3GG3A

Crystal structure of the bromodomain of human pcaf
Total Genus 37
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
37
sequence length
107
structure length
107
Chain Sequence
PDQLYSTLKSILQQVKSHQSAWPFMEPVKRTEAPGYYEVIRFPMDLKTMSERLKNRYYVSKKLFMADLQRVFTNCKEYNPPESEYYKCANILEKFFFSKIKEAGLID
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
molecule keywords Histone acetyltransferase PCAF
publication title Histone recognition and large-scale structural analysis of the human bromodomain family.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 37
structure length 107
sequence length 107
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.3.1.48: Histone acetyltransferase.
pdb deposition date 2009-02-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 3gg3A00
4KV4A 2YQDA 5ETBA 5DW2A 4YY4A 3FKMX 5DY7A 3LJWA 5HQ6A 4UYFA 2OUOA 5JWMA 4YYNA 4NR4A 4XY8A 2YEKA 3MB3A 4UYDA 5HQ7A 4LZRA 4O75A 4LR6A 5KO4A 5CQ7A 3P1DA 4MEQA 1EQFA 2OSSA 2KTBB 2RNWA 4MR6A 5CQ6A 4DONA 4HXRA 5LVRA 4LZ2A 4C67A 4HXOA 4TYLA 4CFKA 3ONIA 4IR5A 4A9MA 5D0CA 3O36A 3G0LA 5FH7A 5CTLA 5AD3A 3UVYA 3LQIA 5DBMA 4Z6HA 3UV4A 4O71A 3U5KA 5C85A 5LJ2A 4NQNA 4PS5A 5A81A 5EWWA 4BW4A 5LKZA 5DW1A 4NR5A 4AKNA 3UVXA 4LYSA 4TT6A 5F61A 5E9IA 4BJXA 3QZTA 5F25A 3MULA 5KU3A 5CGPA 5E3GA 2R0YA 2N9GA 4QUUA 4QEVA 5D3NA 4IR6A 5A5SA 5A5NA 3O37A 4O72A 5DYCA 5A82A 2WP2A 4ZC9A 2DVRA 4QC3A 4PKLA 5D3TA 5TCMA 5HELA 5C89A 3JVJA 5DLXA 5F36A 2L5EA 2R0VA 5A5RA 4HBVA 4UITA 4QYDA 5EPRA 2DWWA 4Q0OA 5ENGA 1E6IA 4KCXA 5FFVA 2WP1A 5CQ5A 3O35A 4O7AA 3G0JA 4BW1A 5BT5A 4TZ8A 5EI4A 4QSPA 1N72A 4E96A 4IR3A 4TU6A 4MR3A 4IOQA 4QZSA 3IU5A 4O7EA 2GRCA 4QSXA 5EWCA 2I7KA 5C4QA 5C87A 5I88A 5I83A 3Q2EA 5C8GA 5FH6A 5AD2A 4NR6A 4YABA 5CRZA 2DATA 4PY6A 4MEOA 5FG4A 5A5QA 5L8UA 2L84A 4PCEA 5D7XA 4LDFA 3SVHA 2DVVA 5LUUA 4NYXA 4CUTA 4YYDA 2MJVB 2YYNA 5H1VA 5CFWA 4QSQA 5CZGA 5A85A 3SVGA 4CUPA 4HXSA 4TZ2A 2E7OA 5FFYA 3S92A 4HBYA 5ENFA 5F63A 2RNYA 5ENCA 3MB4A 4ZW1A 5FE6A 5LJ1A 5F5ZA 5HM0A 3UV5A 3JVKA 5F60A 4UIWA 5CUAA 3LXJA 4WIVA 4NXJA 2DKWA 