The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
16
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sequence length |
55
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structure length |
55
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Chain Sequence |
QYKLILNGKTLKGVLTIEAVDAATAEKVFKQYANDLGVDGEWTYDDATKTFTVTE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Protein binding
|
| molecule keywords |
Immunoglobulin G-binding protein G
|
| publication title |
Dimer Formation of a Stabilized Gbeta1 Variant: A Structural and Energetic Analysis
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Streptococcus sp. 'group g'
|
| total genus |
16
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| structure length |
55
|
| sequence length |
55
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-12-12 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF01378 | IgG_binding_B | B domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 5BMH A; 2KDM A; 1K52 A; 2RMM A; 4KGS A; 1IBX A; 2GI9 A; 2N7J A; 2I38 A; 2PTL A; 4D2K A; 2QSD A; 1P7F A; 4OZB A; 5HFY A; 1IBX B; 4IOI E; 2N9K A; 2OED A; 5BMG A; 3GB1 A; 1Q10 A; 2JXT A; 2IGD A; 2PW9 A; 5HHD G; 1YNT E; 1IGD A; 2ONQ A; 1MI0 A; 2EEL A; 1PGX A; 2IGG A; 1FCC C; 2IGH A; 2ZW0 A; 2JU6 X; 1MHH E; 2LGI A; 1YMH E; 1KH0 A; 2I2Y A; 2KAC A; 4IKG A; 4OZA A; 2PLP A; 2LHD A; 1QKZ A; 3FIL A; 2ZW1 A; 1K53 A; 4HKZ E; 2NMQ A; 2N9L A; 1HZ5 A; 1K50 A; 4GLS C; 3FIL B; 1F2R C; 5HI1 A; 5HG2 A; 2LHE A; 4MAC A; 5BMI A; 1MVK A; 2GB1 A; 1D4B A; 1HEZ E; 2KWD A; 1FD6 A; 1PGB A; 1ZXH A; 3UI3 A; 2RPV A; 1XCT L; 2J53 A; 1GB4 A; 2KQ4 X; 1C9F A; 2ON8 A; 1IGC A; 2J52 A; 1FCL A; 2JWU A; 1GB1 A; 1MPE A; 2K0P A; 3V3X A; 2LUM A; 1JML A; 1F2R I; 1HZ6 A; 1PGA A; 1K51 A; 2KN4 A; 4KGR A; 1P7E A; 4KGT A; 2QMT A; 1XF5 L; 3MP9 A; 5JXV A; 4WH4 A; 1UWX A; 1EM7 A; 2JZP A; 4HJG E; 1MHX A; 4OZC A; 1XCQ L; 2JSV X; #chains in the Genus database with same CATH topology 2QC8 A; 2KDM A; 4K3B A; 4KGS A; 1UZX B; 5AZG A; 3MJW A; 2WX1 A; 2GBK A; 4IWO A; 2KAJ A; 1HE8 