3EX4A

Human orotidyl-5'-monophosphate decarboxylase in complex with bmp
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
MELSFGARAELPRIHPVASKLLRLMQKKETNLCLSADVSLARELLQLADALGPSICMLKTHVDILNDFTLDVMKELITLAKCHEFLIFEDRKFADIGNTVKKQYEGGIFKIASWADLVNAHVVPGSGVVKGLQEVGLPLHRGCLLIAEMSSTGSLATGDYTRAAVRMAEEHSEFVVGFISGSRVSMKPEFLHLTPGVQLEAGGDNLGQQYNSPQEVIGKRGSDIIIVGRGIISAADRLEAAEMYRKAAWEAYLSRLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Orotidine-5'-phosphate decarboxylase
publication title Lys314 is a nucleophile in non-classical reactions of orotidine-5'-monophosphate decarboxylase
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 99
structure length 257
sequence length 257
ec nomenclature ec 2.4.2.10: Orotate phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2008-10-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3ex4A00
3O8AA 5AYZA 2IQTA 4UFJA 4C1KA 3PG8A 4R53A 4MUZA 1TREA 3NZRA 4O1BA 4TO8A 4ZQMA 1SO4A 2J9XA 2VELA 3PM6A 3DKJA 2ZRYA 4CNNA 1SO5A 4NU7A 5CSSA 1UB3A 2NZLA 3LHUA 2C6QA 1GEQA 4OU1A 1H1ZA 2V9DA 1RD5A 3UWVA 1A5AA 1TTPA 2J88A 4ICNA 1H5YA 2A21A 3O63A 4NJJA 3QC3A 3NA8A 5U7SA 5BW6A 4WJEA 3KVKA 5F4XA 1PVNA 5L6UA 5LGZA 3NQMA 1DV7A 5I3IA 3S1WA 5HINA 1QO2A 3HGOA 2NUYA 3WFAA 1FCUA 1HG3A 1ZALA 2R8WA 2RFGA 4AWTA 4M7SA 4O13A 3S5OA 5K4ZA 3MWAA 1X1OA 3O6CA 4AXKA 5MHBA 4JYDA 2CW6A 5AHEA 4MZYA 4A29A 1F2JA 2V2CA 1F05A 1T0OA 5DCEA 3RK8A 3LCXA 3G1SA 5C55A 3DFTA 3FKKA 3WK0A 3GLCA 3GDMA 1OK6A 1QPQA 1TTIA 5SWUA 4ALDA 5IM51 4Z0SA 2A2IA 4HSNA 4P61A 3BV4A 1G69A 2P0OA 3SI9A 2X1UA 5CKSA 1SPQA 4BWLC 3I7QA 4Z1CA 5D05A 5EY5A 2GPTA 3S1VA 1DQWA 3GNNA 2DJXA 4AEOA 1J2WA 6TIMA 1MEWA 3QMSA 3L5MA 3UXDA 4A21A 1EIXA 1SUXA 1H7WA 3TXVA 1Z41A 1M7OA 4Y90A 3EX2A 2E09A 3S1XA 3THQA 2DZWA 2A6LA 3FJLA 4UR8A 4OV9A 3TDFA 2WPBA 4RZ5A 1TJRA 5I3JA 2B7NA 5HR7A 1G7VA 1SZNA 1AK5A 3UY8A 1WV2A 5HWNA 3TROA 2VOMA 1GG1A 3W7OA 1RQEA 4AHOA 1VYSX 2RH9A 4NX0A 1BWKA 1THFD 4HT3A 1JQVA 1H51A 4HPJA 4I7UA 3QZEA 4LVDA 4ZQNA 2B7QA 1DOSA 3TMQA 4O4WA 1YDOA 2I14A 2R94A 1GPWA 3MBFA 1P5BA 5DXXA 2NXHA 