3FKNA

P38 kinase crystal structure in complex with ro7125
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
349
structure length
346
Chain Sequence
ERPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSGAYGSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSRPFQSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIVKCQKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDFGHTDDEMTGYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHIDQLKLILRLVGTPGAELLKKISSESARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDSDKRITAAQALAHAYFAQYHDPDDEPVADPYDQSFESRDLLIDEWKSLTYDEVISFVPPP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Signaling protein, transferase
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 14
publication title Mapping Binding Pocket Volume: Potential Applications towards Ligand Design and Selectivity
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 112
structure length 346
sequence length 349
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2008-12-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3fknA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3fknA01
4EKLA 3OWKA 4R78A 4KKGA 3PRFA 3ODZX 3ODYX 2WTKB 4HVDA 4FKUA 5E92A 3EQGA 4FTQA 1OZ1A 2HAKA 4MYGA 3EN4A 4PY1A 2GNGA 3DLZA 1ZZLA 4JNWA 5DBXA 4H05A 4CFNA 3M1SA 2VTHA 3KRLA 3EL8A 5J9YA 3Q2JA 5AR8A 3KRJA 2PVMA 4FZ7A 4D2TA 3KY2A 2BPMA 5KHXA 3BEAA 4BCIA 1AQ1A 3NVMB 4ERKA 2YFXA 2IVUA 2YJSA 4QP1A 4G2FA 4IZ5A 2F4JA 2E9NA 3LPBA 4HYUA 3VRYA 3ZLWA 4WHZA 1PXPA 5AA8A 4F4PA 5C9CA 4RVLA 1RE8A 4YLJA 1BUHA 2XJ2A 3VS4A 3ZONA 2C5XA 3HV7A 2R3QA 3LXPA 5HGIA 3VF8A 3GCSA 3O7LB 3FKLA 2CJMA 4D1SA 3IGGA 2J0LA 3R73A 3QUPA 5HLPA 3ZSGA 2XK9A 2A1AB 1PY5A 3U8WA 5LVNA 3BE9A 1K9AA 2XYNA 4J8MA 4TWOA 4BWXA 3CE3A 5AR2A 2J50A 5CVGA 3EN9A 3FLQA 3L9LA 5JRSA 2UVXA 4KBKA 1H08A 2QI8A 3UO6A 4AGWA 4YR8A 4XRLA 2PYWA 2P2HA 1A06A 3RK5A 3VRZA 1MRUA 3CTQA 4MD7E 4Y46A 5DA3A 1TQMA 3GVUA 2EXMA 4K9YA 4EYMA 3VWAA 2J7TA 1G8AA 2ACXA 3F9NA 4YJRA 2VO3A 5EFQA 3W2RA 2YIQA 4CT1A 4EC9A 5I0BA 5AP5A 4I5CA 1J7LA 5G6VA 4EH2A 4GS6A 3NYOA 1BKXA 2GHGA 2W4JA 4GUBA 5M4UA 1IRKA 2FH9A 