3EX6 | Genus

Total Genus 97

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	97
sequence length	257
structure length	257
Chain Sequence	MELSFGARAELPRIHPVASKLLRLMQKKETNLCLSADVSLARELLQLADALGPSICMLKTHVDILNDFTLDVMKELITLAKCHEFLIFENRKFADIGNTVKKQYEGGIFKIASWADLVNAHVVPGSGVVKGLQEVGLPLHRGCLLIAEMSSTGSLATGDYTRAAVRMAEEHSEFVVGFISGSRVSMKPEFLHLTPGVQLEAGGDNLGQQYNSPQEVIGKRGSDIIIVGRGIISAADRLEAAEMYRKAAWEAYLSRLG

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase
molecule keywords	Orotidine-5'-phosphate decarboxylase
publication title	Lys314 is a nucleophile in non-classical reactions of orotidine-5'-monophosphate decarboxylase pubmed doi rcsb
source organism	Homo sapiens
total genus	97
structure length	257
sequence length	257
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 2.4.2.10: Orotate phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date	2008-10-16

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00215	OMPdecase	Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3ex6A00

4UFJA 4W9TA 1F74A 1JCJA 3VFLA 3L66A 1K3UA 4LRTA 1H50A 3UD6A 1WBJA 3PWAA 1WXJA 1XM3A 4WX2A 1TQXA 4ZL1A 1KBJA 4HSOA 4UTTA 1XI3A 2EHHA 3M5ZA 3BW2A 4IQLA 4HNVA 5BRBA 2JKEA 4UR8A 1I4NA 2YYUA 4C1KA 4MLJA 5DLCA 1I2NA 2TPSA 1W3IA 4HT3A 4IJBA 3MWAA 6TIMA 1I2OA 3B8DA 4JTKA 5BMXA 3M5VA 5G4WA 1HUVA 3W87A 1LLZA 3P8JA 4DF0A 1IIHA 4IOTA 3LOTA 3RNDA 1YLVA 5J5RA 3G1AA 4H3DA 3EXTA 3W72A 4YCOA 1YYAA 4WD0A 1CX9A 2E6AA 4N02A 1BEUA 5D2YA 3DI0A 3M5YA 3HPXA 1VGAA 2WV8A 1XBVA 1ZENA 5DBUA 2E5BA 2ZDRA 1G67A 2QKFA 4C1LA 2Q3RA 3N2MA 3O63A 4O17A 3BPWA 1TTPA 1WQ5A 2R94A 2VFFA 5FF2A 3E49A 1P0KA 5AC7A 1I2RA 1SW3A 2Y7FA 1VCVA 4N2YA 2C3ZA 1YTEA 2FIQA 4FNUA 1EX5A 1KFBA 3KHJA 1TPDA 4JTJA 1JQVA 3MMTA 2C0AA 5C6MA 1KFJA 3IGXA 1TIMA 2P1FA 1LOLA 4LV9A 4BWLA 3W1XA 3L9CA 2VOMA 3W7KA 1QOQA 1XC4A 1KTCA 3MYOA 1X8FA 3NQ8A 3O8AA 2Z6JA 6ALDA 3LXBA 2AAMA 2YYTA 