3FUQA

Glycosylated sv2 and gangliosides as dual receptors for botulinum neurotoxin serotype f
Total Genus 101
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
101
sequence length
411
structure length
399
Chain Sequence
DNSILDMRYENNKFIDISGYGSNISINGDVYIYSTNRNQFGIYSSKPSEVNIAQNNDIIYNGRYQNFSISFWVRIPKYFNKVNLNNEYTIIDCIRNNNSGWKISLNYNKIIWTLQDTAGNNQKLVFNYTQMISISDYINKWIFVTITNNRLGNSRIYINGNLIDEKSISNLGDIHVSDNILFKIVGCNDTRYVGIRYFKVFDTELGKTEIETLYSDEPDPSILKDFWGNYLLYNKRYYLLNLLRTDKSITQNSNFLNINQQRGVYQKPNIFSNTRLYTGVEVIIRKNNTDNFVRKNDLAYINVVDRDVEYRLYADISIAKPEKIIKLIRTLGQIIVMDSIGNNCTMNFQNNNGGNIGLLGFHSNNLVASSWYYNNIRKNTSSNGCFWSFISKEHGWQEN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Toxin
molecule keywords BoNT/F (Neurotoxin type F)
publication title Glycosylated SV2 and gangliosides as dual receptors for botulinum neurotoxin serotype F
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium botulinum
total genus 101
structure length 399
sequence length 411
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2009-01-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3fuqA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3fuqA02
3O0VA 4DCKC 1JLXA 4NOTA 2ZMNA 3AXDA 1N3QA 4M3CE 5E89A 1QDOA 3UK9A 4ZGRB 3PVOA 4FOWA 1N47A 2VW1A 5T50A 3OY8B 2UWAA 3FJBA 1GZWB 3O5WB 4Z9WB 3CRIA 1FQ9A 2UWBA 1VAMA 4AGVA 1FV2A 3HALA 2UU8A 2ZGMA 3AJ5A 2FMDA 2DUQA 5H9QA 2WSVA 4ENDA 4DEPA 4YM2A 2FGFA 3ILRA 2RHPA 4EFPA 4J2SA 2R49A 1SZ6B 3NJ5A 3VSZA 4BLIA 4L8QA 3WUDA 3VSFA 5GLTA 1ILR1 5H9RA 4D0TA 2VXRA 3UJQA 2ZR1B 3N35A 3CA1A 2DRYA 3UL2A 4LBJA 1Q8OA 4I2SA 1VAVA 3RS6A 1FX5A 1LGBA 3WDYA 1DZCA 4YG6A 3VUOA 3WMVA 4JRAA 1G9CA 1SCSA 4BLJA 5IT6A 2D44A 1RITA 3QR5A 3W59A 4Q27A 3I2XA 4G6JA 2K8RA 1ENQA 1ISYA 2A75A 3ZVXA 5IK5A 