3FZPA

Crystal structure of pyk2 complexed with atpgs
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
274
structure length
259
Chain Sequence
GIAREDVVLNRILGEGFFGEVYEGVYTNHKGEKINVAVKTCKKDCTLDNKEKFMSEAVIMKNLDHPHIVKLIGIIEEEPTWIIMELYPYGELGHYLERNKNSLKVLTLVLYSLQICKAMAYLESINCVHRDIAVRNILVASPECVKLGDFGTRLPIKWMSPESINFRRFTTASDVWMFAVCMWEILSFGKQPFFWLENKDVIGVLEKGDRLPKPDLCPPVLYTLMTRCWDYDPSDRPRFTELVCSLSDVYQMEKDIAME
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
molecule keywords Protein tyrosine kinase 2 beta
publication title Structural characterization of proline-rich tyrosine kinase 2 (PYK2) reveals a unique (DFG-out) conformation and enables inhibitor design.
pubmed doi rcsb
total genus 78
structure length 259
sequence length 274
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2009-01-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3fzpA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3fzpA01
3ELJA 3IS5A 3Q53A 2XMYA 2BPMA 3BU5A 3ZRMA 4AX8A 3TXOA 3WZJA 4QPMA 4XBRA 4AS0A 3P7CA 4UYNA 3V5WA 2RL5A 4F1OA 2E9OA 4IX4A 3ID6C 2EB3A 4YZ9A 3FWQA 3I0QA 4J8MA 4UMUA 3D15A 3OXTA 4F0GA 2I7QA 5KMJA 4IC8A 5DT4A 2JDTA 2BRMA 2CPKE 2PY3A 3OT3A 3UNZA 3MPAA 4C0TA 3CGOA 5BUIA 5GZAA 2ZDTA 4KBKA 4MXXA 3ZTXA 4EOKA 4PTCA 4EOLA 4NTTA 1PYEA 3R71A 2ZMCA 2G2FA 2WKMA 2FA2A 4N4SA 4YZMA 4V01A 2XVDA 3FZTA 4IAAA 4BVUA 2QOBA 4NKAA 5AUXA 4D2WA 4DINA 5L6PA 4GKHA 2IW8A 4BKZA 1W7HA 4O6LA 4IDVA 4A9SA 5DT3A 2XIKA 4D28A 4BCHA 4G3FA 4YPDA 3MFUA 4ZP5A 2WIHA 3TV4A 2HZIA 3E87A 4AE6A 2DWBA 3GU7A 4PL3A 3V6RA 4CFNA 4HVGA 2BAKA 1CKPA 3MWUA 4I41A 5FM3A 4ZY6A 1Y91A 3Q9XA 1SNXA 5HO6A 2VO7A 3QGWA 5CANA 4DG2E 4O0VA 4U43A 4UEUA 4EH6A 3RHKA 2JKKA 5HLWA 4FKWA 2WTJA 4OGRA 3OY3A 5CEIA 3F3TA 3AD6A 5AFVA 1OIYA 4G34A 2IZTA 4I4EA 2W9FB 4I94A 3QCXA 4DBNA 3SXFA 5E9EA 2W5HA 4I0RA 2VV9A 3RZBA 3W55A 4L9IA 2HOGA 3WYYA 3W2PA 2ITQA 5I9XA 4O1OA 2PU8A 1MUOA 3ORZA 3PY3A 3ALNA 2X6EA 4YZCA 3UO4A 4KIOA 2RFEA 3CQWA 4AWIA 3GC9A 4LM5A 1M52A 3HRFA 5L6OA 1Q4LA 4ZTMA 4G3CA 5T68A 4S30A 2Z2WA 2QR7A 3NLBA 4E3CA 1DI8A 4U5JA 2PMOX 5BX0A 3F2AA 