3G6MA

Crystal structure of a chitinase crchi1 from the nematophagous fungus clonostachys rosea in complex with a potent inhibitor caffeine
Total Genus 144
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
144
sequence length
388
structure length
388
Chain Sequence
TGSINAVYFTNWGIYGRNFQPADLQASKILHVLYSFMNLRVDGTVYSGDTYADLEKHYSDDSWNDIGTNAYGCVKQLYKLKKANRSLKIMLSIGGWTWSTNFPAAASTEATRATFAKTAVEFMKDWGFDGIDVDWEYPASETDANNMVLLLQRVRQELDSYSATYANGYHFQLSIAAPAGPSHYNVLKLAQLGSVLDNINLMAYDYAGSWDSVSGHQTNLYPSTSNPSSTPFSTKAAVDAYIAAGVPASKIILGMPIYGRAFVGTDGPGKPYSTIGEGSWESGIWDYKVLPKAGATVITDSAAGATYSYDSSSRTMISYDTPDMVRTKVSYAKGLGLGGSMFWEASADKTGSDSLIGTALSSMGSHDSTQNCLSYPNSKFDNIKNSLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords Chitinase
publication title Crystal structure and mutagenesis analysis of chitinase CrChi1 from the nematophagous fungus Clonostachys rosea in complex with the inhibitor caffeine
pubmed doi rcsb
source organism Bionectria ochroleuca
total genus 144
structure length 388
sequence length 388
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2009-02-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 3g6mA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3g6mA01
3K8KA 1UD4A 5A69A 2DSZA 2VMFA 3ZOAA 2NW0A 1HN1A 3N17A 4XX6A 1BYBA 4MNLA 5A6BD 3ARSA 2VC9A 3BAJA 2FHFA 1D3CA 4QLLA 4NZCA 5CG0A 2WANA 5F7UA 4LYQA 4PMYA 4OBRA 2VRQA 3SCNA 3CZLA 1ISVA 3I3EA 3AXHA 3W29A 4ZFMA 4AIUA 2VI0A 4CCDA 1H09A 5BRQA 1WPCA 1XCXA 3DYPA 4K68A 2FGLA 1NWUA 1RPKA 3U7BA 5BXTA 5C70A 1KCLA 3VNZA 2BFGA 2DQXA 3E1F1 4CKQA 4CN6A 1EQPA 1ISZA 1DWJM 3VO0A 1XV8A 3A4WA 1W9VA 3AS3A 3SIMA 4U5KA 4J3SA 4CU6A 2E40A 2F8QA 1HT6A 4QFUA 1E6QM 3NDZA 4DUVA 1JNDA 2CETA 1W1TA 4H7VA 1IT0A 2J7GA 1PEZA 3VGHA 4OKDA 4AWEA 4AEEA 4PTMA 2WYSA 2BVDA 3M46A 3CHFA 3VIFA 4C7GA 