A; 5DPS A; 1EF5 A; 2KMA A; 3TBL D; 3WCQ A; 4HPL B; 3R66 C; 3L54 A; 4M00 A; 1VJK A; 3E9S A; 1GNU A; 2ONQ A; 2FUG 1; 4MGK E; 3VRB B; 3ALB A; 3ZXV A; 2PE6 B; 4LTU A; 3M62 B; 2L8J A; 2C5L C; 3EHV A; 4EOY A; 1Y8R C; 3DHG C; 2MBH A; 3R8B A; 4BKS D; 5T8I A; 1NYR A; 2AX5 A; 3A9J A; 4GU2 A; 1V8C A; 4WJP A; 3FIL A; 4AOF A; 4P1B C; 2NMQ A; 3MTN B; 3RZF A; 3LB8 C; 3VVW B; 3NZS A; 4YTP B; 3P4Q B; 1KLU D; 2HD5 B; 3KUZ A; 1L6U A; 5HKH A; 4KDL B; 3KWL A; 4I6L B; 3WAL A; 4HCN B; 4HLE A; 4KZC A; 3WAN A; 2DYO A; 1TS3 A; 5C23 A; 2RDB C; 3AB5 A; 1FXA A; 4US9 A; 2BVC A; 1VRA B; 2Z0E B; 2WDQ B; 4LNN A; 4S0R A; 4IM3 A; 3SHQ A; 1WRD B; 4B0E A; 1WY8 A; 2K39 A; 1N5W A; 5E6P A; 4EZL A; 3QIJ A; 2KK8 A; 1N60 A; 4ITK A; 1UWX A; 2NPT B; 4GSW A; 5IN7 A; 1JCK B; 3GZN I; 3DBH I; 2MA9 B; 1GUA B; 1V1P A; 5D2M B; 2L00 B; 3V62 A; 1WXS A; 1DGJ A; 2DAF A; 1UBI A; 2JYT A; 1T0Q C; 5AEK B; 2GBJ A; 2IPK D; 3VXW A; 1GC6 A; 1D5M C; 2J0M A; 3WIM A; 4MSM B; 1L5P A; 2AWT A; 3RUL A; 3W9C B; 4WWM A; 2LMC A; 4HPP A; 2KC1 A; 1VLB A; 3WAP A; 1C79 A; 2JU6 X; 2D3B A; 3P42 A; 1RRB A; 3I5J C; 3UIN B; 2HE7 A; 1UD7 A; 4W9L A; 1KOT A; 2ZVO A; 1NI3 A; 1ZPS A; 3AE9 B; 2CR5 A; 3L17 A; 2FNJ B; 1FMA D; 4BKG A; 4RGT A; 1N61 A; 2KOX A; 1F2R C; 4REZ A; 1YQ3 B; 1QOG A; 2J42 A; 5HG2 A; 1WGY A; 4G50 A; 4WAF A; 4P16 A; 4S17 A; 4WIP A; 1Y56 A; 5AUK A; 5IOI A; 1FPY A; 4US8 A; 2C7N B; 3PGE A; 5GXG B; 2IY0 B; 4YSY B; 3T8M A; 1WM2 A; 4L2Y A; 4WWO A; 1TKE A; 3GE3 C; 3Q8F A; 2PE9 A; 1UGJ A; 2O6V D; 5JHB A; 3S2A A; 1FRR A; 3H8H A; 3B1L X; 3DWG C; 1RAX A; 2GBR A; 1UNS A; 2MHJ A; 2N0S B; 3HK0 A; 1F2R I; 3I57 A; 3SFD B; 4IWP A; 2WYQ A; 3IAM 1; 4ZRI A; 4K81 A; 5I4D A; 1KJT A; 4YWG G; 3MP9 A; 1FEH A; 1WFY A; 1TY0 A; 3M95 A; 1J19 A; 3H6N A; 4G0N B; 2KJR A; 2KZR A; 3Q8A A; 1YOV B; 1WE7 A; 4WWP A; 2FCM A; 3Q3J A; 2X38 A; 5G2N A; 2LVQ A; 3JSV A; 2KO3 A; 1NEK B; 2KYW A; 5HFY A; 1IBX B; 3RNB C; 2KJH B; 1ZE3 D; 2RR9 A; 1GJZ A; 1OFF A; 1TKG A; 2Q5W D; 1L7Y A; 3MFG A; 1CK1 A; 2M19 A; 3URY A; 4OVU A; 4A3O A; 2BW2 A; 1HQR D; 3MC9 A; 1TIF A; 4W9G A; 1PGX A; 4AUQ C; 