3GB6A

Structure of giardia fructose-1,6-biphosphate aldolase d83a mutant in complex with fructose-1,6-bisphosphate
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
322
structure length
318
Chain Sequence
PLCTLRQMLGEARKHKYGVGAFNVNNMEQIQGIMKAVVQLKSPVILQCSRGALKYSDMIYLKKLCEAALEKHPDIPICIHLAHGDTLESVKMAIDLGFSSVMIDASHHPFDENVRITKEVVAYAHARGVSVEAELGTLGGIENTVQLTEPQDAKKFVELTGVDALAVAIGTSHGAYKFKSESDIRLAIDRVKTISDLTGIPLVMHGSSSVPKDVKDMINKYGGKMPDAVGVPIESIVHAIGEGVCKINVDSDSRMAMTGAIRKVFVEHPEKFDPRDYLGPGRDAITEMLIPKIKAFGSAGHAGDYKVVSLEEAKAWYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Fructose-bisphosphate aldolase
publication title Structural insights into the substrate binding and stereoselectivity of giardia fructose-1,6-bisphosphate aldolase.
pubmed doi rcsb
source organism Giardia intestinalis
total genus 110
structure length 318
sequence length 322
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2009-02-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01116 F_bP_aldolase Fructose-bisphosphate aldolase class-II
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3gb6A00
2VOMA 2QJGA 3PUEA 4RR4A 2VKZG 4HNUA 4LNYA 3R12A 1SQ7A 1OFPA 1YTKA 5AOUA 2E5CA 3L9CA 1XXXA 2OT0A 4U4MA 1W3IA 3NQCA 3LLFA 1M7OA 2W0UA 4RX0A 4CQ9A 1FWRA 4PC8A 4FX6M 5LKYA 2QF7A 5AB3A 3S5ZA 4O52A 4YXGA 3W7IA 4LT9A 4ZQRA 2HSAA 4IX0A 4X2RA 1YLVA 2NXGA 5CG7A 1EP3A 2AQWA 4UMAA 1QFEA 4HSOA 3W76A 1MEIA 3TUUA 1OX4B 3L65A 4ALDA 5CPMA 2JGQA 2PRMA 5D38A 3THAA 3UWZA 4JTIA 1FDZA 2VFGA 2QCCA 1TIMA 3P81A 3SSJA 4JTFA 5DXYA 1AW5A 1UUOA 3UXDA 4LVDA 1SW3A 3HG2A 2CZDA 2C6QA 3TMQA 1EUAA 3WJYA 5D2VA 2WOQA 1LOQA 1M6JA 1GVFA 3LOTA 3A21A 1KW1A 1VGAA 3PSWA 4NNBA 4Y8FA 3N9SA 1OFOA 3S9YA 1GJPA 2C19A 3DFNA 4ZQPA 1H7PA 3STGA 3W2UA 3B04A 4RLIA 3CTLA 4O16A 1OX5A 5LNWA 4UFJA 1JCYA 3NNTA 3LXBA 2B4GA 3W7CA 2WJZA 5EL1A 1G6CA 1FQ0A 1JUKA 5D02A 7TIMA 1UJPA 2YW4A 1VYRA 2V2CA 1GQNA 3S42A 3GIYA 3UY7A 4BK9A 1Q6OA 1H51A 1PVNA 1WBJA 4M19A 4XWUA 1KM0A 4WJEA 3H54A 5KZEA 3LTYA 3KHJA 4JD4A 5EY5A 4LS1A 3NPXA 3O06A 1Y0EA 4GUIA 1F73A 1TPVA 2F7FA 4IMEA 5CKSA 3MI2A 3WJZA 4DF2A 1M5WA 1KA9F 4JICA 