3VDCA 4JKLA 4Q22A 1PIFA 4UZSA 1LL4A 2ESCA 1JYWA 2XTKA 4HU0A 3IAQA 1JZ5A 3VGDA 1C90A 5E70A 2XM1A 4L4OA 1JL8A 3QOKA 1J9YA 3GNRA 4OJYA 2UY3A 1XCWA 1PX3A 5TD4A 2D24A 1BYAA 3GDBA 3WDIA 2G3IA 3VIOA 1L0PA 2CIPA 1GQLA 5IHRA 4HP5A 1N82A 1HVXA 4AZCB 2CBVA 1B0IA 2FHCA 3WUFA 1MQRA 5E6YA 3RDKA 1E6SM 4DM2A 2DT1A 3SEPA 3ZIZA 2J75A 3W26A 3EMCA 4D1IA 1V08A 1H5VA 3GH5A 1UR8A 2XVPA 1Q6EA 4M1RA 3EDDA 1YHTA 3U5YA 1JI1A 4AD4A 3L4WA 1V3KA 2O9PA 1JDDA 1J0KA 1OGGA 1R7OA 5I5RA 1ZJAA 4W8BA 3THDA 1Q6FA 1PZ3A 1QW8A 5A95A 1QI0A 3AMGA 3OZPA 4CCCA 4CVUA 2J7EA 2PWFA 1JZ4A 5A8QA 4AZBA 1J18A 1JZ6A 1O6IA 2Z1KA 5LA1A 2ZUTA 1F4AA 2YA0A 4LYRA 1J12A 3UCQA 3VD5A 1W9BM 4UQBA 1VFMA 1NP2A 1IZKA 4JKKA 4BF7A 2WMKA 4F66A 1H0GA 3FXYA 3VTRA 4HOWA 3J7HA 3K8LA 1QVBA 1HF6A 5EB8A 2Z1SA 2VZSA 2BY2A 1E3ZA 1JYXA 1EO5A 3LPFA 5A1AA 1C7TA 2W4XA 2ZX9A 1U33A 1QI5A 2X05A 4ACYA 2XJ7A 2DSKA 1CXFA 1E5NA 1U2YA 5D4YA 4KRTA 1W1VA 3ZJ7A 3CGTA 2O92A 1VEMA 5I79A 3AMCA 5HXMA 4UFIA 2WMIA 1M53A 4V28A 4U3CA 4D6IA 2FH6A 4LPCA 3SCRA 2XFYA 2PWHA 5I2UA 2XPKA 1E55A 2O9OA 4OOUA 4KWUA 7A3HA 3CH9A 4MJ4A 2BHYA 1HKIA 1E43A 1UUQA 2AOSA 3D5HA 1V6WA 5I24A 5BCAA 2YLLA 3RJXA 1G0CA 2BV9A 5E6ZA 4N42A 5EMYA 4WF7A 1V3LA 1EQCA 6CGTA 4WKHA 3DHPA 1GVYA 3WN6A 3BAXA 5CGTA 2E3ZA 1H11A 2OWWA 3WELA 3AOFA 3WUEA 5BYWA 3WMSA 2WMJA 1ZB5A 1HKJA 3GTNA 1VIWA 2VVNA 1VBRA 4UR9A 2E8ZA 1QBBA 2E9MA 1XHGA 1CXLA 3WQ4A 4AIEA 3VIPA 2PF0A 1W3HA 3AHYA 5JBFA 2BY1A 1UG6A 4D6DA 3RO8A 2CHNA 1TFVA 3MMUA 2XM2A 4MB3A 4ATWA 1BGGA 2DIJA 1KGWA 4NI3A 4CGTA 1CXEA 1E40A 3QR3A 2EXOA 3CPUA 2WKLA 3CHCA 1W9PA 2YA2A 2UY4A 4GI8A 4U5IA 4QAWA 3UEQA 3AIWA 1US2A 3GH4A 4V2XA 1MW1A 1HL8A 3NSXA 3SUWA 2ZWZA 1J0YA 1QBAA 3VILA 2ZOXA 2MANA 1DWIM 3LMYA 5EFFA 5ABEA 5IXEA 1NP0A 1UYQA 2W5FA 2IXVA 2BY3A 4UFJA 5JIWA 1MQQA 1TVNA 3W6MA 2X0HA 2WMGA 1FP8A 1ODUA 3PN8A 