1YDNA 3LGEA 3GR7A 5FF7A 5T26A 4GUIA 4WOZA 3BG3A 2WSYA 1ZAHA 4M6PA 3HMJG 4IMCA 3A21A 4O50A 5DCDA 3TW6A 1OABA 1SFJA 3PAJA 1JCJA 2QCMA 4CCEA 4UCGA 5I3GA 3M5ZA 2YYTA 1L9WA 2RHGA 1XCFA 1GTEA 5AC6A 2HS6A 1WDWA 2X30A 1KFEA 1KW1A 1P4CA 5FF0A 4O1DA 1QNVA 4JICA 3LOTA 2VXNA 3W7JA 3H54A 2QEZA 3GXNA 2YSWA 1Z44A 4ML9A 4O11A 3DAQA 1TPC1 3WJYA 1DBTA 3OVRA 2Y70A 3QJAA 5LNWA 2QAFA 4I9AA 5D38A 5A5WA 3R2GA 4LNYA 1OX5A 4IUOA 3I65A 1T8XA 3O07A 1LBMA 4O4VA 3LHTA 2YFNA 4RZ6A 3UZ5A 4IMDA 5L9FA 5G2WA 1GZGA 1TPB1 1X7FA 2RDWA 3KHJA 1ICQA 2NXGA 1G4EA 3MJYA 1KBJA 1OFQA 3IIOA 1KTBA 2PE4A 3QMTA 1XC4A 1AW5A 3SZ8A 1FBAA 1TIMA 4DO5A 3P81A 3QF0A 1DJQA 3JR2A 2J24A 3TFXA 3W1XA 3W9ZA 3B04A 1F74A 4IMEA 1OX4A 2YXGA 2FPYA 1QFEA 3NQDA 3L67A 1K03A 3WK2A 4JTSA 4YLWA 2H90A 1PV8A 3STFA 4AVFA 1B9BA 3OVQA 1FWSA 4X9SA 2O7SA 2V5LA 2E6YA 4NNBA 3W2NA 3NL3A 1WA3A 3G1XA 1OX4B 4R33A 1TCDA 3NG3A 4UIOA 1IIHA 3CEUA 4GJ1A 2B0MA 2R14A 2W6RA 4Z1BA 4UFMA 2ZRWA 4C1LA 3NQGA 1FWTA 4N9DA 1EP3A 2WOQA 4O8RA 4HIBA 4JTHA 3P62A 3DI0A 3NM3A 2C16A 1KM4A 3EWYA 1QO5A 4U28A 1O4UA 1ZY9A 4XBSA 4JTKA 1ZENA 2G5WA 2DP3A 1NF7A 2DORA 4LS1A 1AL7A 5I3FA 4M6VA 1QPRA 2J6XA 5CZSA 4UTUA 3OIXA 4FNTA 4FX8A 1N7KA 1FCQA 4NT0A 1L6YA 3CC1A 3QH2A 4CCCA 1B4EA 1ML1A 3ABQA 3M44A 4UXDA 1DVJA 4O1AA 3I68A 4PEKA 4NJGA 4K8HA 3WJZA 3EEGA 3LB0A 1VCGA 3NL6A 5LHEA 3NQ8A 3VNDA 3GZ3A 3ZS4A 2J9ZA 1RQBA 1WAUA 2E5CA 4IWWA 1A5CA 3LX9A 2PC4A 4IX0A 3L5LA 3W7LA 1H62A 5CPMA 3W7EA 4ZQPA 2Q3RA 3HGJA 5CZTA 2DZVA 2QDGA 1XFBA 4JS3A 3BLFA 5HUPA 4X22A 5AC8A 4ZMGA 1IF2A 3A9IA 3MP5A 1OF8A 3FYOA 4UR7A 3W1MA 1KFCA 1LLZA 3EXSA 4H3DA 3R12A 3GXTA 1KTCA 3SSJA 2ZZ1A 4WD0A 1H7OA 2GJLA 4WX2A 4KFPA 4JY9A 2OZ0A 3W70A 2DZPA 4Z0JA 3S42A 8TIMA 2F84A 3JS3A 4M7TA 3G3DA 1D3GA 1F5ZA 3Q2DA 4L4LA 5TBOA 1WBJA 4UTIA 4IXXA 3W7HA 5AHMA 2XN2A 3T4CA 3ABRA 1PCWA 3P74A 1TPDA 3W7PA 3KRSA 3C2RA 3MP4A 3QYQA 3NEVA 1SW7A 3TH6A 4TMBA 1A53A 4FO4A 3C2VA 3W85A 2ATMA 3LHYA 2H8ZA 4ZVJA 4RXGA 3IIZA 1HFBA 4RZ4A 1G4SA 5BOOA 3LCGA 4XTDA 2Z0IA 3BG9A 3WK3A 3H53A 4JX6A 3VE9A 3QM3A 4RJEA 2NXIA 3T55A 4KFNA 4UMAA 1ZAIA 