3FI8A

Crystal structure of choline kinase from plasmodium falciparum, pf14_0020
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
354
structure length
339
Chain Sequence
SKLTDPLYIKKICLEKVHDWSRCNEDDVCVNQILSGLTNQLFEVSIKEDTAIEYRITRRHVLFRIYPLSEFEVYKTMSKYRIAPLLLNTFDGGRIEEWLYGDPLSIDDLKNKSILVGIANVLGKFHTLSRKRHLPEHWDKTPCVFKMMDRWRLAVSNYKNLDKVTLDINKYIQESHKFLKFIKIYTQIENIANDIVFCHNDLQENNIMNTNKCLRLIDFEYSGYNFLSADIANFFIETTIDYSYNAYPFFIINKKNYISYESRILFVTTYLSKYLDDSTAADQDIIDQFLEAIEVQALGLHLIWAFWSIIRGYQTFDFFLYAKERLKMYDEQKQYLMSK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Choline kinase
publication title Crystal structure of choline kinase from Plasmodium Falciparum, PF14_0020
rcsb
source organism Plasmodium falciparum 3d7
total genus 123
structure length 339
sequence length 354
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-12-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01633 Choline_kinase Choline/ethanolamine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3fi8A01
3.90.1200.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aminoglycoside 3'-phosphotransferase; Chain: A, domain 2 Aminoglycoside 3'-phosphotransferase; Chain: A, domain 2 3fi8A02
4CFXA 4GU6A 2UW4A 3KKVA 3TTIA 2H96A 2RFSA 3OTVA 4C3PA 4PP7A 4DEDA 3JYAA 5CVFA 4G9CA 3NUPA 4JX3A 3OY1A 2EXMA 1XKKA 4K77A 3UG2A 2EB2A 2X9FA 3PG1A 3RPSA 5AV0A 4I41A 4X6RA 3R9DA 3CD3A 3O8TA 1Q8ZA 2VTLA 2XNGA 2WU6A 4BIBA 3LFEA 3BU3A 4M0ZA 2IZTA 4DITA 4JT3A 5HNIX 2BMCA 4RZWA 4JBOA 3MGYA 3K5VA 4X0MA 2YN8A 2JIVA 1YI4A 3EN6A 3P79A 5DOSA 3UP7A 1HCLA 5ICPA 4ALUA 3CLYA 1UU3A 5B2MA 2GDOA 2XK9A 1WBWA 3W2PA 4QTEA 2VWXA 1V0BA 4KWPA 3W0NA 3LXNA 4RVKA 3OEFX 2J0JA 3Q2MA 2UZWE 4XG3A 3FLZA 3BYMA 1V0OA 2Z8CA 2YA9A 3GENA 3GU6A 2FB8A 3T3VA 5AAGA 4XCUA 4C7TA 4IAIA 5ANDA 2QOKA 3SOCA 2F57A 5EW9A 4AZWA 3G6HA 4H36A 5HE1A 3LCSA 3Q4UA 5J1WA 5TO8A 3E3PA 3GCUA 4J96A 3EWHA 3H9FA 1FOTA 5IMXA 4O21A 4X2JA 2BIYA 2ZM1A 2ERZE 3IOPA 3P7AA 1IR3A 2J5EA 2X8IA 4FSYA 3IK3A 4P2KA 4DG3E 4ZMEA 2G9XA 2W4JA 4FG8A 5JK3A 4U81A 3BEGA 4YU2A 2W0JA 3FMDA 3AD6A 4L46A 3I81A 4GJ2A 4CFFA 2JFMA 1GZNA 3R04A 5HIEA 3VBYA 3G9NA 3OW4A 4G16A 