3F4RA

Crystal structure of wolbachia pipientis alpha-dsba1
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
199
structure length
199
Chain Sequence
TSNELLLPLPNDKLLGDPKAPILMIEYASLTCYHCSLFHRNVFPKIKEKYIDTGKMLYIFRHFPLDYRGLKAAMLSHCYEKQEDYFNFNKAVFNSIDSWNYYNLSDLTLLQRIAALSNLKQDAFNQCINDKKIMDKIVNDKSLAINKLGITATPIFFIKLNDDKSYIEHNKVKHGGYKELKYFTNVIDKLYGKAIVKLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Putative uncharacterized protein
publication title Structural and Functional Characterization of the Oxidoreductase alpha-DsbA1 from Wolbachia pipientis
pubmed doi rcsb
source organism Wolbachia pipientis
total genus 76
structure length 199
sequence length 199
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-11-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13462 Thioredoxin_4 Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.40.80 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Ribonucleotide Reductase Protein R1; domain 1 Ribonucleotide Reductase Protein R1; domain 1 3f4rA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3f4rA01
2H0IA 1LBKA 3M9KA 1BYEA 4GCIA 1PKZA 4KX4A 2LRTA 2WS2A 4YAPA 2I9HA 4HJ2A 2KP1A 2F8AA 3DYRA 5AISA 1PKWA 2GSRA 2L4QA 3C1SA 1GSSA 1ML6A 4TKYA 3QCPA 4YQVA 3KH7A 2WDUA 3TKPA 4XIHA 1V57A 4EF0A 5ECOB 3IR4A 4MF7A 1HD2A 4G9HA 1TOFA 2H72A 5IQYA 2AB6A 3QOUA 4RI6A 2GT5A 4F9ZA 2H0GA 1QMVA 5ECNB 3GV1A 3CSHA 1XW9A 3BD2A 3WD6A 2PERA 1XWAA 2YNXA 3O6TA 5JCGA 2TRXA 1UC7A 2B5XA 5DCHA 3HA9A 3G7IA 4OMVA 2ON5A 3TDGA 2EIRA 1EEMA 4EE0A 4V2NA 2CT6A 1AQVA 3L9UA 4AGSA 4CW9A 3QFAC 2CVDA 1U3AA 3HKRA 4J2FA 3KEBA 3APOA 1BJXA 4I8BA 1EP8A 1EP7A 3GX0A 4JR6A 1PRXA 2YV7A 4IJIA 4ULXA 5JWOB 2YZHA 2C3QA 2GSQA 2F3MA 4MZBA 4GSNA 4MH2A 1TU8A 1KEBA 1PA3A 3GA4A 