3FS2A

Crystal structure of 2-dehydro-3-deoxyphosphooctonate aldolase from bruciella melitensis at 1.85a resolution
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
275
structure length
258
Chain Sequence
TANSTVKVGNVTFSNSAPLALIAGPCQMETRDHAFEMAGRLKEMTDKLGIGLVYKSSFDKANIGLEKALEVFSDLKKEYGFPVLTDIHTEEQCAAVAPVVDVLQIPAFLCRQTDLLIAAARTGRVVNVKKGQFLAPWDMKNVLAKITESGNPNVLATERGVSFGYNTLVSDMRALPIMAGLGAPVIFDATHSVQQPGQREFVETLARAAVAVGVAGFFIETHEDPDNAPSDGPNMVPIDKMPALLEKLMAFDRIAKAL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords 2-dehydro-3-deoxyphosphooctonate aldolase
publication title Crystal structure of 2-Dehydro-3-Deoxyphosphooctonate aldolase from Bruciella melitensis at 1.85A resolution
rcsb
source organism Brucella melitensis
total genus 90
structure length 258
sequence length 275
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.5.1.55: 3-deoxy-8-phosphooctulonate synthase.
pdb deposition date 2009-01-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00793 DAHP_synth_1 DAHP synthetase I family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3fs2A00
1XBZA 2Y7FA 1PIIA 5KINA 3P8IA 3W1QA 3T78A 1IXPA 3F1QA 2OT1A 1H7XA 3O06A 1J4EA 3W71A 5CZSA 1JUBA 1W5QA 3KVJA 3W7PA 1T8XA 2A0NA 2Y7GA 3TW6A 3HGSA 4S1FA 1DORA 5DCEA 3RU6A 1F74A 5HWJA 4RCXA 3BG3A 3GIYA 2B7QA 3EWZA 3PBYA 3QQ1A 4O14A 3DFQA 1F6KA 4BF9A 4OWGA 3S1WA 1SO4A 4UTWC 4GRSA 4JIQA 3CIWA 3GNNA 3HGJA 4C1LA 1WQ5A 4AB4A 5BMWA 3IVUA 3L5MA 4UTKA 2ZRVA 2J24A 1DHPA 3G18A 4I7WA 3S5NA 4A22A 5F2IA 3B0PA 1DJNA 4JX4A 3R13A 4QSHA 1GT8A 5CZTA 5DXYA 3W7IA 5HINA 4JYEA 3U8GA 3DH7A 3G1FA 4JD4A 3SSJA 1XBVA 1I2RA 1LP6A 5I3GA 1XDMA 2X30A 4EF9A 4HHPA 2G95A 5BRBA 1SFLA 1YDNA 3GLCA 3UQNA 5EBUA 1LBMA 1IIGA 4LVGA 1Q6OA 2B7PA 2QUVA 4N2YA 2ZZ6A 2QCMA 5DY2A 4BWLC 3HPSA 5FF7A 4GUHA 3WK1A 2TMDA 3BARA 3M7WA 1DBTA 2ISSA 5D03A 2V2CA 4H4IA 2FPVA 1BWLA 1AG1O 3N73A 4O1DA 3FJ6A 2E6DA 5LNSA 4Z1AA 1P0KA 3EWXA 1DKWA 3PB0A 4AXKA 5LNWA 1DOSA 3SGZA 1I2QA 2QCDA 3LHZA 3UXAA 3E02A 4UTTA 4P2VA 4EF8A 3ZR4A 5G2WA 3VNDA 3LLDA 1H51A 1O94A 3NM1A 3GR8A 1K8ZA 1G4PA 3OIXA 3BK0A 4UTMA 5H2ZA 1VYSX 2JKAA 