4PBPA 3ZSKA 4UW4A 2NTDA 4AGGA 1G86A 1GZ9A 5LK5A 3ZSLA 1WW5A 1LHUA 2E4MC 1FNZA 2FHRA 1JW6A 1HWNB 3MPPG 3WA1A 4ZFYB 4JQ0A 1BASA 3I2AA 4K1YA 1WBCA 1M2TB 5DVHA 1FNYA 2A6YA 1LENA 1A8DA 2ZGSA 3A4UA 4EEEB 2FO1A 4H55A 5FZYA 1FN0A 3VKNA 4XTPA 2YMZA 4P6AA 3AX4A 3D7WB 4Z8SB 4YW4A 1APNA 3BADA 4HANA 2E7QA 3SLIA 4YM1A 5JOYA 2GMPA 5GZFA 4OWLA 1AX2A 3L2YA 3N36A 1J0SA 3NV4A 4I4OA 1AX0A 2BEAA 4AN7B 4EB2B 2E6VA 1CPNA 4YOLA 2PHRA 4R9AA 2JKBA 3N0KA 5F8SA 4FQ4A 5EYXA 1PUMB 4R9DA 3AYCA 1Z78A 1G9DA 5GZEA 4DRVA 2NVHA 2RSTA 4I1BA 3WNXA 4FQZA 1J1TA 2KLLA 3T1MA 3W58A 1QGLA 2PHTA 2J3PA 2WT2A 4KEIA 1LOGA 3IM6A 4YGDA 2C5DA 1HWPB 4Y24A 4JKQA 5SV8A 1B09A 4LO2A 3M3QA 1DYPA 1R1ZA 3IIRA 1JTCA 2IHOA 1MS9A 3IM7A 1LOFA 4BPZA 3SNMA 3CRGA 3WCSA 4FPYA 3WDUA 1TEIA 8I1BA 1UZYA 3HBWA 5BXTA 2A6WA 2P3IA 1YTOA 4GP3A 4I4QA 4G1RA 3AZVA 5GLWA 1MS5A 4U2AA 4FPJA 5GAQA 3OY8A 1GZWA 1FATA 3P6JA 2AQZA 1UX6A 2YZ4A 3C2UA 1HIBA 3BAHA 5HCFA 4IHZA 1W6MB 2VSAA 3USUB 1QOOA 1BKZA 2NMNA 2A7AA 1Z4SA 5HCAA 1CQ9A 3AKGA 3IAGC 3GALA 4LBKA 3AH2A 1IS5A 3FFZA 3FJFA 4DPNA 2WQZC 1MS3A 4RA0A 3I29B 2A71A 2VH9A 2X2SA 4YFWA 5BYNA 3AFKA 2EF6A 3NV1A 1ENRA 3T1LA 2R0HA 5D63A 3O0XA 5EXOA 1V6UA 4K20A 4BMEA 4IZEA 3VT2A 5JOZA 2DTYA 3N7JA 1C1LA 4FPOB 2YROA 3FJ9A 1T4QA 4I30A 3N7KA 2TEPA 3MEPA 4P0JA 1AJKA 3WO4A 5EHAA 1H30A 3ILFA 1W6NB 2AGSA 1LU2A 3FLTA 4YGCA 1SCRA 2LALA 3BX1C 3WZ1A 4XJAA 1CPMA 3BAQA 3IM5A 2L5XA 4EFQA 1YIFA 1HQLA 5B2HA 2ET2A 4P14A 3KM5A 5GALA 1CR7A 2JJ6A 3WOGA 1Z0HA 1FGAA 2AAIB 1LGNA 2VU9A 1AXYA 2DVFA 1W3GA 1NLSA 2DUOA 3O12A 1ZM1A 1VIWB 1IILA 5D62A 1S0JA 2D7IA 3O4BA 2X2TA 3VKFC 1JOJA 5E24E 2V5YA 4YW5A 1ISWA 3RMYA 2JD4A 1ULGA 4JP0A 4AVSA 2QYIB 4QC4A 5T5JA 5BXRA 2RG9B 1DQ2A 3UD7A 1AFCA 4WVWA 4I0YA 3TAYA 1V6KA 3DUIA 3U4XA 5GZGA 3AP5A 3ZXFA 4I1EA 