3F5KA

Semi-active e176q mutant of rice bglu1, a plant exoglucanase/beta-glucosidase
Total Genus 197
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
197
sequence length
472
structure length
472
Chain Sequence
NWLGGLSRAAFPKRFVFGTVTSAYQVEGMAASGGRGPSIWDAFAHTPGNVAGNQNGDVATDQYHRYKEDVNLMKSLNFDAYRFSISWSRIFPDGEGRVNQEGVAYYNNLINYLLQKGITPYVNLYHYDLPLALEKKYGGWLNAKMADLFTEYADFCFKTFGNRVKHWFTFNQPRIVALLGYDQGTNPPKRCTKCAAGGNSATEPYIVAHNFLLSHAAAVARYRTKYQAAQQGKVGIVLDFNWYEALSNSTEDQAAAQRARDFHIGWYLDPLINGHYPQIMQDLVKDRLPKFTPEQARLVKGSADYIGINQYTASYMKGQQLMQQTPTSYSADWQVTYVFAKNGKPIGPQANSNWLYIVPWGMYGCVNYIKQKYGNPTVVITENGMDQPANLSRDQYLRDTTRVHFYRSYLTQLKKAIDEGANVAGYFAWSLLDNFEWLSGYTSKFGIVYVDFNTLERHPKASAYWFRDMLKH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Beta-glucosidase
publication title The structural basis of oligosaccharide binding by rice BGlu1 beta-glucosidase
pubmed doi rcsb
source organism Oryza sativa japonica group
total genus 197
structure length 472
sequence length 472
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2008-11-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3f5kA00
4H8VA 3W53A 4Z2IA 4MAVA 3CBWA 2D0GA 2F8QA 3AICA 2VCCA 4EANA 1H0GA 1HKMA 4B16A 2XM1A 3ARZA 1E6RA 3VGEA 2J7EA 4P7NA 3CHFA 1JDAA 3DHPA 4HA1A 2OWXA 5IHRA 3AS2A 1DHKA 5FCZA 1MW1A 4M80A 2J7BA 1E6QM 4CD4A 1ESWA 1E9LA 1H09A 4JCLA 4OJYA 3A6OA 3W38A 1CGVA 1R85A 2WVVB 1AMYA 5FOOA 4EKJA 2EPNA 2YLAA 1LWHA 3J7HA 1GNXA 1YHTA 3WQ4A 1ODZA 2X0YA 3CMGA 4IPNB 5BXTA 2WVTA 4LYQA 1EGZA 4CN4A 5CSUA 2PI6A 1F4AA 4W84A 4J3WA 3SUUA 2J7FA 3G6MA 1IV8A 3MMWA 5GNYA 1US3A 5ABHA 1G0CA 1V02E 2DSKA 5E0FA 3ARVA 4FMVA 5A8OA 4PSPA 2NSXA 1CXIA 4N42A 4YPJA 1UD3A 5I5RA 4MB3A 2RGLA 5JUVA 4CN6A 3AIQA 3AFBA 2XWEA 4DM1A 5BRQA 4TVCA 5D9PA 3ZQ9A 3VVGA 4MNJA 3F5LA 4AD0A 4AXNA 1XD1A 1JZ8A 2ZXDA 4OUEA 2G4FA 4MB5A 4NZCA 2O92A 1FHDA 3OLDA 5KEZA 1TA3A 2HVMA 2XVPA 2EPKX 2YL8A 3AYSA 1JZ7A 4Z2LA 