1GEQA 1L2UA 1WXJA 4TR9A 5C2XA 5K2ZA 5FESA 4JYFA 5I3FA 4KFNA 2DU2A 4FNSA 2WSYA 2NXIA 3A21A 1KFJA 1TTPA 1SFJA 2ZBTA 3QF0A 1W37A 4LTSA 1GG1A 2PRLA 3AO0A 3C0JA 5D38A 1G69A 3L0KA 4K39A 3HPZA 5EL1A 3H54A 3G24A 3TK7A 2JGYA 3LGEA 4H6KA 1RZMA 2YX0A 3NM3A 1YXCA 2W0UA 4FNPA 3DFTA 4FNRA 3PWAA 1W54A 4FO4A 2ZQ0A 1XFBA 1RQBA 4ADSA 5F1VA 3LCFA 4IX0A 4UC5A 2E5BA 3KRUA 1WDWA 4ZL1A 3IIXA 4UR8A 4O18A 1MSSA 3P7YA 3P5ZA 4HPXA 2Y63A 1W3IA 1KTBA 2J9XA 1XUZA 2Y70A 3DBPA 3IIPA 1Q45A 4RV8A 1L6SA 1XKYA 5AHIA 3N2XA 1QFEA 2QUTA 2DJXA 4I7VA 4PH6A 3TE9A 2Y7EA 1I45A 1NFBA 1DQXA 2ZFAA 2WSQA 3S5YA 2RH9A 3W74A 1HTIA 3UZ5A 4O4VA 3IVTA 5DN1A 3WK0A 3OEXA 1XM3A 1QWGA 1V5XA 3TC7A 2QR6A 1RV8A 2JKPA 4L4MA 1KFCA 3UYCA 3O6CA 4BFAA 3B05A 2ZZ3A 1K7XA 3CM4A 2V81A 1VH7A 2V2HA 2WJZA 3Q37A 3B04A 4PFMA 6ALDA 3CEPA 1W0MA 4ALDA 4RJEA 3TQ0A 1IXNA 3THQA 3LLFA 3GXTA 1P1XA 4LRSA 3O6DA 3BGGA 3EWYA 1L6YA 2QAPA 3JS3A 1AK5A 2QCDB 3MBFA 2E5DA 1VYPX 3LCGA 1KM2A 3KAOA 3HMJG 1FUYA 1G6CA 2C3ZA 1VR6A 4UNKA 4E2DA 1AL8A 1MEHA 4IPJA 3S1VA 4O0ZA 1I2NA 3SIZA 3W1PA 1L9WA 2OCZA 3W1UA 3W23A 3MO7A 1KFEA 3P5YA 1EP2A 1QNVA 1DJQA 3C2EA 2TYSA 3M5VA 4DPQA 5E1QA 2NX9A 3W2NA 3HPXA 1FXQA 3W1RA 4JTGA 4FX8A 4MY1A 3W1XA 1ZHAA 5D33A 4UFIA 1OG0A 2A7NA 1FQ0A 3LXAA 5I3HA 1IGSA 3ABQA 3MYPA 5CSSA 4WOQA 3G8EA 1GYNA 5LNVA 5KZEA 5KITA 3E96A 1EB3A 3TSBA 4ZQOA 4JXCA 2C14A 4IMGA 3MMTA 4A3UA 1ZAJA 3PBWA 5K9XA 2ATSA 4LVAA 3CIXA 2QCHA 3EX2A 3ABRA 3M43A 1A5AA 1F5ZA 3NG3A 3B0VC 4UTIA 4XBKA 2I1OA 1SZFA 6TIMA 1QO5A 3W76A 3WFAA 2Z6JA 1VCVA 2Y89A 1B4KA 5EY5A 2ZRXA 1JRCA 2WOQA 4JTKA 3WJZA 2CFFA 1K7FA 1QR7A 1ZENA 4JICA 3S1UA 3LBMA 4R7JA 2QJHA 2VENA 1YTKA 2EGZA 3GR7A 3PSWA 4GUFA 3PG8A 4O1AA 3OHIA 4HSNA 1VYRA 1YDVA 3ELFA 4JX5A 4YCPA 3A9IA 3IIZA 3P67A 2C1HA 1F76A 2GOUA 4DXVA 3MP5A 4CNNA 4ZQPA 2VEPA 2YSWA 3PB2A 4GUJA 2EF9A 3DFPA 3GDTA 3L9CA 3P61A 1F73A 3LRLA 3YPIA 4L4LA 3AJXA 4RZ6A 3W7MA 1LORA 1JCMP 2WSRA 4NJJA 5I3JA 1SW3A 1EP3A 4KWVA 2ZDRA 3NQFA 1NAL1 1QPRA 3RK8A 4ONVA 1R30A 3N19B 5D2VA 5HUOA 4UR7A 3O8AA 3G1VA 5CPNA 3LERA 4O19A 2H90A 4MY9A 3QH2A 4NVTA 4NNAA 3GXNA 2VFFA 3TKFA 4Y90A 1NSJA 2FPYA 3LXCA 5FEWA 3P84A 3NGJA 