1BWKA 4PH6A 1S5TA 4YWIA 4WXZA 3W7IA 1KM0A 4UFIA 3TV8A 1GVQA 4RCXA 4MYXA 4NU7A 1BWLA 1TREA 4DBEA 5AB3A 3E0IA 5DN1A 4O53A 1M5WA 1OG0A 2ZBTA 2CW6A 4JTTA 2NWSA 5H91A 2QEZA 2NV1A 3NOEA 1I2PA 2TRSA 3W7PA 3RFAA 1L6WA 1G4EA 3RF9A 1OX5A 3IIZA 3EXRA 4DO6A 4NQ1A 1FX6A 4JTGA 4XKYB 2EPHA 3ATZA 3GDKA 4GWEA 2FB3A 4DQWA 3BLEA 3W2JA 4JDBA 1K7XA 2CWNA 4NNBA 3O07A 5LNUA 2ZZ6A 1SR9A 4NJKA 1VS1A 1Z42A 4WZHA 5E0KA 1AK5A 2ZZ3A 4KFNA 3BG5A 3LCIA 1JUKA 1FDYA 1FQ0A 1MO0A 3NL6A 4QSHA 1RQBA 2CLHA 5F2IA 2NUWA 1VHNA 1XUUA 5DCEA 5IBXA 5AHIA 4ZQCA 2F7FA 1KFEA 1H5YA 1WOAA 4WY0A 3ZWTA 3NPUA 3BW4A 1YPIA 5K4ZA 3KAOA 4QISA 1W56A 3QM3A 4XBSA 4DPPA 1MEHA 5AHEA 1UB3A 2DZSA 3I7RA 2QCDA 1TV8A 4X2RA 1PHQA 2PC4A 3B03A 5HULA 4GC4A 1CW2A 4UTKA 3HGOA 3G1DA 2V30A 1PCKA 4HKPA 1XXXA 3ZS4A 4UMBA 4IUOA 4UIOA 2ZZ7A 3CIWA 2EKCA 3Q2DA 1VYRA 3QW3A 4Z1DA 1SSGA 3T4CA 2B0MA 3QSRA 1JCYA 4JNMA 1GOXA 1XBYA 1ICQA 3G1YA 1M7OA 1ICPA 3PBYA 4JX5A 5HR7A 1W5QA 1H7NA 3QQ1A 4JIPA 2WKJA 1FXQA 1SQ7A 3GK0A 3R13A 5F2LA 2YCEA 2Y63A 2VEIA 4UXDA 3F4NA 1EUNA 1Z48A 1DBTA 2A4AA 5TIMA 3W07A 4YLWA 4DXVA 3NM1A 4CNPA 4HNUA 2YW4A 3N19B 2BXVA 5I3GA 4WQ6A 3TDFA 5D38A 4JICA 2E68A 3AO0A 1H7RA 5EPDA 3IEBA 3V1PA 1PS9A 5AHFA 2HS6A 3HGRA 5U7SA 5I3HA 1MZHA 2C13A 4N9CA 4FB7A 1KFCA 5BNKA 2ISVA 1ME8A 2H3DA 5CPLA 3P7YA 3TAOA 1FCUA 3C2EA 4NZFA 2YW3A 3EWWA 3ZWSA 4DELA 1ADOA 1ZCOA 1NFBA 2ABBA 4AAJA 4UTWC 3PS7A 4EIVA 3W7NA 4JTSA 1O5KA 4J9JA 3V75A 3NQ2A 5DXXA 4LC8A 4M7TA 3EWXA 4IGHA 1MEWA 3UQNA 1LBFA 1F5ZA 1XCFA 2E1DA 3N73A 4GXMA 1C9DA 5A8GA 4Y9AA 3NO5A 1DORA 4Z1AA 4UUIA 1JULA 1ZALA 1L9WA 4Z0JA 3CB8A 3W7RA 2TSYA 3LI0A 3P8IA 3DBPA 1SPQA 2QJIA 3UWVA 1LOSA 4WOQA 4NXKA 4TIMA 4Y8FA 1GVFA 5K4XA 4XUGA 4O11A 1QCWA 3DFSA 2ZQ0A 2QCLA 4IX2A 2QAFA 2QJHA 4XZ9A 4AHOA 1XDMA 2JBMA 5MHBA 1SZGA 1BKSA 3O6CA 2NUXA 3DKJA 1QR7A 1DQWA 4Y90A 1NAL1 1DKWA 2O7QA 2YDAA 3TH6A 3TE9A 4Y6GA 3G1SA 1TCDA 5IBXC 1E51A 1TTJA 3LTSA 4H6KA 