3FXUA

Crystal structure of tsar in complex with its effector p-toluenesulfonate
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
296
structure length
296
Chain Sequence
MLKLQTLQALICIEEVGSLRAAAQLLHLSQPALSAAIQQLEDELKAPLLVRTKRGVSLTSFGQAFMKHARLIVTESRRAQEEIGQLRGRWEGHITFAASPAIALAALPLALASFAREFPDVTVNVRDGMYPAVSPQLRDGTLDFALTAAHKHDIDTDLEAQPLYVSDVVIVGQRQHPMANATRLAELQECRWAFSSAPRGPGAIIRNAFARYGLPEPKLGLVCESFLALPGVVAHSDLLTTMPRTLYERNAFKDQLCSIPLQDALPNPTIYVLRRHDLPVTPAAAGLIRWIQHHAL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transcription regulator
molecule keywords LysR type regulator of tsaMBCD
publication title Structural studies on the full-length LysR-type regulator TsaR from Comamonas testosteroni T-2 reveal a novel open conformation of the tetrameric LTTR fold
pubmed doi rcsb
source organism Comamonas testosteroni
total genus 90
structure length 296
sequence length 296
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-01-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00126 HTH_1 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family
A PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain 3fxuA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fxuA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fxuA03
3TKYA 4H6DA 3LSFB 4NWCA 1ON2A 4PFUA 3DPTA 2CQKA 2V25A 1QVSA 1SVXB 2LKPA 1MDMA 1TT1A 5JTYB 3B6WA 1BI0A 1LJ9A 3OOAA 5H8FA 3ZP5A 5F7VA 1OKRA 4KR5A 1RNLA 3FV2A 4MFIA 1NNPA 1URGA 4TV7A 4E70A 3HTSB 3TCFA 5ICQA 1WQ2A 3PPOA 3K2ZA 2WKYA 5J8CA 3VFZA 3D0SA 5CBRA 1AL3A 1IIWA 1GV8A 4QF9A 3WE2A 4OWDA 4F1UA 2DSFA 3SZPA 4I01A 1PB7A 1YW7A 4F3PA 1YYVA 1AH5A 3WTXC 3L6GA 4HOBA 3BZ6A 3EHSA 1B7ZA 1MPCA 2QMXA 1OLAA 1HSTA 1EZOA 1XVYA 1I6QA 3T0YA 3WE3A 2F6PA 3J80Z 3IL1B 3N94A 5EHMA 4G9YA 4QSEA 1OPCA 4EMSA 1G3YA 5CVRA 3Q29A 2ONRA 4MHGA 3GBBA 3U94A 3V7SA 5KCJA 3EHUA 1JGSA 2CG4A 3UGWA 1P1UA 3N5LA 2AS5F 2DW4A 1OVTA 1JVXA 4X48A 4H8IA 1JNFA 3VXBA 2CO5A 1BN5A 3ZMZA 4KIFA 4R6KA 2Z8DA 1BI1A 2Y7RA 4JB7A 2P5KA 3F8NA 3EYIA 4LLNA 2NOOA 3C1DA 1Y3NA 3KP3A 4YB7A 4XLNF 2PFBA 4P96A 3T8TA 1B5JA 3KGCA 3MUQA 1TFDA 1UHWA 2OZ6A 1N3WA 3MVXA 3ERED 2MH9A 2XX9A 4A0YA 3V8JA 