1O8XA 5CP1A 3O76A 4EO3A 2HZEA 4G19A 2DJ1A 5DVBA 4ZBDA 5DQYA 4CHSA 2O85A 2X64A 3FR9A 5FHIA 3CYNA 2IMIA 1M2BA 2L6CA 4IELA 3UVHA 2YV9A 3EC3A 6GSXA 4I5QA 4TOPA 1VRSD 2HYXA 1UN2A 1SK0A 1MTCA 5CYYA 1SL0B 2VL3A 1NW2A 3W8JA 2V1MA 1Z9HA 5ECRB 3GTUB 2ON7A 1ERTA 3VURA 8GSSA 2X99A 1WOUA 2ZCTA 2H70A 4ML1A 3D5JA 3VLNA 2XPDA 3CTGA 1T3BA 4ZL9A 3D4TA 3TUEA 3A3TA 3EMPA 5ID2B 4EXJA 4EUYA 2MMZA 1ERUA 3KGKA 4DSQA 2G2QA 1F2EA 3GX8A 2IWTA 3KZQA 5DDLA 1J9BA 5G2ZA 2OE0A 3CSJA 1T8EB 1R5PA 1XFLA 4KUNA 4WF4A 4ILFA 5DAKB 1XBSA 2CX3A 2QC7A 2CV4A 1SKWB 2PGTA 4ML6A 1GWCA 2C0DA 3F3RA 2FNOA 1OAZA 1V58A 1XPVA 1ILOA 3LG6A 3GKMA 4XRDA 4MF5A 6GSUA 2VCTA 2VOCA 3TOUA 1C72A 4D73A 1ERWA 2YWMA 1GSFA 4EKZA 1U88A 2TRCP 3R2QA 4HQZA 3TGZA 1BQ7A 4KDXA 2DIYA 2DC5A 3D21A 3E3EA 1BAYA 1SENA 3H79A 2O7KA 1R7HA 3VFIA 4WBRD 5IMFA 3HVSA 2DMLA 4HQSA 1F9MA 5J5NA 1Q4JA 1QUWA 1PSQA 5HR3A 3F4RA 1A8YA 3LXTA 4ZL8A 2XBIA 2IFQA 3UJ1A 1K3LA 2GQMA 5ELAA 3D6IA 1TI3A 1JZWA 2V2GA 3I9V2 1X5CA 4ZB9A 3GKXA 5D9XA 2IFQB 2I1UA 5EPFA 2ES7A 2GZZA 3FRCA 5IM9A 4WEYA 3U6VA 2NVLA 4TXOA 4IN0A 1AC1A 4N0VA 2OE1A 5ABRA 2KP2A 4LLRA 5D93A 2L5OA 5GAPD 2FLSA 2VM2A 3C1RA 4MMMA 3VPTA 4OCFA 1F3AA 3UL3A 4TXOB 4NXIA 1XCCA 4O7HA 5ELGA 2B1KA 2OJLA 4IGJA 5G1LA 4ZB6A 2IMKA 1QQ2A 2WULA 3UAPA 2A4VA 3FZ9A 3P2AA 1WMJA 3BBYA 1XWGA 3RBTA 1K0MA 3WGEA 4IQ1A 3HXSA 3GKNA 4HI7A 4POMA 3E9JB 2YCDA 5COHA 5HFGA 4Q5NA 1R4WA 3LSZA 2DLXA 3IAS2 5J4UA 1T4YA 4BWQA 1XOAA 2LJRA 2IPAA 2FA4A 2YANA 1FVJA 2H6XA 2FGXA 5KEJA 4IBPA 3P7XA 1K3OA 2DSAA 1Q98A 2F8FA 3S9FA 3LEFA 3EMXA 2KLXA 3MNGA 2I81A 4NWYA 2IMDA 2CA8A 5ECIB 3P90A 1O81A 1W89A 3ZFBA 2LJKA 1G7EA 4IVFA 2XPEA 4I2TA 2YP6A 4YAVA 1FOVA 3I43A 4HS1A 1O7UA 4OO5A 5C00A 1BG5A 4FYCA 5JCUA 1TTZA 2YWOA 1N2AA 4QL9A 1KTEA 1JZDA 3DVWA 1J0FA 