3A5VA 3B0PA 1L6SA 2VC6A 3T40A 2E68A 1TB3A 4JY8A 1K7XA 3O6YX 4JX5A 4DF0A 3LV6A 5BNKA 3W1QA 4NJHA 4WY0F 2CZ5A 4JTLA 1JCLA 4HHPA 5AOUA 5LNRA 3LBMA 1TQJA 1VYRA 3G1VA 1H7XA 1LORA 3TAKA 4WY0A 3W7KA 3CTLA 3HPZA 3DHFA 5EBUA 1WX0A 4GUJA 1EPXA 3LCLA 4LC6A 3B8DA 5D2TA 4YL2A 1HO4A 1W3TA 1PCKA 1KFJA 4JGDA 3A23A 1K7EA 4XKYB 4O28A 1P0KA 4WQ6A 5FF4A 2X1TA 4IPIA 3NR0A 1IIGA 5BMWA 3NQAA 3TXZA 4WY0B 2BXVA 5C5YA 1QPNA 4MFEA 1LROA 4MIMA 1HUVA 1VCFA 2JBMA 5KZMA 1GOXA 1ZNNA 1VHCA 1VZWA 3PBYA 2P10A 3G24A 1IXQA 1G4PA 4DF2A 3MO7A 4ORIA 2EAWA 2BWGA 2XFWA 3LCFA 4YXGA 2ZQ0A 3EX3A 3TFCA 2OT1A 2JKAA 3N19B 3S5YA 3L0NA 5CG7A 2V30A 3W88A 2CLKA 2ZZ3A 3L65A 5G1TA 2VEKA 4UMCA 5E0KA 2PRLA 1O5KA 4RV8A 3L9CA 2PCQA 1UJPA 3B4UA 3FIGA 5BMXA 1KFLA 1Z48A 5G1YA 5G2HA 1JJKA 4FNPA 1VLIA 1JCNA 4LV4A 3DZ1A 2OT0A 5J5DA 3TU9A 1MSSA 1PE1A 4AAJA 2E5DA 2G95A 4IXHA 4JTIA 3M6YA 3DGRA 1VGAA 1BEUA 2QR6A 3RLVA 4PFMA 1A5BA 1W0MA 1I2QA 4N6FA 1XM3A 2VEMA 1CI1A 5HULA 2C13A 3QSTA 1F6KA 3BK0A 4O0KA 3ANYA 3NZ1A 5F1UA 3NPXA 3HG3A 5TQLA 2H3BA 4UTWC 4UNKA 2QCGA 5HWMA 5LNVA 4GUFA 4UTHA 4RCXA 2Q8ZA 4MY1A 3NQ6A 1TQXA 3A5FA 1VJIA 3MYPA 5ABTA 1OJXA 2ZZ6A 3O16A 4O53A 1BTMA 4NUWA 4BI7A 1VC4A 1XUZA 1J4EA 1XKYA 1FUYA 3MYOA 2VFGA 2EGZA 4OQVA 1WYIA 3AO0A 3W1PA 3G1DA 1NF0A 4LVGA 3S5NA 1KV5A 7TIMA 1EWEA 4QSHA 2FFCA 4UFHA 5E93A 3W6YA 2JKPA 4QAIA 1H61A 5D30A 4L4MA 4QNEA 1DQXA 3W87A 1GVSA 1OHLA 3LHVA 2J9YA 4JX4A 3EX6A 3FA5A 3NYZA 3CU2A 3IIVA 4PODA 5D2VA 2WO5A 3INPA 4RLIA 2CLIA 1TRIA 3N2MA 1XDLA 2QCNA 4DEFA 1GJPA 2YZRA 3TMLA 1DKWA 4IJBA 3NDOA 2YR1A 3C2EA 4S2BA 4E0CA 1TSIA 3CT7A 3HF3A 3GAKA 2VEPA 2RDTA 3TK7A 3W72A 3MW7A 3HPSA 3NQVA 2FDSA 2R91A 1V7YA 1PHQA 3N9RA 2Z1BA 3SGUA 5F1VA 1HTIA 5CPNA 3OA3A 1JUBA 3GK0A 1ICSA 1TO3A 2Y85A 3MI3A 1R2RA 3BLEA 1FWNA 3W7RA 4O57A 4A2SA 2CZEA 3HJZA 2GQ8A 1T96A 4I7WA 3I6RA 4LU0A 1ME7A 1FWRA 5D2XA 3CLMA 4EF8A 1EX5A 1YYAA 3USBA 4MZ1A 3A24A 1W3NA 3V1PA 3LXBA 2DZUA 1K02A 3V75A 2WJZA 1ZAJA 5HUOA 4GC4A 4CCDA 3W2JA 4KFOA 4MZ8A 1XL9A 1XUUA 4DBEA 3BO9A 4QNWA 2H6RA 1VYPX 2YFOA 1FCVA 1Z42A 2V81A 3LCIA 1TPWA 1UCWA 