2J74A 7TAAA 4W5ZA 5I77A 2UY2A 1JXJA 4URIA 1V6UA 5M5DA 1VFFA 3TA9A 3ARPA 4N0RA 4HZ6A 1GOMA 2VTFA 5A6LA 3MANA 3T2OA 4CVWA 1SMAA 2XHYA 1V3IA 2GK1A 4GKLA 2EQDA 3HMCA 2WB5A 2D3NA 1UZ4A 3O2LA 1NWTA 1SFSA 3DECA 2DEPA 3W25A 3B9EA 4RL3A 2VCBA 1E4MM 4M81A 2WNWA 4J3WA 4GPNA 2WWCA 3EMZA 1HX0A 4AD1A 3VOCA 2WVVA 4MTVA 1NOUA 1CDGA 1GORA 1UD6A 2CYGA 3L4XA 1B1YA 5ABFB 1HVQA 2G3JA 4HZ7A 1B30A 4UQAA 1RP8A 3OZOA 4MDPA 1XSIA 5A6KA 2FHBA 1GHSA 1CYGA 3L4ZA 1UWQA 2RGLA 3VIJA 3WH5A 1RD6A 4JHZA 2UWFA 4PMVA 2CNCA 1J11A 1TUXA 4S3KA 2BS9A 3AIQA 3NSMA 1WZAA 3WNPA 1FH8A 1E5JA 5IFTA 1WAWA 1E15A 3TP4A 4OOZA 3PBGA 1UA7A 3A47A 3W38A 1JAEA 1S46A 4X9YA 4TVDA 4GZIA 3BLKA 3UG3A 5ABHA 1A3HA 3OLGA 2YL6A 1XRVA 1DWHM 2O9RA 4J7RA 2WHJA 2Y8KA 1UWUA 2JEPA 4YN5A 4AD2A 1Q6GA 1W1YA 3EYPA 1GQJA 1CXKA 2G3MA 1WB0A 1BYDA 1V3HA 4OIFA 3AHZA 2J78A 4TOQA 2GSJA 1EHNA 1BVNP 1BGAA 5D8WA 2EPKX 4P7QA 3OGRA 1WZMA 3B8SA 5CPQA 2JF6A 3NDYA 2WC7A 3T0BA 4C7FA 2XG9A 1CGXA 1FHDA 3ZR5A 1OINA 2J79A 2WWDA 4HA3A 2XSBA 3DYMA 4IPNB 2OSXA 1E0VA 1QNPA 5E09A 3WUBA 2GJRA 1CECA 3MSDA 1C3FA 1FOBA 2CKRA 4XZWA 1QHPA 4UFMA 2PBGA 3BMWA 2JIWA 1UWRA 1QOXA 2OYKA 4UQCA 3ZMRA 4J3VA 4GI6A 1GW1A 1EHAA 4OUEA 4R5EA 1OGSA 3N9KA 1WKYA 1CGWA 1VB9A 1UOKA 1GOOA 3K1DA 1H1NA 2DH3A 2YA1A 4HZ8A 1GJWA 2D0FA 2HISA 3GNOA 4Y7EA 3L2LA 3WDHA 5BWFA 3L4VA 1G9HA 1KWGA 1WO2A 3OGVA 2WLZA 5JUVA 4MADA 2CITA 2PC8A 5DF0A 3K4AA 4W88A 3WNNA 4P7NA 3F4VA 3MSGA 1UHVA 2VX7A 1BHGA 2J7DA 1KXTA 1PIGA 2D20A 3BH4A 4ATLA 1HJXA 4UFKA 4C7DA 3ALFA 1KGXA 1WDRA 1UQZA 2VX5A 1E6NA 1EO7A 4ACZA 2WXDM 4D6EA 2CBIA 2OWXA 4AZ6A 2WPGA 4B15A 2CCRA 2X2YA 3KWXA 4GI9A 3BAWA 3APGA 2XVNA 3AMKA 1AMYA 1CNVA 1V02E 4PMNA 3THCA 4JFSA 1JYNA 4CD8A 4HOZA 3AZRA 1YQ2A 4IISA 3FN9A 1P6WA 3L4UA 3CHEA 2QF8A 4NRSA 4CU7A 1E1FA 5I0DA 1G01A 4UZUA 3FAWA 5CQ1A 1KBBA 4JFVA 2FH8A 4MJ2A 