3LXKA 4CQEA 5TF9A 4O7WA 3PVWA 3QRKA 5H8GA 3ULZA 4XV9A 3CR0A 3QD4A 4ZZNA 3MB7A 4L68A 2ZB1A 5L3AA 4ZMFA 3F3VA 4UXLA 2WTCA 3BYSA 1XBBA 4GYGA 3UTOA 1H28A 4CG9A 3KRJA 4YHJA 4JG8A 2BRGA 3UZRA 3TT0A 1QL6A 4ZTRA 5EM8A 5J95A 5HU3A 2XRWA 5HD7A 4Z16A 3UO5A 2V55A 4FVQA 1JWHA 4FT0A 2O3PA 2X8DA 4PL4A 4FV6A 2WMQA 3BGPA 4YJRA 1OPKA 5IA2A 4FSUA 4OBOA 4QP4A 3ORNA 3TIZA 2I6LA 3QKLA 4QQTA 1YXVA 1AD5A 4UX9A 2VWUA 2B9HA 4I22A 5KHWA 3LCDA 2XNBA 4NSTA 1YWNA 4FVPA 1PRYA 2WTDA 3I60A 4QMQA 1ZLTA 2UZTA 3TKIA 3DV3A 2BPMA 2PMLX 2C3LA 4L01A 5L8JA 4I6HA 4JR3A 5AA8A 3ZM9A 3MJ2A 3EYGA 4JXFA 4Y72A 5AP0A 1HCKA 3G9LX 5FDXA 5LVLA 3ZXTA 2WEIA 3V3VA 3D7TA 4PL5A 3M2WA 5AP1A 5ANOA 2VTQA 2IWIA 2QHMA 2CNVA 3GCPA 5CU0A 5D41A 2ONLA 4JBQA 1BL6A 1RE8A 2PULA 2QOHA 3DJ7A 3QHWA 2BILB 1CSNA 2IO6A 2NNWB 2QQ7A 3AT3A 3L1SA 3MESA 4U40A 4EI4A 3MWUA 4PQNA 2P2IA 5AP4A 4HZRA 1JBPE 4E26A 2B4SB 4RLKA 4FZDB 4J8NA 3SA0A 4IACA 5FDPA 1KSWA 3AC8A 1REJA 5GJDA 4YTFA 1QPJA 2QVSE 5LWNA 4J97A 5DR2A 1VZOA 4P5QA 4DFYA 3PXZA 4QQ5A 4V0GA 3GU4A 2G01A 2JDOA 1WVYA 4FKGA 4O0RA 4JIAA 5K5NA 3R6XA 3JUHA 4NCTC 1KOBA 3PTGA 4BZOA 3OG7A 4CMOA 4BRXA 2WQBA 3ZUTA 1R0PA 2YJSA 2JIIA 3ORZA 5DT0A 3FI8A 5J1VA 3BYVA 1Q62A 3E62A 2YFXA 4TYEA 4CKJA 2QOQA 3ANRA 4XNEA 5EYCA 3DFAA 4Y85A 4CGAA 5H8BA 5HTBA 1MUOA 4X6QC 4CG8A 3FE3A 2QOBA 2VN9A 4FKIA 5C8KA 4KBAA 5CU3A 3S0OA 2QOFA 4TYHB 3ZFMA 3UBDA 3U8WA 4MK0A 3RJCA 4X3FC 4O7LA 4X2GA 5HTCA 3EQCA 3C4ZA 3HX4A 3UPZA 4EOLA 3F2AA 1H26A 2CGXA 3ZBFA 4X2NA 1YQJA 2HW7A 5M57A 2H6DA 3HMOA 4L45A 5HQ0A 3EN9A 3DGKA 2FGIA 3QUPA 2FO0A 5FG8A 2G2HA 2ZOQA 3OOGA 4F99A 1IRKA 3ZEPA 3GFEA 4JX7A 2JC6A 4BDJA 1GOLA 2XM8A 2XRUA 5FEDA 2E9NA 3C0GA 3PLSA 4JJRA 3ATSA 3KXXA 4DLJA 4F63A 3F82A 1ZXEA 3C4EA 3ULIA 5KHXA 1MRYA 4EWHA 1Q3DA 2P2HA 4RG0A 2Y9QA 4QYEA 2X2MA 3NW7A 1G5SA 2F7ZE 2PZRA 3WF7A 3WOWA 4EK6A 3ACKA 4IWDA 2SRCA 5I9VA 3QCSA 3R73A 4O83A 4WNOA 1Y57A 4FTMA 5LMBA 3FEGA 1Q41A 3FLWA 3NUAA 2VTSA 5IUGA 3FV8A 3GBZA 4M13A 4FV4A 2BVAA 4WD5A 1M2RA 5CXZA 3NUUA 4MD7E 2F7XE 2P0CA 3HGKA 1SVEA 3PG3A 4N0SA 3T3UA 2F9GA 4JQ7A 4MKCA 5BVEA 3VQUA 2VTNA 5HLNA 2W5HA 5HHWA 3AG9A 4MBLA 4PMPA 1UNHA 3QGYA 2DQ7X 2WPAA 3GNIB 4XP2A 3TIYA 