3BARA 3CPRA 3KRUA 3W86A 1SSGA 3E02A 1PS9A 1KM5A 3G18A 2FB2A 2ZBTA 3ABSA 3HGRA 3FYPA 3U2OA 1IGSA 3QRHA 3UPWA 4FB7A 4DO6A 1R30A 3DXIA 1S5VA 2QCCA 4K39A 1GQNA 3DU0A 3M7WA 1L2UA 4IOTA 2CLEA 3O6DA 4AB4A 4Y96A 1UASA 2W0UA 3UWZA 4MLJA 1EP1A 2ZYFA 3F4NA 4K8EA 2B7PA 3RF9A 2G96A 3CB8A 1TPFA 4JDBA 3VCRA 4FNSA 1YPFA 3PWAA 3R8RA 2RKXA 3RLUA 3EX1A 1Q3NA 2Z6IA 3D0CA 1JCMP 2WNZA 2D73A 3BLIA 2LLEA 4ZL1A 3C0JA 1TYGA 1H63A 3STEA 3IIPA 1YXDA 3IGSA 1N8FA 4TR9A 5HR6A 1D9EA 3UYCA 2NLIA 2RDUA 4JN6A 3HBLA 2GVGA 4JYFA 4O17A 4LW7A 3P60A 1UUMA 1FY6A 2QCHA 3C3NA 4K36A 1R2TA 1OFBA 2GJNA 2TRSA 3MI6A 2QDHA 3MHFA 4GUGA 3OG3A 1ICPA 3NOEA 5I3KA 4BR1A 4UTKA 2V0TA 2B7OA 3S8HA 5D37A 2EPHA 1I45A 3M43A 3UXAA 3B0UX 3EWUA 1I2PA 2ABBA 3LXAA 1VLWA 3CM4A 4LTSA 1CX9A 3LCHA 4O10A 3WJWA 2V2HA 5KITA 1VRDA 1OX6A 2CWNA 3HGSA 1EA0A 3EXTA 1RPXA 4DF1A 2Z2UA 1VS1A 1X6UA 1KV8A 2VFIA 1JRBA 3GR8A 1GVRA 1Y0EA 2X2GA 5TIMA 3EWWA 2WSQA 1I4NA 5CPOA 3KOFA 4LV9A 2CLOA 1LRNA 1DHPA 3M41A 3UQNA 3FJ6A 1P0NA 1NSJA 5D09A 3NL5A 3LTYA 4J9JA 1TV8A 1XBZA 5D33A 4WUIA 2A1YA 3SW6A 5DLCA 3NAVA 2WSRA 1ME9A 5A8GA 3BW4A 1T99A 3EB2A 2C19A 1YADA 3DHDA 5FF3A 1TRDA 3DKLA 4HSOA 5DY3A 4ADTA 4O19A 1RQHA 2ZA3A 4LVBA 1TV7A 1X8FA 4YMZA 3G0UA 1ZCOA 1ALDA 3R5EA 4LOCA 4P2VA 5K7JA 5K9XA 3TKFA 3W84A 3W83A 2CU0A 2ZA2A 3MMTA 5CSRA 3ATYA 3NQEA 3LBCA 1BKSA 4LRTA 4UTJA 2A85A 1LRTA 4FHAA 3PG9A 4M6QA 4GWEA 3E12A 1YLVA 2ZTJA 3NL2A 1D3HA 4N6EA 1AW1A 4OBTA 3W22A 3P8JA 3GX9A 4FF7A 1M7PA 4LS0A 3SR7A 3GDRA 3S5ZA 4MY8A 1TPUA 2Z6JA 5K4XA 3STGA 2W79A 1JVNA 1OYAA 1OFDA 1OK4A 2VENA 1PHWA 1H50A 4K37A 4LT9A 1WBHA 1B4KA 3VFLA 4DBDA 1XDMA 4D2JA 5DXYA 3W2MA 5BRBA 3CWNA 3C2OA 3TC7A 2ZA1A 3MUXA 3AJXA 3NXFA 1OYBA 3PSWA 4BWLA 4ZQCA 3NQCA 5DELA 4FNRA 4KKXA 2E77A 2PRHA 1BWLA 3N2XA 2GQAA 2EF9A 3NQ2A 1FXPA 1QPOA 3GB6A 3QW4B 1FQ0A 1U83A 3NGJA 1K7FA 3LRMA 1H60A 1K8ZA 1I2OA 5F4SA 3G1AA 3IIXA 1KLYA 4CNOA 4JTJA 2ATSA 3W74A 4N2YA 3U8GA 2P1FA 1LRQA 3RFAA 2I9EA 1GT8A 1ADOA 1F73A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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