1H11A 3IK2A 2X0HA 1WO2A 3UEQA 4EE9A 2V3GA 2VL4A 2J4GA 4M82A 1J0YA 1HIZA 4U3CA 2O9OA 3GNPA 1QI3A 2FGLA 2IXVA 3WDHA 4D72A 2WLYA 5ABFB 1KXTA 2A3EA 3SCVA 1EHNA 1E4IA 4H8HA 3MMDA 3IANA 1KB3A 3SCPA 5EFFA 2E8ZA 2W63A 3LPFA 2X09A 4ATLA 3WF3A 2J8FA 3CTTA 1MQRA 1UKQA 3PTMA 2E4TA 2XFFA 3VM7A 4UZUA 1W9XA 3WN6A 1GONA 1NARA 2Y8KA 2W66A 3D5HA 1CDGA 3POHA 1ZJBA 3AROA 1ISZA 3HMCA 3NDYA 3U5UA 7A3HA 1GQKA 2JALA 1V0MA 2BS9A 2J74A 3RJYA 2YOCA 3WNOA 1R86A 3SCUA 1UR1A 2CIPA 3TTYA 3UESA 2MANA 3WMBA 1TMQA 1HXJA 1CWYA 3BAXA 4Y7EA 1S46A 1V3KA 3IJ8A 3W0KA 1NP0A 5JBFA 4AZHA 4FK9A 4PMYA 4JFVA 5EMYA 3VM5A 4CVWA 2PWHA 3EDJA 1L8NA 4Z2GA 1EH9A 2WKGA 4U3AA 3AS1A 3ARYA 1OIMA 3WUGA 1LG1A 1EXPA 2PF0A 5HNNA 1UD5A 3AQUA 1GOOA 3QR3A 5CPTA 4B3KA 1JAKA 4BA0A 3QHNA 3SCSA 2G3IA 3PZIA 2VCAA 3AJ7A 4P8XA 1Q6DA 1CGTA 3VGDA 1GOMA 1KBKA 2QLYA 4GI8A 4XB3A 1KQZA 4OBSA 5DT7A 4DWSA 5I0DA 4DUVA 5CPSA 3JUGA 3VPLA 5C70A 4QP0A 1HKJA 1OCQA 1CXHA 2JFEX 1OGSA 4XUYA 4UFHA 4AISA 2VRKA 1UR4A 3WMSA 4ZXLA 4CVUA 1E1EA 2ZOXA 3UETA 2VX7A 3DYPA 2BHYA 1JD9A 4QAWA 2VT0A 4NRRA 4ZE5A 1KBBA 1PJ9A 1E6PA 5CLWA 5A95A 1ISVA 6CGTA 2JIEA 1UWUA 1CGYA 1ZBVA 1M53A 4CU7A 5I3DA 1OBAA 1JZ2A 2G3NA 2OSWA 4JZ5A 1UH3A 4AD5A 1EA9C 4MTVA 2WMFA 4W8BA 2J25A 1EIBA 5I24A 2O9TA 3OIHA 2VJXA 1V3HA 3WH5A 3WUEA 2ZUMA 3IAQA 1PX3A 3RJXA 5A8QA 5E09A 3EMQA 1WE5A 5DFAA 1VEPA 1HJUA 2WBKA 4ATDA 1WDQA 3CGTA 4V27A 1HF6A 5D9NA 3RM8A 5IFTA 1DP0A 5A6SA 2XPKA 1BAGA 1H0IA 4PCTA 4AIUA 3WUBA 1J11A 4NI3A 2VX5A 1UR2A 1JXJA 1P6WA 1VIWA 1WZMA 3VNYA 3HN3A 4OIFA 4ZFMA 3CUHA 1LLOA 5A2CA 1J0HA 1C3FA 3I3BA 1UKSA 2XJ7A 4GI6A 4W89A 3CZGA 2WLZA 1UD8A 1Y7VA 4PN2A 3SCQA 3BCFA 3HJEA 4ATWA 1CTNA 5M3WA 3WFZA 4AW7A 2EXOA 1SMAA 5TD4A 1K9EA 2VURA 2DIJA 3VIIA 4ZXOA 4D1JA 2VR5A 2J7HA 3SEPA 2VZTA 3CLWA 2X1IA 2W92A 2WHKA 1JYXA 3WEOA 4TVUA 3NIYA 2FDMA 2ZWYA 3GTNA 1VJZA 3ZO9A 2XGIA 4PRWA 3MMUA 3NDZA 3GM8A 4JAWA 3B9DA 4AZBA 3VGFA 1X1NA 5I23A 1E40A 3W81A 3EMCA 