3FA5A

Crystal structure of a duf849 family protein (pden_3495) from paracoccus denitrificans pd1222 at 1.90 a resolution
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
276
structure length
276
Chain Sequence
GKPCIICVAITGSLPTKENNPAVPITLAEQVESTHEAFEAGASIAHCHVRDDEGRPTSDPDRFAALKEGLERHCPGMIVQLSTGGRSGAGQARGAMLPLCPDMASLSVGSNNFPTRVYENPPDLVDWLAAEMLKYDIKPEIEAFDLSHILQAKRMAGDGRLAGTPYVQFVMGVRNAMPADRDVFDYYIHTVRRLFGEDAPWCAAGIGPSQIVLNEWAISSGGHARTGLEDNVRLDRDRLAPSNAALVGRAVELCEKYERPVATWRQARQILGLRMV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Metal binding protein
molecule keywords protein of unknown function (DUF849)
publication title Crystal structure of protein of unknown function (DUF849) (YP_917261.1) from PARACOCCUS DENITRIFICANS PD1222 at 1.90 A resolution
rcsb
source organism Paracoccus denitrificans pd1222
total genus 95
structure length 276
sequence length 276
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-11-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF05853 BKACE beta-keto acid cleavage enzyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3fa5A00
1RVGA 1THFD 1JUKA 1YPFA 2H90A 1H7XA 4A29A 3NDOA 3TXZA 4O8RA 4TX9A 2ZZ6A 4NXKA 2W79A 4FNQA 2E1DA 4JTLA 3HBLA 4DO5A 5EBUA 2FTPA 3NO5A 3C3NA 1S5WA 4FX8A 3OEXA 1WOBA 1H7WA 5CZTA 1F73A 1XXXA 1OX5A 3HG3A 3QYQA 3MP4A 3S1XA 2YDAA 4NT0A 2ZRXA 4LV4A 4RZ4A 4Z0JA 3EXTA 5CGQA 1TQJA 3KOFA 3UWQA 4JX4A 3A22A 2CLOA 4MIMA 3M6YA 1TPEA 4AWTA 3KVMA 3LOTA 3GYEA 1LBMA 1Q45A 4EF8A 2H3BA 2OMAA 1SW3A 4NVTA 4O1BA 4K6AA 4FO4A 4BI7A 4JTTA 5HUPA 1SO3A 5K9CA 3NL6A 3NAVA 5D2YA 4O54A 2DJXA 3LXCA 4RZ5A 4AB4A 3HPSA 3PULA 4GNJA 1H60A 3LHUA 2B7QA 1S3HA 1YXDA 2FFCA 2ZA1A 3PBVA 4DF0A 2C0AA 3IIZA 1Z41A 2E5BA 4MVAA 2W0UA 3S6DA 1D3HA 4A2RA 3U8GA 2V2CA 1B4EA 1WYIA 4OBTA 3FYOA 2VFHA 1JQXA 3TSBA 5AYYA 4CNNA 4YMZA 3HF3A 4H6KA 3BK0A 2DZUA 4RXGA 3L65A 1VPXA 1GEQA 1KW1A 3TK7A 2A6NA 