3F4VA

Semi-active e176q mutant of rice bglu1, a plant exoglucanase/beta-glucosidase
Total Genus 199
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
199
sequence length
472
structure length
472
Chain Sequence
NWLGGLSRAAFPKRFVFGTVTSAYQVEGMAASGGRGPSIWDAFAHTPGNVAGNQNGDVATDQYHRYKEDVNLMKSLNFDAYRFSISWSRIFPDGEGRVNQEGVAYYNNLINYLLQKGITPYVNLYHYDLPLALEKKYGGWLNAKMADLFTEYADFCFKTFGNRVKHWFTFNQPRIVALLGYDQGTNPPKRCTKCAAGGNSATEPYIVAHNFLLSHAAAVARYRTKYQAAQQGKVGIVLDFNWYEALSNSTEDQAAAQRARDFHIGWYLDPLINGHYPQIMQDLVKDRLPKFTPEQARLVKGSADYIGINQYTASYMKGQQLMQQTPTSYSADWQVTYVFAKNGKPIGPQANSNWLYIVPWGMYGCVNYIKQKYGNPTVVITENGMDQPANLSRDQYLRDTTRVHFYRSYLTQLKKAIDEGANVAGYFAWSLLDNFEWLSGYTSKFGIVYVDFNTLERHPKASAYWFRDMLKH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Beta-glucosidase
publication title The structural basis of oligosaccharide binding by rice BGlu1 beta-glucosidase
pubmed doi rcsb
source organism Oryza sativa japonica group
total genus 199
structure length 472
sequence length 472
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2008-11-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3f4vA00
4PTMA 1GONA 4MNMA 1BPLB 1E6QM 2YDRA 3WQ6A 3LPPA 4UZSA 5I77A 1J0KA 1XD1A 2VQUA 1HJUA 1EH9A 4E4PA 1CEOA 2XSAA 3ARZA 4FLSA 4DM2A 1TCMA 3SEPA 5I5RA 3VGDA 4U5KA 1DWJM 1HJSA 3AXIA 2J8FA 4QAWA 2RGMA 2W5FA 2WCAA 4CCCA 5AY7A 4E8DA 1US3A 4CVUA 1UR9A 3AXXA 2D20A 3OLDA 1ZBVA 2D2OA 4OOZA 5DFAA 4TUFA 3BAKA 4WSKA 3SUTA 4A3HA 4JFUA 1JI2A 4F66A 1H0GA 4A3YA 3AZSA 4RL3A 4PRWA 3N17A 2QMKA 2UWFA 1KCKA 1VB9A 4WIWA 4MNKA 1FA2A 4CUCA 1PIFA 2D0HA 1IZKA 1B31A 2CCRA 3WUEA 3U7BA 2BXZA 1UWTA 4NZCA 3F5KA 3II1A 1BGGA 1EA9C 2XIBA 2D0FA 3T0BA 4GINA 3SURA 1EHNA 4HZ6A 1UWIA 1L8NA 1N82A 3PTKA 2WPGA 2WXDM 3GH7A 2D3NA 4Z2GA 4W8BA 2ZXBA 1HL9A 1CXKA 4V2XA 3W38A 4D6IA 2E8ZA 3SCOA 1CECA 3VUPA 3U7VA 3AISA 4J3WA 5A8MA 3VIIA 2XIIA 3ZJ6A 4Q7NA 4HA4A 5FIPA 3IAQA 3TTQA 5ABFB 4S3JA 2WKGA 