3UIBA 4BCOA 4BTFA 4AA0A 3VUDA 1PKDA 2XNPA 1JKSA 2ITVA 2XA4A 4KABA 4FA2A 4RX5A 1JVPP 3PE2A 2A1AB 3QLFA 2QO2A 2ZV2A 4GT5A 4PL3A 4F0FA 2C5XA 2R3GA 1K2PA 4UYNA 4WBOA 2IPXA 3PXKA 2BAKA 2XIRA 4MXOA 4QPAA 2ZAZA 3QRIA 2PK9A 1R3CA 4BICA 5C27A 2YCFA 3P4KA 4CVAA 1H1WA 2JD5A 4M8TA 2ITQA 3AD4A 3LOKA 3V5PA 3GCSA 4ASDA 4B7TA 2B53A 3PJ8A 4UBAA 5EH0A 5A6OA 3FBVA 4BKJA 3REPA 5FXRA 4FT3A 4ZS4A 4WZYA 3QKKA 4JDKA 4HPUE 5JSMA 3FZTA 5KCVA 4HYUA 3BWFA 3FXWA 4W4YA 5B0XA 4BGGA 4EQUA 2PE2A 2QI8A 4IDVA 4JAIA 2C6DA 5EHYA 4JRVA 2VZ6A 4P90A 4FUYA 5DEYA 2Z7SA 4AAAA 3C1XA 5AM6A 4YPSA 1OL5A 2W9FB 5CEMA 1RDQE 5C01A 4Z55A 4YNOA 4DH8A 3OF0A 4DEIA 1Z5MA 2R4BA 1Q97A 2OF4A 1GIIA 4YLKA 3EIDA 2YCRA 2VRXA 4F1MA 4G6OA 4GEOA 5KMNA 3RK7A 4ZXTA 1NW1A 2PMOX 3W2RA 2XYUA 4C38A 4IFCA 1B6CB 5I9YA 1PMNA 5FM2A 2ITTA 3FQHA 4ASEA 2JFLA 4E6QA 2JKOA 4KD1A 4L42A 1H27A 2YIQA 3WF9A 2W96B 3KVXA 3ZOSA 2WKMA 4NKSA 4QO9A 3E8DA 4DE4A 3FSKA 2ITXA 3O51A 1ZZ2A 2XUUA 2V62A 3O96A 4BIEA 2UZEA 1KWPA 2OLCA 3QZFA 4ITHA 5EI6A 3QA0A 5EQYA 4XP0A 1YDRE 4OGRA 5B7VA 3CPCA 3E92A 4YC3A 2GHGA 4CKIA 2YHVA 4IVBA 4PDSA 1XH7A 4QYYA 1OI9A 3OHTA 2ITUA 2YJRA 4IX5A 5GNKA 5L8LA 3QCYA 5FRIA 2GHMA 5CNNA 3MTFA 3WZEA 3UMWA 2EWAA 4IHPA 4E1ZA 4ASXA 4UZDA 4IAKA 3EFLA 1KE9A 3O0GA 4F4PA 5F94A 4BDGA 4AZTA 4BGHA 5DPVA 4V04A 3RAWA 4BDIA 3U6IA 2WZJA 2HY81 2UW0A 2CLXA 4PDOA 2ZMDA 2FSOX 3BX5A 3UOLA 1K9AA 4IM0A 3V6RA 2GQRA 5ANIA 3EN5A 3SKCA 4PNKA 4R7HA 4M15A 2VTIA 3LFSA 4G6NA 3CY3A 4FSWA 2CN5A 4N6YA 4TY1A 2ESMA 3AMYA 4OTHA 4FNYA 4AN9A 3R8MA 3F5UA 3HV7A 4DT8A 4JRNA 3CGFA 2I40A 5CT0A 2J0IA 4HYHA 5AEPA 1J1BA 2UV2A 4KBKA 5K3YA 2PMNX 1KUTA 4EH4A 3RTPA 5M08A 4GK4A 1ZMUA 2YWVA 5LXMA 1UWJA 3LFFA 3OTUA 3B2WA 4MNFA 5JZJA 3HNGA 1WBOA 3M1SA 3E87A 4IC7A 4GJ3A 4WHZA 2XF0A 3R01A 3ETAA 3SQQA 5AWMA 4CRSA 3LJ2A 2R3OA 2OK1A 4G3EA 4AW0A 5L2TA 3SC1A 4AGUA 5JFVA 4QP9A 3PXYA 4IE9A 3PZEA 3JVRA 4FZAB 4P7EA 2OWBA 3CPBA 3O50A 4ITIA 3P7BA 2PPQA 2A4LA 2I1MA 1B38A 4QT1A 5G6VA 3SXFA 1STCE 2FSMX 2ZYBA 2WMBA 3VBQA 2CMWA 3VRYA 3W55A 2VX1A 4BB4A 1Y8YA 3Q53A 1W8CA 5BUJA 2Y0AA 4YP8A 3KMUA 2CPKE 4RA4A 1GZOA 2FSLX 4CXAA 3A7FA 4BCJA 3I6UA 2P55A 2YEXA 3COMA 3CC6A 4QMWA 3KREA 