3EN9A 5FWKK 3SKCA 4EHEA 4CZUA 1CKIA 3KRLA 3F7ZA 4YZNA 4CKJA 5BYLA 4AZSA 1A9UA 4FKUA 2X81A 1KSWA 4I6BA 4WG5A 4XRJA 5CVHA 3LFQA 4AZFA 5IQFA 4M7IA 4EONA 5AAGA 1P14A 4EQCA 3GFWA 4J7BA 2XNGA 5BVNA 2WMSA 3A7FA 4CQGA 4DEBA 3DAEA 3KL8A 3OOMA 2C3JA 2Y9QA 4OTHA 3B2TA 2IW9A 5IA0A 1UKIA 1YRPA 2QOOA 4W9XA 3H9OA 5KMJA 3HUCA 4K2RA 1WAKA 3PE2A 3UOKA 3FY0A 2ESMA 3QRUA 4MHAA 2WIHA 3VS6A 4O6EA 5LMBA 1CMKE 2G15A 3LFSA 3VBQA 5J95A 3L8SA 2VWYA 3EQRA 4RX8A 4OT6A 4GK3A 4WBOA 4MXOA 4QNAA 3GC7A 1PF8A 4FV3A 3L9LA 4LGDA 3G0FA 5B7VA 2QHNA 2W1IA 5IA5A 4D2VA 5DE2A 5EDPA 1O6LA 4KUJA 1WCCA 5TO8A 2IVUA 4F1MA 2CNQA 4PRJA 3IDPA 3OCBA 1L8TA 3VW6A 4E4NA 5IMEA 5EM7A 2AC3A 2AYPA 4UXQA 3NWWA 5GIPE 3OWJA 2OO8X 2PVJA 2CJMA 2PTKA 5IKWA 3FBVA 2YCQA 1F3MC 5CASA 5DMZA 3NLBA 4GK4A 3RPRA 3HDMA 3ULZA 4DH7A 2CKQA 5KHXA 1M7QA 3QRJA 4YGAA 4O91A 3HUBA 1MUOA 1Q5KA 2J0IA 2QR7A 3IOPA 4U81A 1AQ1A 4C4FA 5ETCA 4C0TA 3ZH8A 4RA4A 1KUTA 3BV2A 4BICA 3PY1A 3KF4A 1FGIA 2Q0BA 4H3QA 1RQQA 3RHKA 4IWQA 1KV2A 1VJYA 4FK6A 1IG1A 4CKRA 3GGFA 4NKSA 2VWWA 3KF7A 4M12A 3R1QA 2EVAA 4L3PA 4ZTRA 5HESA 3RNIA 4EBVA 3DBQA 2YDIA 3BHYA 4I5HA 4KS7A 3SRVB 5AWMA 3C4WA 4J71A 2XNPA 4O0RA 4QD6A 3MIYA 2C6EA 3LMGA 3UE4A 5JRQA 3HRFA 4Z16A 5EI6A 3O7LB 5EK7A 1W83A 4AZWA 4F70A 2BFYA 3H9RA 3ORKA 1Y6BA 1GZNA 4M0YA 5H8EA 3ZFYA 5AIRA 3OUKA 3QQKA 4BHZA 4XJ0A 3UNZA 3JUHA 4I92A 3OBGA 2BMCA 4KIOA 3Q2MA 3ZM9A 4BI2A 3DK6A 4R8QA 3OHTA 2JIIA 4JRVA 5KKRC 4IE9A 2IO6A 4NUSA 2CN5A 4NIFB 4FNZA 3MFRA 2J0JA 3VW8A 3G6GA 4QTAA 4UYAA 3KQ7A 3ALNA 3BWJA 4RIYA 3E5AA 3OXZA 2PVFA 5G6VA 5HD7A 2FSTX 3RZFA 2ITQA 4FIGA 4Q5HA 2PVHA 4YZMA 3NYOA 3Q32A 3ZXTA 4AQCA 1H07A 1SMHA 4HCUA 1FMKA 3KEXA 2C5OA 4RIWA 3IDBA 5JGBA 3FUPA 3POZA 4WO5A 3V8TA 4O7ZA 1GZ8A 5JK3A 1WBOA 5AM6A 5CQUA 3GC8A 3QLFA 5CSWA 2C6OA 2QOBA 3JVSA 5HLPA 4AWIA 3F69A 3PYYA 3C9WA 4EHVA 5AP2A 2BHHA 3COIA 3LE6A 3TN8A 4G9RA 4M0ZA 5CAPA 3D5WA 1TVOA 1Q3WA 2PULA 5FTQA 4FA2A 3HV6A 3LCOA 4KKEA 5EKNA 