5HPQA 1ZH5A 1MY2A 3I6VA 3EUHA 4ZYHA 1R5GA 1CF7A 2EB7A 1IXGA 2HAVA 2GXGA 1EH7A 1FYMA 5HLHA 3KEIA 1SQYA 4F2QA 3O6IA 4LZ5A 2GAUA 3KP4A 3OO9A 2HEOA 5E18F 3U72A 4ESBA 3K6UA 1H9GA 3U2RA 2X7PA 3JAMK 2FBHA 1K6OA 3GFIA 3P7IA 2IJLA 1HW2A 3DF8A 1MD0A 2ZCWA 4AVPA 1T39A 4YG2F 5H8NB 4F18A 3L7WA 3CUQA 1F9BA 4XTCQ 1DPPA 2XXPA 3BDDA 4KPTA 2V9VA 3LA7A 2D1VA 5HS9A 2OBGA 4ZYGA 3S9MC 3QU6A 4MQ9F 1W7PB 1R1NA 4NTLA 1B1HA 3SERA 1Y4CA 5AA4B 1CGPA 4HW8A 3SQNA 3O28A 1KYZA 3GXOA 3HRMA 4GLIA 1QNTA 3IL2A 1FTOA 4R8HA 1B58A 2CMOA 4YKPA 1PDNC 2P1SA 3H03A 4DXBA 1OMIA 2RQPA 4L18B 4KYSA 2VBXA 1S7AA 1G3TA 4M6YA 3G3JA 3QP6A 3CR9A 4HTGA 2O03A 3T5XA 3F3XA 2X26A 2L4MA 3VFJA 2STTA 5FO5A 3ZMDA 4I0AA 3PMXA 2UYFA 4KIBA 3H6TA 2UXNA 2EFQA 4K3FA 5JFRA 2Y7KA 4A0ZA 3H4ZA 4XBFA 3JTHA 5I2KA 2LNBA 4OFJA 4U88A 4HA8A 4PFYA 5I56B 2HOEA 3SEUA 3GZ5A 2O69A 3FASA 5ICFA 5D6FA 1YFHA 3IK6B 2QQAA 4A12A 1PBPA 4OTEA 1OYYA 3Q26A 3TDZC 2O1LA 3CFXA 3N6UA 3G73A 3R6UA 1TNTA 5LGUA 1BIBA 2QWWA 3VODA 4UA8A 4XIGQ 1Y3PA 1LDJA 4YB5A 3V8XB 2O61A 1I6AA 2XXYA 3EQLF 2F7AA 4XKPA 4G7HF 3C7JA 2R7FA 5AA2B 3C3WA 3VE1B 1FP1D 3I64A 4N9IA 4G7OF 2W7YA 2IP2A 3M8FA 1B1XA 4C1UA 4M9SA 1K78A 1G3SA 5CM6A 1D3YA 1IXHA 3DELB 5ITPA 3EHTA 2YR2A 3E5QA 2F2EA 4FJPA 1R6ZA 4F31B 1P2FA 5JTYA 3KBRA 1UTHB 3FATA 5DUKA 4JQFA 2O1MA 4EJVA 1AOYA 2XXTA 1J2XA 1HBXG 5AA2D 3E9XA 1ZG5A 3JW4A 3MCZA 4LB6B 3MZHA 3WG9A 3E6MA 3KJ7A 3EPEA 1HSLA 2B3BA 4IO2A 4KCDA 4BDOA 2OJTA 2OQRA 3V8LA 5DEQA 2Q88A 3QK6A 4FT8A 3GX4X 2QENA 5BQTA 3MWBA 3L6HA 3QYTA 4UXNA 4HQMA 3S9EA 1H43A 3W6KB 4HX7A 3T22A 2BYVE 4U7BA 4ZEFA 1B9JA 2JT1A 1USYE 2HFHA 1GVJA 3F6VA 3O9PA 2VT3A 2Y7WA 3CG1A 4IRHA 1ZRFA 2P7CB 4H67A 1B5HA 2I48A 3K0VA 1ZLJA 2RVCA 2FQ3A 3ZQ7A 3QXMA 4ZZLA 1PP7U 5LGTA 2P8TA 2OQGA 1HW1A 3JTGA 4M74A 3FIRA 4ZZEA 5FTHA 3I58A 4E0XA 1GR2A 3N6TA 5IT9Z 4UVBA 5DYMA 5H8HB 1UQWA 2NXOA 4DZ1A 2X0LA 3MAMA 4QHQA 3EQ1A 2V84A 3LBSA 1NFTA 3F8BA 1D4NA 3LAJA 1B0HA 3BKIB 3J80K 3UP9A 3ZSFA 3ULQB 3HRUA 2HWVA 3MVWA 5JR3A 3R0AA 1YTYA 2FXAA 5DDGA 5HLIA 3UA8A 5TRDA 1T98A 4AWXB 3QSLA 4LQ5A 1NNFA 2RV8A 1IW7F 3BOQA 3TCHA 3H3GA 3IOVA 2ZXJA 4AIHA 4M72A 3E5UA 4O5VA 2IA4A 4ND9A 4F3BA 1Y9UA 4JSDA 4RGRA 3KOSA 3OO6A 3IKTA 