6GSWA 3ZREA 1TRUA 2DJKA 1GTUA 1TW9A 1O8WA 3FR6A 2B5EA 1SJIA 2J23A 4TR1B 3FEUA 5GAND 2C8UA 5CRHA 1WIKA 3DMLA 2HSHA 4WETA 2VD1A 3DIEA 4ISDA 4AJ8A 2NBSA 4MPFA 2C0GA 2IIYA 4ECCA 4HOJA 4RQXA 1GTBA 2LKUA 4JEDA 3V1WA 3D0ZA 2AUVA 3HHVA 2FA8A 1ZL9A 3ED3A 3PH9A 1PN9A 10GSA 4PQHA 1FHEA 2VD0A 1E6BA 5IMZA 5HR1A 4MCUA 2H66A 4BVYA 2I3YA 3BOAA 4DSRA 4JE1A 5DALA 1A23A 1PX6A 4XS4B 5CRDA 4L5LA 3HVXA 3N5OA 3IXRA 1SU9A 2K18A 1GSEA 20GSA 11GSA 2F9SA 1B9XC 3ZVJD 4KDUA 4DVCA 2H19A 4KSOA 4OFMA 3A2XA 3FKFA 1GUKA 4MPGA 1GLQA 2H76A 3L0HA 1G0TA 4Q5QA 1JZOA 5H5QA 3APQA 1SKSB 2V6OA 5CO3A 3L9SA 5ECLB 2YOIA 3LORA 1VF1A 3KIJA 3RPNA 2D2ZA 1M2AA 3KD0A 3DGQA 1T00A 3TRPA 3GH9A 3US3A 2P5QA 1GUMA 1GNWA 1G6YA 3ZTLA 2RM6A 4IP1A 1PL2A 4IP6A 3E0UA 3PGTA 4GXZA 2L59A 2VL2A 3EU3A 4MZWA 4N30A 5G30A 4WF5A 3QAVA 2C4JA 5H5RA 3CSIA 3ZMLA 2TIRA 3FZAA 3QD9A 2EC4A 5HR2A 5J41A 2R37A 5DCGA 1S3DA 2JU5A 2HXKA 1OE8A 4PUFC 5KN1A 1DSBA 4GSTA 1O85A 1YQ1A 4NPBA 5GSSA 1F37A 2G0FA 4TVEA 6GSVA 4LMVA 2V32A 1XWKA 5IO2A 4DSSA 4ZILA 4OCEA 3DWVA 5DBQA 5CRGA 1SKRB 4POBA 1GTAA 2F51A 3QAWA 1XWCA 5GSTA 2O87A 3MWHA 1H75A 4DSSB 1GSQA 1Z6NA 3HJMA 2DJ2A 3UOMA 1TK8B 3VI5A 1XIYA 1DUGA 1SD9A 3L78A 1MDKA 5B8BA 3QDNA 3GFKA 4KE3A 3ERWA 1TXXA 5IOWA 5CNWA 2LRNA 5ECHB 2E7PA 3M9JA 3ZLPA 3F4SA 4PXOA 4TRXA 5E59A 2RM5A 2LQQA 1K0BA 2LRCA 3TJFA 3G7YA 3FYGA 3UEMA 1AW9A 3F3QA 4K0NA 1XOBA 3ISOA 1DBYA 1T1VA 5G1KA 5EL8A 5DQSA 4F03A 5KN0A 1Z5YE 1V2AA 2VL2C 2HZEB 1WPIA 2X8CA 4XCSA 5IMCA 1RK4A 4FYUA 1TRSA 3NZNA 4XHMA 1YKCA 2MMAA 4V2LA 5D9WA 1BEDA 3GNJA 3TKQA 1GSYA 2R5GA 1HQOA 4JR4A 2LNSA 5F07A 2HLSA 19GSA 4F0CA 1MD4A 1THXA 2CVBA 2FHEA 2GVPA 5J3RA 4ZBBA 3D22A 1XZOA 2YWIA 1VF4A 3KM6A 3GURA 1ZOFA 1ZYEA 1GSDA 1F3BA 4F2IA 3ZVJA 2DMMA 1YY7A 2K8SA 4TXVA 3HY2A 3UMAA 5B6NA 