2EJ1A 1M04A 4W87A 1J0IA 4GXPA 1UWRA 2PWFA 2O9TA 4TTGA 3T0DA 1KGWA 3AIVA 1OD8A 4J3SA 5CPSA 1KWKA 3B9EA 3SCUA 3WFZA 4KRUA 5LYRA 3GNOA 1R87A 3PZGA 4HOXA 2V3DA 3WD3A 4AMCA 1M7XA 4MTVA 1AQ0A 1NOFA 4UFHA 2W63A 1JYXA 2EPKX 2G3JA 4MAZA 1B30A 1JI1A 2TAAA 3WH7A 1E1FA 4CN1A 4XUYA 1HJWA 1XSJA 4GI9A 4AISA 2ZUMA 1MYRA 4C7DA 5HBFA 4B16A 1M53A 4M24A 4AZIA 1UWUA 2IUZA 2JEPA 1HKJA 4UZUA 5LA0A 3ARWA 4P8XA 3O9NA 1BSIA 1V6WA 4RE4A 1TVNA 3CIVA 4DUWA 1JYWA 1UD5A 5HNNA 4JAWA 1ZS2A 4GZIA 1EDQA 3WF0A 4BQ2A 1X6LA 2XFRA 1Y7VA 3CUJA 3ZOAA 3BSGA 2DSZA 2VVSA 3PZUA 4M29A 5LA2A 4L4PA 2VQTA 2XWEA 4PSRA 1UR8A 4TTUA 4MNJA 1MW0A 4PUEA 3NUKA 1V3HA 1W9DM 2VCBA 3RIKA 1WDPA 2J25A 2GDVA 3WD4A 1CTNA 2V5DA 3VU2A 1WP6A 1CGTA 3K4DA 1MFUA 1MW2A 4W8LA 4HTYA 5A8QA 1OCQA 3OZPA 4MPKA 1V02A 1W32A 1CXHA 3VX1A 2OWXA 4CCEA 1IT0A 3W6LA 1PX3A 4J28A 4AD5A 5BXSA 4D72A 3AIEA 3PZOA 6CGTA 1EQCA 3RM4A 4IPLA 2C8NA 3MUIA 2VZVA 3O2LA 1C3FA 4W5UA 4LYRA 2Z1KA 3WBAA 1GJUA 1UZ1A 2DQXA 1ITCA 3B9DA 4ZE4A 3VIKA 2GK1B 2BVDA 4AD2A 4E2OA 1PAMA 1VJSA 4HMCA 1MQRA 3EDFA 2ZXAA 2OSXA 5EB8A 1R8LA 1E43A 1NOWA 3QHMA 3RPMA 1WDQA 4KRTA 2PWGA 5HDRA 2XM1A 4W88A 3WQVA 5FKYA 3THDA 2VMFA 3B9AA 3BAIA 2WNWA 2X09A 5HOSA 1G01A 4X9YA 1HJQA 1J18A 2Y4SA 4JCMA 2DSKA 3BAXA 3RDKA 1UA3A 2X0HA 4ZE5A 1GHSA 5IHSA 1W1VA 1XCXA 2C7FA 2ZIDA 2F8QA 5CQ1A 5M17A 3ZQ9A 4U33A 4PMVA 1X6NA 1ZU8A 3KL3A 2VX6A 2XWDA 1EHAA 1V08A 1QI5A 1M03A 4WKFA 4CD7A 1XSIA 1QHZA 1W2PA 5D9NA 1V3MA 3PZ9A 3AIUA 2PC8A 2FGZA 1HKMA 3CUGA 4UQDA 1U30A 1FP9A 3BXWA 4NSBA 1JZ5A 3CH9A 4BCEA 1OGBA 1JZ7A 1QHPA 2J78A 1PX4A 1WKYA 5IFPA 1H09A 1EOKA 1ISXA 4GI8A 3QR3A 1HXJA 9CGTA 3VPLA 4JL2A 1EO5A 3AYSA 1UD2A 1TUXA 4XB3A 1KWGA 4PMQA 1WCGA 2W61A 2XUCA 1KXVA 5GNYA 4WF7A 1H41A 1ISWA 1VJZA 1GPFA 1UR1A 4PCSA 1FH7A 3S2CA 5A6AA 4D6GA 2WVSA 4HPGA 4QFUA 1E5JA 3WL1A 4D6EA 3D5HA 1H11A 3OB8A 2JE8A 1LF1A 2YOCA 4D6JA 2Y2WA 1FFQA 1JYVA 4GQQA 3ARRA 1WPCA 3SUWA 1RPKA 1A3HA 1Q4NX 2NSXA 