1MXVA 5IAIA 5JK4A 4OMZA 1FLIA 1Z7UA 3S9LC 4PGHA 1SD6A 2FEZA 3R6SA 2ELHA 3PV0E 3IORA 4PCQA 3U1DA 5D4RA 1EH8A 5L9OA 1PEBA 1T0KA 4BHBA 4RYAA 5J6XA 2D45A 2OZZA 4XKQA 1Y4TA 1TQPA 1QULA 4I0BA 1GTKA 1G6NA 2XX8A 1MXYA 2XIGA 3T1BA 1BOAA 4ZS9A 2O3FA 1YQAA 3ML6A 1KQ0A 4HW0A 3DM0A 3E97A 1W7PA 1F5TA 2VGQA 2ZNUA 1H76A 2OWSA 5LBQA 3U8QA 1USSA 5CVJA 2ESNA 2AIXA 1O3QA 1XMAA 1B05A 2XAFA 2FE3A 1Y20A 1SMTA 1FTJA 4GVOA 2W57A 4CHUA 4QLCU 3Q9VA 4KFCA 3OENA 3HV1A 2DWAA 2QL3A 3MPLA 4HBLA 1R22A 4Y17A 1KU7A 4LVQA 2Z8EA 2HQ0A 4LQ2A 4Q47A 4YU0A 5A2QZ 1SW5A 1B6AA 3QU3A 4KYEA 2RC9A 2KJCA 3RDIA 5CI5A 2JSCA 1OQHA 2XAHA 4G2ZA 4P5OA 2MA3A 1ZTYA 3NEUA 4PZJA 3CVGA 3TKDA 4ELOA 4FIMA 2DQRA 2M30A 4G6QA 4EDPA 1SDXA 3LSLA 2XUBA 3FXQA 3GVAA 3KLOA 3TO7A 3G3FA 4OYVA 1J7KA 2QVOA 4BLAA 4NF8B 4F1YA 2RC8A 4NB5A 4WXHA 5F1RA 4QRZA 1A99A 3LQRA 3KCCA 3FGSA 1MH4A 2XASA 2I49A 3PUVE 4YFXF 1S9TA 1AWCA 5JEIA 5FTIA 1TW3A 3PPQA 5HBCA 2DYXA 4P11A 1B3LA 1HKTA 4ESJA 4KN4X 3KP6A 1T0FA 4DXCA 4EVIA 3P9CA 3RLFE 3FJMA 2L3DA 4ENNA 1B9MA 4L5IA 3MFKA 4KDPA 4YZZA 5CYVA 1IN8A 5L8DA 3E6CC 5F1QA 1U78A 2Q9TA 3MQ9A 5ERIA 4U7DA 3DKWA 3B6QA 2H5YA 4ZEBA 2L54A 2ISZA 1Y1MA 2QS4A 2OK2A 1MM7A 2KLFA 4H0EA 4BQAA 4U2RA 4IHSA 1UTHA 5TPAA 4BHCA 1ZGJA 1LQ1A 3RKYA 3CSGA 1J5YA 4DNCA 4LB5A 3E6DA 4OHNA 5BWJA 1HKQA 4OIRF 1B1BA 1Q35A 4KUMA 1KU2A 1JEVA 3G3KA 5A5XB 2BJJX 4E0WA 2XKPA 2NNNA 1O3SA 3U93A 4ETSA 3FXUA 1XSXA 4NF4B 1LCTA 1QKAA 4RAYA 3PD9A 4GIZA 1D5VA 3RPUA 5B70A 4ESFA 2Y0MA 3WGHA 2BGCA 2MBFA 3OO7A 3HOTA 1V3FA 3H6WA 2H94A 3T93B 4LATA 1MQGA 2FBKA 4KNYA 3VVDA 3Q5FA 4GO1A 3TO6A 1KU3A 4RPOA 2A5SA 1FBQA 4GXOA 2XROA 1FTMA 4IRIA 1HSEA 4U4SA 1FQFA 4AB6A 2R7DA 1LEBA 1RIOH 4RY1A 5E1ZB 3RYPA 5FHMA 4IGRA 1Z6TA 4XLPF 1IXIA 5AIQA 3VV5A 2G7HA 1R58A 2F5DA 4WXDA 4XSXF 4F7ZA 4R75A 3D4GA 4EJOA 3CI8A 1FQBA 1LSTA 3LC8A 4IO4A 4X1DA 1NMUA 2FNAA 3NQOA 1G4DA 1FSHA 1XB4A 3O2PE 4HYEA 3F22A 2EJRA 4I09A 1XSVA 3LA3A 1AIVA 2DWJA 3O6GA 1VE4A 1B5IA 2I0CA 1MZBA 2JPBA 3MZYA 3T8RA 4QFLA 3WGIA 4YKIA 2RCAA 4BH9A 5AONA 1Y1ZA 1J9IA 4WEPA 2M87A 2OAZA 1ZGAA 2V3TA 1FYLA 1LFHA 1LB8A 2P5VA 5H20A 1LBCA 4I8CA 4ENMA 1VFEA 1GGGA 4GFRA 5TU0A 5IT9K 2JTVA 1QQIA 1D9YA 4B8XA 2I4CA 4RPNA 