4YG3A 1TFMB 1S0DA 1TOOA 5E88A 1GANA 1SLTA 3VWCA 2Y9XE 4XBQA 2OUHA 1WW6A 4L4IA 3H6SE 1S1AA 1C4RA 2DYCA 1QQKA 3MW3A 4D69A 4PQ9A 1JQZA 1XG6A 4GXLA 4LO2C 2Q9XA 3HOMA 4F83A 2AUYA 1QF3A 1BA7A 4X39A 5F5QA 4LBLA 1ULDA 3OYWB 4UW6A 1SBEA 1ONAA 3WDWA 3CRHA 2AENA 3POYA 3PHZA 3RSJA 4M00A 4FOYA 1WD3A 1FWVA 4LO0C 1IRPA 1GICA 2GZBA 1AJOA 3IN9A 1SLIA 2BQPA 4XXPA 2M49A 1Q04A 1W0PA 4A7KA 2D3SA 3R05A 4FPEA 1SLCA 1CESA 5CAZA 3I8TA 4D8HA 5H9PA 1R8OA 1KDMA 4LO7B 1QKQA 4TLPA 1JUIA 2CTVA 1C57A 1DQ5A 1AVBA 2EAKA 4P0LA 2XG3A 2AREA 2MIBA 5T5OA 5BOWA 3WCRA 4BOWA 5JOXA 4WZFA 1W6MA 3USUA 4I4XA 2NYYA 3AK0A 3R4SA 4P9XA 2P3KA 1UN1A 4GOVA 4DS0A 4J23B 5T52A 2G4IA 2D22A 2ZA9A 3AKFA 3AP6A 1F9KA 3AZXA 1V6XA 2DS0A 3JUTA 4XKIA 1S0CA 4I7IA 4OWKA 2KH2A 1W3FA 1KQRA 1LHWA 4SLIA 5JOWA 3O4CA 4XZPA 3M3OA 3O5SA 1RZOB 1V6MA 5E8AA 2LTNA 3ZC8A 1QOTA 2YXSA 1DQ0A 1W6NA 1LODA 4XXAA 4AWDA 1LGCA 4TZDA 1QNYA 2KI6B 4XJWA 1MVEA 1JXNA 5BXPA 4J2XA 4Q9GA 5EC5A 1UL9A 3ZXLA 2UUSA 4GAIA 3SH5A 3BRGC 3O44A 2GO2A 2OW4A 5DUVA 1RMLA 2BFHA 3LCPA 1KRIA 2D43A 1QXMA 1GKBA 1YI7A 4IY8A 3O4OA 1MZ5A 2W68A 1ULFA 1IOAA 4IYBA 1XQNA 4XHXA 4QALA 3N3HA 3FJJA 3ZSJA 5KXBA 3AH4A 5DSSB 2LIEA 4XMIA 4QD2B 1K5UA 1M16A 2DURA 2A6VA 3DGTA 3WO3A 2GN7A 4XMAA 4I3NA 3B3QE 1LEDA 1N1VA 1XZZA 1UMZA 3H6QA 2ZBJA 4CRQA 1YBIA 5KXCA 1FAYA 2ZAAA 2GNMA 1SLBA 3FJEA 4I4VA 1H9WA 5CNAA 3WG4A 1L2HA 1AXMA 1DQOA 3A22A 4A7YA 1W6OA 4PCRA 1LHOA 3KQRA 4HJJA 2GNDA 1HCDA 4JC1A 3FUQA 2VUAA 3E8LC 3SITA 4XE9A 3NBDA 3P6IA 4LO3C 4Q1RA 3V0AB 5F9TA 3HN1A 1RG8A 1DBNA 4YZ5A 1Q03A 2XOAA 5EWSA 4J2YA 1JBCA 2F8XC 2ZGUA 2ZHMA 3OYWA 1U0AA 1BQPA 1SLLA 1S0BA 4XOGA 2W52A 1SFYA 1TWEA 3PUBA 3BA4A 1KDKA 1OKQA 2D1ZA 1RY7A 3A07A 4OEEA 5F8YA 5FZZA 5BVPI 4Y1UA 3BAUA 2B7YA 4K1ZA 4CJMA 3AXEA 1LU1A 5JLVA 5KXDA 2SLIA 3CU1B 