1AW2A 1KA9F 4O0ZA 2CZFA 2RHGA 4AXKA 4O1AA 2VELA 4A22A 2V2CA 3W1AA 4FIQA 4GUFA 5EBUA 1X1ZA 5HWNA 3GDMA 2OT1A 4JTLA 3TROA 3W23A 1M7PA 3RU6A 1QFEA 3W83A 2J9YA 1H62A 4DEFA 2OMAA 4CCCA 1ICSA 2RDWA 3A24A 1SZEA 4JTFA 3S1UA 4FNRA 2YGYA 4OHQA 3LV6A 4BI6A 2I1OA 4R53A 3TQ0A 4A21A 4O52A 4TMBA 3EX3A 2A7NA 5EY5A 1TTIA 2CLIA 1B4EA 5D09A 1YDNA 3TNOA 4TU1A 1TPB1 3NR0A 5KZEA 3GAKA 1FCBA 1UBSA 1XKYA 3QW4B 4QIUA 4N6EA 1L6YA 1B9BA 1A5CA 5LNSA 2YX0A 4OQVA 3W7OA 3LCHA 1OFAA 5FF0A 3U2OA 1GVRA 1LLWA 3M47A 4KFOA 3EX6A 3W2NA 3WK1A 3DXIA 4S2BA 4QNWA 4GUGA 2E6FA 5LGXA 2QCEA 4IMEA 2KZHA 2Y85A 3O15A 2JGQA 3E9AA 1SO6A 1OYBA 3L0GA 3KRSA 1XL9A 1M6JA 2Y61A 3MP5A 1GVSA 5G4EA 4NVTA 1F2JA 4UTUA 4RR4A 3WJSA 1KM3A 2X1SA 2ABAA 3CIXA 2I9EA 3LERA 4N6FA 1TPFA 2C6QA 1U83A 4NX0A 3W6YA 4BI7A 3CEPA 4UTLA 2NX9A 4KWWA 2QCHA 1PE1A 1WDWA 4LS2A 5SWUA 1IF2A 1OABA 3NQ6A 4MY8A 3S5ZA 4HIBA 3GNDA 2YZRA 1IXNA 4P2VA 4GUHA 1YTKA 1T96A 1N7KA 4JYDA 3LTYA 2VEMA 3DFTA 2X1RA 1F6PA 4XTDA 3PUEA 3TC7A 3P61A 2GPTA 1IXPA 3W70A 1LORA 1AL8A 3LXAA 4UR7A 3NQEA 4FNPA 3O6DA 4LOCA 4MYAA 2DZUA 3DFQA 4UFLA 4Z0SA 3ATYA 2HS8A 1LRTA 2G97A 3WFAA 4TMCA 2E09A 3L5AA 3DAQA 3PAJA 1UUOA 2WO5A 1OFBA 3PB2A 1VJIA 1XDLA 2VEKA 4QITA 3IIOA 1J2WA 3A5VA 3TQVA 4G1KA 1QPNA 1OX4A 4CNOA 4FHAA 4HPXA 4BR1A 4DF2A 1GYNA 1TO3A 3L0KA 3W3OA 1DJQA 2DZWA 2VC6A 5BW6A 5LNWA 4O18A 3PM6A 2A85A 3VKJA 3W76A 3QMTA 2TYSA 2A1YA 1VHCA 4RLIA 3RK8A 3UWQA 1UCWA 3IIXA 2P10A 3H54A 3SI9A 3NPXA 3GKAA 1C8VA 3L5MA 3JRKA 4HNTA 3CWOX 3M44A 1K7EA 1SUXA 5LKYA 2RFGA 3R89A 3PBUA 3IIVA 3DH7A 5D30A 5K9DA 3B06A 1WA3A 3NVTA 1XBZA 3L65A 5D32A 1RZMA 3VI2A 4BFAA 4JGDA 3WK0A 1Q3NA 5CZJA 2NXIA 1YDOA 1ONRA 3C56A 3SJ3A 2Z0IA 3TSMA 3PG8A 3A23A 4PODA 2NV2A 1EP1A 1DV7A 5AYYA 3DHFA 1R47A 1OYAA 3SZ8A 1QAPA 2A0NA 1V5XA 4GE8A 3LCWA 4WY0F 1LRQA 3NA8A 4UNLA 2CZ5A 4Z1CA 4EF9A 1W31A 1EB3A 3HB9A 1WOBA 1TPVA 2J27A 4ADSA 4U4MA 3MBFA 5KZMA 3USBA 4LVBA 