3QD0A 4YPSA 5HE3A 4O7LA 4C2VA 3K2LA 3RVGA 1MP8A 2IN6A 2UW5A 2VX0A 3V5JA 3GU8A 2YM3A 3Q2JA 2PYWA 3FDNA 1GIJA 4AXAA 5BVFA 4FYNA 2OGVA 5AIRA 1H01A 2AUHA 2GNGA 3C9WA 3LPBA 4L53A 5H2UA 3R1SA 2WTIA 4E4LA 4E6CA 5K4JA 1YXVA 3RCDA 2XB7A 2GU8A 5DR6A 4LGDA 4C57A 3KQ7A 5AIKA 3C13A 3OTUA 3IW6A 3LMHA 2RSVA 3E8DA 3LOKA 3FY0A 3V51A 4XP0A 1APME 4M67A 4RIXA 3KL8A 4XUFA 3TKUA 3DCVA 3RM7A 3AD4A 3MPTA 2NRUA 3EIDA 3UIXA 4EH4A 5DRBA 5D41A 5ETCA 1GNGA 2A0CX 4G5JA 2JEDA 3MH0A 4A9UA 2XKFA 4RJ5A 3FUPA 2XK7A 2YCSA 3QTSA 4I5CA 5HG9A 3TI1A 4BZOA 5A6OA 2X4ZA 3QTUA 4FODA 4PDSA 2QOKA 4FKQA 4XV9A 5C9CA 2UZDA 4XOZA 3C51A 1J7IA 4IAKA 2XKCA 5M08A 4JQ7A 4EYJA 3CTJA 5AX9A 3A7HA 4DH5A 5HOAA 2C3IB 5EKOA 3PXYA 4NCTA 2C6EA 4L7SA 3QTXA 3KCFA 5CXHA 4W4WA 4C4JA 2JDVA 3ZO2A 4EK8A 4BDAA 4PQNA 4I3ZA 3F3WA 3D5VA 4FKSA 4QMUA 5KZ0A 1STCE 4FT0A 1L3RE 2ZJWA 4Z9LA 4ZSAA 3ZRKA 4UN0C 3QQKA 1TQMA 3HMMA 2B4SB 3NIZA 4MBIA 3OEZA 4ZJJA 4C61A 3SD0A 3D4QA 3O7LB 4O0RA 3R7GA 5EYDA 2X2MA 4ZIMA 4F1TA 3BGQA 2XBJA 3DK6A 3LCKA 1YHWA 3OW4A 5K5NA 5CLPA 1H28A 3DT1A 3MH2A 4ASZA 3PVGA 1LEWA 4AA5A 5EFQA 4C4EA 4QP4A 4AOIA 2PPQA 3RP9A 2X8DA 4BYIA 2BHHA 3MV5A 3Q4UA 3QALE 3R8PA 2R3LA 3LFFA 4JR3A 4EC9A 3RPVA 4G1WA 4D0XA 4BFMA 4EEVA 4H3PA 4O0YA 2W99B 3HNGA 3VS7A 4DEDA 5M09A 4LUDA 4OTRA 3HKOA 3GC0A 3KXZA 4RMZA 1ZARA 4EUUA 5I5ZA 3NUPA 3KULB 5CT7A 3B8RA 3LAUA 4MNEB 4TT7A 2YIYA 4Q5EA 5D12A 4IZ7A 1RQQA 3O8PA 2OIDA 4DGOA 4RJ8A 5CEKA 3OUNB 3AGLA 3PRFA 2JFLA 2XYNA 3KF4A 3UMXA 5J5SA 4JLCA 1S9JA 4OTHA 3E7OA 3FPMA 2WMAA 2PUUA 3UG2A 3LCOA 4O91A 3WARA 2OU7A 2BFXA 3LXNA 3ZFXA 4I6BA 5FBNC 3V3VA 4LI5A 4MQ1A 4KIPA 3O51A 1UWHA 2JDRA 1FMKA 4LOPA 4NWMA 2JBOA 4B8MA 5FBOA 4YTFA 3FY2A 4QTEA 2VO6A 3RGFA 3MPMA 5E7RA 3ET7A 5AV4A 3UJGA 3ENHA 4PMTA 1GZKA 5BVWA 1PW2A 3RWQA 2YDIA 4B4LA 3VF9A 3VS5A 2F57A 4IB1A 1VEBA 1OM1A 1PYXA 3IECA 3Q9WA 2Y4IB 2FGIA 5HESA 1J7LA 5IMXA 1Q8YA 4BGQA 2X7GA 2RF9A 2XNOA 3C7QA 4ZTLA 1P2AA 4XYFA 4CZTA 4EZ5A 3LM5A 4O82A 3D7TB 4JBOA 4XG8A 1FQ1B 4DFNA 4DAWA 3PWDA 4ZS0A 3F2RA 2BR1A 5EYCA 2VWBA 4O7TA 3ORLA 3PJ2A 3CTHA 4JBQA 2QR8A 3MGYA 4ALVA 3FL5A 3WOWA 