1TJRA 2VXNA 3EX4A 2R94A 5CZSA 3DKLA 1SO4A 1OYAA 3DAQA 2ABAA 5SWUA 2CW6A 3O1NA 5F4WA 1W54A 5C54A 3S1WA 4X2RA 3HJZA 2BTMA 1L2UA 3N2MA 2WKJA 4WOZA 2X1TA 3C56A 3O8AA 1FBAA 1KM2A 4WXYA 1XI3A 3EX6A 4LOCA 1S5VA 5E93A 1Q6QA 3B0PA 3W23A 2X1RA 4LNYA 1W5MA 3N9RA 2YYTA 3EWBX 3R89A 2NXIA 2PRHA 5D38A 1JRCA 4TO8A 5LSMA 4DBDA 3LBMA 3BGGA 1LDCA 3HGOA 4QM1A 3ZR4A 4HN4A 1SZNA 1WDWA 3C2RA 5HWNA 5LZLA 3ZWTA 1TCDA 3UWWA 3PBYA 4UFHA 1KFKA 2EGZA 1LORA 3T7VA 5AC8A 3GXNA 3R12A 1C29A 1ZY9A 3UPBA 1TPDA 2LLEA 2OJPA 4RKAA 4JICA 1GVQA 2QCCA 3E96A 3VE9A 1N7KA 3WJXA 3VKJA 2TPSA 4JTFA 5DBTA 4GBUA 4Z0SA 3OVRA 1ZNNA 4OGZA 1H7RA 4AHOA 3NVTA 3B4UA 3GZ3A 3IIXA 4U28A 3M0ZA 2NWRA 1OYCA 4FIQA 6TIMA 4JR5A 5F2LA 2QAFA 4AF0A 1ZENA 2NX1A 3NNTA 1SFLA 2KZHA 1TRDA 5EKYA 1VJIA 2ZCGA 3G0UA 3IV3A 3O63A 1XL9A 2ISVA 3W2UA 4LW7A 5DXYA 4YLWA 5IM51 1SZFA 1ZHAA 2NX3A 3W7GA 1OG0A 1QOQA 1H7PA 3UWUA 1GOXA 2PE4A 1VYRA 5AB3A 1EUNA 3SGUA 5K4XA 1VRDA 4O1DA 1F76A 1KFJA 5D32A 2PRLA 2WSQA 4K38A 2QAPA 4TR9A 2NXGA 4FNTA 1T8XA 3UY7A 1BWKA 4TU1A 1VCGA 1OX4A 3KRZA 3TCEA 1VGAA 3RMJA 3GVGA 2NV2A 5FEXA 4I9AA 1F74A 2ZA2A 3IVTA 2GQAA 1HO4A 1LBFA 1GG1A 4AAJA 1VHCA 3W1MA 1TTQA 3GAYA 1YLVA 1TMHA 2JBMA 5HINA 4DBEA 1X6UA 4JTKA 4UFIA 3PM6A 4YCOA 3KHJA 1DBTA 3E12A 4JEQA 2VELA 1U83A 2RKXA 3NPVA 3FEMA 4IUOA 3QZEA 2ABBA 1FXQA 1SQ7A 2PC4A 3P84A 4LV9A 1QR7A 4MKNA 5F1UA 2A2IA 3W3OA 3C61A 3D0CA 4UIOA 4KFPA 1O4UA 1DV7A 3IRDA 1NF7A 5DY2A 2DORA 1TPFA 3L0GA 1KM0A 4RXFA 3HQ1A 4XBKA 1W5NA 5DCDA 4M7TA 1IIGA 3LI1A 2DZXA 3OIXA 5KMYA 1XFBA 3GLCA 2A5HA 3M47A 3DFPA 3NZRA 4OWGA 4IMDA 5I3FA 2QCNA 2AAMA 2QCGA 4WY0A 3KAOA 3QPYA 4X22A 3M44A 5F1VA 1RV8A 2VFEA 2BLEA 3N73A 4FNRA 3NYZA 2B4GA 2FB3A 3MBDA 1I2PA 4DO4A 3FYPA 1EP1A 1KFEA 3C2EA 5I3HA 4P2VA 1LCOA 2O7SA 1VCVA 3Q58A 3WJSA 2CZDA 3JR2A 3LXAA 4NJJA 2PCQA 4JNMA 3TAOA 1NSJA 1MEWA 3A23A 1GQNA 3DU0A 4MYAA 2Y89A 1JQVA 3RFAA 3OA3A 3GKFA 3ABQA 5AHEA 3TQVA 3TROA 3EX1A 