1H7WA 1FX6A 4LVGA 2V8ZA 4GUGA 3P8JA 1CX9A 2JK2A 4MVAA 5KZMA 1OFDA 1DBTA 1R2TA 1GPWA 3GKFA 3LERA 4JNMA 1LDCA 4O4WA 1H50A 2ZA3A 3W86A 2ISVA 1NAL1 3NAVA 4G1KA 4BWLA 3PBWA 1QO5A 1HO4A 3LHVA 4FF7A 2RDUA 4A29A 2QEZA 3WJSA 1SO4A 2C16A 1Q6QA 4O12A 1OYBA 2CLLA 3W84A 3TSMA 3HBLA 3KFTA 1TSIA 1G4SA 3NQDA 4CCEA 1SZEA 3ZWSA 1JQXA 3TW7A 3LCFA 1GZGA 4MUZA 2C18A 3JS3A 3KVJA 4WOQA 5LHEA 1XL9A 5D05A 1RR2A 2R8WA 1D3HA 1Z48A 1O60A 1W37A 2G95A 1I2OA 3FKKA 3M43A 4AXKA 1ZAHA 4BI6A 4ZQMA 3DFTA 3DZ1A 4WZHA 4MPQA 2VENA 2OJPA 1H1YA 5BMWA 4A21A 4S2CA 1BTMA 1A53A 4AHOA 3R5EA 5F4XA 4FNTA 5EA9A 3BG5A 3W1MA 3W22A 3E96A 3OG3A 3T4CA 4H3DA 4MY9A 4TMBA 3B4UA 5D2WA 3GDKA 5HQEA 1N8FA 3BV4A 1ONRA 1AL8A 3A22A 4HPXA 5U7SA 4ADUA 5A8GA 4EVZA 4IMGA 1FCQA 4QAIA 1L9WA 4BWLC 4E38A 3QMTA 3WK1A 1TTJA 5C55A 2YZRA 3CWOX 3B0VC 3P60A 4DXVA 1ME9A 1DORA 3I7SA 2ZQ0A 3DBPA 4JTGA 1LBMA 1XKYA 1WA3A 1AL7A 1ZY9A 5EMUA 1LCOA 3GDTA 3T78A 2VELA 3TSDA 1TJPA 4K8EA 1KM2A 4L4LA 4HT3A 1YTEA 3BARA 1EEPA 1PL9A 4I7VA 1SW7A 1R2RA 4N2YA 1W31A 5C6MA 3IIOA 3QH2A 2HTMA 3C2RA 3FOKA 4PCFA 2A7NA 3G22A 3OEXA 1VRDA 4CLMA 3TE9A 3F1QA 1JCJA 1EUNA 2J9ZA 2ZRZA 5U4NA 2Y88A 3UQNA 3KX6A 1LZOA 3EEGA 5AC8A 5G2WA 4WXYA 1NEYA 3O07A 4WQ6A 5GVJA 4AHPA 2XN1A 3OHIA 4K6AA 4LVAA 1TCDA 1ZHAA 3EKLA 3G1HA 3I7QA 4NJIA 1SO6A 2NWRA 1VHNA 4HIBA 2V5LA 3HG4A 4IPJA 4O17A 3W7QA 1TQJA 3I65A 2BWGA 1F2JA 1TTPA 4FX8A 2E6DA 2EGZA 1G4PA 2CZEA 3HPZA 4WD0A 1JQVA 1BWKA 1P0NA 2VFDA 3W7KA 3PY2A 1H7RA 1FWSA 4IXHA 1SR9A 1GYNA 2A7PA 3CM4A 2CLOA 5KITA 5I3GA 3HG5A 3MMTA 2WSRA 4L4MA 4M7TA 1QAPA 2Q8ZA 2QUVA 4ORMA 4EOUA 4Q33A 6ALDA 4K7YA 2RDTA 4NZJA 2A4AA 4HNTA 3QSTA 1FCVA 4Y9AA 1AW1A 4NX0A 4QNWA 5F2GA 1TV5A 1L6YA 4O0ZA 2YFNA 3W7LA 3SFKA 3C2FA 3GNDA 4GRSA 3TNOA 4S1FA 2Z6JA 4NUWA 2CZ5A 4CNOA 2J88A 1OFBA 4BI7A 1QPOA 1LTDA 3N73A 3Q37A 4OT7A 3L2IA 1PV8A 3NL2A 1JUBA 3B0UX 2YR1A 3NPVA 1O5KA 5HWNA 3NPUA 5L6UA 4MY8A 1TPWA 1LRQA 2NUXA 3EX4A 5CSSA 4IMFA 3MI3A 4CNPA 1SFJA 4ZZ9A 5HUOA 1EWDA 4LY8A 4IOTA 1KLZA 2PC4A 3TJLA 5AYZA 3G1FA 4TO8A 1ICSA 1KTNA 5K3VA 4DF1A 4IXXA 3W2MA 1LP6A 5FEWA 2E1DA 3TKFA 4P2VA 4WUIA 1KBJA 1VR6A 4JY8A 3EX3A 3KOFA 5J5RA 