3MS8A 2PBGA 4JFTA 3WF3A 3FW6A 1UWSA 2WC3A 5AYBA 5AC4A 1G9HA 2QMJA 1MQQA 3VD4A 4CD4A 1V3IA 2C0HA 3APGA 5E6YA 1CLXA 3AHXA 2WYSA 3CO4A 1GOQA 2CESA 3BMWA 1WZLA 5C71A 8CGTA 5D8WA 3MSGA 2BHZA 3PTQA 4P7QA 3GH5A 1QBBA 4MB5A 1KBBA 2ZUWA 4WK9A 1W3JA 4AD3A 2X8RA 1DWFM 2ZUNA 4WSJA 3AMCA 5CLTA 2EPMX 3PBGA 4UQ9A 2X2YA 3WUBA 2WVVA 4B15A 5EFDA 1JZ2A 2VURA 1C92A 5I2UA 4UNIA 3SCTA 5A6KA 2WBKA 1E4IA 1ITXA 4BQ3A 2VC9A 3MO4A 3AROA 3ZR6A 2CPUA 3IJ7A 1OINA 3GBDA 4MJ4A 1LWJA 2FHCA 2ZX7A 5DF0A 4AXNA 3B8SA 1VFUA 1MQPA 1VEMA 3MV01 3DC0A 3THCA 5I3DA 1TE1A 4J3XA 4PSPA 3BH4A 3K8MA 4M56A 4KWUA 2J7GA 1KQYA 3NSXA 5ABHA 3T2OA 3W29A 3WQ8A 3BC9A 1KB3A 2Z1SA 1ISYA 2ZX5A 5D8ZA 2CBVA 2JEQA 2JIWA 2Y8VA 3CZJA 3CTTA 3NSMA 2GJXA 3UG3A 2WHMA 4CGTA 1VAHA 1MXGA 1JDAA 1CWYA 4P8UA 1SMDA 3OLIA 3GXFA 3VD3A 1HF6A 5BCAA 3AQUA 4B9ZA 3BAJA 5A3HA 4UQCA 3PHAA 4PCTA 2BVYA 1B3ZA 2NT1A 4YHEA 3DYPA 4BS0A 3CGTA 4BQ4A 5A6LA 1VBUA 3MMWA 3AMLA 1ECEA 1CXFA 3BCFA 1GHRA 4HZ7A 4J3UA 3ZIZA 1V3LA 1HJVA 1OT1A 3GZAA 3TTYA 4W86A 3TP4A 4CD8A 4OOUA 3KE0A 3ZSSA 4W84A 2DEPA 2PBOA 4IUGA 1JD7A 1E6RA 1E73M 1E6PA 2GJXB 4DWSD 1TVPA 2PWEA 3VD9A 4PMUA 3VX0A 1NH6A 1J0JA 2V38A 4HU8A 2OWCA 3VOCA 1D3CA 4XZWA 3GXIA 3ALGA 1ODZA 5D9MA 3ALFA 2X0YA 1UOKA 1K9TA 5CSYA 2BY2A 5A6BD 1CDGA 1C8XA 1AQHA 4JHOA 1JDCA 5M03A 2V3GA 2E40A 1EXPA 2CHOA 1GVIA 4OZOA 1QVBA 4PYSA 1XH1A 4ATDA 3A4WA 1CBGA 1V3JA 1V0NA 2J7FA 5BROA 1VIWA 3GNPA 2Q8XA 2DT2A 1E4MM 4N0RA 4ZFMA 3U5UA 1ZBCA 2W91A 2YLLA 3BLPX 3OGVA 4WKAA 3WH8A 4TVUA 1GOKA 1JZ6A 1EO7A 2YA0A 1UZ4A 1BYCA 2X1IA 3IAPA 2WMFA 3N18A 3VIPA 1XHGA 2DSUA 1WE5A 5JUVA 4Z2HA 5BXRA 2J7CA 1C91A 3AS2A 2XVLA 2CIPA 4PMDA 5JIPA 3U5YA 1W3LA 2DH2A 3CBWA 3VO0A 1BYAA 3CZKA 2WMIA 4H8VA 3ZT7A 4UFIA 4D6FA 3TTOA 2XFFA 2D23A 1HVQA 3G6LA 1VFMA 1W1YA 4RE2A 1O7AA 3RO8A 2J74A 3AFBA 5IXEA 3AHVA 2FHBA 1UH2A 4Z2JA 3LMYA 2DPEA 1ZB5A 4QLLA 2BNJA 1DWIM 2O9PA 1VRXA 5CXPA 4GO8A 1QPKA 5I23A 1WDRA 3NDZA 2A3HA 1GQIA 