3PSVA 3N2XA 2J24A 3UZ5A 5KTLA 2NUXA 1QMLA 1VLWA 3Q37A 5C6MA 3QSRA 5J5RA 3G1FA 5U4NA 1SZEA 4IJBA 1OFQA 3G18A 1O60A 1XKYA 4XKYB 5D09A 2PURA 2RFGA 3GAKA 4PA8A 1WX0A 3W85A 5G2IA 4UMCA 3I68A 2A21A 2E6DA 3CEUA 2V0TA 3S5ZA 3QQ1A 3P67A 4MUZA 3S5NA 1Q6OA 3LCIA 3TFCA 1JULA 1YPIA 3ABRA 5AYXA 2ISWA 4BI6A 3B03A 5LNVA 4EWND 4RZ6A 4UMAA 5HNRA 3PVFA 4K8EA 4UTJA 5AOUA 3N14A 1ICSA 5AHMA 1G4EA 2CFFA 3MBFA 3LTPA 3PSWA 3CHVA 5BNKA 3O6DA 3OVPA 3L0NA 4BWLC 3QRHA 5TQLA 3N9SA 3PUDA 3TDFA 1JCYA 1ME9A 1YXYA 1W0MA 1OJXA 3W6YA 5DY3A 4UTKA 1YTKA 3F1QA 4AHPA 3CB8A 2NZLA 4D2JA 4PCFA 2ZZ1A 3TUUA 1KM6A 3W22A 2Z2UA 1LTDA 4UNLA 3W83A 3W7JA 3O07A 2C19A 2ZZ2A 2WQPA 3TC6A 1S5TA 4ADSA 3O15A 4HIBA 1QFEA 1K7EA 3FA5A 3HG2A 5DXXA 4LU0A 2QF7A 4GJ1A 1XC4A 2WSRA 4O0ZA 3W7QA 2AGKA 4POCA 3M16A 3NQ8A 4BF9A 1P0NA 2WV8A 1WBJA 1SO6A 3RLVA 4UR7A 1FDJA 4LS2A 3GDRA 2ZRVA 4DPPA 3NQCA 1H51A 3NPWA 3P8IA 3UWYA 3PC0A 3JRKA 5T26A 1AG1O 1G6CA 3LM7A 2I1OA 4UMBA 1EP2A 3QH2A 2C1HA 1ZAIA 3LTSA 1I2NA 1PCKA 4W9TA 1P0KA 1OFDA 1OF6A 3BO9A 1U5JA 4EF9A 4UTWC 4KKXA 3ABOA 3E9AA 4QSHA 1YXCA 2GJNA 3W72A 1TV8A 1VLIA 3TMQA 1X1OA 2Z0IA 3LB0A 3O16A 1A5SA 5IBXC 3I6RA 4UTLA 1QPRA 1QO5A 3R5EA 3USBA 3MP3A 1ZAJA 4HNTA 1WQ5A 3W1TA 4IMEA 4GXMA 3ZWSA 2Y63A 1QDSA 2EPHA 1FQ0A 3SJ3A 1QOPA 5K9DA 4DXVA 4HHPA 4WQ6A 3G1VA 3K30A 1F6PA 2JKEA 1V7YA 1K02A 3ATZA 3MI6A 3UWVA 1AW2A 5LGZA 2J88A 3NQVA 3FJLA 3T78A 1BWLA 1OFOA 1PL9A 4UCGA 1W37A 5I3IA 3GR7A 3R13A 1DKWA 2VC6A 4IX2A 3UZJA 3W2MA 4A3UA 3MW7A 2D73A 5FEZA 7TIMA 4ZQMA 2NXHA 5HMSA 3W7LA 5D05A 1C9DA 1W3NA 4X9SA 1L6SA 1XBXA 1LRTA 3M43A 5CZJA 1W3IA 4IWWA 2Y85A 4XBSA 5LHEA 3IGXA 5D2TA 3DZ1A 4OV9A 1W5QA 4GRSA 1GVFA 4KWWA 1UBSA 1YTDA 3THQA 3LCWA 3M5ZA 4ML9A 3MHGA 1TYGA 3FS2A 3C0JA 4JX5A 1VH7A 2GQ9A 1J4EA 1QWGA 3G8RA 3QMSA 4KFNA 1VS1A 3CPRA 4NJGA 2DZWA 1L6WA 4H3DA 3LI0A 2A7PA 5D03A 3G1AA 3S8HA 1XBYA 4N6EA 3PUEA 2X1SA 4JTUA 4X3ZA 5C55A 1C8VA 3CTLA 3NG3A 1KM5A 