3ZZXA 3TOTA 3KP9A 5KN3A 2JADA 2VM1A 4FH8A 2ZUPA 4LL1B 1SL2B 1Z7PA 4N0ZA 2GQKA 4ZXGA 1HYUA 3LYPA 2QKEA 3HCZA 2CQ9A 3RHCA 1O6JA 3Q6OA 3GMFA 2CVKA 2QGVA 3DEXA 3EURA 5ECSA 1SJZA 4WR4A 3FK8A 1A2MA 2C0FA 1NSWA 4JRRA 1TI1A 1SL1B 2HRNA 3ZITA 2OACA 3IAM2 1WE0A 3N9JA 3D4MA 1QK8A 2HSYA 4RQRA 3CRUA 2MZCA 3HZ4A 2H74A 3CRTA 2BMXA 1K0AA 1XVWA 3KXOA 1A8LA 2B7JA 2DBCA 4MJAA 1OVNA 4D73B 2R3XA 2L57A 2P31A 4DEJA 5H5SA 2WGRA 3WYWA 4AJ7A 4JBBA 5J9CA 4NMUA 2VCWA 3VWVA 5F06A 3CXGA 5A4VA 5IIZA 1EOHA 2HZFA 3EYTA 4EDZA 2R4VA 1NM3A 1YDKA 2X8HA 3FY7A 2AHEA 3GIXA 1W4VA 4GTUA 5F05A 5LNKe 3M3MA 4HDEA 2B3SA 1M7TA 4NHZA 4OFTA 3H93A 3I6AA 1U6TA 4TR4A 2NPBA 2H75A 1FW1A 5IMDA 2N5AA 4MLYA 1K0DA 3QMXA 2H1BA 3IV4A 4L0WA 4KB3A 4KCAA 1USBA 2E0QA 4YQUA 1SJ6A 4EL1A 1PL1A 4IQAA 1ST9A 1GTIA 1HNAA 3J7Yb 3W8SA 2M80A 3EVIA 1FB6A 4FYBA 2L6DA 1QGVA 1M9BA 5C04A 1DE1A 1QFNA 3UARA 1GLPA 1Y25A 2LS5A 2P0GA 2FCHA 3UBLA 4IKHA 1V40A 1GL8A 1SK1A 3ZYWA 4MABA 1B4QA 3DD3A 1HNBA 3C7MA 3IK9A 1U3IA 2LQOA 2GS3A 4GLTA 5D73A 1RQMA 2H6ZA 1YJ6A 3MDKA 1PD21 7GSSA 4BWSA 2WRTA 16GSA 4KDYA 1PX7A 3WT2A 3L4NA 3AY8A 1K0CA 2WFCA 3SWLA 2B5YA 4K7IA 3QAGA 5JCWA 3GSTA 4OWYA 2OE3A 1A24A 3BCIA 3MAKA 1UA5A 1OKTA 2YZUA 2L4CA 4MK3A 5F8BA 5ECKB 5L71A 2HNLA 1IYIA 3F4TA 2O8VB 1M99A 1OKDA 5HFKA 4I97A 3KJYA 3PR8A 4CDOA 1OC9A 1NHYA 5DJLA 3P8WA 1A2LA 1XW5A 2LV3A 4HU9A 5A5KA 4IS0A 5G5FA 1J08A 3ME7A 5ECPB 5ECMB 4K6XA 1UVZA 3U5RE 3UVTA 1X5DA 1FG4A 3IK7A 4YQMA 4AJ6A 3QPMA 17GSA 2MMNA 1MD3A 1X9MB 4XRAA 3KCMA 2IL3A 3KH9A 5ECQB 2FD3A 2HE3A 3KP8A 1ERVA 3FR3A 3BJ5A 4PURA 3F6FA 3ME8A 2OKAA 2H6YA 3KMNA 4O92A 5B6MA 2ALBA 2HI7A 2H01A 3M8NA 1GULA 2VCQA 4NV2A 1S3CA 5B8AA 5AGYA 4GWRA 2LTKA 3GHAA 2GLRA 2HRFA 1X9SB 4POLA 1PGTA 2VLUA 2V6KA 2HFDA 4MJBA 3TKRA 2H8LA 3K8NA 