1TV8A 2ZZ1A 3LHWA 5K9CA 3PBYA 3N14A 1LOSA 4FIRA 3STCA 5DCDA 1A5BA 3P82A 2DU2A 4KFPA 2V82A 2WKJA 5LNVA 3G8RA 1JCLA 1L2UA 3TQKA 2FPYA 2Y62A 2NX9A 3BK0A 3K30A 5D33A 4OWGA 5K9DA 3IGSA 4N4QA 1WDWA 3C2OA 4FX7A 3VI2A 1GVOA 3HMJG 3INPA 2TMDA 2ZTKA 1JCMP 2OT1A 1EPXA 1TTQA 4JX4A 4ONVA 2CWNA 3LRKA 3HGOA 2G5WA 3KRUA 4O1BA 1IF2A 2ZRVA 4Z1DA 2NV2A 3G1DA 1ME7A 5I3JA 1VCGA 3V1PA 1ZAJA 2Q3OA 1L6SA 4DPPA 3W88A 3M5YA 4LC8A 4PH6A 4RXFA 1SFLA 3QQ0A 4M7SA 2Y61A 1W5PA 1S3HA 3NQ2A 3QMRA 5AHFA 3S5OA 4XBKA 5D32A 1G4TA 2YX0A 3EX1A 2QCFA 1A5AA 1BWLA 3M16A 4H6KA 3PF3A 2J6XA 1S5WA 1W0MA 2DJLA 2YYTA 1F74A 2ISSA 4UTWA 5CZTA 1OX6A 4IX2A 5HJLA 1IXNA 1X1ZA 3MWAA 1O4UA 3QEZA 1EA0A 4UTTA 3EX2A 1XDMA 3O1NA 4RZ5A 3W1AA 5KZDA 5DY2A 3HQ1A 2E5DA 4UCGA 1TPFA 5C2XA 3UXAA 1KM3A 3MO7A 1ICQA 1PE1A 4X22A 5G1YA 5FF3A 5I3IA 1AW2A 4U28A 3W1QA 3S1WA 3T44A 1W1ZA 4MY1A 1GEQA 1UBSA 5FEXA 3W7MA 1OFEA 2DP3A 3HO8A 3WFAA 2X1UA 3PBVA 3W72A 2O7QA 4JIPA 3MUXA 1MEWA 1IGSA 5CZ0A 2E09A 1MO0A 1CI1A 2P10A 3NQFA 3W7GA 1FWWA 3NO5A 1W3TA 3EXRA 1Q45A 4KWVA 4GJ1A 2Q3RA 1JRCA 1VPXA 3C61A 3O63A 1QWGA 4UTWC 1K8YA 4JXCA 3PG9A 5KTLA 1AK5A 1P5BA 3EXSA 5DBTA 4GBUA 1VCVA 4UTTC 4POCA 1R47A 3P8IA 3CLMA 1TRDA 3QMSA 3BLIA 3DH7A 5AC7A 3TW6A 5F1UA 4AMAA 3BG3A 1G4EA 3M1ZA 2RHGA 4I7UA 4WY0B 3THQA 3VNDA 3CWNA 1JJKA 1F6KA 3O16A 1XFBA 2ZRWA 5EKYA 2PCQA 3S1UA 3LX9A 1FCBA 2FTPA 5AYXA 1H61A 3GLCA 4O28A 3G24A 2B7QA 5D09A 3NZRA 4JDYA 1PHWA 2V5BA 4QJ1A 4I7WA 3W3OA 1G67A 5D30A 4WY0A 4IMDA 5TIMA 3NQGA 4LOCA 1YDVA 4JIQA 1J4EA 3HJZA 2ISWA 3S0CA 4MZYA 4PEKA 3GNNA 2Z6IA 3I6RA 3GDRA 1VYSX 2DZSA 3I68A 5EYWA 1KLYA 1XCFA 1YXYA 4GUHA 4O10A 1DL3A 1UB3A 4IMCA 4NZFA 3W1RA 2CLHA 1FUYA 5AHEA 1UASA 1O94A 2QAPA 3NL3A 1Q6RA 5AN7A 2EHHA 2QUTA 4IJBA 1PCWA 1QOPA 2X1RA 2YYUA 5F4WA 3EB2A 3C0JA 1TYGA 3UWYA 3RNDA 3CEUA 3HGSA 2GJNA 4DBDA 2JGYA 3LCLA 1X7FA 3DHFA 2V30A 3L5MA 1B9BA 2Q8LA 1ICPA 1KFEA 5HR6A 3STFA 3JR2A 1TQXA 3M41A 1FXQA 3DGRA 2A6NA 2CLMA 1X6UA 5E1QA 4K36A 4JS3A 3R2GA 3LI1A 4O0KA 4GUFA 3M5VA 4DO5A 2R14A 1QNVA 4IPIA 1KV5A 3PVFA 3TAOA 3DKJA 3P67A 3ABQA 3BO9A 3MHGA 2G96A 3P7YA 5TBOA 2C0AA 4E0CA 1LBLA 1KTCA 1J5TA 5K4XA 