3NPUA 1Q6LA 1ME8A 5LNWA 4OT7A 1PE1A 1VYPX 3P8JA 3G1XA 5L9FA 1XBZA 1KM4A 1SR9A 3EX3A 3FIGA 1UUMA 4BK9A 3QQ0A 4L4MA 2XFWA 4ORMA 2RDTA 3U2OA 3S5OA 4M19A 3W9ZA 2VEKA 3KRUA 4Z1AA 4UTUA 3P82A 1LBLA 1GVOA 2A6LA 2E6YA 3YPIA 4UTTC 3S1VA 1FDZA 3HG5A 3LCHA 2R91A 3H53A 4J9JA 3TQ0A 3W75A 1H62A 3GIYA 1P5BA 3MYOA 3Q2DA 4GUIA 3QJAA 3C2OA 4FHAA 1AW5A 3FFSA 3I65A 8TIMA 1IXNA 2ISSA 4E0CA 3QF0A 5EA9A 2VFDA 2BXVA 1Z42A 3DFSA 2BX7A 2WO5A 3LBCA 1F2JA 4JYDA 1FDYA 1GTEA 1OF8A 1ZAHA 1TPUA 1QNVA 3V1PA 3WJZA 3T44A 2A7NA 5H91A 5AFDA 2QEZA 4Y6GA 1TTJA 4N9CA 4NNAA 3DH7A 3W1RA 3GR8A 4BFAA 4PODA 4S1FA 5CPLA 4GUFA 2E6AA 5BW6A 2ZRZA 4E2BA 3SR7A 2QCDA 4JDBA 4DEFA 1SW0A 1TPC1 3QPZA 1Z48A 2ZRUA 3LLFA 3R8RA 5DBUA 3OHIA 2H8ZA 2ZDRA 4XTDA 3NZ1A 3MMTA 1XDMA 3THAA 2TMDA 1PHWA 2Y70A 1VC4A 1KLZA 4FXSA 2HSAA 3UD6A 3A5FA 3P61A 4ZZ9A 2P0OA 4JN6A 2B7OA 4N4QA 5EY5A 3PS7A 5FEPA 3NM1A 5A5WA 4YL2A 1I2QA 4WJEA 1D9EA 1I8JA 4AVFA 4ZL1A 2Q8LA 3W2LA 2NLIA 3C52A 5BMXA 4FEZA 3T40A 1DVJA 1K03A 4NJHA 1NVMA 2ZTKA 3EXRA 2C14A 4MFDA 4NNBA 4GE8A 4DQWA 2A0NA 3GNDA 1M7OA 3CU2A 4AF0B 3W88A 1Z44A 3W1QA 1JCJA 4Z08A 3EKZA 3LHVA 5D2VA 4RCXA 3PF3A 3GDKA 2E68A 4BR1A 3L68A 1H61A 5LKYA 3NQ2A 4MZ1A 3L5MA 4UUIA 2CU0A 3IVSA 2Y88A 5LNSA 5FF2A 3LCXA 1TPVA 3LHWA 1QPOA 2YYUA 1VCFA 1DQWA 3R2GA 4QAIA 3W76A 2QDGA 4O18A 4JY9A 1RZMA 1EP3A 3G0XA 5J5DA 1KM1A 5FF4A 1L9WA 4CCCA 1OX4B 4IMCA 1SUXA 3SIZA 1JR1A 3INPA 4Z1CA 4MZYA 3TSDA 1SSDA 1UUOA 3CLMA 2V2DA 3LHYA 3G1YA 4UTMA 5K9XA 4RK8A 3G0SA 1H5YA 1F6KA 4K7YA 2X16A 5FF0A 1G7VA 3S9YA 2V5BA 3NOEA 4CQAA 3TC7A 2OT1A 4UFMA 1ZFJA 1K8YA 2RDWA 3W7OA 1WXJA 3BG3A 3TAKA 1EA0A 1CW2A 1DL3A 2VEPA 3G8EA 4B5NA 4OU1A 3P7YA 4TIMA 2B7NA 3W7IA 4CCEA 1FY6A 4HSNA 4HKPA 2E5DA 1LLWA 2JKAA 1H63A 2FIQA 3G1SA 1HUVA 4ONVA 4JGDA 4UFJA 1X1ZA 3HGSA 2YR1A 4O4WA 3W1PA 4Y8FA 1GT8A 3VNDA 5H2ZA 3BVJA 1Y0EA 4UR8A 3H54A 4PC8A 1TSIA 1QCWA 3WK1A 5HWMA 4WY0B 4LRTA 3DFOA 2XN1A 4K36A 