4XS6A 1B9YC 22GSA 1AQXA 6GSTA 3WT1A 4FIWA 1X0RA 3A5WA 3H4KA 2WJUA 2LEGA 4PNGA 2VCVA 1VGLA 4ZBAA 5LCZA 2FUG2 1B48A 2GDRA 3HVVA 3HYPA 3LXZA 2GTUA 3G9BA 5DALB 4AF2A 4LL4B 3DXBA 1TRVA 2GT6A 2MYGA 1AUCA 5JWRB 2YJHA 5HR0A 3A2VA 5JWQB 5D8IA 3GKKA 3EINA 12GSA 4BA7A 4MZCA 4EVMA 2I4AA 5LD0A 4KNDA 4MJCA 2BTOT 4PNFA 2GGTA 9GSSA 3H1NA 2JL4A 1B8XA 1YEXA 3HD5A 1O73A 4V1Ap 3G7JA 2FY6A 2VLTA 2GZYA 3ERGA 4BL7A 5EVOA 1X9WB 4NV5A 2JZRA 2YJ7A 2N5FA 1WWJA 5B7CA 2MBTA 3HJOA 1Z7RA 5IO0A 1TK5B 1ABAA 3HDCA 1THOA 3RPPA 1VF3A 2M46A 4XTSA 4RUVA 2K6VA 3UIWA 4ID0A 4MDCA 3QR6A 2QSIA 4XS1A 3EWLA 2OBKA 5IMAA 4HU7A 4KW6A 4G10A 3IPZA 4WR5A 2YWNA 4MJEA 2CZ3A 3F63A 4WXTA 4TW5A 2YPMA 1BX9A 4K0GA 1TU7A 2JACA 4EDYA 5E4WA 3IHQA 1Z3EA 2RUFA 1M9AA 4IHUA 4TR0A 2BJXA 3FHKA 1JHBA 3HZ8A 1OC8A 4J56E 5IOXA 3IA1A 3EU4A 1M2DA 2C1YA 3KMOA 3GUSA 3F8UA 2Z9SA 2FWGA 3HJPA 3ZRDA 4N10A 2VCZA 4NHWA 5AN1A 2FWHA 4G2EA 5ENUA 1I9DA 3ZIJA 4Q5RA 1CQGA 4JU5A 2CAIA 2MBSA 3ZIVA 1M0UA 4POKA 2LSTA 5EY6A 4IJ3A 1JLVA 1V9WA 1QXHA 3DRNA 2NTOA 2R6KA 1ZYQB 4WBJA 1GNEA 2A2RA 4GSSA 3TKSE 2KHPA 4QL7A 2RUEA 4HZ2A 2JSYA 1GUHA 1ZMAA 3O3TA 3UBKA 1R26A 3RHBA 1YF0A 3VWWA 1AAZA 3Q18A 2PMTA 3VWUA 1TP9A 14GSA 5D9TA 2VCXA 2NDOA 4FO5A 3IE3A 3GTUA 4I6XA 4WKWA 4GF0A 1EV9A 2DJ0A 2H1GA 1SD8A 2PVOC 3TKSA 1ACVA 2H1AA 2E2MA 1G7OA 2VL9A 3LFLA 1PQNA 4IW9A 5ID2A 1S3AA 2AJQB 1WP0A 1T7PB 3VPQA 3TRXA 3C8EA 2GQLA 2C3TA 2WB9A 1MDIA 5DAKA 3Q74A 2B6MA 4V1Ag 2FWEA 18GSA 1ZCPA 3TJBA 3GL3A 1GP1A 1XWBA 4X0XA 5HQPA 4HEA2 3DVXA 4BPYA 2RIIA 4PUAA 1ZGNA 3BCKA 1YF1A 6GSYA 1Z6MA 5IPGA 4EC0A 3VWXA 2REMA 2WCIA 4MA9A 2PWJA 5FT3A 4L0UA 1V98A 5D96A 4L5OA 2DJJA 3VK9A 1B4PA 3FW2A 5IMVA 2MMOA 1MDJA 1WJKA 3ERFA 4TR3A 3J7Yk 4ZL7A 4HUAA 1OE7A 4F0BA 1EGOA 4GRFA 4TN8A 1TKDB 2PUKC 3GRXA 1EV4A 