1YI3A 4CG8A 3PA4A 4H1JA 4O21A 2ZV9A 1JQHA 3MTFA 2XH5A 4BDJA 1SVHA 2QG7A 1XH4A 4CRLA 2JDVA 3OUNB 2C69A 3VUIA 4EEVA 4A9SA 3PVGA 4R5SA 3POOA 4QTBA 5CEKA 3U6IA 2J6MA 4RLLA 1DI8A 2XIRA 3UPZA 4GIHA 5HHWA 4M66A 5CSXA 5CX9A 3OW4A 3RZBA 3S00A 2WMQA 4EK8A 4BVUA 3PE1A 3ODZX 5AV3A 4RC4A 1Q8YA 4GRBA 4ZZMA 4IWDA 4BDFA 3REPA 4O83A 2RKUA 2E9OA 4ZSJA 3MB7A 3V5TA 2PUUA 2QR8A 3DKFA 4ANMA 5HTIA 5HQ0A 1PXNA 3LFCA 3W1FA 3JY0A 4HGEA 5IA2A 3NAXA 2O3PA 2R3KA 3VUDA 4JBPA 5DFPA 4DG2E 5AADA 4YJPA 5FEDA 3IW7A 5IUGA 4RVKA 5BMSA 3EN4A 4G2FA 4QPAA 4JLCA 5EM8A 4ZTQA 3ZXZA 4AW5A 4F9WA 3DY7A 4ZMFA 2VGPA 2XVDA 4TNBA 4IC7A 4I41A 3SW4A 3TEIA 5H8BA 2JBOA 4HOKA 2E9UA 4HVHA 1OB3A 2QLQA 3FZ1A 1GIJA 1H27A 5C27A 3EN5A 1EH4A 3C7QA 3NYXA 3P7AA 2WTCA 5CY3A 2UW7A 2IZUA 3FEGA 3R2YA 5CU4A 3DB8A 5K4IA 4X7QA 4F6WA 2W05A 4NTSA 2V62A 2OJJA 3WZKA 2WMRA 3NPCA 3AMYA 5L4QA 2WMAA 5FTGA 4C57A 3EOCA 2C68A 3BLHA 4MH7A 3PWDA 1NA7A 5E7RA 3UC4A 3MFTA 3HA8A 4RRVA 4EH4A 2XYUA 1WBNA 2W9FB 2WMBA 3A7HA 3COMA 5CTPA 4FX3A 1ZARA 4NM0A 5AV2A 4C3PA 2W4OA 3LQ8A 4MNFA 4ALUA 2A4LA 4ARKA 3U4WA 3A2CA 2VTLA 3R71A 4FT9A 4IX4A 4CFNA 2BR1A 2H96A 1HCLA 4D1XA 3AC8A 4UMRA 4PMMA 1KOAA 5JGDA 4I6FA 3UIBA 4RC2A 1ZYLA 2PWLA 3ORXA 3R8VA 3EL7A 5BVWA 3OFMA 3L9NA 4WSQA 4BDHA 2CN8A 5DLSA 4WUAA 1XHAA 3ZLXA 3VQUA 5K0XA 4WNOA 3WBLA 3ATSA 5AUWA 4PQNA 3JVRA 4FKQA 4UV0A 3R1SA 3T3UA 3OTUA 4C4HA 2WNTA 5IQHA 2P4IA 2XUUA 4U43A 3V8SA 3W18A 4EC9A 4E4XA 3FHIA 1OGUA 2W0JA 2YIYA 5HCYA 5KBRA 2OGVA 4GVJA 5IISA 5AP7A 3SXFA 4PUZA 4X2KA 4AGUA 2JKKA 2RGPA 2VN9A 2JKMA 4QQ5A 4KIKA 4FBXA 5AUZA 5E4HA 4B7TA 1Y91A 4FUYA 3A62A 4U5JA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 5AUV A;  3WIG A;  3Q5Z A;  4ZP5 A;  1B38 A;  5DR2 A;  2IW8 A;  3R7I A;  3AC5 A;  4TYE A;  5D9H A;  2UZV A;  4E8A A;  4F6S A;  4CVA A;  4FV0 A;  2VTM A;  4ZME A;  4MAO A;  4CFV A;  4WSY A;  4I4F A;  4D5K A;  4DHF A;  3DQX A;  3MH2 A;  3NMU F;  5EQY A;  4J98 A;  4FR4 