1MEHA 1XI3A 4EWND 3FJLA 4HSNA 1GG1A 2YFOA 2A21A 3QPZA 3NA8A 2ALDA 2NX1A 4ZMGA 2TYSA 4N9DA 2B7NA 2FPVA 4M6QA 4LS2A 3W85A 1SZNA 1MXSA 4MYAA 3W1UA 1BKSA 3S5NA 4O8RA 1W5OA 3VE7A 1JR1A 2ZA1A 4QQ3A 4YCOA 2JKAA 3W7DA 3NQMA 1WOBA 3DFPA 3FS2A 4RXGA 3W7NA 3W70A 5E93A 3DHDA 3ATYA 5LGZA 4MFEA 4LTSA 3B8DA 2TPSA 3NXFA 2TSYA 3ZS4A 3U6WA 4KFNA 3DU0A 3HIJA 4Y96A 3L0NA 1DHPA 3F03K 4FNUA 4K39A 2ZRUA 1C8VA 1Q6LA 1ZALA 3M9YA 3NQ6A 5F1VA 3NR0A 5LSMA 3NGJA 4CQAA 3GYEA 3UZ5A 4NX5A 1EIXA 3C8FA 1S5VA 1YTDA 1NF7A 3M44A 4UTIA 5KMYA 2XN2A 3UWQA 3H55A 2JKEA 3EWXA 3UWVA 1FY6A 1TPB1 3G18A 2OZ0A 2WSYA 2B7PA 5LGXA 1FBAA 1WBHA 2DORA 1EWEA 3BVJA 3M6YA 2A1YA 3G3MA 4M6PA 5ABTA 5MHBA 2QCDA 2ZTJA 1R46A 5HWMA 3TROA 4JN6A 3BW3A 4NNAA 4FO4A 4AWTA 1LROA 1XBXA 3HPSA 3FKRA 1H7NA 1JVNA 1TPEA 4MLRA 3O6YX 2FDSA 4PTNA 2GVJA 3BPWA 4IGHA 4C1KA 3PULA 2E6AA 1LORA 3CQ0A 4AAJA 4HNVA 1ZAIA 5T26A 4WOZA 3MJYA 3O8AA 1LRNA 4JTHA 2YW3A 1KFLA 3LCIA 4X3ZA 4EIVA 1QO2A 1SO3A 4UFMA 4B5NA 2FQIA 3NL6A 4JTLA 1HFBA 1F5ZA 3OVRA 3IRDA 4AWUA 4LVBA 1SO5A 3P5YA 2ZYFA 1I2QA 3LDVA 3W7EA 4GE8A 3USBA 4QIUA 5F2IA 1C9DA 3LHYA 2XFWA 3ANYA 3S1VA 1G7UA 2ZZ4A 1YYAA 3TC7A 2H3BA 3UWUA 1C29A 3G0XA 4PL1A 3HOJA 4UTKA 3ZWTA 2W6RA 3W9ZA 1IXOA 3KXQA 4PFMA 3DI0A 2HMCA 4EF9A 4XQ6A 4TR9A 4Z0SA 3S1XA 1T8XA 5FEPA 1EB3A 1VQTA 4S2BA 3FIGA 1K7XA 8TIMA 2ATSA 4JYEA 4RZ4A 3NM3A 3NOEA 1SU5A 3SI9A 4AHQA 3UY8A 5F2MA 1CW2A 4A2SA 2GQ8A 4YL2A 4A22A 1U83A 4UFKA 1OFRA 5I3HA 1T0OA 2J9XA 2NZLA 3NDOA 1LBFA 2UV8G 2DZWA 4OV4A 1VC4A 4FIQA 1PCKA 2X1TA 1N7KA 4LUIA 2Y85A 3LHZA 4K37A 1H62A 3W71A 1FXPA 2CU0A 5DBUA 1SPQA 3IIPA 1H7XA 3GB6A 4LV9A 1W8SA 3EWWA 3L0KA 4FHAA 5LHFA 3NZ1A 4UFIA 5FF2A 1FWTA 1I2PA 2C15A 4OE7A 2PRLA 1TPC1 3OVQA 3LTPA 3M5ZA 1LLWA 1VYPX 4QITA 1TJRA 5CPNA 3A5FA 4JX6A 3GAYA 1DJNA 3GZ3A 4N6FA 3SZ8A 1I8JA 2JKPA 3G1SA 5HMSA 3VFLA 3JRKA 3NM1A 5FESA 4JTEA 5SWUA 1OG0A 3N2MA 4MYXA 3MHUA 4MZ1A 5C54A 1JCXA 1O95A 1OHLA 4QSHA 3C4UA 1HL2A 3O05A 3ABSA 5AHNA 3MP4A 2DJXA 4NJKA 1RVGA 2ZZ3A 3LBMA 3UYCA 4R34A 4LC6A 3PB0A 3W83A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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