4IPIA 1ZNNA 2V2DA 3W84A 5ABTA 2NUXA 3PBUA 1H1YA 1TQJA 4O54A 3T7VA 5DBTA 3LHWA 2JKEA 2R14A 2GVLA 2DZXA 4CLMA 5LHFA 3NEVA 2A7RA 5LGZA 3N2MA 4J9JA 4OBTA 5AYXA 3OVPA 4S2BA 5HULA 4P61A 1H50A 1VQTA 4D2JA 2YW4A 1FX6A 1QOPA 2CLKA 1VGAA 1MEWA 1W5OA 4A2SA 1LBLA 2H3BA 2EHHA 3VCRA 5DY3A 4IUOA 4UTWA 4JR5A 3B0UX 4UFLA 2RHGA 3S1XA 3TQVA 3R8RA 1KBIA 3EXSA 2DZWA 1VLIA 1FBAA 2QUUA 4XKYA 5HUPA 1TO3A 2Z6IA 4MYXA 4KFPA 5H91A 5AC7A 3A24A 3B03A 1S3HA 4HNNA 4O52A 1XCFA 2E6FA 1H7NA 2NUWA 3H53A 1H7PA 3PBVA 5HWMA 2YZRA 5F2LA 1F05A 3GDLA 4K8HA 1R2TA 3G1DA 3BW2A 4UXDA 3W7LA 1YTEA 3TXZA 2BXVA 2QJIA 4Y9AA 1JVNA 3TIMA 2E68A 1N8FA 3W2UA 3S8HA 4FXSA 3R5EA 2R94A 4BWLA 4MZ1A 4O11A 4YWIA 4FIRA 3G0UA 1K8YA 3LB0A 3TSMA 4BI7A 1ZFJA 2ISVA 2H8XA 2ZA3A 2ZZ1A 3NQCA 1TTIA 1TPDA 1PE1A 4UNLA 4TX9A 2NXHA 4YLWA 1GTHA 3NO5A 4A21A 5FF0A 4LV9A 4PL1A 1FCUA 1EP1A 5KSWA 1NVMA 1KLZA 3W83A 3PUEA 4QIUA 4RZ5A 2FQIA 1Q6QA 2XN0A 4MJMA 3PSVA 2ZRWA 2X1SA 5FEPA 4AHOA 4UTHA 1KV8A 1KBJA 1MXSA 3VKJA 1WBHA 3LHTA 3W22A 3BG9A 4MLJA 2E09A 3PC0A 4Q4KA 3V1PA 3WJSA 5LSMA 1LOQA 4Y8FA 4I7UA 4O16A 1G67A 4FIQA 4JNMA 2V5BA 2FLIA 4AH7A 1GWJA 1GTEA 1OHLA 2ZZ5A 2RKXA 3PULA 1YDOA 1AW1A 1WA3A 2V0TA 3NL2A 2CWNA 2TRSA 1VCFA 5F2GA 1MO0A 3I7SA 1EIXA 3N34A 1N7KA 4CNPA 1OFBA 2QCCA 2B7NA 5FEZA 4NNBA 1H7RA 3PAJA 1YADA 1FWRA 4MFDA 5BOOA 1RVGA 2VFDA 2QF7A 1HUVA 4GBUA 3EEGA 1KM3A 1OYAA 3DKLA 3FS2A 4HIBA 3N14A 4O28A 2Q8ZA 2PE4A 4FNUA 3SJ3A 3S42A 2E6YA 4K38A 4XKYB 3LTYA 1IIHA 1OFDA 3A22A 3P62A 3C3NA 3NQ8A 4IWWA 4N9BA 4DO4A 5BNKA 1R2RA 2PRHA 3W6YA 4AWUA 1VC4A 4AHPA 3RNDA 4OT7A 1GVOA 1A5SA 5IM51 1FCVA 4IMEA 1LCOA 1LM1A 3EWBX 3A5FA 3ZWSA 2WPBA 2NXGA 3E12A 3RF9A 1TPH1 3RLUA 2PRMA 4BR1A 3CLMA 4HSOA 4X3ZA 2CU0A 4E2BA 1OX5A 2BZNA 5G1YA 4Y96A 1YTDA 4NZJA 4GE8A 4JY8A 1IXOA 2FB2A 3NYZA 3TJXA 3W7DA 3G0XA 2YDAA 4JTSA 3UWYA 1YXYA 4IJBA 2XFWA 3RFAA 1J5TA 1KM1A 1SPQA 3N3MA 2NZLA 1SSGA 4NUWA 1KLYA 3CHVA 3TH6A 2C6QA 1VCGA 1ZALA 1LOLA 1ALDA 2EKCA 5KTLA 3BGJA 4PODA 1YXDA 4C1KA 3LM7A 3NAVA 3TJLA 2NX3A 2XN1A 5F4WA 2GUUA 3FLUA 3NZRA 3UWVA 2YYUA 4N4PA 4NU7A 1XL9A 3LX9A 1GZGA 4LVDA 4NJIA 5A8GA 2WQPA 2Q8LA 3STCA 3MJYA 2P0OA 