1BLFA 4EQBA 4U1OA 1UB9A 4ZZAA 4U0YA 4BDMA 3ABUA 3G3ZA 5H8QB 2UXXA 1SI1A 4LG0B 1XT8A 2RC4A 1P1QA 4CZZA 2JRTA 1U5TB 4IO3A 4F22A 1S8NA 3AAFA 2GHAA 2ZMBA 1JW1A 4ECFA 2A68F 1MJ9A 1J1NA 2A5TA 4QFNA 2JZYA 1LLSA 4OEUA 1L3LA 1B3GA 4YIFA 4BYYA 5L9MA 3BWGA 1RUOA 2X4HA 3I59A 3K69A 1DUXC 5IT3A 1FQAA 3FUZA 4Q5TA 4A5MA 3DP7A 4F19A 1IN6A 2VOOA 1M5DA 2FMYA 1MKMA 1NKXA 4FORA 3BPXA 3HPIA 1MJAA 2DO7A 3FVGA 3G3IA 3V5AA 4R79A 4TLMB 3CFZA 4JWOA 5DV5A 4WXJA 2KIFA 4A5NA 4HF2A 3MPKA 2LDUA 1I1SA 3LWFA 4Y13A 2QLZA 4OFLA 3QUJA 4KIGA 1O63A 5LRRA 2VN2A 3WAEA 1R23A 1XGNA 5TP9B 4LMYA 1A40A 3GW2A 1VFDA 4I98B 1OLCA 4OXVA 2VONA 2ZMEB 3A09A 3N97A 3TO9A 4H0WA 4CXFA 2EK5A 4OIQF 4LONB 4F39A 5I57B 1OIBA 1DPEA 1AMFA 4H65A 2O6AA 4G8NA 5FHOA 4NF6B 4EQ9A 4KT5C 3L2CA 2J5OA 5LHGA 2HZLA 5A2QK 2DBBA 2HZTA 4EM1A 3I54A 1REPC 2AL5A 3UK4A 2NVUB 1U5TC 2QS2A 4H1XA 2P6SA 5DD8A 1SD5A 5CVUA 2E1NA 4LK1F 1SW1A 2PT2A 5E17F 1G3WA 3KJTA 4IRGA 3TQNA 3U9GA 1B52A 4G7ZF 4KMFA 3MQ0A 1DOTA 1QGPA 4HV6A 3TQLA 3WTYC 3JV9A 4IO5A 3HHFA 5I2NA 3G3HA 1W5SA 3K1PA 3ELKA 1FOKA 1K79A 1R00A 1KGSA 1N76A 4ELRA 2Y7IA 3GLXA 3TMGA 5ICEA 5CMBA 3LAPA 2Y75A 2YPNA 2Y7PA 4MLVA 4ZEKA 2YPRA 4ZECA 4ESWA 4UUVA 1A54A 4MTEA 3I53A 4ZE9A 1N7XA 3IC7A 1VR5A 4L9VA 4HDUA 3W9WA 1WDNA 4F29A 3T9HB 3R26A 2E7XA 3RN8A 2AL4A 1MDQA 3RTWB 2A07F 2Z22A 2RDPA 3KSXA 3O97A 1HW5A 1UTBB 2XXQA 5F6FA 1B32A 4DIGA 3KZYA 1LFGA 3TDUC 3FV1A 3PPRA 1US5A 1IXCA 3CUOA 2XVCA 2RC7A 4BHPA 3COAC 2Z33A 4HS7A 3VB2A 1LB9A 2QS3A 4CDGA 1FY7A 3RPQA 4WWCA 1ZREA 4EUOA 2Q8JA 2HEUA 3TDJA 4N07A 5L3CA 1XC1A 2RNJA 1IF1A 2PVUA 2CFXA 3C35A 1BIAA 4MGRA 5KK1A 3TYHA 1YG2A 3HSEA 4G68B 3TGNA 1N0TA 4EXKA 4H5FA 2HR3A 4EJUA 1F4KA 1B4ZA 5ILUA 4NF5A 3TTRA 2GQQA 2KIMA 3HTUA 3MEXA 1FBUA 5FB2A 2DK5A 1B3HA 4BDLA 2XRNA 3FMQA 3SFZA 2FBIA 1STZA 4GXSB 5E1WA 4RA1A 2IVMA 4MEYF 1FSEA 3PQKA 3QAHA 5K5OA 2H4IA 1IN7A 4O3AA 3G7WA 5L3DA 1PBQA 2PLYA 3ZPLA 3OSRA 3T9XB 2D5WA 2VOPA 2ZO4A 1ZMGA 5H6QA 3FMSA 1YPNA 4HCWA 3NRVA 3GLBA 1A04A 3WU0A 4CO8A 4U22A 1Y0UA 5E8IA 1RYOA 4GD5A 1UIVA 4ASNA 2GZWA 1O64A 3SZTA 1I6BA 1HXDA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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