2F2FC 1MS1A 5IK8A 1DZQA 1CONA 4ZBVB 1Q56A 1DFCA 3VKOA 3VV1A 1JT3A 2CYFA 2EXIA 2LIQA 2ZGTA 3A21A 5CB7A 1AVWB 4C1XA 2ZACA 4R6UB 1II4A 1ULCA 4X37A 4K21A 4Q2FA 1O4YA 2AXMA 3D4KA 2EIGA 3C9ZA 1CIWA 2ENRA 1N1SA 4WVVA 3ASIA 3ZXEA 4XBNA 1CN1A 3AJ6A 5BP5A 3D6EA 3FJIA 1WUVA 4BQ1A 3UJOA 1MACA 1AXZA 4LO0A 2K43A 1YRZA 2Q3NB 3RTJB 1S0GA 1HWMB 1MD6A 1GZCA 3K1XA 4XHBA 4Q8KA 1KITA 2HWAA 1N1YA 3WV6A 1BFGA 3ZXJA 5DUXA 2D6OX 4CZSA 3HMYA 5DUYA 4II0A 3SH4A 4BMBA 2DWRA 2PELA 3BTAA 5JVVA 3H6RB 3VEQA 2YY1A 3UD9A 3I4IA 3BOPA 3BB2A 1BYHA 3AKIA 3UD8A 3OBTA 2WKKA 2VSEA 1CE7B 3JRRA 3NV3A 2ESUA 3H0OA 2AH2A 5DUWA 4M3CB 2D6MA 1IT0A 5GJ6A 4EKXB 2ES3A 3QLQA 3ATGA 1ABRB 3FGMA 3IPVB 4YLZA 1XYFA 2D20A 2JDZA 1G9BA 1WD4A 3ZXKA 2CWMA 3M2MA 3IM0A 3WUCA 1QDCA 4USPA 2ZGLA 1MS0A 4FPKA 1MS4A 3B00A 3GNEA 3CA6A 5F90A 3S8JA 1V6WA 3TB0A 3Q9OA 3WDTA 1VCLA 1IRAX 1BARA 3NWKA 2GDFA 3AKHA 1LJ7A 4FP3A 4XJ9A 5DG1A 1LTEA 3WHTA 5T55A 4Y1ZA 1W6PB 1S0FA 4LBQD 2AYHA 2YV8A 2ZGNA 2ZGQA 1CJPA 1V00A 3NBCA 2E51A 1UPSA 1SBFA 5IUQA 3O4DA 1LCLA 4GALA 3A0NA 3V0AA 1DIWA 3FLPA 1BJQA 3V64A 2HWMA 1BFCA 1H9PA 4P0KA 1OQLB 5F8WA 4I4RA 2DU1A 1ZA4A 1YYNA 4LBNA 3Q7WA 4D0ZA 3WDXA 3OGGA 2Z49A 4FPLA 2VW2A 4YM3A 4XJUA 2R16A 4DQAA 2ZABA 4IZXA 4H9WA 1V6NA 5L73A 2DUPA 1HKNA 2Y9GA 4M01A 2QN4A 4LO7C 1G9FA 4KEJA 4JKXB 3QYDA 3POKA 1IJTA 1I1BA 4QBVA 1Z2VA 2DVDA 2PHUA 3RG0A 1C1FA 4AYUA 2R9KB 4ZKTB 2ZHNA 2NM1A 2NN8A 4PC4A 1SBDA 1HWOB 1FV3A 2D24A 4DENA 3WVJA 4I4UA 2UWCA 5BXSA 4ATEA 1LEMA 4YZ3A 4LO3A 4I96A 5BP5C 4XYXA 5GLZA 2ZMKA 2HZ9A 2DU0A 3BRDA 2DVGA 5HCBA 5DZEA 3CA3A 3S8KA 3FUOA 1Q8VA 3BAGA 1HLCA 4GAFA 2A6ZA 3ZSMA 4XTMA 3M3EA 4FGFA 4F34A 1XHBA 2FDBM 4YZ4A 1CVNA 2HW9A 2DVBA 4XIKA 1ENSA 4ZFWB 2E7TA 1BFFA 1EYLA 3AH1A 4XILA 3SISA 2PHWA 4G9NA 3WINA 4Y1YA 1LHVA 1V6JA 