3O7LD 3QTQA 5CSXA 3VVHA 2FO0A 3T9TA 4QMWA 5CASA 2PVJA 3ZLSA 2GNIA 1IAJA 3IK3A 1GY3A 3FZSA 4J96A 1IAHA 3EJ1A 4X2JA 4EH8A 5J9LA 4C35A 3ZYAA 2GQRA 4IX6A 5KMMA 4KNBA 4C4IA 3ZC5A 5KUPA 4FTCA 5FDPA 4DFYA 3O0GA 1YW2A 1JAMA 2ETRA 3D83A 2ZM3A 3RAKA 4YJUA 3VJNA 3DTCA 3OC1A 3PG3A 4FT3A 3NVMB 4FTNA 4Y5HA 4ZZNA 3KEXA 4QMXA 5AWMA 3ZXTA 3OT8A 4UXLA 4XG3A 1OIQA 2QOOA 4YNEA 4BL1A 2UZEA 2X2LA 3EYGA 4L6QA 2EUFB 2F4JA 1XJDA 3QKKA 4QTAA 3CKWA 4IEBA 2QO9A 2J5EA 3MVHA 4IANA 4FZDB 5FUTA 4D9UA 3NZ0A 3W10A 5A14A 4ERKA 4FK6A 3QGYA 3LFCA 3EWHA 2ZDUA 4ITHA 3OCTA 3RAIA 1AQ1A 1P4FA 2UZWE 5EW9A 3QHWA 5A3XA 4BDJA 1LP4A 3L9LA 2QCSA 2YFXA 3CPBA 2ZV2A 2YITA 4FGBA 5DOSA 2C0OA 2C6TA 3FLSA 2XK6A 3COIA 3L8PA 3VQHA 4EORA 3EQBA 3KCKA 3PXZA 5F4NA 2E9NA 4F0FA 5IZFA 4FZAB 3PVUA 4PDYA 3LIJA 5GJFA 5DGZA 5CQWA 4FSRA 2XRWA 3PA3A 2GHLA 3PPJA 4LRJA 1UVRA 2YJSA 1JBPE 4O1PA 5FEEA 4FVRA 2GTNA 2O8YA 3AC4A 3MTLA 3HDMA 2UUEA 3PXQA 4AZFA 4F7JA 1Y6AA 3QTRA 1P14A 3WIKA 2WMTA 4IB5A 4D58A 3ZFMA 3NUYA 4J53A 3FYKX 2NRYA 5TF9A 3QQFA 3RPRA 5CAUA 4WBOA 3VW6A 5JFVA 1SMHA 3OOMA 4USDA 3S4QA 3FMDA 4BTJA 1PXKA 2PTKA 2XKEA 3VUMA 3A62A 1WBNA 5DFPA 3R7UA 3C4ZA 3VS3A 1PMEA 2BUJA 4U79A 3ROCA 3DXNA 4NFNA 2Q0BA 4D2TA 5IA0A 4GG5A 4XRJA 2IZSA 4FSWA 4FTAA 3FKOA 3MA6A 3C4CA 3FZOA 3HMOA 1YQJA 4M14A 5FWKK 4WNKA 1OL6A 4FEVA 2F7ZE 3C4FA 4FVPA 4DG0E 4DFXE 3FI8A 4YJVA 4BN1A 3F61A 2WTDA 4G17A 5D7AA 3TT0A 3PY0A 3WYXA 2XNBA 4U81A 4EHVA 3CGFA 1Q62A 5JFSA 4LMNA 2C6IA 4H05A 3Q4ZA 2HXLA 4L68A 4C02A 4TYHB 2C30A 4QYYA 5EI8A 3TJCA 3UC4A 5CQUA 4KS7A 1UU8A 1M7QA 5AUUA 5JKGA 4R3CA 2ITOA 3CE3A 3Q32A 4OTWA 4LL0A 1TQPA 4I24A 5HX8A 3TDVA 1WVXA 2F49A 2NO3A 4MNFA 4ASXA 4MX9A 4WNPA 4IWDA 4RJ6A 3CLYA 3AQVA 3CXWA 3BU3A 2OICA 3DPKA 2HW7A 3O2MA 4AOJA 4RC4A 2WTKC 5BYYA 4EZ7A 4C2WA 4BHZA 3DAEA 3FC1X 2EVAA 3KA0A 4O6EA 3UIBA 5AAEA 5GZ8A 5I3RA 4AP7A 2VWUA 5J1WA 4L3LA 3A7JA 3Q6UA 5KNJA 3O8UA 1R3CA 1DI9A 4PUZA 5I9UA 5JT2A 4EHZA 4IJ9A 2VTAA 4I23A 3UPZA 4HCUA 4HOKA 2C5VA 2VWYA 4F0IA 1Q8ZA 3KXMA 2B9HA 2J0JA 2YN8A 2XIZA 4E6DA 2WELA 5HX6A 2HWOA 4WSYA 4QP1A 3EFLA 4NSTA 3BHHA 3NCGA 3OY1A 