1V6UA 2D3NA 2WMGA 4HPGA 4OOZA 2Z1KA 2A3HA 1XSKA 1OINA 4NRSA 4GZJA 3KL0A 3WFLA 4W8LA 2V3FA 4WSKA 3APGA 3A4AA 5BWFA 3WEMA 1FP9A 1QI5A 3OGVA 1BG9A 4HMEA 1H5VA 3FW6A 2WVVA 3MANA 3L4ZA 1GCYA 2EPMX 5BXSA 1MXDA 2QMJA 2DQXA 1A47A 4ACYA 3U57A 1VRXA 3NJ3A 3ZT6A 3WY1A 3GYCA 2QPUA 1QHOA 3RCNA 5A69A 2J7CA 4HA4A 1EO5A 2XFRA 4PMZA 3OZOA 2BY0A 2QHAA 4AY1A 1HL8A 2YIHA 4LX4A 4D6FA 3FAXA 1GJWA 2OYLA 4JL1A 1J0JA 4JHOA 2CHOA 4HA3A 4J3SA 4CCDA 2XSAA 1MWOA 1W1YA 2WZHA 1OD8A 2VQTA 1JZ4A 1IZKA 1LL4A 2WKLA 3KEHA 1ZBWA 3CZKA 1EOKA 1PIFA 2YL6A 3ZR5A 5F7UA 1XD0A 5CQ1A 3EDKA 2AAAA 4F79A 3AXXA 4PEEA 1G94A 2F61A 2WM0A 1OT1A 1G9HA 3VUPA 2GFTA 2D23A 1GJUA 2GK1A 1E0VA 2F2HA 2WPGA 3T2PA 3PZVA 1HP5A 1W9PA 2GJPA 3VGGA 4NF7A 5ABGA 1QW9A 3VD7A 2O9RA 3O6AA 3TTSA 5HPOA 3VD4A 2E40A 3AZSA 2CKRA 1JYNA 4CU6A 3BAJA 4UQEA 4PCSA 1J0ZA 5FL1A 1O6IA 4AIEA 4M56A 5LA1A 3NUKA 5GPRA 2WANA 3RPMA 2WVSA 5ABFA 2DDXA 3WH6A 1C8XA 1DEDA 3S6TA 5BCAA 4PBGA 3VIPA 2IXUA 3WDJA 4WK9A 1NWSA 3BSGA 4XZBA 2D22A 2ZX9A 4BQ4A 3WQ6A 1KGWA 3L4YA 3RDKA 1QHPA 4LGXA 4YHEA 4DWSB 1KR0A 2V38A 4TTUA 4UQAA 1PX8A 3KL5A 1VJSA 4F8XA 4FF5A 2W67A 1AQHA 1U30A 3AZTA 3OLEA 3PHAA 4KRTA 2WHJA 1WAWA 2J47A 1AQMA 3ZT5A 2VNCA 3A4XA 2X8RA 3B8SA 2BHUA 2WZIA 4FLOA 1FFQA 2UY5A 3UCQA 2VZSA 3ZJKA 1EDQA 2XWDA 1JDDA 3VIJA 2WC7A 1JI2A 4PTXA 5DT5A 2CESA 1E4MM 4XZWA 5BROA 1WDRA 1MFVA 4W7VA 4AMCA 1W9VA 5AYIA 2EO7A 1G01A 3BAWA 3VKKA 1J01A 1W9UA 3AMGA 4MJ4A 3UG5A 2JF7A 4PMVA 3WD0A 3UG3A 4Q7NA 4JFWA 1R87A 1HVXA 1V6XA 1W2PA 3OZPA 2WAGA 5DF0A 1X6NA 1I75A 1GHRA 3RILA 4NSBA 4GI9A 2WMHA 1V3MA 1KXVA 1FA2A 3VIKA 4AZIA 1UD4A 2GVYA 3AOFA 4OZOA 1SYTA 2BFGA 1LQ0A 1BG4A 2ZUTA 3PZGA 1GOKA 3BLKA 3ECQA 2ZX7A 1W3LA 2IUZA 1HKKA 4UZSA 4J3TA 1IT0A 1EQCA 3MV11 5C8BB 3T08A 1JI1A 4IPLA 2VI0A 3BCDA 4QLJA 1E5JA 3SCOA 2DT1A 2G3JA 2GJRA 3M6DA 4AD3A 2UY3A 2W4XA 4ZENA 3WQVA 1VEOA 1V0NA 5A8PA 2PWGA 4CUCA 1NWUA 2BY2A 1VFFA 3PZ9A 3TA9A 1CLXA 4F9JA 2OWWA 1C8YA 