3RIKA 4AYSA 5C71A 1C8QA 5LA2A 2VCCA 1VENA 1PZ2A 1ODZA 1TA3B 1WNOA 3CIVA 1ZS2A 3GH7A 3WEZA 4XUYA 3OGSA 4ZEPA 1XYZA 2JIEA 3VD7A 1HP5A 1ZBCA 4M29A 3ZT5A 2WSKA 2GJXA 4HMEA 5BRPA 6A3HA 2OYMA 3WL1A 3GNPA 2WHLA 5CLWA 2C7FA 4WJXA 3UR8A 3IJ9A 3HN3A 1W9XA 1SMDA 4W87A 3ZJ8A 4F9DA 3NUKA 1J0IA 3VD3A 1JIBA 1GPFA 1ECEA 3FAXA 3TONA 1BAGA 4TX8A 3TOPA 1GNXA 5LYRA 4HOXA 3CUHA 1LF1A 1TCMA 4UOJA 1GOQA 3AJ7A 2WBKA 3W6LA 3BGAA 2DT2A 1ISYA 2PWGA 1VRXA 1C7SA 2IXUA 4CUCA 4JHOA 4GINA 3CMGA 5HOSA 1MQPA 4D6GA 3NJ3A 1ZU8A 4AD3A 4W85A 3II1A 2BY0A 4AW7A 1B9ZA 3MMWA 2WLYA 2WMHA 2YDQA 1U30A 1CGYA 3WKZA 4QCFA 2B31A 3GZAA 1BLIA 2YJQA 2VVSA 4D1JA 5E0CA 1AVAA 1H41A 2DIEA 4BQ5A 1LG1A 3ZR6A 1QPKA 1AQMA 2VZUA 4H8VA 3QHNA 4D6HA 1MW3A 1JZ2A 2WZIA 5CPSA 1WZLA 3WF0A 4TXEA 3WSUA 4HPGA 5E9AA 3M07A 4UFHA 1ZBWA 5FD0A 3WH9A 3IAPA 2XVLA 4B9YA 4BQ3A 3ZM8A 4E8CA 4R27A 3WBEA 3VMNA 4M8UA 3ZJ6A 3BCFA 4GIAA 4ATDA 3IJ8A 1FP9A 3BXWA 3T08A 3WQWA 4MDOA 1GCYA 2YOCA 3PZGA 3WNMA 3AIEA 4BQ2A 4MAZA 4AZ5A 2G4FA 1HNYA 2OYLA 3LPPA 5CSYA 4U31A 5GQBA 3ZT6A 2WMIB 3VU2A 1PJ9A 3PZVA 1CIUA 4MPKA 4PRWA 2CKSA 2BXYA 1QHOA 1CWYA 3AIBA 1B3XA 1B90A 1Q6CA 1FH7A 3NSNA 2E9LA 5DMYA 4B3LA 1AQ0A 2Q8XA 3PHAA 1JYVA 4X0VA 2ZX7A 1HIZA 4PMDA 1BPLB 4XZBA 3OA5A 3SUUA 4Z2IA 5JBDA 4CD6A 1WP6A 4AC1X 1NH6A 4WSKA 1LWHA 1XSKA 1HJQA 2ZICA 3L2MA 4P8WA 1VJZA 2Y8VA 1QNQA 3WF4A 3PZTA 4HMCA 1H2JA 3VDAA 3RM4A 4H2CA 3SUTA 2ZIDA 3FY1A 2XVKA 1KXHA 2WZEA 5GNXA 4Q7NA 2XFFA 2OSWA 5D9MA 3S6TA 3RM9A 2WVTA 5AY7A 2XUCA 2IUZA 2WVUA 4MAVA 4P7RA 3VIMA 4DUWA 5GNZA 4P7OA 3WF1A 4Z2HA 5AYBA 3AYRA 3T09A 2WVSA 5FKYA 4RE2A 2EO7A 4JL2A 3GXFA 3VVGA 5HPCA 4WKAA 2E4TA 3T0DA 1RP9A 1EH9A 3K8MA 1W3LA 3AS2A 1CENA 2PWDA 1CXHA 3WQ6A 3IANA 3UERA 5LA0A 4BA0A 5I23A 3WDJA 2BVTA 3MS8A 2DGAA 3OLEA 2WK2A 5D9PA 4LX4A 2GFTA 1ZJBA 2CBJA 4UCFA 3CTTA 3ZQ9A 