2PBJA 1F6MC 2OA7A 5INYA 4ECBA 1NHOA 5AIVA 4KH7A 2YN1A 2GZPA 4ZB8A 4OFNA 4YH2A 4QQ7A 2FWFA 4K9ZA 1Y6EA 3TKSC 4GQFA 5G5EA 3LWAA 3TJJA 1ON4A 1FAAA 4JZQA 3M0FA 2CZ2A 2H0HA 3LYKA 5CREA 2XC2A 3NOFA 1H4OA 1RW1A 1LJRA 1EZKA 3QFBC 2VLVA 1AIUA 1SYRA 3IBHA 2LJAA 4Q5FA 3FZ4A 3GN3A 1TJDA 4K2DA 5GZZB 4I2UA 1YKAA 3ZFLA 1SYXA 2O89A 2H71A 1G6WA 2OBIA 4Z7XA 2C3NA 2AAWA 3PINA 2PU9C 1TDIA 2CX4A 3CMIA 1IYHA 3EE2A 2RLIA 3H8QA 4KCEA 3WGXA 2C80A 1E2YA 2A2SA 1OYJA 2AYTA 3GL5A 4K8MA 5FWGA 4HJMA 3A2WA 1A0RP 3I69A 5G31A 4X43A 1EEJA 1DE2A 4KA0A 2KOKA 4BVXA 3C73A 3F6DA 2JZTA 1X5EA 1AQWA 2LNTA 3L9VA 4NAXA 3RDWA 4PQIA 5D9VA 2IJYA 2B1LA 4MF6A 5A4UA 1LU4A 3TCOA 2J9HA 3LJRA 1JZRA 5IPHA 1KBNA 3GSSA 4HZ4A 4MP4A 2IMEA 5AIXA 3GH6A 2IMFA 3NIVA 2H1DA 1YZXA 13GSA 3FZ5A 4OD7A 4ECIA 1GRXA 2P5RA 2K8VA 4OO4A 1JLWA 1I5GA 1XW6A 4PX1A 1FVKA 1ZZYA 2WZ9A 3WGDA 3IRAA 4GQCA 2VIMA 4J57E 4KAEA 4N11A 4KSMA 2IN3A 3IDVA 3ZL5A 1A0FA 3IOSA 4LMWA 4X1UA 3KTBA 1OC9B 2JSZA 1YEPA 3OR5A 1OC3A 1EOGA 4LA1A 2X8GA 5A4WA 4RI7A 4PGTA 1XVQA 5CRWA 1U87A 2M72A 2VUPA 3TJGA 5HFIA 1GH2A 2E2GA 3VI7A 4V2MA 3ZMKA 1KNGA 5J9BA 4K1FA 3JCML 2PN8A 4TR1A 3Q19A 3W6GA 1K0OA 2R2JA 1TK0B 2LUSA 1CQHA 2KUCA 1HNCA 2N5BA 1FB0A 5CAXA 1K0NA 3SBCA 1VF2A 4ECJA 3KTLA 2CAQA 1GSUA 1K3YA 1AXDA 4KGIA 3TRQA 2AV4A 1N8JA 2GSSA 6GSSA 3GYKA 1EWXA 2B7KA 3APSA 4XS4A 3M1GA 3TJKA 3LQ7A 2PPTA 3MSZA 1WRYA 4L8EA 2DIZA 1XXUA 4F82A 2PVQA 2HT9A 4K7OA 2OADA 2XBQA 3C71A 4K7NA 4E8HA 2V41A 3IC4A 1PMTA 3F0IA 4P3YB 4PQ1A 3CBUA 2VO4A 2VAFA 2C0EA 3LGCA 5DJMA 3RAZA 4MH3A 1TRWA 2DJ3A 2EIOA 2GSTA 4O32A 3TB2A 1MEKA 1R5AA 4O5RA 5F0GA 5KN2A 1URMA 2JZSA 4ACSA 2XHFA 2K9FA 4E8EA 1EGRA 1A2JA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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