3GDQA

Crystal structure of the human 70kda heat shock protein 1-like atpase domain in complex with adp and inorganic phosphate
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
379
structure length
376
Chain Sequence
GIAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPQNTVFDAKRLIGRKFNDPVVQADMKLWPFQVINEGGKPKVLVSYKGENKAFYPEEISSMVLTKLKETAEAFLGHPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKGERHVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVSHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQANLEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELCADLFRGTLEPVEKALRDAKMDKAKIHDIVLVGGSTRIPKVQRLLQDYFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Chaperone
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1-like
publication title Crystal structures of the ATPase domains of four human Hsp70 isoforms: HSPA1L/Hsp70-hom, HSPA2/Hsp70-2, HSPA6/Hsp70B', and HSPA5/BiP/GRP78
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 122
structure length 376
sequence length 379
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-02-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3gdqA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3gdqA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3gdqA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3gdqA04
5ADXH 4FWRA 1GLDG 2QWNA 2GWJA 4B1WB 1YVNA 4WQ5C 1SZ2A 3D7EO 4J8FA 4FOEA 1KAXA 3ZETA 5BR9A 4FPAA 3LM9A 4WQ4A 4H0OA 1ATNA 4JD2B 1KXPA 2E2OA 3EO3A 4HWIA 1BA1A 2P9UA 5FPEA 4MLHA 2CH6A 3ULEB 3WXLA 2ASOA 2OANA 5AQVA 5JICA 4K42A 3D2FA 3VPZA 4B1ZA 2Q97A 3QB0A 3GG4A 1JCFA 4BG8A 1S22A 2FSNA 3FR0A 2YJFA 3WQUA 4WYBA 4CZMA 4BRFA 3VOVA 1KAYA 1J6ZA 4B1UB 1DGKN 5AQNA 5AZJB 1GLAG 5BN9A 3DXMB 4BRMA 4IJAA 4DCHA 2P9NB 2P9SA 1MWKA 4EHTA 3FZKA 2CGKA 2ASPA 2FXUA 3VGMA 1NGDA 1S3XA 2V52B 4DHYA 2Q36A 3MN6A 3H1VX 1TUUA 3FFKB 3BP8A 5AQPA 2P9IA 5LY3A 4CBWA 4RCHA 4M63C 3ZX3A 3D2EB 2A40A 2I7NA 2FSJA 1Y64A 3R8EA 3HSCA 3SLCA 1NGGA 