1HQWA 5AVAA 4XFTA 3AZYA 2A3YA 4ATFA 2D3RA 1GNZA 4ASMB 2V73A 1DGLA 1E0OA 3ZYPA 1OFSA 4Q1PA 5T5LA 3FJDA 2A70A 2CL2A 3RQ0A 4OW4A 3BODA 4Y20B 2F2FA 3RMXA 4DFSA 1AX1A 2JECA 3O49A 3A23A 3VKLA 1DQ1A 3AYAA 3UJ4A 4JAWA 3B9UA 3OJBA 2RQ9A 1UZZA 3T2TA 3PMEA 2WRYA 4X38A 1DJSB 4MYEA 1AF9A 4LBOA 3H6RA 3Q7XA 5DZFA 4Q8LA 2ZKNA 2A3XA 4FPCA 1Q8SA 4XIOA 4A7ZA 4WBCA 2IWTB 4I37A 3WDVA 3ZXDA 4QD2C 4GKXA 2OVUA 3FJHA 5G00A 1ISZA 5DZGA 4YW3A 4Y1VA 4M3CA 2ZZJA 3ENRA 3INAA 4I4SA 2D6KA 3KMVA 3VT0A 1KNMA 2KI4A 1EVTA 3IPVA 4FVVA 3D5OA 2Z42A 1QU0A 3F1RA 1ULEA 2P23A 4AVTA 1G7YA 1JYIA 1BFBA 4X3AA 4FOQA 1V6OA 2P2KA 2WNEA 4KBBA 4YM0A 3LLPA 1UAIA 2NZ9A 1YO8A 1AVUA 1W0OA 5EG6C 1JN2P 4ZFUB 1UKGA 4XFSA 4YZ2A 3CA0A 4Y1XA 1WLDA 1JY0A 1PZ7A 2WSUA 4Q26A 3AYDA 1F5FA 1LOAA 1QMJA 2CY6A 3BA7A 3OJMA 4ISRA 1IS4A 2MLLB 3V0BB 1W6PA 2R1BA 1MVQA 4Q91A 2GN3A 2GNBA 1PZ9A 3MW4A 4R9CA 1D2SA 1GGPB 1MZ6A 4XBLA 4I4YA 1RIRA 2JE7A 1NZKA 3AZWA 5GLUA 1DYKA 4YG0A 4AGRA 1Q8QA 4LO1A 1AZDA 1LOCA 4WV8A 4I4PA 3WLUA 2PHXA 5FREA 3OJVA 1O4ZA 1ITBA 1A78A 1NXD1 1FYUA 2ZHKA 4GA9A 4DRRA 2WBCA 1ONKB 31BIA 1G8WA 2ZQOA 2NMOA 3AYEA 4UW5A 2DV9A 4JPZA 4QO3A 5FZUA 2GMMA 1W3AA 2GALA 4C1WA 4GP0A 1TWMA 5FNWA 1V6LA 4YZ1A 1T9FA 3OJ2A 4AVVA 4IQPA 1K5VA 2D6PA 1KJLA 3O3QA 4Y22B 4FPHA 6I1BA 2EXJA 1JT7A 3CA4A 2VLCA 3JUUA 3FJ8A 3WG2A 1SR4C 3N7MA 1AXKA 2EXHA 4ZXKA 3PJQA 1PZ8A 3WINC 4KEKA 4AN6A 3LSEA 1QQLA 2HYKA 5KXEA 2ZGRA 5DXDA 3FJAA 4FPFA 5CA6A 4OWJA 4Q9PA 1DQ6A 2VY0A 3APBA 3WMUA 4ITCA 3ZC9A 2AR6A 1LOEA 3F62B 1IHKA 4ZLBB 5DG2A 2A5ZA 1JHNA 3NV2A 1VALA 5GLVA 2P39A 5T5PA 4U36A 4XJ8A 1I1EA 3WO2A 3OBRA 1WBLA 1X50A 1TP0A 2AFGA 4HL0A 1GBGA 2VXTI 2D6LX 1W6QB 1ISVA 4NO4A 3M3CA 4Y20A 2E53A 4GWNA 1WLWA 2GMEA 1JYCA 5D61A 2ERFA 3FBYA 1WCSA 4Z8BA 1GYKA 2R0FA 1EV2A 1FWUA 1V6VA 2FFVA 