1FWNA 1JCLA 3FLUA 3MBDA 4ZQPA 1H60A 1L6SA 2GVJA 3C2OA 4Z1BA 4CQ8A 1GTEA 3OVRA 3QJAA 1TSIA 1DJNA 5G2IA 1DQXA 1ME7A 4ONVA 2OZ0A 4MY1A 3C61A 5D2TA 1VQTA 1D3GA 3QMRA 2Q3OA 1EPXA 3DFPA 2VKZG 4RK8A 3S42A 1A5BA 3S8HA 4FXSA 1R46A 4O13A 2P0OA 2B7OA 2DJLA 1W5PA 3W7JA 2A2IA 2HSAA 2HTMA 3UZJA 3HGSA 4L4LA 3TIMA 3M43A 4GFSA 4N4QA 2Y89A 5LGZA 1HL2A 3PG9A 4M5PA 2R14A 3DZ1A 4LW7A 4WOZA 5AC8A 3MI3A 2DU2A 3IVTA 4CCEA 3G8RA 1XBXA 3LGEA 5DCBA 5FI8A 4GNJA 4EOUA 3EB2A 3QZEA 3W7CA 5LSMA 3A22A 1TRDA 4WUIA 1LOQA 3RMJA 4R33A 2FLIA 2Y7DA 3SIZA 3IRDA 3S5YA 4NNAA 5D37A 4RX0A 3W86A 3DKLA 4IWWA 3W2LA 3I65A 1S5VA 2BZNA 4DO5A 3HF3A 2WSYA 3MP3A 2C1HA 2B4GA 5BOOA 1X6UA 2WOQA 1EP3A 4O28A 3NL2A 2QDGA 1DVJA 1VYSX 1GPWA 3LHWA 3TMLA 1A53A 3TW7A 5K9XA 1NVMA 1THFD 2PRHA 4MY9A 3N9SA 3RLUA 1OFDA 3EX4A 4MLRA 4UFKA 1KBIA 4WY0B 4PCFA 4LUIA 3S5OA 1R2TA 3HGJA 1NF0A 4MKNA 5ABTA 3O06A 4LV4A 4RKAA 4IPIA 2XN2A 3MHFA 1QPOA 1P0NA 2QCDB 5AC6A 1VCFA 3CHVA 2FFCA 3D0CA 1QO5A 2E5CA 5CGQA 1JCXA 3W1UA 1OYCA 3O05A 1OX6A 1OFPA 3AJXA 4I7UA 3W2MA 1VR6A 3R5EA 2QAPA 4U28A 4I7VA 2V9DA 4HPJA 5AYZA 3T44A 4AF0A 1JUBA 4GUIA 4LS1A 3W7HA 1H7PA 4UTTC 4O4WA 1T99A 3THAA 2ATMA 3L2IA 4MZ8A 3NZRA 3I7SA 1SW7A 1SZNA 4NJHA 2H3BA 4LTSA 3JS3A 4FX8A 4I9AA 1OJXA 1VC4A 3N14A 3KVKA 3W74A 3LHZA 2DZXA 2GQ9A 5TBOA 2VXNA 3SR7A 4Y96A 1KV8A 4AVFA 1UUMA 4N4PA 1JRCA 1W5NA 1XFBA 3PBVA 1B4KA 3C4UA 4AWSA 5D2VA 5F1UA 2Q8ZA 3TR2A 2E6DA 5AN7A 2DZVA 1L2UA 4FNQA 3PBWA 3C52A 4RZ4A 1DL3A 3W1PA 4PFMA 3L5LA 4PL1A 3GNNA 3BO9A 4JTUA 3IGUA 4MFEA 4JEQA 3HG4A 1C29A 1NSJA 3OVQA 1TPC1 2CLLA 2B7PA 1H1YA 4E2DA 1TV7A 1PV8A 3VE9A 1OVDA 1WYIA 2CZEA 4NJJA 4OV9A 2WSRA 1Q6QA 4X9SA 3NL5A 3HPZA 1YXYA 3MI2A 5F4WA 3TA6A 2WNNA 1DOSA 4HHPA 4BWLC 1VPXA 4CCDA 3P81A 3QPYA 3HPSA 2OJPA 3SFKA 2B7QA 2Y7GA 3W2KA 4BF9A 1LBLA 1IIGA 4RXFA 3B05A 1OF6A 2ZTJA 3CT7A 4CNNA 1TPH1 3G1VA 4JTEA 4K38A 1D3HA 3HBLA 1H7XA 2I14A 1KV5A 1KM5A 1PCWA 5HR6A 