1YAGA 2NRHA 4FWOA 1TUYA 5CE3A 3LDPA 3WT0A 3CJBA 5BPLA 3P4IA 2ITMA 4BR5A 4H0XB 1U2VB 4Y0WA 3H6EA 5F1XA 1QQMA 2YHWA 3OHRA 3UKRB 4JN4A 3FZHA 4FL9A 1HUXA 5F0XA 3L6QA 3R6MA 4MO5A 5ELZA 4H0TB 4BR0A 4BRQA 3CI5A 4FWMA 1ATSA 3I33A 3FGUA 3ZX2A 4BRHA 5BPNA 4BREA 4H5VA 3BF3A 1NGAA 3TU5A 2EWSA 1ATRA 5BRHA 2YCHA 5B8HA 2YI1A 3C7NB 1RFQA 5KPZA 4CD3A 1U6ZA 2KHOA 5KQDA 1WUAA 3ZETB 3SK3A 2QW9A 2ASMA 1TYQA 2HF3A 3HBTA 3VEXA 5KPTA 3WXJA 1XC3A 2E2NA 5E26A 3O8MA 4MO4A 4BG9A 2YHYA 2BTFA 2ZF5O 3LDOA 3IFRA 2IVNA 3EN9A 4H5NA 5AFUH 2CGJA 3BF1A 3QICA 3VF6A 3ENHA 2P9UB 3G25A 5BREA 2GTDA 5KQ8A 4I6MB 2QWLA 3W3DA 4B9QA 2W40A 2IIRA 3M6GA 2Q2RA 4NB4A 3EKUA 3D2FB 3A0IX 1C0GA 4GY2B 5EXWA 3GBTA 1NGIA 5LJWA 2BUPA 2ZWHA 1ZC6A 2ZGZA 3CHWA 3VGLA 2V7ZA 3CIPA 4BRDA 1ZXOA 3MMVA 4H0YB 3FZFA 2IVOA 1NWKA 3SMPA 4BRKA 4PL8A 4B1VA 4BRNA 1G99A 3EL2A 1HKBA 3FZMA 5BPMA 3A5MC 4BC5A 1P8ZA 3U4LA 3VETA 4CZGA 3WEEA 4BC3A 4EFHA 1H1VA 4IWVA 3VF4A 3KHYA 1LCUA 2CGLA 4JHDA 1NMDA 4CZJA 3GDQA 4M7XA 4IZ9A 4EAHD 2D0OA 3BUZB 4O8KA 2E20A 4CI6A 5ADXA 2P9IB 1SAZA 3MN9A 3QMLA 2GUPA 1CZAN 3QFUA 3GE1A 5AQTA 3S41A 3O5BA 3CETA 2P9PA 3DXKA 1NGBA 4K41A 1NBWA 5AZIA 3VEOA 2GEMA 3EKSA 4FO0A 2QWQA 3VEWA 1HJOA 4FWQA 5AQIA 2I7PA 5BRDA 4H5TA 5AQMA 1BA0A 3UKUB 5AQHA 1Q18A 2A3ZA 5AQUA 3J8AA 4KBOA 3EZWA 2W41A 2A41A 4BRAA 3MN5A 5AQXA 2D1KA 1BDGA 2FLOA 4H0VB 4RTFD 4YDUA 4PKHA 4AM6A 3H3OB 5FPDA 3DAWA 4PL7A 4BC2A 5AQOA 2NLXA 5AQJA 2WUSA 4XH5A 3FZLA 3M3ZA 5BN8A 3O6WA 3ZX0A 3ID8A 4WQ5A 2FF3B 5EX5A 4QS9A 3B8AX 1BO5O 1LOTB 1MA9B 5AQQA 4JD2A 4H5RA 2PAVA 1T44A 4EIAA 4F9OA 1YUWA 4FWNA 5AQYA 4PKGA 2GWKA 4CD1A 2QM1A 4K25A 3JS6A 3MCPA 1ZBSA 4BGAA 1D4XA 3VF2A 3HTVA 4CZFA 2ZGYA 4BR2A 3SMSA 4B1XB 4BVPA 2FSKA 1DKGD 3O08A 4K43A 4FWPA 1NGCA 1EQYA 4O5FA 5AR0A 2F9TA 4A61A 3LDLA 4WQ4C 5AQGA 2F9WA 4EHUA 2QWRA 5EY4A 2HMPA 3SJHA 4Z94A 4BR7A 3AAQA 4LC9B 1RDWX 3I8BA 1NGJA 4IO8A 3LM2A 4BGBA 5JLFA 4CZHA 1SQKA 4BR4A 1OKJA 2A5XA 5AQLA 2YHXA 3MN7A 3IUCA 3GOIA 1QQOA 3DXKB 3D2EA 2AP1A 3TPQA 1X3MA 