5EWDA 3AADA 5H85A 3O33A 3P1EA 5EP7A 4OGIA 5LVQA 2YEMA 5DLZA 5FE4A 4Z6IA 5I1QA 2F6NA 4YYMA 4QR5A 4NYWA 5F1HA 5II2A 5H1UA 2RFJA 5DFDA 5IG6A 4NUCA 5CPEA 5IIDA 3UW9A 4IOOA 5G4RA 4A9IA 5I40A 5L8TA 4O7FA 2DVQA 4OUFA 5HRWA 5A5PA 5CUEA 1ZS5A 5DKCA 4O74A 4CUUA 3MXFA 5D3RA 5KHMA 5I29A 3DAIA 4QBMA 5BT3A 5G4SA 5IGNA 5DX4A 4HXKA 4NRAA 5CUGA 4QC1A 4IR4A 5E73A 4NYVA 2DVSA 4N4FA 5E9YA 3AQAA 4XUAA 3QZSA 5E74A 5EWVA 4J0RA 4TS8A 5AMEA 4YYKA 5I7YA 4Q0NA 4CFLA 4NQMA 5F2PA 5CRMA 4YY6A 5CUDA 5I7XA 3LQJA 3LQHA 3K2JA 4QEWA 4N4GA 5HFRA 1F68A 3DWYA 4YH4A 5LKXA 3U5PA 5EPBA 5FE1A 3TLPA 4HBXA 4UIYA 5CY9A 5L98A 5DFCA 4YBMA 5L97A 5I80A 4O70A 5E3DA 2RS9B 5EGUA 5IBNA 3SVFA 5EQ1A 3ZYUA 4NS5A 4KV1A 5E9VA 4Z1SA 1WUMA 5HENA 4RVRA 4QSVA 2NXBA 2R0SA 4LYIA 4YATA 2FSAA 4HXLA 5FDZA 5ACYA 4YBTA 5DYAA 5EPSA 2RNXA 4CUQA 4QR4A 5FBXA 5HFQA 3O34A 5D3HA 5K29A 5BT4A 4A9OA 5CQ3A 5CQTA 5J0DA 3S91A 3NXBA 4YYIA 5EICA 5A5OA 2I8NA 4A9FA 3RCWA 5FE2A 5CU8A 4O7BA 5DYXA 5HRXA 2YELA 4QSSA 5A7CA 3HMFA 4HXMA 5CQ4A 5IGLA 1JM4B 3P1FA 5AMFA 4UIUA 5FFWA 5KTUA 4QYLA 5CUCA 4A9JA 5COIA 5EWHA 5D3LA 4A9EA 5FE5A 5E7DA 5L99A 3GG3A 4MR4A 5ENEA 5CP5A 5LJ0A 2E7NA 4J1PA 4TU4A 4HXPA 4NRCA 4YADA 4CLBA 4UIZA 3P5OA 4TT2A 2E3KA 4UIVA 4YC9A 2OO1A 4QB3A 5E9KA 5FE0A 5H1TA 4IORA 4QSTA 5F3AA 4NUEA 3UVWA 4TQNA 4UYEA 5DKDA 4A9LA 5EM3A 4N4IA 4FLPA 5D25A 5HQ5A 3QZVA 5DFBA 4PCIA 2H60A 5LKTA 4QSWA 2RI7A 4BW2A 4YBSA 4YH3A 4CURA 5KTXA 5FG6A 3JVLA 4J0SA 3HMHA 3HMEA 4Z1QA 4LYWA 4O76A 4LZSA 5HLSA 4NR8A 3U5LA 3U5JA 5D26A 1X0JA 5I89A 2D82A 5CQAA 5FH8A 4YYHA 4N3WA 5F1LA 5ENIA 4TTEA 4CL9A 5CUBA 4ZQLA 4GPJA 5E0RA 4OGJA 5DYUA 4A9HA 3UVDA 4C66A 5LKUA 5ENBA 2YDWA 4Z93A 5FE9A 5ENHA 4MEPA 5C7NA 5II1A 2F6JA 5EVAA 2L85A 4YK0A 4A9NA 5FB1A 4MR5A 5A83A 4WHUA 4XUBA 4LRGA 3UV2A 4QNSA 5HEMA 1JSPB 4ALGA 2RO1A 5HCLA 4N4HA 4YAXA 5IGKA 4YYJA 4NRBA 4O77A 5IGMA 4UIXA 4XY9A 5FB0A 4F3IA 2D9EA 5KTWA 5EU1A 4HBWA 5D3JA 4ALHA 5HJCA 4J3IA 5FE8A 4QSUA 5FG5A 4XYAA 5ENJA 3I3JA 3U5NA 5EA1A 3D7CA 5CS8A 4QR3A 2G4AA 5EV9A 5TB6A 3MQMA 3U5OA 5F62A 3MUKA 5I86A 4X2IA 4QUTA 4BHWA 