4FV7A 4TT7A 3UMWA 5IZFA 3HAVA 5BUIA 4LGHA 3AD6A 3ITZA 1T45A 4FZ6A 3WF7A 1DAYA 1ZLTA 4JDHA 2JIIA 3DDPA 5CQUA 5AM6A 3WZDA 2BR1A 5E91A 2ITUA 3A7HA 1QL6A 3QTUA 4D0WA 3U54A 5C8KA 2VNWA 4BCPA 2PTKA 4CV8A 5C8NA 4XNEA 3TM0A 2OFVA 4WG3A 3EFJA 2O65A 4E5BA 1ZYSA 2RG6A 3R8LA 3RAIA 3UO5A 1PYXA 2CKOA 4O82A 2GS6A 2W9ZB 3BHHA 2JC6A 4Y95A 3RALA 2C3JA 3DAJA 5CI6A 5DRDA 3THBA 3GU7A 4F1OA 3QLFA 2GNHA 1AD5A 3ZO3A 3ET7A 4IEBA 3NDMA 3W2CA 3HKOA 1SNXA 2LAVA 4YJVA 1XH7A 4BDIA 3QU0A 3E63A 3DTWA 3GC9A 3BZ3A 3EQBA 4M13A 2WQMA 4PTCA 1OM1A 4AQCA 2OWBA 4RC2A 4DF3A 3UP2A 1NVQA 4NTTA 2XKEA 5BVOA 4TKSA 2FSOX 2GNFA 4JIKA 5EOBA 3BELA 3BYUA 4RFYA 4WUNA 5CT7A 1DI8A 2VTMA 3HP2A 1YI6A 3C50A 5C4LA 2IO6A 2WAJA 4K18A 4RGJA 3K3JA 2YLEA 5HE2A 4IZ7A 4DITA 4EOMA 5A14A 3Q9XA 3TT0A 5L8LA 4H3PA 3EIDA 4FC0A 5DR9A 3CP9A 4YHTA 4I1ZA 5HD7A 5KMJA 3BLRA 1OL5A 3Q32A 3PZEA 4BHZA 3L8PA 2CGXA 4HGLA 4NK9A 4Z16A 2GS2A 3PIXA 4O0SA 3OC1A 3EOCA 4W9XA 2OIQA 5CEMA 1URWA 3Q5IA 4DFUA 5HCYA 2XEYA 2ZM4A 4EOLA 4F6SA 2WTVA 2XH5A 4BKYA 3KFAA 3PY0A 4WIHA 1Q4LA 5DIAA 2G15A 4FNXA 4TWCA 4QQCA 1LP4A 2WMAA 3BU3A 3NUSA 4TWPA 3QLGA 5CYIA 2G1TA 1JLUE 3GQIA 3RAKA 1ZOHA 3ZO1A 4DGNA 5LMKC 3NUXA 4IFGA 5IG1A 2WTJA 4IX6A 4HCUA 2YA9A 3HRFA 2E9OA 2Y7JA 3VS1A 5IMXA 4KAOA 4AOTA 4CQGA 3RZBA 1JSUA 1PHKA 3VAPA 4CTBA 3LCTA 4TPTA 4U5JA 3R83A 4E73A 3UPXA 4B9DA 3UZTA 2WNTA 5AFVA 3BHUA 4JDKA 5FQDC 4EQUA 2R3GA 3EJ1A 2E2BA 3KRWA 3W33A 3P5KA 2PE0A 3ZRLA 1PKGA 4USEA 1E1VA 2EU9A 3DDQA 2IZTA 2Z7SA 2VWBA 4MQ2A 2UZEA 5CEIA 4C8BA 1V1KA 3NNXA 2PMLX 1Q41A 3E7OA 3GNIB 3PFQA 3QCQA 2VX1A 3LXKA 4FYNA 4PL5A 4U0IA 2QKRA 3R0TA 1F3MC 3OEZA 3ENHA 3OT3A 5AR5A 4JQ7A 2HW7A 4FT3A 4QP3A 4XBRA 4BZOA 5JFXA 2R3MA 3OW3A 2JIVA 3OXTA 4JDIA 4AT3A 4C2VA 2YWPA 4PDSA 3D9VA 4IQ6A 4YJSA 5CZHA 4A7CA 4CZTA 4L3PA 2R7BA 4C4IA 4EBWA 5E4HA 3I0OA 3NNVA 4MF1A 4YJQA 5AP0A 5ICPA 4PV0A 2GCDA 4GUEA 4PTGA 1BMKA 3G0FA 1H26A 4YSMA 2C0OA 5JGDA 2CNQA 4I92A 4O0XA 1B6CB 3LFNA 4FTLA 2ETRA 5F4NA 2QODA 2VTSA 3F61A 4IE9A 1SM2A 5FBNC 2PMNX 3H0ZA 5IH5A 1H1PA 3F88A 3VS5A 2AYPA 3E3PA 2BVAA 5L6WL 3UO4A 4QMQA 4FKOA 1Q24A 4S32A 3QD0A 4I4FA 4PX6A 4NKAA 5EDQA 1PXOA 5FTQA 4EH4A 5L2SA 