3CQXA 1C0FA 1HX1A 1X3NA 3U8XA 5AZIB 5AFUA 3GL1A 1QZ5A 1K8KA 3H3NO 1T6DA 4XEIA 2QWPA 1V4SA 1U2VA 4XH4A 2E2QA 2D0PA 3WUHA 3CJAA 4A2AA 4FPBA 4CJ7A 3H1QA 1BUPA 1R59O 2P9SB 3UKRA 1IG8A 2AA4A 2A42A 3CERA 2YJEA 4YDUC 3VENA 2CH5A 1V4TA 4ISGA 3W0LA 3WQTA 2E1YA 3BEXA 3RSEA 4H03B 2V7YA 1NGEA 1HKGA 3A5NC 3O1WA 4BQZA 5AQKA 1T6CA 3ZEUA 3IMXA 4A2BA 3IDHA 3C7NA 4FWLA 4JAXA 3VEZA 1RGIA 1BU6O 2Q0RA 4FWSA 4M7YA 2QXLA 3A5LC 5BRFA 4B1YB 3QBWA 4BRPA 3DJCA 2E8AA 4BRGA 2P9KA 3L0QA 4RWTA 3LL3A 3C0BA 4BROA 1GLLO 3O1BA 5F2RA 3A5OC 2NZTA 4IXCA 1XUPO 3QFPA 3AARA 5AQSA 4I6MA 3U9ZA 1YXQA 3VEVA 1DEJA 1E4GT 5I9EB 3CJ9A 3CJ7A 1HPMA 3HM8A 3ATUA 1MWMA 3WXKA 5FPNA 1ESVA 2P9LA 5AQWA 3UE5A 1XQSC 1TYQB 3U9DA 1GLCG 5FPMA 4CZIA 4QS7A 1QQNA 2GELA 2VCPA 4BC4A 3A8YA 3O4WA 2V51B 1BWFO 4CZLA 2Q0UA 3AAPA 1BOTO 3H45C 4FSVA 4E1JA 2H3GX 4BQLA 1MDUB 3HZ6A 3CJCA 4BVOA 3ULEA 5AQFA 2PBDA 3QBXA 2QWOA 2Q31A 1QZ6A 4CBUA 4NO7A 3WXIA 5TKYA 4ISEA 1K8KB 3O80A 3QDKA 4DB3A 3VEYA 4BRLA 3UB5A 5E84A 1NM1A 2E2PA 4MLEA 3ENOA 1NGFA 1HLUA 1E4FT 4GNIA 2J4RA 4XH1A 1NGHA 3FE1A 2UYTA 2D4WA 3WEEB 3HI0A 3UKUA 2E1ZA 5AZJA 4H5WA 1Z05A 3DXMA 4HTLA 2P9NA 4JHDB 3VGKA 5JMVA 1GLBG 3RSEB 2Q1NA 4C23A 4FWKA 5KPRA 4DQ8A 2QWMA 1WOQA 1HKCA 3VESA 3H46O 3ZEUB 4H0PA 4FOIA 1BG3A 4BR9A 2DPNA 4PKIA 5AQRA 5EOYA 1GLEG 4L3QA 4JNEA 2P9PB 5EVZA 2A6AA 2HF4A 3VERA 3R9PA 3FLCO 3DWLA 1GLJO 4AM7A 4CZKA 3LDNA 3JXUA 2P9KB 3L4IA 4CBXA 3M1FA 2HOEA 3AY9A 1X9JA 1Z6RA 2IVPA 2FF6A 5JLHA 3ATVA 3KVGA 4QS8A 3CQYA 1IJJA 5LJVA 1QHAA 4A62A 3MK6A 1JCEA 2E88A 4BRIA 1GLFO 1KAZA 3MDQA 1JCGA 3F9MA 4IJNA 4BRCA 4CZEA 1NLVA 2VYPA 3KZBA 3LDQA 2VWBA 2P9LB 3CJ1A 4ISFA 5AQZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3QLHA 5ADXH 3O3FA 4FWRA 1GLDG 3HM9A 2GWJA 4WQ5C 3MXMA 2LSNA 2YEOA 4LSNA 2NRZA 4ICLA 3CC4N 4LSLA 4H0OA 4FLYA 3TR8A 1BQMA 2OCEA 3EO3A 5I42A 4JEPA 4KO0A 3OYBA 1WBDA 5GADP 2P9UA 4M3YA 1J53A 4W5NA 2O8CB 1N6QA 3HVRA 1FW6A 2DFFA 5AQVA 1KLNA 2NRTA 4BG8A 5MLCQ 3F73A 2O4IA 4I2QA 2OZMA 1KLMA 