3AIVA 3WMCA 2ZUMA 3VKKA 3AMDA 2V38A 4Z2LA 2QHAA 3ZJKA 1J10A 3ARZA 5IDIA 2W63A 2VZTA 1V0NA 2G3NA 1D7FA 2CBUA 4WSJA 3EDJA 1C8XA 4HTYA 3GYCA 2VJXA 3SCTA 4E2OA 5A2AA 2D3LA 4RE4A 4PTWA 3TTYA 3WH7A 1EDQA 3A4XA 1K9FA 1BTCA 2VNCA 2XIBA 3O9NA 2X09A 2ZXBA 1MFVA 2XIIA 1G5AA 3AZTA 4F79A 4JFUA 1UA3A 5A6MA 3MUIA 5D9OA 1KQZA 4WKFA 1ISWA 3EDFA 4LQ1A 4YPJA 1EGZA 2WW5A 5CPTA 4AXNA 4GO8A 1BF2A 2DT0A 4W8LA 1AQHA 3N18A 4YHGA 2WZHA 3VIKA 1NM9A 2ZUSA 2E9BA 1UZ1A 3SCQA 1EXPA 1E4NA 3AFBA 4B16A 1WZKA 4HMDA 5DEZA 3GXMA 4H41A 1UKPA 3WNLA 1TG7A 1CPUA 1V6VA 1ISXA 1B3VA 1GQKA 3OLIA 1JXKA 4PCTA 4QDMA 3WNOA 3PTQA 1FFQA 5EFDA 3HJEA 1LLOA 3AICA 1E6PA 5A94A 1DWFM 2DPEA 1E72M 2JEQA 1KQYA 2NT0A 5CSUA 2D0HA 2QMKA 3PTKA 2VURA 2G8ZA 2F2HA 3WENA 2YBTA 3BAKA 2E0PA 4JZ5A 2QMJA 4FF5A 2VRKA 1C93A 4EANA 4J28A 3SUSA 1QW9A 1TZ7A 1UR4A 3B9DA 4AY1A 3VD9A 1W9UA 5I6SA 4MB5A 5JBEA 1EDGA 3ARXA 3WFLA 1V0MA 3SCUA 3WY1A 1Y7VA 3NYDA 1XH0A 4EK7A 3T0AA 4D6FA 1K9DA 1UWSA 4FK9A 1XYFA 4UTFA 2FGZA 4W86A 1WDSA 1UR1A 4D71A 4E4PA 4D6CA 1M01A 5BROA 4D72A 3U5UA 4MNJA 3PTMA 1TVPA 3RPMA 1WDPA 4DWSC 3VDBA 3POCA 1HJVA 2A3EA 2EJ1A 2XWEA 1OIMA 1PPIA 4F8XA 2WKGA 4KH2A 1KR1A 1K9EA 1GOWA 3BMVA 2VR4A 1TE1A 3AS1A 3QHOA 2QPSA 3SUVA 2PB1A 1OSEA 2GVYA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3U57 A;  4YHE A;  3WQ8 A;  2C0H A;  1PAM A;  2J7C A;  3SCO A;  5BXP A;  3QHM A;  3T2P A;  1TR1 A;  1EDT A;  1E6R A;  3WBA A;  3PZ9 A;  5FCZ A;  1QI2 A;  3VMO A;  2DDX A;  4KGJ A;  5FL0 A;  1UR9 A;  3CUG A;  2VO5 A;  4J27 A;  5JIP A;  5CZK A;  5M3W A;  3TTS A;  2V5C A;  1E70 M;  2DSW A;  5A2C A;  2OWC A;  3OLD A;  1UQY A;  4LYP A;  2VR5 A;  5I78 A;  2ZXQ A;  5A6A A;  3L4Y A;  3UG4 A;  8A3H A;  3ZST A;  3M6D A;  1JF6 A;  2QV4 A;  2XWD A;  2J25 A;  4ZXO A;  2BVY A;  4HA1 A;  1BYC A;  1EOM A;  3AQU A;  