3EFLA 5K5NA 4QPMA 5HCXA 4ZS0A 4IIRA 3RPOA 3R9RA 5FXSA 4C34A 3HL7A 1P2AA 4JAIA 5AWMA 4C02A 3NR9A 3FMKA 4U8ZA 4FUYA 2YM8A 3ORMA 2CGWA 1M7QA 1SNUA 2XK4A 3LM5A 3QA8A 4DCEA 2XYUA 4JXFA 3MJ1A 1XKKA 3FQEA 2EB2A 4JR7A 2WQEA 3PXYA 1HOWA 1S9JA 4OTQA 3DKFA 4PTEA 2VTAA 3CIKA 5B0XA 4FT9A 3LFAA 2C0IA 4UXQA 4A9YA 5IQIA 3PJ2A 5IU2A 4B8MA 3GEQA 4IJPA 3ID6C 4O2PA 4DEHA 2A27A 5LARA 3L8SA 2JDRA 2X6EA 3TZMA 1KV2A 3R2YA 3WF6A 1KSWA 4FK3A 4G3EA 5CQWA 5CLPA 2XNMA 5FEQA 3QCXA 2ITOA 2BHHA 2PVYA 4DFXE 5A6OA 3OTVA 2XKDA 5DVRA 2CMWA 3R28A 2J0JA 3PE2A 4KS7A 5IISA 4QPSA 3LIJA 4DEDA 2C1BA 3PY1A 1Q3DA 5IA3A 5IQDA 3E64A 1H1SA 3ZSIA 4RIWA 3MY1A 3NGAA 1W7HA 4EOJA 3AG9A 5ACKA 3F82A 3LCKA 2RFEA 3W2PA 3JVSA 4ACCA 4FV3A 4CG8A 3EQCA 4KABA 4IDVA 2IZUA 3D2KA 4BF2A 3BGZA 4WUAA 4DC2A 3FLNC 3PVWA 2OXXA 3FMNA 1ZMVA 2PZ5A 1Q62A 3E3BX 2VWYA 1H0VA 2NPQA 3O17A 4OTGA 3UGCA 4FSTA 4G3FA 4A9TA 4IJ9A 4XLIA 4YZ9A 3TDWA 2BRHA 5BUJA 4LQMA 1YOJA 5AP4A 3EKKA 4ASZA 3QCYA 3BKBA 4FTCA 4O7NA 2BMCA 4V0GB 3RP9A 3W10A 2ERKA 3LXLA 3R04A 3HV4A 4L3JA 3QUEA 3OWPA 2A2AA 4O1PA 3UZPA 3VUKA 4CV9A 3S4QA 5GIOE 5TR6A 2C6LA 3O8PA 2YIWA 2ZV7A 3KCKA 2OG8A 4KA3A 4IWDA 3S1HA 3WILA 2UW7A 3MH3A 3D83A 4JX7A 4NW6A 1BLXA 3CLYA 3CTHA 3GFWA 4J98A 3TACA 5LMBA 2XNPA 3QKLA 3ZTXA 3GCQA 1FGIA 4I6HA 4ZY4A 3DXQA 3PJ8A 4G6OA 4GL9A 4V04A 3MVLA 5EM8A 3ZXZA 4YTFA 1WBOA 2YIXA 3AT4A 3F3UA 4S34A 5HG7A 4NIFA 4M84A 3WZKA 2W96B 3QC9A 3OG7A 4M3QA 4PPCA 4QP9A 3ZFYA 4EOIA 2ETKA 2OJ9A 3BLHA 3UJGA 3PWDA 4RJ4A 1OL1A 2YM5A 3COHA 1YDRE 4MH7A 4NM7A 4BI2A 3QYZA 4MX9A 3R8ZA 3TV6A 3V5QA 4C3PA 5HVYA 4G31A 3IS5A 3MVHA 5GHVA 3HA8A 3SKCA 3EN7A 3F5UA 4W4YA 4D4RA 3SW7A 5IQGA 3BQRA 4TYEA 1H1RA 2XNEA 3H30A 5DN3A 3ZLSA 4BYJA 2YITA 3K3IA 5JGAA 4ANLA 3ORLA 4QRCA 2WFYA 4CRSA 2YERA 3TUCA 4K8AA 5A9UA 3R71A 3L8VA 4E5AX 4B8LA 4FKSA 4YO6A 4Y8DA 1PKDA 1YXUA 4KB8A 4U3YA 5HKMA 3ORTA 3IOPA 4GJ2A 3I1AA 4GT5A 4KIQA 5F1ZA 3VS2A 2GHMA 4G6NA 1KE8A 5C01A 2I0VA 4FOBA 3T9TA 1H01A 2R2PA 2WB8A 3DOGA 3FI4A 3L9MA 4C61A 3BWJA 4A07A 4EONA 2VTQA 3ATTA 5AAEA 3NW7A 3KRXA 1MP8A 4MBIA 1OVEA 3I60A 3MI9A 4AA5A 5HG5A 4DEAA 2X8EA 5IF1A 4MCVA 5LVLA 4G5JA 4RX8A 1XH8A 4CFMA 5HBJA 