5K7JA 2G5WA 3IEBA 1SU5A 3PUOA 2E6FA 3IIPA 1LRNA 1W56A 4NJIA 3W1UA 3N19B 3RF9A 4XZ9A 5DCEA 1RPXA 5LGXA 1FCBA 3VCRA 4UTHA 1G69A 1H1ZA 1RD5A 1RQHA 2VEMA 3W70A 3WJYA 4FNPA 2B7PA 5HJLA 2HS6A 1XM3A 4FX7A 1HO1A 2C13A 2DZTA 3H55A 2CLMA 3CWNA 2Y7FA 3F4WA 1I2RA 4XTIA 4FX6M 5KSWA 2YW4A 2YFOA 1YDOA 4WZHA 1KA9F 4ZVJA 3DI1A 4LC8A 1LP6A 4HPXA 3T55A 2HMCA 4JTHA 3TX9A 1LZOA 1OX6A 4LVDA 4RLIA 4JTSA 3NL3A 3DFTA 2V82A 5AC7A 2G96A 2NUWA 2Y7DA 3HPXA 1J2WA 2JK2A 1GYLA 5AN7A 1R2SA 4K39A 2H6RA 4MJZA 1EB3A 1RQBA 1EPXA 3B0VC 4FF7A 2V8ZA 4PL2A 1NF0A 3MJYA 2CLLA 3P62A 1O94A 2Y61A 5IBXA 1M7PA 1QPQA 3IIVA 3BW3A 1LOSA 4LWWA 5CZ0A 2Q3OA 3UNDA 5KZDA 3STGA 2DZPA 4LVFA 3PY2A 1JCMP 1KTCA 3BG9A 4HNUA 4NQ1A 4EOUA 4NX5A 2QDHA 4OV4A 4P61A 3W84A 3O05A 1B9BA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1RVG A;  2WW5 A;  1H7X A;  4RPQ A;  3NEH A;  4A29 A;  3NDO A;  3TXZ A;  4O8R A;  3CO4 A;  2ZZ6 A;  1ZLP A;  4V1Y A;  3XIM A;  3SUS A;  4D9P A;  3SCN A;  2VVN A;  4JTL A;  1WZK A;  2BP1 A;  3VGF A;  5EBU A;  4KRU A;  3C3N A;  1NDZ A;  1S5W A;  1EF2 A;  3OEX A;  4AXN A;  4MWA C;  1WOB A;  1H7W A;  1XXX A;  4UOJ A;  5JH1 A;  1OX5 A;  4Q7N A;  4PRT A;  3VK5 A;  3SBF A;  2ZRX A;  1EA9 C;  3EXT A;  5CGQ A;  4ZFM A;  5AC4 A;  7TAA A;  3IGH X;  1CLX A;  3S83 A;  2E3Z A;  1XLH A;  2NT0 A;  1XIM A;  1LBM A;  3TJI A;  3KBM A;  4INF A;  2DIK A;  1XRS A;  3GNX A;  1YBQ A;  3H2M A;  3NL6 A;  3HPS A;  3QGK C;  2CBI A;  1XIB A;  3BQ5 A;  1RPK A;  1Z41 A;  3S6D A;  1B5T A;  1Z3N A;  5BCA A;  2PDM A;  4PUE A;  1EQC A;  5CXP A;  2QPX A;  3HF3 A;  4UR9 A;  2DZU A;  4CD6 A;  3KCO A;  3L65 A;  4GI9 A;  4GIE A;  3TK7 A;  4LUS B;  2VXN A;  4HU4 A;  1BXN A;  2GJR A;  3N29 A;  3RO8 A;  1OYA A;  3DAQ A;  2XGI A;  3O1N A;  4ZR8 A;  3ONC A;  1NY1 A;  5F4W A;  3WLT A;  2WC7 A;  4OEC A;  4IMA A;  3HJZ A;  4AC1 X;  1UA7 A; 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