3PTQA 4WKFA 2DT0A 1GQIA 1GORA 1JYVA 4WSJA 1E4NA 2X2YA 1NOWA 2DEPA 4OOUA 1KGXA 4B9ZA 1C90A 5FKYA 2UY4A 4CD7A 3TTOA 3VDBA 1CXLA 2W61A 1R7AA 3F4VA 4GIAA 2BVYA 3MSDA 4W5ZA 2V3DA 3MKKA 4RE4A 4MAZA 1WCGA 2CBUA 2EQDA 1FH7A 2EEXA 3N12A 3VIHA 1KWGA 3PBGA 5ABEA 3K4DA 3NCOA 1IZJA 1FFRA 3ARTA 4WKHA 1QNRA 3CUJA 1D7FA 3AI0A 4B9YA 3WNLA 4AD4A 1E70M 4D1IA 2FH6A 1E55A 1V3JA 4UFIA 4TOQA 2E9LA 3VDHA 3QHOA 1W2VA 4DWSD 3N18A 4UTFA 1BPLB 1FP8A 1WZLA 3G6LA 3SURA 1KCLA 2Y2WA 1H41A 2GK1B 4KGLA 3WDPP 1GZJA 3SCRA 4P7RA 1NQ6A 3N1AA 2DH2A 4TX6A 4W5UA 1BGAA 3L4XA 1DWGM 4BZYA 2WXDM 2XVNA 2CCRA 2QF8A 2E9MA 5DO8A 3FHAA 5E6ZA 3WEZA 2XM2A 1HJWA 2GDUA 3GH5A 2CHNA 3AIBA 3CH9A 3N13A 2BVTA 1OSEA 5D9MA 4JHZA 1XRVA 3WD2A 1H49A 3UR8A 3N9KA 4D6HA 4BS0A 2YA0A 3VOCA 1VB9A 5D4YA 3WQWA 2XIIA 1Q6CA 4P7OA 3LPOA 1UKOA 2D20A 6A3HA 3WQ8A 2G41A 2XVLA 1NWTA 3AZRA 3QOKA 1RD6A 2Y4SA 3OLIA 3WF4A 4KWUA 4E8DA 3PZTA 1QHZA 2CEQA 3K8MA 3PN8A 3GH4A 2GSJA 1HN1A 3W6LA 2VMFA 3CHCA 4WLCA 5ECUA 1QBAA 1ITXA 4TVDA 1JNDA 4GQRA 5I78A 1W9BM 4MNKA 4GPNA 1UKPA 1E3ZA 2XG9A 1JYWA 4IISA 1SFSA 2GJXB 2OSYA 3PZOA 1PIGA 3RMEA 4D6EA 5BYWA 4HMCA 3ARQA 5A3HA 3AIVA 1C8QA 5CLTA 2VRQA 4BCEA 2WMKA 3ALFA 2VX4A 4UNIA 1HP4A 2ZIDA 3WQ5A 1A3HA 1W1PA 1MQQA 1GVYA 3GXDA 4X0NA 3M7SA 1LG2A 2QV4A 1UWIA 3WH7A 1E72M 3LPGA 3AYRA 1BVNP 3KWXA 1US2A 5A8NA 2PBOA 3MUZ1 1KFWA 5IDIA 4JKLA 4QDMA 2NW0A 5A2BA 2CBVA 4FLRA 2XIBA 3THDA 3WMCA 2JEPA 4UQDA 5FIPA 1C92A 5CXPA 3EDEA 1BVZA 3AISA 3FY1A 2BY1A 2VVSA 5A6JA 1KWKA 1C7TA 1XH0A 4Q22A 3SUVA 2VC9A 1KXHA 1K6AA 5JBEA 3ZOAA 1ISYA 3SCNA 3A47A 1JD7A 1DTUA 3U5YA 5A6BD 3FXYA 1UD2A 1QI0A 4CCEA 5AYBA 3WUFA 3L4UA 2GDVA 1UH2A 3WD1A 2ZWZA 3MU7A 1K9FA 3VD3A 1XHGA 3QGVA 1MFUA 4D71A 1GQJA 2ZUWA 5A2AA 4CN1A 4HOWA 1NOFA 1U33A 4AZGA 4AZ6A 2PB1A 2VZVA 3EDDA 2WC4A 2XUCA 1N82A 3WNKA 3OGRA 1QNQA 2EPOA 3SUWA 1EDTA 1QOXA 4J28A 3ARSA 1GOIA 2WK2A 2W62A 4M29A 1UWTA 2DT3A 1TFVA 1CNVA 3W37A 1EQPA 3MS8A 