2GDU A;  4B9Z A;  5KEZ A;  2WAG A;  2OSY A;  1B2Y A;  2BHU A;  3T2Q A;  1XD0 A;  1UKT A;  3BSH A;  3IJ7 A;  2DSU A;  4QP0 A;  4Z2K A;  2WHK A;  3W81 A;  4WK9 A;  2W67 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 2VO5 A;  2O55 A;  1ZQ5 A;  1S2T A;  2V5C A;  2AGT A;  1K8Z A;  3G0X A;  2CWX A;  2Q5A A;  3AUJ A;  3GX9 A;  1GVS A;  3L4Y A;  2YFN A;  1YDV A;  5FJJ A;  3M6D A;  3NGF A;  1RQH A;  4ZOA A;  3NQ7 A;  3IVU A;  5I7G A;  1BYC A;  1EOM A;  3UZJ A;  3AQU A;  1Z42 A;  2GDU A;  3T2Q A;  1NDY A;  2QIW A;  2DSU A;  4H7C A;  4QP0 A;  4Z2K A;  3N73 A;  2WHK A;  4U4M A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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 2ESC A;  1JYW A;  2XTK A;  4HU0 A;  3IAQ A;  4DRN A;  4U85 A;  1JZ5 A;  3VGD A;  1C90 A;  5E70 A;  2XM1 A;  4L4O A;  1JL8 A;  3QOK A;  1J9Y A;  3GNR A;  4OJY A;  2UY3 A;  1XCW A;  1PX3 A;  5TD4 A;  2D24 A;  1BYA A;  3GDB A;  3WDI A;  2G3I A;  3VIO A;  1L0P A;  2CIP A;  4GIV A;  1GQL A;  5IHR A;  4HP5 A;  1N82 A;  1HVX A;  4AZC B;  2CBV A;  1B0I A;  2FHC A;  3WUF A;  1MQR A;  5E6Y A;  3RDK A;  1E6S M;  4DM2 A;  2DT1 A;  3MDY B;  3SEP A;  3ZIZ A;  2J75 A;  3W26 A;  3EMC A;  4D1I A;  2IF4 A;  1V08 A;  1H5V A;  3GH5 A;  1UR8 A;  2XVP A;  1Q6E A;  4M1R A;  3EDD A;  1YHT A;  3U5Y A;  1JI1 A;  4AD4 A;  3L4W A;  1V3K A;  2O9P A;  1JDD A;  1J0K A;  1OGG A;  1R7O A;  5I5R A;  2XP4 A;  1ZJA A;  4W8B A;  4DRM A;  3THD A;  1Q6F A;  4MSP A;  1PZ3 A;  1QW8 A;  5A95 A;  1QI0 A;  4TW7 A;  3AMG A;  3OZP A;  4CCC A;  4CVU A;  2J7E A;  2PWF A;  1JZ4 A;  4XAK A;  5A8Q A;  4AZB A;  1ZK6 A;  1J18 A;  1FKB A;  1JZ6 A;  1O6I A;  1PBK A;  2KI3 A;  2Z1K A;  5LA1 A;  2XP6 A;  2ZUT A;  1F4A A;  2YA0 A;  4LYR A;  1J12 A; 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