A;  3U9N A;  2GS2 A;  1XKK A;  1XR1 A;  2ZM3 A;  4OUC A;  4FVP A;  4FZD B;  3G6H A;  2YWP A;  4ITJ A;  4HZR A;  4I93 A;  5CSH A;  2R3L A;  4AN3 A;  4IAZ A;  2G1T A;  4Y72 A;  1V1K A;  5HNG A;  3D0E A;  5CAN A;  1GAG A;  3LLA A;  4BTJ A;  3EZV A;  5LCJ A;  2PSQ A;  5M44 A;  3MPT A;  4FOB A;  3TDW A;  2BZK B;  4BDD A;  4ZIM A;  3D5X A;  4HGL A;  4I23 A;  3GCS A;  3FI8 A;  4NM3 A;  1RW8 A;  4I3Z A;  3K54 A;  3Q9Z A;  5TKD A;  3D5V A;  4L00 A;  3R1N A;  4OR5 A;  1H1R A;  4F09 A;  3QUD A;  4YC3 A;  2W06 A;  4JS8 A;  4E6A A;  1NVS A;  1QMZ A;  3P5K A;  4E5B A;  3HMN A;  1H1W A;  5IDP A;  4JR7 A;  4AF3 A;  2GHL A;  3LFE A;  2XBJ A;  4QMO A;  5M07 A;  4IAF A;  4IWO A;  2W9Z B;  3CE3 A;  4FTM A;  3H9F A;  3I5N A;  4KBC A;  3GP0 A;  2GNF A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3C4Z A;  4FGR A;  4O0X A;  3VAP A;  4BI1 A;  5C8N A;  1XH9 A;  3HMO A;  4D5H A;  1YXV A;  4AQK A;  3BYM A;  2ZMC A;  3SD0 A;  2WTD A;  4H36 A;  4FC0 A;  1VYZ A;  4E6D A;  3FKO A;  4P4C A;  3FKL A;  5IA4 A;  4KRC A;  3AD5 A;  2XIZ A;  5HG5 A;  3KMU A;  1P5E A;  2W1F A;  3PIX A;  3QTZ A;  2YAC A;  3EMG A;  3NYN A;  4LG4 A;  1H0W A;  2XBA A;  3QUP A;  4W4X A;  4YPS A;  2W1E A;  5ANJ A;  3WZU A;  4DH8 A;  4D0X A;  5IG1 A;  5D10 A;  2F4J A;  4CTC A;  4U9A A;  5J9Z A;  2XAR A;  1HOW A;  4EOP A;  4C61 A;  4OBP A;  5IEV A;  1J7U A;  1W7H A;  4O4C A;  4ZAU A;  3FZT A;  3UDZ A;  4IAA A;  4DHJ A;  5HTC A;  3AC1 A;  3DGK A;  4IWP A;  2GNH A;  4KNB A;  2HXL A;  1UU8 A;  2B4S B;  5HIC A;  3VBX A;  1LPU A;  4D4V A;  5LXM A;  3NW6 A;  3QQH A;  1MQ4 A;  2QOL A;  3Q53 A;  4BGG A;  2VO7 A;  2F7X E;  4IIR A;  4YHF A;  3I0Q A;  3UZP A;  2CGU A;  5L3A A;  3A7I A;  4UBA A;  1AD5 A;  1JKL A;  3FYK X;  2WQM A;  1VZO A;  3OY1 A;  3JXW A;  4XLV A;  4EQM A;  3V51 A;  5AAF A;  3ORO A;  4IAC A;  3ZFX A;  3WZE A;  3S0O A; 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