5AHMA 3C0JA 1LROA 5KINA 2E5DA 2Y70A 5EYWA 4O0KA 1FBAA 1FDZA 3UY7A 4AEOA 3LLDA 2Y7EA 1TTQA 2ZZ2A 3EX2A 4AMAA 4D2JA 4QAIA 3G1FA 3QRHA 2QCNA 2NWRA 2QDHA 1GYLA 3N3MA 3S0CA 4HSNA 5HUOA 4O12A 1R30A 1ZAHA 2ZRZA 3GYEA 1EEPA 1MSSA 1JQXA 4GUJA 4JX6A 4M7SA 4R34A 2QCFA 3P74A 2A21A 2H8XA 1WX0A 3W88A 3B0VC 1G4TA 1VLIA 3C8FA 3P62A 3BW3A 1GJPA 4ZQNA 5HMSA 5GVJA 1W0MA 2X2GA 1EWEA 5A5WA 4OE7A 4RV8A 1OFQA 3A21A 2DP3A 3R12A 5D04C 2ATSA 3TXVA 3NNTA 1NEYA 4K8HA 3FKKA 4E38A 3CEUA 4JR5A 3SW6A 3LX9A 2BLEA 1X1OA 2A6LA 1G7VA 3WJYA 4EWND 5D33A 2QCGA 5C2XA 3S1WA 1ML1A 5FF4A 3CPRA 1ZNNA 2X30A 3M5XA 5HWJA 5LNRA 2UV8G 5CG7A 1KFKA 1FUYA 1W37A 3QF0A 4OWGA 1KFLA 3BG9A 1KM2A 2PURA 4JS3A 4UCGA 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5D02A 3THQA 3U6WA 1K8YA 5FEZA 1OK6A 5CPMA 1ZAIA 2WJZA 2JGYA 3INPA 4K7VA 3UPWA 3P82A 4LUJA 4ADUA 1NF7A 1JUEA 4JY8A 3L21A 3G8EA 3MHUA 2Y62A 3LTPA 3EWZA 4LY8A 4Q33A 3IGSA 3KOFA 3HMJG 1EWDA 4PTNA 3ABRA 4UMAA 3W1LA 4IX0A 3FS2A 4ZVJA 1AW1A 3DENA 4FX7A 1SO5A 2FQIA 4M19A 1P5BA 1LDCA 2Q8LA 3LB0A 1ALDA 5I3JA 1JR1A 3TSDA 3KX6A 1G69A 1B57A 2QF7A 4AWUA 1SU5A 2W0UA 3P5ZA 3G3DA 4UNKA 3G22A 1G6CA 4K7YA 3FOKA 1I2QA 5LHFA 3W84A 1K8ZA 2G95A 4RZ6A 5K7JA 5KMYA 5CZ0A 5E1QA 4LT9A 2J24A 3RLVA 1X7FA 4NJIA 4K37A 1ZJIA 4EF8A 3SGZA 3UWYA 1Q6RA 4JXCA 1VRDA 3TUUA 3NQGA 4UTHA 3LV5A 4O4VA 4PEKA 2LLEA 3W7GA 4YL2A 3ABOA 3TMQA 3G1HA 2CLMA 3MI6A 2NXHA 3EXSA 4O10A 3LXCA 3CQ0A 1OFRA 4JIQA 3O1NA 3HIJA 2ZA3A 3UYCA 3KXQA 1F76A 2C14A 5HJLA 1FXPA 5HINA 2GQAA 3Q58A 3CLMA 3ABQA 1TB3A 3L67A 2OCZA 5CSRA 2VENA 3GDTA 4N9EA 2Z6IA 1SZFA 2HMCA 5D2XA 5HWMA 1VCGA 3PUOA 5CPNA 3T40A 1OFEA 3NAVA 4RXGA 1O5XA 3EKLA 4LU0A 4TR9A 1FWRA 2V2HA 3BLFA 4CQ9A 4O19A 4FF7A 4OU1A 2CU0A 3W1NA 3TQKA 3B0UX 2QCCA 4JTIA 3ELFA 5I3FA 3GVGA 3PY2A 2V0TA 5DY2A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3EX6A

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