4O44A 2FSNA 3WQUA 4FLXA 4CZMA 4O5BA 4BRFA 2ITGA 4B1UB 2JWKA 3SJJA 5AZJB 4A59A 1GLAG 3OA9A 4N5SA 4IJAA 2P9SA 3THYB 5GINA 3PV8A 2KGQA 3OBYA 4JKHA 1NGDA 4CIGA 3CCJN 3KWGA 4DHYA 1SKRA 1EWRA 3H1VX 1TUUA 5AQPA 4JI8K 2LJ7A 2P9IA 5LY3A 3J80O 4RCHA 4M63C 3ZX3A 1GOAA 2KSKA 3D2EB 2FSJA 4LF7K 4HCBA 4JLHA 3SLCA 1NGGA 4GKKK 3THXA 2YBRC 5CY0A 1DTTA 3G0ZA 1TK8A 4B9VA 4CF0A 4NLCA 4X66K 3U3GA 2EHGA 1NKEA 1JZBA 2YHWA 2QXFA 2KJAA 4CGGA 1HUXA 4B9NA 3KK2A 1ASWA 4BR0A 3BZKA 3K5OA 4C8KA 1E3MA 3CI5A 5KTQA 3G4SN 1ATSA 5LMUK 3I33A 2QA4N 4GV3A 3ZX2A 1SNBA 5BPNA 2MBKA 1VSJA 4LFCK 2G2KA 1NGAA 1Q81O 3TU5A 2EWSA 3T3FA 1ATRA 3ISNC 1YF5L 3VA0A 1T05A 4HHTA 4JKCA 3HT3A 1RFQA 5KPZA 4CD3A 5KQDA 3ZETB 1QVFM 4AHTA 2ASMA 1BIUA 1HNVA 1TYQA 1VSEA 2E2NA 1C0MA 3MCAB 5E26A 1ZU3A 3O8MA 4MO4A 4CEDA 3DRRA 3EN9A 5AFUH 4DUYK 3BF1A 3VF6A 3G25A 3J7AP 5KQ8A 3MWTA 1WBBA 2QWLA 4IG3A 3SZ2A 2LR3A 2Z1IA 3CM6A 2W40A 3B6OA 3E1YA 1J5EK 3D2FB 3A0IX 4XJXA 3AVHA 1TGOA 3ID6A 1P00A 2BUPA 5LJWA 1L3SA 2ZWHA 2ZGZA 2V7ZA 3VQ6A 1YITN 1JLBA 3MMVA 1NE5A 3RTVA 3SMPA 1WT7A 1TK5A 4PL8A 4B1VA 1UAXA 3FZMA 1IH7A 3A5MC 4BC5A 3SPZA 3QESA 2IOCA 3WEEA 4FVMA 4CJQA 1QQCA 3HRGA 4LD0A 4B9UA 3HSTB 1YI2N 4JHDA 4IZ9A 4O8KA 4NXNK 3MN9A 2HW3A 1NK6A 3QIOA 5M1PA 3O5BA 5IWAK 4CJWA 1ICAA 4CJ5A 1TVRA 4KTWA 3DLKA 3EKSA 1FKOA 1BI4B 1PE4A 5C12A 1XWLA 4FWQA 2I7PA 2G8VA 2VG6A 1VK0A 1BA0A 5AQHA 1T7PA 1N8RO 3WNGA 2P51A 3EZWA 4JRPA 3KOXA 2W41A 3LP1A 1FK9A 1BMRA 3THVA 1HYSA 1WN7A 1SKWA 4PL7A 1NJIO 5AQOA 2NLXA 4F3TA 3WNEA 4B9SA 3K9KA 3CFRA 2YNFA 3ID8A 2OTJN 2FF3B 3ZT3A 3E01A 2FC0A 3TWHA 3VQ7A 3PY8A 2YKMA 3NGYA 3SAFA 4E89A 2PAVA 4F9OA 3SQ0A 1W9HA 4CK3A 5AQYA 2KQ2A 2F4VK 3TSPA 3AVAA 2XRIA 3EEQA 1VQMN 4KI4A 1NJXA 3LP0A 3JS6A 4CJPA 3K59A 4DWIA 1SEGA 2G8WA 2O8EB 4RW6A 3VF2A 2M8BB 1VSDA 4CZFA 4A5AA 4DSKA 4JKGA 4CF2A 3SMSA 3KKSA 2F96A 4UJ0A 2FSKA 1OH5A 5AR0A 2YX6A 1T7AA 4FW1A 2QWRA 3HVTA 5EY4A 1C56A 5GAGP 4BR7A 4FLTA 3V4IA 4RG8A 3LM2A 2VWKA 5JLFA 1WSIA 3AO1A 2VG5A 3OJUA 2FBVA 3QEVA 3HL8A 