1JLYA 3ZYRA 2P34A 2K4AB 1BXHA 3V79C 4LO8B 4R9BA 3EF2A 1LULA 3Q7YA 1JT5A 1WLCA 4Y26A 1P63A 2ZGKA 1OQ1A 9ILBA 2WJSA 3CQAA 2Z48A 4XJZA 1N4KA 4FOVA 3BAVA 3QCWA 2D7RA 4I6IA 2CWSA 1QOSA 2DVAA 4LBMA 5BQUA 3POWA 3R4UA 5GZDA 1AVAC 4GWMA 3RTIB 3PVEA 3CAHA 3P53A 2I2SA 4H04A 4EFRA 1N3OA 1NUNA 2D7FA 3JU9A 1IS6A 1DQGA 2WT1A 3MALA 4FP2A 3VT1A 4G9MA 2DRZA 3NBEA 2FFUA 4QBCA 4LBQB 4YW1A 3AJYA 1F31A 4TYSA 2D3PA 1MS8A 4KC3A 1AVXB 3AP9A 3O0WA 3V0BA 4JCKA 4J2KA 4LO1C 2PHFA 1GSLA 4YGEA 1V6IA 3OGFA 4HR6C 1DFQA 5I1BA 2D6NA 1TTUA 3ILAA 3N7LA 4RL7A 3ILNA 3B69A 1LESA 3IKWA 1PC8B 2A6XA 1RINA 3LSDA 1LOBA 4OZXA 5GZCA 4PBOA 5H9SA 2ERMA 3AP4A 3V65A 3ZX7A 1DQ4A 1KJRA 1GV9A 2Y9FA 1VLNA 5FNXA 2ZHLA 5FRAA 3VKMA 3AP7A 3BAOA 3LTQA 21BIA 4QKSA 3HR9A 1WBFA 4G6MA 7I1BA 2EALA 3PG0A 2EXKA 1WW7A 5DZUA 3UDAA 3B01A 4ISQA 1BLAA 2OUJA 4IY9A 2I1BA 3WG1A 1PZZA 5DUUA 2P3JA 4ZOTA 1FMMS 1HKDA 1IOBA 2KKIA 4XFUA 4Y22A 2A3WA 4FPGA 5JMCA 2ARBA 4L4HA 1YXWA 2WLQA 1DHKB 3IMNA 3MW2A 2DREA 4XDQA 2W08A 1G9AA 1A3KA 5IK4A 1G82A 1LHNA 4YW2A 2Q5TA 1CVSA 3BA5A 1WBAA 1DZDA 1URXA 1I3HA 3O4AA 3RRDA 1GLHA 1LECA 2NP0A 1IKQA 1BZWA 5IK7A 1SLAA 4P9WA 4M3CF 4OEGA 1N3PA 2Y9WC 3AZZA 1W6OB 2P37A 2ZMLA 5HPZA 1FMZA 1YF8B 1PUUB 1D0HA 3TC2A 3W9TA 1QNWA 2VW0A 1S0LA 1W6QA 2E4MA 4P9YA 3A0KA 1LOFC 3OPZA 2WT0A 3WHUA 3BRFA 4I8MA 2ZGPA 1EPWA 1Y7BA 4YFZA 1S0EA 1IS3A 5EYYA 4QKRA 1SR4A 3FJCA 5BQUC 4GOYA 3NBNA 4BM8A 1HCEA 4USOA 2GNTA 3ZPYA 1TIEA 2ZGOA 3PVNA 1HDKA 4YGBA 3M1HA 3HSMA 1MR5A 1JT4A 2MC2A 3ZXGA 3T8SA 1Q1UA 5JDBA 2C9AA 4HA2A 1R8NA 4UW3A 4CTEA 4W65A 1S0IA 1WW4A 2BEBA 4ZA3B 41BIA 1PWAA 1SACA 3SNVA 3AJZA 3WG3A 2CNAA 2DTWA 3CA5A 2ARXA 3CNAA 3FJKA 2H0BA 2D23A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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