5E9LA 5D3PA 5CQ8A 4UYGA 5DKHA 4UYFB 1WUGA 3U5MA 5EK9A 4PTBA 2R10A 3P1CA 4TT4A 4O7CA 3Q2FA 4UYHA 4LC2A 4NUDA 4QEUA 4NR7A 5EISA 4Y03A 2LSPB 5D3SA 4BW3A 4HXNA 3IU6A 4A9KA 5L96A 4O78A 5JI8A 5FE3A 5FE7A 4WHWA 4QY4A 4CUSA 5ETDA 4NR9A 5D24A 4MENA 5HRVA 3JVMA 5E9MA 4YYGA 2YW5A 4QSRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4KV4A 2YQDA 5ETBA 5DW2A 4YY4A 3FKMX 5DY7A 3LJWA 5HQ6A 4UYFA 2OUOA 5JWMA 4YYNA 4NR4A 4XY8A 2YEKA 3MB3A 4UYDA 5HQ7A 4LZRA 4O75A 4LR6A 3ERRA 5KO4A 5CQ7A 3P1DA 3D1DA 4MEQA 1EQFA 2OSSA 2KTBB 2RNWA 4MR6A 5CQ6A 4DONA 4HXRA 5LVRA 4LZ2A 4AI6A 4C67A 4HXOA 4TYLA 4CFKA 3ONIA 4IR5A 4A9MA 5D0CA 3O36A 3G0LA 5FH7A 5CTLA 5AD3A 3VKHA 3UVYA 3LQIA 5DBMA 4Z6HA 1PUOA 3UV4A 4O71A 3U5KA 5C85A 5LJ2A 4NQNA 4PS5A 5A81A 5EWWA 4BW4A 5LKZA 5DW1A 4NR5A 4AKNA 3UVXA 4LYSA 4TT6A 5F61A 5E9IA 4BJXA 3QZTA 5F25A 3MULA 5KU3A 5CGPA 5E3GA 2R0YA 2N9GA 4QUUA 4QEVA 5D3NA 4IR6A 5A5SA 5A5NA 3O37A 4O72A 5DYCA 5A82A 2WP2A 4ZC9A 2DVRA 4QC3A 4PKLA 5D3TA 5TCMA 5HELA 5C89A 3JVJA 5DLXA 5F36A 2L5EA 2R0VA 5A5RA 4HBVA 4UITA 4QYDA 5EPRA 2DWWA 4Q0OA 5ENGA 1E6IA 4KCXA 5FFVA 2WP1A 5CQ5A 3O35A 4O7AA 3G0JA 4BW1A 5BT5A 4TZ8A 5EI4A 4QSPA 1N72A 4E96A 4IR3A 4TU6A 4MR3A 4IOQA 4QZSA 3IU5A 4O7EA 2GRCA 4QSXA 5EWCA 2I7KA 5C4QA 5C87A 5I88A 5I83A 3Q2EA 5C8GA 5FH6A 5AD2A 4NR6A 4YABA 5CRZA 2DATA 4PY6A 4MEOA 5FG4A 5A5QA 5L8UA 2L84A 4PCEA 5D7XA 4LDFA 3SVHA 2DVVA 5LUUA 4NYXA 4CUTA 4YYDA 2MJVB 2YYNA 5H1VA 5CFWA 4QSQA 5CZGA 5A85A 3SVGA 4CUPA 4HXSA 4TZ2A 2E7OA 5FFYA 1ZKRA 3S92A 4HBYA 5ENFA 5F63A 2RNYA 5ENCA 3MB4A 4ZW1A 5FE6A 5LJ1A 5F5ZA 5HM0A 3UV5A 3JVKA 5F60A 4UIWA 5CUAA 3LXJA 4WIVA 4NXJA 2DKWA 5EWDA 3AADA 5H85A 3O33A 3P1EA 5EP7A 4OGIA 5LVQA 2YEMA 5DLZA 5FE4A 4Z6IA 5I1QA 2F6NA 4YYMA 4QR5A 4NYWA 5F1HA 5II2A 5H1UA 2RFJA 5DFDA 5IG6A 4NUCA 5CPEA 5IIDA 3UW9A 4IOOA 5G4RA 4A9IA 5I40A 5L8TA 4O7FA 2DVQA 4OUFA 5HRWA 5A5PA 5CUEA 1ZS5A 5DKCA 4O74A 4CUUA 3MXFA 5D3RA 5KHMA 5I29A 3DAIA 4QBMA 5BT3A 5G4SA 5IGNA 5DX4A 4HXKA 4NRAA 5CUGA 4QC1A 4IR4A 5E73A 4NYVA 2DVSA 4N4FA 5E9YA 3AQAA 4XUAA 3QZSA 5E74A 5EWVA 4J0RA 4TS8A 