4KGLA 3PZVA 1F4AA 4U2YA 2OYKA 3WL0A 3W27A 4AEFA 3CUHA 2F61A 2IXUA 2G41A 3A3HA 4HPHA 5IDIA 5I0DA 4FLQA 1GVYA 3J7HA 4W5ZA 4ZENA 1NP2A 3WIJA 2YBTA 3PTMA 3WFLA 4PTXA 4JFVA 2WB5A 1BAGA 3BAWA 2CKRA 1DWGM 3AS1A 1E6SM 3ARTA 3QOMA 4D6CA 2YA1A 1L0PA 1E56A 1CXIA 1OM0A 4W89A 2ZX8A 3CZGA 1NWSA 3LPOA 4GPNA 4H8UA 2WAGA 1MXDA 4F9DA 1R7AA 4GI6A 5KEZA 1EGZA 2WW5A 2JIEA 2PF0A 3NSNA 4MB4A 4MDOA 5I24A 1W9BM 4UQAA 1XCWA 4BF7A 4JKLA 1US2A 4EANA 2VCCA 1OWQA 1WNOA 3IJ8A 1MW3A 1FHDA 3POHA 3WMCA 4ML4A 3QHOA 5CG0A 2WKLA 3WEOA 1CIUA 3MV11 5D9OA 1V0MA 1BHGA 4YHGA 2WK2A 4QDMA 4J3VA 1E40A 2PI6A 1E5NA 3KL0A 4BZYA 5HPOA 3ZJKA 2EPNA 3ZT5A 4Q22A 1UD8A 2W62A 1UQZA 2HISA 1TFVA 3LPFA 3ZJ8A 3WDQA 1WO2A 1V6XA 3WDHA 2CITA 5A1AA 1EOMA 4HZ8A 4ACZA 3IANA 1ISVA 4KH2A 3AMKA 1AQMA 1Z32X 2WMHA 1KXTA 3DHPA 5FD0A 4J7RA 3W6MA 3L2MA 2XGBA 2YJQA 5FOOA 2WHLA 4BQ5A 1G5AA 4OUEA 2O92A 2YIHA 2BHUA 3GXMA 4AW7A 3L4XA 1ZJAA 5CGTA 4M1RA 1E6NA 3FAWA 2BHYA 3TONA 3CPUA 2ZICA 1KXHA 3FY1A 1S46A 2DDXA 2XM2A 3SCQA 1K6AA 3VIMA 2VR4A 2ZOXA 2WHJA 2YL9A 3W24A 4U5IA 2ZX6A 2E0PA 4HOWA 4OJYA 1W9PA 3CUFA 1QOXA 5AC5A 3UERA 3AYRA 3VNZA 3ARUA 1H0IA 1UR0A 2XHYA 2J47A 3PN8A 2DT3A 1IV8A 1JG9A 4JZ5A 1J0YA 4C7GA 1V03A 2VZOA 3MUY1 1MW1A 1UWQA 2G3MA 3WD2A 4AZCA 3WNPA 2ZWZA 1UD4A 2WM0A 3MSDA 3UETA 1VBRA 2DGAA 2BV9A 4Z2KA 1XRVA 1UH4A 1I1WA 3CHCA 2JF6A 2BFGA 2GFTA 1Q6FA 1XH2A 2VNCA 4XV0A 3VGEA 5GQBA 3SCRA 3K8LA 4S3KA 1J10A 1LLOA 1VEOA 1G0CA 1UKQA 2YDQA 1J0ZA 3L4WA 1CPUA 5BYWA 3WQ4A 2CHNA 3UG4A 2UY2A 1PZ3A 4HP5A 1H49A 1B3WA 3AJ7A 2WSKA 1J0HA 4AIUA 4UQEA 1GZJA 4MB3A 5CPQA 3ZMRA 2CYGA 3VGFA 1FP8A 4A4AA 2VRJA 2E9MA 5IHRA 3ZR5A 1UKTA 4ATLA 1QNPA 4UFKA 2VR5A 2XG9A 3PZMA 4AEEA 3K4AA 3I3EA 3L4YA 2XVPA 4AY1A 3WN6A 3W53A 3CZ8A 4B3LA 4PMOA 1HP4A 2BY1A 5DT5A 4FK9A 1CYGA 1XYZA 1GOWA 4W7VA 1TR1A 3N04A 2CBIA 3QGVA 2PWHA 2WHKA 4IISA 1UD6A 1K9DA 3VDCA 1E3ZA 3A4XA 1OIFA 1V0KA 3HU7A 1CGYA 2VJXA 2EPLX 2EXOA 1H1NA 4AD4A 