3SBTA 5E41A 4IFYA 2YHXA 3CCEN 3MN7A 4B3OA 3CQXA 3J81O 1HX1A 1X3NA 4GW6A 4CHOA 1IKVA 1FKPA 3MXIA 2E3GA 1T6DA 2QWPA 3NBPA 4DV2K 2K35A 4QAGA 3MAQA 3KHWA 1RTHA 3WUHA 5J2PA 1EX4A 3H1QA 1R59O 2P9SB 1IKWA 2D0AA 4NCAA 2B6AA 4DR4K 2A42A 1WSEA 3VQ4A 2HB5A 4RW8A 1V4TA 2E1YA 3BEXA 4H03B 1JXEA 2V7YA 3SQ4A 3L56A 3ZEUA 4A2BA 3TAPA 3VEZA 4MDAA 4CJ3A 1SS6A 3CFOA 4R5PA 4FWSA 3A5LC 4C1NK 5BRFA 3KLEA 4DQSA 1O13A 2E8AA 2GV9A 3OYAA 1TKTA 4BRGA 3L0QA 1KVBA 2JGUA 3LL3A 4CJVA 4IDKA 1GLLO 3O1BA 4OLAA 3THWA 3LPTA 5GAEP 4M3ZA 1XUPO 1NNEA 4I6MA 1BIZA 3ALYA 1SKSA 1CZ9A 1E4GT 3TSUA 1NK7A 1J9AA 2DFHA 1BCOA 1QSLA 1OVQA 5HBMA 5C2FA 1LW2A 2DY4A 3ATUA 4M42A 4DSLA 5FPNA 4KH4A 4CEFA 1ESVA 2NY9X 3E7RL 2A1SA 3A2FA 5JVHL 1Q9YA 1XQSC 1TYQB 1TV6A 3AA4A 4OPJA 1GLCG 4UADE 4FJXA 5FPMA 4JI2K 1IG9A 1SUQA 4CJTA 3O9RA 3VMFB 2V51B 3VQ5A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3QLH A;  5ADX H;  3O3F A;  4FWR A;  1GLD G;  3HM9 A;  2GWJ A;  4WQ5 C;  3MXM A;  2LSN A;  2YEO A;  4LSN A;  2NRZ A;  4ICL A;  3CC4 N;  4LSL A;  4H0O A;  4FLY A;  3TR8 A;  1BQM A;  2OCE A;  3EO3 A;  5I42 A;  4JEP A;  4KO0 A;  3OYB A;  1WBD A;  5GAD P;  2P9U A;  4M3Y A;  1J53 A;  4W5N A;  2O8C B;  1N6Q A;  3HVR A;  1FW6 A;  2DFF A;  5AQV A;  1KLN A;  2NRT A;  4BG8 A;  5MLC Q;  3F73 A;  2O4I A;  4I2Q A;  2OZM A;  1KLM A;  4O44 A;  2FSN A;  3WQU A;  4FLX A;  4CZM A;  4O5B A;  4BRF A;  2ITG A;  4B1U B;  2JWK A;  3SJJ A;  5AZJ B;  4A59 A;  1GLA G;  3OA9 A;  4N5S A;  4IJA A;  2P9S A;  3THY B;  5GIN A;  3PV8 A;  2KGQ A;  3OBY A;  4JKH A;  1NGD A;  4CIG A;  3CCJ N;  3KWG A;  4DHY A;  1SKR A;  1EWR A;  3H1V X;  1TUU A;  5AQP A;  4JI8 K;  2LJ7 A;  2P9I A;  5LY3 A;  3J80 O;  4RCH A;  4M63 C;  3ZX3 A;  1GOA A;  2KSK A;  3D2E B;  2FSJ A;  4LF7 K;  4HCB A;  4JLH A;  3SLC A;  1NGG A;  4GKK K;  3THX A;  2YBR C;  5CY0 A;  1DTT A;  3G0Z A;  1TK8 A;  4B9V A;  4CF0 A;  4NLC A;  4X66 K;  3U3G A;  2EHG A;  1NKE A; 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