2UW3A 3HP2A 3R04A 3V8TA 3QRUA 5IMEA 2PVMA 1UU3A 4PF4A 3UO6A 4BKJA 5C8NA 5AP2A 4X3JA 4O7YA 4O0UA 4ZTHA 3R30A 1SM2A 2PK9A 4F64A 2E9UA 1VR2A 3R22A 1PMNA 2B52A 3U54A 3Q96A 4BWXA 3P5KA 3PXKA 3SQQA 4OTQA 3S95A 3ULIA 4EWQA 5HU3A 1T46A 3V5TA 5HTCA 4RSSA 2ERZE 2OF2A 5IUHA 4PPBA 5A4LA 1IA9A 3NGAA 5LVMA 4IVCA 2FSTX 4MWIA 4U80A 5KCVA 3JY0A 4JRVA 1SVGA 3VS0A 1PXPA 4BCKA 3HAVA 4G31A 4FUYA 4IM2A 5AP0A 3NYOA 4GFOA 2VTIA 4QMOA 1TKIA 4XG9A 4BCFA 2CJMA 2J4ZA 1FVRA 2PSQA 4RA5A 3S1HA 4OAVB 2XKDA 5HBEA 1V1KA 4YO4A 1UNHA 2B55A 3MY0A 3K3IA 2OLCA 3KMMA 3QQLA 4NFMA 4CMOA 3MVJA 4JNWA 3QLGA 4NJDA 4EOQA 4AA4A 3B8QA 3DXPA 4QT1A 4KBCA 4FEXA 1JPAA 4BIEA 4GT3A 3F82A 3O71A 4LOQA 4WRSA 3HX4A 5FD2A 3R9RA 2JFMA 3NMUF 3FSFA 4NL0A 1CM8A 5HIBA 2B53A 1ZMWA 4OLIA 4W8EA 4EJNA 4P4CA 2OZAA 4P90A 3E62A 4MVFA 4W4XA 5CX9A 3G15A 1DAYA 4UY9A 5ETAA 3DAJA 1T45A 5I9ZA 2X7FA 4FV5A 4HNIA 5ANJA 5HBHA 4QP8A 4EOPA 4N6YA 4D5HA 2PE0A 3I7BA 3KF7A 2YA9A 3MFTA 2W1HA 5TOZA 3FQEA 2R64A 2FVDA 2R9SA 4EKKA 3NRMA 2VWIA 4J97A 2OIQA 2C5NA 3LCSA 3UNJA 2LGCA 4IVBA 4U45A 5JZJA 2R0IA 5M55A 3ZONA 2VX3A 3PVBA 3UC3A 4MCVA 3RK7A 4GEOA 1V0PA 3MIYA 5E4HA 4ZZMA 4DCAA 3ZM9A 3Q4CA 4M12A 4E93A 4G6OA 4GUEA 5EK7A 4C8BA 3NW5A 2QG5A 4NZWB 1H1QA 1ZYLA 4FEQA 2BVAA 4JL9A 4V0GB 5F9EA 4WSQA 4HCTA 2O0UA 4CSVA 3ZBFA 3V01A 1H0WA 3VBTA 3OUKA 4BRXA 2DS1A 3MDYA 5AUZA 2R3HA 4HW7A 1JKTA 1MQBA 5EOLA 2BCJA 4L44A 3SV0A 2IWIA 3OROA 3W16A 2XF0A 5E91A 2VTSA 4I21A 5JEBA 4WG3A 5HVKA 2WTCA 3KXXA 4PTGA 2JAMA 3BBWA 2Q83A 3SC1A 2X8IA 3BGPA 4HZRA 4XBUA 4D1ZA 5DR2A 4I0SA 1NW1A 1OZ1A 4NH1A 4O7SA 4CV8A 3O8TA 5I4NA 3COHA 5L8LA 4O7VA 2QOHA 4QMTA 4FTTA 2DUVA 2XZSA 4FVQA 2E9PA 3F88A 3FLWA 2GFCA 3V5QA 4F1MA 3LFEA 4WG5A 4YP8A 3OFMA 4B7TA 2OFVA 4QYGA 5KMKA 3RALA 4O7WA 2BRNA 4FOBA 1RW8A 3CD3A 5AP5A 3G33A 5HG5A 3VBVA 4BBEA 3RAWA 1EH4A 4ALUA 5IQAA 4M69A 5C03A 1QCFA 2VTPA 3GFEA 1KUTA 4NKSA 1H1PA 3DJ7A 4FL1A 3V5LA 3OXIA 5L2WA 4FV7A 4RJ4A 3IPHA 4R1YA 4XHKB 5DWRA 4A4LA 4D5KA 5J9YA 3QQJA 4JBPA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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