2A3AA 4TXEA 3ZT6A 3QHNA 1JIBA 4YPJA 3CZLA 1D7FA 1C7SA 1F4HA 1E15A 5JIWA 2WC7A 5D9PA 1B90A 1SR0A 1B9ZA 2QPSA 3ARYA 1GJWA 2YA2A 3VIFA 4YN5A 1PBGA 4TOQA 4KMQA 1CGVA 3VMOA 3PZTA 3RM9A 1WZAA 4W8AA 3WENA 2VL4A 2QHAA 1DHKA 3L2LA 4UTFA 2XVGA 1PEZA 3RMEA 2Y8KA 3OA5A 2YKKA 3SIMA 2ZXQA 3POCA 2A3BA 3WBEA 2JALA 3W0KA 4AIEA 3UESA 2WZIA 4MDPA 3WD0A 4QLKA 3EDJA 1V3KA 3I3BA 2OWWA 3FNDA 3ZSTA 3CMJA 3RM8A 1HT6A 1OIMA 4H41A 4CU7A 2E9BA 3W25A 3T2PA 1LQ0A 4URIA 3UR8A 1V6YA 2CETA 1OT2A 2D22A 1E71M 4HMDA 1UKOA 4H7VA 4N42A 4ACYA 3WDPP 3EBVA 2VVNA 4NRSA 1JZ4A 5HXMA 1E9LA 2Y24A 2D24A 1JFXA 4M80A 4ZXLA 1V0LA 2VZUA 4P8VA 1EDTA 2D0GA 3WDIA 4P7LA 4UOZA 5M5DA 1RP9A 3BCDA 2E3ZA 4JKKA 1B0IA 4P7RA 3PZNA 1UQYA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4PTM A;  1GON A;  4MNM A;  1BPL B;  1E6Q M;  2YDR A;  3WQ6 A;  3LPP A;  4UZS A;  5I77 A;  1J0K A;  1XD1 A;  2VQU A;  1HJU A;  1EH9 A;  4E4P A;  1CEO A;  2XSA A;  3ARZ A;  4FLS A;  4DM2 A;  1TCM A;  3SEP A;  5I5R A;  3VGD A;  4U5K A;  1DWJ M;  1HJS A;  3AXI A;  2J8F A;  4QAW A;  2RGM A;  2W5F A;  2WCA A;  4CCC A;  5AY7 A;  4E8D A;  1US3 A;  4CVU A;  1UR9 A;  3AXX A;  2D20 A;  3OLD A;  1ZBV A;  2D2O A;  4OOZ A;  5DFA A;  4TUF A;  3BAK A;  4WSK A;  3SUT A;  4A3H A;  4JFU A;  1JI2 A;  4F66 A;  1H0G A;  4A3Y A;  3AZS A;  4RL3 A;  4PRW A;  3N17 A;  2QMK A;  2UWF A;  1KCK A;  1VB9 A;  4WIW A;  4MNK A;  1FA2 A;  4CUC A;  1PIF A;  2D0H A;  1IZK A;  1B31 A;  2CCR A;  3WUE A;  3U7B A;  2BXZ A;  1UWT A;  4NZC A;  3F5K A;  3II1 A;  1BGG A;  1EA9 C;  2XIB A;  2D0F A;  3T0B A;  4GIN A;  3SUR A;  1EHN A;  4HZ6 A;  1UWI A;  1L8N A;  1N82 A;  3PTK A;  2WPG A;  2WXD M;  3GH7 A;  2D3N A;  4Z2G A;  4W8B A;  2ZXB A;  1HL9 A;  1CXK A;  4V2X A;  3W38 A;  4D6I A;  2E8Z A;  3SCO A;  1CEC A;  3VUP A;  3U7V A;  3AIS A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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