3L08 A; 1E8W A; 4KKJ A; 1VCB A; 5FK9 C; 3NZU A; 2LGY A; 2W55 A; 2IO1 B; 2KQS A; 1ROE A; 2VH1 A; 3APF A; 1C4P A; 4IKG A; 1WXM A; 1ZUD 2; 1SIF A; 4L1B A; 4OZA A; 2PLP A; 3TEW A; 3E56 A; 2KX0 A; 2GBN A; 2N9L A; 1V97 A; 1E8Z A; 1LM8 B; 1V6E A; 2JYE A; 2Y3A A; 2LHE A; 2AQ2 B; 2WWZ A; 2NCN A; 5CHW A; 2K6D B; 3A1Q B; 1WGH A; 4NJ7 A; 3AI5 A; 1AYF A; 1WJU A; 2FBW B; 2XK5 B; 2WXF A; 3T3N A; 3UI3 A; 1WGG A; 3PZ7 A; 1WZ0 A; 3R2T A; 2FID A; 1ZDX A; 3APC A; 2QDF A; 3N30 A; 3ZYY X; 2O6V B; 3UIO B; 3N20 C; 2KLC A; 3BYT B; 1PUT A; 3BIN A; 2KFK B; 4JQW C; 2YVC A; 2KQ7 A; 3RMK C; 4YSX B; 1M4V A; 3P4P B; 4H2A A; 4K1R B; 5BMH A; 2QIL A; 3DWM A; 1S1Q B; 2MEK A; 3AXC A; 1E8Y A; 2I38 A; 2GRI A; 1E5W A; 4HCP B; 3BK1 A; 5FR6 A; 4TSS A; 3GB1 A; 5MPO A; 2K6Q A; 2WXQ A; 2A5U A; 4KDI C; 2X8X X; 2CU1 A; 4Q2J A; 4GXB A; 1PDX A; 1ZDV A; 3IHP C; 1ZP0 B; 1T6B X; 1LQB A; 4IDI A; 4DXF A; 3PS6 A; 3TL5 A; 5FR3 A; 2DHZ A; 4HDQ A; 1VZ7 A; 3ZDM C; 3U7Z A; 3IXS A; 4KIK B; 4URK A; 3AMZ A; 2N1W A; 1K50 A; 4C7Z A; 1RFK A; 2B76 B; 3Q3O C; 5D7G A; 3RT3 B; 1KRH A; 4MAC A; 2WQY B; 4BBN C; 1E7U A; 4OHJ A; 3JW0 X; 1HTO A; 4EZJ A; 1FNW A; 2WU5 B; 1PGB A; 1OQY A; 5IA7 A; 4MGY E; 5DPW A; 4MEL A; 4JWS C; 4K3C A; 1ET6 A; 1I7H A; 3T3O A; 1TS4 A; 4MGI E; 4ZYS A; 4E71 A; 3PLU A; 1FCL A; 3H1U A; 1OGW A; 4IC7 B; 5E6O A; 4CO7 A; 2WXI A; 1TKY A; 1UGM A; 2MP2 B; 1I4H A; 3ZRC A; 3R2I A; 4YSZ B; 2QMT A; 2MX2 A; 4ANV A; 2I1K A; 1N5X A; 4ARI A; 2XBB C; 3W1S C; 1KLG D; 2MBQ A; 1V9J A; 1XLO A; 1JWU D; 4DXA B; 2N7J A; 4RMA A; 2ZCB A; 4WUR A; 1RM6 C; 3AUL A; 3I9V 1; 2JRH A; 2KVR A; 1OQQ A; 4LJO B; 2LD9 A; 2HTH A; 2NVU I; 3NVY A; 3KVF B; 3NRZ A; 3VUY A; 4DBG A; 4C80 A; 2PW9 A; 4DHZ B; 4MSQ B; 2WS3 B; 5L83 A; 1QIL A; 1ET9 A; 4LJP B; 3U30 A; 3HUI A; 1MI0 A; 3Q3M C; 1FCC C; 1L0V B; 2YEP F; 1JWB D; 1SE3 A; 1NI2 A; 2WX0 A; 1KH0 A; 3GS2 A; 1R4N B; 1C1Y B; 1SIJ A; 1UF0 A; 4YTN B; 2K8B A; 1D3Z A; 2LAS A; 3AEA B; 1K53 A; 1JRU A; 4MM3 B; 4BOZ B; 5J17 A; 4AJY B; 4HRS A; 2R2Q A; 2QIE B; 1ZXH A; 3V61 A; 1J7C A; 2PKO A; 5G5H A; 4NY0 A; 1QLB B; 4FLH A; 3KYC D; 