3VILA 4A3HA 1J12A 1B3WA 9CGTA 2D24A 3VGHA 3PZUA 2WHMA 5D9OA 3L4WA 3IAPA 1JFXA 1DWJM 2ZUUA 3ZSTA 5A6KA 5I6SA 1V02A 1CENA 1FH8A 3OA5A 3T0BA 1Q4NX 4DUWA 5I2UA 4AEEA 4U5IA 4W87A 1Q6FA 4EK7A 2UWFA 2ZUVA 1CXKA 1Z32X 4HZ8A 3UERA 3F5JA 4AZ7A 3WDRA 7CGTA 1NP2A 2J7GA 3ZT7A 5BXRA 4R5EA 3WD4A 1B90A 1E1FA 4HOXA 3OLGA 2HISA 2Y8VA 1SMDA 4QCEA 3WSUA 1MYRA 1E0XA 5GNZA 1LL6A 1E6NA 4DM2A 3W24A 1MW3A 4BF7A 1HT6A 1QVBA 5A8MA 3AIEA 4X9YA 1OWQA 4W88A 4WIWA 1W9DM 2WCSA 2VZUA 1V6WA 1M04A 1TG7A 1F4HA 1BHGA 1NWRA 3N11A 1JFHA 4ZEPA 3WENA 1Q6EA 5DMYA 2B31A 5A94A 3WNNA 2YL9A 1B30A 5EFDA 5HPCA 4GO9A 1HJVA 1DWAM 2BY3A 8CGTA 4W7WA 3WH9A 1JIBA 3N17A 5CGTA 5A6BA 2E3ZA 2FHBA 5A6LA 4ZE4A 1OM0A 2PWDA 1XCWA 3CUIA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4H8V A;  3W53 A;  4Z2I A;  4MAV A;  3CBW A;  2D0G A;  2F8Q A;  3AIC A;  2VCC A;  4EAN A;  1H0G A;  1HKM A;  4B16 A;  2XM1 A;  3ARZ A;  1E6R A;  3VGE A;  2J7E A;  4P7N A;  3CHF A;  1JDA A;  3DHP A;  4HA1 A;  2OWX A;  5IHR A;  3AS2 A;  1DHK A;  5FCZ A;  1MW1 A;  4M80 A;  2J7B A;  1E6Q M;  4CD4 A;  1ESW A;  1E9L A;  1H09 A;  4JCL A;  4OJY A;  3A6O A;  3W38 A;  1CGV A;  1R85 A;  2WVV B;  1AMY A;  5FOO A;  4EKJ A;  2EPN A;  2YLA A;  1LWH A;  3J7H A;  1GNX A;  1YHT A;  3WQ4 A;  1ODZ A;  2X0Y A;  3CMG A;  4IPN B;  5BXT A;  2WVT A;  4LYQ A;  1EGZ A;  4CN4 A;  5CSU A;  2PI6 A;  1F4A A;  4W84 A;  4J3W A;  3SUU A;  2J7F A;  3G6M A;  1IV8 A;  3MMW A;  5GNY A;  1US3 A;  5ABH A;  1G0C A;  1V02 E;  2DSK A;  5E0F A;  3ARV A;  4FMV A;  5A8O A;  4PSP A;  2NSX A;  1CXI A;  4N42 A;  4YPJ A;  1UD3 A;  5I5R A;  4MB3 A;  2RGL A;  5JUV A;  4CN6 A;  3AIQ A;  3AFB A;  2XWE A;  4DM1 A;  5BRQ A;  4TVC A;  5D9P A;  3ZQ9 A;  3VVG A;  4MNJ A;  3F5L A;  4AD0 A;  4AXN A;  1XD1 A;  1JZ8 A;  2ZXD A;  4OUE A;  2G4F A;  4MB5 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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