5AMEA 4YYKA 5I7YA 4Q0NA 4CFLA 4NQMA 5F2PA 5CRMA 4YY6A 5CUDA 5I7XA 3LQJA 3LQHA 3K2JA 4QEWA 4N4GA 5HFRA 1F68A 3DWYA 4YH4A 5LKXA 3U5PA 4AKGA 5EPBA 5FE1A 3TLPA 4HBXA 4UIYA 5CY9A 5L98A 5DFCA 4YBMA 5L97A 5I80A 4O70A 5E3DA 2RS9B 5EGUA 5IBNA 3SVFA 5EQ1A 3ZYUA 4NS5A 4KV1A 5E9VA 4Z1SA 1WUMA 5HENA 4RVRA 4QSVA 2NXBA 2R0SA 4LYIA 4YATA 2FSAA 4HXLA 5FDZA 5ACYA 4YBTA 5DYAA 5EPSA 2RNXA 4CUQA 4QR4A 5FBXA 5HFQA 3O34A 5D3HA 5K29A 5BT4A 4A9OA 5CQ3A 5CQTA 5J0DA 3S91A 3NXBA 4YYIA 5EICA 5A5OA 2I8NA 4A9FA 3RCWA 5FE2A 5CU8A 4O7BA 5DYXA 5HRXA 2YELA 4QSSA 5A7CA 3HMFA 4HXMA 5CQ4A 5IGLA 1JM4B 3P1FA 5AMFA 4UIUA 5FFWA 5KTUA 4QYLA 5CUCA 4A9JA 5COIA 5EWHA 5D3LA 4A9EA 5FE5A 5E7DA 5L99A 3GG3A 4MR4A 5ENEA 5CP5A 5LJ0A 2E7NA 4J1PA 4TU4A 4HXPA 4NRCA 4YADA 4CLBA 4UIZA 3P5OA 4TT2A 2E3KA 4UIVA 4YC9A 2OO1A 4QB3A 5E9KA 5FE0A 5H1TA 4IORA 4QSTA 5F3AA 4NUEA 3UVWA 4TQNA 4UYEA 5DKDA 4A9LA 5EM3A 3D1BA 4N4IA 4FLPA 5D25A 5HQ5A 3QZVA 5DFBA 4PCIA 2H60A 5LKTA 4QSWA 2RI7A 4BW2A 4YBSA 4YH3A 4CURA 5KTXA 5FG6A 3JVLA 4J0SA 3HMHA 3HMEA 4Z1QA 4LYWA 4O76A 4LZSA 5HLSA 4NR8A 3U5LA 3U5JA 5D26A 1X0JA 5I89A 2D82A 5CQAA 5FH8A 4YYHA 4N3WA 5F1LA 5ENIA 4TTEA 4CL9A 5CUBA 4AKIA 4ZQLA 4GPJA 5E0RA 4OGJA 5DYUA 4A9HA 3UVDA 4C66A 5LKUA 5ENBA 2YDWA 4Z93A 5FE9A 5ENHA 4MEPA 5C7NA 5II1A 2F6JA 5EVAA 2L85A 4YK0A 4A9NA 5FB1A 4MR5A 5A83A 4WHUA 4XUBA 4LRGA 3UV2A 4QNSA 5HEMA 1JSPB 4ALGA 2RO1A 5HCLA 4N4HA 4YAXA 5IGKA 4YYJA 4NRBA 4O77A 5IGMA 4UIXA 4XY9A 5FB0A 4F3IA 2D9EA 5KTWA 5EU1A 4HBWA 5D3JA 4ALHA 5HJCA 4J3IA 5FE8A 4QSUA 5FG5A 4XYAA 5ENJA 3I3JA 3U5NA 5EA1A 3D7CA 5CS8A 4QR3A 2G4AA 3VKGA 5EV9A 5TB6A 3MQMA 3U5OA 5F62A 3MUKA 5I86A 4X2IA 4QUTA 4BHWA 5E9LA 5D3PA 5CQ8A 4UYGA 5DKHA 4UYFB 1WUGA 3U5MA 5EK9A 4PTBA 2R10A 3P1CA 4TT4A 4O7CA 3Q2FA 4UYHA 4LC2A 4NUDA 4QEUA 4NR7A 5EISA 4Y03A 2LSPB 5D3SA 4BW3A 4HXNA 4AKHA 3IU6A 2EJNA 4A9KA 5L96A 4O78A 5JI8A 5FE3A 5FE7A 4WHWA 4QY4A 4CUSA 5ETDA 4NR9A 5D24A 4MENA 5HRVA 3JVMA 5E9MA 4YYGA 2YW5A 4QSRA
chains in the Genus database with same CATH topology
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