2OZAA 4DGMA 5LVPA 1SVGA 3HZTA 5ETAA 4CSVA 3FPQA 1O6YA 2OXXA 3AOXA 5ITAA 4OUCA 3W18A 3ORPA 4O7YA 1JKLA 1W7HA 3FMEA 4RVTA 4BCQA 1ZWSA 3W0QA 4KIPA 3NSZA 4BCFA 5M55A 4APCA 1VYZA 3GC9A 3OEZA 3A62A 4FTLA 2YACA 3E64A 1PHKA 5JGBA 4YJNA 4AGCA 5A4LA 3RM6A 5F95A 4R5YA 3QQLA 3MFUA 5CSWA 1YOJA 3VUHA 3D9VA 4I23A 2H9VA 3OBJA 5FD2A 3VAPA 4WIHA 3W0PA 1XH6A 2ITNA 2UW9A 5EHOA 3TV6A 3BE2A 3GB2A 3NW5A 3NUYA 4O91A 4DGOA 2V5QA 4KRDA 5HG7A 3A60A 3ORKA 2WTIA 3LM5A 3DTWA 3U87A 1TQMA 4ANQA 2Y6OA 4IB5A 2CGWA 2VWWA 4J52A 4N6ZA 5CLPA 4A4LA 5IEVA 1OVEA 3L8PA 4FSTA 1JQHA 3KMMA 3PJ3A 5IQCA 2PSQA 4OTFA 3EQPA 4TYJA 4AW5A 3PWYA 4AA4A 5CEKA 4C59A 4A07A 4LGGA 3OCBA 4QRCA 3UJGA 2HZ0A 3POOA 2IVUA 5AADA 4RJ3A 4YJPA 3F2NA 5AUXA 3EQFA 4FSQA 4GG5A 2JDRA 5HE0A 4J98A 1UKIA 4YHTA 4LUEA 4DFZE 1GJOA 1WBTA 4ERKA 4F7JA 5DHJA 3A99A 4CD0A 3NCZA 3UIMA 2BRMA 2OICA 1U54A 4FSZA 4BDCA 4MBIA 4QTCA 5KZ0A 4IMYA 3O8UA 5CF4A 1S9JA 3QX2A 4XG9A 3HAMA 4R3CA 3G0EA 2BAQA 5DRBA 4UN0C 3RM7A 5M4UA 3DKCA 3HYHA 4FNZA 4YPDA 5E8YA 3RK5A 5I9WA 4YSMA 4ZEGA 2EU9A 3CEKA 3R8PA 3UIUA 5IDNA 2VGOA 2XK7A 2YM6A 3KVWA 4UEUA 4EKKA 5CSPA 3E5AA 1KV2A 1LUFA 3V8WA 4FMQA 1OITA 3Q9WA 3Q4ZA 4J95A 4O22A 4FKSA 4EKLA 3LMHA 5IF1A 1YRPA 3OT3A 5JMSA 1ZYCA 3CTHA 2EXCX 2REIA 3FQSA 2C3KA 4NZWB 2JLDA 5CAOA 5J9LA 5IA3A 4U3ZA 4ZZOA 3LLAA 4U7ZA 3EL7A 2F49A 5F4NA 5J87A 2RGPA 3MPMA 2J0LA 3P9JA 3UQGA 5CF5A 5HD4A 1PYXA 3QLGA 1MQBA 5ANGA 3NNUA 2JAMA 5DR6A 1OECA 5DYJA 2UUEA 3V51A 2CNQA 4XV1A 3FZ1A 3LFDA 3F66A 4LV5A 1BMKA 3KCFA 2J4ZA 4A9YA 4JQ8A 2PE1A 5HKMA 3ZDIA 3WI6A 4WT6A 1YWVA 3UZPA 2ZV9A 4QMTA 1WVWA 3PIYA 3UPXA 3Q9XA 4D1SA 4FTUA 2Y7JA 2ZB0A 3D5UA 3LAUA 3MB6A 5DIAA 2HWOA 4FV7A 2CNUA 1YW2A 4O7TA 1M52A 3MPAA 3R30A 4WO5A 5IQIA 4DEEA 4RGJA 3AC4A 4A9RA 3IW4A 3TCPA 2LGCA 4MH7A 3MJ1A 4F7NA 1FMOE 3FMLA 4M84A 3VUKA 3OW3A 4ZJIA 2XIXA 3R2YA 4KKEA 5DRDA 3A4OX 4R5SA 1OM1A 1FINA 1R1WA 4FGRA 2JAVA 4XRJA 1U4DA 1GIJA 2ACXA 1FVVA 4KKGA 3EYHA 4E5WA 3S3IA 3ZMMA 4CFUA 2VO0A 2XEZA 3OXZA 2OJIA 4KB8A 4ZIMA 3U54A 4BTJA 4BIDA 1OMWA 4M69B 3FZPA 3IGOA 3QRUA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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