5AZH A; 2MBE A; 3DCG A; 2INP E; 3ECI A; 1FIQ A; 3QJZ A; 4MJS A; 2BB6 A; 2WXP A; 2BYE A; 4HWI B; 3V3X A; 2LUM A; 4ZRJ A; 1PGA A; 2M1M A; 3ZJT A; 1F0Z A; 2WU2 B; 4KGR A; 3NG0 A; 4KGT A; 2G1E A; 3PO0 A; 1L6V A; 3FAH A; 2BKR B; 2D11 A; 3IVF A; 4K7W A; 1SF0 A; 4WJQ A; 3K9O B; 1Z5S B; 2ZNV B; 3N3K B; 1TY2 A; 3C0R B; 1YD8 U; 2PTL A; 4D2K A; 3C19 A; 2BWF A; 2DZM A; 2WDR B; 3H7P B; 1BML C; 4FJV B; 3BZD B; 2JX5 A; 2CHX A; 3LDZ E; 2J4X A; 1OEY J; 1XD3 B; 2LRW A; 1WX9 A; 3PLV A; 4GDK A; 3N32 A; 5AUI A; 3AN1 A; 2N1V A; 2OJW A; 4AQ7 A; 3D32 A; 1DOY A; 2LGI A; 5LXH A; 3W5V B; 2ZVN A; 1ZW7 A; 2KMC A; 2RGF A; 3Q14 C; 4DXG A; 1FO4 A; 3H9D A; 3CWI A; 3APD A; 4CYE A; 1WF9 A; 4R3D A; 4M0W B; 1QQR A; 1JWM D; 3PZD A; 2KMM A; 1I4Q A; 3L16 A; 2LXC A; 3JYU A; 3V60 A; 2RD0 A; 5C1Z A; 1TGZ B; 4E3C A; 2WXG A; 4JL9 A; 2IND C; 1UEL A; 2D5G A; 3DBS A; 4N58 A; 2KWD A; 1SE2 A; 4J6I A; 2D3A A; 2AEH A; 4TMA B; 3BY4 B; 4W9H A; 1SJE D; 2Y5B B; 4ICU A; 3NS1 A; 4HXD A; 2R2O A; 1EF1 A; 3EEC A; 3H7S A; 5C2T B; 5H92 C; 3U4E G; 4EEW A; 3PRZ A; 3OJ3 A; 4NJ6 A; 3SEB A; 2NBV B; 4RGN A; 3RZW C; 3AH7 A; 1P7E A; 3RI7 C; 4W9F A; 3DBR I; 3P63 A; 4RH6 A; 3AED B; 2JRI B; 1YIW A; 4WH4 A; 1VDV A; 1YJJ A; 1I35 A; 3B2F A; 2IO2 B; 1MHX A; 2ZJD A; 3DVG Y; 3LJ3 A; 3Q8B A; 3EFU A; 1J7A A; 4XX5 A; 2L32 A; 1ACC A; 2OED A; 5BMG A; 2DZI A; 1MG8 A; 2PMV A; 4E74 A; 2M0X A; 4BOS C; 2JF5 A; 3NVZ A; 1EWY C; 4KKI A; 3ZUN A; 2IGG A; 4FHJ A; 2XN9 C; 2D2Q A; 3RNG C; 5JH5 C; 3CIR B; 1NEN B; 2WDT B; 2DX5 B; 3QQ8 B; 1R4M I; 3KLS X; 2J7Q B; 2INN E; 2INC C; 3Q8C A; 3AV8 A; 2BS3 B; 1N62 A; 3ZNZ B; 5D94 A; 4IG7 B; 1BT0 A; 4RF0 A; 2MLB A; 5J2R A; 4NAM A; 2L05 A; 3RCZ A; 1TTN A; 1XLN A; 2NBU A; 2WXJ A; 2O2V B; 1EO6 A; 3TCA A; 3CMM B; 1JRP A; 2RSU A; 2DYB A; 1LO5 D; 1UUP A; 3W1S A; 4HJK A; 4B6W A; 2VRR B; 2CJO A; 2NBW B; 1XCT L; 2JZ3 B; 3DHH C; 3ML9 A; 3UIP B; 2GLS A; 3SD5 A; 1FFU A; 4KSK C; 1QOA A; 2J52 A; 4N9F 4; 1CQV A; 4WQO B; 3A9K B; 3PZ8 A; 1WSP A; 3VUW A; 3PT2 B; 4ANX A; 4DHZ E; 3B08 A; 3V6C B; 4ZHO A; 2NPT A; 2DNF A; 2JUO A; 3VRA B; 1FNV A; 5D3I