3G1SA 4MJZA 1JUKA 4UMBA 4K7YA 4JS3A 1SO6A 4XTIA 3BLFA 4NJHA 4LS2A 3W7EA 4N9DA 3STEA 5MHBA 3NPUA 4FX7A 3OBKA 2VFIA 2NUYA 1A5CA 4ZQCA 3G8RA 3L2IA 3TA6A 5L9FA 1PCKA 3PG9A 3W7GA 4DF1A 5DELA 2YCEA 1B3OA 3CTLA 1OJXA 1PS9A 1Q6LA 5HNRA 4JTLA 1M6JA 2J27A 3W75A 4PC8A 4WJEA 4JTIA 1Q3NA 2ZRZA 4FNTA 1AW5A 5F4SA 1U83A 1KM6A 3BW3A 1TTQA 3LHUA 3MP3A 1K03A 1WV2A 3CT7A 3SZ8A 1OK4A 4AWSA 5AB3A 3HB9A 1TPWA 3UNDA 3BO9A 4MZ8A 1S5VA 1ZCOA 1Z41A 4WQ6A 4DO6A 2X2GA 2Q3OA 3ZFHA 3UPBA 2DJLA 1K3UA 2FPTA 2NWRA 5KMYA 2VFGA 5CPMA 3M44A 1BKSA 2WNQA 3DZ1A 1TRIA 2WO5A 5DLCA 3HQ1A 1RPXA 3C61A 1VPXA 3SR7A 2QJGA 1BWKA 2E77A 2DZVA 1RQEA 5C5YA 4ORIA 4Z0SA 4HN4A 5AN7A 3K30A 5G1TA 1TJRA 2VOMA 3MUXA 3JR2A 1WYIA 2AQWA 2CLOA 5G4WA 1XI3A 4FF7A 1JCXA 3L0GA 3UPWA 4UTLA 5AHEA 1SQ7A 8TIMA 4QJ1A 1IF2A 3EXTA 2J9ZA 3M47A 3LHYA 3UY7A 4LRTA 1L6WA 4YCOA 1H63A 1ICPA 1SU5A 3VI2A 1R2SA 2A4AA 3W72A 4ADTA 2X16A 1EWDA 3GVGA 3P60A 1VZWA 5TIMA 3S9YA 1UASA 4TIMA 5AHMA 2YW3A 1OVDA 2X1UA 4KKXA 1G4SA 3EB2A 4WXZA 3M0ZA 1ONRA 1LLZA 2QCLA 2NX1A 1FCBA 1UJPA 4DBDA 2GPTA 3NDOA 1LRTA 2QCNA 4S2CA 4M19A 2Y62A 2DORA 3W86A 2Y61A 1GVRA 1QPNA 1W1ZA 3R12A 1KM0A 4LNYA 3ANYA 1R46A 5CZJA 5D30A 2ZA1A 5LNRA 2H8ZA 5SWUA 2YYTA 1EUNA 2WKJA 4M5PA 4DF2A 4UFHA 2VKZG 4JIPA 4UMCA 3CEUA 2JGQA 3M6YA 5K4ZA 5D02A 3CPRA 3G1YA 3MP4A 1W31A 3A23A 4RXFA 3NR0A 1GYLA 5DCBA 3MYOA 5AYYA 4WZHA 3I6RA 2QDHA 4OV4A 1I4NA 4WXYA 1UUMA 4UMAA 2NLIA 2FFCA 4R53A 1ADOA 3QC3A 3VFLA 1GOXA 5AFDA 3L67A 2A6NA 3QMSA 1UBSA 4A29A 1W5PA 1GG0A 1YYAA 3MI2A 2QCEA 1KFKA 4JTEA 2E5CA 4LVBA 5HMSA 3NQDA 1E51A 3IGSA 4HPJA 4UFJA 1QPOA 1PHQA 2ABAA 4N9CA 1HO4A 1B57A 1X1OA 1OFPA 1PVNA 4LC6A 5AHFA 4GFSA 3TXVA 1H1ZA 3G3MA 4H3DA 4JGDA 4G1KA 4JTJA 3HG3A 3U6WA 3ZWTA 2J88A 3NXFA 1KV5A 2BSLA 4YXGA 2YXGA 2YPIA 4CCCA 3O05A 1O5XA 3NL3A 2TPSA 4NQ1A 3W70A 1VJIA 1I2PA 3T44A 3PVFA 3DXIA 3W7NA 3W7RA 3KXQA 5FF4A 3HBLA 1TIMA 3ABOA 3QFEA 4ADUA 4RR4A 5I3KA 2GJNA 4EVZA 1M7OA 1OX6A 4LW7A 1O60A 3O63A 2CLFA 2QKFA 1XXXA 3DFNA 3FJLA 3DGRA 3MHUA 3LTSA 2VEIA 1GPWA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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