1Q61A 2QO9A 3PXKA 4E26A 4IVCA 3R1NA 5D41A 4O22A 4HCVA 4CXAA 4C4HA 5FP6A 2YN8A 5C26A 4X7QA 1KOBA 5CSXA 2NRUA 4CVAA 3HLLA 4ACDA 2QOHA 3GUBA 5BX0A 5IDPA 4FTUA 3D7ZA 3FLYA 3H3CA 4FL2A 4TRLA 3RM6A 2YDIA 2Y6MA 2CDZA 3MYGA 4LL0A 3D94A 3OHTA 3R02A 3ORKA 4LGDA 2C6EA 2FVDA 3SOAA 4CFFA 5L8JA 4BWKA 1U5RA 3PIZA 5HVJA 4NFMA 3PDTA 5E1SA 4EWQA 2JEDA 4F09A 4FUXA 3QYWA 2X4FA 4O2ZA 4QD6A 3D7TA 4YZMA 4HW7A 5LMKA 2XNBA 3P7CA 4F65A 2ZDTA 4NCTC 4PL3A 4TYGA 4NUSA 1B39A 1GOLA 1R39A 1VEBA 4D58A 3ELJA 4O7SA 5E8VA 3V3VA 3AD5A 2UZVA 3EL7A 1E1XA 4PF4A 1FMKA 3HUBA 4TYIA 1BYGA 3KN6A 4EK5A 3UZRA 1WBSA 3V5PA 1TQPA 4W8DA 5L2WA 4FGRA 4LRMA 5HHWA 4Y72A 1VYWA 2J9MA 3ZC6A 4MKCA 5FXQA 2C6OA 3DB6A 4YJUA 2Y9QA 2W1DA 4RC4A 3K54A 2F9GA 5AV3A 1O6KA 3ZDUA 4CYJA 3F3ZA 2F49A 5GNKA 2BAJA 2JFLA 3RHKA 4QMXA 2GNLA 2PVHA 4AN3A 5DT0A 4D4SA 2R3JA 3DXNA 3FV8A 4EH7A 3LMHA 3NUUA 4EQCA 4JL9A 4M69A 1GIIA 3R6XA 4O96A 2ZV2A 3PA4A 3AC2A 3QRTA 3VBVA 1F5QA 3E7VA 2WMXA 3DK7A 5JSMA 1YRPA 2GU8A 4LI5A 5LWMA 5CAOA 3G9LX 4IDTA 4F7SA 3PG3A 2PVNA 1A48A 3NNUA 4WBOA 2Z60A 4ZLZA 5AMNA 4OLIA 2IW9A 5AUWA 1SVEA 4FKGA 4MXXA 3AGLA 5KKRC 5J1WA 3DJ6A 2VTJA 4YLKA 4IB3A 4UWCA 3QTWA 4EYJA 4M0ZA 4K77A 5A6NA 4EH8A 2XIXA 3L9NA 3UTOA 3A4OX 5AR4A 3ZRKA 3FKNA 3BE2A 1LEWA 2VX0A 5CNOA 3WIKA 4OAVB 5FTOA 4E4MA 4EHGA 3E92A 3OEFX 3IQ7A 2BZHB 2JD5A 2Q0NA 1ATPE 1Y91A 1M14A 5AUYA 3D14A 4AW5A 1ZRZA 4M67A 3VHEA 2HWPA 4FT5A 2Z2WA 4O81A 3PXRA 1QCFA 1UU9A 3AT3A 3POZA 2O8YA 5FXRA 2RFNA 3E5AA 4HYSA 4PDOA 5B2KA 4EC8A 2YCSA 5D9HA 3KEXA 4X3FB 3ZBXA 4RPVA 2PVRA 3KREA 4BDHA 4C37A 3JY0A 4FG7A 4GIHA 4EOQA 5EI2A 3SV0A 1IASA 4BDDA 5CALA 2W1GA 3UBDA 3SA0A 4YNEA 4FYOA 4FT0A 3RKBA 3C13A 3MSSA 4J71A 4CEGA 2ZV9A 2UW0A 2VTRA 3Q4CA 4RFZA 3V04A 5HQ0A 4NYEA 3QFVA 2P33A 3H9OA 3V8SA 3KGAA 5LWNA 4WD5A 3VS3A 4AP7A 4YBJA 4I23A 2WXVA 2Z7QA 4BDCA 4OW8A 2QURA 1OKVA 1K3AA 2YCFA 2UZDA 3LFBA 3W55A 5IA1A 3MN3A 4JT3A 4EUTA 3MPAA 5F20A 1XBBA 3CR0A 4XUFA 4FIFA 3V01A 3DFCB 3PLAE 3U4WA 3MB6A 2P2IA 3WZEA 4EH9A 1ZMWA 4IVBA 2R0UA 4JIAA 3MA6A 5A4CA 5M09A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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