B; 5BYS A; 2FIF A; 1YN5 A; 2GOW A; 1FFV A; 1V80 A; 3VTW A; 3PRM B; 2WXM A; 4I6P A; 4JWU C; 1C4C A; 1YQB A; 2PPH A; 2JXT A; 2R61 A; 2UYZ B; 4MH0 E; 3X23 A; 4HPM B; 3B9J A; 5HHD G; 2LRU A; 2NTS A; 3NJT A; 4NAW B; 2C60 A; 3C8Y A; 3L4P A; 4KZ0 A; 3U7D A; 2Z0D B; 1RWS A; 2D3G A; 5KHO A; 4C4V B; 1SJH D; 4A6Q A; 2LJI A; 1YX5 B; 4A20 A; 2WXH A; 2ZCC A; 2RDG A; 1UBQ A; 5EE3 A; 3DOW A; 2G4D B; 4BKS A; 3QCA A; 4W9E A; 5CTR C; 3RD2 A; 2ZW1 A; 1QOB A; 2EKE C; 1WGD A; 1HZ5 A; 1WWT A; 3ZVV A; 2KDE B; 1N63 A; 3I63 C; 2V0G A; 1SXT A; 4USA A; 3ZJU A; 1MVK A; 2BYT A; 2V4L A; 2LGD A; 1T5X D; 1GAQ B; 2BTE A; 3KH0 A; 2CS4 A; 3BWU D; 4I6N B; 3WAM A; 2IYD B; 3P4S B; 4K7U A; 2J53 A; 1MJD A; 1ESF A; 1SGH A; 2CJN A; 2EMS A; 4P1C C; 3AE6 B; 2IO3 B; 1C9F A; 4MDK E; 1WX8 A; 2ON8 A; 1WRI A; 2LZ6 A; 1WJ6 A; 3ZNH B; 3LYY A; 3B2G A; 1HZ6 A; 1R7S A; 1V1O A; 1XT9 B; 2KC2 A; 3DBL B; 1XO3 A; 1OQR A; 3P2B A; 3DHI C; 3TSS A; 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4MT5 A; 3ZW3 A; 2DAJ A; 2QCZ A; 2KLG A; 2KKC A; 3VAW A; 1TYG B; 5BO4 B; 2N9K A; 3AE7 B; 4NZL B; 3KWV A; 3I3T B; 1PFD A; 3NOB A; 5IKC M; 3NVW A; 4A55 A; 1DOX A; 4RM8 A; 2KWU B; 2V3N A; 4GDL B; 3DVN V; 2HTM E; 1TZO A; 2ZPY A; 4RGO S; 4WJO A; 4DHJ B; 1YJI A; 4KIK A; 1YMH E; 4XYC A; 4LCD E; 2JT4 B; 2H89 B; 2ASQ A; 2D07 B; 2LHD A; 4HK2 A; 4LLG M; 2HDE A; 1STE A; 4NQK E; 2WHI A; 1AWD A; 1F77 A; 1WH3 A; 3EC8 A; 3PRE A; 3AEB B; 4EE2 A; 4RM9 A; 4TV3 A; 2GB1 A; 2WGS A; 3AE1 B; 4IUM B; 2LEK A; 2SAK A; 3CST A; 3RYT A; 1GB4 A; 1P98 A; 2KAN A; 2RPQ A; 2DEN B; 2PIA A; 4HVB A; 2BT6 A; 1TT5 B; 4IM2 A; 1WXQ A; 2N7D A; 1SE9 A; 2GMI C; 1GB1 A; 3N1Y C; 1MPE A; 2LWP A; 2MP2 A; 1EU4 A; 1T0R C; 1YJ1 A; 5EE9 A; 3VH4 B; 4ANW A; 4GOC A; 1AAR A; 1OTR B; 1YN3 A; 3ZJV A; 1HTQ A; 2DWQ A; 4XWW A; 2Z8L A; 3HIZ A; 3BII D; 4IW0 A; 2W3S A; 1K52 A; 2AL6 A; 5LNK 1; 3N9Y C; 3L0W B; 4WAA A; 4J3O D; 2I1J A; 1YX6 B; 3GOE A; 1JRO A; 3IT4 B; 1PQS A; 1IYF A; 1DYQ A; 1RYJ A; 4ZRQ A; 1CJE A; 4CQN A; 4EFO A; 2VZK D; 3R3M A; 2LUE A; 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